Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
JoVE Journal Developmental Biology
Click here for the English version

Developmental Biology

בניית מודלים אלמנטים סופיים לחקור ביומכניקה לסת דג הזברה

Published: December 3, 2016 doi: 10.3791/54811
Automatic Translation
1, 1, 2, 1
1Physiology, Pharmacology and Neuroscience, University of Bristol, 2Earth Sciences, University of Bristol

Introduction

דוגמנות אלמנט סופי (FE) היא טכניקה הנדסה שניתן לחשב המחשוב ולמפות את גודל ומיקום של זנים שפועלים על מבנה 1. המודל מורכב מבנה 3D, מיוצג על ידי רשת של "אלמנטים סופיים", ואת התוצאה הסופית של הניתוח נשלטת על ידי מספר גורמים, כולל את המבנה ואת מספר אלמנטי הרשת, העוצמת והמיקום של המכנים המון ואת תכונות חומר. תכונות חומר לתאר היבטים מסוימים של ההתנהגות של חומר תחת סוג של עומס נתון; מודול יאנג (E) מתאר את האלסטיות של החומר תוך מקדם פואסון מתאר את הירידה המידתית ברוחב של חומר אורכו כאשר מדגם נמתח. דוגמנות FE יכול לשמש כדי לחשב מגוון רחב של משתנים ובהם עקירה, מתח, לחץ ומשחק הלחץ על מודל על ידי לקיחת בחשבון את נתוני הקלט שמייחד את מבנה '; S צורה, מיקום וגדל המון ואת תכונות חומר המבוקשות.

דוגמנות FE נעשה שימוש נרחב בהנדסה 2 ויותר עבור יישומים אורתופדיות 3 ו כפליאונטולוג 4. בפיתוח כוחות ביומכניים ידועים לפעול כגירוי בתאים רבים כדי להפעיל תגובות תא 5-8 וזה שימושי לחזות הוא את המיקום היחסי ואת הבהירויות של גירויים מכאניים בתוך בפיתוח מערכות איברים, לעומת זאת, כיום דוגמנות FE כבר המשמש קצת לפיתוח דג הזברה.

הסחוס והעצם שניהם הוכחו להיות חומרי mechanosensitive. לדוגמא, במבחנת דחיסה נמצאה להפעיל מסלולי chondrogenic, תוך מתח הוכח להיות הכרחי עבור עצם היווצרות 9. FE הניתוח (FEA) נוצל מודל זנים הפועלים דגימות ביולוגיות, כולל הפועלים אלמנטי שלד במהלך עצם FOrmation 10. פיתוח יישומים אחרים כוללים את שימוש בו כדי לחזות את הצורה של ג'וינט לאחר שהוא נחשף כוחות ביומכניים תיאורטי 11,12 וכדי להראות הדפוס של זנים נוכחים במהלך המורפוגנזה מפרק ברך חומוס 8.

פרוטוקול זה נועד לשתף את החוויה של יצירת משטחים 3 ממדים, משתלב ומודלי אלמנטים סופיים מתמונות confocal עם נוף להבנת המכניקה של רקמות מתפתחות. אנחנו גם להראות דרכים של תיקוף המודלים FE אף לכידת מידע עקירה משותף אמיתי in vivo. בעוד אנו משתמשים לסת דג הזברה כדגם אותן הטכניקות יכולות לשמש על כל מערכת ביולוגית קטנה עבורו מידע 3D על המבנה של מערכת השלד והשרירים ניתן להשיג על ידי הדמית confocal או multiphoton.

Protocol

כל השלבים שונים הפרוטוקול אחרי מאונ' הטיפול בבעלי החיים של הבריסטול והנחיות רווחה לבין אלה של משרד הפנים בבריטניה.

ויזואליזציה 1. לאנטומיה השלד והשרירים

הערה: כדי להמחיש את הצורה של אלמנטים השלד, לכמת שרירים כדי למצוא את המיקום המדויק של הקבצים המצורפים שריר, immunostain (סעיף 1.1) דגים בגיל המתאים עבור שרירן השלד (אשר חושף שרירים) וקולגן מסוג II (לדמיין סָחוּס). לחלופין, לדמיין את האנטומיה השריר-שלד באמצעות קווי כתב ניאון מהונדסים כגון col2a1 כתב a1 קולגן: mCherry 13,14 לדמיין סחוס ואת smyhc כתב השרשרת כבדה האיטי השרירן: GFP 15 כדי להמחיש את העמדה מצורפת שריר (סעיף 1.2).

קווים אלטרנטיביים המסמנים סחוס ושרירים יכולים לעבוד באותה מידה.

