Introduction
किसी को भी जो मस्तिष्क सरल ऑन-लाइन thresholding और गवाक्षन से अधिक परिष्कृत तरीकों का उपयोग करने से बाह्य संकेतों रिकॉर्ड की पहचान करने और शोर वोल्टेज संकेतों इलेक्ट्रोड के द्वारा दर्ज से अलग न्यूरॉन्स से संकेतों को अलग करने का कार्य चेहरे। यह कार्य सामान्यतः कील छँटाई के रूप में जाना जाता है। कील छँटाई की कठिनाई विभिन्न कारकों से बढ़ रहा है। न्यूरॉन्स एक साथ बहुत करीब जा सकता है ताकि संकेतों के पास के एक इलेक्ट्रोड ने उन से दर्ज की गई इसी तरह की और अंतर करना मुश्किल होने की संभावना है। संकेतों को एक न्यूरॉन द्वारा उत्पादित डेन्ड्राइट कि इलेक्ट्रोड के करीब है, या संभवतः के रूप में कर रहे हैं में उच्च फायरिंग दर, वोल्टेज conductances के सक्रियण के चर डिग्री की अवधि के दौरान शायद इलेक्ट्रोड, चर सोडियम चैनल कैनेटीक्स के आंदोलनों की वजह से समय के साथ भिन्न हो सकते हैं, मस्तिष्क राज्य में परिवर्तन का एक परिणाम है। (- 100 माइक्रोन 20) आर इन समस्याओं के कई निकट दूरी के साथ बहु-इलेक्ट्रोड सरणियों (MEAS) का उपयोग करके कम किया जा सकता चैनल जो एकल न्यूरॉन्स से संकेतों के बेहतर स्थानिक परिभाषा की अनुमति देता है, क्योंकि वे आम तौर पर कई चैनलों 1, 2 पर बाहर फैल रहे हैं ecording। हालांकि, इस तथ्य यह है कि अंतरिक्ष में इलेक्ट्रोड ओवरलैप की पूरी लंबाई के साथ फैल न्यूरॉन्स से संकेतों के साथ संयुक्त, एक संभावित बहुत उच्च आयामी अंतरिक्ष के भीतर जो अद्वितीय न्यूरॉन्स के लिए इसी समूहों में परिणामों की पहचान की जानी चाहिए। यह समस्या इलेक्ट्रोड चैनलों की एक छोटी संख्या से अधिक के लिए computationally असभ्य हो जाता है। तिथि करने के लिए, वहाँ कोई आम तौर पर सहमत हुए कील छँटाई के लिए सबसे अच्छा तरीका है, हालांकि कई समाधान 3 प्रस्तावित किया गया है, 4, 5, 6, 7, 8 और Meas से रिकॉर्डिंग तेजी से सामान्य 9 होते जा रहे हैं,गधा = "xref"> 10। क्योंकि कील छँटाई अपने आप में एक अंत नहीं है, लेकिन बस आगे डेटा विश्लेषण से पहले एक आवश्यक प्रारंभिक कदम है, वहाँ है कि कच्चे रिकॉर्डिंग डेटा फाइलों में पढ़ सकते हैं और के रूप में छोटे उपयोगकर्ता के साथ हल कील गाड़ियों के लिए उन्हें बदलना होगा एक आसानी से प्रयोग करने योग्य पैकेज के लिए एक की जरूरत है इनपुट, और जितनी जल्दी और मज़बूती से संभव के रूप में।
इन जरूरतों को पूरा करने के उद्देश्य से विकसित कार्यक्रम - इस पत्र SpikeSorter के उपयोग के लिए एक ट्यूटोरियल प्रदान करता है। कार्यक्रम पहले से प्रकाशित पत्र 11, 12, 13 में वर्णित एल्गोरिदम पर आधारित है। कार्यक्रम को डिजाइन करने में लक्ष्यों थे कि एक) यह एक उपयोगकर्ता के अनुकूल इंटरफेस कम या कंप्यूटर प्रोग्रामिंग के या कील कार्यप्रणाली छँटाई का कोई पूर्व ज्ञान की आवश्यकता नहीं होनी चाहिए; ख) मानक विंडोज या लिनक्स ऑपरेटिंग सिस्टम के परे कुछ या कोई अन्य विशेष सॉफ्टवेयर घटकों की जरूरत किया जाना चाहिए; सी घ) छँटाई कम किया जाना चाहिए दौरान उपयोगकर्ता इनपुट के लिए की जरूरत है, और ई) छँटाई बार एक उचित तरीके से पैमाने चाहिए, आदर्श रैखिक, रिकॉर्डिंग की अवधि और इलेक्ट्रोड पर चैनलों की संख्या के साथ। एल्गोरिदम कार्यक्रम में लागू क) पूर्व प्रसंस्करण और घटना का पता लगाने रणनीतियों में से एक लचीला सेट शामिल हैं; ख) एक स्वचालित बांटो और आयाम कमी है जो प्रमुख घटकों (पीसी) विशिष्ट समूहों को सौंपा चैनलों के सबसेट से प्राप्त वितरण पर आधारित वोल्टेज waveforms समूहों की जीत की रणनीति; मतलब पारी एल्गोरिथ्म 3, 14, और विकास पर आधारित एक तेजी से क्लस्टरिंग प्रक्रिया) आंशिक रूप से स्वचालित जोड़ो में विलय और समूहों के बंटवारे के साथ पीसी वितरण के ग) स्वचालित क्लस्टरिंग सुनिश्चित करें कि प्रत्येक सभी दूसरों से संभव के रूप में अलग है। लिए थीएस, प्रक्रियाओं का एक सेट जोड़ दिया गया है कि मैनुअल बंटवारे या पीसी वितरण, पार और कील गाड़ियों और कील waveforms के समय आयाम भूखंडों की ऑटो correlograms के निरीक्षण के आधार पर समूहों के विलय की अनुमति है। tetrodes, tetrode सरणियों, यूटा सरणियों के साथ ही एकल और बहु टांग Meas से रिकॉर्डिंग पढ़ सकते हैं और हल किया जा सकता है। चैनलों की संख्या पर मौजूदा सीमा 256 है, लेकिन यह भविष्य में वृद्धि हो सकती है।
एक और पार मंच खुला स्रोत कार्यान्वयन, "Spyke" (http://spyke.github.io), भी उपलब्ध है। हम में से एक अजगर और Cython (एमएस) ने लिखा, Spyke, SpikeSorter के रूप में एक ही समग्र दृष्टिकोण का उपयोग करता कुछ मतभेदों के साथ: स्मृति मांगों को कम करने, कच्चे डेटा छोटे ब्लॉकों में केवल जब बिल्कुल आवश्यक भरी हुई है, और; समूहों को विशेष रूप से प्रदर्शित छेड़छाड़, और 3 डी में हल कर रहे हैं; और प्रमुख घटक और स्वतंत्र घटक विश्लेषण दोनों पूरक आयाम कमी तरीके के रूप में इस्तेमाल कर रहे हैं। Spyke में और अधिक उपयोगकर्ता की आवश्यकता हैteraction, लेकिन कीबोर्ड और माउस शॉर्टकट और एक पूर्ववत करें / फिर कतार पर काफी निर्भर करता है तेजी से spikes के किसी भी सबसेट की क्लस्टरिंग पर विभिन्न कारकों के प्रभाव का पता लगाने के लिए। इन कारकों में कील चैनल और समय सीमा चयन, कील संरेखण, क्लस्टरिंग आयाम और स्थानिक बैंडविड्थ (सिग्मा) 11 में शामिल हैं।
निम्नलिखित एल्गोरिदम और रणनीतियों छंटाई के लिए प्रयोग किया जाता का एक संक्षिप्त विवरण है। अधिक पूरा विवरण SpikeSorter भीतर पिछले प्रकाशनों 11, 12, 13 में और स्पष्टीकरण मदद बटन के माध्यम से पहुँचा जा सकता है में पाया जा सकता है (एक साथ की पहचान '?')। एक कच्चे कोशिकी वोल्टेज फ़ाइल लोड हो रहा है और कम आवृत्ति घटकों, घटनाओं का एक सेट में घटना का पता लगाने के परिणामों की एक प्रारंभिक चरण में, जिनमें से प्रत्येक के पहले और घटना के समय के बाद एक संक्षिप्त वोल्टेज स्नैपशॉट के होते हैं छानने के बाद। चुनावसवार साइटों पर्याप्त बारीकी से (<100 माइक्रोन), एकल इकाई संकेतों आम तौर पर कई पड़ोसी चैनलों पर दिखाई देगा स्थान दिया गया है। एक केंद्रीय चैनल स्वचालित रूप से, प्रत्येक घटना के लिए चुना चैनल है जिस पर घटना की चोटी से पीक वोल्टेज सबसे बड़ा है के लिए इसी है। प्रत्येक इलेक्ट्रोड चैनल के लिए एक एकल प्रारंभिक क्लस्टर बनाने, सभी घटनाओं है कि उस चैनल के लिए स्थानीय से मिलकर गए थे द्वारा शुरू होता है छँटाई स्वचालित। spikes के इन दो सेट से समूहों समान के रूप में पहचान की जाएगी और बाद में विलय कर दिया: चैनलों के बीच रास्ते के मध्य में स्थित एक इकाई spikes है कि स्थानीय कर रहे हैं (शायद अनियमित) विभिन्न चैनलों के लिए को जन्म दे सकता है। प्रत्येक प्रारंभिक क्लस्टर में घटनाओं की औसत तरंग तो गणना की जाती है। यह क्लस्टर टेम्पलेट के रूप में जाना जाता है। सहायक चैनलों आयाम और हर चैनल पर टेम्पलेट waveforms के मानक विचलन के आधार पर प्रत्येक क्लस्टर को सौंपा है। प्रमुख घटक मूल्यों तो प्रत्येक क्लस्टर आधारित ओ के लिए गणना कर रहे हैंn चैनलों की सौंपा सेट पर waveforms। उपयोगकर्ता प्रमुख घटक आयामों की संख्या का उपयोग करने के लिए चुन सकते हैं: आमतौर पर 2 के लिए पर्याप्त है। प्रत्येक क्लस्टर तो समूहों का एक और सेट में विभाजित है, और इस तक कोई भी स्वचालित क्लस्टरिंग द्वारा आगे विभाजित किया जा सकता दोहराया है।
