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Neuroscience

전방 시상 핵의 깊은 뇌 자극 후 쥐 해마의 유전자 발현 변화 분석

Published: March 8, 2015 doi: 10.3791/52457

Abstract

깊은 뇌 자극 (DBS) 수술 등 기저핵, 시상 및 시상 영역으로 뇌의 다양한 지역을 대상으로, 약물 치료에 반응하지 못한 여러 가지 운동 장애에 대한 효과적인 치료입니다. DBS 수술 분야의 최근 발전은 비만, 우울증과 강박 장애 등 다양한 다른 조건이 수술 기법의 응용 프로그램을 확장하기 시작했다. 이러한 확대 표시에도 불구하고, 거의 DBS 수술의 유익한 효과를 촉진 기본 생리 학적 메커니즘에 대한 알려져있다. 이 질문에 대한 하나의 접근은 전기 자극을 수신 뉴런 유전자 발현 분석을 수행하는 것이다. 이전의 연구는 쥐의 치아 이랑에서 그 신경은 시상 (1)의 전방 핵의 대상 DBS에 유도되어 보여 주었다. ATN을 대상으로 DBS 수술은 치료 불응 성 간질을 위해 널리 사용됩니다. 따라서 그것은 많은 가출 중 하나입니다우리 t 전기적으로 ATN을 자극에 의​​해 유도되는 전사 변화를 탐구한다. 이 논문에서 우리는 성인 남성의 Wistar 쥐에서 ATN을 대상으로 정위 유도 DBS 수술에 대한 우리의 방법을 설명합니다. 우리는 또한 유전자 발현 변화를 측정하기위한 조직 박리, RNA 분리, cDNA를 준비하고 정량적 RT-PCR을위한 다음 단계에 대해 설명합니다. 이 방법은 적용 일반적으로 임상 적 대상 기저핵과 뇌의 다른 영역을 자극 수정할 수 있습니다. 여기에 설명 된 유전자 발현 연구는 DBS위한 메커니즘을 지시 할 수있는 분자 플레이어를 발견하기위한 후보 타겟 유전자 접근법을 가정한다.

Introduction

전기적으로 뇌 회로를 자극 할 가능성이 2 탐험 때 신경 외과 기술로 뇌 심부 자극의 발전 뒤에 역사는 1870 년대로 거슬러 올라간다. 신경 장애의 치료 만성 고주파 자극의 사용은 1960 년에 시작 3. 나중에 만성 이식 DBS 전극 4-6의 출현으로 1990 년, DBS로 처리 하였다 신경 질환의 수는 계속 증가. 뇌 심부 자극 태성 진전 제 6 치료제로 미국에서 사용 하였다. 오늘 수술은 현재 약물의 개입에 의해 치료할 수있는 신경 질환을 치료하는 데 널리 사용된다. DBS는 현재 파킨슨 병 및 근긴장 7-9의 운동 장애를 치료하는 데 사용된다. 알츠하이머 형 치매, 헌팅 톤병, 간질, 통증 및 신경 정신 질환 우울증, 강박 장애, 뚜렛7; 증후군 및 중독 DBS 10-12로 처리 의무 조건의 일부입니다. DBS 수술 FDA는 파킨슨 병, 및 근육 긴장 태성 진전을 치료하기위한 승인을하는 동안, 상기 언급 된 기타 상태의 치료를위한 DBS의 사용은 환자 (13, 14)에 많은 가능성을 제공하는 랩의 다양한 단계 및 임상 연구이다.

임상 적으로, DBS 수술은 두 단계로 수행된다. 첫 번째 단계는 방사선 수술 위치의 조합을 이용하여 해부학 적 위치에 타겟 DBS 전극을 위치시키는 것을 포함한다, CT, MRI뿐만 아니라 향상된 정밀도를 미세 판독. 두 번째 단계는 환자의 가슴 윗부분에 펄스 발생기를 주입하는 것을 포함하고 연장 설치는 펄스 발생기에 두피로부터 리드. 신경 학적 조건에 기초하여, 펄스 발생기의 프로그래밍을위한 여러 방식이 규격화되어​​ 있고 원하는 전압을 제공하기 위해 사용될 것이다. 최종 권최소 전압 15 가장 임상 적 응답을 수신하도록 다케는 단계적으로 진행한다. 그러나, 우리의 연구에서 만성 DBS 임플란트 달리 간략화를 위해 임상 적으로 사용 된, 우리는 동물 모델에서 (1 시간 동안) 한번 고주파 자극을 연구에 의존했다.

