Abstract
Lymfocyten reageren op verschillende stimuli door het activeren van intracellulaire signaleringsroutes, wat weer leidt tot een snelle cellulaire proliferatie, migratie en differentiatie en cytokineproductie. Al deze gebeurtenissen zijn nauw verbonden met de energiestatus van de cel, en bestudeert daarom de energieproducerende paden kan aanwijzingen over de algemene functionaliteit van deze cellen geven. Het extracellulaire flux analysator is een gebruikelijke inrichting voor het evalueren van de prestaties van glycolyse en mitochondriale respiratie in vele celtypen. Dit systeem is gebruikt om immuuncellen te bestuderen in enkele gepubliceerde rapporten, maar een algemeen protocol bijzonder geoptimaliseerd voor lymfocyten ontbreekt. Lymfocyten fragiele cellen die slecht overleven in ex vivo omstandigheden. Vaak lymfocyt subsets zijn zeldzaam, en het werken met een laag aantal cellen is onvermijdelijk. Aldus wordt een experimentele strategie die deze problemen behandelt vereist. Hier bieden we een protocoldat zorgt voor snelle isolatie van levensvatbare lymfocyten van lymfoïde weefsels en voor de analyse van de metabolische toestanden in de extracellulaire flux analysator. Bovendien geven we de resultaten van experimenten waarin de metabolische activiteiten van verschillende subtypes lymfocyten bij verschillende celdichtheden werden vergeleken. Deze waarnemingen suggereren dat ons protocol kan worden gebruikt om consistente, goed gestandaardiseerde resultaten zelfs bij lage concentraties cel, en dus kan het brede toepassingsmogelijkheden in toekomstig onderzoek gericht op de karakterisering van metabole gebeurtenissen in immune cellen.
Introduction
De immuunrespons tegen antigenen is een strak gereguleerd evenwicht tussen immuunactivatie en immuunonderdrukking. Immuun-activering drijft snelle celproliferatie en migratie, en cytokineproductie, antilichaamuitscheiding en verhoogde fagocytose in reactie op de stimulans, terwijl immuunsuppressie eenvoudig deze gebeurtenissen remt en derhalve is belangrijk bij het voorkomen van onnodige immuunresponsen 1-6. Recente studies hebben aangetoond dat er een rechtstreeks verband bestaat tussen de activeringsstatus van immuuncellen en de activiteit van verschillende metabolische pathways 7. Immuuncellen kan verschuiven tussen rustende en geactiveerde toestanden door over te schakelen energieproducerende paden in en uit. Verder is waargenomen dat verschillende celtypen immune verschillende metabolische strategieën kunnen gebruiken om hun toegenomen energiebehoefte brandstof tijdens de activering. Bijvoorbeeld, terwijl activatie van T lymfocyten leidt cellen in een vrijwel glycolytische state 8 9,10. Deze studies wijzen op het belang van het onderzoek naar de effecten van de immuuncel activering op de celstofwisseling.
Real-time, gelijktijdige metingen van zuurstofverbruik rate (OCR) en extracellulaire verzuring rate (ECAR), als indicatoren van oxidatieve fosforylering en glycolyse, is een gemeenschappelijke strategie om de toestanden van energieproducerende paden 11-13 te pakken. Om dit te bereiken, een extracellulair flux analysator, zoals Seahorse XF 96, wordt routinematig gebruikt. Een dergelijk instrument kan snel veranderingen in OCR en ECAR vergelijken uit verschillende celtypen of op verschillende stimulatie omstandigheden. Tot dusver verschillende celtypen, waaronder immuuncellen, werden onderzocht met behulp van deze apparaten. Echter, een geoptimaliseerd protocol specifiek voor immuuncellen niet beschikbaar.
Immuuncellen bijzonder lymfocyten, verschillen othaar celtypen in een aantal kritische manieren. Lymfocyten fragiele cellen die geen overleven lange duur in ex vivo omstandigheden 14-16. Dit is een nog groter probleem wanneer ze worden gekweekt in suboptimale groei medium zonder essentiële voedingsstoffen, zoals die gebruikt in extracellulaire flux analyse. In tegenstelling tot macrofagen en vele cellijnen, hoeft lymfocyten niet aan kunststof oppervlakken; Daarom is het essentieel om ze te hechten aan de analyse plaat zonder dat dit tot stress. Tenslotte kunnen sommige lymfocyt subpopulaties uiterst zeldzaam en het oogsten op de gewenste, optimale hoeveelheden kunnen uitdagend 17-19 zijn.
Hier geven we een geoptimaliseerd protocol dat specifiek voor lymfocyten ontwikkeld. Gebruik splenocyten, B-lymfocyten en naïeve CD4 + T-lymfocyten geïsoleerd uit muizen milt en lymfeklieren 20 tonen wij de kenmerken van de ruststatus glycolyse en oxidatieve fosforylering in Gesplitstet celdichtheden. Gegevens werden genormaliseerd om rekening te houden met de verschillen in de initiële celaantallen voor elke wel door meting eind assay cellysaat proteïneconcentraties, die recht evenredig met het aantal cellen waren. Ons protocol biedt niet alleen richtlijnen voor de snelle isolatie van levensvatbare lymfocyten voor extracellulaire flux assays, maar het maakt het ook mogelijk voor het werken bij suboptimale cel concentraties, zonder afbreuk te doen aan de kwaliteit van de gegevens.
Protocol
Alle dierlijke experimenten werden uitgevoerd in overeenstemming met de LIG-4 dier protocol, dat door de NIAID Animal Care en gebruik Comite werd goedgekeurd uitgevoerd.
1. Bereiding van reagentia
- Bereid magnetische scheiding (MS) buffer: PBS (pH 7,2) aangevuld met 0,5% BSA en 2 mM EDTA of automatische scheidingsoplossing aangevuld met 0,5% BSA. Steriel filter (0,22 pm) en opslag bij 2-8 ° C.
- Bereid RF10 medium: RPMI 1640 medium aangevuld met 10% door warmte geïnactiveerd foetaal runderserum, 50 U / ml penicilline, 50 uM streptomycine, 1 mM natriumpyruvaat, 2 mM L-glutamine, 0,1 mM niet-essentiële aminozuren, 50 pM 2 mercaptoethanol, 10 mM HEPES. Gebruik steriele reagentia. Steriel filter en bewaar bij 2-8 ° C.
- Bereid mitochondriale stresstest medium: XF basismedium gesupplementeerd met 1 mM natriumpyruvaat, 2 mM L-glutamine en 25 mM glucose.
- Bereid glycolyse stresstest medium: XF basismedium vullendeted met 2 mM L-glutamine.
- De pH van zowel de mitochondriale en glycolyse stresstest media 7,4, steriel filter en bewaar bij 2-8 ° C. Warm media tot 37 ° C en opnieuw op pH vóór gebruik (pH verrichten metingen bij 37 ° C).
