A seqüência de difusão na Medula Espinhal Rat Cervical

Introduction

A ressonância magnética (RM) é uma ferramenta não invasiva que fornece uma janela para o cérebro ea medula espinhal na saúde e na doença. MRI revolucionou o diagnóstico clínico, mas também é uma ferramenta valiosa para a investigação laboratorial. Os modelos animais de lesão neurológica ou doença fornecer uma plataforma para entender a fisiopatologia e acelerar a descoberta de terapias. Neste relatório, nós demonstrar a aplicação da ressonância magnética para um modelo de rato de lesão da medula espinhal para investigar potenciais biomarcadores de lesão microestrutural ¹ usando tensor de difusão (DTI). O potencial de descoberta de biomarcadores imaging vai ajudar no diagnóstico e tratamento de pacientes com lesão medular. Estes marcadores são susceptíveis de desempenhar um papel na descoberta de terapias em modelos pré-clínicos e possibilitando a observação ou prognóstico em sua tradução para o contexto clínico.

DTI é uma forma especializada de MRI que mede movimento microscópico demoléculas de água (isto é, difusão). DTI tem sido particularmente vantajosa no sistema nervoso devido à presença de axónios em que a difusão é desproporcionalmente mais rápido ao longo dos axónios que perpendicular a elas, que fornece informações sobre a sua orientação e composição microestrutural. Índices escalares derivados de DTI, incluindo uma medida da difusão dentro do tecido geral, a difusividade (MD), e uma medida da dependência da orientação difusão significa, anisotropia fracionada (FA) ^2,3, visto ter aplicações extensas na caracterização da microestrutura do sistema nervoso na saúde e na doença ^4. Essas métricas têm revelado características microscópicas dos tecidos que são invisíveis através da maioria dos outros métodos de ressonância magnética. Esforços anteriores demonstraram que DTI detecta alterações microestruturais remotos dentro do cordão cervical seguinte torácica SCI em ratos ^1. As mudanças DTI remotos a partir da lesão provavelmente refletem como todo o res da medula espinhallagoas a lesão, e são potencialmente um marcador de lesão secundária.

Imaging o medula espinhal de ratos in vivo apresenta vários desafios únicos. Mais notavelmente, a medula espinhal é afetada pelo movimento respiratório e requer muita atenção para minimizar movimento usando vários métodos. Em estudos anteriores, os dispositivos de imobilização removido movimento da coluna vertebral durante a verificação, ^5. Para imagiologia de medula cervical, nós utilizamos contenção física sob a forma de um suporte de cabeça e barras de ouvido, que atenua, mas não elimina o movimento provocado pela respiração. Além disso, nós utilizamos um sistema personalizado de gating respiratório para sincronizar a aquisição de imagens com o ciclo respiratório de uma maneira eficiente. Estas modificações permitem que a remoção dos artefactos de outra forma causados ​​pelo movimento de grandes quantidades em grande escala causada pela respiração ^6. DWI é altamente sensível ao movimento microscópico, incluindo o fluxo de CSF e da pulsação sanguínea, e essas fontes de menor dimensão do movimento contamination também são atenuadas por gating o esquema respiratório. Além disso, a medula espinhal tem uma pequena área da secção transversal e representa apenas uma fracção do campo de visão. No caso da imagiologia coluna cervical, em que a medula espinal está situado no fundo do corpo do animal, de uma bobina cilíndrica de radiofrequência com uma penetração de sinal adequada é necessária para a imagem da medula espinhal cervical com alta resolução. A redução do campo de visão é conseguida por supressão do volume exterior (OVS), que também serve para cancelar, ou estragar, o sinal a partir de tecidos fora da medula espinhal. Este método, chamado de gradientes de spoiler ou supressão de volume externo, também serve para reduzir a contaminação de movimento residual animal, fluxo CSF, ou pulsação arterial dentro desses tecidos.

O arranjo da medula espinal, também podem ser exploradas para simplificar o protocolo de imagiologia. Os axónios da medula espinal na matéria branca (WM) são quase todos orientados paralelamente ao eixo principal da medula espinhal. Thnós, enquanto DWI do cérebro requer medidas ao longo de pelo menos 6 direções para assegurar os resultados não dependem da posição dentro do ímã (um processo chamado de tensor de difusão de imagem), as medições na medula espinhal podem ser adquiridos somente ao longo de duas direções paralelas e perpendicular ao cabo de ^7,8, a seguir designado longitudinal e transversal, respectivamente. Assim, a difusividade e outros parâmetros são medidos ao longo das duas direcções, separadamente e em permitir inferências a microestrutura do tecido na saúde e na doença ou lesão.

