Summary
这里,我们描述了通过使用脱乙酰壳多糖的抑制病媒蚊基因功能/干扰是由幼虫摄取的RNA纳米颗粒的过程。
Abstract
蚊子造成更多人的痛苦比任何其他生物-和杀死每年有超过百万人。蚊子基因组计划推动研究蚊子生物学的新方面,包括在初级非洲疟蚊冈比亚按蚊和登革热和黄热病载体埃及伊蚊功能基因研究。核糖核酸干扰 - (RNAi-)介导的基因沉默已用于靶向目的基因在这两种疾病的载体蚊子物种。在这里,我们描述了一个程序,制备壳聚糖/干扰RNA纳米颗粒相结合,与食物和幼虫摄取。这种技术上简单,高通量,并且相对便宜的方法,这是与长双链RNA(dsRNA)的或小的干扰RNA(siRNA)分子相容,已经使用了若干在A中不同基因的成功击倒冈比亚和A.伊蚊幼虫。以下幼虫喂食,击倒,这是通过定量RT-PCR或原位杂交证实,可以持续至少通过后期蛹期。这种方法可以适用于各种各样的蚊子和其它昆虫物种,包括农业害虫,以及其它非模式生物。除了其在研究实验室工具,在未来,脱乙酰壳多糖,一种廉价,无毒和可生物降解的聚合物,有可能被利用在该领域。
Introduction
在按蚊和Aedine属血液喂养蚊子传播负责几个人类的祸害最严重的致病因子。据估计,3.4十亿人的风险感染疟疾,负责每年全球有超过一半万人死亡。从感染疟疾结果由疟原虫属寄生虫,这是通过按蚊属感染的蚊子,包括主要的非洲病媒冈比亚按蚊 (叮咬传播给人类http://www.who.int/topics/malaria/en/ ,2014)1。 埃及伊蚊是登革热病毒,导致登革热,一种非特异性发热性疾病是世界上最普遍和显著虫媒病毒病的主要蚊子。登革热病毒是目前为> 2.5十亿人在热带地区的威胁,与每年inciden每年24000人死亡导致大约〜50000000案件CE( http://www.cdc.gov/dengue/ ,2014)2。尽管蚊子传播的疾病,对人体健康的毁灭性的全球影响,预防和治疗这些疾病的有效手段缺乏。灭蚊是目前预防疾病的最佳方法。
用于控制通过媒介昆虫的遗传操作节肢动物传播的疾病的可能性已经认识超过四十年3。 A.转基因品系伊蚊设计有一个阻遏女性特有的飞型近期取得的潜力,利用转基因矢量控制策略成为现实4-6。这些进步都质疑研究人员确定了矢量控制和蚊子操纵基因功能的补充手段新的基因目标。基因表达ð维修uring发展,是女性飞蚊4的情况下,可能会促进新的矢量控制策略的阐释。但是,这主要是由于技术上的挑战,很少基因的功能已被鉴定A.发展过程中冈比亚,埃及伊蚊,或其他蚊种。
自从发现C.线虫 7,RNA干扰(RNAi),这是保守的动物,植物和微生物,已被广泛用于功能基因研究中的各种生物,包括昆虫8,9。 RNAi途径由Dicer酶,它劈开长双链RNA进入开始充当序列特异性RNA干扰短20-25个核苷酸长的siRNA。的siRNA沉默基因是在互补序列通过促 进转录周转,裂解和翻译9的中断。长的dsRNA分子(通常为300-600碱基对)或定制的siRNA靶向particulař序列可用于在研究实验室用于沉默感兴趣的任何基因。当通过RNA干扰交付管理,研究人员可以控制时间,其中的基因沉默发起。因为它可以用来克服的挑战,如发育杀伤力或无菌,可阻碍生产和维护菌株轴承可遗传突变,一个昂贵的和劳动密集的过程,目前尚未在所有昆虫种类可用的这个优点是非常有用的。虽然基因沉默的RNA干扰的程度可以从基因而异基因,组织对组织和动物动物,RNAi技术被广泛地用于基因蚊子和其它昆虫8,9的功能分析。
三个干扰RNA递送策略已用于蚊子:显微注射,浸泡/局部施用,并摄取。进行了详细的历史和在昆虫中使用这三种技术中的比较,请参阅Yu 等人 8。 W¯¯E具有成功地使用显微注射10作为递送的siRNA的一种手段,以靶向A.发育基因伊蚊胚胎,幼虫,蛹和11-14。然而,这种劳动密集型的投放策略同时需要显微注射的设置和熟练的手。此外,显微注射是压力的生物体,一个混杂因素,特别是当行为表型进行评估。最后,显微注射递送不能扩展到田间进行矢量控制。作为替代,浸泡在干扰RNA溶液中的生物也成为一种流行的诱导基因沉默的手段,因为它是方便的,并且需要很少的设备或劳力。浸泡已经主要是在昆虫细胞系被应用研究8,但在最近的一项研究,在击倒A.达到伊蚊幼虫浸入dsRNA的15,其中动物似乎是摄取的溶液。然而,对于涉及多个experimenta的分析研究升组或表型,浸泡是相当昂贵的。洛佩兹-马丁内斯等人 16描述补液驱动的RNAi,一种新的方法来干扰RNA交付,涉及脱水生理盐水补液和用含有RNA干扰一滴水。这种方法并切断与整个动物浸没相关的成本,但是比注射更昂贵,并且可以将其应用到可容忍高渗透压物种的限制。此外,它是很难设想如何浸没或脱水/再水化浸渍方法可适于在磁场矢量控制。由于这些原因,用于后胚胎的研究,递送干扰RNA与摄入食物是一种可行的替代策略。