OPMERKING: Met XF medium dat bicarbonaat mist, is kritisch. Omdat de atmosfeer in de extracellulaire flux analysator bevat slechts omgeving CO 2, elke bicarbonaat in het medium na binding aan protonen uitgebracht als een bijproduct van glycolyse, dissociëren tot CO2 en water. CO 2 ontgast tijdens het experiment, waardoor afwijkingen in pH dat de glycolytische verzuring signaal zou verduisteren. - Bereid oligomycin: Bereid 10 mM voorraadoplossing in DMSO; bewaren bij -20 ° C.
- Bereid 2,4-DNP: Bereid 1 M voorraadoplossing in DMSO; bewaren bij -20 ° C.
- Bereid antimycin A: Bereid 10 mM voorraadoplossing in DMSO; bewaren bij -20 ° C.
- Bereid rotenon: Bereid 10 mM stock oplossing in DMSO; bewaren bij -20 ° C.
- Bereid glucose: Los glucose in glycolyse stresstest medium om een 250 mM oplossing; vers bereid voor elk experiment en niet invriezen.
- Bereid 2-DG: Los solid 2-DG in glycolyse stresstest medium om een 500 mM oplossing te vormen; vers bereid voor elk experiment en niet invriezen.
2. Oogsten milt en de lymfeklieren van muizen
- Euthanaseren de muis door CO 2 stikken, gevolgd door cervicale dislocatie.
- Spuit de muis met 70% ethanol.
- Voor de volgende T-cel isolatie, de oogst van de milt, oppervlakkige cervicale, oppervlakkige / diepe oksel, onderkaak, lies en mesenteriale lymfeklieren.
- Voor daaropvolgende B celisolatie, oogst alleen de milt.
LET OP: Gebruik een bioveiligheid kast en houden de geoogste organen in PBS of RF10 media op ijs tot verwerking. Gebruik steriel laboratorium en steriele techniek voor alle verwerkingen en isolatie stappen. Houd alle buffers en media op ijs isolatie efficiëntie te verhogen en celdood te verminderen.
3. Weefsel bewerken
- Plaats een 70 um cel zeef in een 50 ml conische buis en de overdracht van de organen op de zeef. Voor T cel isolatie combineren alle organen en B celisolatie overdracht alleen de milt.
- Met de plunjer van een steriele 3 ml spuit, mash het weefsel door de zeef. Tijdens pureren, zorg ervoor dat het filter en de organen zijn vochtig te allen tijde en nat hen, zoals vereist door het toevoegen van MS buffer. Dit zal zowel de levensvatbaarheid van de cellen blijven hoog en verstopping van het filter te voorkomen.
- Na pureren, gelden 5-10 ml MS buffer om het filter naar cel herstel te vergroten. Centrifugeer de suspensie bij 400 xg gedurende 5 minuten bij 4 ° C. (Voer alle verdere centrifugeren onder deze omstandigheden, tenzij anders aangegeven).
- Schenk de vloeistof en resuspendeer de pellet in 5 ml ACK rode bloedcel lysisbuffer. Incuverminder gedurende 5 min op ijs rode bloedcellen lyseren (rode bloedcellen moeten worden verwijderd omdat ze interfereren met de magnetische scheiding). Voeg 10-20 ml MS buffer en centrifuge.
- Plaats een 30 um cel filter over een 15 ml conische buis en vul het met 1 ml MS buffer (dit filtratie zal puin van de erytrocyten lysis te verwijderen). Schenk de vloeistof van de gecentrifugeerde buis, resuspendeer de pellet in 5 ml MS buffer en doorgeven door het filter. Was de eerste buis met 4 ml MS buffer naar cel herstel te verhogen, en dit gebruiken om het filter te spoelen.
- Met behulp van een hemocytometer of geautomatiseerde celgetalmeter Bepaal het totale aantal cellen. Deze cel nummer wordt gebruikt om de hoeveelheid magnetische scheiding benodigde reagentia in punt 4. Indien splenocyten worden gebruikt in de daaropvolgende extracellulaire flux assay te bepalen, vernietiging van het juiste aantal cellen op dit moment.
- Centrifugeer de schorsing en ga verder met magnetische scheiding. Resuspendeer splenocyten niet gebruiktvoor B-cel isolatie in 5 ml RF10 en blijf op ijs tot de extracellulaire flux test.
4. Magnetische scheiding van B-cellen en naïeve CD4 + T-cellen
- Bepaal de benodigde hoeveelheden biotine-antilichaam cocktail, anti-biotine microbolletjes en MS buffer. Gebruik de volgende hoeveelheden van 10 8 cellen als richtlijn en vergroot of verkleind indien nodig.
OPMERKING: Incubeer monsters in de koelkast niet op ijs sinds incuberen op ijs kan antilichaambinding efficiëntie en langere incubatietijden kunnen worden verlangd verminderen.
| Reagentia voor naïeve CD4 + T-celscheiding | Volume 10 8 cellen |
| (schaal adequaat) | |
| Biotine-antilichaam cocktail | 100 gl |
| MS buffer voor de eerste incubatie | 400 gl |
| Anti-biotine microkorrels | 200 gl |
| CD44 microbolletjes | 100 gl |
| MS buffer voor de tweede incubatie | 200 gl |
| Incubeer de biotine-antilichaam cocktail en cellen bij 4 ° C gedurende 5 minuten. Add anti-biotine microbolletjes, CD44 microkralen, MS buffer en incuberen bij 4 ° C gedurende 15 minuten. | |
Tabel 1: T cel isolatie volumes en instructies.
| Reagentia voor B celscheiding | Volume 10 8 cellen |
| (schaal adequaat) | |
| Biotine-antilichaam cocktail 100 gl | |
| MS buffer voor de eerste incubatie | 400 gl |
| Anti-biotine microkorrels | 200 gl |
| MS buffer voor de tweede incubatie | 300 gl |
| Incubeer de biotine-antilichaam cocktail en cellen bij 4 ° C gedurende 15 minuten. Voeg de juiste hoeveelheid biotine-antilichaam cocktail en MS buffer en incuberen van het mengsel bij 4 ° C gedurende 15 minuten. Voeg de juiste hoeveelheid anti-biotine microbolletjes en MS buffer en incuberen van het mengsel bij 4 ° C gedurende 15 minuten. Na de tweede incubatie, vul de buis met MS buffer en centrifuge. | |
Tabel 2: B celisolatie volumes en instructies.
- Resuspendeer de pellet in buffer MS: 500 pl voor handmatige scheiding, 3-4 ml voor automatische scheiding.