Protocol

NOTA: Declaração de Ética: O Cuidado Institucional e usar os comités (IACUC) da Faculdade de Medicina de Wisconsin e Clement J. Zablocki VA Medical Center aprovado todos os procedimentos.

1. Preparação animal e Monitoramento

1. Anestesiar o rato numa câmara de indução, utilizando 5% de isoflurano em ar medicinal. Quando o reflexo de endireitamento está ausente e apertando a pata traseira não produz reflexo de retirada, reduzir a anestesia para 2% e transferir o animal para o scanner em uma posição propensa de cabeça. Manter isoflurano a 2% através de um dispositivo de cone do nariz ao longo do processo, e manter o ar medicinal a um caudal de cerca de 1 L / min. Aplicar uma pequena quantidade de lubrificante unguento para os olhos dos ratos para evitar danos na córnea enquanto sob anestesia.
2. Coloque um cinto de monitorização respiratória com segurança em torno do tronco do rato. Conecte o cinto para um sistema de gating respiratório. Antes de avançar o rato dentro do furo scanner, chec k o computador monitorização respiratória para garantir o ciclo respiratório é clara e consistente. Ajuste o cinto, se necessário, uma vez que esta etapa é fundamental para a qualidade da imagem.
3. Monitorizar e manter a temperatura do corpo do animal a 37 ° C por meio de uma sonda rectal e sistema de aquecimento por ar quente. Manter a freqüência respiratória, entre 30-45 respirações por minuto, ajustando o nível de anestesia entre 1,2 e 2%.
4. Posicione o rato no suporte da cabeça com uma barra de mordida e de parafuso em barras de ouvido (Figura 1), e deslize a cabeça em uma bobina de volume quadratura até a coluna cervical está posicionado no centro da bobina.
   NOTA: Os ombros do rato pode impedir a progressão na bobina.
5. Avance o rato e titulares de apoio dentro do furo scanner. Se for o caso, ajustar a sintonia e capacitores correspondentes da bobina para a frequência adequada e impedância de acordo com as instruções fornecidas pelo fornecedor de bobina.

e_title "> 2. MRI parâmetros de digitalização

NOTA: Os procedimentos descritos aqui usei um 9.4 T furo horizontal sistema de animal de pequeno porte, mas são aplicáveis ​​a outras forças do campo de sistemas de ressonância magnética de animais de pequeno porte.