इस बिंदु, कहते हैं की एक प्रारंभिक सेट पर, एक 64-चैनल इलेक्ट्रोड से 64 समूहों, दो या तीन बार में, इकाइयों कि रिकॉर्डिंग में मौजूद था की संख्या के आधार पर विभाजित किया जा सकता है कि संख्या। लेकिन विभिन्न चैनलों के लिए एकल इकाइयों से घटनाओं की चर काम की वजह से, इस स्तर पर पाया समूहों की संख्या लगभग निश्चित रूप से बड़ा है यह होना चाहिए है। छंटाई के अगले चरण के समूहों के जोड़े की तुलना और इसी तरह के जोड़े के विलय या एक से दूसरे घटनाओं फिर नियत से oversplitting सही करने के लिए है। छंटाई के इस मंच के रूप में 'विलय और विभाजन' के लिए जाना जाता है।
विलय और बंटवारे
एन समूहों के लिए, वहाँ एन * (एन -1) / 2 जोड़े और इसलिए जोड़े की संख्या एन 2, जो अवांछनीय है के रूप में बढ़ता जाता है। हालांकि, कई जोड़े तुलना से बाहर रखा जा सकता है क्योंकि इस जोड़ी के दो सदस्यों को शारीरिक रूप से दूर कर रहे हैं। यह कुछ है कि अधिक रैखिक चैनलों की संख्या से संबंधित है के लिए निर्भरता कम कर देता है। इस शॉर्टकट के बावजूद, मर्ज और विभाजन चरण अभी भी काफी समय लग सकता है। यह निम्नलिखित तरीके से काम करता है। प्रत्येक क्लस्टर जोड़ी है कि तुलना करने के लिए किया जा (उन है कि शारीरिक रूप से करीब एक साथ कर रहे हैं, के रूप में चैनल को दिए सेटों में ओवरलैप द्वारा न्याय), विलय कर दिया अस्थायी रूप से किया जाता है, हालांकि दो सदस्य जाना जाता समूहों में spikes की पहचान रखते हुए। विलय जोड़ी के प्रमुख घटकों तो गणना कर रहे हैं। दो समूहों में अंक के बीच ओवरलैप के एक उपाय के पहले दो प्रमुख घटकों के वितरण के आधार पर गणना की है।
रास्ते ov erlap के उपाय गणना की कहीं और 11 और अधिक विस्तार में वर्णित है। इसका मूल्य शून्य यदि समूहों में सभी ओवरलैप नहीं है, यानी प्रत्येक बिंदु का निकटतम पड़ोसी ही क्लस्टर में है। यदि समूहों पूरी तरह से ओवरलैप करते हैं, यानी निकटतम पड़ोसी ही क्लस्टर में होने की संभावना अंक की एक वर्दी मिश्रण से भविष्यवाणी की है कि के रूप में ही है इसका मूल्य 1 के करीब है।
विभिन्न फैसलों जो खाते में ओवरलैप उपाय ले बना रहे हैं। ओवरलैप एक निश्चित मूल्य से अधिक है, तो समूहों विलय किया जा सकता है। ओवरलैप बहुत छोटा है, तो क्लस्टर जोड़ी अलग रूप में परिभाषित किया है और अकेला छोड़ दिया जा सकता है। मध्यवर्ती मूल्यों, क्लस्टर जोड़ी की अधूरी जुदाई का संकेत है, संकेत हो सकता है कि इस जोड़ी को विलय कर दिया जाना चाहिए और फिर पुन: विभाजन, वांछित परिणाम कम ओवरलैप के साथ समूहों की एक जोड़ी जा रही है। इन प्रक्रियाओं के एक मैन्युअल निर्देशित चरण में पहले एक स्वचालित चरण में और उसके बाद चलाए जा रहे हैं।
तम्बू "> स्वचालित चरण में, एक उच्च मूल्य के साथ ओवरलैप क्लस्टर जोड़े विलय कर रहे हैं;। तब क्लस्टर जोड़े के मध्यवर्ती के साथ कम ओवरलैप मूल्यों विलय कर दिया और फिर से विभाजित कर रहे हैं करने के लिए दूसरा, उपयोगकर्ता निर्देशित चरण में, उपयोगकर्ता के साथ प्रस्तुत किया है सब शेष अस्पष्ट क्लस्टर जोड़े (यानी एक परिभाषित मध्यवर्ती रेंज में ओवरलैप मूल्यों के साथ उन) अनुक्रम में और एक) जोड़ी विलय करने के लिए है कि क्या चयन करने के लिए कहा जाता है, ख) विलय और जोड़ी resplit, ग) जोड़ी की घोषणा करने के अलग-अलग हो सकता है (जो ओवरलैप उपाय के महत्व को पार कर जाएगी), या डी) के रूप में 'अस्पष्ट' का संकेत है कि इस जोड़ी के स्पाइक्स अच्छी तरह से हल किया जाना संभावना नहीं है। विभिन्न उपकरण उपलब्ध कराए गए हैं जोड़ी इन फैसलों के साथ मदद करने के लिए, ऑटो सहित के बीच संबंध को परिभाषित करने के लिए - और पार correlograms और कील ऊंचाई और पीसी मूल्यों का समय श्रृंखला भूखंडों।आदर्श रूप में, विलय और बंटवारे के चरणों के अंत में, हर क्लस्टर सभी दूसरों से अलग होना चाहिए,क्योंकि या तो यह कुछ है या अन्य समूहों के साथ आम में कोई चैनल नहीं है, क्योंकि या ओवरलैप सूचकांक एक निर्धारित मूल्य से कम है। यह मान उपयोगकर्ता के चयन है, लेकिन आम तौर पर 0.1 है। क्लस्टर (यूनिट) है कि इस परीक्षा में पास के रूप में 'स्थिर' परिभाषित कर रहे हैं, उन है कि नहीं (क्योंकि एक या अधिक अन्य समूहों के साथ ओवरलैप सीमा से अधिक है) 'अस्थिर' के रूप में परिभाषित कर रहे हैं। अभ्यास में, इकाइयों के महान बहुमत अंत छँटाई के अंत में के रूप में 'स्थिर' में परिभाषित किया जा रहा है, शेष के लिए या तो त्याग या संभावित बहु इकाई के रूप में व्यवहार किया जाना छोड़ रहा है।
सॉफ़्टवेयर आवश्यकताएं
SpikeSorter विंडोज 7 और विंडोज 10 के 64 बिट संस्करणों के साथ संगत है, और यह भी शराब एमुलेटर का उपयोग कर लिनक्स के तहत सफलतापूर्वक चलाया जा रहा है। डेटा फ़ाइलों को पूरी तरह से स्मृति (गति के लिए) इसलिए उपलब्ध रैम रिकॉर्डिंग के आकार के साथ पैमाने पर करने की जरूरत में लोड कर रहे हैं (कार्यक्रम खुद के लिए के बारे में 2 जीबी की अनुमति)। electrophysiologicअल डेटा फ़ाइलों को 130 GB से बड़े आकार में सफलतापूर्वक दोनों विंडोज और लिनक्स वातावरण में हल किया गया है। विकल्प मानक Windows मेनू, एक उपकरण पट्टी और संवाद के माध्यम से पहुँचा रहे हैं। मेनू पर आइटम के लेआउट, छँटाई में मोटे तौर पर कार्रवाई के आदेश मैचों डेटा इनपुट और हल डेटा के निर्यात की अनुमति के लिए सही पर 'निर्यात' मेनू के लिए छोड़ दिया पर 'फ़ाइल' मेनू के साथ शुरुआत की। टूलबार बटन शॉर्टकट सामान्यतः मेनू आइटम इस्तेमाल करने के लिए प्रदान करते हैं।
चैनल विन्यास फाइल
कई रिकॉर्डिंग डेटा स्वरूप चैनल स्थानों दुकान नहीं है। हालांकि, इन जानते हुए भी कील छँटाई के लिए आवश्यक है। चैनल भी अधिग्रहण सॉफ्टवेयर द्वारा विभिन्न तरीकों से गिने जा सकता है: SpikeSorter जरूरी है कि चैनल के अनुक्रम में गिने जा रहे हैं, इस प्रकार चैनल 1 के साथ शुरुआत है, एक सहायक इलेक्ट्रोड विन्यास फ़ाइल बनाया जा सकता है कि चैनल संख्या remap अनुक्रमिक नियम का पालन करने के लिए कर सकते हैं, और करने के लिए दुकान चैनल नियंत्रण रेखाations। चैनल विन्यास फाइल प्रत्येक चैनल के लिए पाठ की एक पंक्ति के साथ एक पाठ फ़ाइल है। फ़ाइल की पहली पंक्ति में लंबे समय के 16 अक्षरों तक एक पाठ नाम दुकानों, कि इलेक्ट्रोड को पहचानती है। बाद लाइनों में संख्या टैब, एक अल्पविराम, या रिक्त स्थान के द्वारा अलग किया जा सकता है। वहाँ (क्रम में) प्रदान करने के लिए प्रत्येक पंक्ति में चार नंबर हैं: फ़ाइल में चैनल संख्या, चैनल संख्या है जो यह मैप किया जा करने के लिए (यानी नंबर कि SpikeSorter द्वारा उपयोग किया जाएगा), और एक्स और वाई निर्देशांक है चैनल, माइक्रोन में। एक्स के समन्वय सामान्य रूप से इलेक्ट्रोड प्रविष्टि की दिशा को सीधा के रूप में ले जाया जाएगा और y के हिसाब से समन्वय स्थापित करने के ऊतकों में गहराई होगा। विन्यास फाइल रिकॉर्डिंग फ़ाइल के रूप में एक ही निर्देशिका में रखा जाना है। वहाँ यह कैसे नामित किया जा सकता में कुछ लचीलापन है। कार्यक्रम के पहले कच्चे डेटा फ़ाइल के रूप में, लेकिन एक .cfg विस्तार के साथ ही नाम है जो किसी फ़ाइल के लिए खोज करेंगे। तो उस फ़ाइल को मैंनहीं मिला है, यह फाइल 'electrode.cfg' के लिए खोज करेंगे। तो बदले में उस फ़ाइल को नहीं मिला है एक त्रुटि संदेश चैनल लेआउट जानकारी की कमी का संकेत करने के लिए उत्पन्न होता है।
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Protocol
1. कार्यक्रम सेटअप