- Ga verder met handmatige of automatische scheidingenals volgt:
- Handmatig Scheiding:
- Plaats een LS kolom in de scheiding magneet plaatst onder een steriele 15 ml conische buis om de stroom door en de eerste kolom verzamelen door wassen met 3 ml buffer MS. Gooi de stroom door.
- Breng de celsuspensie aan het gegronde LS kolom en laat het passeren; was het buisje gebruikt tijdens de incubatie met 3 ml MS buffer en geven deze door de kolom ook. Het eluaat wordt de gezuiverde cellen bevatten. Voor de B-cel isolatie, passeren de gezuiverde cellen door de kolom voor de tweede keer in een nieuwe 15 ml buis en herhaal de wasstap. Dit zuiverheid en opbrengst te verhogen.
- Geautomatiseerde Scheiding:
- Schakel de automatische afscheider en controleer de niveaus van loopbuffer, spoeloplossing en 70% ethanol. Zorg ervoor dat het afval leeg is voordat de scheiding.
- Selecteer het juiste gekoeld rek afhankelijk van de buis grootte van tHij ongezuiverde monster (bijvoorbeeld 15 ml). Om de levensvatbare cellen gedurende het scheidingsproces te houden, gebruikt stellingen die eerder bij 2-8 ° C gedurende 3-4 uur gekoeld, of totdat de koelvloeistof vaste stof.
- Monteer de gekoelde rek op het monster etappe van de automatische afscheider.
- Plaats de monsterbuis in slot A1, een buis voor de negatieve fractie slot B1, en een buis voor de positieve fractie C1. Wanneer verzamelen meer dan één monster, plaatst extra buizen in de volgende kolommen (A2, B2, C2, etc.).
- Selecteer het tabblad scheiding op het touchscreen, en geven de plaatsing van buizen op het rek. Vanuit het menu scheiding, selecteer het programma "put" en vul het programma cyclus met het juiste type van wassen (zie opmerking hieronder).
LET OP: Het programma "put" voert uitputting behulp van meest gevoelige modus van de machine, die de zuiverheid prioriteit. Daarnaast zijn er drie verschillende wassen opties: quick spoelen, spoelen, en slapen. Indien de monsters uit dezelfde bron en worden samengevoegd, selecteert snelle spoelen. Als de monsters gescheiden moeten worden gehouden, selecteert spoelen. Selecteer de optie slaapstand als er geen verdere isolaties die dag zal worden uitgevoerd en als de machine zal worden afgesloten na isolatie - Begin de isolatie door te drukken "Run" en bevestig de buffer levels als daarom wordt gevraagd. Nadat het programma is afgelopen, zullen de negatieve fractie gezuiverde cellen bevatten.
- Vul het conische buis tot 15 ml met MS buffer en centrifugeer.
- Giet het MS buffer en resuspendeer cellen in 5 ml RF10 media. Houd cellen op ijs tot de extracellulaire flux assay.
OPMERKING: Idealiter het extracellulaire flux bepaling worden onmiddellijk na isolatie uitgevoerd. In voorlopige experimenten geen significante verschillen in bepalingsbuffer resultaten werden waargenomen in cellen die binnen 3 hr isolatie versus vers geïsoleerde degenen.
- Handmatig Scheiding:
OPMERKING: Het protocol hier beschreven is aan de 96-well formaat van het instrument. Volumes moeten worden aangepast als een ander formaat wordt gebruikt.
- Hydratatie van Sensor Cartridge
- Til de sensorcartridge, vul elk putje van het nut plaat met 200 ul kalibrant oplossing en laat de sensorcartridge op het nut plaat, kopje onder de sensoren in de kalibrant oplossing.
LET OP: Controleer of het kalibratieoplossing niveau is hoog genoeg om de sensoren onder water te houden. De patroon herbergt fluoroforen geassocieerd O 2 en H + voor elk putje; deze moeten worden gehydrateerd, zodat zij goed werken. - Plaats de patroon in een 37 ° C incubator niet aangevuld met CO 2 of zuurstof / stikstof. Verricht alle verdere incubaties onder deze omstandigheden, tenzij anders aangegeven. Incubeer de cartridge 's nachts te hydrateren.
- Til de sensorcartridge, vul elk putje van het nut plaat met 200 ul kalibrant oplossing en laat de sensorcartridge op het nut plaat, kopje onder de sensoren in de kalibrant oplossing.
- preparatie van Adhesive-coated Plates
- Bereid 2,5 ml van een 22,4 mg / ml hechtende oplossing in 0,1 M natriumbicarbonaat, pH 8,0 (bicarbonaat bepaalt de optimale pH voor kleefstof adsorptie).
- Toepassen 25 ul van de oplossing in elk putje van de testplaat, en incubeer de bank bij kamertemperatuur gedurende 20 min.
- Zuig lijm en was elk putje twee keer met behulp van 200 ui steriel water. Wacht tot putten droog zijn voor het zaaien van de cellen.
- Zaaien Cellen in-Adhesive gecoate platen
- Centrifugeer cellen bij kamertemperatuur bij 200 xg gedurende 5 minuten. Resuspendeer cellen in 5 ml van de geschikte bepaling (zie hierboven voor bereiding van mitochondriale stress en glucosebelastingstest media). Centrifuge cellen opnieuw en resuspendeer in de gewenste concentratie in testmedium (resuspensie volume zal variëren op basis van de concentratie; elk putje wordt 180 pi celsuspensie bevatten).
OPMERKING: Zolang de geschikte test media en verbindings worden gebruikt, de extracellulaire flux analyzer kan gelijktijdig de mitochondriale en glycolyse stresstests op dezelfde plaat. - Plaat 180 gl celsuspensie in elk putje. Gebruik putten A1, A12, H1, en H12 voor achtergrond temperatuurcorrectie: voeg 180 ul assay medium in deze putten (geen cellen).
- Incubeer de platen gedurende 25 min bij 37 ° C.
- Centrifugeer de plaat bij 200 xg gedurende 5 minuten zonder rem zodat alle cellen volledig zijn bevestigd. Visueel bevestigen dat de cellen die stabiel zijn gehecht aan het cultuur oppervlak, waarbij een monolaag, door het bekijken onder de microscoop. Breng de plaat terug in de incubator gedurende nog 30 min.
- Centrifugeer cellen bij kamertemperatuur bij 200 xg gedurende 5 minuten. Resuspendeer cellen in 5 ml van de geschikte bepaling (zie hierboven voor bereiding van mitochondriale stress en glucosebelastingstest media). Centrifuge cellen opnieuw en resuspendeer in de gewenste concentratie in testmedium (resuspensie volume zal variëren op basis van de concentratie; elk putje wordt 180 pi celsuspensie bevatten).
