Protocol
Etikk uttalelse: Alle forsøkene er utført i henhold til retningslinjer fastsatt av Institutional Animal Care og bruk Committee (IACUC) ved Florida International University (IACUC 13-004).
1. EEG Recordings
- Klargjøring av EEG mini-cap
- Fordype elektrode tips av EEG mini-cap minst 12 timer i destillert vann med 0,2% klorid. Skyll EEG mini-cap forsiktig i destillert vann. Tørk hetten og elektrodene i luften.
- Mix EEG elektrodemasse med 0,9% NaCl-løsning i volumandelen av 2: 1. Tilsett en dråpe av metylenblått, noe som vil bidra til å visualisere elektrodemassen inne i elektrodene og på huden. Ta den blandede pastaen i en sprøyte. Pass på at det ikke er luftbobler i sprøyten. Injiser gelen inn i hver av 32 elektrodene, fylle dem uten å innføre luftbobler. Det anbefales å injisere fra bunnen i stedet for toppen. Dette gir bedre tilbess til hver elektrode og reduserer muligheten for gelen smitte over.
- Slå på EEG og fysiologiske opptak system, og åpne den tilsvarende innspillingen programvare på datamaskinen i bruk.
- Animal forberedelse og anestesi
MERK: Kronisk epilepsi ble opprettet ved hjelp av en protokoll for FCD 8 i Wistar rotter. EEG-opptak ble utført på voksne Wistar-rotter (8 uker gamle, 300-400 g).- Spill rotte vekt i et eksperiment ark. Bruk denne informasjonen til å beregne beroligende dose (dexdomitor 0,25 mg / kg). Innledning av anestesi i rotter med 5% isofluran og 100% oksygen (1 l / min ved 14,7 psi).
- Etter trimme rotte hode, redusere isofluran til 2% og opprettholde det under hele innstillingen av EEG mini-cap. Sjekk rotte reflekser er fraværende (toe-pinch). Plasser rotte på en varmepute i stereotaxic apparatet ved å feste øregangene bruker øret barer. Sørg for anestesi nesen membran er sikker.
- Apply smøremiddel oftalmisk salve til hvert øye.
- Barbere ekstra hår på rotte hode og ører å bruke en barberhøvel. Unngå blødning under barbering.
MERK: Noen hår igjen på huden vil produsere støy i EEG opptak. Gni rat hud med 90% isopropylalkohol for å stimulere blodårene og avfetter huden. - Plasser en saltvanns vattpinne i hodebunnen, og dekke det helt til å holde god hudledningsevnen til EEG mini-cap er klar til å bli plassert.
- Koble temperatur, respirasjon, og tre bly elektro sonder. Legg merke til at temperaturen blir målt av en rektal sonde. Kontinuerlig overvåke fysiologi av rotte under innspillingen prosedyrer. Kontroller at normal temperatur er 37 ° C, er respirasjon rekkevidde 30-60 pust per minutt, og pulsen er rundt 350-450 slag per minutt.
- Opptaksprosedyrer
- Fjern saltpinne på rotte hodebunn og plasser forberedt EEG mini-cap på huden sin. Fest mini-cap med gummistrikk. Plasser en gummistrikk på forsiden av hodebunnen, vanligvis foran øynene, og et annet bånd på baksiden av hodebunnen mellom ørene og nakke. Bruk en plastbeskyttelsen under halsen for å lette normal respirasjon.
- Sette et lag av høy ledningsevne elektrodemasse på både bakke- og referanseelektroder. Legg dem på det respektive øret.
MERK: Referanse elektroden kan muligens plasseres andre steder. - Koble EEG mini-cap til forsterkerne og observere en forhåndsvisning av arbeidsbenk for elektrodeimpedans. Sjekk resultatene for alle elektrodene. For en høykvalitets opptak, sikre at impedansverdien er i størrelsesorden 5-30 kohm. Hvis det er noen støyende elektroder, gir bedre kontakt med hodebunnen enten ved å bevege dem inne i stillaset mot hodebunnen eller forsiktig injisere mer gel fra toppen av elektroden.