1. Use procedimentos automatizados do sistema de MRI para detecção da frequência de ressonância, melhorando de forma iterativa a homogeneidade do campo magnético (calços), a calibração da energia de radiofrequência, e ajustamento do ganho do receptor.
2. Usando a interface do software do sistema, obter um plano de três olheiro varredura padrão para garantir o posicionamento correto.
   1. Clique em "Nova verificação", selecione TriPilot, e clique no botão "semáforo" para adquirir as imagens.
   2. Assegurar o centro da coluna cervical está alinhada tanto com o centro do magneto e o centro da bobina de ressonância magnética. Para centralizar a espinha dentro do ímã, empurrar ou puxar sobre o berço e readquirir a digitalização olheiro para verificação.
   3. Para ajustar a position da coluna cervical em relação à bobina de ressonância magnética, remover o suporte do íman para reposicionamento. Se necessário, repita o processo até que a posição é consistente. Se o animal é reposicionado, repita o passo 2.1.
3. Adicionar uma sequência spin-echo ponderada nova difusão eco-planar (DtiEpi) com o protocolo de imagem atual.
   1. Configurar e adquirir difusão imagens ponderadas com a sequência de DWI usando as configurações padrão, exceto para o seguinte:
   2. Abra a posição interface gráfica fatia de prescrever 12 fatias com uma espessura de 0,75 mm. Orientar as fatias perpendicularmente ao eixo principal do segmento cervical. Assegurar o posicionamento fatia consistente entre animais diferentes ou em diferentes sessões de imagem utilizando a base do cerebelo como uma referência interna.
   3. Defina as bandas de saturação para 'On'. Posição 4 bandas de saturação com uma espessura de 10 mm do lado de fora da medula espinal para minimizar o sinal a partir desses tecidos ereduzir o seu potencial para induzir estruturas (Figura 3). Definir gating respiratório ('módulo trigger') para 'on'.
      NOTA: O gating custom respiratória requer conhecimento e experiência em programação seqüência de pulsos. Se este não está disponível, uma solução consiste em reduzir o número de fatias de 3-5 e o TR a 1 s para assegurar que todas as fatias são obtidos em entre respirações do animal. Repita a seqüência completa com o outro subconjunto de fatias para obter a cobertura completa da medula cervical.
   4. Clique no ícone da caixa de ferramentas e, em seguida, clique em "Editar método." Definir o número de segmentos do PAV a 4. Mude a direção de codificação de fase para a esquerda-direita. Outras configurações padrão devem ser: echo espaçamento = 0,3234 ms, comprimento total de trem eco por segmento EPI = 32.
      NOTA: A codificação de fase definida como a direcção da esquerda para a direita em vez de ântero-posterior irá reduzir a contaminação de movimento a partir de outras estruturas.
   5. Use as seguintes geometriconfigurações de cal. Tamanho da matriz = 128 x 128, e no plano de campo de visão = 25,6 x 25,6 milímetros, resultando numa resolução espacial no plano x 0,200 = 0,200 milímetros. Certifique-se de espessura de corte = 0,75 mm. Ordem Slice = 'intercalados', gap fatia = 0 mm.
   6. Use as seguintes configurações de ponderação de difusão: DW modo medida = 'DW contraste ", duração gradiente de difusão (δ) = 7 ms, separação gradiente de difusão (Δ) = 12 ms, o número de valores de b = 8, desejados b valores = 0 , 250, 500, 750, 1.000, 1.500, 2.500, 3.500 mm / s ^2, o número de instruções de difusão = 2, pesando difusão instruções = [1 0 0] e [0 0 1] (a ser feita nos planos paralelos e ortogonal ao eixo da medula espinal).
      NOTA: Com essas configurações, conseguimos b valores tão altos como 3.500 s / mm ^2. Especificações de hardware e outras características de desempenho do sistema pode limitar o valor b, sendo que a duração gradiente de difusão (δ) e separação por gradiente de difusão (Δ) são dependentes do gdesempenho radient, que no nosso sistema foram: (a força máxima gradiente: 440 mt / m, taxa de variação máxima: 3.440 T / m / s). Para medições de curtose, B-2 valores, com o valor de b maior de pelo menos 2.000 s / mm ^2, são recomendados.
   7. Use as seguintes configurações de sincronização. tempo de eco (TE) = 27 ms (ajustado no mínimo, inserindo 0), tempo de repetição (TR) = 1.800 ms.
4. Adquirir a sequência preparado. Com os parâmetros listados acima, o tempo total da aquisição é de aproximadamente 25 min.
5. Ao longo de todas as análises, controlar o software de gating respiratório e ajustar o período de atraso entre o "gatilho" (software de detecção de validade) e o sinal para o sistema MRI, de modo que as aquisições ocorrer apenas na porção quiescente (imóvel) do ciclo respiratório (Figura 2a, parcela estável de linha cinza). Um atraso do disparo entre 100-400 mseg é necessário, dependendo da respiração do animal padrão. Isso vai ajudar a reduzir o artifatos que ocorrem com o movimento respiratório (Figura 3e).
6. Se estiver disponível, repetir a seqüência com o costume "blips reverter" definida como 'on', o que requer um adicional de 25 minutos de tempo de aquisição.
   NOTA: Se o costume 'reverse-blip' seqüência ⁹ (necessário para correção de susceptibilidade artefato durante a Etapa 3) não está disponível, apenas uma única direção codificação fase EPI é possível, enquanto a modificação seqüência blip invertida permite a escolha da direção codificação fase (à direita -para-esquerda ou da esquerda para a direita).
7. Quando imaging for concluída, remover o animal do titular e devolvê-lo à sua gaiola. Não deixe um animal sem supervisão até que ele recuperou a consciência suficiente para manter decúbito esternal.