- Bereiding van 10x concentraties van verbindingen en laden van injectorpoorten
- Voor de mitochondriale stresstest bereiden 2,5 ml van 10 uM oligomycin, 1 mM DNP en een mengsel van 10 uM en 10 uM rotenon antimycin A, alle in mitochondriale spanning assay medium.
Opmerking: De concentratie van 2,4-DNP is gebaseerd op eerder gepubliceerde studies, 21 dit is een algemene richtlijn maar de concentratie ontkoppelaar voor elk gebruikte celtype worden bepaald door de onderzoeker. - Voor de glycolyse stress test, voor te bereiden 2,5 ml van 250 mM glucose, 10 uM oligomycin en 500 mM 2-deoxyglucose (2-DG) in glycolyse stress-test medium.
- Warm 10x oplossingen tot 37 ° C en de pH instellen op 7,4.
- Laad de verbindingen in de juiste injectorpoorten van de patroon met een multichannel micropipettor en het laden geleiders, als volgt:
Tabel 3: Verbinding volumes.Haven Mitochondriale Stress Assay Glycolyse Stress Assay EEN 20 gl oligomycin 20 pi glucose B 22 ui 2,4-DNP 22 ul oligomycin C 25 gl antimycin A / rotenon 25 ui 2-DG
OPMERKING: Elke reeks poorten (bijvoorbeeld alle poorten A) moet hetzelfde volume bevatten. Het is essentieel dat alle putjes in een bepaalde serie worden geplaatst, ook als deze niet gebruikt in het experiment, anders zullen de verbindingen niet worden geïnjecteerd (poorten in ongebruikte bronnen kan worden geladen met hetzelfde volume testmedium). - Incubeer de cartridge tijdens het opzetten van het programma.
- Voor de mitochondriale stresstest bereiden 2,5 ml van 10 uM oligomycin, 1 mM DNP en een mengsel van 10 uM en 10 uM rotenon antimycin A, alle in mitochondriale spanning assay medium.
- Opstellen Extracellulaire Flux Assay Protocollen
- Stel de volgende programma (tabel 4).
Tabel 4: Program lay-out.Stap Lus ijking - evenwicht - Baseline lezingen 3 keer: Meng 3 min, wacht 0 min, maatregel 3 min einde lus - Injecteren Port A - Afmetingen 3 keer: Meng 3 min, wacht 0 min, maatregel 3 min einde lus - Injecteren Port B - Afmetingen 3 keer: Meng 3 min, wacht 0 min, maatregel 3 min einde lus - Injecteren Port C - Afmetingen 3 keer: Meng 3 min, wacht 0 min, MEASURe 3 min einde lus - einde Programma -
OPMERKING: In bepaalde omstandigheden, bijvoorbeeld bij het gebruik van geactiveerde cellen, de verzuring kunnen blijven langer dan bij niet eerder behandelde cellen. Daarom kan het nodig zijn de "wacht" tijd in het programma elke meetcyclus keer verlengen of herhalen. - Begin het programma. Na de kalibratie stap, vervangt de kalibrant plaat voor de testplaat (als daarom wordt gevraagd).
OPMERKING: Gebruik van de software, is het mogelijk om groepen van putjes die soortgelijke voorwaarden geven. Daarnaast is het van cruciaal belang om aan te geven welke bronnen de controle putten zijn (in dit protocol, zijn ze de vier hoeken van de plaat) en aan te geven welke putten leeg zijn. Voor een meer gedetailleerde, stap-voor-stap protocol voor het instellen van de machine en hets software, dient de website van de fabrikant worden geraadpleegd.
- Stel de volgende programma (tabel 4).
- Het meten van het eiwitgehalte
- Verwijder het resterende assay medium uit elk putje zonder de cellen.
Opmerking: Als het niet handig te gaan met de eiwitconcentratie assay, kan men de gehele plaat invriezen bij -20 ° C tot analyse. Indien bevroren, ontdooien alvorens verder te gaan. - Bereid een 1x oplossing van proteaseremmers (100x voorraad) in RIPA lysis medium (voldoende voor 50 pl / putje).
- Voeg 50 ul RIPA lysis medium aangevuld met proteaseremmers aan elk putje. Schud plaat op een schudder gedurende 5 min, en vervolgens incubeer plaat op ijs gedurende 30 minuten volledig te lyseren cellen.
- Draai de plaat bij 200 xg gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur lipiden en andere moleculen aan de onderzijde van de plaat te brengen zodat ze niet interfereren met de bicinchoninezuur (BCA) assay.
- Meet eiwitconcentratie door BCA assay volgens de fabrikant &# 39; s aanbevelingen.
- Verwijder het resterende assay medium uit elk putje zonder de cellen.
Representative Results
Eukaryotische cellen gebruiken een geïntegreerd netwerk van glycolyse, de tricarbonzuur (TCA) cyclus en oxidatieve fosforylering het merendeel van de energiebehoefte te voldoen en tussenproducten nodig zijn voor celgroei en proliferatie. Deze routes beginnen met het intracellulaire vangen van vrije glucose in glucose-6-fosfaat, dat vervolgens wordt verwerkt tot pyruvaat. Pyruvaat wordt hetzij gereduceerd tot lactaat of in de mitochondriën, waar het vormt acetyl coenzyme A (CoA) getransporteerd. Acetyl-CoA gaat dan in de TCA cyclus. Hoge-energie tussenproducten met de TCA cyclus voortbewegen van de beweging van elektronen in de elektronentransportketen (ETC), dat op zijn beurt verdrijft H + van de mitochondriale matrix een H + gradiënt over de binnenste mitochondriale membraan ontstaan. Zuurstof fungeert als de uiteindelijke elektronen acceptor, en H + terug te keren naar de mitochondriale matrix door de F O / F <sub> 1 complex, waar hun potentiële energie wordt gebruikt om ATP (Figuur 1A) genereren.
Het werkingsprincipe van de extracellulaire flux test hangt af van bemoeien met glycolyse en oxidatieve fosforylering op specifieke punten, en de beoordeling van de daaruit voortvloeiende gevolgen. Hiervoor gebruikten we glucose glycolyse uitgehongerde cellen en 2-deoxyglucose (2-DG), dat wordt omgezet in 2-deoxyglucose-6-fosfaat, een competitieve remmer van phosphoglucoisomerase 23, door hexokinase verspreiden, teneinde blokkeren glycolyse. Rotenon (complex I-specifieke remmer van de ETC), antimycin A (een complex III-specifieke remmer van de ETC), oligomycin (remmer van ATP synthase 24), en de ontkoppeling middel 2,4-dinotrophenol (DNP) 25 waren gebruikt om specifieke evenementen in verband met het vervoer, proton gradiënt en ATP synthese (Figuur 1A) elektronen ingrijpen. In plaats van 2,4-DNP, carbonyl cyanide-4- (trifluormethoxy) fenylhydrazon (FCCP) kan ook gebruikt worden, maar verdere optimalisatie kan vereist. In beide gevallen moet ontkoppelrails altijd getitreerd voor een bepaald celtype voor gebruik om de optimale concentratie te bepalen nodig.