우리의 연구 그룹의 일부는 치료 - 간질 DBS 수술의 사용을 연구에 초점을 맞추고있다. 고주파 자극을 사용하여 정위 수술 방법은 간질 10,16,17의 모든 발생률의 약 30 %를 구성하는 의학적 내화물 간질을 치료하는 효과적인 옵션으로 많은 다른 사람에 의해 탐구하고있다. 깊은 소뇌 핵뿐 아니라 피질 표면 타겟팅 소뇌 자극 10,18,19 간질을 치료 표적으로 이전에 사용되어왔다. 또한, 해마 자극도 시도했지만 혼합 된 결과 (20, 21)와 함께하고있다. 다른 일부 조사간질에 대한 DBS 목표는 대뇌 피질, 시상, 시상 핵과 미주 신경 (8)를 포함한다. 그러나 지난 몇 년 동안 여러 연구에서 다음과 같은 결과는, 전방 시상 핵 (ATN)은 간질 치료 10,22에 대한 가장 일반적인 DBS 대상으로 떠오르고있다. 신경 해부학 회로, 및 동물 모델로부터의 결과에 대한 지식에 기초하여, 여러 연구 23-26 간질 치료에 ATN의 깊은 뇌 자극 치료 효과에 초점을 맞추었다. ATN은 변연계 회로의 일부이며 발작 빈도에 영향을 미치는 뇌의 영역에 위치하고 있습니다. 로 Hamani 등. 연구, 필로 카르 핀에 의한 간질 모델에서 ATN-DBS의 효능을 시험하고 양국 간 ATN 자극이 필로 카핀에 의한 발작과 간질 중첩증 (24)에 대한 대기 시간을 연장 것을 발견했다. 또한, ATN의 고주파 자극의 EP pentylenetetrazol (PTZ) 모델에서 발작 빈도수를 감소였다25,27-29 ilepsy. Lee 등 알., 내화물 부분 간질 (30)의 치료에 ATN의 만성 깊은 뇌 자극에 따라 약 75 %의 발작 빈도의 평균 감소를보고했다.

치료 불응 성 간질에 대한 최근의 임상 연구는 전방 시상 핵 (ATN) 22 대상 DBS 수술 후 유망한 결과를 보여 주었다. 치료 불응 성 간질 (SANTE 시험)에 대한 ATN의 양자 DBS를받은 110 명의 환자와 다기관 무작위 임상 시험은 약 40 % (31)에 의해 발작 빈도의 저하를 지적했다. 본 연구의 결과는 또한 2~3개월 포스트 수술에서 관찰 지연 최적 항 간질 효과를 시사. 토다 등의 등으로 추가적인 연구., 그들은 동물 모델 1 나중에 포스트 DBS (일 3-5)에서 일어나는 신경을 보여 곳 이러한 연구 결과로 뒷받침. 또한, Encinas 등., 해마 neurogene 신고되었습니다ATN (32)의 고주파 자극 후 성인 마우스 치아 이랑의 동생. 이전의 연구 33-35은 만성 측두엽 간질과 학습 적자와 관련, 기억 손상과 자연 재발 모터 발작 같은 특정 간질의 경우 해마의 신경 발생을 감소 신고되었습니다. 또한, 이러한 동물 모델 (33) 만성 간질 해마 FGF2 및 IGF-1과 신경 줄기 세포 전구 세포 인자의 감소가 있었다. 이 고려, 치아 이랑 (dentate gyrus)에서 신경의 증가를 보여 같은 DBS 등의 중재 전략 연구를위한 흥미로운 길이다. 이러한 연구 결과는 간질의 메커니즘 기본 신경 포스트 DBS 치료에 더 깊이 탐구하는 우리를 격려했다. 우리는 (대표 결과에) (데이터가보고되지 않음)뿐만 아니라 양측 모두 일방적으로 ATN을 목표로하고 쥐의 치아 이랑에서 볼 수 증가 뉴로 트로 (BDNF) 표현했다. 우리의 Current 가설은 BDNF 발현 DBS 수술의 항 간질 효과로 해석 신경 절정 유전자 발현 캐스케이드를 개시하는 것이다. 이 논문에서는 DBS의 장점을 기본 메커니즘을 연구하는 매력적인 방법으로 유전자 발현 분석 한 다음 쥐의 ATN을 대상으로 DBS 수술에 대한 우리의 방법을 제시한다.

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Protocol

참고 : 윤리 문 :이 원고에서 설명하는 모든 절차는 (실험실 동물의 관리 및 사용에 대한 가이드) 동물 연구에 대한 NIH의 지침에 따라이며, 하버드 의과 대학 IACUC위원회에 의해 승인됩니다.

1. 수술 전 준비

  1. 모든 수술 도구 중 하나를 고압 증기 멸균 또는 필요에 따라 소독액 및 / 또는 에탄올로 세정 소독되어 있는지 확인합니다. 가능하다면, 이러한 메스, 바늘과 주사기로 멸균 일회용 장비를 사용합니다.
  2. 수술 용 드레이프와 워크 벤치를 커버 가능한 생물 학적 폐기물 처리가 있는지 확인합니다.
  3. 쥐의 체중 및 마취 량을 계산한다. 쥐를 마취 케타민 / 크 실라 믹스 (케타민 75 ㎎ / ㎏과 크 실라 10 ㎎ / ㎏)를 사용합니다.
    주 : 200-250g가 정위 프레임에서의 적절한 정착 동물뿐만 아니라 ATN의 정확한 표적화를위한 최적의 중량 사이이다. Isoflur메탄은 마취 제로서 사용할 수있다.
  4. 마운트 및 보안 두 멸균 전극 전극 홀더 (고압 증기 멸균 또는 에틸렌 산화물 살균) 정위 수술 프레임 및 현미경 (10-40X 배율)의 도움으로 (그림 2), 적절한위한 전극의 끝을 검사 정렬. 두 개의 전극 간격 3.0 mm를 고정합니다.
    참고 : 하드 표면에 접촉하여 전극의 끝 부분이 손상되지 않도록주의하십시오.