Processamento 3. Imagem

1. Exportar dados do sistema em formato DICOM diretamente do sistema (preferível) ou converter os dados para o formato NIfTI usando custom ou thirsoftware d-party.
2. Execute susceptibilidade correção artefato.
   1. Extraia o b = 0 volumes de cada digitalização em um único arquivo, usando utilitários fornecidos com FSL ou outros pacotes de software de ressonância magnética. Um arquivo para cada sentido codificar fase é necessária.
      NOTA: Por exemplo, se cada varrimento consistia de 8 varrimentos de diferentes valores de b com ponderação de difusão na direcção transversal, seguido por 8 varrimentos de ponderação de difusão na direcção longitudinal, o ficheiro de imagem contém b = 0 varreduras em 1 o ^r e ^9ª volumes, e pode ser extraído e montada com o seguinte código shell:
      fslroi $ {up} _dwi_masked.nii.gz temp1 0 1
      fslroi $ {up} _dwi_masked.nii.gz temp2 8 1
      fslroi $ {down} _dwi_masked.nii.gz TEMP3 0 1
      fslroi $ {down} _dwi_masked.nii.gz Temp4 8 1
      fslmerge -t blip_both temp1 temp2 TEMP3 Temp4
      (Em que, neste caso, para cima e $ $ baixo estão os scans com normal e reversa instruções codificam fase, respectivamente). Use o comando 'topup' em FSL ^10,11 para criar um arquivo corrigido com redução de artefatos de distorção de imagem. Aplique esta correcção às imagens DWI-primas a serem utilizadas para a criação de mapas de parâmetros.
      NOTA: As instruções de utilização do comando pode ser encontrada em http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/TOPUP/TopupUsersGuide . Exemplo de código a usar o comando, neste caso, é a seguinte:
      topup --imain = blip_both_nlmf_b0images_masked.nii --datain = .. / topup_data.txt --config =. / b02b0_ratspine.cnf --out = topup_splines_nlmf --iout = $ out --verbose --logout = topuplog.log
      dwiup = `ls $ {up} * dwi_nlmFilt.nii`
      = dwidown `ls $ {down} * dwi_nlmFilt.nii`
      applytopup --imain = $ {dwiup}, $ {} dwidown --datain = .. / topup_data.txt --method = jac --inindex = 1, $ ind --topup = topup_splines_nlmf --out = DWI _ $ {out } -v
      Copie e editar o arquivo padrão em $ {} FSLDIR /etc/flirtsch/b02b0.cnf para o spin ratoai cabo, reduzindo cada um dos valores nas linhas --fwhm --warpres e por um factor de 10.
3. Se as imagens com ponderação difusão são adquiridos ao longo de pelo menos 6 direções não ortogonais (usando um esquema DTI em Paravision ou um design personalizado similar), use os pacotes de software, tais como Diffusion Toolbox ¹² ou Camino da FSL ¹³ para calcular mapas de parâmetros DTI padrão. Se não, utilizar um procedimento de geração de métricas de costume úteis, que emprega ponderação difusão apenas ao longo de duas direcções, por exemplo, como indicado nos passos 3.4 a frente.
4. Carregar o arquivo DWI corrigido emitido por TopUp em fslview e selecione "File -> Criar Mask" a partir do menu. Utilize as ferramentas de lápis para desenhar uma região de interesse dentro de um tipo de tecido (por exemplo, GM, WM dorsal, ou ventrolateral WM). Salve este arquivo e repita para quaisquer outros ROIs desejados para usar mais tarde.
   NOTA: outros procedimentos para ROIs segmento da medula espinhal foram documentados ^14,15
5. Use o arquivo de ROI para mascarar o arquivo DWI e depois calcular a média do sinal dentro do ROI para cada volume de imagem usando o seguinte comando:
   fslstats -t DWI_corrected.nii.gz -k GM_mask.nii.gz -M
6. Copie os 8 primeiros resultados em programa de computação numérica como MATLAB, como um vetor para o sinal transversal (por exemplo, chamá-lo sig_T), eo segundo 8 resultados como um vetor para o sinal longitudinal (sig_L), onde 8 é o número de b- Os valores utilizados.
   1. Copie os valores de B, em um programa de computação numérica como um vetor de 8 valores-B. Os valores-B para as direcções transversais e longitudinais foram idênticos. Se possível, o valor b-benefício, ao invés do valor nominal b, deve ser obtido a partir do scanner, que está listado na janela de parâmetros do passo 2.3.5 como "Valor eficaz B".
   2. Use curva toolbox montagem do programa de computação numérica para caber o sinal vs. dados b-valor para poe modelo desejado digitando cftools no prompt de comando. Para fazer isso, clique em "Data ..." e selecione os vetores de sinal como data-y e os valores-B como dados-x. Clique em "Fitting ..." e em "Tipo de ajuste" escolher "Equação personalizada" e clique em "New" e "Equações gerais" para inserir uma equação para a montagem.
7. Para ajustar ao modelo de difusão standard, entram na equação:
   S0. * Exp (-x. * D) "(1)
8. Para caber a um modelo que inclui a difusão e um termo de segunda ordem (kurtosis; K) para medir o desvio da difusão gaussian ^16, entram na equação:
   S0. * Exp (-x. * D + (1/6). * (X. * D). ^ 2. * K) "(2)
9. Clique em "OK" e "Aplicar". Observar os valores estimados para diffusivity (D) e curtose (K) na janela de saída. No "conjunto de dados:" selector, selecione os dados sig_T (ou sig_L) para uso com a equação (1)ou (2) e clique em "Aplicar".
10. Calcule o índice de anisotropia (AI), utilizando o transverso e difusividades longitudinais:
    AI = (D _L D _T) / (D _L + D _T) (3)
    Isto é análogo à anisotropia fracionada (FA) calculado a partir do modelo de DTI. Um índice de anisotropia para curtose também pode ser calculado usando transversal e longitudinal curtose em lugar de difusividade.
    Nota Este método indica os valores de parâmetros do modelo, tais como K _T, D _T, etc. Também é possível usar a operação de linha de comando da caixa de ferramentas de ajuste de curva em cada voxel dentro da coluna vertebral para criar um mapa de cada parâmetro do modelo . Métodos de montagem alternativos podem ser utilizados e estão detalhados em outro lugar. ¹⁷

