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Chemistry

Slp1 중합체 및 단층의 AU-상호 작용 Published: January 19, 2016 doi: 10.3791/53572
Automatic Translation
1, 1,2, 1
1Helmholtz Institute Freiberg for Resource Technology, Helmholtz-Zentrum Dresden-Rossendorf, 2Institute for Resource Ecology, Helmholtz-Zentrum Dresden-Rossendorf

Introduction

전자 인해, 촉매, 바이오 센서, 또는 의료 기기 등 여러 가지 응용 프로그램에 대한 금의 사용 증가로,이 귀금속의 수요는 최근 몇 년 6-9 시간 동안 성장했다. 무거운 또는 귀금속에 의해 대부분의 환경 오염에 대한 진행 과정이지만 골드뿐만 아니라 많은 다른 귀금속과 중금속, 광업 활동을 통해, 묽은 농도의 산업 폐수를 통해 환경으로 배출, 폐기물 처리 7,8,10된다 주로 과학 기술 활동에 의해 발생. 이는 자연 생태계의 중요한 간섭에 이르게 잠재적으로 인간의 건강 (9)을 위협 할 수 있습니다. 이러한 부정적인 결과를 아는 것은 새로운 기술은 산업 폐수에서 금속을 재활용 오염 된 생태계와 개선에서 금속을 제거하는 대한 검색을 촉진합니다. 침전 또는 이온 교환 등의 노포 물리 화학적 방법은 특히 높은에서, 그렇게 효과적이지 않다LY 솔루션 7,8,11 희석. Biosorption는 하나의 생활 또는 죽은 바이오 매스로, 폐수 처리 (10, 12)에 대한 매력적인 대안이다. 생물학적 물질의 사용은 독성 화학 물질의 소비를 줄일 수있다. 많은 미생물이 축적 또는 금속을 고정화 기술되었다. 예를 들어, Lysinibacillus 스패 리 쿠스의 셀 (L. 스패) JG-A12은 귀금속, 높은 결합능을 도시 한 예를 들면, 팔라듐 (II), 백금 (II), 금 (III), 및 납과 같은 다른 독성 금속 (II) 또는 U (VI) 4,13, CR (VI) 14 바실러스 메가 테 리움의 세포), 금 (Au에 대한 백금 (II) 및 Pd (II) (15), 그리고 클로렐라 저속한위한 사카로 마이 세스 세레 비지에의 세포 (III)과 U (VI) (16) 17. 금과 같은 금속의 결합 이전 (III), (II)도 Desulfovibrio보고 된 팔라듐 (II), 및 Pt는 18 L.를위한 desulfuricans 스패 리 쿠스 JG-B53 (19, 20). 그럼에도 불구하고,하지 등L 미생물은 금속의 높은 금액을 결합하여 흡착 물질로서의 응용이 제한 12,21입니다. 또한, 용량을 결합 금속은 예를 들어, 다른 매개 변수, 세포 구성, 사용 된 바이오 구성 요소, 또는 환경 및 실험 조건 (PH, 이온 강도, 온도 등)에 따라 달라집니다. 고립 된 세포 벽 조각 (22, 23)의 연구는 막 지질, 펩티도 글리, 단백질, 또는 다른 구성 요소와 같이 복잡한 구성 전체 세포 8,21의 프로세스를 결합 금속을 이해하는 데 도움이됩니다.

이 연구에 초점을 맞추고 세포 구성 요소는 S-층 단백질이다. S-층 단백질은 많은 박테리아 및 고세균의 외부 세포 외피의 일부이며, 이들은 약 15 구성 - 이들 유기체의 총 단백질 질량의 20 %. 환경에 대한 제 1 인터페이스로서, 이러한 화합물은 세포 강하게 세균성 흡착 특성 (3)에 영향을 미친다. 분자량이 마흔에 이르기까지와 S-층 단백질kDa의 수백 개의 셀 내에서 발생되지만, 외부의 조립에 그들은 지질 또는 폴리머 막 세포벽 성분에 층을 형성 할 수있게한다. 고립되면, 거의 모든 S 계층 단백질이 자발적으로 인터페이스에서, 또는 평면 또는 튜브와 같은 구조 (3)을 형성하는 표면에, 정지에 자기 조립 고유 속성이 있습니다. 단백질 단일 층의 두께는, 세균에 따라, 5의 범위 내에 - 25 내지 24. 일반적으로, S-층 형성 단백질 구조는 35 내지 3,24에 경사 (P1 또는 P2), 정사각형 (P4), 또는 육방 정 (P3 또는 P6) 2.5의 격자 상수와 대칭을 가질 수있다. 격자 형성은 이가 양이온에 의존하고, 주로 칼슘 25, 26, 라프, J. 등의 많은 경우에 보인다. S-층 단백질을 기반으로 설계된 나노 구조의 산업용 애플리케이션에 기반 나노 복합체. (EDS Tijana (Z) 그 로브 및 Aitziber L. Cortajarena) (스프링, 2016 (제출)). 그럼에도 불구하고, 특히 칼슘 및 마그네슘 2+와 같은 이가 양이온 단량체 폴딩, 단량체 단량체의 상호 작용, 격자의 형성, 및 다른 금속의 역할의 전체 반응 캐스케이드는 아직 완전히 이해되지 않는다.

그람 양성 균주 L. 27 (새로운 계통 분류 후 바실러스 스패 리 쿠스에서 이름) 스패 리 쿠스 JG-B53는 우라늄 광산 폐기물 더미 "Haberland"(Johanngeorgenstadt, 작센, 독일) 4,28,29에서 분리 하였다. 기능적 S 층 단백질 (Slp1)가 정사각형 격자 116 30 kDa의 분자량, 및 박테리아 세포를 살아있는 31 ≈에 10 nm의 두께를 갖는다. 이전 연구에서, 약 10 nm의 두께를 가진 닫힌 안정된 단백질 층의 형성은 시험 관내에서 10 미만 19 분에서 달성되었다. 관련 균주 L. 스패 리 쿠스 JG-A12은, 또한 "Haberland"더미로부터 분리가 높은 금속 결합 능력을 보유하고 그 격리 S 층 단백질은 금과 같은 귀금속에 대한 높은 화학적, 기계적 안정성 및 우수한 수착 속도를 보여 주었다 (III), 백금 (II), 및 Pd (II) 4,32,33를. 귀금속의 결합이 어느 정도 특정 금속의 일부이고, 중합체의 외측 및 내측 표면에 단백질 및 기공의 관능기, 이온 강도의 가용성 및 pH 값에 의존한다. , OH-, PO 4 - -, SO 4 -, 및 SO-단백질에 의해 금속의 상호 작용을위한 관련 기능 그룹은 COOH-, NH 2이다. 원칙적으로, 금속 결합 용량은 응용 프로그램, 라프, 제이 등의 다양한 스펙트럼을 엽니 다. S-층 단백질을 기반으로 설계된 나노 구조의 산업용 애플리케이션에 기반 나노 복합체. (EDS Tijana (Z) 그 로브 및 Aitziber L. Cortajarena) (스프링 2016 (제출)). 예를 들어, 같은 제거 또는 복구를위한 biosorptive 구성 요소용해 독성 또는 유가 금속의 합성 또는 정기적으로 구조화 된 금속 나노 입자 NPS () 촉매를 들어, 바이오 감각 층 3,5,18,33 같은 다른 생물 공학 물질의 정의 증착을위한 템플릿. 금 등을 규칙적으로 배열 NP 어레이 (0) -NPs는 CO 산화 34-37위한 분자 전자 및 바이오 센서, 초 고밀도 저장 장치 등이 있으며, 촉매에서부터 주요 애플리케이션에 사용될 수있다. 이러한 응용 프로그램 및 이들 재료의 세련된 디자인의 개발은 기본 금속 바인딩 메커니즘의 깊은 이해를 필요로한다.

이러한 바이오 기초 물질의 개발을위한 전제 조건은 상기 생체 분자와 기술 (38, 39) 표면 사이의 계면 층의 신뢰성 구현이다. 예를 들어, 고분자 전해질 층은 S-39 단백질의 재결정 계면 층으로 사용 된 층별 (LBL) 기술 40,41 조립 19,42, 라프, J. 등의 금속과의 상호 작용에 관한 설명은 할 수있다. S-층 단백질을 기반으로 설계된 나노 구조의 산업용 애플리케이션에 기반 나노 복합체. (EDS Tijana (Z) 그 로브 및 Aitziber L. Cortajarena) (스프링 2016 (제출)). 그러나, 단백질 흡착 단백질과 표면의 복잡한 상호 작용 메커니즘은 완전히 이해되지 않는다. 특히, 형태, 패턴 방향 및 코팅 밀도에 대한 정보는 아직 행방 불명입니다.