  1. פלורסנט Immunostaining
    1. תקן זחל paraformaldehyde 4% העודפים (PFA) ב פוספט שנאגר מלוח (PBS) במשך שעה 1. לשטוף ב- PBS עם 0.1% Tween 20 (PBT) ו מייבשים מתנול 50% (MeOH) ב PBT ו 100% MeOH במשך 5 דקות בהתאמה.
      זהירות: PFA הוא רעיל, יש לטפל בהתאם גיליון בטיחות חומרים.
      הערה: זחל ניתן לאחסן 100% MeOH עד לרגע השימוש.
    2. רעננותם זחל ב -50% MeOH ב PBT במשך 5 דקות. לשטוף PBT במשך 5 דקות.
    3. Permeabilize זחל טריפסין 0.25% ב PBT על קרח למשך 5-6 דקות. לשטוף 4x PBT במשך 5 דקות כל אחד.
    4. חסום במשך 2-3 שעות בסרום 5% ב PBT.
    5. דגירה הזחל עם הדילול המומלץ של קולגן אנטי סוג הארנב 2 ונוגדנים נגד שרירן העכבר בסרום 5% ב PBT במשך שעה 1 ב טמפ החדר או לילה ב 4 מעלות צלזיוס.
      הערה: טווח הדילול המומלץ הוא בדרך כלל על גיליון נתוני נוגדן. בחר נוגדנים אשר מועלות כנגד זנים שונים זה לזה וכי הם גם diffeלשכור לרקמה.
    6. לשטוף 6x זחל במשך 15 דקות ב PBT.
    7. חסום במשך 1-2 שעות בסרום 5% ב PBT.
    8. מדגירים נוגדנים משני בחושך. השתמש שכותרתו fluorescently ועכבר אנטי (550) ו-ארנב נגד (488) נוגדנים משני ב דילול מתאים בסרום 5% ו PBT עבור הנוגדן הספציפי.
    9. לשטוף 6X במשך 10 דקות כל אחד ב PBT ותמונה על מיקרוסקופ confocal 10X בהקדם האפשרי.
  2. הדמיה השלד והשרירים גיאומטריה
    1. הר הזחלים ventrally על coverslip ב נקודת התכה 0.3-0.5% נמוך פושר (LMP) agarose בתמיסה של Danieau 16.
      הערה: דג מהונדס יהיה צורך מסומם ב 0.02% MS222 (methanesulfonate Tricaine, pH 7) לפני הרכבה ובמהלך הדמיה.
    2. קח ערימת תמונת confocal של האזור של עניין באמצעות העדשה 10X אובייקטיבית הזום הדיגיטלי כ פי 2.5. הכנת תמונות של ערוץ ירוק ואדום באמצעות 488 ננומטר ו 561 nמ לייזרי בהתאמה. תמונה ברזולוציה פיקסל 512 x 512 עם מרווח בין מטוסי z של 1.3 מיקרומטר ו -3 ממוצעי קו. המחסנית וכתוצאה מכך תהווה של כ -100 פרוסות z.
    3. לייצא את הנתונים כסדרה TIFF. תחזיות מקסימלי של אלמנטים שריר וסחוס של פגית דג הזברה 5dpf מוצגים באיור 1.

2. יצירת משטח 3D

  1. בחר במערך נציג עבור כל נקודת זמן ב -3, 4 ו -5 DPF (בחר לאחר להדמיה של דגימות מרובות).
  2. פתח ערימת TIFF 3 ממדים ובחר את כל ערוצי תוכנת ניתוח. קליק ימני על ערוץ הסחוס ובחרתי תמונת מסנן חלק: גאוס (איור 2 ב).
  3. לאור פרויקט קליק ימני על תמונה מסוננת ובחר 'פילוח תמונה' ולאחר מכן 'לערוך תווית חדשה'. צור תווית חדשה עבור כל חומר, כלומר, סחוס joint. בחר את אזור הסחוס של התמונה (איור 2C, אות לבן, מתאר סגול) באמצעות הכלי מטה הקסמים. השתמש בכלי המברשת כדי להסיר את רעש מן המתאר.
    הערה: אם אתה משתמש בכלי מטה קסם, לחץ על 'כל הפרוסות'.
  4. בחר את האזור המשותף עם כלי המברשת ולהקצות לרכיב משותף (איור 2 ג, מתאר כחול)
  5. מספר פרוסות חלקות בבת אחת על ידי בחירת פילוח בתפריט העליון ותוויות חלקות. קליק ימני על התמונה ובחר ליצור משטח לייצר משטח 3D לדקלם של הרכיב (איור 2 ד).
  6. הקש על המשטח ולשמור נתונים כקובץ hmascii לצורך יבוא תוכנת meshing.