2. DBS 수술

  1. 케타민 / 크 실라는 동물에게 복강 혼합 동물 (발가락 - 핀치 반사, 호흡 속도와 깊이와 호흡의 규칙 확인하여) 마취의 수술 비행기에 도달 한 것으로 확인 주입한다. 절개됩니다 두피의 영역에서 머리를 제거하고 각 베타 딘, 알코올 또는 멸균 식염수 중 3 교대 스크럽과 두피를 소독. 안전하고 정위 FRAM에 동물의 위치를전자.
  2. 최적 상태에서 동물의 체온을 유지하기 위해 순환 온수 패드를 사용한다. 과잉 드라이로부터 보호하기 위해 동물의 눈에 눈 윤활제를 적용합니다.
  3. anterioposterior -1.6 mm, mediolateral 1.5 mm 및 5.2 mm 1 dorsoventral 다음 정위 ATN (전방 시상 핵을) 대상에 대한 좌표를 사용합니다.
    참고 : 정위 좌표 Paxinos 왓슨 (6 판) 쥐의 뇌지도 책 (36)를 기준으로합니다.
  4. 두피의 절개 sagittally 두개골을 공개합니다. 견인기의 쌍 두피 절개를 사용하여 고정 두개골을 노출시킨다. 절개를 세척 멸균 식염수를 사용합니다. 절개가 너무 젖은 경우, 건조 멸균 면봉을 사용합니다. 브레 그마을 찾아 검은 색 마커 표시합니다. 코론에 시상 봉합 1.6 mm 후방에서 mediolaterally 양쪽에 약 1.5 mm에서 두 개 더 마르크을하기 위해선, 버 구멍의 위치를​​ 안내하는알 봉합.
  5. 버 홀을 만들었다 휴대용 드릴을 사용한다. 버 구멍의 끝이 에탄올로 소독하여 멸균 있는지 확인합니다. 드릴 때 두개골 표면에 45 °에 대한 각도로 드릴을 잡고. 자주 버 어가 구멍의 위치에 과도한 열을 피하기 위해 두 버어 구멍 전환.
  6. 경질이 노출 될 때까지 시추를 계속합니다. 그 팁을 구부리고가 'L'의 모양을 닮은와 바늘을 사용하여 전극의 삽입을 방해 할 뼈의 깨진 조각을 제거합니다. 구부러진 바늘을 사용하여 뼈 조각을 제거하는 동안 기본 경질 및 / 또는 뇌 조직 손상되지 않도록주의하십시오.
    참고 : 무딘 바늘 또는 미세 무딘 집게를 사용하여도 옵션입니다.
  7. 정위 프레임의 회전 핸들 이중 전극 조립체를 고정 및 90 ° 각도로 핸들을 고정한다. 정위 프레임의 조정을 사용하여 정확히 정수리 위의 왼쪽 전극을 배치합니다.
  8. 스테레오를 사용하여전술 조정 mediolateral 포지셔닝 정확하게 지금 완벽 관상 봉합사 따라 정렬 개의 전극이 존재하지만 브레 그마로부터 mediolaterally 1.5 mm 이격되도록 브레 그마의 좌측의 좌측 전극 1.5 mm 이동.
  9. anterioposterior 정위 조정을 사용하여 관상 봉합에 전극 1.6 mm 후방 이동합니다.
  10. 버 구멍이 버 구멍의 거친 가장자리를 건드리지 않고, 전극이 쉽게 삽입 할 수 있도록 올바른 위치에서 수행 된 경우 먼저 확인 전극을 낮추기 위해 dorsoventral 조정을 사용합니다. 그렇다면, 두개골의 표면으로부터 5.2 mm의 깊이로 전극을 삽입한다.
  11. 130 Hz로 설정 자극기, 2.5 V, 90 마이크로 초 펄스 폭 1로 리드를 통해 전극을 연결합니다.
  12. 시간 고주파 자극을 전달 (또는 실험 구성에 따라, 소망의 시간). 자극 과정 동안, (P)을 보장하는 기억정기적으로 발가락 핀치에 응답에 발 철수의 부재를 확인하여 로퍼 마취 깊이. 마취를 유도하기 위해 사용되는 대략 절반 초기 투여 량으로 마취를 보완. 마취 깊이를 검사 할 때 멸균 장갑의 오염을 방지하고 필요한 경우 변경합니다. 하나의 실험 요구에 따라 일방적 또는 양자 자극을 수행합니다. 이러한 저주파 자극 등의 컨트롤 (예를 들어합니다., 10 Hz에서)와 (후속 자극에 전극을 삽입) 비자극 동물을 포함합니다.
  13. 자극이 완료되면, 조심스럽게 전극을 제거하고 3-0 봉합 또는 멸균 수술 스테이플 절개를 봉합.
  14. 피하 통증으로 부 프레 노르 핀 (0.05 ㎎ / ㎏)을 관리합니다. 정상 활동으로 복귀 할 때까지 동물을 모니터링하고 주거 시설로 돌려줍니다.
  15. 실험적인 디자인을 기반으로 시간의 집합 기간 후 (예 : 0, 3, 6 또는 12 시간 후 DBS 수술)마취 과다 복용으로 동물을 안락사. 활력 징후의 유무를 확인한 후, 동물을 목을 벨.
  16. 제 가위를 사용하여 피부를 제거하여 뇌를 해부. 해부 가위를 사용하여 시상 ​​봉합을 따라 뼈를 잘라. 양쪽 측면에있는 뼈를 통해 두 개 더 절개 (인치에 대한 각)를 확인합니다. 집게를 사용하여, 뇌를 노출 두개골의 뼈의 상부로부터 부분적으로 절단 된 부분을 들어 올려.
  17. 미세 가위 나 집게를 사용하여 두개골에서 뇌을 제거하고 얼음 차가운 PBS와 페트리 접시에 전송할 수 있습니다.
    주 : 뼈를 통해 절개를하는 동안 뇌에 손상을 방지하기 위해주의하십시오.