- Administrere dexdomitor (0,25 mg / kg) intraperitoneally og umiddelbart redusere isofluran hastighet til 0%. Hvis respirasjonsfrekvensen er ikke innenfor 30-60 pust per minutt rekkevidde, begynne å øke isofluran rente forsiktig. Ikke overstige verdien av 1% isofluran. Overvåk dette trinnet nøye fordi blandingen av isofluran og dexdomitor kunne be dyrene til en kritisk tilstand.
MERK: På preklinisk modell av fokus epilepsi, påvirker isofluran IEDer, mens dexdomitor ikke. Fag under isofluran har svakere epileptogen eiendom, det vil si, kan relativt færre IEDer bli oppdaget i forhold til andre forhold 7,14. Den dexdomitor dose er effektiv i ca 2 timer. Derfor, for å spare tid for sin effekt, ble preparatet utført under isofluran. - Gjennomføre EEG opptak. Etter innspillingen, markerer posisjonene til de tre stikk sirkler av EEG mini-cap på toppen av huden ved å sette inn en farge penn inni dem før EEG mini-hetten er fjernet. Bruk dem som landemerker for MRI co-Registrering. Ta et bilde av rottehode med landemerker. Plasser rotte tilbake inne i buret og overvåke det til fullstendig gjenoppretting fra dexdomitor effekt.
NB: I dette forsøk ble rød farge (motstander farge til grønt) brukes for å skille fra elektrodeposisjonene (grønt). Imidlertid er det anbefalt å bruke andre farger (lilla / grønn) hvis små blødninger flekker er observert i huden.
Figur 1. Et bilde av EEG mini-hetten plasseres på en bestemt rotte.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
2. Brain Source Imaging
- IED klassifisering
MERK: IED deteksjon og klassifisering er utført ved hjelp egenutviklede koder i MATLAB basert påtidligere studie 15. Denne programvaren vil være tilgjengelig ved forespørsel.- Kast støyende kanaler ved visuell inspeksjon EEG sporstoffer. Fjern EKG gjenstander ved hjelp av en automatisk metode for periodisk bølgeform subtraksjon, som er basert på en mal og en korrelasjonsanalyse.
MERK: Vanligvis eksperimentator som spilte inn EEG deler skrevet eksperimentell ark for den observerte dårlig kanalinformasjon basert på impedansverdiene. Programvare for å fjerne EKG artefakter vil også være tilgjengelig ved forespørsel.
Figur 2. Et eksempel på EEG spor som viser forskjellige typer av IEDer. Den røde boksen indikerer en type IEDs.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Påfør et band-pass filter med cutoff frekvenser på 3 - 150 Hz og et hakkfilter for å fjerne nettfrekvensen (60 Hz generelt og 50 Hz i noen land) komponent frakoblet.
- Oppdage to typer IEDer (pigger og skarpe-bølger). Pigger og skarpe-bølger utgjøre store elektriske hendelsene i 20-70 ms og 70-200 ms varighet hhv. Derfor, etter å ha påført en respektive band-pass filter (cutoff frekvenser på 15 - 50 Hz for pigger og 5-15 Hz for skarpe-bølger), er IEDer oppdaget basert på amplitudeterskler 15.
MERK: Tersklene blir automatisk satt til 4σ som foreslått i forrige undersøkelse for multiunit aktivitet 15. Her er σ en anslått standardavvik av det båndpass-filtrerte signal, σ = median {| filtrerte signalet | / 0,6745}. - Under klassifisere pigger og skarpe-bølger i forskjellige grupper. De karakteristiske trekk ved ulike pigger og skarpe-bølger er hentet ved hjelp av wavelet transform 15. De er sub-klassifisert i flere klynger bruker k-midler,og det optimale klyngen tall k bestemmes ved hjelp silhuett.