虽然摄入为基础的战略并不适用于所有的昆虫种类,也许最值得注意的是果蝇 ,口服给药干扰RNA与食物混合促进基因SIlencing在各种昆虫8,17,包括A.伊蚊成年人18。我们在A.描述壳聚糖纳米介导的RNA干扰冈比亚幼虫19,并已成功地应用这种方法为A.降低基因表达伊蚊幼虫20,21。这里,方法为这个RNAi的过程,这涉及截留通过聚合物壳聚糖干扰RNA的,是详尽。脱乙酰壳多糖/干扰RNA纳米颗粒通过聚阳离子的自组装通过氨基的脱乙酰壳多糖中的正电荷和由磷酸基团上的干扰RNA 19的骨干承载负电荷之间的静电引力干扰RNA形成。所述的程序是与两个长的dsRNA分子(以下简称为双链RNA)或双链的siRNA(以下简称为干扰)兼容。以下的合成,脱乙酰壳多糖/干扰RNA纳米颗粒混合,幼虫的食物,并传送到幼虫通过口服。这种方法相对便宜,只需要很少的设备和劳动力19,并有利于多种表型,包括行为20,21的分析的高通量分析。这种方法,可以适用于在其他昆虫,包括其它疾病的载体和昆虫农业害虫的基因沉默研究,有可能在各种其他动物物种的用于基因沉默。此外,脱乙酰壳多糖,一种廉价,无毒,可生物降解的聚合物22,有可能被利用在该领域为物种特异性蚊虫控制。
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Protocol
1.蚊种和饲养
- 维持A.冈比亚 G3和A.伊蚊利物浦IB12菌株(在下面的代表性研究中使用),或者根据标准的实验室实践或如先前23,24描述的其它感兴趣的菌株。
2.双链RNA和siRNA设计与制作
- 设计引物来构造特定的感兴趣的基因长的dsRNA模板。使用E-的RNAi工具25。根据选择或作为该方法产生的dsRNA先前所述19。
- 对于阴性对照,合成的dsRNA 19对应于绿色荧光蛋白(GFP),β半乳糖苷酶(β-GAL)或一些不表达于蚊子其他基因的序列。如果需要的话,19的dsRNA用于生成摘要如下代表性的结果可被用作阳性对照。商店的dsRNA溶解在无RNA酶的水在-80℃下直到需要。
- 或者,根据标准实验室实践设计基因特异性siRNA或如前面10所描述。加扰击倒的siRNA的序列来设计阴性对照siRNA不对应于任何蚊基因。购买定制的siRNA,这些都可以通过一些信誉良好的供应商。
- 如果需要的话,siRNA的20,21用于获得下面总结了代表性的结果可被用作阳性对照。商店的siRNA溶解在无RNA酶的水在-80℃直到需要。
3.准备壳聚糖/干扰RNA纳米粒子
- 收集预制备的RT 100mM的硫酸钠(100毫用Na 2 SO 4在去离子H 2 O)和0.1M乙酸钠(0.1M NAC 2 H 3 O 2 -0.1 1M乙酸,pH 4.5的去离子H 2 O)缓冲区。
- 壳聚糖溶解(≥75%脱乙酰化)的0.1M乙酸钠缓冲液,使0.02%(重量/体积)的工作溶液,并在使用前保持该溶液在RT。
- 溶解的dsRNA或siRNA在50μl去离子H 2 O和它添加到100mM的硫酸钠缓冲剂使32微克每100微升的50mM硫酸钠的dsRNA / siRNA的的100微升溶液中。
- 加入100微升的脱乙酰壳多糖溶液,以所述dsRNA / siRNA的溶液中,然后加热的水浴中的混合物在55℃下1分钟。设置了控制通过加入100微升的50mM硫酸至100μl的脱乙酰壳多糖溶液的钠,并按照相同的程序。
- 立即混合溶液30秒由高速涡流在RT以促进纳米粒子的形成。
- 在13000×g离心离心混合物10分钟,在RT下,在这之后时间的颗粒应该是可见的。将上清液转移到一个新的1.5毫升管。用它来制备蚊子食前空气干燥沉淀在室温≈10分钟。