3. 해마 분리

참고 : 얼음이 섹션의 모든 후속 단계를 수행합니다.

  1. 얼음에 미리 냉각 아크릴 뇌 매트릭스에 두뇌를 놓습니다. 면도날을 사용하여, 전방 가장 ED에서 coronally 약 7-8mm 뇌를 잘라뇌의 GE. 첫 번째 컷에 두 번째 coronally 컷과 후방을 확인하도록 약 5 mm 두께의 뇌 조각을 제거 할 수 있습니다.
  2. 얼음처럼 차가운 PBS와 페트리 접시에 뇌 조각을 전송합니다. 면도날을 사용하여, 두 개의 반구형 부분을 절단하고, 각각 좌우에 대응하는 반구 유의 돌. 일방적 인 자극을 수행하는 동안이 특히 중요합니다.
  3. 미세 집게와 가위를 사용하여 조심스럽게 해마를 제거합니다.
  4. 플래시 후속 RNA 추출 단계에 대한 준비가 될 때까지 -20 ° C 냉장고에 드라이 아이스와 저장소의 해마 조직을 동결.
    주 : 장기 저장을 위해, 그것 -80 ° C에 냉동 조직을 저장하는 것이 바람직하다.

4. RNA 추출 및 정량 PCR

  1. 조직을 균질화를 위해 준비 될 때까지 드라이 아이스에 냉동 상태를 유지해야합니다.
  2. 주 : 후드에서이 단계를 수행합니다.
    1. HIPP에 트라이 시약 1 ML을 추가조직이 작은 조각으로 깨진 될 때까지 1.5 ML의 원심 분리기 튜브 ocampal 조직과 먼저 피펫 여러 번하여 균질화. 더 나아가 깨지지 보이는 조직이 없을 때까지 25 G 바늘 주사기를 통과함으로써 조직을 균질화. 얼음에 균질화 단계를 수행합니다.
    2. 조직을 균질화 한 후, 세포 용해를 허용하는 세포 현탁액은 실온에서 5 분간 방치한다.
      참고 :이 시점 후 세포 현탁액은 냉동 및 추가 처리 할 때까지 -70 ° C에서 저장 빠르게 할 수 있습니다.
  3. 0.2 ㎖의 클로로포름을 첨가하고, 20 초 동안 볼 텍싱하여 혼합하고 15 분 동안 실온에서 용액을 방치.
  4. 4 ℃에서 15 분 동안 12,000 XG에서 샘플을 원심 분리기. 원심 분리 후, 볼 수 있습니다 세 가지 별도의 레이어를 방해하지 않고 신중하게 튜브를 제거합니다.
    참고 : 아래 (빨간색) 단계는 단백질을 포함, 중간 흐린 단계는 DNA를 포함하고 톱 클리어 단계는 R을 포함NA.
  5. 신선한 1.5 ml를 원심 분리 관으로 톱 클리어 위상 (RNA)를 전송 (일반적으로 위상을 함유하는 500 ㎕의 RNA가 얻어진다). 여기에 0.5 ml의 이소프로판올을 추가하고 와동에 의해 혼합. 여기에 RNA의 캐리어로 2 ~ 3 μL 글리코겐 (20 ㎎ / ㎖)를 추가합니다. 샘플을 10 분 동안 실온에서 테이블 위에 올려 놓지.
  6. 4 ℃에서 1 시간 동안 12,000 XG에 샘플을 원심 분리기. RNA 펠렛은 튜브의 바닥에서 볼 수 있는지 확인합니다.
  7. 뜨는을 취소하고 75 % 에탄올 1 ㎖를 추가하여 RNA 펠렛을 씻어 (뉴 클레아 무료 물로 만든). 펠릿은 관의 바닥에서 상기 용액으로 제거 될 수레까지 시료를 여러 번 전환. 4 ℃에서 10 분 동안 12,000 XG에 솔루션을 원심 분리기.
    참고 : 75 % 에탄올 펠릿을 상기 단계까지 -20 ℃에서 저장 될 수있다.
  8. 실온에서 5 분 오픈 튜브를 남겨 건조 공기 RNA 펠렛을 허용합니다. 비켜을 방지하기 위해 예방 조치를 타고이것은 다음 단계에서의 물에의 용해에 영향을 미칠 수있는 바와 같이 펠릿을 건조 r에.