- Gjennomsnittlig sub-klassifisert signaler i samme klynge. De gjennomsnittlige EEG-signaler for hver IED sub-type vil bli brukt for hjernen kilde analyse.
- Kast støyende kanaler ved visuell inspeksjon EEG sporstoffer. Fjern EKG gjenstander ved hjelp av en automatisk metode for periodisk bølgeform subtraksjon, som er basert på en mal og en korrelasjonsanalyse.
- Volume dirigent modell
MERK: For de neste avsnittene vil åpen kildekode, Brainstorm 12, brukes med MR atlas for Wistarrotter 9. Imidlertid kan enkelte rotte MR også brukes til å generere volumet leder modell hvis den er tilgjengelig. MR atlas 9 kan lastes ned på http://www.idac.tohoku.ac.jp/bir/en/ . Denne nettsiden gir atlas som Nifti format under "Wistar rotte MRI Atlas" delen, og det kan være tilgjengelig etter registrering. Den trengs for pre-prosessering programvare kan også finnes i dette nettstedet.- Input MR og hjernen overflaten til programvaren 12.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
- Generere hodeoverflaten med standardinnstillingen.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Generere hodebunn og indre / ytre skallen overflater basert på MR for bly feltet beregning 12.
MERK: Oppløsningen av topp-punktene påvirker nøyaktigheten av den estimerte kilde, men stort antall hjørner gir høy beregningskompleksitet. Anbefalt antall hjørner av hvert lag er 642 for akseptabel nøyaktighet med rettferdig beregningsorientert kompleksitet. Tykkelsen av skallen kan kontrolleres fra MRI, og i tilfelle av MRI atlas, er det omtrent 1 mm. Når du har lagt over verdiene i programvaren, tilsvarende trekant ansikt-vertex maskene for hver overflate vil bli opprettet.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Kontroller retningen og plasseringen av hver flate i forhold til MR ved hjelp av visualisering alternativet. Endre følgelig om noen flater er ikke co-registrert 12.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Bruk av rottehode bildet ervervet i 1.3.5. co-registrere posisjonene til de tre landemerker (R1, R2 og R3) i MRI. Bruk grid interessante landemerkene som henvisninger til generate elektrodeposisjonene som elektrodene er festet til stillaset (figur 3B).
Figur 3 (A) Rotte hode bilde anvendes for å oppnå elektrodestillinger og (b) den EEG mini-cap diagram med koordinatsystemet. Røde prikker i (A) viser landemerkene nevnt i 1.3.5. som svarer til de røde tallene i (B). Også, de grønne merkene i (a) viser de 32 elektrodeposisjoner, og de svarer til tallene i de blå (B).
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Generere N × 3 elektrode posisjon matrise basert på de tre landemerker. Her, N er antall kanaler (N = 32) og kolonnen representerer den tilsvarende x, y, og z-koordinatverdier.
MERK: EEG mini-cap er en stiv stillaset. Derfor, når de tre referansenett (R1, R2 og R3) oppnås, plassering av elektrodene er automatisk. Brukeren trenger bare å omdefinere Z-verdier på en måte som mini-cap er hensiktsmessig projisert på hodebunnen. De N punktnett kan nummerert som vist i figur 3b blå tall. Standarden stillas for EEG mini-cap er kommersielt tilgjengelig (Table of Materials). Programvaren for co-registrering er også tilgjengelig for samfunnet. - Input den genererte kanal filen.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Vise og bekrefte plasseringen av alle elektrodene. Endre noen feilplasserte elektroder 12. Den endelige koordinatsystem for den elektrode stillinger skal sammenfalle med koordinatsystemet som brukes for ovennevnte overflater.