분산 모니터링 (QCM-D) 기술로 수정 진동자 마이크로 밸런스는 단백질 흡착, 코팅 동력학 연구를위한 도구와 상호 작용 친로서 최근 주목 받고있다나노 미터 크기 19,43-45에 세 스. 이 기술은 실시간 질량 흡착 상세한 검출을 허용하고, 단백질에 격자 19,20,42,46-48 단백질 자기 조립 공정 및 기능성 분자의 결합을위한 지표로 사용될 수있다. 또한, QCM-D 측정은 천연 생물학적 조건 하에서 단백질 성 금속 층 상호 작용 과정을 연구 할 수있는 가능성을 연다. 최근의 한 연구에있어서, Eu와 같은 선택된 금속과 S 층 단백질의 상호 작용 (III), 금 (III), 팔라듐 (II), 및 Pt가 (II) QCM-D (19, 20)과 함께 연구되어왔다. 흡착 된 단백질 층은 그람 양성 박테리아의 세포벽의 단순화 된 모델이 될 수있다. 이 단일 성분의 연구는 금속의 상호 작용에 대한 깊은 이해에 기여할 수있다. 그러나 전적으로 QCM-D 실험은 표면 구조와 단백질에 금속의 영향에 관한 진술을 허용하지 않습니다. 다른 기술들이 이러한 정보를 얻기 위해 필요하다. 하나의 POS구조적 특성에 촬상을위한 바이오 나노 대한 접근성 및 취득 정보는 원자력 현미경 (AFM)이다.

제시된 연구의 목적은 L.의 특정 Slp1에서 ((0) -NPs을 금 (III) 및 금) S-층 단백질에 금의 흡착을 조사했다 스패 리 쿠스 JG-B53. ICP-MS를 사용하여 5.0 QCM-D를 사용하여 고정화 S-레이어 - 실험은 2.0의 pH 범위에서 배치 규모에 현탁 단백질로 이루어졌다. 또한, 격자의 안정성에 금속염 용액의 영향이 후속 AFM 연구하여 조사 하였다. 이러한 기술들의 조합은 특정 금속 친화 관한 전체 박테리아 세포에 대한 이벤트를 바인딩에 대해 더 학습하기위한 도구로서 시험관 금속 상호 작용 과정의 이해에 기여한다. 이 기술뿐만 아니라 환경 보호를위한 금속의 회수를위한 적용 가능한 필터 재료의 개발 및 재의 보존을위한 중요(49)뿐만 아니라, 다양한 애플리케이션을위한 고도의 기술 순서 금속 NP에 어레이의 개발을위한 소스.

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Protocol

1. 미생물과 배양 조건

참고 :. 모든 실험은 무균 상태에서 시행 하였다 L. 스패 리 쿠스 JG-B53은 냉동 보존 된 문화 (29, 30)로부터 얻은 것입니다.

  1. 전송 300 ml의 멸균 영양 국물 (NB) 미디어 (3 G / L 고기 추출물, 5g / L 펩톤, 10g / L의 NaCl)에 클린 벤치에서 문화 (1.5 ml)에 냉동 보존. 이후 재배 예비 배양을 얻었다 30 ℃에서 최소한 6 시간 동안 용액을 교반 하였다.
  2. 70 L에서, pH는 7.0에서 30 ° C를주의 미디어에서 호기성 조건에서 박테리아를 배양 증기 제자리 생물 반응기를 조정. 따라서 ≈ 57 L의 탈 이온수로 반응기를 채우기. 생물 반응기에서 직접 고체 NB 미디어를 추가하고 용해 (농도는 위 참조).
    1. 또한 재배하는 동안 거품 형성을 억제하는 미디어에 소포제 (30 μL / L의 NB-미디어)를 추가 한 후 오토 클레이브 미디어 (122 ° C, 온도 시간 30 분 유지)반응기 내부 설비.
  3. 미디어를 냉각하고 완전한 산소 포화도를 수행합니다. (1 MH 2 SO 4, 2 M NaOH를 사용) 7.0으로 pH를 조정하고 300 ml의 사전 문화의 자동 접종을 시작합니다. 접종 시점에서 배양 파라미터의 데이터 기록을 시작한다. 재배 내에서 예를 들어 온라인 매개 변수, 용존 산소 수준 (2 할), 산 및 염기 또한, pH를-값의 로그를 취합니다.
    1. 비 침습적 탁도 측정에 의해 온라인으로 세균의 성장을 모니터링합니다.
  4. 재배의 모든 시간 후 추가 샘플링을 수행하고 바이오 건조 중량 (BDW)과 오프라인 광학 밀도 (OD)로 추가 매개 변수를 결정합니다. 따라서, 멸균 조건 하에서 각각의 샘플링 지점에서 20 ml의 배양 배지를 수집합니다.
    1. 600 nm에서 흡착의 광도 측정하여 오프라인 외경을 결정합니다. 빈 값으로 멸균 여과 NB-매체를 사용합니다. 선미어 흡착> 0.4 희석에게 램버트 - 맥주 법률의 선형성 다음 세포 현탁액에 도달.
    2. 박테리아 현탁액을 5 ml에 BDW 원심 분리기 (1)의 결정을 위해 RT에서 5 분 동안 5,000 XG에 (셀 밀도에 따라). 오븐 최대 질량 안정성 가열에 105 ° C에서 얻어진 세포 펠렛을 건조 및 펠릿의 질량을 측정한다.
  5. 박테리아 성장의 확인 및 교차 오염 제어와 같은 400, 1000 배 확대 (각각 위상차 콘덴서 2, 3)에 광학 상 대비 연구 현미경 현미경 이미지를 가져 가라.
  6. 온라인 검출 지수 성장기에 도달 한 후 2 온라인 탁도를 수행 15,000 XG, 4 ° C에서 관류 원심 매스 수확 및 표준 완충액 (50mM 트리스 회 매스 씻어 된 10 mM의 MgCl 2, 3 mM의 NaN의 3, pH는 7.5).
    참고 : 얻어진 바이오 매스 펠릿 -18 & # 저장할 수 있습니다(176), 절연을위한 추가 사용까지 C.

2. S-층 단백질 분리 및 정제

주 : 앞서 2,19,30,32,50,51 바와 같이 구성된 방법에 따라 Slp1 중합체를 정제.

  1. 표준 완충액에서 배양으로부터 얻어진 세정 해동 조 매스 균질화 (1 : 1 (W / V))로 4 ℃에서 냉각 빙욕 하에서 분산기 (레벨 3, 10 분)를 이용하여 편모를 제거한다.
  2. 현탁액 (8000 XG, 20 분 동안 39 ° C)를 원심 분리하고 표준 완충액으로 두번 세척 얻어진 펠렛 (1 : 1 (W / V)). 세정, 원심 분리 (8,000 XG, 20 분, 4 ℃) 한 후, 기준 버퍼에 펠렛을 재현 탁 (1 : 1 (W / V)), 현탁액의 DNase II 및 된 RNase (0.4 단위 / g 바이오 매스)를 첨가하고, 붕해 고압 균질 1,000 바 세포. 그 후 27,500 XG, 1 시간 동안 4 ℃에서 현탁액을 원심 분리기.
    주 : 연구 MI와 컨트롤 세포 현탁액을croscope. 3 그대로 세포를 400 배 배율의 현미경의 시야에서 볼 수 있습니다 - 이하 2 때 파열이 완료됩니다.
  3. 표준 완충액으로 두 번 씻어 펠렛 (1 : 1 (W / V))로 다시 원심 분리를 수행한다. 이후 표준 버퍼에 펠렛을 재현 탁 (2 : 1 (W / V))로, 1 % 트리톤 X-100을 혼합하고, 지질 침착을 가용화 연속 진탕 (100 RPM) 하에서 20 분 정도 배양한다.
  4. 용액을 원심 분리기 (27,500 XG, 1 시간 동안 39 ° C) 및 표준 완충액으로 얻어진 펠릿 세 번 세척 (1 : 1 (W / V)).
  5. 표준 완충액에서 6 시간 동안 추가로 원심 분리 (27,500 XG, 1 시간 동안 4 ℃) 후의 펠릿을 인큐베이션 (1 : 1 (W / V)) 펩티도 50의 결합을 가수 분해하기 위해, 0.2 g / L의 리소자임, 혼합. 또한 서스펜션의 DNase II와의 RNase (각 0.4 단위 / g의 바이오 매스)를 추가합니다.
  6. 원심 분리 (45,500 XG, 4 ℃, 1 시간) 후 T의 낮은 볼륨으로 상부 흰색 단백질 상을 재현 탁그는 원심 상청 (<30 mL)에 함유 된 단백질 서브 유닛.
  7. 6 M 구아니딘 히드로 클로라이드 (6 M GuHCl, 50mM 트리스, pH는 7.2)으로 1 : 1 혼합하여 백색 현탁액을 용해. 용액을 밝게된다.
  8. 추가적인 고속 원심 분리 (45,500 XG, 1 시간 동안 39 ° C) 뒤에 GuHCl 처리 용액의 멸균 여과 (0.2 μm의)을 수행한다.
  9. 투석막 튜브에 상청 (MWCO 50,000 달톤)를 전송하고 48 시간 동안 재결정 완충액 (15 mM 트리스, 10 mM의 CaCl2를, pH는 8.0)에 대하여 투석을.
  10. 45,500 XG, 1 시간 동안 4 ℃에서 원심 분리 튜브로 백색 재결정 단백질 중합체 용액을 전송. 초순수 (<30 ㎖)의 낮은 체적 펠렛을 재현 탁.
  11. 그 후, 투석막 튜브에 서스펜션을 전송하고 버퍼의 컨텐츠를 제거하기 위해 24 시간 동안 초순수에 대한 투석을 수행합니다.
    주 : 버퍼 또는 초순수 D의 여러 가지 변화를uring 투석은 필수적이다.
  12. 동결 건조기에서 동결 건조를 정제 Slp1.