- M通过使用上清液从控制(见3.5)作为空白来计算的dsRNA / siRNA的那保留在上清液中的总量easure的dsRNA / siRNA对上清液中的浓度。使用的dsRNA / siRNA的的起始量和残留在上清液来计算的dsRNA / siRNA对截留在纳米颗粒的百分比的量之间的差。这装载效率通常在90%以上。
- 如果需要更多的纳米粒子重复相同的过程。立即用干的纳米粒子。之前使用的颗粒冷库的影响尚未评估。
4.准备蚊子食物含壳聚糖/干扰RNA纳米粒子
- 制备1ml的2%的琼脂糖溶液(重量/体积)在去离子水中,熔化琼脂糖,并保持熔化的琼脂糖溶液在55℃的水浴后使用。
- 混合鱼食品薄片(47%的粗蛋白,最小值粗脂肪10%,最大粗纤维3%)和干酵母在1(重量/重量):2的比例。研磨该混合物以用研钵和研杵(及格通过50号美国标准试验筛)的小颗粒。使用地面食品,这应该是带褐色的颜色,或者立即或者在密封容器中储存于4℃几周。
- 在1.5ml管中,混合6毫克地面食品与来自第3.7节用牙签将干燥的纳米颗粒。
- 加入30微升2%的预熔化的琼脂糖凝胶溶液的食品的纳米粒子混合物;用牙签或枪头立即,充分搅拌。
- 使用含有食品和纳米颗粒立即喂养蚊子幼虫的凝胶。可替换地,一旦将凝胶在室温下完全固化,储存于4℃的凝胶,并使用第二天,或在-80℃以备后用。
5.饲养蚊子幼虫食含壳聚糖/干扰RNA纳米粒子
- 喂养A.冈比亚蚊子幼虫:
- 删除SI从1.5 ml管使用牙签切成使用干净的刀片或牙签6等于切片ngle凝胶颗粒。
- 转让20第三龄幼虫到含有100毫升去离子水的500毫升的培养皿。
- 加入每一天四天培养皿一次凝胶颗粒(切碎成小块)的一个切片喂蚊子幼虫。请务必遵守幼虫取食的颗粒,应在尺寸显著减少或第二天完全不存在。时间之后,蚊子就会发展成晚期第四龄幼虫。
- 记录在实验过程中的任何明显的表型变化。审查的转录水平和其他表型的改变为在第6在四个天期间的结束讨论。
- 喂养A.伊蚊孑孓:
- 切凝胶粒料成使用干净的刀片或牙签6等于切片。
- 卵孵化后,科幻放置50岁同步24小时首先龄幼虫成≈40毫升去离子水的培养皿。
- 饲料每培养皿中的幼虫一个片4小时/天,然后回到幼虫转移到正规的幼虫饮食的2:1地面鱼食片和干酵母一天的休息。每天在整个4龄幼虫重复上述步骤。
- 检查转录水平和其他表型的改变,如第6,在预期的发育时间点讨论。
6.确认基因敲除的
- A.在通过定量RT-PCR相对定量成绩单伊蚊和A.冈比亚幼虫。
- 执行与如上所述11,19,20,或按照标准实验室程序在至少10汇总控制与实验幼虫分析定量RT-PCR测定具有三个生物学重复。代表性的结果包括在下面。
- 对于特定的组织类型/身体部分( 即 ,脑或天线),射孔的分析RM QRT-PCR如6.1.1以下解剖描述来恢复感兴趣的组织(例如,参见迈索尔等人 21)。
- 通过原位杂交确认击倒
- 合成地高辛标记的反义,并根据标准的实验室实践或描述26感知控制的核糖核酸探针。
- 执行在每豪根等人的 27协议原位杂交确认击倒如前所述11,20和在下面的代表性结果部分中讨论。
- 通过免疫组化确认击倒
- 如果是可用的抗基因靶向的蛋白质产物,进行免疫组化分析,如前所述28,这有利于识别与击倒的表型分析20的最大水平的个体中例举的representati已经下文结果部分。
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Representative Results
冈比亚按蚊:
壳聚糖/双链RNA纳米颗粒由于脱乙酰壳多糖的氨基和dsRNA的磷酸基团之间的静电相互作用形成。 dsRNA的掺入效率为纳米粒子通常为90%以上,是因为通过从溶液耗尽dsRNA的测量。原子力显微镜图像表明,在直径壳聚糖的dsRNA粒径的平均值为140nm,从100-200纳米( 图1)。
图1.纳米粒子的形成壳聚糖和干扰RNA。壳聚糖/纳米双链RNA(A)或不加双链RNA(B)的壳聚糖溶液的原子力显微镜图像。图像的尺寸为1.0微米×1.0微米。比例尺= 250纳米。e.com/files/ftp_upload/52523/52523fig1large.jpg“目标=”_空白“>点击此处查看该图的放大版本。