5. RNA 준비에서 DNA를 제거

  1. RNA 펠렛에 뉴 클레아 무료 물 9 μl를 추가하고 펠렛 부드럽게 튜브를 텍싱에 의해 진행하기 전에 용해되어 있는지 확인합니다. 이 10 배의 DNase I 버퍼의 1 μL, 1 μL (의 DNase I 키트) 재조합의 DNase를 추가하려면, 간단하게, 부드럽게 튜브를 쓸어 넘겨 혼합 튜브를 회전하고 30 분 동안 물을 욕조에 37 ℃에서 배양한다.
  2. 샘플 (DNase의 I 키트) 2 μL DNase의 불 활성화 시약을 추가하고 2 분 동안 실온에서 품어 부드럽게 튜브를 가볍게 치면 자주 섞는다. 신선한 1.5 ㎖의 원심 분리 관에 10 분 맑은 상층 액의 약 10 μl를 전송 12,000 XG에 원심 분리기.
  3. nanodrop 또는 분광 광도계를 사용하여 RNA 농도를 측정한다.

6. RNA에서 cDNA를 만들기

  1. 필요한 볼륨 번째 추가1 μg의 RNA를 포함하고 클레아없는 물을 첨가하여 8 μL로 전량에 가져다. 여기에 1 μL 된 10 mM의 dNTP 믹스와 첨자 첫 스트랜드 합성 키트 임의 헥사 1 μl를 추가합니다. 부드럽게 섞어 어느 수욕 또는 미리 프로그램 된 열 순환기에 5 분 동안 65 ° C에서 배양한다.
  2. 10 배 RT 버퍼, 25 M의 MgCl 2, 0.1 M DTT의 2 μL와의 RNAse OUT 1 μL (40 U / μL)의 4 μL 2 μL 다음 시약을 포함하는 프리믹스를 확인합니다.
    참고 : 주어진 볼륨이 반응 당 있으며, 사용자는 하나의 실험의 필요에 따라 확장 할 필요가있다.
  3. 65 ° C에서 샘플을 포함하는 RNA를 분리 한 후, 분 동안 실온에서 튜브를 설정합니다. 9 μL 프리믹스 용액을 첨가하고, 2 분 동안 실온에서 배양한다. 슈퍼 스크립트 II 역전사 효소 1 μL (50 U / μL)를 첨가하고 10 분 동안 실온에서 배양한다.
  4. 50 42 ° C에서 샘플을 품어분 역전사가 발생 할.
  5. 15 분 반응을 정지하고 70 ° C에서 샘플을 인큐베이션.
  6. 얼음에 샘플을 잠시 놓고 1 μL RNaseH를 (2 U / μL)를 추가하고 20 분 동안 37 ℃에서 배양한다.
  7. 짧게 응축 액체를 스핀 다운 3,000 XG에서 튜브를 원심 분리기.
    주 :이 정량적 PCR에 사용되는 cDNA를이다. cDNA를 PCR 설정 될 때까지 -20 ℃ 냉동고에 저장 될 수있다. 또한 cDNA를 PCR로 진행하기 전에 자유 클레아 물로 희석 될 수있다.

7. 정량 PCR

  1. 다음과 같은 시약을 포함하는 마스터 믹스 (주어진 볼륨은 반응 기준입니다) 확인 : 배 SYBR 녹색 믹스의 6.3 μL, 앞으로 프라이머 (10 μM)의 0.6 μL, 역방향 프라이머 (10 μM)의 0.6 μL 및 뉴 클레아 무료 물 0.5 μl의 .
    주 : 프라이머 디자인을 사용하여 수행 하였다 관심 NCBI 유전자의 염기 서열 페이지 옵션 '프라이머 선택'을.
  2. 96 잘 PCR 플레이트의 각 웰에 10 μL의 mastermix를 추가합니다. 이전에 잘 mastermix를 포함하는 제작 된 cDNA의 2.5 μl를 추가합니다. 각 샘플에 대해 세중 PCR 반응을 설정해야합니다.
  3. mastermix 및 cDNA의 첨가를 완료 한 후, 웰을 밀봉하는 광 접착 시트를 사용하여 PCR 플레이트를 커버. 우물의 바닥에 모든 액체를 해결하기 탁상 원심 분리기 500 XG에서 5 분 동안 짧게 플레이트 스핀.
  4. 미리 프로그램 된 RT-PCR 기계에 PCR 플레이트를 넣습니다. 표 1에 제공된 PCR 파라미터를 사용한다.
  5. 데이터 분석 : 추가 계산에 대한 qPCR에 출력에서 C의 t 값을 사용합니다. 내부 통제 유전자 PCR 반응을 설정 테스트 유전자와 함께, 18S rRNA 유전자는과 β - 굴지 (음성 대조군) (동일한 입력을 보장하기 위해). ΔΔCt 방법 (37)에 따라 배의 변화를 계산합니다.