De glycolyse stress test (Figuur 1B) begint met een nulmeting van de extracellulaire verzuring rate (ECAR) in de eerder uitgehongerd cellen. Omdat deze cellen hun basale minimum en derhalve praktisch gezien als niet-glycolytische wordt de ECAR gemeten op dit punt als de niet-glycolytische verzuring. Deze verzuring waarschijnlijk overeen met respiratoire CO 2 gegenereerd in de TCA cyclus wordt omgezet in HCO 3 - en H +. Dit wordt gevolgd door de injectie van glucose glycolyse activeren, die weer als een toename van het extracellulaire verzuring door de vorming van lactaat.Deze toename vertegenwoordigt het normale tarief van glycolyse. De cellen worden vervolgens geprikkeld met de injectie van oligomycin, welke blokken de vorming van ATP door middel van oxidatieve fosforylering. Cellen reageren op deze dramatische daling van ATP productie door het activeren glycolyse zijn maximumniveau en dat resulteert in een toename van de secundaire ECAR niveau (glycolytische reserve). De proef wordt beëindigd door totale remming van glycolyse met de glucose analoge 2-DG, die de ECAR de niet-glycolytische niveau terugkeert. Interessant is voorgesteld dat, zoals aanbevolen door de fabrikant, maximale glycolyse wordt niet noodzakelijkerwijs bereikt door de injectie van oligomycin 26. In cellen met een hoge glycolytische capaciteit, als er geen significante toename in ATP vraag glycolyse kan perfect kunnen gaan met het verlies van mitochondriale ATP zonder dat dit product up-gereguleerd. De glycolytische tarief met oligomycin kon worden overtroffen door het toevoegen van de luchtwegen remmersZoals rotenon en myxothiazol, die enkele voordelen ten opzichte oligomycin bieden: 1) Zij vergen ATP mocht de omkering van ATP synthase veroorzaken met ATP hydrolyse, om protonen te pompen in een poging om de mitochondriale membraanpotentiaal 26 herstellen; 2) Ze voorkomen respiratoire verzuring van het medium, waarin de ECAR resultaten (zie hieronder) kunnen verwarren. Andere manieren om ATP vraag te vergroten omvatten de toevoeging van verbindingen die de hydrolyse van ATP stimuleren door het plasmamembraan ATPasen 26. Dit alles moet zorgvuldig worden overwogen door onderzoekers bij het plannen van een glycolyse stresstest.
De mitochondriale stress test (figuur 1C) begint met een nulmeting van het zuurstofverbruik rate (OCR) in niet-uitgehongerd cellen. Dit wordt gevolgd door de injectie van oligomycin, die de terugkeer van protonen door de F O / F 1-complex remt en daardoor snel hyperpolarizes het mitochondriale membraan. Hyperpolarisatie voorkomt verdere proton pompen door respiratoire complexen, en de ademhalingsfrequentie afneemt. De resterende ademhaling heet proton lek, waarbij de stroom van protonen met lipiden of andere kanalen vertegenwoordigt. Dit gehyperpolariseerde toestand wordt snel omgekeerd door de toevoeging van de ontkoppeling middel 2,4-DNP, dat als een proton ionofoor. In reactie, cellen proberen om de membraanpotentiaal in een vergeefse poging te herstellen door het verhogen van het elektron transport tarief op zijn maximum, en dit op zijn beurt verhoogt de OCR. Tot slot, met de toevoeging van twee ETC-remmers (antimycin A en rotenon), mitochondriale ademhaling volledig stopt en OCR af tot het laagste niveau. Op dit niveau zuurstofverbruik niet door mitochondriale activiteit (niet-mitochondriale). Het verschil in de OCR die door deze remmers wordt de maximale mitochondriale ademhaling, die de som van de basislijn ademhaling en de reservecapaciteit.
B-cellen en naïeve CD4 + T-cellen werden geïsoleerd zoals beschreven in paragraaf 4 van het protocol, en splenocyten werden eenvoudigweg verkregen door lyseren van de rode bloedcellen zoals beschreven in paragraaf 3.3.
De gevoeligheid van celtype-specifieke metabolische assays afhankelijk van de levensvatbaarheid en de zuiverheid van het uitgangsmateriaal celpopulatie. Daarom, om de levensvatbaarheid van de geïsoleerde muizen T-cellen, splenocyten en B-cellen en de zuiverheid van T- en B-cellen te verifiëren, kleine fracties cellen werden gekleurd voor flowcytometrische analyse (figuur 2). In de forward scatter-area versus zijwaartse verstrooiing-area (FSC-A vs. SSC-A) plot, lymfocyten werden afgesloten, en binnen deze poort, de bevolking langs de diagonaal in de forward scatter-height (FSC-H) vs. FSC-A plot werden bepaald als de singlets. Binnen het singlet bevolking, werd levensvatbaarheid gemeten door het poorten van de cellen die negatief gekleurd voor de live / dead marker (Figuur 2A); T cellevensvatbaarheid was 97,9%, splenocyten levensvatbaarheid was 92%, en B cellevensvatbaarheid was 94%. B-cel zuiverheid, zoals gemeten door de B220 + CD19 + populatie 26, was 99%, terwijl CD4 + T-cel zuiverheid zoals gemeten door de CD44 - populatie CD4 + 27 was 98,3% (Figuur 2B).
Eiwitconcentratie van het cellysaat kan worden gebruikt als een directe indicatie plated celaantal.
Geïsoleerde lymfocyten en splenocyten werden uitgezet in een met kleefstof beklede 96-well assay plaat bij 5 x 10 5 cellen / putje, 2,5 x 10 5 cellen / putje, 1,25 x 10 5 cellen / putje, en 0,625 x 10
Mitochondriale en glycolytische stress assays zijn afhankelijk van vergulde aantal cellen.