실험에 Slp1 3. 특성 및 정량

참고 : 흡착 및 코팅 실험 Slp1 농도는 UV-VIS 분광 광도계로 정량 하였다.

  1. 직접 광도계의 낮은 측정 받침대 위에 용해 Slp1 샘플의 피펫 2 μL. 단백질 특성, 280 nm의 파장에서 흡착 최대 단백질 농도를 결정합니다. Slp1 농도를 결정하기 위해 0.61의 흡광 계수를 사용한다. 참조 측정을위한 Slp1 무료 솔루션을 사용합니다.
  2. 실험 (1g / L과 0.2 G / L에 대한 원하는 농도 (0.9 % 염화나트륨을 사용하여 배치 모드에서 흡착 실험, pH는 6.0 및 QCM-D 실험이 재결정 버퍼를 사용하기 위해, pH는 8.0) 버퍼와 단백질을 희석 각기).
  3. 표준 bioanal 의해 Slp1 품질 및 분자량을 분석램리, UK (52)에 의해 기술 된 방법 ytical 나트륨 도데 실 설페이트 폴리 아크릴 아미드 전기 영동 (SDS-PAGE).
    1. 금 (0) -NP 배양 10 % 폴리 아크릴 아미드 분리 젤을 사용한 후, 실험 예에서 Slp1를 사용하기 전에 SDS-PAGE를 수행합니다.
    2. SDS-샘플 믹스 샘플 버퍼와 재배 또는 단백질 시료의 ≈10 μL에서 (1.97 g의 트리스, 블루 5 mg을 브로 모 페놀, 5.8 ml의 글리세린, 1g의 SDS, 2.5 ml의 β-머 캅토 에탄올, 50 ㎖에 초순수로 입력) 겔 주머니 95 ℃에서 4 분간 배양 후 1 (v / v)의 혼합물을 피펫 : 1의 비율.
    3. 샘플까지 60 V의 전압에서 실행 SDS-PAGE 30 분은 한 번 분리 겔을 통과하는 120 V로 수집 젤 변화 전압을 전달합니다.
    4. 겔 시스템으로부터 겔을 제거하는 고정 용액 (10 % 산성 산, 무수 에탄올 50 %)로 1 시간 초순수 및 장소 헹군다. 그 후, 초순수로 린스 젤.
    5. 얼룩 젤적응 불특정 콜로이드 쿠마 화려한 푸른 방법 (53, 54)를 사용하여. (72, 73)를 탈색 한 후, 제조 업체의 프로토콜에 따라 겔 문서 시스템에 의해 SDS-PAGE 이미지를 가져 가라.

배치 모드 및 금속 정량화 4. 흡착 실험

  1. 일괄 수착 실험 HAuCl 4에서의 Au (III) 원액 ∙ 3 H 2 O를 준비 금속염을 희석 및 1g / L의 1 mm의 초기 금속 농도와 최종 Slp1 농도 Slp1 / NaCl 용액과 섞어 . Slp1없이 추가 음성 대조군과 세 쌍둥이의 실험을 수행합니다. 흡착 실험을 5 ml의 총 부피를 사용합니다.
  2. 24 시간 (저 농축 염산과 수산화 나트륨 용액으로 pH를 조정)에 대한 2.0-5.0 사이의 서로 다른 사전 조정 된 pH 값에 실온에서 지속적으로 서스펜션을 흔들어.
  3. 흡착 후, 15,000 XG, 20 분 동안 4 ℃) separ하기에 원심 분리상층 액에서 Slp1을 먹었다.
  4. 용해 단백질 단량체를 제거하는 20 분 동안 15,000 XG에서 4 ℃를 한외 여과 튜브에 뜨는 (MWCO 50,000 다) 원심 분리기이를 전송합니다.
  5. ICP-MS (19, 20)에 의하여 얻어진 여과 액 중의 금속 농도를 결정하고 Slp1 건조 질량으로 흡착 된 금속 백 계산 결과를 사용한다. 원칙을 측정, 방법 및 사용 된 ICP-MS의 구성 요소의 기회 문학 55에 설명했다.
    1. 내부 표준 (1 ㎎ / ㎖)와 같은 매트릭스와 로듐으로 1 % HNO 3를 사용하여 ICP-MS 측정을위한 샘플 및 참조를 준비합니다.

5. AU-NP의 합성 및 입자 크기의 결정

주 : 구연산염은 금 (0)가 -NP Mühlpfordt, H. 등에 의해 전술 적응 방법에 따라 합성 하였다 안정화. (1982)의 직경을 갖는 구형 입자를 얻었다 10-15 나노 56,57

  1. NP 형성에 안정화 된 25 mM의 HAuCl 4 ∙ 3 H 2 O 주식을 준비합니다.
  2. 19.75 mL의 초순수에이 원액 250 ㎕의 희석 연속 진탕을 15 분 동안 61 ° C에서 배양 한이.
  3. 제 스톡 용액 5 ㎖ (12 mM의 탄닌산, 7 mM 시트르산 나트륨 디 하이드레이트, 3 0.05 mM의 K 2 CO)를 준비하고, 15 분 동안 61 ° C에서 별도로 2 차 용액을 배양.
  4. 상수는 솔루션 하나에 2 차 원액을 교반 추가합니다. 61 ℃에서 적어도 10 분 동안 반응 혼합물을 교반한다. 그 후 용액을 냉각 및 QCM-D 실험 내에서 Slp1 격자에 순이익 코팅을 위해 사용합니다.
    주 : 얻어진 금 (0) -NP 전형적 (0) 58 -NPs 형성된 Au로 검출에 사용은 520nm의 흡광도 최대 UV-VIS 분광 특성화 하였다. 용액을 4 ℃에서 저장 될 수있다.
  5. 형성의 크기를 분석또한 동적 광산란으로 알려진 광자 상관 분광법 (PCS)에 의한 AU (0) -NP.
    1. NP 크기의 결정을 위해, 층류 상자에 먼지가없는 상태에서 큐벳으로 합성 금 (0) -NP 용액 1.5 mL로 전송하고 크기 및 제타 전위 입자 크기 측정기로 분석한다. PCS 및 샘플 제조의 상세한 설명은 Schurtenberger, P. 등으로 주어진다. (1993) 59, 자이나교, R. 등. (2015) 60.

6. QCM-D 실험 - Slp1 격자 상 표면에 Slp1 코팅 및 AU-NP 흡착

주 : 측정은 최대 네 개의 흐름 모듈 장착 QCM-D와 함께 수행 하였다. 모든 QCM-D 실험은 25 ℃에서 125 μL / 분의 일정한 유속으로 수행 하였다. Slp1 코팅 및 금속 / NP 배양은 ≈ 5 MHz의 기본 주파수와 SiO2를 압전 AT 컷 석영 센서 (Ø 14mm)에서 수행 하였다. 단계를 세척 및 추가솔루션의 ition는 대표적인 결과 부분의 그림에 표시됩니다. QCM-D 실험 단계 방법에 의해 단계는 Slp1의 재결정에 의해 나중에 금속 및 금속 순이익의 상호 작용에 따라 사용되는 센서의 세정 및 표면 개질로 시작이라고 할 수있다.