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Representative Results

도 1a 및도 1b는 제어 유전자 β 액틴에 BDNF와 GABRD의 상대적 표현을 나타낸다. BDNF는, 뉴로 트로는 종종 많은 신경 질환의 38 ~ 41의 신경 보호 효과와 관련이있다. 이것은 간질 환자에게 치료 적 이점을 수득 ATN의 자극에 응답하여 BDNF의 발현 프로파일을 분석하는 것이 흥미 롭다. 표시된 시간 - 점 걸쳐 BDNF의 유전자 발현 프로파일을 도시도 1a에 DBS 자극을 게시, BDNF는 상향 조절 (up-regulation)을 3 시간에 (비자극 배인 3) 피크 식 따라 DBS 수술 직후 (0 시간) 관찰 포스트 자극. 이러한 관찰을 향상 BDNF의 발현과 그 결과 신경이 DBS의 치료 효과에 기여할 수 있음을 시사한다. 또 다른 유전자 GABRD (도 1b)도 qPCR의 방법을 이용하여 조사 하였다. GABRD은 GABA 수용체이다 WHICH는 항 간질 약물 (42)을 설계하기위한 잠재적 표적 중 하나이다. GABRD의 발현 양상은 3 시간 포스트 DBS에 자극받지 않은 대조군에 비해 자극 동물의 개선 식을 보여줍니다. GABA 작용제 효과 발작 억제제로 사용되는 점을 감안하면, 그것은 DBS의 항 간질 효과 GABA에 대한 가능한 역할을 연루, 강화 GABRD 발현 후 DBS를 관찰하는 것이 재미있다.

여기에 설명 된 RT-PCR 프로토콜은 유전자 발현 패턴과 대조 동물에 비해 상대적 배 차이를 나타내 재현성 정량적 결과를 산출한다. 데이터 분석은 다음과 같이 수행된다 : qPCR의 출력은 분석 된 각 샘플에 대한 시험 유전자 임계 C t의 값을 준다. C의 t 값은 또한 제어 유전자 β 액틴 및 18S rRNA 유전자 (입력 컨트롤)에 대해 얻어진다. ΔΔC t의 방법은 유전자 EXPR를 계산하는데 사용될 것이다이러한 C (T)를 사용하여 ession 프로파일 (37) 값. 예를 들어, 주어진 샘플에 대해, BDNF 및 18S rRNA에 대한 C의 t 값의 차이가 계산 된 제 ΔC t이다, BDNF 용 유전자 발현 변화를 산출한다. 동일한 샘플에 대해, β 액틴 및 18S rRNA에 대한 C의 t 값 사이의 차이는 제 ΔC의 t를 제공하도록 계산된다. 두 ΔC t의 값 사이의 차이는 t ΔΔC를 제공하도록 계산된다. 이 ΔΔC의 t 값은 β-굴지에 비해 BDNF의 상대 템플릿 풍요 로움을 제공합니다 2 ^ (-ΔΔC의 t)을 계산하는 데 사용됩니다. 비자극 제어 나란히 서로 다른 시간의 포인트에 걸쳐이 값을 플롯함으로써, 시간에 걸쳐 DBS 포인트에 의해 유도 된 유전자 발현 변화는 가시화 될 수있다. 전술 한 방법은 다른 전위 솔직한 유전자 발현의 변화를 조사하기 위해 효과적으로 사용될 수있다DBS 자극에 응답하며, 이들 유전자의 발현을 조절할 하류 일부 효과를 조사하기 위하여 오버라이드.

그림 1
그림 1 : ATN의 고주파 자극에 대한 응답에서 BDNF의 발현 (A) 시간 코스 분석. 프로토콜에 설명 된대로 조직 수확, RNA 추출, cDNA를 준비 및 Q-PCR을 실시 하였다. 유전자 발현에서의 변화는 상대뿐만 아니라 제어 유전자 (β 액틴) (18S rRNA 유전자를 증폭하여) 입력을 정규화 한 후에 계산된다. 실시간 PCR에 의한 C t의 값은 t ΔΔ C의 방법 (37)에 의해 발현 수준을 계산하는데 사용 하였다. 분석 시간 - 점 0, 3, 6 및 12 시간 후 DBS 자극이다. 여기서 선택된 특정 시점들에 대해 연구하고 HY에 따라 변경 될 수있다 : 참고pothesis 실험 계획. (B) GABA 수용체 델타 서브 유닛 (GABRD) ATN을 대상으로 130 Hz에서 DBS의 질문에 답변 수준의 시간 코스 분석. 방법 및 계산은 BDNF 데이터와 유사한으로 수행되었다.

그림 2
그림 2 : DBS 전극과 자극을 설정합니다.

PCR주기
1 단계 : 초기 변성 95 ° C 15 분
2 단계 : 변성 95 ° C 15 초
가열 냉각 60 ° C 30 초
신장 72 ° C 30 초
2 단계의 40주기
주 : 어닐 온도에 따라 변한다
프라이머 융점. 프라이머는 일반적으로 설계
60 ° C의 최적의 어닐링 온도를합니다

표 1 : PCR 매개 변수.