饲养这些颗粒相结合,与标准的幼虫的食物,并纳入琼脂糖支持正常幼虫发育。重要的是,外胚层衍生AgCHS1转录特异性击倒以及肠特异性AgCHS2( 图2)是可能的19,这表明dsRNA的吸收通过纳米颗粒的摄取会启动RNA干扰超出肠。击倒效率≈40-60%观察到( 例如 , 图2)和转录之间变化。
几丁质合成酶2(AgCHS2)的dsRNA的摄入后图2转录水平 <EM> A.冈比亚幼虫。AgCHS2的相对mRNA水平取食纳米粒子DS AgCHS2或控制DS GFP。数据是来自三个独立生物学重复表示为平均值±标准差。在酒吧不同的字母表示基于配对t检验(P = 0.003)显著的差异。
AgCHS1击倒显著降低第四龄幼虫的几丁质的总含量,增加的易感性的几丁质合成抑制剂杀虫剂,灭幼脲19,AgCHS2击倒显著增加calcofluor白色的效果和二硫苏糖醇而扰乱了围食矩阵(PM)的四龄幼虫( 图3),导致死亡率增加17。
AgCHS2摄入纳米粒子A.冈比亚围食矩阵(PM)的渗透性。Calcofluor白或DTT处理破坏A的PM 冈比亚幼虫其通过脱乙酰壳多糖的摄取进一步exuberated由AgCHS2击倒/双链RNA纳米颗粒19。(A)的蚊子与完整AM。(B)的蚊子与打乱下午,葡聚糖蓝泄漏到胃ceacae。
埃及伊蚊:
壳聚糖/ siRNA的纳米颗粒被用来针对轴突导向的基因信号蛋白-1A(sema1a)A.在伊蚊幼虫发育20。 sema1a的击倒通过原位杂交,其检测到降低sema1a的水平的幼虫大脑屁股≈60%,证实ESSED并没有检测到sema1a表达敲除动物的大脑≈40%( 图4C与B;黄色箭头表示触角叶)。上汇集整个动物进行的qRT-PCR测定显示,该技术导致了sema1a转录32减少±10%相比,控制纳米颗粒喂养的动物( 图4A,P <0.01基于配对t检验中,N = 5,其中N是生物学重复的次数)。通过蛹发展中的至少24小时击倒在大脑中持续,就证明了抗Sema1a抗体表达( 图4E1与D 1),其用于在幼虫和蛹的嗅觉表现型分析,以确定动物显著击倒的损失。幼虫和蛹的触角叶缺陷(量化表1)中sema1a拦截幼虫和蛹进行检测( 图4E2,E3与图4E2与D2,可视化与mAbnc82;两个信号的叠加显示在图4D3,E3)。两个独立的sema1a击倒的siRNA,这有助于确保观察到的缺陷不是异地用两种siRNA干扰的结果生成相媲美的表型。生成击倒的最高水平时的siRNA合并,可用于提高击倒效率的策略(参见迈索尔等人 20为更详细说明)。
图4.壳聚糖/ siRNA的诱导sema1a击倒A中的显影嗅觉系统伊蚊。定量RT-PCR(A)和原位杂交(B,C)分析证实sema1a在幼虫击倒馈送sema1a靶向siRNA 890和siRNA 1198壳聚糖/干扰RNA纳米颗粒与对照纳米颗粒的混合物。 Sema1a表达缺失导致肾小球的变形(E1-3与D1-3)。详见说明书。背是在所有面板。比例尺= 25微米。这个数字最初出现在迈索尔等 20。 请点击此处查看该图的放大版本。
幼虫 | 蛹 | |||||
的siRNA | ñ | <STRONG>野生型 | AL缺陷 | ñ | 野生型 | AL缺陷 |
控制 | 69 | 69(100%) | 0(0%) | 68 | 68(100%) | 0(0%) |
sema1a KD | 77 | 42(54.5%) | 35(44%)* | 75 | 51(68%) | 24(32%)* |
表1.量化以下sema1a击倒触角叶的缺陷。结果控制获得的编制汇总的siRNA与sema1a击倒(KD)的siRNA 890 +的siRNA共有两种幼虫进行8个重复实验,1198壳聚糖纳米颗粒喂养的动物(左)和蛹(右)示出。总评估(n)的个人和动物展示野生型形态与触角叶(AL)的缺陷(嗅觉受体神经元定位缺陷,有缺陷的神经毡及肾小球形成)的数量/百分比数表示。击倒免疫组织化学证实用抗Sema1a抗体染色的动物(15幼虫和蛹10),所显示的最严重的缺陷的一个子集(标注有*)。以这种方式评价所有击倒动物被发现具有降低Sema1a的水平,而Sema1a水平控制喂养的动物并没有明显改变。此表最初出现在迈索尔等 20。