  1. 절차 청소 :
    1. 센서 인형과 유체 세포를 착용. 펌프 적어도 20 ㎖를 통해 QCM-D와 튜브 시스템 (초순수 (v / v)의 2 %의 세제) 알칼리성 액체 세정제의 (모듈 당 각). 이후 시스템을 통해 초순수의 다섯 겹 볼륨을 (각 모듈 당) 펌프 (300 μL / 분 속도를 흐름). 제조 업체의 프로토콜에 따라 청소를 수행합니다.
    2. 2 % SDS 용액에서 배양 (20 분 이상)로 유동 모듈 외부의 SiO2 센서를 청소하고 초순수로 61, 62 이후 여러 번 씻어 센서.
    3. 필터링 빌려와 결정을 건조공기를 ressed 20 분 63, 64에 대한 오존 세척 실에 배치합니다.
    4. 모든 유기 내용을 제거 두 번 청소 절차를 반복합니다.
    5. 센서 표면에서 결합 된 금속을 제거하려면 1 M HNO 3 센서를 씻어. 그 후, 초순수 모든 헹굼 단계를 수행합니다.
  2. 고분자 전해질에 의해 센서 표면 개질 :
    표면 개질 중 내부 수행 할 수 있습니다 (절차를 통과) 또는 흐름 모듈 외부 (LBL 기술) 참고. 이들 실험에서 표면을 수정하기 위해 다음 방법을 사용 하였다.
    1. 3g하여 문서의 특별한 사용 시스템에 대해 이전에 설명 LBL 기술 40, 41를 사용하여 딥 코팅을 통해 폴리에틸렌 이민 (PEI, MW 25,000)와 폴리스티렌 설 폰산 (PSS, MW 70,000)의 교류 PE 층 / L로 센서를 수정 SUHR, M. 등. (2014) 19.
    2. 깊은 W에서 해당 PE-솔루션 내부에 센서를 배치ELL 접시와 실온에서 10 분 동안이 품어.
    3. PE-용액으로부터 센서를 가지고 초순수로 집중적마다 딥 코팅 공정 사이에 센서를 헹군다.
      주 : 새로운 표면 개질은 양전하 PEI 갖는 적어도 세 개의 PE 층 종단 이루어져있다.
    4. 이 수정 후 외부 유동 모듈 내부 센서를 배치하고 실험을 시작하기 전에 초순수 린스 센서 평형.
  3. Slp1 단일 플라이 재결정 :
    1. 단량체로 폴리머를 변환 4 M 요소에 Slp1을 녹인다.
    2. monomerized 단백질 15,000 XG, 1 시간 동안 4 ℃에서 원심 분리기는 더 큰 단백질 덩어리를 제거합니다.
    3. 0.2 g / L의 최종 단백질 농도로 재결정 완충액으로 용해 및 원심 Slp1 상등액을 혼합한다.
      주 : Slp1 (자기 조립)의 재결정을 따라 칼슘의 첨가에 의해 촬영 시작rystallization 버퍼입니다. 따라서, 즉시 (플로우 모듈 내부에 배치) 센서 125 μL / 분의 유속으로 혼합 용액 펌프. 재결정은 QCM-D 실험 내에서 검출 된 주파수와 소비 변화의 안정된 값 후에 완료됩니다.
    4. 플로우 모듈 내부 PE 변성 센서 위에 성공적 단백질 재결정 후의 주파수 및 분산 시프트 안정 값까지 125 μL / 분의 유속으로 waterintensively 재결정 버퍼 또는 초순수와 피복 센서 린스 것이 발견되었다.
      참고 : Slp1 단층과 AFM 연구 상 이상 흡착 실험 PE와 SiO2를 표면 개질는 그림 1에서 보여집니다.

그림 1
그림 1. 도식 디자인 PE의 표면 개질과 Slp1 단층코팅; 이 수치는 SUHR, M. 등에서 수정되었습니다. 스프링의 허가 (2015) 19. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

  1. 금속 및 금속 순이익 상호 작용 :
    주 : 금 금속 염 용액이 수착 (HAuCl 4 ∙ 3 H 2 O)을 1 mm 이하 0.9 %의 NaCl 용액에서 pH에서 5 mM의 농도 = 6.0에서 수행 하였다. AU-NP 흡착은 pH가 ≈ 5.0에서 1.6 mM의 트라이 - 나트륨 구연산 버퍼에 희석 AU-NP에 함께 이루어졌다.
    1. 주파수 및 분산 안정 시프트 값이 검출 될 때까지 유동 모듈 성공적인 Slp1 코팅 한 후, 0.9 % NaCl 용액으로 집중적 수득 Slp1 층을 헹군다.
    2. 125 μL / 분의 유속으로 유동 모듈 제조 된 금속 용액 (1 mM)을하고 NP 용액을 펌프 및 질량 SL에 흡착 추적P1 층. 질량 흡착 사우어 브레이 방정식 참조 주파수 천이 (수학 식 1)을 추적하여 직접 검출 할 수있다.
    3. 금속 및 금속 순이익 상호 작용을 완료 한 후, 약한 결합 또는 약한 부착 된 금속 또는 나노 입자를 제거하기 위해 금속 / NP 무료 버퍼 레이어를 씻어.
      참고 : 실험 장치의 그림이 그림 2에 표시됩니다.

그림 2
그림 2. * 66 (401) 흐름 모듈 QFM를 사용하여 QCM-D 설정의 도식 디자인. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

  1. 데이터 기록 및 평가 :
    1. 헤르츠 (Hz, Δf에 없음)과 소비 (ΔD N에서 주파수 변화를 기록한다) QCM-D는 특정 소프트웨어를 사용하여 QCM-D 실험 내에서.
    2. 배음 n 번째에 적용되는 센서 표면에 마찰없이 결합 얇고 단단한 필름 유효 흡착 질량 감도 (ΔM) 사우어 브레이 식 / 모델 (식 1) (65) (66)의 평가를 위해 사용합니다. 컷 수정 센서에서 사용되는 5 MHz의에 대한 용어 C (사우어 브레이 상수) 17.7 NG ∙ Hz에서 -1 ∙ CM -2 (68)이다. 강성 들어, 균일하게 분포하고, 충분히 얇은 흡착 층은 좋은 근사 식 1로 사용한다.
      식 (1)
    3. 점탄성 분자 제조업체 특정 소프트웨어와 68-71 유효 켈빈 - 보이트 모델에 따라 추가 모델링을 수행하고 사우어 브레이 모델의 그것과 결과를 비교.
    4. 층 두께의 계산 및 물질의 흡착에 사용할중요한 모델링 파라미터로서 1.35의 흡착 층의 층 밀도 g ∙ cm -3 S 층 단백질 72-75 대한 전술 된 값에 대응. 단백질과 금속 층 상호 작용의 계산에 동일한 값을 사용한다.

7. AFM 측정

  1. 거꾸로 광학 현미경에 완벽하게 할 수있는 AFM과 함께 연구를 수행합니다.
    1. 직접 코팅 QCM-D 센서에 재결정 버퍼 또는 초순수를 사용하여 액체의 기록 AFM 이미지.
    2. QCM-D 실험 후 초순수로 센서를 씻어 AFM 유체 세포 내부에 배치합니다. 따라서, 약 1.5 ml의 총 부피로 유체 밀폐 셀을 사용한다. 30 ° C에서 유체 셀 상수의 온도를 유지한다.
    3. 물 ≈ 25 kHz의 공진 주파수와 <0.1 ​​N / m의 강성을 가진 캔틸레버를 사용한다. 2.5 및 10 μm의 / 초 사이의 스캔 속도를 조정합니다.
      4. 76 댐핑 진동에 의해 표면에 캔틸레버의 거리를 결정한다.
      주 : Z-값의 정확한 표면 토포 그래피를 나타내는 이미지를 동시에 높이가 Z 스케일로 도시된다. 진폭, Z 값은 스캔 매개 변수에 따라 제한된 정보를 부담하기 때문에 진폭 (의사 3D) 이미지는 Z-규모없이 표시됩니다. 이미지 분석은 세 가지 다른 평가 소프트웨어의 77를 사용하여 수행 하였다.

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Representative Results

미생물과 Slp1 특성의 재배

박테리아의 성장의 기록 데이터는 약 5 시간의 지수 성장기의 끝을 나타낸다. 이전 조사는 Slp1 수확의이 점 (4.36 G / L 젖은 바이오 매스 (≈ 1.45 그램 / 리터 (BDW)) 최대 수율 (19)와 분리 될 수 있음을 보여 주었다. 그럼에도 불구하고, 정의 된 미디어 구성 요소 또는를 사용하여 재배의 최적화 FED- 일괄 재배 전략. 이것은 산업용 애플리케이션을위한 바이오 매스의 높은 양의 사용에 대한 양도 할 수없는 것입니다 높은 바이오 매스 수율로 이어질 것입니다. 온라인의 값과 오프라인 기록 재배 매개 변수도 3a에 요약되어있다. 현미경 제어 (그림 3B)를시 L. 스패 리 쿠스 JG-B53의 수확 쇼가 아닌 포자 세포의.


그림 3 : L.의 (A) 온라인과 오프라인 측정 재배 매개 변수 L.의 중요한 박테리아 세포의 스패 리 쿠스 JG-B53과 (B) 현미경 이미지 스패 리 쿠스 JG-B53 400 배 배율 수확시; 이 수치는 SUHR, M. 등에서 수정되었습니다. 스프링의 허가 (2014) 19. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

또한, 별도로 만들어진 SDS-PAGE 단백질 프로파일 (도 4a)은 5 시간 배양시 Slp1의 최대 양을 나타낸다. (150 kDa의이 ≈) 두꺼운이지만 Slp1에 대응하는 단백질 밴드는 여기에서 강도의 손실에 accompan을 관찰분열 가능한 단백질 또는 기타 단백질의 분리에 의한 저 분자량을 가진 단백질의 증가에 의해 IED. (도 4b) 상술 한 방법에 의해 얻어진 분리 및 정제 된 단백질 밴드 (116 kDa의) 30 Slp1의 서열 데이터를 기반으로 계산 된 중량보다 무거운 약 150 kDa의 중 분자량에 해당한다. 이것은 아마도 번역 후 변형에 기인한다. SDS 겔 이론 분자 질량과 ​​관찰 분자량 사이의 불일치에 대한 다른 이유는 아마도 SDS 겔 (30)에 따라 유물을 부과하고 있습니다.