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Discussion

Benabid 등의 등으로 랜드 마크 작업에 따라. 파킨슨 병 및 태성 진전을 치료하는 뇌 심부 자극을 사용하여, DBS 수술 기법은 많은 신경 장애 6,10,43을 치료하기 위해 지난 10 년 동안 많은 관심을 가지고 연구되어왔다. 뇌 회로의 다양한 신경 해부학 지역을 대상으로 DBS 연구는 현재 주요 신경 질환을 해결하기 위해 많은 그룹에 의해 수행되는 임상 시험의 다양한 단계에있다. 시상 핵 (STN) 또는 글로 창백 (GPI)의 내부 세그먼트의 자극은 FDA 승인 및 파킨슨 병 (10)에 운동 장애의 치료에서 사용된다. SANTE 임상 시험은 전방 시상 핵 (31)의 고주파 자극을받는 간질 환자를위한 유망 추세를 보이고있다. 단계의 결과는 내가 양측 결막 자극의 임상 시험은인지 기능 저하와 다시 속도의 지연을 보여 주었다메모리 회로부 8,44의 활성화뿐만 아니라 알츠하이머 병에서 본 hypometabolic 글루코스 흡수 보편. 또한, 최근 몇 년 동안 신경 외과는 강박증 (강박 장애) 치료 저항성 우울증, 뚜렛 증후군 및 중독 10,45-55 등의 신경 정신 질환 치료를위한 DBS 시험을 실시했다.

임상 시험에 더하여, 최근 몇 년 동안, 동물은 수술 우리에게 임의의 기술에 의해 시험 관내 비할하게 살아있는 동물 내 수술 기법에 의해 유도 된 생리 학적 변화를 연구하는 큰 기회를 제공하고있다. 이 논문에서 우리는 설치류에서 뇌 심부 자극 수술을 수행에 참여 방법을 논의했다. 1.1.2 설치류 정위 수술 잠재적 DBS 대상 검색에 이용 될 수 있으며, 질환 모델 동물을 이용한 수술의 효능을 테스트하기 위해. 실험자 시간 동안 과제 중 하나재현성은 감수하게 정확한 해부학 적 궤적을 타겟팅 할 수있다. 정확한 타겟팅 확인은 자극이 수행되며, 동물을 안락사 후에 만​​ 가능하기 때문에 수술 숙련 기술자에 대한 요구가 특히있다. 또한 때때로, 하나는 실수로 중요한 혈액 손실과 동물의 때로는 죽음으로 이어질 수있는 주요 혈관을 손상 할 수도 있습니다. 또한, 추가의 생화학 적 분석을위한 해마를 절개 할 필요가 조직 절편에 대한 손상 뇌 시험편을 필요 같은 적절한 동물에서 타겟팅 전극 용 면역 조직 검증 가능성을 제한한다. 적절한 전극 타겟팅은 아마도 동일한 방식으로 자극을 다른 동물에서 확인할 수 있습니다. 그러나, 이것은 실험 동물의 적절한 표적화를위한 증거를 제공하고이 방법의 제한하지 않는다. 최근 출판물 simultaneou와 DBS 수술을 실시하여이 문제를 회피 시도의 fMRI (56)는이야. 여기에 설명 된 기술의 개선은 가능 하나 동물에 이식 된 자극을 통해 만성 자극의 영향에 대한 연구가 될 수있다. 그러나, 우리는 세포 수준에서 DBS에 의해 유도 된 변화를 이해하는 첫 단계로, 고주파 자극의 단일 용량 (1 시간)에 대한 우리의 분석을 제한.

신경 장애의 다양한 DBS 수술의 사용을 고려하면, 우리는 DBS의 유익한 효과의 기초가되는 메커니즘을 아는 것이 필수적이다. 이 정보는 DBS의 전문가들에 의해 조사되지 않은 다른 조건에 대한 치료로 DBS의 유틸리티를 탐험 또한 수술 향후 개선을 개발하고 중요합니다. 또한, 수술 기법에 변형 과정의 특정 해로운 부작용을 방지하기 위해 효과적으로 질환 상태의 재발을 처리하도록 구현 될 수있다.

깊이있는 기계적인 아나DBS는 DBS의 용해에 의해 유도 된 유전자 발현 변화를 검토하여 가능하다. 어느 후보 유전자 접근 방식은 고주파 자극, 또는 DBS에 의해 유발 분자 이벤트에 대한 중요한 통찰력을 줄 수있는 글로벌 사체 분석과 같은 자극을 탈분극에 반응 신경 경로에 대한 기존 지식을 바탕으로. 유전자 발현 분석 기술 (후보 유전자 접근뿐만 아니라 높은 처리량 법) 분자 메커니즘 및 DBS 수술과 관련된 세포 변화를 탐험 열쇠 강력한 도구이다. 우리가 몇 년 전에 불가능했던 매우 짧은 시간에 세포 생리학의 여러 측면에 대해 풍부한 정보를 얻기 위해이 지역의 최근 발전은 그것을 가능하게했다. 예컨대 ChIPseq 높은 처리량 시퀀싱 기술의 출현으로, 그것은 DBS 57,58 응답 중요한 전사 인자의 게놈 차원의 위치를 특성화 할 수있다. 비 연결 최근 발견신경 퇴행성 질환과 같은 마이크로 RNA로 RNA를 코딩 (joint-coding), miRNA의 시퀀싱 기술 59, 60을 사용하여 뉴런 후 DBS에서 miRNA의 수준에서 가능한 변화를 분석 할 수있게. DBS의 질문에 답변 후생 유전 학적 서명 등의 DNA 메틸화와 히스톤 수정의 변화 가능성도 탐색 할 수 있습니다. 그러나, 장점에도 불구하고, 이러한 기술의 한계 중 일부뿐만 아니라 분석 중에 발생할 수있는 잠재적 인 문제를 인식하는 것이 중요하다. 유전자 발현에 중요한 관심사는 재현성 및 기술 오류되었습니다 분석. 이 실험이 주목을 받아 신뢰성을 보장하기 위해 반복 적절한 수있는에 계획하는 것이 중요합니다. 높은 스크리닝 연구의 일부와 일반적인 문제는 생성되는 데이터의 엄청난 양의 해석에 어려움이있다. 때때로 관찰 유전자 발현 변화는 직접적 영향에 기인하는지 여부를 결정하는 것이 중요해진다실험적 치료 효과 또는 하류이다. 이것은 일반적으로이 문제를 해결하기 위해 설계되는 추가 연구가 필요합니다.