- http://www.swindale.ecc.ubc.ca/SpikeSorter पर जाएं कार्यक्रम डाउनलोड करने के लिए। अपनी पसंद की निर्देशिका के लिए आपूर्ति निष्पादन योग्य फ़ाइल को कॉपी करें। साथ दिए गए दस्तावेज़ों पढ़ें।
नोट: कोई औपचारिक स्थापना या संकलन आवश्यक है। - किसी भी फाइल को हल किया जाना खोलने से पहले, यह सुनिश्चित है कि वहाँ रिकॉर्डिंग की पूरी अवधि को रोकने के लिए पर्याप्त मुक्त रैम है। यह भी सुनिश्चित करें एक वैध चैनल विन्यास फाइल बनाने, दस्तावेज में वर्णित के रूप में, डेटा फ़ाइल के रूप में एक ही निर्देशिका में मौजूद है।
- कार्यक्रम शुरू करें, तो 'फ़ाइल - ओपन' के लिए जाना है और जिसके परिणामस्वरूप खुली फ़ाइल संवाद के नीचे सही पर ड्रॉप-डाउन सूची से रिकॉर्डिंग फ़ाइल स्वरूप का चयन करें। फ़ाइल खोले जाने के लिए का चयन करें, तो क्लिक करें 'ओपन'।
- एक बार पढ़ने के पूरा हो गया है, वोल्टेज रिकॉर्डिंग प्रदर्शन का निरीक्षण किया। प्रदर्शन पर डबल क्लिक करें (या 'देखें - वोल्टेज रिकार्ड') नियंत्रण है कि किसी भी बराबर की अनुमति देने के साथ एक संवाद को लाने के लिएरिकॉर्डिंग तरंग की टी देखा जाना चाहिए।
नोट: अन्य प्रदर्शन खिड़कियों पर डबल क्लिक अक्सर जुड़े संवादों लाएगा। - बाद संवाद से बाहर निकल गया है, प्रदर्शन के ऊपरी बाएँ कोने में विशेष रूप से वोल्टेज मूल्यों को प्रदर्शित करने के waveforms पर माउस होवर करें। प्रदर्शन के किसी भी हिस्से पर ज़ूम करने के लिए स्क्रॉल व्हील का प्रयोग करें। विंडो सामग्री खींचें करने के लिए बाएँ माउस बटन दबाए रखें।
नोट: इस प्रदर्शन अक्सर नव पता लगाया घटनाओं के अलावा प्रतिबिंबित करने के लिए, या इंगित करने के लिए, रंग और / या संख्याओं, क्लस्टरिंग के बाद उनके क्लस्टर कार्य के माध्यम से अद्यतन किया जाता है। - अगर रिकॉर्डिंग अनफ़िल्टर्ड है और स्थानीय क्षेत्र की क्षमता शामिल है, यह 'पूर्व प्रक्रिया - रूपांतरण / फिल्टर' के लिए जा रहा द्वारा हटाने के लिए (या उपकरण पट्टी में फिल्टर आइकन पर क्लिक करें)। चुनें 'उच्च पास Butterworth फिल्टर', तो एक उपयुक्त कट ऑफ आवृत्ति और डंडे की संख्या, और फिर प्रेस 'क्या यह!'। एक बार छानने समाप्त हो गया है, वोल्टेज की लहर में नई तरंग का निरीक्षणफार्म खिड़की।
नोट: छनन फूरियर डोमेन में किया जाता है, गैर कारण है, और waveforms के चरण विरूपण परिचय नहीं है। एक लंबे समय रिकॉर्डिंग के लिए, छानने के कई मिनट लग सकते हैं। - अगले, चैनलों कि दोषपूर्ण हो और नकाबपोश होना पड़ सकता है के लिए जाँच करें। करने के लिए जाओ 'पूर्व की प्रक्रिया - चैनल की जांच' (या चैनल की जांच आइकन पर क्लिक करें) और फिर ग्राफ प्रतीत होता है कि निरीक्षण किया। ग्राफ उनके स्थानिक जुदाई 5 के एक समारोह के रूप में चैनल जोड़े के बीच संकेत संबंध में परिवर्तन को दर्शाता है। चैनल कि इस संबंध उल्लंघन ठीक ढंग से काम नहीं किया जा सकता है। किसी भी तरह के outliers देखने के लिए, 'एक चैनल शुद्ध विचलन' पर क्लिक करें।
- एक दूरस्थ चैनल मुखौटा करने के लिए या तो चैनल संख्या का चयन करें, या समस्या सूची से चयन करें। जब इस संवाद से बाहर निकल गया है, मुखौटा मूल्यों को बचाने के लिए प्रॉम्प्ट पर 'हाँ' पर क्लिक करें।
नोट: इस फाइल रिकॉर्डिंग डेटा फ़ाइल के रूप में, लेकिन विस्तार .msk के साथ एक ही नाम होगा। यह automaticall पढ़ा जाएगाY जब भी एक ही डेटा फ़ाइल खोला है।
- एक दूरस्थ चैनल मुखौटा करने के लिए या तो चैनल संख्या का चयन करें, या समस्या सूची से चयन करें। जब इस संवाद से बाहर निकल गया है, मुखौटा मूल्यों को बचाने के लिए प्रॉम्प्ट पर 'हाँ' पर क्लिक करें।
2. घटना का पता लगाने
- 'पूर्व की प्रक्रिया - घटना का पता लगाने' के लिए जाना घटना का पता लगाने संवाद (चित्रा 1) को लाने के लिए। यह संवाद भी उनके शोर के स्तर के आधार पर मास्किंग चैनलों का विकल्प (इन हालांकि अक्सर पिछले परीक्षणों से पता लगाया जाएगा) प्रदान करता है। उदाहरण के लिए, एक चैनल है कि जानबूझकर आधारित कर दिया गया है एक बहुत कम शोर स्तर हो सकता है।
- विशेष चैनलों पर शोर का स्तर निरीक्षण करने के लिए ऊपर सही पर स्लाइडर का उपयोग करें। वोल्टेज प्रदर्शन की सावधानी से निरीक्षण भी चुप या असामान्य रूप से शोर चैनलों नकाबपोश किए जाने की जरूरत है कि प्रकट हो सकता है।
- घटना का पता लगाने के लिए एक thresholding विधि चुनें। विकल्पों के बारे में अधिक जानकारी के लिए समूह बॉक्स में मदद बटन का प्रयोग करें। 'चर' 4.5X की एक सीमा के साथ thresholding, - 6X शोर 7 की सिफारिश की है। शीर्ष पर नियंत्रण का प्रयोग करें चयन करने के लिए शोर का स्तर वीं के लिए गणना की है कि कैसे छोड़ाउद्देश्य है।
- ड्रॉप-डाउन सूची से पता लगाने की विधि चुनें। 'गतिशील multiphasic फिल्टर' अनुशंसित विधि है। यह एक अस्थायी खिड़की के विनिर्देश की आवश्यकता है। खिड़की मोटे तौर पर एक ठेठ कील की आधी चौड़ाई होना तय। बहुत ही संकीर्ण मूल्यों संकरा spikes के लिए पूर्वाग्रह का पता लगाने जाएगा, हालांकि प्रभाव बड़ी नहीं है। सीमा 0.15 में मान - 0.5 एमएस 12 सिफारिश कर रहे हैं।
नोट: मूल्यों को प्रदर्शित नमूना अंतराल (नमूना आवृत्ति के पारस्परिक) के पूर्णांक गुणकों में हैं। - संरेखण विधि का चयन करें। अगर कई spikes एक से अधिक सकारात्मक चोटी है विकल्प सबसे अच्छा है कि एक एकल, spikes है कि हल किया जा रहा है, जैसे, एक 'सकारात्मक शिखर' के अस्थायी स्थानीय सुविधा पहचानती चुनें एक गरीब विकल्प हो सकता है। कई रिकॉर्डिंग के लिए, एक 'नकारात्मक गर्त' सबसे अच्छा विकल्प होगा। अन्य विकल्प आम तौर पर उनके मूलभूत मूल्यों पर छोड़ा जा सकता है। स्टार्ट दबाएँ'।
नोट: घटना का पता लगाने कर सकते हैं टाकई सेकंड से कई मिनट, रिकॉर्डिंग की लंबाई और चैनलों की संख्या के आधार पर करने के लिए Ke। - प्रेस 'हो गया' संवाद बाहर निकलने के लिए। घटनाओं, ग्रे में दिखाया गया है, वोल्टेज तरंग विंडो में निरीक्षण किया। जाँच करें कि संकेत है कि घटनाओं की तरह लग पाया गया है।
- यदि नहीं, तो एक कम का पता लगाने सीमा के साथ फिर से चल घटना का पता लगाने पर विचार करें। हालांकि सावधान रहना है कि बहुत कम आयाम spikes सुलझाने के लिए मुश्किल हो सकता है और उनमें से बड़ी संख्या में बड़ा आयाम spikes के छँटाई में बाधा हो सकती है। यह भी स्पष्ट डुप्लिकेट या आसपास के spikes को हल करने और तदनुसार स्थानिक-सामयिक तालाबंदी खिड़की मापदंडों को समायोजित करने के लिए एक विफलता के लिए जाँच करें।
नोट: इस स्तर पर घटनाओं घटना और एक चैनल संख्या के अपने समय से पहचाने जाते हैं। आम तौर पर इस चैनल है जिस पर कील की चोटी से शिखर आयाम सबसे बड़ा है। घटनाओं के शुरू में unclustered कर रहे हैं, इसलिए प्रत्येक शून्य के एक समूह काम किया है।
- यदि नहीं, तो एक कम का पता लगाने सीमा के साथ फिर से चल घटना का पता लगाने पर विचार करें। हालांकि सावधान रहना है कि बहुत कम आयाम spikes सुलझाने के लिए मुश्किल हो सकता है और उनमें से बड़ी संख्या में बड़ा आयाम spikes के छँटाई में बाधा हो सकती है। यह भी स्पष्ट डुप्लिकेट या आसपास के spikes को हल करने और तदनुसार स्थानिक-सामयिक तालाबंदी खिड़की मापदंडों को समायोजित करने के लिए एक विफलता के लिए जाँच करें।
3. छंटनी ध्यान दें: अगले कदम दिनचर्या सामान्य रूप से छँटाई से पहले नहीं किया जाता है, लेकिन यह जब पहली बार के लिए छंटाई, या जब अपरिचित डेटा का सामना यह करने के लिए बहुत उपयोगी है।
