Summary
Этот протокол описывает модель мыши цефоперазона из Clostridium несговорчивый инфекции (CDI) с использованием клинически релевантных и генетически-послушное штамм, R20291. Акцент на клиническом мониторинге заболеваний, C. несговорчивый бактериального токсина, перечисление цитотоксичности и гистологических изменений по всему КДИ в мышиной модели подробно описаны в протоколе.
Introduction
Clostridium несговорчивый является анаэробная, грамположительных, спорообразующие бациллы , которая вызывает опасные для жизни понос 1. C. несговорчивый инфекция (КДИ) связано с повышением заболеваемости и смертности людей и результаты в более чем $ 4,8 млрд в расходы на здравоохранение в 1-4 года. В 2013 году Центры по контролю и профилактике заболеваний к категории C. несговорчивый как неотложное антибактериальной риска возникновения резистентности, что свидетельствует о том , что она представляет собой насущную угрозу для здоровья населения 1. В настоящее время лечение антибиотиками с ванкомицин и метронидазол считаются стандартом лечения КДИ 5. К сожалению, рецидив КДИ после успешного лечения антибиотиками высока, происходит в 20 - 30% больных 2,5-7. Таким образом, открытие новых терапевтических средств против этого возбудителя кишечно необходимо. Для оценки терапевтических средств против C. несговорчивый, животной модели , приближенной к болезни человека в переменномlinically релевантных штамм необходим.
Первоначально постулаты Коха были созданы для C. несговорчивый в 1977 году с использованием клиндамицина обработанной модели сирийский хомяк 8. Эта модель до сих пор используется сегодня , чтобы исследовать влияние C. несговорчивый токсинов на патогенез 9,10. Тем не менее, CDI в модели хомяка приводит к высокому уровню смертности и не приближают хронические коварные проявления болезни , которые можно увидеть у людей с КДИ 10,11. На основе доступности и наличия реагента мышиных платформ в области исследований, модель мыши CDI актуальна.
В 2008 году , надежная мышиную модель КДИ была создана путем обработки мышей с коктейлем антибиотика в питьевой воде (канамицин, гентамицин, колистину, метронидазол и ванкомицин) в течение 3 дней с последующим внутрибрюшинного введения клиндамицина 12. Это сделало мышей восприимчивы к КДИ и тяжелым колитом. зависетьмости от дозы вводимого посевного материала, ряд клинических признаков и летальности можно наблюдать с помощью этой модели. Начиная с этого времени, различные схемы лечения антибиотиками были исследованы , что изменяют мышиный кишечную флору, снижение колонизационной резистентности к точке , где C. несговорчивый могут колонизировать желудочно - кишечного тракта (обзор в Best и др. И Лоли & Young) 13,14.
Совсем недавно, широкий спектр цефалоспоринов, цефоперазон, приведены в питьевой воде в течение 5 дней или 10 дней воспроизводимо делает мышей , восприимчивых к КДИ 15. Поскольку введение цефалоспоринов третьего поколения ассоциируются с повышенным риском КДИ в организме человека, использование модели цефоперазон более точно отражает природные заболевания 16. Цефоперазон мышей , обработанных восприимчивого к C.difficile , были поставлены под сомнение с обоими C.difficile , спор и вегетативных клеток из множества штаммов в пределах клиническойАктуальность и вирулентности 17. Несмотря на некоторые из оригинальных исследований с использованием C. несговорчивый вегетативные клетки в качестве инфекционной формы, C. несговорчивый споры считаются основным способом передачи 18.
В последнее десятилетие, C. несговорчивый R20291, A NAP1 / BI / 027 штамм, возник, вызывая эпидемии КДИ 19,20. Мы попытались определить клиническое течение заболевания , когда цефоперазон обработанных мышей заражали с клинически значимой и генетически послушный C. несговорчивый штамма, R20291. Этот протокол детали клинического течения, в том числе потеря веса, бактериальной колонизации, токсин цитотоксичности и гистологических изменений в желудочно - кишечном тракте мышей , зараженных спорами С. несговорчивый R20291. В целом, эта модель мыши оказывается ценным экспериментальной площадкой для КДИ аппроксимирующих болезни человека. Эта модель мыши отличающаяся таким образом, может быть использована для оценки последствийиз новых терапевтических средств на улучшение клинического заболевания и по восстановлению колонизационной резистентности против C. несговорчивый.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
Этическое заявление:
По уходу и использованию животных комитет Институциональный (IACUC) в Государственном Университете Северной Каролины колледжа ветеринарной медицины (NCSU) одобрил данное исследование. NCSU Уход за животными и использование политики применяет стандарты и руководящие принципы , изложенные в Законе об охране животных и Закон расширение исследований здоровья 1985. объектов животного лаборатории в NCSU придерживаться руководящих принципов , изложенных в Руководстве по уходу и использованию лабораторных животных. Статусы здоровья животных оценивали ежедневно, а умирающие животные были гуманно эвтаназии СО 2 удушья с последующим вторичных мер. Квалифицированные техников животных или ветеринаром проводили животноводство в AAALAC аккредитованного объекта в ходе этого исследования.
1. Введение антибиотика цефоперазона в питьевой воде для достижения Восприимчивость к C. несговорчивый инфицированию и развитию заболевания
ПРИМЕЧАНИЯ: 5- 8-недельных мышей C57BL / 6 WT (самки и самцы)были закуплены и помещены в карантин за 1 неделю до начала применения антибиотиков воды. После карантина мышей были помещены с автоклавного пищи, постельное белье и воды. Изменения Кейдж проводились еженедельно сотрудниками лаборатории в ламинарный.
- Приготовьте цефоперазон (0,5 мг / мл) в стерильной дистиллированной воде за 7 дней до целевой день вызова (рисунок 1).
- Заполните автоклавного воды бутылки с водой цефоперазона (0,5 мг / мл) и поместить их в каждой клетке мыши.
Примечание: свежеприготовленные цефоперазон вода должна быть сделана и менять каждые 2 дня в течение периода 5 дней, как обозначено в шагах 1.1 и 1.2. Правильная утилизация цефоперазона воды ниже институциональные рекомендации по гигиене окружающей среды и безопасности рекомендуется. - Через 5 дней на цефоперазон воду, заменить бутылки с водой автоклавированы бутылками стерильной дистиллированной водой. Дайте мышам эту питьевую воду в течение всего срока эксперимента.
2. Приготовление C.difficile , Spore инокулята и желудочный зонд из мышей
Примечание: Перед началом работы убедитесь, что следующие элементы помещаются в анаэробной камере в течение по крайней мере 24 часа: 1x фосфатно-солевой буфер (PBS, см Материалы), таурохолат циклосерин цефокситин фруктозы агар (TCCFA) пластины (см Материалы и дополнительный файл ), а также стерильный L-образный расширитель.