在第二个调查21,壳聚糖/ siRNA的纳米颗粒使用的嗅觉系统的开发过程为目标的转录因子专一(SIM)。定量RT-PCR检测与整个动物解剖脑池表示,SIM击倒大脑有平均47%的reducti在比较的sim转录控制纳米颗粒喂养的动物(p = 0.005根据配对t检验)。可比的测定与天线透露,平均一个在SIM卡的水平减少了77%,相对于控制喂养的动物(P = 0.002基于配对t检验)。尽管在组织和动物之间击倒的水平一些可变性,SIM转录物不通过下列与两种不同的siRNA敲低( 图5B2,B3,C2治疗检测到的原位杂交在击倒动物大脑/触角≈50%, C3与B1,C1,表2)。在酵母中的行为试验期间,这被吸引到酵母个人被授予的1分,而没有引起动物给予0分,平均分数为430 SIM卡或SIM 718敲除动物SI比对照喂养的动物在2重复实验的gnificantly下( 图5A,P <0.001根据配对t检验)。有缺陷的气味跟踪行为( 图5A)与卡的水平降低,在天线( 图5B2,B3与B1)和大脑( 图5C2相关,C 3与C 1,黄点标记触角叶的周界; 参见表2结果定量)。多个缺陷的天线和SIM击倒动物的触角叶鉴定(见迈索尔等人的详细资料。21)。例如,SIM卡击倒幼虫和蛹缺乏ORCO,专性共受体的所有气味受体在嗅觉受体神经元( 图6)的表达。与SIM卡430(喂人被检测减少ORCO转录水平图6A3,B3),或SIM 718( 图6A4,B4)的击倒(KD)脱乙酰壳多糖/ siRNA的纳米颗粒(比较于野生型动物在图6A1,B1和控制壳聚糖/ siRNA的纳米颗粒喂养的动物, 如图6A2,B 2)。经过至少24小时蛹形成( 图6B1-B4)后,在L4幼虫( 图6A1-A4)观察ORCO表达型的损失持续。
图5. SIM击倒幼虫显示有缺陷的气味引诱行为。 原位杂交揭示了SIM RNA水平减少了天线(B2,B3)和大脑的SIM(C2,C3)430和SIM 718击倒动物(比较来控制喂养在B1,C1),它未能对酵母臭气物质引诱(A)的反应。详见说明书。天线的近端在B1〜B3向上导向。背在C1-C3向上为主。比例尺= 25微米。这个数字最初出现在迈索尔等[21]。 请点击此处查看该图的放大版本。
图6.在显影A.损失ORCO表达在个人FE检测伊蚊天线以下的SIM击倒。ORCO成绩单水平降低ð与SIM卡430(A3,B3)或SIM卡718 (A4,B4)击倒(KD)脱乙酰壳多糖/ siRNA的纳米颗粒(比较于野生型动物在A1,B1和控制壳聚糖/ siRNA的纳米颗粒喂养的动物中A2,B2)。详见说明书。比例尺= 25微米。这个数字是从发表在迈索尔等 21图像编辑。 请点击此处查看该图的放大版本。
吸引 | 没有引起 | ||||||||
的siRNA | ñ | #动物 | 正常 | 温和 | 零 | #动物 | 正常 | 温和 | 零 |
控制 | 195 | 196(100%) | 196(100%) | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
SIM 430 KD | 176 | 63(35%) | 48(76%) | 15(24%) | 0 | 113(64%) | 20(18%) | 12(11%) | 81(71%) |
SIM 718 KD | 177 | 66(37%) | 44(66%) | 22(34%) | 0 | 111(63%) | 20(18%) | 9(8%) | 82(74%) |
表2.等级SIM第关联与在酵母行为检测幼虫的表现。在四个酵母的气味引诱获得结果的汇总编制复制实验显示。动物(n)的总数表示未在这些行为分析测试个体幼虫的数目。个别幼虫的数量(#动物)被吸引的(左;动物感动酵母沉淀,并获得1分),或者没有引起(右;动物没有触及酵母沉淀并获得0分)各条件下(对照,SIM 430 KD,或SIM 718 KD壳聚糖/ siRNA的纳米颗粒进料)被示出,并且总动物的百分率都包括以下的原始数据。 SIM卡的击倒通过原位杂交评估在大脑和动物的触角吸引(左)还是不吸引(右)的酵母。该生数/个人与正常比例(相当于野生型SIM转录水平),空(没有观察到SIM成绩单),或中度(减少,但不是野生型)SIM水平表示。 SIM的损耗以及相关的缺乏吸引力的酵母。此表最初出现在迈索尔等[21]。
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Discussion