- करने के लिए जाओ 'क्रमबद्ध करें - समूहों के लिए चैनलों कन्वर्ट'। यह प्रत्येक बेपर्दा इलेक्ट्रोड चैनल के लिए एक एकल क्लस्टर बनाता है, यह सोचते हैं कि हर चैनल उसे सौंपे कुछ घटनाओं की है। करने के लिए जा रहा द्वारा इन समूहों की जांच करने 'की समीक्षा - देखें साफ और स्प्लिट समूहों'। यह एक और संवाद (चित्रा 2) को लाता है। क्लस्टर देखी जा करने के लिए चयन करने के लिए स्पिन नियंत्रण (ऊपर बाएं) का प्रयोग करें।
ध्यान दें: ठोस नीला (सियान) लाइन क्लस्टर में सभी waveforms का औसत है और क्या इस प्रकार में क्लस्टर टेम्पलेट के रूप में जाना जाता है। क्लस्टर में घटनाओं की प्रमुख घटकों (पीसी) वितरण नीचे विंडो में दिखाए जाते हैं। ये अक्सर दो या अधिक subclusters की उपस्थिति प्रकट होगा। - प्रत्येक घटना के समय बदलने के लिए 'फिर से संगठित करना' बटन दबाएँ(प्रदर्शन में waveforms के छोटे बग़ल में पाली में जिसके परिणामस्वरूप) के रूप में तो बेहतर टेम्पलेट के आकार के लिए यह मैच, ऐसा अक्सर subclusters अधिक कॉम्पैक्ट और विशिष्ट बनाता है, और कभी कभी स्पष्ट संख्या (चित्रा 3) कम कर देता है।
- एक क्लस्टर दो या अधिक विशिष्ट subclusters और प्रेस 'Autosplit' है कि चयन करें। subclusters पीसी प्रदर्शन में पहचाने जाते हैं, तो वे रंग का हो जाएगा। एक अभ्यास के रूप में, छोटे 'विभाजित' बटनों में से एक का प्रयोग कर एक नया क्लस्टर बना सकते हैं और यह जांच करने के लिए। छंटनी मैन्युअल इस तरह से जारी रख सकता है, लेकिन इसके बजाय वापस जाने के लिए और तेजी से autosort प्रक्रिया का उपयोग करें।
- करने के लिए जाओ 'क्रमबद्ध करें - Autosort' (या उपकरण पट्टी पर autosort बटन दबाएँ) स्वत: छँटाई शुरू करने के लिए। जिसके परिणामस्वरूप संवाद 4 चित्र में दिखाया गया है। यह विकल्प की एक किस्म प्रस्तुत करता है।
- 'घटना का पता लगाने के लिए छोड़' विकल्प है, तो घटना का पता लगाने के पहले ही किया जा चुका है जाँच छोड़ दें। यह जाँच नहीं की है, तो घटना का पता लगाने चलाया जाएगापैरामीटर मूल्यों और घटना का पता लगाने के संवाद से विरासत में मिली विकल्पों का उपयोग कर। चूंकि घटना का पता लगाने के पहले से ही किया गया है, उस विकल्प की जाँच छोड़ दें।
- 'क्लस्टरिंग' नीचे पैनल में, एक अस्थायी खिड़की पर्याप्त बड़ी कील तरंग पूर्ववर्ती और संरेखण बिंदु निम्नलिखित की सम्पूर्णता को रोकने के लिए है, लेकिन कोई अधिक का चयन करें। कील तरंग, जैसे लंबे चर afterpotentials, के क्षेत्रों को ब्लॉक करने के लिए इस विंडो का प्रयोग करें अगर वे दिखाई देते हैं (करने के लिए थोड़ा योगदान दे या) के साथ हस्तक्षेप किए जाने की छँटाई। आमतौर पर सीमा में मूल्यों ± 0.5 एमएस उपयुक्त हैं। अन्य अस्थायी खिड़कियों की तरह, खिड़की इसलिए लौकिक मूल्यों है कि दिखाई नमूना अंतराल के गुणकों हैं, नमूना अंक का अभिन्न संख्या है।
- अगले, क्लस्टरिंग के दौरान इस्तेमाल किया जा करने के लिए एक फिर से संगठित करना विकल्प चुनें। इस टेम्पलेट तरंग का इस्तेमाल करते हैं और जहां कसौटी है घटना का पता लगाने के प्रारंभिक मामले में अधिक से अधिक मजबूती के साथ काम करता रहेगा अपेक्षाकृत शोर व्यक्तिगत एस के लिए लागू किया जाएगापाइक waveforms। अनुशंसित विकल्प 'शिखर भारित दांत' लेकिन 'नकारात्मक गर्त' बेहतर हो सकता है कि अगर कील waveforms के अनुरूप एक सुविधा है।
- एक न्यूनतम क्लस्टर आकार का चयन करें। spikes के उस नंबर से भी कम समय के साथ समूहों को हटा दिया जाएगा, छंटाई के दौरान छोटे, संभवत: नकली, समूहों की बड़ी संख्या के संचय को रोकने।
- पीसी अंतरिक्ष में आयाम है कि क्लस्टरिंग के लिए इस्तेमाल किया जाएगा की संख्या पर फैसला। दो आम तौर पर पर्याप्त लेकिन थोड़ा बेहतर परिणाम, 3 के साथ प्राप्त किया जा सकता है एक लंबी छँटाई समय के साथ यद्यपि है।
- उनके डिफ़ॉल्ट सेटिंग्स पर अन्य विकल्प छोड़ दें। मदद बटन का प्रयोग विभिन्न विकल्पों में से अधिक विस्तृत व्याख्या पाने के लिए।
- प्रेस 'आरंभ' autosort शुरू करने के लिए। चैनल आधारित समूहों का गठन कर रहे हैं के रूप में 3.1 कदम में सचित्र। ये अब बारी में कार्रवाई कर रहे हैं, अलग-अलग उप समूहों, एक समय में एक बंद बंटवारे से नए समूहों के गठन। हर बार एक नया क्लस्टर है सपाबंद जलाया, पीसी मूल्यों पुनर्गणना और प्रदर्शित कर रहे हैं। यह जारी रहता है जब तक कोई व्यक्ति क्लस्टर आगे विभाजित किया जा सकता।
- प्रदर्शन, जहां subcluster कि माता पिता क्लस्टर से अलग किया जाएगा, लाल रंग में दिखाया गया है में संकेतों का पालन करें।
नोट: कभी कभी अंतिम क्लस्टर uncolored outliers कि एक विशिष्ट subcluster फार्म नहीं है साथ लाल है। ये outliers आम तौर पर हटा दिया जाएगा। इस प्रक्रिया के दौरान समूहों की संख्या धीरे-धीरे बढ़ जाती है। जब यह समाप्त हो गया है, क्लस्टर ओवरलैप सूचकांकों हर पात्र क्लस्टर जोड़ी के लिए गणना कर रहे हैं। जोड़े हैं कि बड़े ओवरलैप मूल्यों स्वचालित रूप से विलय कर रहे हैं, जबकि जोड़ी है कि मध्यवर्ती ओवरलैप मूल्यों (डिफ़ॉल्ट रेंज पर 0.5 करने के लिए 0.1 है) resplit विलय कर रहे हैं और उसके बाद। मध्यवर्ती मूल्यों दो अलग-अलग समूहों देखते हैं लेकिन कुछ बिंदुओं misassigned कर रहे हैं कि सुझाव देते हैं। इस चरण के दौरान समूहों की संख्या आम तौर पर कम हो जाती है और स्थिर समूहों की संख्या बढ़ जाती है।
4. अनुकूलन
- अगर (अगले चरण के दौरान या संभवतः) पहली बार के लिए कार्यक्रम का उपयोग कर, खिड़की के आकार और स्थिति को अनुकूलित। करने के लिए 'फ़ाइल-प्राथमिकताएं' जाओ। पुल से नीचे सूची से खिड़की प्रकार का चयन और स्क्रीन सूट करने के लिए आकार का समायोजन करके विभिन्न खिड़कियों के लिए आकार का चयन करें। संवाद से बाहर निकलें और Windows स्थिति स्क्रीन का सबसे अच्छा उपयोग करने के लिए।
- संवाद से, स्केलिंग मूल्यों है कि सबसे अच्छा लेआउट और रिकॉर्डिंग में इलेक्ट्रोड पर चैनलों और spikes की रिक्ति सूट चुनें। वहाँ एक autoscaling विकल्प है लेकिन यह हमेशा सर्वश्रेष्ठ मूल्यों का चयन नहीं कर सकता है। इसे बंद करता है, तो यह नहीं है।
- स्टिकी पैरामीटर विकल्प की जाँच करें: यदि विकल्प चुना जाता है, पैरामीटर मान छँटाई (जैसे के रूप में घटना का पता लगाने में प्रयुक्त) में परिवर्तनों को सहेजा और अगली बार जब कार्यक्रम शुरू होता है विरासत में मिला दिया जाएगा। यह उपयोगी हो सकता है लेकिन यह भी जरूरी है कि पैरामीटर मूल्यों की जाँच की जानी सुनिश्चित करने के लिए वे लापरवाही के रूप में विभिन्न विकल्पों का पता लगाया जाता है नहीं बदला गया है या एक परिणाम के रूप मेंके विभिन्न काम फाइलों में पढ़ रहे हैं। उप क्लस्टर रंग बदलने के लिए विकल्प भी उपलब्ध हैं।
- व्यायाम देखभाल प्रोसेसर धागे की संख्या बदल रहा है। इष्टतम संख्या आमतौर पर 1 शारीरिक (आभासी नहीं) सीपीयू कोर की संख्या से कम है। धागे की संख्या बढ़ाने के प्रसंस्करण में तेजी लाने के नहीं हो सकता है और यहां तक कि एक गंभीर मंदी में परिणाम कर सकते हैं।
5. विलय और विभाजन
- autosort पूर्ण होने के बाद प्रेस 'अगला' मैन्युअल निर्देशित मर्ज और विभाजन चरण के लिए जाने के लिए। जिसके परिणामस्वरूप संवाद शो, निचले बाएँ कोने में, शेष अस्पष्ट क्लस्टर जोड़े की जरूरत है कि संख्या के रूप में अच्छी तरह से स्थिर समूहों की संख्या के रूप में की जांच की जा सके।
- प्रेस 'शुरू'। एक और संवाद को एक साथ प्रकट होता है के साथ जांच की जा करने के लिए जोड़े की पहली।