그림 4
(A)의 SDS-PAGE에 의해 만들어진 그림 4. 단백질 프로파일 재배 샘플 및 성공적인 차단 후 Slp1 정제 (B)에서 얻은 박테리아 세포를 분해; 이 Fi를gure는 SUHR, M. 등에서 수정되었습니다. 스프링의 허가 (2014) 19. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

일괄 흡착 실험 및 ICP-MS와 금의 결정

최대 금속 결합능 현탁 Slp1 의해 금 (III)의 (Q 최대)은도 5에 나타내었다. 결과에 Au (III)을 안정적으로 조사 pH 범위 내에서 24 시간 배양 중에 Slp1 의해 결합 된 것을 보여준다. 100 mg의 금 (III) / g Slp1 - 결과는 약 80의 범위에서 최대 Q를 나타낸다. 요약 값 (표 1) / g Slp1가 SUHR, M. 등에 의해 이전에보고 (III) 75 ㎎을 금의 흡착 용량을 비교 하였다. 자기 조정과 실험에서 얻은 (2014)금속염 용액 (PH ≈ 4.3) (19)의 첨가에 의해 pH의 값. 요약하면, Slp1는이 요소의 높은 결합 능력을 입증하고 초기에 첨가 금 (III)의 많은 양을 결합하는 능력을 보여 주었다.

그림 5
pH를 조정 실험에서 Slp1 폴리머에 용량 금 (III)의 (Q 최대)를 바인딩 최대 금속 그림 5. 다이어그램 SUHR, M. 등에 의해보고 자기 조정 산도 값 (≈ 4.3)를 사용하여 흡착 결과를 비교 하였다. (2014) 19. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

따라서 60 % 재 확인 - 조사 pH 범위 내에서 산출 된 금속 제거 효율 (RE)는 50 내지이었다SUHR, M. 등으로 만든 sults. 40 %의 값이 달성되었다 (2014). 미리 만든 실험에서, 관능기 예 carboxylic-, 히드 록실, 및 아미노기와 금 (III)의 강한 작용은, L.의 SlfB Slp1 같은 S 층 단백질과 비교 단백질에 대해 관찰 된 스패 리 쿠스 JG-A12 1,78. Jankowski, 미국 등의 알. (2010)을 중심으로도 L.의 Slp1에 대해 추론 할 수 SlfB의 카르 복실 그룹과 광학적 금 (III)의 강한 상호 작용을 검출 스패 리 쿠스 JG-B53 20,79,80. 또한, 금으로 금 (III)을 감소시킬 극한 단백질 특성 (0) 환원제의 부재하에 강한 상호 작용 (79)에 대한 이유가 될 수있다. 또한,이 연구의 결과는 바람직한 낮은 pH의 값에 Slp1 결합의 경향을 보여준다. 한편,도 Slp1의 변성을 초래할 수있는 낮은 pH의 값에 바인딩. Slp1에 대한 연구는 pH를 아래로 단백질의 안정성을 입증 =3.0 (게시되지 않은 결과). 산성 조건 하에서 탈 착용 실험, 예를 들면, 질산을 사용하여 또는 EDTA 또는 시트르산 (데이터 미도시)와 같은 착화 제를 사용하는, 금 안정적 결합시키고 Slp1 중합체로부터 방출되지 않을 수 있음을 검증한다.

L. 스패 리 쿠스 JG-B53의 Slp1에 금 (III)
C 초기 (㎎ / ℓ) 196.97
pH가 (5) 4.5 ≈ 4.3 (23) 4 3.5 3 2.5 (2)
값
Q 최대 88.3 85.3 74.7 102.5 94.1 (81) 101.9 96.9
(밀리그램의 Au (III) / g Slp1)
레 47.1 47.8 37.9 57.1 54.1 44.8 58.7 56.5
(%)

표 1 : 최대 금속 용량 (Q 최대)과 금으로 일괄 흡착 실험의 금속 제거 효율 (재) 바인딩 (III) 및 ICP-MS에 의해 분석 솔루션에 Slp1 중합체. 데이터 SUHR, M. 등의 이전에 발행 된 결과를 비교 하​​였다. (2014) 19.

QCM-D에 의해 추적 Slp1 단일 플라이 재결정

주파수에 즉각적인 감소 (Δf에 5, Δf에 7, Δf에 9, Δf에 11) 빠른 흡착 및 PE 표면 개질 (그림 6A)에 단백질의 높은 선호도를 나타냅니다. 주파수의 빠른 변화, 소비 (ΔD 5, ΔD 7, ΔD 9, ΔD 11)에 균등는 즉시 증가한다. 이 사실은 분산 값을 증가의 결과로 인해 빠른 감쇠 점탄성 표면 분자의 흡착을 나타낸다. 최대 주파수 편이 ≈ 95 Hz에서 4.2 ΔD의 값과 5 분 후에 달성된다. 나중 단계에서 재결정 Slp1의 재구성이 발생한다. Slp1 흡착는 thusly 히 T를 보장하기 위해 60 분 동안 실시 하였다그는 거의 완전히 덮여 표면의 형성과 정기적으로 주문 단백질 격자. 실험 양전하 PE 층은 안정된 코팅을 달성하기위한 양도 할 수없는 것을 나타내고, 음의 끝 변형 약한 흡착 이상 코팅 속도론 리드 (38) (데이터는 보이지 않음). 약하게 부착 단백질 응집체는 Slp1없는 재결정 완충액으로 세척하여 제거 하였다. Δf에의 작은 변화는 N 낮은 단백질 탈착 및 Slp1의 안정적인 흡착을 확인합니다. 그럼에도 불구하고 손실은 더 큰 탄성 분자가 제거되었는지를 나타내는 ≈ 2.8 아래로 떨어진다.

그림 6
그림 QCM-D에 의해 분석 수정 된 SiO2를 센서에 Slp1 6. 재결정; Δf에 / ΔD 플롯 및 (B)의 표면에 두께 PROFIL (A)이자형; 이 수치는 SUHR, M. 등에서 수정되었습니다. 스프링과 SUHR, 엠 허가 (2014) 19 (2015) 20. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

이전에 언급 된 모델을 사용하여 계산 된 표면 프로파일 (켈빈 - 보이트 탄성 막에 대한 모델) 10.0 nm의 (경질 층 사우어 브레이 모델) (도 6b)의 ≈ 11.2 nm의 Slp1 단일 층 두께를 나타낸다.이 값보다 낮 SUHR, M. 등에 의해보고. (2014). 차이 모델링 내의 단백질 층의 밀도 다른 중고 값에 의해 설명 될 수있다. 전류 값은 L.의 살아있는 세포의 세포 표면에 S 층 단백질의 층 두께의 실체에 근접해야 스패 리 쿠스 JG-B53 31,42. 이 모델을 보여줍니다 그 사우어 브레이 관계 I때문에 흡착 Slp1 질량과 두께의 과소 평가 결과 점탄성 액체 필름 (81, 82)의 전단 탄성파의 전파, 음향 얇은 단백질 층에 부적절한이야. 이는 탄성 층 S 단백질의 특성 및 흡착 공정 중에 물 분자의 결합에 의해 설명 될 수있다. 단백질과 물의 상호 작용을 용이하게 흡착 층 (83)에 공동으로 수화 껍질, 점성 드래그 또는 포획의 형성에 의해 설명 될 수있다. 이것은 켈빈 - 보이트 모델로 측정 높은 층 두께 영향 및 서로 다른 두 모델에 의해 얻어진 층의 두께의 차이를 명확히 할 수있다. AFM 이전 연구에서, 약 8-12 nm 인 Slp1 격자 층의 두께를 측정 하였다. 질량 Slp1 흡착 대신 층 두께, 1506.6 NG ∙ cm -2 (켈빈 - 보이트 모델)의 총 ΔM을 계산에 의해 산출 하였다. 서핑에 대량 흡착 데이터에이스는 표 2에 요약 및 켈빈 - 보이트 모델의 값을 사용하여 높은 질량 흡착 표시된다.

M 최대 ΔM 최대 두께 두께
(NG / cm 2) (NG / cm 2) (㎚) (㎚)
(켈빈 - 보이트) (사우어 브레이) (켈빈 - 보이트) (사우어 브레이)
코팅 및 세척 후 Slp1 1,505.6 1,351.6 11.2 (10)

표 2 : 재결정 버퍼로 세척 한 후 QCM-D에 의해 분석 수정 된 고분자 전해질의 SiO2 결정에 Slp1의 흡착 질량 (PH = 8.0) 및 계산 층 두께를.