脱乙酰壳多糖/干扰RNA纳米颗粒本文所描述的方法已被用于在A中幼虫发育期间有效地针对基因冈比亚 ( 图2,3)和A.埃及伊蚊 ( 图4,5,6,表1,表2)。壳聚糖的纳米颗粒可以与任一长的dsRNA或siRNA,这两者已被成功地用于在蚊子就证明了这里所描述的代表性的结果来制备。 dsRNA的合成比购买的siRNA更便宜,但更耗费人力。如果脱乙酰壳多糖/ siRNA的被使用时,表型可以与多个的siRNAs被确认,从而更好地保证发现的表型不是由于场外定位。此外,商业化生产的siRNA集体可更好地促进扩大壳聚糖/干扰RNA沉默的种属特异性蚊虫控制领域。当然,这将需要克服obsta克莱斯如成本和交付。
虽然我们有着良好的成功与该协议,方法必须为每个基因进行优化。出于这个原因,我们建议测试多个的siRNA,或也许有siRNA和很长的双链RNA,在一个新的项目开始。一旦表型鉴定,并与对应于感兴趣的基因的至少两个不同的siRNA证实,它可能是有用的,以结合这些siRNA来增加表型的外显率( 图4)。定时,也壳聚糖的持续时间/干扰RNA供给时间可以为每个研究A.进行优化。 冈比亚茁壮成长时仅与脱乙酰壳多糖馈送/如本文所述干扰RNA的食物。然而,在实验中,我们已经执行迄今为止,A。伊蚊的日子并不好过没有补充营养,我们通过壳聚糖后4小时将它们转移到一个饮食正常的食物/干扰RNA喂养克服的一个问题。尝试用壳聚糖/干扰在不同的食品基质RNA传递,这是我们还没有尝试,可能会解决这个问题。我们已经发现,4小时每天喂养在数天的过程中导致击倒和足够的营养之间的良好平衡,但馈送的持续时间的修改,可以根据需要进一步探讨。另外,幼虫龄,其中脱乙酰壳多糖/干扰RNA纳米颗粒馈送开始/继续可以针对这取决于基因功能进行检查,该协议的主要优点的临界发育期间的各实验。
击倒的验证是当然关键的,但也可能需要排除故障。出于这个原因,它可能是有用的同时检查是否正在生成感兴趣的表型如击倒效率被评估。对于QRT-PCR验证实验,即引物和PCR条件进行了优化,这是至关重要的。此外,重要的是,动物是发育在实验的开始同步,如一些成绩单的表达能够在开发过程中变化多端,由于昼夜节律29。此外,虽然这种技术显然生成击倒超出肠道,我们才刚刚开始,以评估此技术是有效的组织,这可能物种之间有所不同。因此这将是测量击倒在特定组织中,这可以通过解剖,从整体动物的qRT-PCR测定或兴趣组织原位杂交来实现通过( 图4-6)20,21和免疫组化( 图4)20有用试验(见豪根等27克莱蒙斯等 28,分别为排除这些协议)。由于击倒因个体而不同,它是执行双标记实验,以评估在与敲低的水平组合的表型有帮助的(Figu再4)20,极大地方便了表型特征。对于行为研究,击倒的水平在个体动物可以与它们的行为表现( 表2)20,21。
下面壳聚糖介导的RNA干扰交付给A.埃及伊蚊幼虫,减少基因表达在蛹发育24小时( 图4,6)20,21检测到。尽管基因表达水平尚未以详细的方式评估超过该点的发展,基因表达水平的降低已经在这两个48和72小时A.已检测伊蚊蛹(KM,未发表)。这将是有益的追求击倒水平的更详细的分析,在A的多个阶段伊蚊蛹的发展,也评估A.冈比亚蛹。这也将是有趣的,以确定是否击倒坚持成人和探索纳米介导的terfering RNA交付策略成蚊。
网站特异性核酸基因打靶的方法,最近推出A.伊蚊和A.冈比亚 ,并允许在蚊子和其他非遗传模式生物30,31的针对性,遗传突变的产生。虽然使用这些方法允许功能表型的更均匀的损耗分析,过RNA干扰方法的优点,筛选感兴趣的突变仍然是相当耗时且劳动密集的。此外,虽然功能研究的RNAi损失需要维护的唯一的野生型菌株,突变株蚊必须单独饲养。隐性致死或者成人不育突变维护目前具有挑战性鉴于目前缺乏蚊子标志着平衡器。因此,尽管位点特异性核酸酶基因打靶方法正在迅速得到普及,脱乙酰壳多糖/干扰靶向可以是最优的核糖核酸不具备维护蚊子株实验室和案例选择哪个基因功能的开发过程中的损失与应变的生存是不相容的。