MERK: Den opprettede overflater kan inspiseres visuelt på en MR ved hjelp av visualisering alternativ, og da vil en valgt overflate vises som gule linjen på MR "MR registrering Sjekk MR / overflateregistrering.". I tillegg kan de tre landemerker og de 32 elektrode stillinger skal vises på MR ved å velge verktøykassen valg, "Vise sensorer MRI Viewer." Stedene kan kontrolleres visuelt ved å sammenligne distribusjoner basert på rotte øye og øre steder ( figur 4).
Figur 4. (A) MRI atlas med co-registrerte hjernen overflate (gul linje), (B) opprettet volumet ledermodell med de flukt 32 elektroder og tre landemerker (røde prikker) og (C) MRI atlas med co-registrert ref erence grid R1.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
- Input MR og hjernen overflaten til programvaren 12.
- Brain Source Imaging
- Beregn bly feltet matrix 13. Inngangs de konduktivitetsverdier som tilfredsstiller forholdet av huden, hodeskallen, og hjernen som 1: 1/80: 1. Få ledningen feltet matrise basert på volumet lederen modellen og elektrodeposisjonene er laget i 2.2.
MERK: Verktøykassen 12 tilbyr grensesnitt mot annen programvare for å beregne BEM 10. Derfor er det bare de ledeevne kreves som input.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Inngangsgjennomsnitts EEG-signaler for hver IED sub-type som er lagret i 2.1.4.
"Src =" / files / ftp_upload / 52700 / 52700vis7.jpg "/>
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Skaff sLORETA løsning 13 basert på den beregnede bly feltet matrise og innspill EEG-signaler. Ved å velge kilden beregningsmetode alternativet, kan den inverse løsningen oppnås 12.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. - Plott de estimerte kilder.
- Beregn bly feltet matrix 13. Inngangs de konduktivitetsverdier som tilfredsstiller forholdet av huden, hodeskallen, og hjernen som 1: 1/80: 1. Få ledningen feltet matrise basert på volumet lederen modellen og elektrodeposisjonene er laget i 2.2.
Representative Results
Når alle prosedyrer er riktig utfylt, kan anslagsvis kilder visualiseres i hjernen overflaten av pre-klinisk modell. Figur 5 viser de estimerte kilder fra ett bestemt sub-type spikes (øverst) og skarpe-bølger (nederst) fra IEDer. I tillegg Figur 6 viser hvordan kildedistribusjons endringer i sekvensielle tidsrammer under et anfall etablering. Disse resultatene støtter evnen av de foreslåtte metoder for å ta opp høyoppløselig EEG på rotter med fokus epilepsi og å gjennomføre kilde analyse ved hjelp av tale EEG.
Figur 5. Estimert hjernen kilde steder av IEDer med hensyn til ulike klynger i pigger (øverst) og skarpe-bølger (nederst). (A) Tidsserier, (B) EEG topografi, og (C) kortikale nåværende sourCES. Evalueringen er utført på et bestemt tidspunkt merket med en rød vertikal linje i (A).
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet. 
Figur 6. Beregnet hjerne kilder under anfall. Er Tids øyeblikkene markert som røde vertikale linjer.
Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Discussion
En ny metode for ikke-invasiv record flerkanals EEG i en bestemt preklinisk modell av fokal epilepsi er beskrevet. Opplysningene for opptaks- og analyseprosedyrer, med konkrete eksperimentelle tips, er gitt. Det var viktige faktorer for å vurdere å oppnå gode resultater. Først, for EEG opptak, få signaler høy kvalitet er avgjørende. Riktig viskositeten på EEG lim skal brukes til hver elektrode under mini-cap forberedelse, og rotta hode og ørehår bør fjernes helt under barbering. Impedanskontrollsignalet er det viktigste steget for å bekrefte kvaliteten på EEG opptak. Sekund, for hjernen kilde imaging, generere riktig volum dirigent modellen er avgjørende. Hver overflate skal være co-registrert. I tillegg bør de genererte elektrode stillingene har minimumsavstand feil fra de faktiske elektrode steder på rotte hodebunn.