게놈 연구뿐만 아니라, DBS에 응답 핵심 선수의 시공간적 현지화 및 뇌의 다양한 영역에서 자신의 수준의 변화 정량의 광범위한 면역 분석은 미래의 발전에 큰 자산이 될 것입니다 DBS 수술. 유전자 발현에서의 누적 결과는 면역 조직 화학적 연구는 중요한 요소뿐만 아니라 신경 세포 또는 신경 퇴화와 같은 세포 과정을 조절하는 키 이벤트 사이의 신규 한 분자의 상호 작용을 표시 할뿐만 아니라 분석한다. 이러한 중요한 분자 표지의 식별은 미래의 약물 발견을 가능하게 할 수있다. 이러한 연구 결과는 사람을 이해하기 위해 노력하고 과학자의 관점에서 가치있는 정보를 인 뇌 회로의 일반적인 기능에 되거 수Y 신경 질환. 최신 기술 병원에 만든 진보뿐만 아니라 실험실 통합에 우리의 미래의 노력을 연출하는 것은 질병에 대한 우리의 싸움에서 우리에게 상당한 이점을 제공 할 가능성이있다.

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Materials

Name Company Catalog Number Comments
Deep Brain Stimulation Surgery
Stereotactic frame Kopf Instruments Model 900
Drill  Dremmel 7700, 7.2 V
Scalpel BD 372610
Ketamine Patterson Veterinary 07-803-6637 Schedule III Controlled Substance, procurement, use and storage according to institutional rules
Xylazine Patterson Veterinary 07-808-1947
Buprenorphine Patterson Veterinary 07-850-2280 Schedule III Controlled Substance, procurement, use and storage according to institutional rules
Surgical staples ConMed Corporation 8035
Sutures (3-0)  Harvard Apparatus 72-3333
Syringe (1 ml, 29 1/2 G) BD 329464 Sterile, use for Anesthesia administration intraperitoneally
Syringe (3 ml, 25 G) BD 309570 Sterile, use for Analgesia administration subcutaneously
Needles BD 305761 Sterile, use for clearing broken bone pieces from the burr holes
Ethanol Fisher Scientific S25309B Use for general sterilization 
Eye Lubricant Fisher Scientific 19-898-350
Stimulator Medtronic Model 3628
DBS electrodes Rhodes Medical Instruments, CA SNEX100x-100 mm Electrodes are platinum, concentric and bipolar
Betadine (Povidone-Iodine)  PDI S23125 Single use swabsticks, use for sterilizing the scalp before making incision 
 Brain Dissection and Hippocampal tissue isolation
Acrylic Rodent Brain Matrix Electron Microscopy Sciences 175-300 www.emsdiasum.com
Razor Blade V W R 55411-050
Guillotine Scissors Clauss 18039 For decapitation, make sure these scissors are maintained in clean and working condition
Scissors Codman Classic 34-4098 Use for removing the brain from the skull
Forceps Electron Microscopy Sciences 72957-06 Use for removing the brain from the skull and for handling during dissection
Phosphate Buffered Saline  Boston Bioproducts BM-220
 RNA Extraction and cDNA Preparation
Tri Reagent Sigma T9424 Always use in a fume hood and wear protective goggles while handling; avoid contact with skin
Syringe (3 ml, 25 G) BD 309570 Use for tissue homogenization
Chloroform Fisher Scientific BP1145-1 Always use in a fume hood and wear protective goggles while handling; avoid contact with skin
Isopropanol Fisher Scientific A416-1
Glycogen Thermo Scientific R0561
Dnase I Kit Ambion AM1906
Superscript First Strand Synthesis Kit Invitrogen 11904-018
Tabletop Microcentrifuge Eppendorf 5415D
 Quantitative PCR               
SYBR Green PCR Kit Qiagen 204143
Custom Oligos Invitrogen 10668051
PCR Plates (96 wells) Denville Scientific C18080-10
Optical Adhesive Sheets Thermo Scientific AB1170
Nuclease free Water Thermo Scientific SH30538-02
Real Time PCR Machine Applied Biosystems 7500

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신경 과학 97 호 전방 시상 핵 뇌 심부 자극 치아 이랑 (dentate gyrus) 해마 간질 유전자 발현 고주파 자극 정량적 RT-PCR
전방 시상 핵의 깊은 뇌 자극 후 쥐 해마의 유전자 발현 변화 분석
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Selvakumar, T., Alavian, K. N.,More

Selvakumar, T., Alavian, K. N., Tierney, T. Analysis of Gene Expression Changes in the Rat Hippocampus After Deep Brain Stimulation of the Anterior Thalamic Nucleus. J. Vis. Exp. (97), e52457, doi:10.3791/52457 (2015).

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