3. חישוב הכוחות השרירים כדי לשמש דגם FE

  1. לספור את מספר סיבי שריר מתמונות confocal של smyhc: דג הזברה מהונדס GFP (איור 1 א ', ראש חץ, 1C) ולמדוד את קוטרeter של סיבים כדי לחשב שטח החתך שלהם (πr 2).
  2. זהה כוח מתאים ליחידת שטח שריר מהספרות. כוח השריר המקסימאלי שנוצר ליחידת שטח עבור שרירי שלד דג זברת זחל (40 ננ / מיקרומטר 2) שמש 17.
  3. לחשב את הכוחות לכל קבוצת שרירים אנטומיים ידי הכפלת מספר סיבי ושטחם ידי הכוח ליחידת שטח. ראה טבלה 1.

4. יצירת Mesh

  1. ייבא את מודל 3D שנוצר בסעיף 2 (לעיל) לתוך חבילת תוכנה מסוגלת לייצר רשת אלמנטים סופית.
  2. צור רשת A2D של הסחוס ומשטחים משותפים על ידי שימוש באפשרות הפסיכולוג לעטוף תחת תפריט 2D. בחר גודל אלמנט מתאים.
    הערה: השתמש בגודל אלמנט בין 1.5-2.5. במידת הצורך, ליצור מגוון של השטח 2D בגודל שונה משתלב לבצע אופטימיזציה רשת 3D (סעיף 4.4).
  3. לבצע בדיקות איכות רשת למצוא תחת "כלי 2D>> בדוק אלמנטים" לוח לבדוק אלמנטים כפולים, הוספות וחדירות של הרשת. תקן זוויות dihedral באמצעות לשונית שירות עץ מודל.
  4. צור רשת 3D מן משתלב משטח 2D עם הבדלי גודל האלמנט באמצעות subpanel 3D> Tetramesh.
    הערה: השווה את התוצאות של גדלי רשת שונים ובחר את מודל FE עם גודל הרשת הנמוך ביותר מתכנס לאחר סימולציות נוספות כלשהו ואינו משפיע על הגדרת תכונה. הדוגמא באיור 3 מכילה 1.5 מיליון אלמנטים tetrahedral עבור סחוסי הלסת התחתונים והייתה לו גודל אלמנט 2D של 2.0.
  5. להפוך את הרשת כך מודל לסת הוא להתרחב בד בבד לכל מחסנית confocal באמצעות subpanel הגיאומטריה> המרחק.
    הערה: ודא הסחוס ורכיבים משותפים מחוברים במודל על ידי יצוא מודל ממוזג או באמצעות קשרים.

5. Mod אלמנטים סופייםאל בניה

  1. באמצעות אלמנטים סופיים תוכנה מסחרית (FE), ליצור מודל FE. באמצעות ערימות confocal 3D השרירים שכותרתו סחוס שנוצרו בסעיף 1 כמדריך, להקצות צמתים מתאימות נקודות מצורפות שריר. צור וקטור בין שני צמתים המייצגים את המקור ואת החדרת כל שריר (איור 3).
  2. צור אספן עומס מסוג 'היסטוריה' כדי להחיל "עומס ג 'עבור כל שריר. ציין את גודל ב ניוטונים (המחושב בשלב 3.3) ולהקצות וקטור הקשורים. איור 3 מציג את נקודות ההתקשרות עבור mandibulae adductor (PM), מד-זווית hyoideus (PH) ו intermandibularis (IM).
    הערה: לקבלת שרירי לסת אלה, כוח התכווצות מקסימלית מופץ בין מוצא ההחדרה כך שרק 50% של כל אחד מעומסי מוחל בכל אתר.
  3. הקצאת תכונות החומר איזוטרופיים אלסטי המתאים כפי שנקבע על ידי הספרות. מודול יאנג עבור סחוסואת interzone במודל זה היו 1.1 מגפ"ס ו 0.25 מגפ"ס בהתאמה ויחס פואסון היה 0.25 עבור שני 18,19.
  4. צור אספן עומס של 'הגבול' הסוג להחיל מגבלות ראשוניות לדגם. עבור אל כרטיסיית ניתוח> האילוצים של subpanel ליצור, לאסוף את הבלוטות לדגם ברצונך להגביל. בחר את דרגות החופש (DOF) כי מגבילים את התנועה של המודל הקירוב הטוב ביותר של טווח התנועה הטבעי.
    הערה: המודל באיור 3 היה מוגבל בכל צירי תנועה (DOF: 1, 2, 3 מייצגים x, y ו- z, בהתאמה) בבית ceratohyal לעגן אותו בחלל בנקודה אמצע במודל וב ציר y ו- z בנקודה שבה palatoquadrate מתחבר לשאר הגולגולת דג הזברה (איור 3, טבלה 1). המודל חייב להיות מוגבל בכל השלושה DOF בתוך צומת לפחות אחד.
  5. צור "צעד טען ', עבור כל סוג של תנועה ברצונך מכשירי כושראכול (כלומר, פתיחה, סגירה), תחת תפריט הניתוח ובחר את כל ההמון הרלוונטי (עשה בסעיף 5.2) ואילוצים (עשה בסעיף 5.4) כדי לדמות את התנועה הזאת. בחירה 'סטטי' מן התפריט הנפתח כאשר הוא מופיע.
  6. מודל יצוא כוללים רשת, המון, אילוצי תכונות חומר בפורמט קובץ מתאים, בפורמט ".inp" במקרה זה.
  7. מודל טען לתוך תוכנת ניתוח FE. יצירה וביצוע עבודה עבור המודל באמצעות מודול איוב.
  8. לנתח פלט מתח, מתח, עקירה, וכו המצויות בתפריט להדמיה הכרטיסייה ותוצאות (איור 4 ו -5).