Selv om dette manuskriptet introduserer kildeanalysefremgangsmåten som bruker brain 12, kan de bli utført ved bruk av andre åpne programvare 16,17 og 18,19 kommersielle produkter. Også, foruten sLORETA 13 andre inverse løsninger som flere dipol modeller og stråletilformeren kan brukes fire.
En begrensning med denne tilnærmingen er at atferd analyse ikke kan utføres ettersom EEG opptaket blir utført under bedøvelse. Men sammenlignet med de andre metodene for EEG opptak i rotter 5,6, er denne tilnærmingen ikke-invasiv.
Våre foreløpige resultater støtter viktigheten for en presis klassifisering av IED-markører fra EEG opptak som avgjør de irritative soner i en rotte med fokal epilepsi, samt å vurdere sitt forhold til de underliggende mekanismene for anfall start 11. I tillegg har det blitt vist at EEG kildelokalisering for slike spesifikke IED viste en god overensstemmelse med respektiv BOLD aktivering og deaktivering regioner 20.
Vår studie vil stimulere til bruk av prekliniske modeller for å evaluere bed-benk-sengs strategier utviklet av biomedisinske ingeniører. For eksempel er IED ekstraksjonen utføres i dag i sykehus manuelt, noe som krevde en betydelig menneskelig innsats. Metodikken foreslått i denne studien gjør det automatisk. Vi hypotese at bruken av denne metoden vil gi lignende resultater når den brukes til pasienter med FCD. Vi forbereder IRB protokoller for vurdering av dette, og andre aspekter av metodikken i menneskelig datasettet.
Videre vil bruken av prekliniske modeller hjelpe oss å forstå mulighetene og begrensningene ved EEG kilde lokalisering i epilepsi 21. Nøyaktig estimering av hjerne kilder streke epileptogenesis er avgjørende for terapeutiske strategier og kirurgisk planlegging. Dessuten vil ha en standard plattform for opptak EEG på rotter være nyttig forevaluering av effekten av flere antiepileptika i prekliniske studier. Dette er den første studien som epileptiske rotter er registrert non-invasiv etter sedasjon, som vil åpne nye dører for evaluering av EEG biomarkører for epilepsi. Men hele metodikken presentert i denne studien kan utvides til andre eksperimentelle forhold og hjernesykdommer. EEG mini-cap kan også brukes i andre gnagere er typer.
I det siste har en forepaw stimulering paradigme i Wistarrotter blitt brukt til å evaluere kvaliteten og reproduserbarhet av data tatt opp med EEG mini-cap to. Dessuten har valideringer for hjernen kilde rekonstruksjon utført av høyoppløst skallen EEG samtidig tatt opp med laminat lokale feltpotensialer fra Wistar rotter under ett whisker stimulering paradigme 22. Denne metodikken er utviklet for Wistarrotter grunn av eksistensen av en MR atlas for denne rotte stog. Det kan imidlertid anvendes på andre gnagertyper med deres standard format of Atlas, inkludert mus, 23 Sprague-Dawley rotter, og 24 i Paxinos og Watson 25 rotter. I tillegg kan de grunnleggende fremgangsmåten i vårt foreslåtte metodikk brukes i noen gnager prekliniske modeller som EEG er en viktig modalitet. Men mange aspekter av denne metodikken er spesielt for epilepsi, spesielt de som er knyttet til EEG forbehandling (IED deteksjon og klassifisering). Også forskere må være klar over riktige medisiner som brukes for sedasjon i ulike tilfeller. Bruk av isofluran og dexdomitor i vår studie har blitt nøye vurdert på grunn av redusert innvirkning på IEDer. Angå EEG opptak, i tilfelle av mus, vil den relativt lille hodebunnen flateareal redusere antall kanaler betydelig.