ПРИМЕЧАНИЕ: Мыши , стимулированными C. спор несговорчивый должны быть размещены в виварии уровень биологической безопасности 2.
- Получают C.difficile , спорами запас желательного штамма (в данном случае, R20291) , который был подготовлен ранее и хранили при 4 ° С в стерильной воде 21,22. Определить перечень этого споровой запаса перед использованием.
- На основе известной концентрации (спор / мл) споровой запаса, рассчитать желаемое разбавление , чтобы получить 10 5 спор на 25 мкл. Убедитесь, что объем инокулята достаточен для инокуляции всемышей в эксперименте (25 мкл на мышь), чтобы выполнить перечисление посевного материала (примерно 30 мкл), а также учитывать ошибки пипетирования.
- Vortex оригинал C. несговорчивый Спора запас. Затем ресуспендируют расчетный объем (со стадии 2.2) исходной C. несговорчивый споровой запаса в стерильной воде в завинчивающейся крышкой трубки микроцентрифужных. Выполните это аэробно в ламинарном потоке. Определить эту смесь разбавленного как "споровой посевного материала."
- Поместите Спора прививочный материал в водяной бане при 65 ° C и нагревают ее в течение 20 мин.
Примечание: Этот шаг гарантирует , что только активные C.difficile , споры остаются после термообработки. - В капюшоне ламинарного потока, возьмите 50 мкл нагретой споровой посевного материала , поместите его в стерильную пробирку микроцентрифужных, и передать его в анаэробной камере 23. Используйте этот образец для перечисления спорами.
- В ламинарном потоке, загрузите оставшуюся подогреваемый спорами инокулята Intгабаритная 1-мл шприц прилагается к стерильной термометру наконечником иглы в желудок через зонд. Использование ручного шприца степпер, чтобы обеспечить точное и быстрое повторение дозирования между мышами. Убедитесь, что игла с принудительным кормлением заполнена споровой посевного материала нагретым до использования.
Примечание: новая стерильная игла для принудительного кормления с каждой мыши не требуется. Тем не менее, если различные дозы C. спор несговорчивый вводят, новая игла с принудительным кормлением рекомендуется для каждой дозы.
Примечание: C. несговорчивый споры обладают высокой устойчивостью к традиционным дезинфицирующим средствам. Таким образом, использование спороцидного дезинфицирующего средства, такие как # 62 Perisept спороцидного дезинфицирующие, необходимо. Производитель рекомендует время контакта 2- х мин , чтобы уничтожить C. спор несговорчивый. - С принудительным кормлением каждую мышь с 25 мкл споровой посевного материала. Сдерживать каждую мышь мягко схватив животное рыхлой кожей шеи и спины, чтобы иммобилизации голову. Используя указательный палец дополнительно обездвижить голову животного и кудлинить пищевод. Убедитесь в том, что животное не напевать или показать другие признаки бедствия во время сдержанности.
Примечание: Общий объем дано мышам с помощью желудочного зонда не должна превышать 10 мл / кг веса тела (0,1 мл / 10 г). - Поддерживать мышь в вертикальном, вертикальном положении и аккуратно пройти через зонд иглу в сторону рта. Направьте иглу через зонд вдоль крыши рта и медленно продвигать иглу через зонд в пищевод.
Примечание: Если какое-либо сопротивление встречается, то через желудочный зонд игла может входить в трахею и, следовательно, не должны быть выдвинуты, а удалены и переставлять сразу. - После того, как через желудочный зонд игла находится примерно на полпути в пищевод, вводят 25 мкл споровой инокулята нагретого и осторожно снять через зонд иглу из пищевода.
Примечание: Силовое продвижение зондового иглы может привести к разрыву пищевода или желудка. Поэтому, если сопротивление при продвижении иглы через зонд, То лучше сразу удалить и переместить иглу через зонд. - Вернуть животное в клетку и наблюдать его для любого кашля или признаков дыхательной недостаточности, так как это может свидетельствовать о непреднамеренное введение трахеи или аспирации споровой посевного материала с подогревом.
ПРИМЕЧАНИЕ: Мыши очень восприимчивы к C. несговорчивый после лечения антибиотиками; Поэтому меры предосторожности для предотвращения перекрестного загрязнения между клетками имеет важное значение. Это особенно важно при управлении антибиотические обработке, но и неоспоримые мышей в качестве контрольной группы. - После засева всех мышей, поместите оставшиеся подогреваемый спор прививочный материал в стерильную пробирку микроцентрифужных и передать его в анаэробной камере для перечисления спорами.
- Для перечисления споровой посевного материала нагретым (с шага 2.4), а остальные через желудочный зонд, нагретую споровой посевного материала, делают 1:10 серийные разведения каждого посевного материала в 1X PBS. Рекомендуется сделать и пластина 4 - 5 разбавление (т.е. 10 -1 через10 -5).
- С помощью асептической техники, передача 100 мкл каждого последовательного разбавления на отдельной пластине TCCFA.
- С помощью стерильной L-образный шпатель, равномерно разбавление, примененную к носителю в лунки планшета. Даже распространение разведенного инокулята имеет важное значение для точного подсчета спор.
- Инкубируйте пластин анаэробно в течение 24 ч при 37 ° С. Через 24 часа C. несговорчивый колониеобразующих единиц (КОЕ) можно перечислить , чтобы получить инфекционный дозу вводили мышам в 25 мкл (0,025 мл) объем (см дополнительный файл "Пример вычислений"). C. несговорчивый колонии плоские и бледно - желтого цвета и имеют неровные края и притертой внешний вид 24.
Примечание: Предел обнаружения бактериального подсчета 10 2 КОЕ.
3. Контроль потери веса мыши и клинические признаки болезни в течение инфекции C. несговорчивый
- взвешиватьnimals до и после лечения антибиотиком 5-дневный цефоперазона, после восстановления 2-дневного отключения антибиотиков (день 0), а затем в течение всего срока эксперимента.
Примечание: Получение весов на последовательное время каждый день. Веса получен день вызова (день 0) следует использовать в качестве начальной исходной массы для сравнения на протяжении C.difficile , инфекции. - Поместите цифровые весы в шкаф биологической безопасности. Поместите стерильную пластиковую мензурку на весы и тарные вес пластикового стакана. Затем, осторожно поднимите мышь на основании хвоста и поместите его в пластиковый стакан.
- Поместите стакан обратно на весы. Hover рукой по верхней части стакана, чтобы гарантировать, что мышь не избежать. Это может занять 2 - 3 сек, чтобы получить стабильный вес. Затем, аккуратно поместите мышь обратно в клетку. Запишите этот вес и повторить процесс для каждой мыши в этой клетке.