단백질 성 Slp1 단일 플라이와 금속 및 금속 순이익 상호 작용의 검출을위한 도구로 QCM-D

1 mM 내지 5 mM의 용해 금 (III)로 재결정 Slp1 단층의 상호 작용을 조사 하였다. 주파수 및 소산의 변화의 기록 데이터의 계산 및 모델링에서 얻은 총 흡착 된 질량의 결과를 표 3에 나타내었다. 금 (III)의 상호 작용의 QCM-D 연구 단층은 금속 생체 분자의 더 깊은 이해를 제공하여 상호 작용. 처음 결합능, 흡착 동역학 및 방법에 대한 메타L은 단백질 안정성 나노 범위의 영향을 연구 하였다. 빠른 흡착 질량을 나타내는 주파수가 최초 5 분 이내에 감소 Slp1 단층에 금속염 용액의 첨가 후. 이전의 연구 19 PD (II)와 같은 다른 금속에 기재 한 바와 같이 그럼에도 불구하고, 금의 흡착은 60 분 후에 완료되지 않았습니다. 질량 증가는 18 시간까지 발생한다. 이 시간이 지나면, 헹굼 단계는 흡착 된 금속이 거의 안정적으로 재결정 Slp1 층에 결합되는 것을 보여주는 금속 무료 버퍼로 하였다. 마지막으로, 955.0 ± 2.7 NG ∙ cm -2 (켈빈 - 보이트 모델)의 총 금속 흡수 1mM의 금 (III) 용액 케이스 4,534.4 ± 5.5 NG ∙ cm -2 (켈빈 - 보이트 모델)에서 얻었다 5mM의 경우 금 (III). 5mM의 금 (III) 용액에 의해 얻어진보다 높은 값이 작은 금속이 금 (0) -NP이 용액으로부터 형성 하였다 Slp1 극한의 환원 특성으로 설명 할 수있다. 이러한 적절한 감소Slp1의 관계는 이미 PD (II) 및 금에 대한 이전의 연구에서보고되고있다 (III) 32,33,79,84합니다. 데이터는 또한 골드 용액과의 상호 작용은 단백질 층의 불안정으로 이어지지 않는 것으로 나타났다. 이 단백질은 금과 같은 중합체를 이용한 ICP-MS의 측정에 의해 확인되었다 Slp1, 내지 (III)의 특이적이고 안정한 결합을 나타낸다.

합성 과정에서의 Au (0) -NP의 형성은 불그스레 한, 출발 황색 용액에서 색 변화에 의해 시각화 될 수있다. 이 색상 변화는 금속 나노 입자의 표면 플라즈몬 진동의 여기에 의해 발생하고 (0) 1,78 -NPs 금의 형성을 입증한다. 더욱이 작은 NPS 값 용액의 다른 채색에 표시 및 PCS의 측정 결과에 의해 검증 된 환원제의 농도 (더 높은 농도 탄닌산) (85)의 변형 예에 의해 합성 될 수있다 (데이터는 미도시). 에다른 한편으로는, 탄닌산 농도를 증가시키는 것은 NP 안정성의 손실을 초래하고 20 NPS는 응집하는 경향이있다. 원리의 증거로, 사전 합성 금 (0) -NPs (10의 크기 분포 -도 7a에서 볼 PCS에 의해 측정 된 18 나노 미터)을 48 시간 동안 중단 Slp1 배양하고, SDS-PAGE에 의해 분석 하였다. 도 7b에 도시 된 프로파일은 단백질의 Au (0)가 -NPs Slp1 구조를 방해하지 않도록, QCM-D 데이터로부터 도출 된 결론을 검증한다. 150 kDa의 단백질에서 관찰 된 밴드 그대로 Slp1의 존재를 증명한다.

그림 7
미리 합성 금의도 7 (A) 번호 가중치 크기 분포는 (0) 및 PCS (B) Slp1의 SDS-PAGE 단백질 프로파일 측정 -NPs; 레인 1 : 2 μg의 Slp1 금 (0) -NPs 상호 작용 및 레인 2 전 : 정지 1 μg의 Slp1 폴리머 후 48 시간의 incuba 미리 합성 된 금 (0)와 기입니다. -NPs 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

NP-합성 및 특성화 후 QCM-D 실험을 수행 하였다. 사전 합성 금속의 흡착 금 (0) 예시 Δf에 / ΔD 플롯 (그림 8)과 두께와 질량 프로파일 (그림 8B)와 같은 QCM-D 실험에 표시됩니다 -NPs.

그림 8
전 합성 금의 흡착도 8 (0) Δf에 / ΔD 플롯과 (B) 층 표면 및 질량 프로필 QCM-D (A)에 의해 분석 재결정 Slp1 래티스 상 -NPs."빈>이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

18 nm의 구형 금 (0) -NPs - 그것은 QCM-D는 (10)의 흡착을 검출하는데 사용될 수 있음을 확인할 수 있었다. AU-NP 희석 용액을 첨가 한 후 (520 내지 = 1) 기재된 합성하여 얻어지는, 주파수 사우어 브레이 방정식 (수학 식 1)의 예측에 의해 설명 질량 흡착 직접적인 지표 인 감소한다. Au로 흡착 (0) -NPs 거의 미만에서 60 분 이내에 완료되었다. 그것은 모든 반응성 부위 또는 기공의 Au (0) -NPs 의해 점유 된 것으로 가정 될 수 있으므로이 시간 후에 더 NPS는, Slp1 격자의 상부에 증착시켰다. 손실의 표시 감소는 순이익의 상호 작용에 의해 Slp1 격자 원인의 보강에 가입 할 수 있습니다. 총 질량 흡착의 값은 표 3에 요약되어 있습니다. NP-무료 구연산 버퍼에도 집중적 인 세척은 NEI 리드NP에의 탈착에 나 Slp1 단일 층의 분리에 THER. 따라서, 안정되고 강한 상호 작용은 금 (III)과 동일한면에서의 Au (0) -NP 상호 작용을 예측할 수있다.

금속 C 금속 ΔM 최대 ΔM 최대 두께 두께
(NG / cm 2) (NG / cm 2) (㎚) (㎚)
(켈빈 - 보이트) (사우어 브레이) (켈빈 - 보이트) (사우어 브레이)
1 밀리미터 (955) 932.6 --- ---
5 밀리미터 4,534.4 4,687.9 --- ---
AU (0) - --- 1,382.9 1,382.7 10.2 10.2
NP에

표 3 : 재결정 Slp1 격자 금 (III)의 상호 작용 후 (PH = 6.0)와 AU-NP 흡착 QCM-D와 금 (0) -NP 코팅 후 층 두께의 계산에 의해 분석 (PH = 4.7)에 흡착 질량. 데이터 SUHR, M. 등의 이전에 발행 된 결과를 비교 하​​였다. (2014) 19.

나노 미터 스케일 된 구조의 시각화에 대한 AFM

그림 9에서, Slp1의 단백질 격자 진폭 이미지와 같은 전형적인 사각형 격자 (P4)로 표시됩니다 PE 수정 센서에 재결정. 이전의 실험 30의 결과에 필적 14 나노 - 격자 상수는 13로서 결정될 수있다. AFM에 의해 측정 된 2.0 내지 ± 10 nm의 층의 두께는 11.2 nm의 ≈ (켈빈 - 보이트 모델링)의 QCM-D 측정치의 예측 층 두께를 확인 하였다. 표면 높이의 작은 차이는 calcul는 사실에 의해 설명 될 수있다고해상도 AFM 연구는 단지 일부 영역을 나타내고있다 ated QCM-D 맞춤은 전체 센서 영역을 고려한다. 이를 감안할 때, 센서 표면에 부착 된 단백질 응집체는 층 두께에 각각 흡착 된 질량의 계산에 포함 및 AFM에 의해 결정된 것보다 더 높은 층 두께가 주도 하였다.

그림 9
그림 9. AFM (L)의 재결정 Slp1 격자의 진폭 이미지 스패 리 쿠스 JG-B53 QCM-D의 결정에 직접 코팅 후 버퍼 마크가 표시된 영역의 확대로 세척; 이 수치는 SUHR, M. 등에서 수정되었습니다. 스프링의 허가 (2014) 19. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

(10) 그림은 그대로 Slp1를 보여줍니다 금 (III) 용액으로 배양 한 후 격자. 이 배양 후 단백질 격자 완전히 그대로 남아 있음을 나타낼 수있다. 이 피막의 안정성을 예측 QCM-D의 실험 결과를 확인한다. Slp1 격자에 표시됩니다 - 그림 11A와 B의 흡착은 -NPs이 (PCS에 의해 결정 18 nm의 크기는 10에서 다름) (0) 금을 미리 합성. 때문에 입자 크기, 금 (0) -NPs는 Slp1 기공에 흡착되어 Slp1의 P4의 -symmetry를 수행하지 않습니다. AU (0) -NPs 단백질 격자에 분산 된 통계이다. 즉 약 10 내지 19, 20의 범위에서, 더 작은 23 nm이고, - AFM 이미지 높이의 입자 크기를 측정함으로써 된 NP의 크기 (16)의 범위이다 (데이터는 미도시). 이 버전PCS에 의해 이전에 측정 된 결정 순이익의 크기 (그림 8에서 볼)을 하는지를 나타낸다.