Disclosures
Ingen interessekonflikter erklært.
Acknowledgments
Forfatterne ønsker å takke Pedro A. Valdes Hernandez, Francois Tadel, og Lloyd Smith for deres verdifulle råd og fruktbar diskusjon. Vi takker også Rafael Torres for korrektur.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Data Acquisition Computer | Hewlett-Packard | Z210 Workstation | |
| Dexdomitor | Orion Pharma | 6295000 | Dexmedetomidine hydrochloride |
| EEG Analysis Software | The Mathworks Inc. | MATLAB R2011b | |
| Brainstorm | Sylvain et al. 2001 | ||
| OpenMEEG | Gramfort et al. 2010 | ||
| EEG Data Streamer | Tucker-Davis Technologies | RS4 Data Streamer | |
| EEG Electrode Paste | Biotach | YGB 103 | |
| EEG Preamplifier | BioSemi | Active Two | |
| Brain Products | BrainAmp | ||
| Tucker-Davis Technologies | PZ3 Low Impedance Amplifier | ||
| EEG Recording Software | BioSemi | ActiView | |
| EEG Recording Software | Tucker-Davis Technologies | OpenEx - OpenDeveloper | |
| EEG SCSI Connector | BioSemi | Active Two SCSI Connector | |
| Brain Products | D-sub Connector | ||
| EEG Processor | Tucker-Davis Technologies | RZ2 BioAmp Processor | |
| Tucker-Davis Technologies | Zif-Clif Digital Headstage | ||
| High Resolution EEG Mini-cap | Cortech Solutions | DA-AR-ELRCS32 | US patent Application No. 13/641,834 |
| Isoflurane, USP | VedcoPiramal Healthcare | NDC 66794-013-25 | |
| Isopropyl Alcohol | Aqua Solutions | 3112213 | 90% v/v solution |
| Lubricant Ophthalmic Ointment | Rugby | NDC 0536-6550-91 | Sterile |
| NaCl | Abbott | 2B8203 | Vaterinary 0.9% Sodium Chroride Injection USP |
| Physiology Recording Software | ADInstruments | LabChart 7.0 | |
| Physiology Recording System | ADInstruments | PowerLab 8/35 | |
| Syringe | Monoject | 200555 | 12cc |
References
- Furman, M. Seizure Initiation and Propagation in the Pilocarpine Rat Model of Temporal Lobe Epilepsy. Journal of Neuroscience. 33 (42), 16409-16411 (2013).
- Sumiyoshi, A., Riera, J. J., Ogawa, T., Kawashima, R. A Mini-Cap for simultaneous EEG and fMRI recording in rodents. NeuroImage. 54 (3), 1951-1965 (2011).
- Engel, J., et al. Epilepsy biomarkers. Epilepsia. 54 (4), 61-69 (2013).
- Baillet, S., Mosher, J. C., Leahy, R. M. Electromagnetic Brain Mapping. IEEE Signal Processing Magazine. 18 (6), 14-30 (2001).
- Quairiaux, C., Megevand, P., Kiss, J. Z., Michel, C. M. Functional Development of Large-Scale Sensorimotor. Cortical Networks in the Brain. Journal of Neuroscience. 31 (26), 9584-9510 (2011).
- Lee, M., Kim, D., Shin, H. S., Sung, H. G., Choi, J. H. High-density EEG recordings of the freely moving mice using polyimide-based microelectrode. Journal of Visualized Experiments. (47), e2562 (2011).
- Bernal, B., Grossman, S., Gonzalez, R., Altman, N. fMRI under sedation: what is the best choice in children. Journal of Clinical Medicine Research. 4 (6), 363-370 (2012).
- Colciaghi, F., et al. Status epilepticus-induced pathologic plasticity in a rat model of focal cortical dysplasia. Brain. 134 (10), 2828-2843 (2011).