Примечание: Крайне важно, чтобы меры предосторожности для предотвращения перекрестного Загрязнителиние между клетками при получении веса. Каждая клетка мышей должна иметь свою собственную пластиковую мензурку для взвешивания. Пластиковые стаканчики должны быть продезинфицированы с спороцидного агентом между каждым использованием и покрывается стерильной алюминиевой фольгой.
- Поместите стакан обратно на весы. Hover рукой по верхней части стакана, чтобы гарантировать, что мышь не избежать. Это может занять 2 - 3 сек, чтобы получить стабильный вес. Затем, аккуратно поместите мышь обратно в клетку. Запишите этот вес и повторить процесс для каждой мыши в этой клетке.
- Монитор оспариваемые животных два раза в день (как минимум) на наличие признаков клинически тяжелой инфекции C. несговорчивый, в том числе вялость, потеря аппетита, диарея и сгорбленной позе.
- Гуманно эвтаназии животных , которые теряют 20% своего первоначального базового веса тела и / или развиваются тяжелые клинические признаки инфекции C. несговорчивый (перечисленных в пункте 3.3).
ПРИМЕЧАНИЕ: Мыши , которые показывают клинические признаки инфекции C. несговорчивый должны быть взвешены по мере необходимости в ходе эксперимента , чтобы гарантировать , что они не потеряли 20% своего первоначального веса тела базовой линии. В течение ранних моментов времени в эксперименте, это может означать, два раза в день измерения.
4. Бактериальный Перечень C. несговорчивыйот мыши калом и содержимого слепой кишки
Примечание: Перед началом работы убедитесь, что следующие элементы помещаются в анаэробной камере в течение по крайней мере 24 часа: 1x PBS (см Материалы), TCCFA пластины (см Материалы), стерильный L-образный расширитель и стерильные микроцентрифужных трубки и / или ПЦР-планшеты для разведений.
- Получение образцов для C. несговорчивый Перечисления
Примечание: Перед получением фекалии или содержимое слепой кишки, весят стерильные пробирки микроцентрифужных в аналитическом масштабе. Регистрируют вес трубы на стороне трубки, округление до четырех знаков после запятой (например, 0,9864 г). Обозначим этот вес как "вес трубки." Каждый собранный образец должен быть помещен в стерильный, взвешивали центрифужную пробирку.- Стерильный коллекция кала мыши
- Аккуратно сдерживаться каждую мышь, взявшись за животное рыхлой кожей шеи и спины, чтобы иммобилизации голову. Используйте мизинец, чтобы мягко сдерживать хвост животного, тHUS подвергая ануса. Убедитесь в том, что животное не напевать или показать другие признаки бедствия во время сдержанности.
- Держите стерильный, взвесили микроцентрифужных трубки непосредственно под ануса животного. Крайне важно, чтобы труба не вступает в непосредственный контакт с мышью.
- Как животное испражняется, соберите фекальный осадок в трубку. Держите трубку при комнатной температуре, пока все образцы фекалий не собираются. Это может занять несколько минут для мыши к дефекации, что требует повторных попыток сбора фекалий.
- Взвесить пробирки, содержащие фекалии на аналитическом уровне. Запишите вес трубки, округление до четырех знаков после запятой (например, 1,0021 г). Обозначим полученную массу в качестве «конечного веса трубки."
- Проходят фекальных образцов в анаэробной камере для бактериального подсчета непосредственно после сбора кала.
- Стерильный коллекция мыши содержимого слепой кишки во время аутопсии
- После гуманной эвтаназии СО 2 удушья с последующим вторичных мер, выполнить вскрытие , чтобы получить слепая кишка 25. Слепая кишка является большим, форме запятой часть желудочно-кишечного тракта.
- Поместите слепую кишку на стерильной пластиковой чашке Петри. Используйте одноразовые, стерильные NO. 10 Скальпель лезвие, чтобы отрезать слепая кишка открыт с глухом конце пакета, чтобы выставить содержимого слепой кишки.
- Осторожно извлечь содержимое слепой кишки с применением светового давления с скальпелем и подметание содержимое по направлению к вырезанной части слепой кишки.
Примечание: Следует соблюдать осторожность, чтобы не нарушить слепой кишки ткани, который будет представлен для гистологической экспертизы.
- Осторожно извлечь содержимое слепой кишки с применением светового давления с скальпелем и подметание содержимое по направлению к вырезанной части слепой кишки.
- Поместите содержимое слепой кишки в стерильный, взвешивали микроцентрифужных трубки сразу же после сбора. Только около 10 мг содержимого слепой кишки требуется для бактериального подсчета.
- Взвесить пробирки, содержащие содержимое слепой кишки на аналитической SCALе. Запишите вес трубки, округление до четырех знаков после запятой (например, 1,0021 г). Обозначим полученную массу в качестве «конечного веса трубки."
- Проходят образцы содержимого слепой кишки в анаэробной камере для бактериального подсчета.
- Стерильный коллекция кала мыши
- Бактериальный Перечень C. несговорчивый
- Вычислить конечный вес содержимого (фекалии или слепой кишки) , которые будут перечислены для C. несговорчивый. Выполняется это путем вычитания "конечного веса трубки" от "веса трубы."
- Вычислить 1:10 разбавление содержимого в 1X PBS и ресуспендируют соответственно. Для фекальных шариков, используйте кончик пипетки, чтобы аккуратно разрушить осадок в растворе (см дополнительный файл "Пример вычислений").
- Анаэробно инкубировать эти образцы ресуспендировали при комнатной температуре в течение 30 мин, что позволяет содержимое осесть.
- Сделать серийные разведения для каждого образца в 1X PBS для перечислениярение КОЕ на грамм содержимого (кала или слепой кишки). Выполните это анаэробно.
- С помощью асептической техники, передача 100 мкл каждого последовательного разбавления до TCCFA пластин. Используя стерильный L-образный расширитель, распространение разбавления применяется в средствах массовой информации, чтобы равномерно распределить его по всей пластине. Даже распространение разбавления имеет важное значение для точного подсчета колоний.
- Инкубируйте пластин анаэробно в течение 24 ч при 37 ° С. В это время, перечислить C.difficile , колонии для получения КОЕ на грамм содержимого (кала или слепой кишки). C. несговорчивый колонии плоские и бледно - желтого цвета и имеют неровные края и притертой внешний вид 24.
Примечание: Этот протокол может быть использован для перечисления C.difficile , с другой мышиной содержанием GI, включая подвздошной и ободочной содержание. ПЦР-пластины могут быть использованы для изготовления серийных разведений.