Representative Results

Procedimentos adequados para minimizar artefatos de movimento resultar em difusão de alta qualidade imagens ponderados do rato cervical da medula espinhal. Usando gating custom respiratória (Figura 2), saturando sinal indesejado a partir de tecidos fora da coluna vertebral (Figuras 3B & C), e no campo de correção de distorção susceptibilidade magnética produz imagens ponderadas em difusão como as figuras 4 e 5. Imagens impróprias ou não-fechado vai levar a artefatos na forma de fantasmas (Figura 3E), enquanto gating correto é livre de artefatos.

A inspeção visual das imagens ponderadas difusão através da 12 fatias revela características da medula espinhal que se relaciona com sua microestrutura. Especificamente, a difusão mais rápida nos resultados dos tecidos em maior perda de sinal em imagens ponderadas de difusão, que é agravada com maior ponderação difusão (b-valor). Com ponderação difusão realizada perpendicular para o eixo da medula espinal, a matéria branca ao longo da periferia do fio aparece brilhante, uma vez que a difusão é lenta e restrita perpendicular aos axónios. Em contraste, a matéria cinzenta dentro da região central do cabo aparece mais escura, uma vez que ele é composto de axónios e corpos celulares que não estão todos alinhados ao longo de uma única direcção. Em comparação, a ponderação de difusão na direção resultados paralelos na substância branca com uma aparência mais escura, uma vez que a difusão é rápido ao longo dos axônios, enquanto a massa cinzenta é relativamente brilhante. É importante notar que os difusão ponderada imagens separadas são mostrados para diferentes valores de b, uma vez que as direcções paralelas e perpendiculares têm o melhor contraste entre matéria branca e cinzenta a valores de b diferentes.

Combinando todas as imagens de difusão ponderada usando formalismos matemáticos permite mapas dos parâmetros de difusão a ser mostrado. Os sinais médios da matéria branca e cinzenta, são plotados contra o diffator de ponderação de fusão (b-value) para as direções paralelas e perpendiculares. Estes dados quantitativa reforça as imagens ponderadas de difusão mostrados na Figura 4. Especificamente, a matéria branca tem uma forte dependência da direcção do coeficiente de difusão (longitudinal ou transversal), ao passo que a matéria cinzenta é menos dependente da direcção. Da mesma forma, o sinal de encaixe em cada voxel usando a equação de difusão de curtose rendimentos quantitativos mapas de parâmetros de difusão (Figura 6B), que põem em evidência esta mesma dependência. A massa branca tem um alto grau de anisotropia, tanto para a difusão (AID) e medidas de curtose (AIK). Assim, a difusão transversal e curtose revelar a microestrutura subjacente da medula espinal que é conhecido a partir de estudos histológicos. Estes parâmetros de difusão, que são adquiridas ao vivo, mas anestesiados animais, refletir propriedades microscópicas dos tecidos, como a densidade de axônios e diâmetro. Alterações namedidas si causados ​​por lesões e doenças será útil para noninvasively avaliar as conseqüências da lesão e os efeitos das terapias promissoras. A difusão de imagem ponderada da medula espinal de rato cervical pode, portanto, tornar-se uma ferramenta para estudos pré-clínicos de lesão da medula espinal e doenças da medula espinal.