根据我们的研究结果,我们预计,脱乙酰壳多糖/干扰RNA可广义A的开发过程中使用的许多不同的基因敲除冈比亚,埃及伊蚊,以及其他昆虫,和潜在的其它非遗传模型生物。成功的基因沉默与脱乙酰壳多糖/干扰RNA已经报道在其他节肢动物物种,包括斑节对虾 (虾)32。最近的一项研究表明,纳米颗粒有利于dsRNA的吸收,从而提高了抑制效率与双链RNA在亚洲cornborer 33,这突出的潜在使用此技术来定位农业害虫直接喂养相比。可能使用的siRNA的纳米粒子作为人类治疗的是吸引了大量Ø˚F兴趣在医学界。 Giljohann 等 34中所述的多价的RNA金纳米颗粒缀合物,其具有6倍更长的半衰期相比,释放的dsRNA和容易地进入细胞的合成和表征。 Davis 等人 35描述涉及使用纳米颗粒递送系统向实体瘤患者的siRNA的全身施用所述第一人的临床试验,并用脱乙酰壳多糖/ siRNA治疗的最近综述36的可能性。因此,壳聚糖/ RNA干扰基因打靶技术是一种宝贵的实验室技术有潜力为更广泛的应用。未来的研究将探讨该技术的其他应用程序。此外,脱乙酰壳多糖和其它聚合物,一个活跃的研究领域的化学改性,可能会增加干扰RNA递送的效率或允许靶向递送到特定组织37。
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Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.02 ml pipetteman | Rainin | PR20 | for resuspension of interfering RNA |
0.2 ml pipetteman | Rainin | PR200 | for resuspension of interfering RNA and preparation of interfering RNA/nanoparticles |
0.5 ml graduated tube | Fischer Scientific | 05-408-120 | for aliquoting resuspended interfering RNA |
1 ml pipetteman | Rainin | PR1000 | for resuspension of interfering RNA and preparation of interfering RNA/nanoparticles |
1.5 ml graduated tube | Fischer Scientific | 05-408-046 | for preparation of interfering RNA/nanoparticles |
1M Sodium Acetate, pH 4.5 | TEKnova | S0299 | to prepare sodium acetate buffer |
Acetic Acid, AIRSTAR. ACS, USP, FCC Grade | BDH | VWR BDH3092-500MLP | to prepare sodium acetate buffer |
Agarose Genetic Technology Grade | MP Biomedicals LLC. | 800668 | to coat prepared interfering RNA/nanoparticles |
Centrifuge | Eppendorf AG | 5415D | to pellet interfering RNA/nanoparticles |
Chitosan, from shrimp shells | Sigma-Aldrich | C3646-25G | to combine with interfering RNA for prepararation of interfering RNA/nanoparticles |
Dry Yeast | Universal Food Corp | NA | to prepare mosquito larval food with interfering RNA/nanoparticles |
E-RNAi tool | German Cancer Research Center | NA | for design of dsRNA; http://www.dkfz.de/signaling/e-rnai3// |