- , चुनें जोड़ी विलय करने के लिए है कि क्या है, यह resplit (एक कम ओवरलैप मूल्य में जिसके परिणामस्वरूप), 'अलग' के रूप में इस जोड़ी को लेबल करने के लिए, जिसका अर्थ है कि ओवरलैप सूचकांक के मूल्य नजरअंदाज कर दिया जाएगा ओआर 'अस्पष्ट' के रूप में इस जोड़ी को लेबल करने के लिए, जिसका अर्थ है कि यह अनिश्चित है कि क्या spikes ही है या अलग-अलग इकाइयों से कर रहे हैं माना जाता है।
- चेक बॉक्स पर क्लिक करें कील मानकों (पीक से पीक (पीपी) के प्रमुख घटकों की ऊंचाई, या पहले (PC1) या दूसरा (PC2)) बनाम समय, और / या ऑटो और पार का ग्राफ प्रदर्शित करने के लिए सह-संबंध histograms।
नोट: बनाम समय पीपी ऊंचाई के प्रदर्शन को अक्सर निर्णय लेने से दो समूहों विलय करने के लिए है कि क्या में बहुत उपयोगी है। एक इकाई में spikes की ऊंचाइयों ही समय है कि एक इकाई गोलीबारी बंद हो जाता है और अन्य इसे और अधिक से अधिक नहीं होने की संभावना है कि वे एक ही इकाई हैं और विलय कर दिया जाना चाहिए शुरू होता है पर फिर से उन लोगों में आसानी से मिश्रण हैं। क्रॉस-correlograms दो समूहों में कील समय के बीच एक मजबूत संबंध लौकिक प्रकट हो सकता है। पार correlogram एक बहुत ही कम समय के अंतराल पर एक मजबूत, विषम चोटी है (5 के आसपास जैसे - 10 एमएस) और दूसरी कील एफआइआर की तुलना में छोटा होता है, खासकर अगरटी, दो इकाइयों सबसे अधिक संभावना एक एकल इकाई है जो कील जोड़े जिसमें दूसरी ना + चैनल अनुकूलन की वजह से पहले की तुलना में छोटा होता है फायरिंग कर रहे हैं। - मामलों में जहां विलय करने के लिए निर्णय करना आसान नहीं है, 'अस्पष्ट' के रूप में जोड़ी लेबल और बाद के विश्लेषण में तदनुसार समूहों का इलाज।
- चेक बॉक्स पर क्लिक करें कील मानकों (पीक से पीक (पीपी) के प्रमुख घटकों की ऊंचाई, या पहले (PC1) या दूसरा (PC2)) बनाम समय, और / या ऑटो और पार का ग्राफ प्रदर्शित करने के लिए सह-संबंध histograms।
- मर्ज और विभाजन विकल्प स्पष्ट रूप से वियोज्य समूहों को खोजने के लिए कहा जाए, संवाद में स्लाइडर का उपयोग असमर्थ है तो मैन्युअल, एक क्लस्टरिंग पैरामीटर (एक स्थानिक बैंडविड्थ, सिग्मा) भिन्न करने के लिए एक साथ विलय बटन के सेट के साथ, एक विभाजन है कि संतोषजनक लग रहा है पता लगाने के लिए । दो समूहों के मूल राज्य के लिए वापस जाने के लिए 'रिवर्ट' बटन का प्रयोग करें। प्रेस 'के रूप में दिखाया विभाजन' खत्म करने के लिए। नोट दो से अधिक समूहों को इस प्रक्रिया द्वारा उत्पादित किया जा सकता है।
- इस प्रक्रिया के साथ जारी रखें जब तक वहाँ कोई और अधिक जोड़े का निरीक्षण कर रहे हैं। समूहों के महान बहुमत के रूप में अब 'स्थिर' सूचीबद्ध किया जाना चाहिए।
- बहुत कुछ क्लस्टर जोड़े हैकम ओवरलैप सूचकांक, ताकि वे निर्देशित मर्ज द्वारा नजरअंदाज कर दिया जाता है (लेकिन अभी भी उन्हें विलय के लिए सबूत है), के लिए जाना 'की समीक्षा - तुलना क्लस्टर जोड़े के' मेनू विकल्प (या उपकरण पट्टी में जुड़े आइकन पर क्लिक करें) और खुले संवाद चित्रा 5 में दिखाया गया है। तुलना के लिए समूहों के किसी भी जोड़ी का चयन करने के लिए संवाद के शीर्ष पर स्पिन नियंत्रण का प्रयोग करें।
नोट: निर्देशित मर्ज और विभाजन के साथ के रूप में, जोड़े के हल सूची में डाल रहे हैं, लेकिन इस मामले में तुलनात्मक मीट्रिक क्लस्टर ओवरलैप सूचकांक करने के लिए अतिरिक्त उपलब्ध हैं।- पुल से नीचे की सूची से 'सामान्यीकृत डॉट उत्पाद' विकल्प का चयन करें। इस टेम्पलेट मूल्यों के बीच के संबंध की गणना करता है। यह गुणक स्केलिंग रूपों के प्रति असंवेदनशील है और अच्छी तरह से क्लस्टर जोड़े कि शिखर से पीक ऊंचाई परिवर्तनशीलता के एक artefactual परिणाम हैं बाहर उठा लिए अनुकूल है।
- सबसे समान जोड़ी प्रदर्शित करने के लिए संवाद के बीच में 'सबसे समान' बटन दबाएँ। horizonta का प्रयोग करेंबटन के नीचे एल स्पिन नियंत्रण सूची के माध्यम से आगे या पीछे जाने के लिए। सिर्फ उपयोगकर्ता निर्देशित मर्ज और विभाजन के लिए के रूप में, विलय निर्णय करने के लिए सह-संबंध प्रदर्शन और पीपी ऊंचाई बनाम समय प्रदर्शन का प्रयोग करें। ध्यान दें कि सूची प्रत्येक विलय ऑपरेशन के बाद पुन: परिकलित किया जाता है। इस तुलना मंच ओपन एंडेड है, और यह उपयोगकर्ता के लिए विलीन हो जाती है के पक्ष में सबूत के लिए खोज करने के लिए कैसे बड़े पैमाने पर फैसला करना है।
6. समीक्षा - पोस्ट प्रसंस्करण
- अब जाएँ 'की समीक्षा - बाद के प्रसंस्करण' (या उचित उपकरण पट्टी आइकन पर क्लिक करें)। यह संवाद (चित्रा 6) विकल्पों को जोड़ना या समूहों से घटनाओं, साथ ही संकेत करने वाली शोर अनुपात (SNRs) है कि एक सीमा से नीचे गिर के साथ पूरे समूहों को हटाने के विकल्प को दूर करने के लिए प्रदान करता है। डुप्लीकेट घटनाओं (एक क्लस्टर में एक ही समय में होने वाली घटनाओं) संरेखण त्रुटियों से छंटाई के दौरान बनाया जा सकता है। घटनाओं है कि एक लंबा रास्ता तय करना उनके मूल स्थान से हटा रहे हैं sometim कर सकते हैंतों दूसरी जगह जा; वे भी जब स्थानांतरण काम नहीं करता हटाया जा सकता है।
- समूहों कि टेम्पलेट के लिए एक बुरा मैच रहे हैं घटनाओं से दूर करने के लिए संरेखण सफाई बटन का प्रयोग करें। रिवर्स करने के लिए 'Recluster' बटन का प्रयोग करें, यानी unclustered घटनाओं है कि एक विशेष टेम्पलेट के लिए एक अच्छा मैच रहे फिरसेआबंटितकरें। reclaimed घटनाओं प्रत्येक माता पिता क्लस्टर का एक subcluster के रूप में चिह्नित कर रहे हैं और 'देखें, स्वच्छ और विभाजन समूहों' संवाद का उपयोग कर निरीक्षण किया जा सकता है। इन घटनाओं के क्लस्टर में रहेगा (और इस तरह के रूप में निर्यात किया जा सकता है) जब तक वे नष्ट हो जाती हैं (पहले subcluster के लिए छोटे 'को हटाना' बटन का उपयोग करें)। बाद के प्रसंस्करण के संवाद के लिए रिटर्निंग, यह अगले 'को हटाना' बटन और स्पिन नियंत्रण का प्रयोग कर एक SNR से चयनित सीमा से कम के साथ समूहों को नष्ट करने के लिए।
- हालांकि क्लस्टर संख्या n, जहाँ n समूहों की कुल संख्या, छंटाई के अंत में समूहों की वास्तविक नंबरिंग है 1 से लगातार जाने के लिए एक के करीब हैrbitrary। इलेक्ट्रोड पर जैसे ऊर्ध्वाधर स्थिति, या चैनल नंबर एक चुना कसौटी के अनुसार समूहों फिर से अंकित करने के लिए, 'क्रमबद्ध करें' बटन का प्रयोग करें। ध्यान दें कि, डुप्लिकेट घटनाओं का विलोपन के अपवाद के साथ, वर्तमान में कोई उद्देश्य सबूत दूसरों की तुलना में बेहतर होने के रूप में इस संवाद में विशेष विकल्प का समर्थन है।
- एक तरह से मैन्युअल प्रक्रिया के दौरान किसी भी स्तर पर यह जो वर्तमान पैरामीटर मान, छँटाई विकल्प, घटना के समय, क्लस्टर गुण और संदेश रिकॉर्ड में शामिल है एक फ़ाइल को बचाने के लिए संभव है। करने के लिए जा रहा द्वारा इस फ़ाइल बनाएँ 'फ़ाइल - काम फ़ाइल सहेजें। फ़ाइल एक ऐसा नाम है जो स्पष्ट रूप से डेटा फ़ाइल और प्रेस 'बचाओ' के उस से संबंधित है दीजिए। पहले मूल रिकॉर्डिंग फ़ाइल, उच्च पास छानने के बाद (यदि शुरू में किया) खोलने के द्वारा एक बाद में समय पर छंटाई फिर से शुरू। फिर, बचाया काम फ़ाइल खोलें। कार्यक्रम तो एक राज्य भी इसे जब काम फ़ाइल को बचाया गया था में था करने के लिए समान में होगा। काम फाइल भी एक फिर से हैकैसे छँटाई किया गया था की रस्सी - मापदंडों का इस्तेमाल किया और छँटाई के दौरान जारी किए गए संदेशों की।