그림 10
그림 10. AFM QCM-D 센서 결정에 재결정 그대로 Slp1 격자의 진폭 이미지 후 배양의 5 mM의 금 (III) 솔루션과 마크 된 지역의 확대; 이 수치는 SUHR, M. 등에서 수정되었습니다. 스프링과 SUHR, 엠 허가 (2014) 19 (2015) 20. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 11
흡착 금 (0) -NPs QCM-D 센서 결정에 재결정 Slp1 격자에 (왼쪽 그림 11. (A) AFM 진폭 이미지) 및 (B)는 3 차원 표면 형상 (오른쪽)를 재구성; 이 수치는 스프링과 라프, 제이 등의 허가 SUHR, M. (2015) 20에서 수정되었습니다. (2016) 라프, 제이 등. S-층 단백질을 기반으로 설계된 나노 구조의 산업용 애플리케이션에 기반 나노 복합체. (EDS Tijana (Z) 그 로브 및 Aitziber L. Cortajarena) (스프링 2016 (제출)). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

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Discussion

이 연구에서 상이한 분석 방법의 조합을 이용하여 조사 하였다 S 층의 Au 단백질의 결합을 연구 하였다. 특히, 금의 결합은 광산 물 또는 공정 용액에서 금의 회복뿐만 아니라, 물질, 예를 들면, 감각 표면의 건설을위한뿐만 아니라 매우 매력적이다. 금 상호 작용의 연구를 위해 (금 (III) 및 금 (0) -NPs)에 현탁하고 Slp1의 단층을 재결정 화하여, 단백질이 가지고 격리된다. 따라서 본 연구는 그람 양성 균주 L.의 성공적인 재배를 보여 주었다 스패 JG-B53과 표면층 Slp1 단백질의 분리. 그럼에도 불구하고, 재배 및 단백질 분리 도전을 유지하고 최적화해야합니다. 바이오 매스와 S-층 단백질의 대규모 생산은 금속 선택적 필터 재료의 제조에 모두 산업 응용 예를위한 전제 조건이다. 그들의 응용 가능성이있다 undoubtedl독성 금속의 제거 처리 또는 물에 용해 된 유가 금속의 회수, 폐수 또는 배출수 높은 Y. 또한, S-층에 대한 응용 가능성은 바이오 센서 및 촉매와 같은 다른 바이오 영감 재료, 자신의 추가 가능성을 고려하여 더 큰 것입니다.

현탁 Slp1 중합체의 배치 수착 실험 2.0-5.0 조사 pH의 범위 내에서의 Au (III)의 높고 안정된 결합 나타냈다. 이것에 의해, 60 %의 금속 제거 효율에 도달 할 수있다. 이 놀라운 결합 동작은 아마 단백질의 표면 상에 존재하는 카르복실기 및 질소 함유 기의 상호 작용을 통해 유도 Slp1과 금 (III)의 강한 상호 작용에 의해 설명 될 수있다. 이 인수는 유사한 변형 L.의 FTIR 및 EXAFS 조사에 의해 강화 될 수있다 스패 리 쿠스 JG-A12 32,79. 또한, Slp1의 고유 감소 특성 redu으로 금 (III)의 높은 R​​E를 설명 할 수를 향하도록하는 것은 금을 nanoparticular (0). 그것은 S-층은 환경에 박테리아의 첫 번째 인터페이스로, 결합 금속에 주로 관여해야한다고 가정 할 수있다. 조사 pH 범위 내에서, 102.5 mg의 금 (III)과 결합능이 높은 금속 / g Slp1는 pH가 4.0에서 달성 하였다. 이 결합 용량은 바실러스 서브 틸리 스 (Bacillus subtilis)의 고립 된 세포벽 (71.5 mg의 금 (III) / G) 다른 바이오 구성 요소, 예를 들어,보고보다 높은 86 또는 클로렐라 심상 (98.5 mg의 금 (III) / g)을 8의 바이오 매스 .

ICP-MS는 Slp1 폴리머에 의해 결합 된 금속의 결정에 사용되는 매우 민감한 방법이며이 연구에서 금의 작은 양의 검출을 할 수 있습니다. ICP-MS는 예를 들면 미량의 금속 결정, 쉽게 핸들링 시스템과 낮은 검출 한계를 수행하기위한 많은 장점을 제공한다; 1 PPT - 0.1 다운 황금의 경우. 이는 낮은 농도 범위에서 biosorptive 프로세스를 조사하고이 방법을 다양한 도구를 만드는에스. 그러나, 이러한 조사의 결과를 S-현탁 중합체 층으로 쉽게 획득하고, 표면 상에 재결정 S-격자 층에 전달 될 수없고, 따라서, ICP-MS의 제한을 나타낸다. 예를 들어, 절연 단백질 중합체의 직접적인 관계는 중요한 박테리아 세포에 S-그 층 구조로 이루어지지 될 수있다. 또한, ICP-MS 측정은 금속 수착의 운동의 결정을 허용하지 않는다. 따라서, 얇은 필름을 고정화 단백질에 의해 결합 된 금속의 조사를위한 방법이보다 적합 찾을 필요가있다.

본 연구에서는, QCM-D 분석은 표면에 S 층의 격자 시튜 형성뿐만 아니라 단백질의 금의 침착을 검출하기 위해 적용 하였다. 따라서, QCM-D는 분자 흡착과 상호 작용 과정의 인식을위한 견고하고 재생 가능한 방법이다. 또한 QCM-D가 S를 모니터링하는 비교적 간단하고 비용 효율적이며 무해한 방법은UCH 온라인을 처리합니다. 방법 겨 ∙ cm -2 ≈ 0.5의 액체에서 최대 질량 감도 질량 변화를 검출하는 이점이있다. 이 가능성은 용해 된 금속과 단백질, 예에도 약한 상호 작용을 검출하거나 낮은 농도 범위에서 adsorptions를 측정 할 수있다. QCM-D의 단점은 이것이 예를 들어, 단백질의 시각화를 그릴 수 있도록 구조 영상 법 없다는 것이다. 따라서, 다른 기술이 필요하다.

QCM-D는 AFM 영상으로 추적 관찰이 연구에서 분석한다. 이들 방법의 조합에 따라서는 이들이 박형 필름 금속 단백질 상호 작용을 조사하는 다용도 공구임을 증명 흡착 동역학 및 코팅 용의 Au 수착 결과의 조사를 허용했다. 또한, 기술 지원에 S 층 단백질의 신뢰성 재결정 후의 단백질 상호 작용 연구에 필수적인 것으로 나타났다. 그곳에전단, 접착 촉진제를 사용하여 표면의 변형이 관심이다. 고속 단백질 코팅하는 개선 된 방법에의 SiO2 표면 단백질 층 리드 사이 중간층 (양전하 PE들로 끝나는) 고분자 전해질의 기술 된 구현. 양 전하 고분자 전해질 층의 긍정적 인 효과는 L.의 중요한 박테리아 세포의 예 고정화 전술 한 스패 리 쿠스 JG-B53 (31). 제시 PE-층의 구현은 S 층 단백질 이후 성공적인 재현성 재결정 가장 중요하고 중요한 단계이다.

그것은 Slp1의 얇은 층의 조사, QCM-D는 실시간으로 단층 필름과 같은 단백질 재결정에 각각의 질량 흡착을 보여줄 수있는 좋은 방법임을 입증 할 수있다. 이것은 또한 S 층의 단백질 L. SbpA의 재 조립을 위해 이전에 관찰 될 수있다 스패 리 쿠스 </ EM> CCM2177 47. 후속 고해상도 AFM을 이용하여 단백질 자체 어셈블리 격자 구조의 변화가 가시화 될 수있는 분석. AFM 측정 Slp1의 P4 대칭을 밝혀 약 10 나노 미터의 Slp1의 모델링 층 두께를 확인합니다. 또한, 단백질 층과 용해 된 금속 이온의 직접적인 상호 작용 (III) 기본 단백질로의 Au 층의 양호한 결합을 증명 QCM-D에 의해 모니터링 될 수있다. 작은 Au로 형성 가능성 (0) -NPs QCM-D 측정 Slp1 내의 격자의 본질적인 특성에 의한 환원 단백질 기공 내부의 Au (III) 용액을 후속 AFM 측정에 의해 검출되지 수로부터. 이는 AFM의 분해능 한계 및 본 연구에 설정된 실험과 관련 될 수있다. 이것은이 기법과 서브 나노 미터 크기의 생체 분자에 대한 고해상 이미지의 필요성의 한도를 나타낸다. 그러나, 재결정 Slp1 층의 높은 안정성 번째로부터 추론 될 수있다E는 QCM-결과 얻어진 AFM 조사에 의해 확인 하였다.

결론적 Slp1 중합체가 조사 pH의 범위 내에서 높은 금 금속 결합 능력을 가지고 있음을 표시 할 수있다. 또한, 조사 Slp1 격자가 좋은 매트릭스 금속 이온 결합과 금속 나노 입자의 고정화를위한 것임을 알 수있다. 이는이 문서에서 사용 된 방법은 각각의 범위에서 나노 스케일 구조를 시각화 할 수 심지어 작은 금속의 상호 작용, 또는 AFM 경우를 검출 할 가능성이 있다고 보여 질 수있다. 하지만, 그것은 단지 분자 수준에서 조사 단백질의 지식 및 이해를 향상 할 수있다 이러한 도시 된 방법의 조합에 의해서이다.