6. אימות של לסת דפורמציה / עקירת מרחקים

  1. בחר 3-6 Tg (Col2a1aBAC: mCherry) דג הזברה מהונדס.
  2. קלות לטשטש את הזחלים עם MS222 0.02% עד שהם מפסיקים להגיב למגע אך ליבם עדיין פועם.
  3. הרהזחלים רוחביים (תוך מורדם) על coverslips ב agarose LMP פושר 1% (המורכבים בתמיסה של Danieau).
  4. הסר את agarose מרחבי הראש והלסתות עם מלקחיים.
  5. לשטוף הטרי הפתרון של Danieau (ללא MS222) מעל ראשו של הזחל להסיר הרדמה בעזרת פיפטה פסטר עד תנועות פה נורמליות לחדש.
  6. השתמש בתוכנת לכידת סרט לקחת קטעי וידאו בהיר שדה מהיר של תנועות פה. קח סרטים של סביב משך דקות בקצב התמונות הגבוה ביותר, או מספיק כדי להקליט מחזורים רבים של פתיחת לסת.
  7. בחר מסגרות המציגות את הלסת פתוחה העקירה המקסימלית שלה. למדוד את המרחק בין הקצה הקדמי של הסחוס של המקל ואת הלסת העליונה (קץ צלחת כִּברָתִי) ב מיקרומטר.
  8. חשב את עקירת ממוצע זחלי דג מרובים.
  9. לחלץ נתוני עקירה מהמודל. השתמש העקירה הממוצעת מחושבת ב 6.8 לאמת התנהגות תזוזת מודל (

Representative Results

Immunostaining עבור שריר (איור 1 א) וסחוס (איור 1B) או הדמיה של כתבים מהונדסים (תרשים 1C) מאפשר מבנה 3D של הלסת להיות מדמיין, יחד עם השרירים הקשורים. על ידי הדמיה ברזולוציה גבוהה ניתן היה לבנות מודל לוכד הוא הצורה התל-ממדית של הלסת (איור 2) ואת המיקום ומיקום של עומסים (איור 3). ניצול ב התקות vivo לראות דרך לכיד וידאו במהירות גבוהה (איור 4) אנו מאשרים כי את טווח התנועה במודל היה בטווח מציאותי.

מודלי FE פעם ריצה יכולים לשמש כדי להציג מגוון של נתונים, כגון מתח (איור 5 א), מינימום ומתח עיקרי מרבי (איור 5 ב - K). תוצאות אלו עולות שלושה עמומות ensional כך המודל יכול להיות מוגדל לראות דפוסים בסדר הפירוט (איור 5E, 5i) לסובב להשיג צפיות רלוונטי (איור 5F, 5G, 5J, 5K) מחולק באופן דיגיטלי (5E איור ', 5E' ', 5i', 5i '') כדי להראות עד כמה דפוסי מתח, מתח או שינוי בלחץ לאורך כל דגם. כמו כן ניתן לחלץ נתונים כמותיים מהמודל (לא מוצג). על ידי אימות המודל באמצעות תכונות חומר המדויק ביותר, המון רשת צורת המודל FE יכול לשמש כדי לחקור את האומדן הטוב ביותר של הסביבה המכאנית נחווים על ידי תאים במהלך החלון של פיתוח. התוצאות של המודל ניתן להשוות באופן ישיר לשינויים בהתנהגות הסלולר ביטוי גנים 20.