5. Vero Cell цитотоксичности на Количественно C. несговорчивый токсинного Cytotoxiгород
Примечание: Рекомендуется, чтобы этот анализ выполняется после завершения модели мыши на образцах, собранных при аутопсии и хранили при -80 ° С. Асептики клеточной культуры имеют важное значение для предотвращения загрязнения клеток Vero в ходе этого анализа. Этот протокол занимает 2 дня для выполнения. Все фекалии и кишечного содержимого, используемым в этом анализе необходимо хранить в взвешивали, стерильной микроцентрифужных трубки (обозначаемой с "массой трубки", смотрите раздел выше). Вес конечная труба (включая содержимое) измеряется с помощью аналитической шкалы до ближайших четырех знаков после запятой (см раздел выше). Использование многоканальной пипеткой рекомендуется для этого анализа.
Примечание: Перед началом работы убедитесь, что следующие элементы доступны: Vero Клетки, модификации Дульбекко орла средней (DMEM) 1x 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сыворотки (FBS) и 1% пенициллина / стрептомицина СМИ (обозначается как "DMEM 1x СМИ; "см Материалы и дополнительный файл), 0,25%Трипсин-ЭДТА, 1x PBS, 0,4% трипанового синий, 96-луночного культуры клеток с плоским дном пластины, 96-луночного фильтр пластины, Clostridium несговорчивый Токсин А (аликвоты в 3 мкл на 1 мкг / мкл в сверхчистой воды и хранить при температуре -80 ° С), Clostridium несговорчивый Антитоксин, рабочий лист (для расчетов и карт пластины, см дополнительные файлы).
Примечание: Следует соблюдать осторожность во время этого анализа для облучения персонала к C. несговорчивый и его токсина.
- Деление клеток Vero (день 1)
- Предварительно подогревают носитель DMEM, 1x, 0,25% трипсин-ЭДТА и 1X PBS в водяной бане при 37 ° C.
- Получают колбу клеток Vero из клеточной культуры инкубатор (37 ° C и 5% CO 2) и поместите его в стерильной капот культуре клеток ламинарного потока. Используйте 70% этанола, чтобы вытирать капот и оборудование перед использованием. Использование серологические пипетки, аспирация носитель из колбы для культуры ткани, чтобы удалить его из клеток Vero и выбросить его в отходы Container.
- Промыть клетки Vero с 5 мл 1x PBS (предварительно нагретый) в колбе для культивирования тканей. Аспирируйте PBS и выбросить его в контейнер для отходов.
- Добавляют 5 мл 0,25% трипсин-ЭДТА в колбу с тканевой культурой. Дайте время контакта 2 - 3 мин. За это время наблюдать клетки начинают отрываться поверхности колбы. Осторожно покачайте ткани сторону культуры колбы в сторону, чтобы ослабить клетки Vero.
- После того, как время контакта с трипсин-ЭДТА, сразу же добавляют 5 мл DMEM, скорости 1x в колбу с тканевой культурой. Это нейтрализует трипсин-ЭДТА. Используйте этот раствор осторожно смывки неприкрепленные клетки Vero от задней части колбы. Затем, с помощью серологических пипетки перенести эту смесь в 15 мл коническую трубку.
- Центрифуга клетки Vero в конической пробирке в течение 5 мин при 180 х г и 25 ° C. Убедитесь в том, что центрифуга правильно сбалансирован. После того, как центрифугирование, наблюдать видимый осадок клеток Vero в нижней части конической трубки. Будьте осторожны, чтобы не DISRУПТ этот осадок. Аспирируйте от супернатанта из коническую трубку и выбросить его.
- Ресуспендируют клеток Vero в 3 мл DMEM, скорости 1x.
- Подсчет клеток Vero
- Добавьте 100 мкл суспензии клеток Vero (сделанный на стадии 5.1.7) до 100 мкл 0,4% трипановым синим. Аккуратно перемешать с помощью пипетки раствор вверх и вниз.
- Добавляют 10 мкл этой смеси в каждой камере гемоцитометра.
- Подсчет количества жизнеспособных клеток в четырех квадрантах гемоцитометра. Мертвые клетки Vero займет трипанового синего и, таким образом, будет окрашен в голубой цвет (эти клетки не должны учитываться). Запишите эти номера в "Vero клеток рабочего листа" при условии.
- Суммировать общее число жизнеспособных клеток Vero во всех четырех квадрантах и вычислить среднее значение. Умножаем на коэффициент разбавления, который является 2, так как 100 мкл клеток в общей сложности 200 мкл жидкости.
- Умножить на поправочный коэффициент, чтобы дать "; количество клеток / мл "При использовании гемоцитометра, коэффициент коррекции всегда 10 4 Умножение общего объема , чтобы дать." общее количество клеток "..
- Определение количества лунок , необходимое для каждого эксперимента
Примечание: Один образец (либо фекалии или кишечного содержимого) требует 24 отдельных скважин, которые должны выполняться в двух экземплярах. В концентрации 10 5 Vero клеток на лунку (общий объем 90 мкл) требуется.
Примечание: Если желательно , чтобы инкубировать Веро клетки 96-луночные планшеты в течение ночи при 37 ° С, в концентрации 10 3 Vero клеток на лунку рекомендуется для учета расширенного времени инкубации. Расчеты в пределах ячейки рабочего листа Веро должны быть скорректированы с учетом этого изменения.- Определить количество скважин, которые могут быть использованы на основе количества клеток Vero доступных (со стадии 5.2, использование ячеек рабочего листа Веро, в комплект поставки).
- Определить объемСуспензию клеток Веро необходимо для заполнения количество требуемых скважин (на основе количества проб тестируется). Убедитесь в том, что любой дополнительный объем добавляется в учетную запись для пипеткой ошибку (используйте входящий в комплект Vero клеток рабочего листа).
- Развести клеточной суспензии Vero (полученного на стадии 5.1.7) в DMEM, скорости 1x, чтобы получить объем, требуемый для эксперимента.
- Посев Vero клеток в 96-луночный культуральный планшет
- Использование клеток Vero взмучивания с шага 5.3.2, использовать пипетку многоканальный для добавления 90 мкл суспензии клеток Vero в каждую лунку 96-луночный культуральный плоским дном пластины.
- Инкубируйте планшет с клетками Vero в культуре клеток инкубаторе при температуре 37 ° С и 5% CO 2 в течение как минимум 4 часов перед добавлением токсина (образцов) в лунки. Это время инкубации позволит клетки Vero придерживаться нижней части каждой лунки.
- Создание маточных растворов из образцов (Кал илиКишечные содержимое)
Примечание: Все образцы должны иметь "вес трубки" и "конечный вес трубки", измеренный с помощью аналитической шкалы. Используйте Vero Cell Рабочий лист для расчетов.- Рассчитывают вес содержимого. Преобразовать г в мг, затем мг до мкл. Высчитать окончательное общее количество мкл раствора, необходимых, чтобы сделать разведение 1:10 в 1X PBS. Вычислить общую сумму 1x PBS, чтобы добавить к образцу.