- Valdez-Hernandez, P. A., et al. An in vivo MRI Template Set for Morphometry, Tissue Segmentation, and fMRI Localization in Rats. Frontiers in Neuroinformatics. 5 (26), 1-59 (2011).
- Gramfort, A., Papadopoulo, T., Olivi, E., Clerc, M. OpenMEEG: opensource software for quasistatic bioelectromagnetics. BioMedical Engineering OnLine. 9 (45), (2010).
- Song, Y., Sanganahalli, B., Hyder, F., Lin, W., Riera, J. An fMRI and EEG Study of Epileptogenesis in a Rat Model of Focal Cortical Dysplasia. Organization for Human Brain Mapping. , Available from: https://ww4.aievolution.com/hbm1401/index.cfm?do=abs.viewAbs&abs=4046 (2014).
- Tadel, F., Baillet, S., Mosher, J. C., Pantazis, D., Leahy, R. M. Brainstorm: A User-Friendly Application for MEG/EEG Analysis. Computational Intelligence and Neuroscience. 2011, 1-13 (2011).
- Pascual-Marqui, R. D. Standardized low resolution brain electromagnetic tomography (sLORETA): technical details. Methods & Findings in Experimental & Clinical Pharmacology. 24 (D), 5-12 (2002).
- Iijima, T., Nakamura, Z., Iwao, Y., Sankawa, H. The Epileptogenic Properties of the Volatile Anesthetics Sevoflurane and Isoflurane in Patients with Epilepsy. Anesthesia and Analgesia. 91 (4), 989-995 (2000).
- Quiroga, Q. R., Nadasdy, Z., Ben-Shaul, Y. Unsupervised spike detection and sorting with wavelets and super-paramagnetic clustering. Neural Computation. 16 (8), 1661-1687 (2004).
- Delorme, A., Makeig, S. EEGLAB: an open source toolbox for analysis of single-trial EEG dynamics including independent component analysis. Journal of Neuroscience Methods. 134 (1), 9-21 (2004).
- Oostenveld, R., Fries, P., Maris, E., Schoffelen, J. M. FieldTrip: Open Source Software for Advanced Analysis of MEG, EEG, and Invasive Electrophysiological Data. Computational Intelligence and Neuroscience. 2011, 1-9 (2011).
- Koessler, L., et al. Source localization of ictal epileptic activity investigated by high resolution EEG and validated by SEEG. NeuroImage. 51 (2), 642-653 (2010).
- Manganotti, P., et al. Scalp topography and source analysis of interictal spontaneous spikes and evoked spikes by digital stimulation in benign rolandic epilepsy. Electroencephalography and Clinical Neurophysiology. 107 (1), 18-26 (1998).
- Bae, J., Deshmukh, A., Song, Y., Brain Riera, J. Source Analysis of Interictal Epileptiform Discharges Using a Rat Model of Focal Epilepsy. Organization for Human Brain Mapping. , Available from: https://ww4.aievolution.com/hbm1401/index.cfm?do=abs.viewAbs&abs=4098 (2014).
- Birot, G., et al. Head model and electrical source imaging: A study of 38 epileptic patients. NeuroImage: Clinical. 16 (5), 77-83 (2014).
- Riera, J. J., et al. Pitfalls in the dipolar model for the neocortical EEG sources. Journal of Neurophysiology. , (2012).
- Hawrylycz, M., et al. The Allen Brain Atlas. Springer Handbook of Bio-Neuroinformatics. , 1111-1126 (2014).
- Schweinhardt, P., Fransson, P., Olson, L., Spenger, C., Andersson, J. L. A template for spatial normalization of MR images of the rat brain. Journal of Neuroscience Methods. 129 (2), 105-113 (2003).
- Schwarz, A. J., et al. A stereotaxic MRI template set for the rat brain with tissue class distribution maps and co-registered anatomical atlas: application to pharmacological MRI. Neuroimage. 32 (2), 538-550 (2006).