Figura 1:. Desenho da bobina e o suporte para a medula espinhal cervical MRI Uma bobina volume de quadratura personalizado (Doty Scientific Inc) foi usado para a imagem da coluna cervical, com elevada sensibilidade e uniformidade. Anestesia e ar medicinal são entregues pelos portos de gás indicadas para o cone de nariz, a qual se encaixa confortavelmente em torno do nariz do rato. E o excesso de gás exalado é capturado pela linha de escape sob ligeiro vácuo. O chefe do rato é protegido com o bar mordida colocadas em torno dos incisivos eo delic barras de ouvido colocadosately dentro do canal auditivo. Outros componentes de monitoramento fisiológicos, incluindo o monitor respiratório e sonda de temperatura não são mostrados.

Figura 2: Esquema de gating respiratório. Um traço típico respiratória (cinzento) e gatilho (vermelho) a partir da unidade de propagação são mostrados esquematicamente (A). Na aplicação típica de gating (B), um único gatilho é utilizado para adquirir todas as fatias (linhas verticais; 12 mostrado aqui), por vezes uniformemente espaçados no tempo de repetição (TR). Se o TR excede o período típico, várias fatias podem ocorrer durante uma respiração e ser susceptível de movimento (vermelho). No esquema modificado (C), um subconjunto de fatias são adquiridos rapidamente após o gatilho (6 mostrado aqui), seguido por um atraso, com as outras fatias adquiridas após o gatilho subsequente. Efetivamente, A TR é idêntica entre os dois regimes, reorganizando os atrasos na sequência.

Figura 3:. Posicionamento fatia MRI, bandas de saturação e controle de movimento Doze cortes axiais foram dispostos a imagem olheiro (A) com a fatia mais anterior posicionado a uma distância consistente a partir da interseção do tronco cerebral e cerebelo diante. Bandas de saturação (B) foram adicionados a eliminar sinal indesejável fora da área de interesse. Uma imagem sem ponderação de difusão (C) e um com ponderação de difusão (D) com o esquema de gating personalizado empregada mostram claramente a anatomia do cabo e é livre de artefatos. Com o esquema não otimizado gating ou gating respiratório imprópria, de difusão de imagens ponderadas mostrar artefatos (E) como uma perda de sinal dentro do cordão, ou múltiplos "fantasmas" fora do cabo que vai posterior análise corrupto. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4:. Representativas de difusão imagens ponderadas Usando as optimizações descritas no texto, imagens ponderadas de difusão de alta qualidade foram obtidos com ponderação difusão transversal aplicada (A) e longitudinal (B) em relação ao eixo principal da medula espinal. Valores diferentes B são mostrados para cada direção que proporcionar o melhor contraste entre a substância branca e cinzenta para fins ilustrativos. Para cada direção ou b-valor, todos os 12 fatias foram adquiridas em aproximadamente 90 segundos. carga / 52390 / "target =" _ 52390fig4large.jpg blank "> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5:. Invertida processo de correção de fase-codificar A coluna esquerda mostra uma única fatia fotografada com a sequência de DWI, conforme descrito neste ("blip up" imagem) protocolo. A coluna do meio mostra a sequência adquiriu uma segunda vez com o "reverso blips" definido para 'on'. Note como recursos que aparecem esticadas na primeira imagem apareça comprimido na coluna do meio. A coluna da direita mostra as imagens de difusão ponderada corrigidas usando TopUp. A linha superior é a difusão não-imagem ponderada, a linha do meio é um exemplo utilizando a ponderação de difusão aplicada na direcção transversal, e a linha inferior é um exemplo utilizando a ponderação de difusão aplicada na direcção longitudinal."target =" _ //www.jove.com/files/ftp_upload/52390/52390fig5large.jpg blank "> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6:. Mapas de difusividade e curtose computadorizada O sinal normalizado (intensidade de imagem) é representado graficamente (A) como uma função de ponderação de difusão (b-valor) para a transversal (T) e direcção longitudinal da codificação (L) difusão. Mapas de alta qualidade (B) da difusividade (D), curtose (K), e anisotropia (AI) são calculados a partir do sinal em cada voxel e revelam características únicas do tecido da medula espinhal. Especificamente, há clara diferença de parâmetros entre a substância branca e cinzenta, assim como as diferenças regionais nas regiões de substância branca. Por favor clique aqui para view uma versão maior desta figura.