Het OCR werd gemeten voor elk celtype en plating dichtheid in de extracellulaire flux analysator. Zoals verwacht hogere celaantallen een hogere gemeten OCR, evenals meer dramatische reacties op oligomycin, 2,4-DNP en antimycin A / rotenon (Figuur 4A). Standaardiseren OCR metingen om eiwitconcentratie elk monster onthult dat in het algemeen, grotere aantallen cellen leiden tot een meer nauwkeurige OCR-metingen. Scheepswand in 5 en 2,5 x 10 5 cellen / putje leidde tot soortgelijke genormaliseerde OCR metingen in de T-cellen en splenocyten en 5 en 1,25 x 10 5 cellen / putje leidde soortgelijke genormaliseerde OCR metingen in B-cellen (Figuur 4B). De kleine verschillen in de genormaliseerde B-cel OCR metingen kan een indirecte indicatie dat B-cellen beter presteren bij 2,5 x 10 5 cellen / putje in vergelijking met andere celdichtheden. Door alle maatregelen, 0,625 x 10 5 cellen / putje gaf suboptimale resultaten, waaruit blijkt dat dit plating dichtheid is onvoldoende. Baseline ademhaling, proton lek, maximale mitochondriale ademhaling, niet-mitochondriale ademhaling en ATP productie lineair gecorreleerd met plating dichtheden voor alle celtypen (Figuur 4C). Bovendien, de meeste van de basislijn ademhaling wordt aangewend voor het synthetiseren van ATP, zoals aangegeven door de lage proton lek in de drie celsoorten. Terwijl de primaire focus van de mitochondriale spanning experiment is om bij OCR meten de ECAR nog steeds nuttig op te nemen zodat de test met succes is uitgevoerd. Vergelijkbaar met de OCR, de twee hoogste beplating dichtheden leidde tot hogere ECAR en dramatischer reacties op oligomycin, 2,4-DNP en antimycin A / rotenon (Figuur 4D). De dramatische veranderingen in ECAR bij toevoeging van 2,4-DNP en antimycin A / rotenon kan door veranderingen in de ademhaling naast veranderingen in glycolysis Aangezien CO 2 gegenereerd in de TCA cyclus wordt omgezet in HCO 3 - en H +. Deze kwestie is onlangs aangepakt, en er bestaat een eenvoudige methode voor het corrigeren van de totale extracellulaire verzuring signaal met behulp van zuurstofverbruik van gegevens, naar de echte glycolytische tarief 12,29 te verkrijgen.
De glycolyse spanning test was zeer succesvol in de hoogste plaatdichtheid (Figuur 5A, B). In alle celtypes, de 5 x 10 5 cellen / putje monsters hadden de grootste veranderingen in ECAR na de toevoeging van glucose, oligomycin en 2-DG (Figuur 5B). Bovendien, het normaliseren van eiwit concentratie aangetoond dat voor elk type cel, de 5 x 10 5 cellen / putje monsters leverde een optimaal resultaat, terwijl lagere concentraties, vooral 0,625 x 10 5 cellen / goed niet een robuuste glycolytische reservecapaciteit te geven. Non-glycolytic verzuring, glycolyse, en schijnbare glycolytische capaciteit lineair gecorreleerd met plating dichtheden voor alle celtypes (figuur 5C). Voor de glycolyse spanning experiment, de OCR grafiek blijkt dat glucose enigszins stimuleert mitochondriale ademhaling, die vervolgens wordt geremd door oligomycin behandeling; de toevoeging van 2-DG beïnvloedde de OCR (figuur 5D). De OCR grafiek kan worden gebruikt als een verdere indicatie dat de glycolyse spanning experiment succesvol is uitgevoerd. Ook kan de OCR grafiek worden voor het corrigeren van de ECAR grafiek eventueel zoals hierboven beschreven bij de mitochondriale stresstest 12,29.
Figuur 1:. Overzicht van extracellulaire flux assays (A) Illustratie van glycolyse (links) en oxidatieve fosforylering (rechts) die de werking van demetabole geneesmiddelen die in het extracellulaire flux assays. (B) Schematische voorstelling van de extracellulaire verzuring rate (ECAR) grafiek; schematische weergave van het zuurstofverbruik rate (OCR) grafiek (C). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
. Figuur 2: Stapsgewijze gating van T-cellen, B-cellen en splenocyten levensvatbaarheid en zuiverheid bepalen Flow cytometrische plots die de levensvatbaarheid van T-cellen, splenocyten, en B-cellen (A); en zuiverheid van T- en B-cellen (B). De resultaten zijn representatief voor ten minste drie onafhankelijke experimenten. Klik hier om een grotere versie van th bekijkenis figuur.
Figuur 3:. Celconfluentie correleert met het lysaat eiwitconcentraties van elk celtype in verschillende plating dichtheden (A) licht microfoto van cellen in putjes van ten plating dichtheden variërend van 5 x 10 5 cellen / putje tot 0,625 x 10 5 cellen / goed. Schaalbalken geven 50 urn. (B) Lysate eiwitconcentraties op verschillende plating dichtheden, zoals gemeten met de BCA assay. De resultaten zijn representatief voor ten minste drie onafhankelijke experimenten. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Figuur 4: Mitochondriale stress-test. Raw (A) en gestandaardiseerde (B) OCR voor elk celtype en plating dichtheid weergegeven. (C) Aantal cellen afhankelijke veranderingen in de niveaus van de basislijn, maximale mitochondriale en non-mitochondriale ademhaling, en zuurstof verbruik verbonden proton lekken of ATP productie, worden getoond voor elke celtypen. (D) Raw ECAR waarden verkregen uit de mitochondriale stresstest getoond. Elk gegevenspunt stelt het gemiddelde van 7-8 putjes standaarddeviatie. Gelabelde pijlen duiden injecties oligomycin (O), 2,4-DNP (D) en rotenon / antimycin A (R / A). De resultaten zijn representatief voor ten minste drie onafhankelijke experimenten. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
_upload / 54918 / 54918fig5.jpg "/>
Figuur 5:. Glycolytische spanning assay Raw (A) en gestandaardiseerde (B) ECAR voor elk celtype en plating dichtheid weergegeven. (C) Aantal cellen afhankelijke veranderingen ECAR voor niet-glycolytische verzuring, glucose geïnduceerde glycolyse en totale glycolytische capaciteit getoond. (D) Raw OCR waarden verkregen uit de glycolytische stresstest getoond. Elk gegevenspunt stelt het gemiddelde van 7-8 putjes standaarddeviatie. Gelabelde pijlen duiden injecties van glucose (G), oligomycin (O) en 2-deoxyglucose (2-DG). De resultaten zijn representatief voor ten minste drie onafhankelijke experimenten. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Discussion
De techniek die we ontwikkeld toegestaan efficiënte isolatie van zuivere en levensvatbare lymfocyten, die vervolgens in extracellulair flux analyse werden in verschillende concentraties aan de verschillen in de glycolyse en mitochondriale ademhaling te evalueren. Dit protocol is speciaal ontworpen voor lymfocyten en richt de speciale overwegingen met betrekking tot deze celtypes, zoals lage basale metabolische activiteit, breekbaarheid, lage frequentie, en hun onvermogen om zich aan testplaten. Daarom vergeleken met eerder gepubliceerde protocollen 11,12, onze methode biedt een handige en beter geoptimaliseerd gids voor onderzoekers op het gebied van immunologie. Er zijn een aantal cruciale stappen in dit protocol, met inbegrip van het krijgen van zuivere en levensvatbaar celpopulaties, plating de cellen op een optimale samenvloeiing, en het standaardiseren van de extracellulaire flux test metingen om de eiwit-concentratie in elk putje.
de initial aantal cellen verzilverd konden beide worden gevisualiseerd door lichtmicroscopie en ook worden gekwantificeerd met behulp van eiwitconcentratie metingen. De lineaire correlatie tussen het aantal cellen en eiwitconcentratie bevestigd dat de eiwitconcentratie inderdaad kan worden gebruikt als een manier om de effecten van veranderingen in het aantal cellen tussen verschillende putjes standaardiseren.