- Добавьте общий объем 1x PBS (рассчитанное выше) к образцу. Выполните это аэробно, и с помощью асептической техники. Для фекальных шариков, используйте кончик пипетки, чтобы аккуратно разрушить осадок в раствор.
- Vortex образцы, а затем центрифугировать их в 3522 х г в течение 5 мин при комнатной температуре. Убедитесь в том, что центрифуга правильно сбалансирован. Будьте осторожны, чтобы не нарушать осадок и ресуспендируют образца в раствор.
Примечание: Во время этапа 5.5.3, если только несколько образцов находятся в стадии обработки, содержимое может быть стерилизованпропуская их через один фильтр 0,22 мкм вместо использования фильтрующей пластины 96-луночного. Некоторые образцы могут потребовать несколько фильтров для стерилизации всего содержимого тома с помощью этой техники. - Стерилизацию образец / PBS смесь, взяв 150 мкл надосадочной жидкости и размещение его на отдельные лунки на фильтровальную пластину 96-луночного. Поместите пластину фильтра надежно в верхней части 96-луночный культуральный плоской нижней пластине так, чтобы содержимое будет просачиваться в этой пластине.
- Центрифуга пластина фильтра / ячейки стека культуры пластины на 431 мкг в течение 5 мин при комнатной температуре. Убедитесь в том, что центрифуга правильно сбалансирован и что / ячейку стека культуры пластины фильтра пластины плотно выровнены и не сместится во время центрифугирования.
Примечание: Эти отфильтрованные содержание являются 10 -1 запас , который будет использоваться в смесительный пластин. - Поместите пластину с отфильтрованных образцов на лед.
- Создание Разбавление Plate # 1
Примечание: При разбавлении Плат.е # 1 (DP # 1) потребует 6 скважин на выборку, в том числе положительных (C. несговорчивый токсин типа А) и отрицательные (1x PBS) управления (см DP # 1 макет на ячейке рабочего листа Vero).- Для приготовления положительного контроля ( что C.difficile токсин типа А) для этого анализа, получают 3-мкл аликвоты (1 мкг / мкл) от -80 ° C и добавляют 297 мкл сверхчистой воды, получая конечную концентрацию 0,01 мкг / мкл. Место на льду.
- Этикетка скважин с их разведений (10 -1 до 10 -6) для каждого образца и указать положительный и отрицательный контроль (см DP # 1 макет).
- Добавить соответствующее количество 1х PBS в каждую лунку. В 10 -1 колодцев, не добавляют PBS. За 10 -2 до 10 -6 лунки, добавляют 90 мкл 1x PBS.
- Добавить соответствующее количество образцов в каждую лунку. В 10 -1 лунки, добавляют 100 мкл 10 -1 запаса для каждого образца (см Шаг 5.5.7 из фильтра Platд). За 10 -2 до 10 -6 скважин, делают серийные разведения; начать с принятия 10 мкл из 10 -1 лунку и добавить его к 10 -2 хорошо. Продолжить серийные разведения к 10 -6 разбавления.
- Накройте DP # 1 пластина с прозрачной пластиковой липкой печатью и поместите его на льду.
- Создание Разбавление Plate # 2
Примечание: Разбавление Plate (DP # 2) потребуется 2 полосы движения из 6 лунок для каждого образца, в том числе положительных и отрицательных контролей (см DP # 2 расположение на листе Vero Cell).- Этикетка скважин с их разведений (10 -1 до 10 -6) для каждого образца и указать положительный и отрицательный контроль (см DP # 2 макета). Этикетка скважин с именем образца (обозначается как «образец скважин») или образца имени с антитоксина (обозначается как "антитоксина скважин").
- Рассчитать количество антитоксина, необходимое для этого анализа. Примечание: Антитоксин является 25x запасРешение, которое должно быть разбавлен 1:25 в 1х PBS. Поместите приготовленный раствор Антитоксин 1x на льду.
- Для "пробы скважин," добавить 20 мкл 1x PBS в каждую лунку для всех разведениях (10 -1 до 10 -6) этого образца. Для "антитоксина скважин" добавить 20 мкл 1x антитоксина в каждую лунку для всех разведениях (10 -1 до 10 6) этого образца.
- Передача 20 мкл разведенной пробы в скважинах с DP № 1 в указанных скважинах на ДП № 2 для строк 1 - 6 и 7 рядов - 12 (см DP # 2 расположение на листе Vero Cell). Смешайте раствор осторожно пипеткой вверх и вниз.
- Накройте DP # 2 с прозрачной пластиковой липкой печатью и позволяют 40 мин инкубации при комнатной температуре. Это Инкубационный позволить Антитоксин связывать и , таким образом , инактивировать и нейтрализовать токсин C. несговорчивый.
- После инкубации добавляют 10 мкл смеси из DP # 2 в соответствующие ячейки скважин Vero (см Vero клеточной пластинки расположение на Vэро Cell Рабочий лист). Аккуратно перемешать раствор с помощью пипетки вверх и вниз, следя за тем, чтобы не нарушить клетки Vero, которые прилипают к нижней поверхности лунки.
- Инкубируйте клеточной пластинки Vero в течение ночи в инкубаторе для клеточных культур при температуре 37 ° С и 5% СО 2.
- Оценка Vero клеток для Округление с помощью светового микроскопа (день 2)
Примечание: Напомним , что изменения коэффициента разбавления в 10 раз при добавлении образца смеси к клеточной пластинки Веро (например, 10 -3 теперь 10 -4). Скважины, которые имеют антитоксина настоящий должны иметь практически нет клеток округлением Vero отметил. Клеточная округление Vero (цитотоксичность) будут отмечены в образцах, содержащих токсин C.difficile , . Если цитотоксическую активность нейтрализуется в разведении , содержащей образец и антитоксина, присутствие токсина C.difficile , что приводит к клеточной цитотоксичности Vero подтверждается.- Изучение клеток для закругления Vero с использованием LIGHт микроскопом при увеличении 200X. Для получения образцов скважин ( в том числе положительный контроль), запишите разбавление скважины , которая является последним , чтобы иметь 80% Vero клеток округление отмечено.
- Вычислить титр цитотоксическое, который определяется как величина, обратная максимальному разведению, который произвел 80% Vero округление клеток на грамм образца. Например, если наибольшее разведение составляет 10 -5, то коэффициент разбавления будет 10 -6 для этого образца. Таким образом, журнал [окончательный коэффициент разбавления] / г образца будет войти [10 6], что дает ответную титр 6.