בתשובה לשאלה 1 "src =" / files / ftp_upload / 54,811 / 54811fig1.jpg "/>
איור 1:. נציג תמונות של אלמנטי השלד של לסת דג הזברה הנמוכה ב 5 DPF ערימות confocal נציג של הלסת התחתונה של זחלי 5dpf כל מוצג עם קדמי למעלה (א) Immunostaining עבור A4.1025 אשר מכתים את כל שרירן השלד (B) immunostaining עבור קולגן סוג II המסמן את כל הסחוס (C) סטאק של פגיית חיים המבטאים את col2a1 הכתבים המהונדס: mCherry סימון סחוס (אדום) ו smyhc: שרירים איטיים GFP (ירוק). IA: הקדמי intermandibularis, PH: המד hyoideus, AM: adductor mandibulae, HI: hyoideus נח, HI: hyoideus מעולה, CH: sternohyoideus, MC: הסחוס של המקל, PQ: Palatoquadrate, CH:. Ceratohyal אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של נתון זה.

"FO: keep-together.within-page =" 1 "> איור 2
איור 2: דור של משטח 3D מנתונים confocal תמונות מראות את המעבר מנתוני confocal לתוך משטח 3D עבור לסת דג הזברה הנמוכה עם גדלה גבוהה של האזור המשותף.. (א) נתונים confocal גלם; (ב) מערך נתונים לאחר היישום של מסנן גאוס; (ג) מתאר מסונן; (ד) משטח 3D. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 3
איור 3: משתלב נציג מראים אילוצי וקטורי כוח משתלב נציג עבור זחל 5 DPF עבור (א) סגירת פה.(ב) פתיחת פה. נקודות לבנות מציינים במקומות בהם מודל מוגבל ושבהם ממדים (למשל, x ו- y או x, y ו- z). קווים לבנים לציין עמדות שרירות, עם הווקטור בכוח השריר כונה על ידי חצים לבנים. אדום עולה סחוס צהוב interzone. נתון זה יש הבדל בין חומר משלים שפורסמו בעבר בנטל et al. 15. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 4
איור 4:. בדיקות רגישות FE-מודל המדמה עקירה בלסת דג הזברה 5dpf לסחוס שונים moduli של interzone יאנג. לסת עקירה (פתוח סגור מיקרומטר) מסומן על הלסת; רשם באמצעות מקש הצבע. כל דגם (A - L) יש שילוב שונה של סחוס (c = 1.1, 3.1, או 6.1 MPA) או interzone (i = של 0.25, 0.5, 0.75, או 1 נכסים MPA). חץ שחור אופקי מדגיש את הערך של עקירת בלסת בקצה של הסחוס של המקל (המיוצגים על ידי החץ השחור האנכי). M ו- N סטילס מתוך וידאו של 5 DPF מינימום מראה זחלים, כלומר, לסת סגורה (M) ומקסימום, כלומר, לסת פתוחה לגמרי (N) עם שני גבים (O) - קו לבן על O מייצגת את העקירה (43 מיקרומטר). יחסית במקרה זה תכונות סחוס של 1.1 עם interzone של 0.25 (א) ההתאמה הטובה ביותר התקות לראות דגים חיים (O). לוחות AL של נתון זה פורסמו בעבר בנטל et al. 15. אנא לחץ כאן כדי להציג vers גדוליון של נתון זה.

איור 5
איור 5: נציג נתונים מהמודלים FE סימולציה FE-מודל של כל השרירים מיושם 5 DPF הזחל (A - C).. (א) פון מיזס (EMaxmin) (B) זן עיקרי מינימום (E Min. P, μɛ) (ג) זן העיקרי מקסימלי (E מקס. פ, μɛ). FE-מודל סימולציה של זנים עיקריים מינימום ומקסימום במהלך פתיחת הלסת. (D - K): זן עיקרי מקסימאלי (. E מקס פ, μɛ) (ד) צפה לסת גחון (E) נוף משותף גחון (E) מציג את המיקום של חלקים הפרוקסימלי-דיסטלי דרך הסחוס של המקל משותף ואת interzone ב (E ') ו- (ה' '), בהתאמה. (F): לרוחבלסת בעלת נוף. (G): נוף משותף לרוחב. (H - K): זן עיקרי מינימום (. E Min P, μɛ) ב (H) גחון לסת הצגה (I) נוף משותף גחון. (אני) מציג את המיקום של חלקים הפרוקסימלי-דיסטלי דרך משותפת הסחוס של מקל ו interzone ב (אני) ו (אני '') בהתאמה (J): נוף הלסת לרוחב. (K): נוף משותף לרוחב. נתון זה כבר פורסם בעבר בנטל et al. 15. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

