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Neuroscience

Published: May 28, 2015 doi: 10.3791/52537

Introduction

以下に記載されたプロトコルの目的は、細胞型特異的遺伝子発現、タンパク質発現、あるいはエピジェネティックマーカーのその後の分析のために、神経組織の不均質な集団から個々の細胞型を単離することです。脳は、異なる前駆細胞に由来する多くの細胞型で構成され、それは、細胞型特異的な特性及び機能を有します。これらの違いにもかかわらず、これらの異なる神経細胞型は、測定または従来の方法を使用して、細胞型特異的に解釈することは困難で、これらの複数のユビキタスタンパク質の分析を行う類似の受容体および細胞内シグナル伝達分子を発現することができます。神経科学者は、脳内のこれらの異なる細胞型の機能および活性化を識別する必要があり、これは最終的には神経学的および神経精神疾患のためのより具体的な薬剤および治療標的を同定するための最初のステップになるように、彼らは個別に動作に影響を与えることができる方法。 Tにもかかわらず、神経科学研究の彼の包括的な目的は、遺伝子またはタンパク質発現、シグナル伝達分子の活性化、またはDNAにエピジェネティックマーカーの修飾を分析するための脳からの個々の神経細胞型を単離することは困難であっできます。細胞型特異的マーカーの追加の染色と組み合わせた場合、これは適切にタンパク質を染色することができる特異的な抗体に依存しているが、現在使用されている技術のうち、免疫組織化学は、細胞型特異的な様式でタンパク質の発現を同定することができます興味のある、それはin situハイブリダイゼーションでは 、脳内の個々の細胞内メッセンジャーリボ核酸(mRNA)の特定の局在を同定することができる。定量化することは困難であるが、これは、特定の細胞型の同時分析を制限する骨の折れるプロセスであり、のみ関心のある1または多分少数の遺伝子の分析を可能にします。レーザーキャプチャーマイクロダイセクションは、視覚化される細胞の亜集団を単離するためにレーザーを使用して顕微鏡を介して、しかし、このプロセスの時間がかかり、自然と比較的低い収率が著しく、これらの分子の発現はそもそも低い場合は特に、タンパク質またはmRNAレベルのその後の分析を制限することができます。蛍光活性化細胞選別(FACS)は、神経科学の分野では比較的新しい技術は、遺伝子発現1および/ ​​またはエピジェネティックなターゲット2のその後の分析のために脳からの個々の細胞型を単離することです。このプロセスは、細胞型特異的遺伝子発現、タンパク質発現、またはエピジェネティックマーカーのその後の分析のために神経細胞の特定のタイプを分類するために使用することができます。 FACSは、物理的または生化学的特徴3のいずれかに基づいて異なる細胞をカウントし、ソートするために、このような数十年のための癌および免疫学などの医学研究のフィールドの数で使用されています。また、フローサイトメトリー古典特異的な抗体を用いて、セルごとにタンパク質の発現を分析するために使用されているフロー。以下の手順は、分子生物学のエンドポイントの、その後の分析のために個々の細胞型を単離するために、古典的なフローサイトメトリー技術を利用します。フローサイトメーターは、上述した技術への迅速かつ効率的な代替手段になります第二に、数千の細胞を分析することができます。さらに、細胞は、特定のタンパク質(例えば、神経伝達物質受容体)、または2つ以上のタンパク質(特定の細胞型における複数のタンパク質の共局在化)の組み合わせの細胞の発現に基づいて単離することができます。これにより、ユーザは、脳内でそれらの機能を識別するために、それらの分子の特性に基づいて、非常に選択的な神経細胞タイプを単離することができます。

FACSを実施するために、神経細胞は、それらが光ビームと分析のためのレーザを通して単一ファイルを通過するように細胞を搬送し、整列フローセルを通過する単一の細胞懸濁液中に調製されます。コンピュータは、各セルとpからデータを取得します。指定されたパラメータ(サイズ、粒度、および蛍光)の分析のためのヒストグラム上たくさんそれを。これらのパラメータに基づいて、細胞はすぐに記憶し、所望の任意のエンドポイントの、その後の分析のために別々のチューブに選別することができます。以下に記載されているプロトコルは、(分化分子11B、のCD11b抗体のクラスタを使用して)(胸腺細胞抗原1、はThy1抗体を使用して)、ニューロン、アストロサイト(グリアグルタミン酸トランスポーター、GLT1抗体を使用して)、およびミクログリアをソートする3つの抗体を利用しています。以下に説明する、または1つが自分の実験のために隔離したい細胞のタイプに応じて異なる抗体で修飾されたように、このプロトコルを使用することができます。