- अंत में, क्लस्टर घटनाओं निर्यात। करने के लिए जाओ 'निर्यात - हल से कील फ़ाइलें' (या प्रासंगिक बटन उपकरण पट्टी पर क्लिक करें)। '.csv फ़ाइल' लटकती सूची से (अल्पविराम से अलग चर) का चयन करें फिर 'के रूप में सहेजें' पर क्लिक करें। फ़ाइल है कि हल इकाइयों के लिए निर्यात सीएसवी डेटा शामिल होंगे लिए एक नाम चुनें।
नोट: इस पाठ फ़ाइल, क्रम में, घटना के समय (निकटतम 10 μs के लिए सेकंड में) युक्त प्रत्येक घटना के लिए एक भी लाइन होगा, (1 ऊपर की तरफ से) क्लस्टर नंबर और उस सौंपा गया था चैनल की संख्या घटना के लिए। ध्यान दें कि सौंपा चैनल एक क्लस्टर में सभी घटनाओं के लिए ही नहीं हो सकता है, तो घटनाओं को लगातार एक खास चैनल पर बड़े नहीं थे।
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Representative Results
एक ठेठ हल रिकॉर्डिंग के लिए - 7 चित्रा प्रदर्शन ( 'हल से waveforms देखें' करने के लिए जा रहा द्वारा प्राप्त) से पता चलता है। डिफ़ॉल्ट दृश्य विकल्प सिर्फ प्रत्येक क्लस्टर के लिए केन्द्र चैनल पर waveforms दिखाने के लिए है। एक आम अनुभव है कि एक ही चैनल पर एक क्लस्टर जोड़ी के लिए waveforms समान लग रही है, लेकिन जब 'की तुलना जोड़े के' संवाद पीसी प्रक्षेपण में अलग-अलग समूहों वहाँ दो समूहों की जांच करने के लिए प्रयोग किया जाता है, सबसे अधिक बार आसन्न चैनलों पर तरंग मतभेद से उत्पन्न होता है । यह आंकड़ा 7 में चैनल 62 पर waveforms की, सच है, उदाहरण के लिए।
जैसा कि ऊपर उल्लेख किया, यह क्लस्टर जोड़े जहां विलय फैसलों आयाम समय भूखंडों पर और पार correlograms पर आधारित होना चाहिए खोजने के लिए असामान्य नहीं है। 8 चित्रा एक विलय पार correlogram पर भाग में स्थित निर्णय का एक उदाहरण दिखाता है। एक बहुत मजबूत, asymmetriकम समय के अंतराल (चित्रा 8B) इकाइयों और इसी तरह की गोलीबारी पैटर्न (चित्रा 8E) के शिखर से पीक ऊंचाई में एक अंतर के साथ मिलकर सी पार से संबंध दृढ़ता से पता चलता है कि spikes ही न्यूरॉन से आते हैं। 9 चित्रा एक मामले में जहां विलय के लिए सबूत की इसी तरह की कमी दिखाता है। इधर, पार correlogram कमजोर और जोरदार विषम नहीं है। इसके अलावा, दो समूहों के autocorrelograms का आकार अलग-अलग (चित्रा 9 ए) कर रहे हैं। यकीनन, दो इकाइयों के प्रमुख घटकों (चित्रा 9) के वितरण में अतिरिक्त स्पष्ट अंतर की वजह से विलय नहीं किया जाना चाहिए। चित्रा 10 एक मामले में जहां दो इकाइयों के पीपी ऊंचाइयों एक ही समय उनमें से एक बंद हो जाता है कि गोलीबारी और अन्य को फिर से एक साथ मिश्रण से पता चलता है। इस मामले में विलय करने का निर्णय सही लगता है, हालांकि एक संभावना है कि इकाइयों में उनके फायरिंग पैटर्न के समन्वय से इंकार नहीं कर सकतेजटिल तरीके और कहा कि हाइट्स में समानता आकस्मिक है।
इन उदाहरणों कैसे विलय निर्णय करने के लिए पर फर्म मार्गदर्शन देने में कठिनाई वर्णन। यह कील छँटाई के समग्र गुणवत्ता और पैरामीटर परिवर्तन के प्रभावों का आकलन करने के लिए उद्देश्य के उपायों की सामान्य कमी से बढ़ रहा है। यह जमीनी सच्चाई के बारे में जानकारी है, जो, कील छँटाई के लिए, हर न्यूरॉन है कि एक रिकॉर्डिंग इलेक्ट्रोड के लिए काफी करीब detectable कोशिकी संकेतों को जन्म दे रहा था से intracellular रिकॉर्डिंग (या उनके समकक्ष) के शामिल होगा की कमी की वजह से है। इस सीमा के बावजूद, वहाँ जमीनी सच्चाई डेटा के लिए सरोगेट मदर रहे हैं और यह है कि रणनीति है कि किराए के आंकड़ों पर बेहतर प्रदर्शन में यह परिणाम छँटाई में एक परिवर्तन के वास्तविक आंकड़ों के साथ बेहतर प्रदर्शन का नेतृत्व करेंगे लगता है अनुचित नहीं है। किराए की कोख वास्तविक विदेश मंत्रालय रिकॉर्डिंग डेटा जिसमें spikes, रिकॉर्डिंग से लिया, recordi में वापस जोड़ रहे हैं शामिलविभिन्न चैनलों, जहां वे मूल spikes के साथ भ्रमित नहीं किया जा सकता पर ज्ञात समय पर एनजी। इस तरह के एक परीक्षण जी Buzsáki और टी हैरिस द्वारा आयोजित एक कील छँटाई प्रतियोगिता का आधार बनाया 2013 सरोगेट डेटा चेतक या स्वतंत्र रूप से घूम रहा है चूहों के हिप्पोकैम्पस में की गई रिकॉर्डिंग से उत्पन्न किया गया में Janelia फार्म में आयोजित (ए Peyrache, ए Berenyi और जी Buzsáki, अप्रकाशित डेटा)। स्पाइक संकेत हैं, जो के लिए 'जमीनी सच्चाई' वहाँ एक इकाई एक टांग पर दर्ज spikes से ले रही है और एक और टांग इस प्रकार सुनिश्चित करना है कि पृष्ठभूमि गतिविधि और मस्तिष्क राज्यों के साथ कि कील ट्रेन के संबंध संरक्षित किया गया था पर रिकॉर्डिंग करने के लिए उन्हें जोड़ने के द्वारा उत्पन्न किया गया। रिकॉर्डिंग जोड़ा जमीनी सच्चाई कील ट्रेनों के अलावा वास्तविक spiking गतिविधि निहित। जबकि इसी झूठी नकारात्मक दर 2.1% और 0.37% (ए Peyrache, व्यक्तिगत संचार) थे SpikeSorter के लिए झूठी सकारात्मक दरों 0.26% और दो अलग अलग परीक्षण सेट के लिए 0.01% थे। इन दरों टी के बीच में थेउन्होंने प्रतियोगिता के लिए सबसे अच्छा है, लेकिन अधिक महत्वपूर्ण बात यह है कि वे कम और शायद neurophysiological विश्लेषण के सबसे प्रकार के लिए स्वीकार्य हैं। एक और दृष्टिकोण न्यूरॉन्स के नेटवर्क के अत्यधिक विस्तृत बड़े पैमाने पर biophysical सिमुलेशन का उपयोग करने के लिए निर्दिष्ट विदेश मंत्रालय के डिजाइनों से नकली कोशिकी रिकॉर्डिंग उत्पन्न करने के लिए है। वर्तमान में विदेश मंत्रालय छँटाई तरीकों पर काम कर रहे शोधकर्ताओं इस प्रकार 15 वर्ष की परीक्षा सिमुलेशन सुलझाने के लिए आमंत्रित किया गया था। पांच अलग छँटाई एल्गोरिदम तुलना की गई। वहाँ छँटाई प्रदर्शन और जो उपाय के अनुसार अलग अलग समूहों के प्रदर्शन का मूल्यांकन करने के विभिन्न तरीकों का इस्तेमाल किया गया है, कोई भी समूह जाहिर है किसी भी अन्य की तुलना में बेहतर होने के साथ कर रहे हैं। SpikeSorter के परिणाम विभिन्न समूहों द्वारा प्राप्त परिणामों की सीमा के भीतर गिर गया।
चित्रा 1. घटना का पता लगाने संवाद। यह समर्थक, शोर माप की विधि का चयन, मास्किंग चैनलों के लिए thresholding मूल्यों और उन्हें लागू करने के तरीकों, स्थापित करने के लिए और घटना के दोहराव से बचने के लिए तरीकों को चुनने के लिए vides विकल्प। इस और अन्य संवादों में, विकल्पों के बारे में जानकारी प्रश्न चिह्न द्वारा की पहचान बटन ( '?') द्वारा प्रदान की जाती है।
चित्रा 2. देखें, स्वच्छ और विभाजन संवाद। यह क्लस्टर waveforms देखने, की पहचान करने और दूरस्थ waveforms को हटाने, एक या एक से अधिक subclusters में समूहों के बंटवारे के लिए, के लिए और हटाने या subclusters से नए समूहों के गठन के लिए विकल्प प्रदान करता है। Subclusters रंग दिखा द्वारा पहचाने जाते हैं। (ये वरीयता संवाद में बदला जा सकता है।)