Discussion

As técnicas descritas aqui pode fornecer difusão de alta qualidade imagens ponderadas de medula espinhal de ratos in vivo. A qualidade da imagem depende de muitos factores, mas a medula espinhal tem vários problemas únicos que são importantes.

Movimento é um problema importante que se não for corrigido, irá resultar em imagens inutilizáveis. Assim, requer um acompanhamento atento durante a sessão de ressonância magnética. Se artefatos de imagem são observadas no exame inicial que são consistentes com o movimento, parar a aquisição e tomar medidas para eliminar os artefatos, uma vez que estes são difíceis de remover no pós-processamento. Verifique se o computador respiratório recebe um sinal forte, regular a partir da unidade de monitorização respiratória. O cinto de respiração pode necessitar de ser ajustado para a tensão correcta, que fornece um sinal consistente, mas não restringir a respiração do animal. Manter o nível adequado de anestesia em todos os momentos; 1,5-2,0% de isofluorano foi usado na nossa experience. Da mesma forma, a redução no movimento global do animal e a coluna vertebral é um outro aspecto importante para fornecer imagens sem efeitos artificiais. Ao contrário da medula espinhal humana, que experimenta movimento significativo causado pela pulsação CSF relacionada com o ciclo cardíaco, pulsação CSF no roedor é predominantemente associada ao ciclo respiratório ^18. Embora seja difícil de eliminar completamente todos os movimentos no cabo, isto é particularmente importante para reduzir o movimento na medida do possível, o que é muitas vezes conseguida através de tentativa e erro. Além disso, os ratos com várias lesões neurológicas ou doenças respiratórias podem ter taxas anormais ou outras complicações fisiológicas que podem exigir adaptação dos procedimentos aqui descritos.

As modificações na sequência de pulso para gating respiratório, além de procedimentos de reconstrução de imagem adaptados para esta finalidade, minimizar os efeitos de distorção causadas por campos magnéticos não homogéneos que não podem ser removed por ajustes realizados no sistema de ressonância magnética.

Do mesmo modo, a qualidade da imagem depende da duração de tempo de imagem. No nosso exemplo, limitando o número de coeficiente de difusão ao longo apenas duas direcções permitiu uma redução no tempo total de imagiologia. A limitação dessa abordagem é que ela não é mais compatível com a análise tensor completo (DTI), que é a norma para muitos outros estudos. Alternativamente, a utilização de menos médias e mais instruções de difusão ou valores de b pode permitir uma melhor caracterização, mantendo ao mesmo tempo de aquisição. Estudos anteriores demonstraram que a abordagem 2-sentido proporciona informação consistente com a 6-sentido (DTI) abordagem ^19, mas deve ser tomado cuidado para assegurar que as fatias (e indicações de difusão) estão orientadas precisamente ao longo e perpendicular ao cabo. No entanto, a aquisição de vários valores-b permite uma melhor caracterização e montagem de curtose matemática e é recomendada a utilização de mais de um único b-Value. Além disso, a sequência completa foi repetido com uma direcção de codificação de fase inversa o que diminui os efeitos do campo magnético artefactos de susceptibilidade, e melhora a qualidade da imagem por meio de cálculo da média global. Por fim, a resolução da imagem usada em nosso protocolo prevê uma separação clara entre a substância branca e cinzenta. As imagens com maior resolução são possíveis, embora isso muitas vezes vem à custa de tempos de varredura mais longos ou o potencial para mais artefatos.

Melhorias na bobinas de radiofreqüência, seqüências de pulsos, e métodos de pós-processamento, todos eles terão o efeito de melhorar a imagem da medula espinhal em futuras adaptações deste método. Por exemplo, bobinas de superfície pode ser benéfico para uma melhor qualidade de imagem semelhante ao observado em ratinhos. ²⁰ Estas medidas têm uma alta probabilidade de serem úteis como marcadores para o diagnóstico clínico e tratamento de lesões da medula espinal.

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
Small animal imaging RF coil	Doty	SAIP400-H-38-S
Respiratory gating system	SA Instruments	1030
MR scanner	Bruker	Biospec 94/30 USR