このプロトコルは、特定の実験のために適切であるかどうかを判断する際に考慮すべきいくつかの注意事項があります。一つの大きな注意点は1つが隔離したい特定の細胞型に関係することができます。このプロトコルでは、使用される3つの抗体は、その細胞外の抗体であります実験者は、このように内部のRNA、DNAおよびタンパク質の完全性を維持し、染色手順の間、無傷の細胞型を維持することを可能にします。それは一つだけで、特定の細胞内で発現されるタンパク質を同定する抗体を使用して、特定の神経細胞型を単離することを望む可能性があります。例えば、1はヒドロキシラーゼをチロシンまたはコリンアセチルトランスフェラーゼに対する抗体を用いたアセチルコリン神経細胞を単離するために抗体を用いてドーパミン作動性ニューロンを分離することができます。これらのタンパク質は、細胞内であり、従って、適切な抗体を用いたその後の染色のために細胞膜の固定および透過処理を必要とします。これは、4,5の前に行われてきたが、このプロセスはかなりこれらの透過性細胞からのRNAまたはDNAの収量を減少させることができます。もう一つの注意点は、すべての抗体は、FACSに適していることであってもよいです。例えば、1は現在、ウェスタンブロットのために非常にうまく機能する抗体、Dを必要と技術を使用してもよいですタンパク質のenaturation。この抗体は、必ずしもタンパク質がこのプロトコルのいずれかの時点で変性されていないので、抗体は、その固有の抗原に結合する方法がないことが指定されたFACSを使用してこれらの細胞型の同定に適していないかもしれません。企業は、抗体が承認されたアプリケーションを特定仕様書を提供しています。抗体は、フローサイトメトリーのために承認されていない場合には、特定の抗体を用いて、このプロトコルを試みてから1を妨げるべきではありません。しかし、人はそれをFACSのために動作することが保証されていないことに注意する必要があります。このプロトコルの第三の注意点は1つが隔離しようとしている細胞の数に関係しています。 FACSは、組織の小さな作品から可能なほとんどの細胞を得るための優れた手法であるが、それは1つが比較的小さな脳の領域から細胞の比較的まばらな集団を単離する場合は、一匹の動物からの収量がすることも可能であり、本質的に低いこと。この場合には、とすることができますその後の分析のために必要な細胞数を得るために同一の治療群の数匹の動物からの脳組織をプールすることが必要。しかしながら、最近の刊行物は、遺伝子発現を分析することが可能であることを示す、より大きなセットソートニューロンから起動ニューロン(5〜6%)の少数の遺伝子発現のその後の分析のためのcDNAの遺伝子標的プレ増幅を使用してい動物6この技術の最後の警告を大量にプールすることなく、神経細胞の小さなサブセットから一つが離れすぎていないセルソーターへのアクセス権を持つべきであるということです。セルソーターは、それを適切に使用するにはかなりの訓練を必要とする複雑な機械です。したがって、これらのマシンは、多くの場合、中核施設で資格のある技術者によって運営されています。また、この手順の目標は、おそらく(、神経組織を解離特異的抗体のためにそれを染色し、直ちに短時間でソータにこれらのサンプルを取ることです半日)。この時間枠は、単離された細胞の生存率および収率を増加させ、後続の処理および分析のための細胞の完全性を維持するのに役立ちます。上述のこれらのパラメータの全てが満たされている場合、FACSは、神経組織からの遺伝子およびタンパク質の細胞型特異的発現を分析するための優れた方法です。

全ての実験は、実験動物の管理と使用に関するデラウェア大学の施設内動物管理使用委員会(IACUC)と健康ガイドの国立研究所に従って行いました。

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Materials

Name Company Catalog Number Comments
Neural Dissociation Kit (P) Miltenyi Biotec 130-092-628
Myelin Removal Beads II Miltenyi Biotec 130-096-733
LS Columns Miltenyi Biotec 130-042-401
QuadroMACS Separator Miltenyi Biotec 130-090-976
MACS MultiStand Miltenyi Biotec 130-042-303
Nylon Mesh Sheet Amazon CMN-0074-10YD 40 inch width, 80 micron size mesh
Fc Block / anti-CD32 BD Biosciences BDB550270 reactivity for rat
APC-conjugated CD11b antibody Biolegend 201809 reactivity for rat
Rabbit anti-GLT1 Novus Biologicals NBP1-20136 reactivity for rat or human
PE-conjugated anti-rabbit secondary antibody eBioscience 1037259 secondary antibody for anti-GLT1
FITC-conjugated anti-rat CD90 (Thy1) mouse antibody Biolegend 202504 reactivity for rat

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References

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Cite this Article

Schwarz, J. M. Using FluorescenceMore

Schwarz, J. M. Using Fluorescence Activated Cell Sorting to Examine Cell-Type-Specific Gene Expression in Rat Brain Tissue. J. Vis. Exp. (99), e52537, doi:10.3791/52537 (2015).

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