चित्र तीन। एक अविश्वसनीय फ़ीचर करने के लिए घटनाक्रम Aligning का प्रभाव। यह आंकड़ा एक चैनल आधारित क्लस्टर से डेटा, घटनाओं जिसका शिखर से पीक तरंग voltages एक खास चैनल पर सबसे बड़ा थे के सेट के रूप में परिभाषित चलता। पैनल इस क्लस्टर, overplotted, विभिन्न चैनलों पर इलेक्ट्रोड से 50 घटना waveforms के एक सबसेट से पता चलता है। चैनल संख्या waveforms के प्रत्येक सेट के ऊपरी बाएँ कोने में दिखाया जाता है। एक चैनल संख्या के बगल में काले डॉट्स से संकेत मिलता है कि चैनल है कि विशेष क्लस्टर को सौंपा गया है। चैनलों को एक ही स्थानिक क्रम में वे इलेक्ट्रोड पर है बाहर रखी हैं। अक्ष क्षैतिज और ऊर्ध्वाधर समय कुल्हाड़ियों, वोल्टेज दिखा। ऊर्ध्वाधर अक्ष की क्षैतिज स्थिति संरेखण बिंदु इंगित करता है, यानी प्रत्येक घटना तैनात है तो इसकी संरेखण बिंदु धुरी के साथ मेल खाता है। नीचे पैनल ए के छोड़ दिया पर scalebar 0.5 एमएस और 100 μV पता चलता है। एक में ब्लू लाइनों waveforms के प्रत्येक सेट (टेम्पलेट) की औसत से संकेत मिलता है। चैनल 24 (सलेटी रंग) छिपा हुआ है। घटनाक्रम के तरंग (नकारात्मक गर्त) की सबसे नकारात्मक स्थानीय न्यूनतम करने के लिए गठबंधन कर रहे हैं के रूप में तुरंत घटना का पता लगाने के बाद चुना गया। पैनल बी क्लस्टर में सभी waveforms से निकाली गई पहले 2 प्रमुख घटकों के वितरण से पता चलता। तीन subclusters इस वितरण में दिखाई दे रहे हैं। पैनल सी उन्हें टेम्पलेट तरंग को संरेखित के बाद की घटनाओं का एक ही सेट से पता चलता है। प्रमुख घटकों वितरण (पैनल डी) अब केवल दो subclusters (एक लाल रंग में पहचान) से पता चलता। इसके अलावा परीक्षा से पता चला है कि बी में एक नकली क्लस्टर एक दूसरे नकारात्मक गर्त (बाद संभावित धीमी नकारात्मक) जो कुछ मामलों में पहले से ज्यादा नकारात्मक था करने के लिए घटनाओं की एक सबसेट के संरेखण की वजह से हुई। इन घटनाओं के कुछ misaligned पैनल में दिखाई waveforms के रूप में जिसका आकार बाकी मैच नहीं करता है।_blank "> यह आंकड़ा का एक बड़ा संस्करण देखने के लिए यहां क्लिक करें।
चित्रा 4. Autosort संवाद। इस घटना का पता लगाने के विकल्प, क्लस्टरिंग विकल्प और स्वचालित विलय और क्लस्टर जोड़े के बंटवारे के लिए विकल्पों में प्रारंभिक स्वचालित क्लस्टरिंग चरण निम्नलिखित प्रदान करता है।
चित्रा 5. तुलना क्लस्टर जोड़े संवाद। इस जोड़े तुलना मूल्य द्वारा आदेश की सूची के माध्यम से खोज, क्लस्टर जोड़े, तुलना उपायों (मिलान विधि) को चुनने के लिए विकल्प प्रदान करता है, पीपी ऊंचाई (या PC1 या PC2) बनाम समय है, और करने के लिए एक विकल्प के, correlograms प्रदर्शित भूखंडों को प्रदर्शित करने के लिए विकल्प जोड़े के विलय।
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चित्रा 6 पोस्ट प्रसंस्करण संवाद। यह स्थानांतरित करने और / या डुप्लिकेट घटनाओं को हटाने, संभवतः शोर घटनाओं को हटाने के लिए, unclustered घटनाओं reclustering के लिए शोर अनुपात (SNR) के लिए एक कम संकेत के साथ समूहों को हटाने के लिए, के लिए और अलग अलग मापदंड के अनुसार renumbering (छँटाई) समूहों के लिए विकल्प प्रदान करता है।
चित्रा 7. छाँटे इकाइयों का प्रदर्शन बेतरतीब ढंग से चुना दिखा रहा है, Overplotted Waveforms रंग क्लस्टर संख्या के अनुसार। स्पष्टता के लिए, प्रत्येक क्लस्टर में से केवल केन्द्र चैनल तरंग दिखाया गया है। (Mitelut और मर्फी, अप्रकाशित से) डाटा कम 14 माउस दृश्य प्रांतस्था से एक 64-चैनल इलेक्ट्रोड रिकॉर्डिंग के चैनलों को दिखाते हैं।
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8 चित्रा सबूत एक निर्णय या नहीं, दो गुच्छे मर्ज करने पर सहन लाया जा सकता है उदाहरण। संवाद तुलना समूहों (पैनल) समान तरंग आकार के साथ क्लस्टर जोड़े के लिए खोज करने के लिए, आयाम (सामान्यीकृत डॉट उत्पाद मैच विधि) अनदेखी इस्तेमाल किया गया था। पैनल बी autocorrelograms (एसी) और दो समूहों के लिए पार correlogram (सीसी), दो अलग अलग बिन चौड़ाई (0.2 और 2 एमएस) के साथ दिखाता है। ये पता चलता है कि दूसरे क्लस्टर (इकाई 53) में spikes एक बहुत मजबूत पहली (इकाई 28) के स्पाइक्स से पहले या तो 4 या 8 एमएस घटित करने की प्रवृत्ति है। पैनल सी दो इकाइयों की कील आकार से पता चलता है और यह भी पता चलता दूसरा (हरे रंग में दिखाया गया है) पहले की तुलना में एक छोटे कील है। पैनल डी दो समूहों के पीसी वितरण से पता चलता। पैनल ई दो इकाइयों की दो इकाइयों के रेखांकन PC1 (ऊर्ध्वाधर अक्ष) (लाल और हरे रंग क्रमशः) बनाम </ Em> समय (मिनट में दिखाया गया है) रिकॉर्डिंग की पूरी अवधि के दौरान। आगे विवरण के लिए पाठ देखें। यह आंकड़ा का एक बड़ा संस्करण देखने के लिए यहां क्लिक करें।
चित्रा 9. एक क्लस्टर जोड़ी का उदाहरण है, जहां विलय के लिए बहुत कम साक्ष्य। पैनल से पता चलता है कि autocorrelograms (एसी) और पार correlogram (सीसी) के दो समूहों के लिए अलग अलग आकार की है। पैनल बी आदेश में और अधिक स्पष्ट रूप से तरंग आकार में अंतर दिखाने में औसतन टेम्पलेट तरंग और मानक विचलन (छायांकन इंगित करता है 1 एसडी इकाई) से पता चलता है। पैनल सी दो समूहों के पीसी वितरण से पता चलता। पैनल डी वीं के दौरान चोटी से शिखर ऊंचाई दो इकाइयों बनाम समय की (ऊर्ध्वाधर अक्ष, μV) रेखांकनरिकॉर्डिंग की पूरी अवधि के लिए ई। आगे विवरण के लिए पाठ देखें। यह आंकड़ा का एक बड़ा संस्करण देखने के लिए यहां क्लिक करें।
चित्रा 10 पैटर्न और प्रधान अवयव रूपांतर निशानेबाजी के आधार पर विलय के लिए साक्ष्य। पैनल एक दो समूहों (लाल और हरा) के waveforms पता चलता है। पैनल बी दो समूहों के लिए बनाम समय (क्षैतिज अक्ष) PC1 (ऊर्ध्वाधर अक्ष) भूखंडों और PC1 मूल्यों समय में समान होने के साथ गोलीबारी में एक पूरक पैटर्न से पता चलता एक इकाई फायरिंग और अन्य शुरू होने से रोकता है। इस पीसी वितरण (पैनल सी) में अलग-अलग समूहों की मौजूदगी के बावजूद विलय करने के लिए एक निर्णय का समर्थन करता है।
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Discussion
फ़ाइल स्वरूप
वर्तमान में समर्थित फ़ाइल स्वरूपों Neuralynx (.ntt और .ncs), Plexon (.plx), Neuroscope (.xml + .dat), मल्टीचैनल सिस्टम्स (.mcd), ब्लैकरॉक (.nev) और Intan (.rhd) शामिल हैं। असमर्थित प्रारूपों के लिए, वहाँ दो विकल्प हैं। एक एक आगामी रिलीज करने के लिए फ़ाइल स्वरूप के अलावा अनुरोध करने के लिए ( '- परिचय सहायता' संवाद डेवलपर के लिए एक ईमेल कड़ी में प्रदान की जाती है) है। अन्य एक समर्थित प्रारूप करने के लिए फ़ाइल में परिवर्तित करने के लिए है। एक सरल विकल्प समय-कील-प्रारूप '.tsf' का उपयोग करने के लिए है। इस नंगे हड्डियों प्रारूप वोल्टेज रिकॉर्ड और चैनल स्थान डेटा प्लस घटनाओं के रिकॉर्ड और चैनल और क्लस्टर कार्य छँटाई निम्नलिखित शामिल हैं। इन फाइलों को पढ़ना अक्सर अन्य प्रारूपों के लिए की तुलना में तेजी है। असमर्थित स्वरूपों से निपटने के लिए स्वतंत्र रूप से यह एक .tsf फ़ाइल में छान डेटा को बचाने के लिए (इस प्रारूप निर्यात विकल्पों के बीच शामिल है) के बाद से इस बाद के समय लेने वाली fil के लिए जरूरत से बचना होगा सुविधाजनक हो सकता हैTERING। .tsf प्रारूप का विवरण प्रलेखन है कि इस कार्यक्रम के साथ आता है में शामिल किए गए हैं।
अनुषंगी फ़ाइलें
दो सहायक फाइल मानकों, ss_prefs.sav और ss_parameters.sav स्टोर करने के लिए इस्तेमाल कर रहे हैं। फ़ाइल 'ss_prefs.sav' केवल उपयोगकर्ता के लिए चुना मूल्यों छँटाई पर कोई सीधा प्रभाव है और कम से बदलती जरूरत की संभावना है कि बचाता है, उदाहरण के लिए खिड़की के आकार और स्थिति, वोल्टेज और अन्य स्केलिंग मूल्यों। अगर ss_prefs.sav मौजूद नहीं है, जब यह प्रासंगिक संवाद में 'लागू करें' बटन दबाया जाता बनाई गई है, या जब कार्यक्रम से बाहर निकल गया है। इस फाइल में 'चिपचिपा मापदंडों' विकल्प सेट है, तो एक अलग फाइल 'ss_parameters.sav' उपयोगकर्ता के चयन पैरामीटर मूल्यों और विकल्प है कि छंटाई के साथ ही कई प्रदर्शन विकल्प के परिणाम को प्रभावित स्टोर करने के लिए प्रयोग किया जाता है। इस फ़ाइल में सहेजा जाता है, या अद्यतन, इस कार्यक्रम के सामान्य 'फ़ाइल - बाहर निकलें' के माध्यम से बाहर निकल जाता है जब मार्ग (लेकिन जब कार्यक्रम 'बंद'बटन (ऊपर दाएं) का इस्तेमाल किया जाता है)। स्टार्टअप पर इस फाइल के अभाव में, मूलभूत मूल्यों उपयोग किया जाता है।