Примечание: Vero клетки должны пройти не менее 3 - 4 переносов и не более 30 -го пассажа перед их использованием в этом анализе 26.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
В ходе репрезентативного исследования, 5-недельных мышей C57BL / 6 мышей WT подвергают предварительной обработке с цефоперазона в питьевой воде (0,5 мг / мл) в течение 5 дней и давали 2-дневный промывать с регулярной питьевой водой. Мышей заражали 10 5 спор C. несговорчивый R20291 через желудочный зонд на день 0 (Рис . 1А) Мыши были проверены для потери веса и клинических признаков (вялость, отсутствие аппетита, диарея и выгибание спины) от КДИ в течение 14 дней. Задача мышей C57BL / 6 WT со спорами C. несговорчивый R20291 приводит к диарее в течение 24 ч и значительной потере веса в течение 48 ч после заражения (Фиг.1В). Хотя это и не наблюдалось в этом эксперименте мышей заражали высокой дозой C.difficile , R20291 может стать тяжело болен или иметь больше , чем 20% снижение веса на 48 - 72 ч после заражения, таким образом , что требует гуманного эвтаназии. Поэтому, мыши требуется как минимум два раза в деньмониторинг после заражения C. несговорчивый спор.
В этом представительном исследовании значительное количество потери веса и клинических признаков болезни у мышей также наблюдались в дни 2 - 7 после заражения (Фигура 1В). Через 7 дней после заражения, мыши начали набирать вес, а также клинические признаки болезни стихли. К последней неделе эксперимента мышам появились клинически нормальный, без признаков клинических признаков КДИ, в том числе диарея.
Фекальные гранулы были собраны до заражения C. спор несговорчивый и каждые 48 ч после заражения (рис 1C). До лечения антибиотиками, у мышей не были колонизирована с C. несговорчивый. В течение 24 ч после заражения C. несговорчивый спор мышей колонизировали с 10 7 КОЕ Ч. несговорчивый на г фекалий (Рисунок 1C </ Сильный>). Мыши оставались постоянно колонизировали с С. несговорчивый в течение всего эксперимента, несмотря на отсутствие доказательств потери веса или клинических признаков КДИ в течение последних 7 дней эксперимента.
Рисунок 1: цефоперазон обработанных мышей заражали C. несговорчивый R20291 Потеря веса Приложение и колонизация C. несговорчивый. А) 5-недельных мышей C57BL / 6 WT JAX (п = 3M / 3F в каждой группе) были предварительно обработаны с цефоперазона в питьевой воде (0,5 мг / мл) в течение 5 дней и позволил 2-дневный промывать с регулярным питьевых воды. Мышей заражали 10 5 спор C. несговорчивый R20291 через желудочный зонд в день 0. Мышей мониторинг для потери веса и клинических признаков (вялость, отсутствие аппетита, диарея и выгибание спины) от КДИ в течение 14 дней. Фекалии собирали и использовали для бактериального подсчета до начала цефоперазон, немедленно AfteR завершает антибиотик, а в дни 0, 1, 2, 3, 4, 5, 7, 9, 11, 13 и 14 по всей инфекции. Вскрытие проводили в дни 0, 2, 4, 7 и 14. В) Мыши потеряли значительное количество своего исходного веса после контрольного заражения C.difficile , R20291. Средняя масса тела мышей измеряли ежедневно с 0 день Значительные потери веса был замечен в дни 2 по 7 по сравнению с 0-й день, базисный вес. C) C. несговорчивый R20291 бактериальной нагрузки в кале после заражения. В течение 24 ч после контрольного заражения C. спор несговорчивый, все мыши были колонизирована с 10 7 КОЕ (колониеобразующих единиц) на грамм фекалий. Никаких существенных различий в этих параметрах не были замечены между женщинами и мужчинами. Значение определяли с помощью непараметрического Крускала-Уоллиса один конец теста ANOVA с последующим посттестовых Данна (*, р ≤ 0,05; **, р ≤ 0,01; *** р ≤ 0,001; ****, р Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Четырех мышей (2 мужчин и 2 женщины) были гуманно умерщвлены и подготовлены к аутопсии в день 0, до инфицирования, чтобы служить в качестве неинфицированных лиц контрольной группы. Кроме того, одна мышь из каждой клетки была гуманно умерщвлены и подготовлены к аутопсии в дни 2, 4, 7 и 14 после заражения (Фигура 1А). Перечень C.difficile , в пределах содержимого слепой кишки проводили при каждом аутопсии. В соответствии с фекально перечислением, не что C.difficile не был обнаружен в содержимого слепой кишки мышей до инфицирование C. несговорчивый. В 48 часов после заражения мышей колонизировали с приблизительно 10 8 КОЕ Ч. несговорчивый на грамм содержимого слепой кишки (рис2А). Все мыши оставались постоянно колонизировали в течение всего эксперимента.
Содержимое слепой кишки также оценивали по всей инфекции на присутствие токсина C.difficile , с использованием клеточной цитотоксичности Vero. Никаких признаков C.difficile , токсин цитотоксичности не был обнаружен в содержимом слепой кишки до начала вызова (Фигура 2В). С. несговорчивый цитотоксичность была обнаружена через 2 дня после заражения C. спор несговорчивый и сохранялись в течение инфекции. Несмотря на довольно равномерной колонизации C. несговорчивый, изменение уровней C. несговорчивый цитотоксическую активность проявляется в отдельных мышей (рис 2В).
Большинство мыши содержимого слепой кишки , нейтрализованной C.difficile , антитоксина в процессе анализа Веро цитотоксичности и не было никаких признаков цитотоксичности (Веро CEбудем округлением) в разведениях исполнении. Тем не менее, несколько отдельных мышей, несмотря на повторное тестирование, имели признаки 50 - 100% цитотоксичности в 10 -1 разведения (разбавления , где образец наиболее концентрированная), без признаков Vero клетки округление в других разведений. Антитоксин используется в данном анализе представляет собой нейтрализующее поликлональных антител C.difficile , токсин, который был подготовлен в козами 27. Таким образом, этот антитоксин не может нейтрализовать C.difficile , бинарный токсин , который продуцируется штаммом R20291. Тем не менее, что C.difficile двоичный токсин не считается цитотоксический 10. Чрезмерное что C.difficile токсин не может быть нейтрализовано с помощью антитоксина или присутствии другого цитотоксического агента, кроме что C.difficile токсин может способствовать к этой находки. Это наблюдение не влияет на определение титра цитотоксичности для этих образцов, так как последнее разведение каждого образца с 80% клеток округлением Vero имелникаких признаков цитотоксичности, когда не в сочетании с антитоксина в указанном разведении.