Door het standaardiseren van de ECAR en OCR de eiwitconcentraties hebben we aangetoond dat, ondanks de lagere celconfluentie, zo weinig als 2,5 x 10 5 cellen / putje kan worden gebruikt in de meeste assays zonder de kwaliteit van de gegevens. De ondergrens van cellen die gebruikt kunnen variëren tussen celtypen en assays. Bijvoorbeeld, terwijl zo weinig als 1,25 x 10 5 cellen kunnen worden gebruikt voor B-cel OCR metingen, zelfs 2,5 x 10 5 cellen / putje waren niet voldoende om de glycolytische prestaties van hetzelfde celtype beoordelen. Daarom, zolang als aantal cellen is geen beperkende factor, scheepswand in meer dan90% confluentie, die ongeveer overeenkomt met 5 x 10 5 lymfocyten / putje, de voorkeur. Verdere optimalisatie kan vereist indien cellen van verschillende grootte-zoals eerder geactiveerde en gedeeltelijk gedifferentieerde lymfocyten-gebruik. Bovendien, bij gebruik van eerder gekweekte primaire lymfocyten, kan er een verschil in cellevensvatbaarheid verschillende behandelingsomstandigheden, die de betrouwbaarheid van eiwitconcentratie zou dalen als maat voor het aantal cellen omdat dood of stervende cellen kunnen ook bijdragen aan de gemeten eiwitniveaus . In dergelijke gevallen kan het nuttig zijn om levende cellen door flow cytometry gekozen voor het uitvoeren van de extracellulaire flux assays.
In onze tests met vers geïsoleerde en hoogst haalbare lymfocyt populatie, verkregen we betrouwbare functionele gegevens voor zowel OCR en ECAR metingen. Terwijl alle celtypen eveneens gedragen in de mitochondriale stresstest opvallende verschillen tussen celtypen warenwaargenomen in de glycolyse stresstest. Bijvoorbeeld, de glycolytische prestaties van naïeve T-cellen was laag vergeleken met splenocyten of B-cellen, en veranderde niet met de toevoeging van oligomycin. Deze waarneming is in overeenstemming met eerder gepubliceerde studies 7,30, hetgeen de validiteit van onze protocol.
Concluderend onze methode biedt een efficiënte en eenvoudige manier van het testen van de metabole activiteit van lymfocyten met een extracellulair flux analysator, en kan nuttig zijn bij een groot aantal immunologische studies waarin de metabole veranderingen in immuuncellen na activering, celdifferentiatie of wegens ziekte fenotypes zoals infectie, auto-immuniteit en hematologische maligniteiten.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| PBS (pH 7.2) | Gibco-ThermoFisher | 20012-050 | To make MACS buffer |
| Bovine Serum Albumin BSA | Sigma-Aldrich | A3803 | To make MACS buffer |
| 0.5 M EDTA, pH 8 | Quality Biological | 10128-446 | To make MACS buffer |
| autoMACS rinsing solution | Miltenyi Biotec | 130-091-222 | Instead of PBS + EDTA to make MS buffer. Also used in autoMACS Pro Separator. |
| RPMI-1640 | Gibco-ThermoFisher | 11875-093 | Contains phenol red and L-glutamine |
| Fetal Bovine Serum | Gibco-ThermoFisher | 10437-028 | For heat-inactivation, thaw frozen stock bottle in a 37 °C water bath and then inactivate at 56 °C for 30 min. Aliquot heat-inactivated serum for storage (e.g., in 50 ml conical tubes) and freeze at -20 °C until needed. |
| Penicillin-Streptomycin (Pen Strep) | Gibco-ThermoFisher | 15140-122 | Combine Pen Strep with L-Glut 1:1 (if making 500 ml media, make a total of 12 ml Pen Strep/L-Glut); keep aliquots at -20 °C until ready to make media. |
| L-Glutamine 200 mM (L-Glut) | Gibco-ThermoFisher | 25030-081 | Component of RF10 and stress test media |
| Sodium pyruvate 100 mM | Gibco-ThermoFisher | 11360-070 | Component of RF10 and stress test media |
| HEPES 1 M | Gibco-ThermoFisher | 15630-080 | Component of RF10 |
| MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x) | Gibco-ThermoFisher | 11140-050 | Component of RF10 |
| 2-Mercaptoethanol (55 mM) | Gibco-ThermoFisher | 21985-023 | Component of RF10 |
| Falcon 70 μm cell strainer | Falcon-Fischer Scientific | 87712 | Used in cell isolation |
| Monoject 3 ml Syringe, Luer-Lock Tip | Covidien | 8881513934 | Used in cell isolation |
| Falcon 15 ml Conical Centrifuge Tubes | Falcon-Fischer Scientific | 14-959-53A | Used in cell isolation |
| Falcon 50 ml Conical Centrifuge Tubes | Falcon-Fischer Scientific | 14-432-22 | Used in cell isolation |
| ACK Lysing Buffer | Lonza | 10-548E | Used in cell isolation |
| CellTrics 30 μm cell filter, sterile, single-packed | Partec CellTrics | 04-004-2326 | Used in cell isolation |
| B Cell Isolation Kit, mouse | Miltenyi Biotec | 130-090-862 | Used in cell isolation |
| Naïve CD4+ T cell isolation kit, mouse | Miltenyi Biotec | 130-104-453 | Used in cell isolation |
| LS Column | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | Used in cell isolation |
| MidiMACS separator | Miltenyi Biotec | 130-042-302 | Magnet for separation |
| MACS MultiStand | Miltenyi Biotec | 130-042-303 | Holder for magnets |
| autoMACS Rinsing Solution | 130-091-222 | Rinsing solution for autoMACS Pro Separator | |
| autoMACS Pro Separator Instrument | Miltenyi Biotec | N/A | |
| 2-Deoxy-D-glucose (2-DG) | Sigma-Aldrich | D8375-5G | |
| Cell-Tak | Corning | 354240 | Cell adhesive. Take care to note concentration, as each lot is different (package is 1 mg). |
| Oligomycin | Sigma-Aldrich | 75351 | |
| 2,4-Dinotrophenol (2,4-DNP) | Sigma-Aldrich | D198501 | |
| Antimycin A | Sigma-Aldrich | A8674 | |
| Rotenone | Sigma-Aldrich | R8875 | |
| Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | |
| Halt Protease Inhibitor Cocktail | ThermoFisher Scientific | 78429 | Supplied as 100x cocktail, combine with RIPA to form 1x solution for lysis. |
| RIPA Buffer | Boston BioProducts | BP-115 | |
| Pierce BCA Protein Assay Kit | ThermoFisher Scientific | 23225 | Follow manufacturer's instructions |
| Seahorse XFe96 FluxPak | Seahorse Bioscience | 101085-004 | Includes assay plates, cartridges, loading guides for transferring compounds to the assay cartridge, and calibrant solution. |
| Seahorse XF Base Medium | Seahorse Bioscience | 102353-100 | Used to prepare stress test media |
| Seahorse XFe96 Extracellular Flux Analyzer | Seahorse Bioscience | ||
| Stericup Sterile Vacuum Filter Units, 0.22 μm | EMD Millipore-Fisher Scientific | SCGPU10RE | Used to sterile filter media. |
| Sodium bicarbonate | Sigma-Aldrich | 487031 | Dissolved to 0.1 M and used to dilute Cell-Tak. |
References
- Motz, G. T., Coukos, G. Deciphering and reversing tumor immune suppression. Immunity. 39 (1), 61-73 (2013).