कार्यक्रम की सीमाएं
रिकॉर्डिंग है कि हल किया जा सकता है की लंबाई करने के लिए सीमा कंप्यूटर पर RAM की मात्रा से निर्धारित होता है। राम के 16 GB के साथ एक पीसी आम तौर पर आकार में से 13 जीबी 14 जीबी के कच्चे फ़ाइलों को संभाल कर सकते हैं (2 जीबी रैम की कुल से भी कम) यदि स्मृति में अन्य प्रयोजनों के लिए उपयोग में नहीं है। अन्य सीमाओं, चैनलों की अधिकतम संख्या, अधिकतम क्लस्टर आकार, आदि पर जैसे कार्यक्रम संस्करण और भविष्य के उन्नयन के साथ भिन्न हो सकते हैं। वे '- परिचय सहायता' के लिए जा रहा द्वारा देखी जा सकती है।
अतिरिक्त सुविधाये
देखें, स्वच्छ और विभाजन समूहों संवाद क्लस्टर सीमाओं के मैनुअल परिभाषा के लिए कई विकल्प प्रदान करता है। वे माउस के उपयोग में शामिल बनाम समय प्रदर्शन पीपी आयाम में एक आयत (या PC1 या PC2) आकर्षित करने के लिए, पीसी प्रदर्शन खिड़की में एक अंडाकार आकर्षित करने के लिए, और discriminat आकर्षित करने के लिए मुख्य तरंग प्रदर्शन में आयन खिड़कियां। ये प्रत्येक subclusters बनाने के लिए (किसी भी मौजूदा subclustering ओवरराइट किया जाएगा) का इस्तेमाल किया जा सकता है। संवाद से पहले इन वस्तुओं के किसी भी खींचा जा सकता है बाहर निकल जाना चाहिए। संवाद पर संबंधित बटन दबाने ( 'विंडोज', 'अंडाकार' या 'आयत') subcluster बनाता है।
एक रणनीति संवाद (क्रमबद्ध करें - रणनीति) पैरामीटर है कि कम परिवर्तित करने की आवश्यकता होने की संभावना है, लेकिन जो छँटाई छँटाई पर एक महत्वपूर्ण प्रभाव हो सकता है की एक किस्म को प्रदर्शित करता है। ये उदाहरण के लिए, शामिल हैं, पैरामीटर है कि समूहों के लिए चैनलों के काम और समय अंक है कि किसी भी क्लस्टर के लिए प्रमुख घटकों की गणना करने के लिए योगदान के चयन का निर्धारण। प्रबंधित समूहों संवाद से देखें, स्वच्छ और विभाजन समूहों संवाद, या बाद के प्रसंस्करण संवाद द्वारा प्रदान की गई है अलग-अलग समूहों के बारे में अधिक विस्तृत जानकारी प्रदान करता है। वहाँ भी समूहों को हटाने के लिए और अधिक विविध विकल्प हैं।
ontent "> चैनल एक विशेष खड़ी क्रम में प्रदर्शित कर रहे हैं, 'क्रमबद्ध आदेश' करार दिया वोल्टेज प्रदर्शन विंडो में। आदर्श रूप में यह आदेश चैनलों की शारीरिक निकटता को प्रतिबिंबित करेगा लेकिन यह देखते हुए प्राप्त करने के लिए वास्तविक लेआउट में है मुश्किल हो सकता है दो आयाम हैं। सॉर्ट क्रम y के लिए एक दिया कोण रिश्तेदार के साथ एक लाइन पर चैनल पदों के प्रक्षेपण की गणना के द्वारा उत्पन्न होता है धुरी। लाइन पर चैनल के क्रम संख्या क्रमबद्ध आदेश है। यह कई मामलों में स्वचालित रूप से गणना की है । लेकिन यह देखें - अधिग्रहण गुण 'के लिए जा रहा द्वारा एक अलग से एक उत्पन्न करने के लिए संभव है। संख्यात्मक क्रम में चैनलों प्रदर्शित करने का विकल्प भी प्रदान की जाती है नोट प्रदर्शन के आदेश छँटाई पर कोई प्रभाव नहीं पड़ता है।दूसरे दृष्टिकोण
कील छँटाई करने के लिए अन्य सॉफ्टवेयर संकुल मौजूद हैं। ये wel के रूप में, इस तरह के ऑफलाइन सॉर्टर (http://www.plexon.com/products/offline-sorter) के रूप में व्यावसायिक कार्यक्रमों में शामिल, Klustakwik (केडी हैरिस: https://sourceforge.net/projects/klustakwik/), Wave_clus: इस तरह के MClust (http://redishlab.neuroscience.umn.edu/MClust/MClust.html ई redish) के रूप में एल के रूप में मुफ्त सॉफ्टवेयर (RQ Quiroga: http://www2.le.ac.uk/departments/engineering/research/bioengineering/neuroengineering-lab/spike-sorting) और कार्यक्रमों Neuroscope और Klusters (http:। // neurosuite) 16। इन अन्य कार्यक्रमों, जिनमें से कई आम उपयोग में हैं के साथ एक विस्तृत तुलना, वर्तमान पत्र के दायरे से परे है। इस तरह की एक तुलना Meas के साथ ही tetrodes के लिए अनुकूलन क्षमता विश्वसनीयता उपयोग की आसानी, फ़ाइल स्वरूप का समर्थन, जीयूआई डिजाइन, प्रलेखन, स्वचालन की डिग्री, हार्डवेयर और सॉफ्टवेयर घटकों पर निर्भरता, प्रसंस्करण गति, सहित संबंधित मानदंडों की एक किस्म को शामिल करना होगा, और, इस हद तक है कि यह इसे मापने के लिए, सटीकता छँटाई संभव है। एक विस्तृत तुलना के अभाव में, हम मानते हैं कि SpikeSorter कील प्रकार के लिए विकल्पों में से एक संयोजन और सहायता प्रदान करता हैआईएनजी है कि किसी भी अन्य वर्तमान में उपलब्ध स्टैंडअलोन कील छँटाई पैकेज में उपलब्ध नहीं हो सकता।
छंटनी गुणवत्ता
जैसा कि ऊपर कहा, उद्देश्य परिणाम उपाय है कि इस्तेमाल किया जा सकता है तय करना होगा कि एक प्रक्रिया या पसंद दूसरे से बेहतर काफी हद तक कमी कर रहे है। मानकों और लगातार उपयोगकर्ता इनपुट की आवश्यकता पर निर्भरता भी यह संभावना नहीं है कि बनाता है किसी विशेष प्रकार कभी reproduced किया जा सकता है। यह अपने आप में, परिणाम उपायों के उपयोग को सीमित करता है, तो वे अस्तित्व में होता है। मामले को बदतर बनाने के लिए, यह निश्चित रूप से दूर है कि सही कील छँटाई भी सिद्धांत रूप में संभव है। कोशिकी पास के एकल कक्षों के intracellular रिकॉर्डिंग के साथ मिलकर रिकॉर्डिंग मौजूद न्यूरॉन्स के पड़ोसी जोड़े से 17, 18, लेकिन intracellular रिकॉर्डिंग साबित करना है कि पड़ोसी कोशिकाओं से संकेत हमेशा प्रतिष्ठित किया जा सकता की जरूरत है। कारक है कि एक से कोशिकी वोल्टेज संकेतों पैदा कर सकता हैदिया न्यूरॉन समय की अवधि में अलग अलग करने के लिए, लघु रूप में अच्छी तरह से लंबे समय के रूप में भी अच्छी तरह से समझ नहीं रहे हैं और अभ्यास पर्याप्त परिवर्तनशीलता में जोड़ सकते हैं (उदाहरण के लिए 8 और 10 के आंकड़े) कि छँटाई पेचीदा हो। कील एक व्याख्या करने योग्य समस्या इन परिवर्तनों छोटे, या प्रकृति में अलग, सबसे छोटी मतभेद है कि स्थितीय मतभेद का एक परिणाम के रूप में कोशिकाओं के बीच हो सकता है की तुलना में होना जरूरी होने की छंटाई के लिए। क्लस्टर गुणवत्ता के संख्यात्मक उपायों पर भरोसा भी समस्याग्रस्त हो सकता है। उदाहरण के लिए, कोशिकाओं दर है कि परिमाण 19, 20 के आदेश से अलग है पर आग सकते हैं। एक उच्च फायरिंग दर सेल के उन लोगों के बीच एक कम फायरिंग दर सेल से लगभग सभी spikes के शामिल किए जाने के किसी भी क्लस्टर गुणवत्ता के उपाय पर थोड़ा प्रभाव हो सकता है, तथ्य यह है कि कम दर सेल की छंटाई की गुणवत्ता खराब या गैर होगा छुपा विद्यमान। इन चुनौतियों को देखते हुए, की गुणवत्ता का आकलन करने के लिए तरीके क्लस्टर ओवरलैप पर आधारित छँटाई8, 21 या पैरामीटर बदलाव 22 के चेहरे में स्थिरता छँटाई सुरक्षा के एक झूठे अर्थ दे सकता है। इसके बजाय, हम सुझाव है कि यह अधूरा विज्ञान पर आधारित है कि कील छँटाई स्वीकार करने के लिए आवश्यक हो सकता है। Sorters दोष की भावना के साथ रहना है और जानने के लिए यह समय डेटा विश्लेषण के लिए और अधिक उत्पादक रूपों के बजाय लगातार एक तरह की गुणवत्ता में सुधार करने की कोशिश कर समर्पित करने के लिए बेहतर हो सकता है कि हो सकता।
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Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| spikesorter.exe | N/A | http://www.swindale.ecc.ubc.ca/SpikeSorter |
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