goldfish food | Wardley | Goldfish FLAKE FOOD | to prepare mosquito larval food with interfering RNA/nanoparticles |
Heated water bath | Thermo Scientific | 51221048 | to heat the interfering RNA/nanoparticles at 55oC |
Ice | not applicable | not applicable | for thawing interfering RNA and preparation of interfering RNA/nanoparticles |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Ice bucket | Fisher Scientific | 02-591-44 | for storage of ice used during the procedure |
liver powder | MP Biomedicals LLC. | 900396 | to feed mosquito larvae post interfering RNA/nanoparticle treatment |
Microwave oven | A variety of vendors | not applicable | to prepare 2% agarose solution |
petridish (100 x 15 mm) | Fischer Scientific | 875713 | interfering RNA/nanoparticle feeding chamber for larvae |
pH meter | Mettler Toledo | S220 | for preparation of buffers |
Razor blade | Fischer Scientific | 12-640 | to divide the interfering RNA/nanoparticle pellet for feedings |
siRNA | Thermo Scientific/Dharmacon | custom | for preparation of siRNA/nanoparticles |
Sodium Sulfate, Anhydrous (Na2SO4) | BDH/distributed by VWR | VWR BDH0302-500G | to prepare 50 mM sodium sulfate solution in which the interfering RNA will be resuspended |
Thermometer | VWR | 61066-046 | to measure the water bath temperature |
Tooth picks | VWR | 470146-908 | for stirring during interfering RNA/nanoparticle food preparation and cutting gel pellets |
Ultralow freezer | A variety of vendors | not applicable | for storage of interfering RNA aliquots and interfering RNA/nanoparticles at -80oC |
Vortex mixer | Fischer Scientific | 02-216-108 | for preparation of chitosan/interfering RNA |
Weight paper | Fischer Scientific | NC9798735 | to divide the interfering RNA/nanoparticle pellet for feedings |
References
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