מספר סיבי שריר שריר סיבים באזור (מיקרומטר 2) שרירים באזור הקבוצה (מיקרומטר2) חיל (N)
5 DPF intermandibularis קדמי 5 23.8 119 4.76e-6
5 DPF מד hyoideus 6 23.8 142.8 5.71e-6
5 DPF adductor mandibulae 9 23.8 214.2 8.57e-6

שולחן 1: כימות שרירים. לפי חישוב כוחות שריר הממוצע עבור Anterior Intermandibularis, adductor Mandibulae ואת זוית Hyoideus ב 5 DPF באמצעות 40 ננ / מיקרומטר 2 (ערך ליחידת שטח שנלקח התייחסות 17). (Lorga et al., 2011) (n = 3).

Discussion

מודלים אלמנטים סופיים שימשו להתייחס בתחומי אלמנטים השלד כי הם תחת לחץ עם אלה היווצרות העצם והתנסות 10, כמו גם למפות את האזורים תחת לחץ במהלך התאבנות endochondral ומורפוגנזה משותף 8,12,21. מחקרים אחרים גם הצליחו ליישם מודלי צמיחה תיאורטי לשכפל שינויים במהלך פיתוח משותף 11,12. כאן אנו מציגים את הפרוטוקול לבניית מודלי FE עבור מערכת פשוטה יחסית, לסת דג הזברה 20. בניגוד לשיטות חלופיות איסוף תמונות גולמיות עבור דגמי FE, כגון CT סריקה 22, הדמית confocal של קווים מהונדסים או דג זברת immunostained מאפשר רקמות מרובות כדי להיחקר. זה יכול, אם כן, לספק מידע ישיר על נקודות מצורפות שריר ביחס סחוס. בין דגמי חוליות דג הזברה ניתנת במיוחד מניפולציה גנטית תרופתית. הדור של דגמי FE עבור דג הזברהסחוס craniofacial עכשיו פותח את האפשרות של מחקר נוסף של יחסי הגומלין בין ביומכניקה וגנטיקה morphogenesis משותף.

ישנם מספר שלבים קריטיים לתהליך של יצירת מודל FE; הראשון הוא יצירת ייצוג תלת ממדי מדויק של המערכת. זה דורש הדמיה ברזולוציה גבוהה מספיק כדי להגדיר גבולות ברורים. שימו לב כי גם עם הדמיה ברזולוציה גבוהה לבצע משטח טוב אחד יכול להיות להחליק כמה אזורים. שלב קריטי נוסף הוא הגדרת המיקום הנכון של העומס ואילוצים נכונים. מודל מוגבל מספיק ייכשל לפתור והשמה שגוי של העומסים יגרום תנועה חריגה.

חלק מהעיבוד של הנתונים הגולמיים (איור 2) יש צורך כמשטח המופק מהנתונים הגולמיים יהיה קשה רשת (תרשים 2B). אנחנו מסוננים הנתונים באמצעות מסנן גאוס (איור 2 ג

חשוב לזכור כי תמיד יש מגבלות מודל היפותטי ssumptions הריץ מודלי FE. כאשר רק דוגמנות אחד או מספר קטן של דוגמאות הוא קריטי כדי להבטיח מדגם מייצג נבחר שם צפוי להיות שינויים קלים בין אנשים. כפי רק כמה מן האלמנטים הלסת והשרירים נכללו, המודל הוא גרסה פשוטה יותר של מערכת השלד והשרירים craniofacial דג הזברה. לכן, אילוצים חייבים להיות ממוקמים לתת דין וחשבון על שלושת יסודות לסת הדגם שיחברו עם שאר הגולגולת ואת המודל היה מוגבל באופן מלאכותי במרכז לתקן את זה ב 'מרחב'. אילוץ מלאכותי זה לא השפיע על פרשנות שאובי המודלים כמו ceratohyal עצמו לא נותח. ההכללה יותר של מבנה craniofacial, במיוחד אחרים שרירי פתיחת לסת כגון sternohyals והסחוס המצורף שלה 23, יכל להוסיף למודל, אבל מגבלות כוללות את היכולת של דגמים גדולים יותר לרוץ בתוכנת האלמנטים הסופיים.