Рисунок 2: Колонизация слепую кишку и цитотоксичности при инфицировании с C. несговорчивый R20291. А) Мыши придатков оставались постоянно колонизировали с С. несговорчивый в течение всего эксперимента, несмотря на разрешение клинических признаков и наблюдается увеличение веса. Все мыши были колонизированы с более чем 10 8 КОЕ на грамм содержимого слепой кишки при оценке через 2 дня после заражения. В) Веро клеток цитотоксичности от содержимого слепой кишки в течение инфекции C. несговорчивый R20291. После заражения C. спор несговорчивый, мыши имели значительные уровни цитотоксичности, как измерено в log 10 взаимного разведения токсина на г содержимого слепой кишки в дни 2, 4 и 7 после заражения по сравнению с 0 -й день (медианы represented линией). Значение определяли с помощью непараметрического Крускала-Уоллиса один конец теста ANOVA с последующим посттестовых Данна (*, р ≤ 0,05; **, р ≤ 0,01; ***, р ≤ 0,001; ****, р ≤ 0,0001 ). Столбики ошибок обозначают стандартные отклонения от среднего значения. Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Рекомендуется, чтобы гистологические оценка проводится с помощью совета сертифицированных ветеринарной патологоанатом слепым методом. Для озвучивания ткани, 0-4 числовая система подсчета очков должны быть использованы для оценки отдельно отек, инфильтрация воспалительных клеток, а также эпителиальные повреждения клеток в подвздошной, слепой кишки и толстой кишки на основе ранее опубликованной схеме 17 подсчета очков.
При слепом гистологического экзаменминации мышиного подвздошной кишки, слепой кишки и ободочной кишки после заражения с C. несговорчивый R20291, наиболее значительные патологические изменения были отмечены в слепой кишке (рисунок 3). Суммарные ободочнокишечных гистологические показатели были существенно отличались между днем 0 и дни 2 и 4 после заражения. Никаких существенных повреждений не было отмечено в подвздошной кишке в течение инфекции (рисунок 3). Более мягкие поражения были отмечены в толстой кишке. Суммарные ободочной гистологические показатели значительно отличались между днем 0 и дни 2 и 7 после заражения (рисунок 3).
Представитель H & E секции подвздошной кишки, слепой кишки и толстой кишки в течение инфекции доступны на рисунке 4. Каждое изображение имеет соответствующее общее гистологическую оценку и индивидуальные оценки для эпителиального повреждения, воспаления и отека, как определено слепом сертифицированный ветеринарный патологоанатом ( СЭМ).
Рисунок 3: Гистологический Scoring мышиного подвздошной, слепой кишки и толстой кишки во время инфекции с C. несговорчивый R20291. Всего гистологические показатели были рассчитаны путем сложения всех трех баллов из параметров оцениваемых: эпителиальные повреждения, воспаление и отек. Никаких существенных изменений не гистопатологические были отмечены в подвздошной кишке в течение инфекции. Слепой кишки ткани содержали наиболее значимых гистологических изменений во время КДИ. Суммарные ободочнокишечных гистологические показатели были существенно отличается от 0-й день на дни 2 и 4 после заражения. Более мягкие поражения были отмечены в толстой кишке. Суммарные ободочной гистологические показатели значительно отличались от 0-й день на дни 2 и 7 после заражения. Значение определяли с помощью непараметрического Крускала-Уоллиса один конец теста ANOVA с последующим посттестовых Данна (*, р ≤ 0,05; **, р ≤ 0,01; *** р804; 0,001; ****, Р ≤ 0,0001). Столбики ошибок обозначают стандартные отклонения от среднего значения. Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Рисунок 4: гистопатология во время инфекции с C. несговорчивый R20291. Эта панель содержит репрезентативные секции H & Е подвздошной, слепой кишки и толстой кишки по всей инфекции с C. несговорчивый R20291. Суммарные гистологические баллы в скобках () за соответствующий день и ткани перечисленных: для подвздошной день 0 (0), 2-й день (1), 4-й день (0), 7-й день (0), и 14-й день (0) ; для слепой кишки день 0 (0), 2-й день (5), 4-й день (4), 7-й день (3), и 14-й день (3); и для толстой кишки день 0 (0), 2-й день (4), 4-й день (1), 7-й день (4), и 14-й день (2). Микрофотографии получены на светло-микроскопе с цифровой камерой 5 Мп и сопутствующим программным обеспечением (масштаб бар представляет 200 мкм). Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| #62 Perisept Sporidicial Disinfectant Cleaner | SSS Navigator | 48027 | This product will require dilution as recommended by the manufacturer |
| 0.22 μm filter | Fisherbrand | 09-720-3 | Alternative to filter plate for indivdiual samples tested in the Vero Cell Assay |
| 0.25% Trypsin-EDTA | Gibco | 25200-056 | Needs to be heated in water bath at 37 °C prior to use |
| 0.4% Trypan Blue | Gibco | 15250-061 | |
| 1% Peniciilin/Streptomycin | Gibco | 15070-063 | |
| 10% heat inactivated FBS | Gibco | 16140-071 | Needs to be heated in water bath at 37 °C prior to use |
| 1 ml plastic syringe | BD Medical Supplies | 309628 | |
| 1x PBS | Gibco | 10010-023 | |
| 2 ml Micro Centrifuge Screw Cap | Corning | 430917 | |
| 96 well cell culture flat bottom plate | Costar Corning | CL3595 | |
| 96 well filter plate | Millipore | MSGVS2210 | |
| Adhesive Seal | ThermoScientific | AB-0558 | |
| Bacto Agar | Becton Dickinson | 214010 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Bacto Proteose Peptone | Becton Dickinson | 211684 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Cefoperazone | MP Bioworks | 199695 | |
| Cefoxitine | Sigma | C47856 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Clostridium difficile Antitoxin Kit | Tech Labs | T5000 | Used as control for Vero Cell Assay |
| Clostridium difficile Toxin A | List Biological Labs | 152C | Positive control for Vero Cell Assay |
| D-cycloserine | Sigma | C6880 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Distilled Water | Gibco | 15230 | |
| DMEM 1x Media | Gibco | 11965-092 | Needs to be heated in water bath at 37 °C prior to use |
| Fructose | Fisher | L95500 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Hemocytometer | Bright-Line, Sigma | Z359629 | |
| KH2PO4 | Fisher | P285-500 | Part of TCCFA plates (see below) |
| MgSO4 (anhydrous) | Sigma | M2643 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Millex-GS 0.22 μm filter | Millex-GS | SLGS033SS | Filter for TCCFA plates |
| Na2HPO4 | Sigma | S-0876 | Part of TCCFA plates (see below) |
| NaCl | Fisher | S640-3 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Number 10 disposable scalpel blade | Miltex, Inc | 4-410 | |
| PCR Plates | Fisherbrand | 14230244 | |
| Plastic petri dish | Kord-Valmark Brand | 2900 | |
| Sterile plastic L-shaped cell spreader | Fisherbrand | 14-665-230 | |
| Syringe Stepper | Dymax Corporation | T15469 | |
| Taurocholate | Sigma | T4009 | Part of TCCFA plates (see below) |
| Ultrapure distilled water | Invitrogen | 10977-015 | |
| C57BL/6J Mice | The Jackson Laboratory | 664 | Mice should be 5 - 8 weeks of age |
| Olympus BX43F light microscope | Olympus Life Science | ||
| DP27 camera | Olympus Life Science | ||
| cellSens Dimension software | Olympus Life Science |
References
- Antibiotic Resistance Threats in the United States. , U.S.D.o.H.a.H. Services. Available from: http://www.cdc.gov/drugresistance/pdf/ar-threats-2013-508.pdf (2013).