- Akkaya, M., Barclay, A. N. How do pathogens drive the evolution of paired receptors? Eur J Immunol. 43 (2), 303-313 (2013).
- Smith-Garvin, J. E., Koretzky, G. A., Jordan, M. S. T cell activation. Annu Rev Immunol. 27, 591-619 (2009).
- Dinarello, C. A. Proinflammatory cytokines. Chest. 118 (2), 503-508 (2000).
- Kurosaki, T., Kometani, K., Ise, W. Memory B cells. Nat Rev Immunol. 15 (3), 149-159 (2015).
- Mosser, D. M., Edwards, J. P. Exploring the full spectrum of macrophage activation. Nat Rev Immunol. 8 (12), 958-969 (2008).
- Pearce, E. L., Poffenberger, M. C., Chang, C. H., Jones, R. G. Fueling immunity: insights into metabolism and lymphocyte function. Science. 342 (6155), 1242454 (2013).
- Gerriets, V. A., Rathmell, J. C. Metabolic pathways in T cell fate and function. Trends Immunol. 33 (4), 168-173 (2012).
- Doughty, C. A., et al. Antigen receptor-mediated changes in glucose metabolism in B lymphocytes: role of phosphatidylinositol 3-kinase signaling in the glycolytic control of growth. Blood. 107 (11), 4458-4465 (2006).
- Caro-Maldonado, A., et al. Metabolic reprogramming is required for antibody production that is suppressed in anergic but exaggerated in chronically BAFF-exposed B cells. J Immunol. 192 (8), 3626-3636 (2014).
- Pelletier, M., Billingham, L. K., Ramaswamy, M., Siegel, R. M. Extracellular flux analysis to monitor glycolytic rates and mitochondrial oxygen consumption. Methods Enzymol. 542, 125-149 (2014).
- Mookerjee, S. A., Brand, M. D. Measurement and Analysis of Extracellular Acid Production to Determine Glycolytic Rate. J Vis Exp. (106), e53464 (2015).
- Chacko, B. K., et al. Methods for defining distinct bioenergetic profiles in platelets, lymphocytes, monocytes, and neutrophils, and the oxidative burst from human blood. Lab Invest. 93 (6), 690-700 (2013).
- Klein, A. B., et al. Impact of different cell isolation techniques on lymphocyte viability and function. J Immunoassay Immunochem. 27 (1), 61-76 (2006).
- Hsueh, R. C., et al. Purification and Characterization of Mouse Splenic B Lymphocytes. AfCS Research Reports. 1 (1), 1-11 (2012).
- Zambrano, K., et al. Prolonged ex vivo expansion and differentiation of naive murine CD43 B splenocytes. Biotechnol Prog. , (2016).
- Costa, G. L., et al. Targeting rare populations of murine antigen-specific T lymphocytes by retroviral transduction for potential application in gene therapy for autoimmune disease. J Immunol. 164 (7), 3581-3590 (2000).
- Franz, B., May, K. F., Dranoff, G., Wucherpfennig, K. Ex vivo characterization and isolation of rare memory B cells with antigen tetramers. Blood. 118 (2), 348-357 (2011).
- Schneider, D. F., Glenn, C. H., Faunce, D. E. Innate lymphocyte subsets and their immunoregulatory roles in burn injury and sepsis. J Burn Care Res. 28 (3), 365-379 (2007).
- Reeves, J. P., Reeves, P. A. Removal of lymphoid organs. Curr Protoc Immunol. Chapter 1, Unit 1 9 (2001).
- Akkaya, B., et al. A Simple, Versatile Antibody-Based Barcoding Method for Flow Cytometry. J Immunol. 197 (5), 2027-2038 (2016).
- Traba, J., et al. Fasting and refeeding differentially regulate NLRP3 inflammasome activation in human subjects. J. Clin. Invest. 125 (12), 4592-4600 (2015).
- Wick, A. N., et al. Localization of the Primary Metabolic Block Produced by 2-Deoxyglucose. J. Biol. Chem. 224 (2), 963-969 (1957).
- Linnett, P. E., Beechey, R. B. Inhibitors of the ATP synthetase system. Methods Enzymol. 55, 472-518 (1979).
- Terada, H. Uncouplers of oxidative phosphorylation. Environmental Health Perspectives. 87, 213-218 (1990).
- Mookerjee, S. A., Nicholls, D. G., Brand, M. D. Determining Maximum Glycolytic Capacity Using Extracellular Flux Measurements. PLOS ONE. 11 (3), e0152016 (2016).
- Lai, L., Alaverdi, N., Maltais, L., Morse, H. C. 3rd Mouse cell surface antigens: nomenclature and immunophenotyping. J Immunol. 160 (8), 3861-3868 (1998).
- Gerberick, G. F., Cruse, L. W., Miller, C. M., Sikorski, E. E., Ridder, G. M. Selective modulation of T cell memory markers CD62L and CD44 on murine draining lymph node cells following allergen and irritant treatment. Toxicol Appl Pharmacol. 146 (1), 1-10 (1997).
- Mookerjee, S. A., Goncalves, R. L. S., Gerencser, A. A., Nicholls, D. G., Brand, M. D. The contributions of respiration and glycolysis to extracellular acid production. Biochim. Biophys. Acta - Bioenergetics. 1847 (2), 171-181 (2015).
- Buck, M. D., O'Sullivan, D., Pearce, E. L. T cell metabolism drives immunity. J Exp Med. 212 (9), 1345-1360 (2015).