s = "jove_content"> מגבלה נוספת היא שלא אנו דגם כניסת רצועה, אם כי זו יכולה להיות מושגת על ידי ההחדרה של מעיינות 8. הנחה נוספת אחת עשתה במקרה זה הייתה שהמודל יתנהג באופן ליניארי. סדרי הגודל של זנים על המודלים היו דומים לאלו במודלים שפורסמו וכן להחיל תאים במבחנת 10,24, עם זנים להיות מתחת 3500 ומעלה -5000 μɛ מלבד נקודות מצורפות אילוץ ושרירים. לכן, הזנים על האזורים הרלוונטיים של המודל נחשבו בתוך טווח מקובל עבור מודל ליניארי. סחוס אינו מתנהג לגמרי כחומר לינארית כבר דגם בעבר כחומר poroelastic, שאפשר ניתוח של ההתנהגות הנוזלת במודל 25. הפצת נקודות המצורפת שריר בקרב צרור של בלוטות מקומיות תחלק כוחות השיא ועוד לייצג במדויק את כניסת השריר עבור שרירים מסוימים.

אף אוזן גרון "> שימוש FE מאפשר הערכה של הזנים המדגישים מתנהגים על מבנה. כטכניקה הוא משמש לעתים קרובות בתחומי מדעי חיים רבים כולל אורתופדיה, פליאונטולוגיה וביולוגיה התפתחותית ולאחרונה. כאן אנו מתארים כיצד לבנות פס עבור דג הזברה לסת תחתונה. בעתיד המודלים האלה ניתן יהיה להרחיב להסתכל הלסת כולה, כולל את החיך. בטכניקות דומות יכולות לשמש מודל ביומכניקה שדרה בדגים, אשר עד כה בעיקר נחקרו באמצעות קינמטיקה.

Disclosures

החוקרים אין לי מה לחשוף.

חלק מנתוני תאני 3-5 כבר נדפסו מן J.Biomech, 48 (12), בניטל et al., דוגמנות אלמנט סופית צופה שינויים בצורה משותפת ותא התנהגות כתוצאה מאובדן מתיחת שריר בפיתוח לסת, 3112-22. 2015, באישור Elsevier 15.

Acknowledgments

LHB מומן על ידי תכנית PhD Cell Wellcome Trust הדינמית; קאר מומנה על ידי מענק פרויקט MRC MR / L002566 / 1 (הוענק Ejr ו CLH) ו CLH מומנה על ידי מענק ערוק 19479. כמו כן, אנו רוצים להודות מתקן bioimaging וולפסון ייעוץ הדמיה.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Coll2 Abcam ab34712 Type II collagen antibody - stains all cartilage
A4.1025 / MF20 Developmental studies hybridoma bank A4.1025 Skeletal mysoin antibody - marks all skeletal muscle 
Low melt agarose Sigma  A9414-5G For mounting zebrafish
MS222 (Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate ) Sigma E10521-10G To make anesthetic
Trypsin Fisher T/3760/48 sample permeablilisation
Dylight 488 Mouse IgG Thermofisher 35502 Secondary antibody
Dylight 550 Rabbit IgG Thermofisher  84541 Secondary antibody
SP8/SP5 or SPE confocal Leica  For imaging 
LAS Leica capture software Leica Imaging software
Aviso (version 7.0.0) FEI Visualization Science Group 3D image analysis software (Section 2)
Hypermesh part of the Hyperworks package (version 10) Altair Engineering FE model generating software (Section 4-5)
Abaqus (version 6.14) SIMULIA FE analysis software (Section 5.7-5.8)