- Lessa, F. C., et al. Burden of Clostridium difficile Infection in the United States. New England Journal of Medicine. 372, 825-834 (2015).
- Gerding, D. N., Lessa, F. C. The epidemiology of Clostridium difficile infection inside and outside health care institutions. Infect Dis Clin North Am. 29, 37-50 (2015).
- Dubberke, E. R., Olsen, M. A. Burden of Clostridium difficile on the healthcare system. Clin Infect Dis. 55, Suppl 2 88-92 (2012).
- Kociolek, L. K., Gerding, D. N. Breakthroughs in the treatment and prevention of Clostridium difficile infection. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. , (2016).
- Kelly, C. P., LaMont, J. T. Clostridium difficile--more difficult than ever. N Engl J Med. 359, 1932-1940 (2008).
- Louie, T. J., et al. Fidaxomicin versus vancomycin for Clostridium difficile infection. N Engl J Med. 364, 422-431 (2011).
- Bartlett, J. G., Onderdonk, A. B., Cisneros, R. L., Kasper, D. L. Clindamycin-associated colitis due to a toxin-producing species of Clostridium in hamsters. The Journal of infectious diseases. 136, 701-705 (1977).
- Kelly, M. L., et al. Improving the reproducibility of the NAP1/B1/027 epidemic strain R20291 in the hamster model of infection. Anaerobe. , (2016).
- Kuehne, S. A., et al. Importance of toxin A, toxin B, and CDT in virulence of an epidemic Clostridium difficile strain. The Journal of infectious diseases. 209, 83-86 (2014).
- Bartlett, J. G., Onderdonk, A. B., Cisneros, R. L. Clindamycin-associated colitis in hamsters: protection with vancomycin. Gastroenterology. 73, 772-776 (1977).
- Chen, X., et al. A mouse model of Clostridium difficile-associated disease. Gastroenterology. 135, 1984-1992 (2008).
- Lawley, T. D., Young, V. B. Murine models to study Clostridium difficile infection and transmission. Anaerobe. 24, 94-97 (2013).
- Best, E. L., Freeman, J., Wilcox, M. H. Models for the study of Clostridium difficile infection. Gut Microbes. 3, 145-167 (2012).
- Reeves, A. E., et al. The interplay between microbiome dynamics and pathogen dynamics in a murine model of Clostridium difficile Infection. Gut Microbes. 2, 145-158 (2014).
- Owens, R. C., Donskey, C. J., Gaynes, R. P., Loo, V. G., Muto, C. A. Antimicrobial-associated risk factors for Clostridium difficile infection. Clin Infect Dis. 46, Suppl 1 19-31 (2008).
- Theriot, C. M., et al. Cefoperazone-treated mice as an experimental platform to assess differential virulence of Clostridium difficile strains. Gut Microbes. 2, 326-334 (2011).
- Martin, J. S., Monaghan, T. M., Wilcox, M. H. Clostridium difficile infection: epidemiology, diagnosis and understanding transmission. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. , (2016).
- Connor, J. R., Johnson, S., Gerding, D. N. Clostridium difficile infection caused by the epidemic BI/NAP1/027 strain. Gastroenterology. 136, 1913-1924 (2009).
- He, M., et al. Emergence and global spread of epidemic healthcare-associated Clostridium difficile. Nat Genet. 45, 109-113 (2013).
- Perez, J., Springthorpe, V. S., Sattar, S. A. Clospore: a liquid medium for producing high titers of semi-purified spores of Clostridium difficile. Journal of AOAC International. 94, 618-626 (2011).
- Sorg, J. A., Dineen, S. S. Laboratory maintenance of Clostridium difficile. Curr Protoc Microbiol. , Chapter 9, Unit9A.1 (2009).
- Edwards, A. N., Suarez, J. M., McBride, S. M. Culturing and maintaining Clostridium difficile in an anaerobic environment. Journal of visualized experiments : JoVE. , e50787 (2013).
- George, W. L., Sutter, V. L., Citron, D., Finegold, S. M. Selective and differential medium for isolation of Clostridium difficile. J Clin Microbiol. 9, 214-219 (1979).
- Knoblaugh, S., Randolph-Habecker, J., Rath, S. Comparative Anatomy and Histology. Dintzis, S. M. , Academic Press. 15-40 (2012).
- Ammerman, N. C., Beier-Sexton, M., Azad, A. F. Growth and maintenance of Vero cell lines. Curr Protoc Microbiol. , Appendix 4, Appendix 4E (2008).
- Clostridium difficile Toxin/Antitoxin Kit Cat No.T5000. , TECHLAB. Available from: http://www.techlab.com/wp-content/uploads/2013/06/t5000isert_rev_0307.pdf (2007).
- Theriot, C. M., et al. Antibiotic-induced shifts in the mouse gut microbiome and metabolome increase susceptibility to Clostridium difficile infection. Nat Commun. 5, 3114 (2014).
- Koenigsknecht, M. J., et al. Dynamics and establishment of Clostridium difficile infection in the murine gastrointestinal tract. Infect Immun. 83, 934-941 (2015).
- Theriot, C., Bowman, A., Young, V. Antibiotic-Induced Alterations of the Gut Microbiota Alter Secondary Bile Acid Production and Allow for Clostridium difficile Spore Germination and Outgrowth in the Large Intestine. mSphere. 1, 00045 (2016).
- Xiao, L., et al. A catalog of the mouse gut metagenome. Nature biotechnology. 33, 1103-1108 (2015).
- Leslie, J. L., et al. Persistence and toxin production by Clostridium difficile within human intestinal organoids result in disruption of epithelial paracellular barrier function. Infect Immun. 83, 138-145 (2015).
- Stabler, R. A., et al. Comparative genome and phenotypic analysis of Clostridium difficile 027 strains provides insight into the evolution of a hypervirulent bacterium. Genome Biol. 10, 102 (2009).
- Valiente, E., Dawson, L. F., Cairns, M. D., Stabler, R. A., Wren, B. W. Emergence of new PCR ribotypes from the hypervirulent Clostridium difficile 027 lineage. J Med Microbiol. 61, 49-56 (2012).