주로, QCM-D와 AFM은 미래의 단백질 단층 흡착의 조사 및 금속과 기능성 분자와의 상호 작용에 대한 선택의 선호하는 방법입니다. 이러한 두 가지 방법, S 층 단백질 광고의 검출을 조합하여흡착 공정 및 표면 영상은 살아있는 박테리아의 지식과 자신의 환경과의 상호 작용을 향상시키기 위해 전송 될 수있다 분자 프로세스에 대한 통찰력을 제공한다. 이 연구는 이해의 단백질과 금속의 상호 작용에 도움이 가능한 방법의 발췌를 보였다. 생체 분자의 조사를 위해 다양한 분광 분석법 및 크로마토 그래피 방법에 이르기까지 상세히 이러한 공정의 기술을 향상시킬 수있는 다른 유용한 기술은 향후 연구에 포함되어야한다.

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Disclosures

저자가 공개하는 게 없다.

Acknowledgments

본 연구는 부분적으로 BMWi과 BMBF 프로젝트 "Aptasens"(BMBF / DLR 01RB0805A)에 의해 투자 IGF-프로젝트 "S-체"(490 ZBG / 1)에 의해 투자되었다. AFM 연구 중과 영어를 모국어 스피커로 원고를 읽는 에릭 V. 존스턴에 그의 귀중한 도움을 토비아스 J. 귄터 특별 감사. 또한, 본 논문의 저자 (ICP-MS 측정에 도움을 자원 생태 연구소)에서 알린 리터와 사브리나 Gurlit 감사드립니다, Manja 보겔, 낸시 엉거, 카렌 E. Viacava와 헬름홀츠 연구소의 그룹 생명 공학 자원 기술에 대한 프라이 부르크.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
equiment and software
Bioreactor, Steam In Place 70L Pilot System Applikon Biotechnology, Netherlands Z6X Including dO2, pH sensors of Applikon Biotechnology and BioXpert software V2
Noninvasive Biomass Monitor BugEye 2100 BugLab, Concord (CA), USA Z9X ---
Spectrometer Ultrospec 1000 Amersham Pharmacia Biotech, Great Britain 80-2109-10 Company now GE Healthcare Life Sciences
MiniStar micro centrifuge VWR, Germany 521-2844 For centrifugation of cultivation samples
Research system microscope BX-61 Olympus Germany LLC, Germany 037006 Microscope in combination with imaging software
Cell^P (version 3.1) Olympus Soft Imaging Solutions LLC, Münster, Germany --- together with microscope
Powerfuge Pilot Separation System Serie 9010-S Carr Centritech, Florida, USA 9010PLT For biomasse harvesting
T18 basic Ultra Turrax IKA Labortechnik, Germany 431-2601 For flagella removal and sample homogenization
Sorvall Evolution RC Superspeed Centrifuge Thermo Fisher Scientific, USA 728411 Used within protein isolation
Mobile high shear fluid processor, M-110EH-30 Pilot Microfluidics, Massachusetts, USA M110EH30K Used for cell rupture
Alpha 1-4 LSC Freeze dryer Martin Christ Freeze dryers LLC, Osterode, Germany 102041 ---
UV-VIS spectrophotometry (NanoDrop 2000c) Thermo Fisher Scientific, USA 91-ND-2000C-L For determination of protein concentration
Mini-PROTEAN vertical electrophoresis chamber Bio-Rad Laboratories GmbH, Munich, Germany 165-3322 For SDS-PAGE
VersaDoc Imaging System 3000 Bio-Rad Laboratories GmbH, Munich, Germany 1708030 Used for imaging of SDS-PAGE gels
ICP-MS Elan 9000 PerkinElmer, Waltham (MA), USA N8120536 For determination of metal concentration
Zetasizer Nano ZS Malvern Instruments, Worcestershire United Kingdom ZEN3600 For determination of nanoparticle size
Q-Sense E4 device  Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-E4 ordered via LOT quantum design (software included with E4 platform)
Q-Soft 401 (data recording) Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden
Q-Tools 3 (data evaluation and modelling) Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden
QCM-D flow modules QFM 401  Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-QFM401 ordered via LOT quantum design
QSX 303 SiO2 piezoelectric AT-cut quartz sensors Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-QSX303 ordered via LOT quantum design
Ozone cleaning chamber Bioforce Nanoscience, Ames (IA), USA QS-ESA006 ordered via LOT quantum design
Atomic Force Microscope MFP-3D Bio AFM Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA MFP-3DBio AFM measurements and imaging software
Asylum Research AFM Software AR Version 120804+1223 Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA --- imaging software included in Cat. No. MFP-3DBio
Igor Version Pro 6.3.2.3 Software WaveMetrics, Inc., USA --- imaging software included in Cat. No. MFP-3DBio
BioHeater Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA Bioheater Sample heater for AFM measurements
Biolever mini cantilever,  BL-AC40TS-C2 Olympus Germany LLC, Germany  BL-AC40TS-C2 Prefered cantilever for AFM measurements
WSxM 5.0 Develop 6.5 (2013) Nanotec Electronica S.L. , Spain freeware Software for AFM analysis
Name Company Catalog Number Comments
Detergents and other equiment
acidic acid, 100 %, p.A. CARL ROTH GmbH+CO.KG 3738.5 Danger, flammable and corrosive liquid and vapour. Causes severe skin burns and eye damage.
Antifoam 204 Sigma-Aldrich Co. LLC. A6426 For foam suppression
bromophenol blue, sodium salt Sigma-Aldrich Co. LLC. B5525 ---
Coomassie Brilliant Blue R (C45H44N3NaO7S2) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3862.1 ---
Deoxyribonuclease II from porcine spleen Sigma-Aldrich Co. LLC. D4138 Typ IV , 2,000 - 6,000 Kunitz units/mg protein
Ethanol, 95% VWR, Germany 20827.467 Danger, flammable
glycerine, p.A. CARL ROTH GmbH+CO.KG 3783.1 ---
Guanidine hydrochloride (GuHCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 0037.1 ---
Hellmanex III Hellma GmbH & Co. KG 9-307-011-4-507 ---
Hydrochloric acid (HCl) (37%) CARL ROTH GmbH+CO.KG 4625.2 Danger; Corrosive, used for pH adjustment
Lysozyme from chicken egg white Sigma-Aldrich Co. LLC. L6876  Lyophilized powder, protein = 90 %, = 40,000 units/mg protein (Sigma) 
Magnetic stirrer with heating,  MR 3000K Heidolph Instruments GmbH & Co.KG, Germany 504.10100.00 Standard stirrer within experiment
NB-Media DM180 Mast Diagnostica GmbH 121800 ---
Nitric acid (HNO3) CARL ROTH GmbH+CO.KG HN50.1 Danger; Oxidizing, Corrosing
PageRuler Unstained Protein Ladder ThermoScientific-Pierce 26614 ---
Poly(sodium 4-styrenesulfonat) (PSS) Sigma-Aldrich Co. LLC. 243051 Average Mw ~70,000
Polyethylenimine (PEI), branched Sigma-Aldrich Co. LLC. 408727 Warning; Harmful, Irritant, Dangerous for the environment; average Mw ~25,000
Potassium carbonate anhydrous (K2CO3) Sigma-Aldrich Co. LLC. 60108 Warning; Harmful
Ribonuclease A from bovine pancreas  Sigma-Aldrich Co. LLC. R5503 Type I-AS, 50 - 100 Kunitz units/mg protein 
Sodium azide (NaN3) Merck KGaA 106688 Danger; very toxic and Dangerous for the environment
Sodium chloride (NaCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3957.2 ---
Sodium dodecyl sulfate (SDS) Sigma-Aldrich Co. LLC. L-5750 Danger; toxic
Sodium hydroxide (NaOH) CARL ROTH GmbH+CO.KG 6771.1 Danger; Corrosive, used for pH regulation within cultivation and pH adjustment
Spectra/Por 6, Dialysis membrane, MWCO 50,000  CARL ROTH GmbH+CO.KG 1893.1 ---
Sulfuric acid (H2SO4) CARL ROTH GmbH+CO.KG HN52.2 Danger; Corrosive, used for pH regulation within cultivation
Tannic acid (C76H52O46) Sigma-Aldrich Co. LLC. 16201 ---
TRIS HCl (C4H11NO3HCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 9090.2 ---
Triton X-100 CARL ROTH GmbH+CO.KG 3051.3 Warning; Harmful, Dangerous for the environment
VIVASPIN 500, 50,000 MWCO Ultrafiltration tubes Sartorius AG VS0132 ---
β-mercaptoethanol Sigma-Aldrich Co. LLC. M6250 Danger, toxic

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Slp1 중합체 및 단층의 AU-상호 작용<em&gt; Lysinibacillus 스패 리 쿠스</em&gt; JG-B53 - QCM-D, 생체 분자 - 금속 연구 도구로서 ICP-MS와 AFM
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Suhr, M., Raff, J., Pollmann, K.… More

Suhr, M., Raff, J., Pollmann, K. Au-Interaction of Slp1 Polymers and Monolayer from Lysinibacillus sphaericus JG-B53 - QCM-D, ICP-MS and AFM as Tools for Biomolecule-metal Studies. J. Vis. Exp. (107), e53572, doi:10.3791/53572 (2016).

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