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Rayfield, E. J. Finite Element Analysis and Understanding the Biomechanics and Evolution of Living and Fossil Organisms. Annu. Rev. Earth Planet. Sci. 35, 541-576 (2007).
  2. Rao, S. S. The Finite Element Method in Engineering: Fifth Edition. , (2010).
  3. Taylor, M., Prendergast, P. J. Four decades of finite element analysis of orthopaedic devices: Where are we now and what are the opportunities. J Biomech. 48, 767-778 (2015).
  4. Button, D. J., Rayfield, E. J., Barrett, P. M. Cranial biomechanics underpins high sauropod diversity in resource-poor environments. Proc Royal Soc London B: Biol Sci. 281. 281, (2014).
  5. Mammoto, T., Mammoto, A., Ingber, D. E. Mechanobiology and developmental control. Annu Rev Cell Dev Biol. 29, 27-61 (2013).
  6. Shwartz, Y., Farkas, Z., Stern, T., Aszodi, A., Zelzer, E. Muscle contraction controls skeletal morphogenesis through regulation of chondrocyte convergent extension. Dev biol. 370, 154-163 (2012).
  7. Rolfe, R. A., et al. Identification of mechanosensitive genes during skeletal development: alteration of genes associated with cytoskeletal rearrangement and cell signalling pathways. BMC genomics. 15, 48 (2014).
  8. Roddy, K. A., Kelly, G. M., van Es, M. H., Murphy, P., Prendergast, P. J. Dynamic patterns of mechanical stimulation co-localise with growth and cell proliferation during morphogenesis in the avian embryonic knee joint. J Biomech. 44, 143-149 (2011).
  9. Haudenschild, D. R., Chen, J., Steklov, N., Lotz, M. K., D'Lima, D. D. Characterization of the chondrocyte actin cytoskeleton in living three-dimensional culture: response to anabolic and catabolic stimuli. Mol cell biomech. 6, 135-144 (2009).
  10. Nowlan, N. C., Murphy, P., Prendergast, P. J. A dynamic pattern of mechanical stimulation promotes ossification in avian embryonic long bones. J Biomech. 41, 249-258 (2008).
  11. Giorgi, M., Carriero, A., Shefelbine, S. J., Nowlan, N. C. Mechanobiological simulations of prenatal joint morphogenesis. J Biomech. 47, 989-995 (2014).
  12. Heegaard, J. H., Beaupre, G. S., Carter, D. R. Mechanically modulated cartilage growth may regulate joint surface morphogenesis. J Ortho Res. 17, 509-517 (1999).
  13. Hammond, C. L., Schulte-Merker, S. Two populations of endochondral osteoblasts with differential sensitivity to Hedgehog signalling. Development. 136, 3991-4000 (2009).
  14. Mitchell, R. E., et al. New tools for studying osteoarthritis genetics in zebrafish. Osteoarthritis and cartilage / OARS, Osteoarth Res Soc. 21, 269-278 (2013).
  15. Elworthy, S., Hargrave, M., Knight, R., Mebus, K., Ingham, P. W. Expression of multiple slow myosin heavy chain genes reveals a diversity of zebrafish slow twitch muscle fibres with differing requirements for Hedgehog and Prdm1 activity. Development. 135, 2115-2126 (2008).
  16. Danieau's solution (30×). Cold Spring Harb Prot. , pdb.rec12467 (2011).
  17. Iorga, B., et al. Micromechanical function of myofibrils isolated from skeletal and cardiac muscles of the zebrafish. J Gen physiol. 137, 255-270 (2011).
  18. Tanck, E., Blankevoort, L., Haaijman, A., Burger, E. H., Huiskes, R. Influence of muscular activity on local mineralization patterns in metatarsals of the embryonic mouse. J Ortho Res. 18, 613-619 (2000).
  19. Tanck, E., et al. The mechanical consequences of mineralization in embryonic bone. Bone. 35, 186-190 (2004).
  20. Brunt, L. H., Norton, J. L., Bright, J. A., Rayfield, E. J., Hammond, C. L. Finite element modelling predicts changes in joint shape and cell behaviour due to loss of muscle strain in jaw development. J Biomech. 48, 3112-3122 (2015).
  21. Roddy, K. A., Prendergast, P. J., Murphy, P. Mechanical influences on morphogenesis of the knee joint revealed through morphological, molecular and computational analysis of immobilised embryos. PloS one. 6, e17526 (2011).
  22. Cuff, A. R., Bright, J. A., Rayfield, E. J. Validation experiments on finite element models of an ostrich (Struthio camelus) cranium. Peer J. 3, 1294 (2015).
  23. Schilling, T. F., Kimmel, C. B. Musculoskeletal patterning in the pharyngeal segments of the zebrafish embryo. Development. 124, 2945-2960 (1997).
  24. Dowthwaite, G. P., et al. A mechanism underlying the movement requirement for synovial joint cavitation. Matrix biol. 22, 311-322 (2003).
  25. Nia, H. T., Han, L., Li, Y., Ortiz, C., Grodzinsky, A. Poroelasticity of cartilage at the nanoscale. Biophys J. 101, 2304-2313 (2011).

Tags

ביולוגיה התפתחותית גיליון 118 דג הזברה ביומכניקה זנים שלד ושרירים אלמנטים סופיים Confocal מורפולוגיה morphogenesis המשותף
בניית מודלים אלמנטים סופיים לחקור ביומכניקה לסת דג הזברה
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Brunt, L. H., Roddy, K. A.,… More

Brunt, L. H., Roddy, K. A., Rayfield, E. J., Hammond, C. L. Building Finite Element Models to Investigate Zebrafish Jaw Biomechanics. J. Vis. Exp. (118), e54811, doi:10.3791/54811 (2016).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter