Summary
Maya tomurcuklanan nedeniyle güçlü genetik ve mikrotübül hücre iskeletinin basitliği için in vivo olarak mikrotübül dinamiklerinin çalışmak için avantajlı bir modeldir. Aşağıdaki protokol dönüşümü ve kültür maya hücreleri eş odaklı mikroskopi görüntü elde ve kantitatif maya hücrelerini canlı mikrotübül dinamiklerini analiz etmek açıklamaktadır.
Abstract
Dinamik mikrotübülüsler birçok hücresel süreçlere temeldir ve mikrotübül dinamiklerinin doğru ölçümler hücreleri bu süreçleri düzenleyen nasıl içine ve nasıl genetik mutasyonlar darbe düzenleme öngörü sağlayabilir. metazoan modellerinde mikrotübül dinamiklerinin miktar genetik manipülasyonlara yüksek mikrotübül yoğunluğu ve ilişkin kısıtlamalar da bulunmaktadır ilişkili zorluklar, bir dizi vardır. Buna karşılık, tomurcuklanan maya modeli bu zorlukların üstesinden avantajlar sunuyor. Bu protokol, maya hücreleri, canlı bir mikrotübül dinamiklerinin ölçmek için bir yöntemi tarif etmektedir. floresan etiketli tubulin ifade eden hücreler, sabit zaman atlamalı görüntü elde etmek için izin monte kayar odalarına yapıştırılır. Yüksek hız için ayrıntılı bir rehber, dört boyutlu görüntü elde etme de eş odaklı görüntü yığınlarının dinamik mikrotübül özelliklerinin ölçülmesi için bir protokol, hem de temin edilmektedir. Bu yöntem, geleneksel maya genetik ile birlikte, atakantitatif tübülin alt-birimleri aktivitesini değiştiren mikrotübül regülatörleri veya mutasyonların etkilerini değerlendirmek için çok uygundur bir yaklaşım IdeS.
Introduction
Mikrotübüller αβ-tübülin proteini alt ünitelerinin yapılmış iskelet polimerlerdir ve hücre içi ulaşım, hücre bölünmesi, morfojenez ve motilite içeren hücresel bağlamlarda çeşitli kullanılmaktadır. nerede ve ne zaman mikrotubuller formu bu çeşitli roller için mikrotübül ağları oluşturmak için, hücreler dikkatle düzenleyen gerekir. Bu düzenleme, serbest alt-birimler halinde mikrotübül polimerler veya demonte mikrotübüllere αβ-tübülin alt-birimleri monte ya da bu reaksiyonların kontrol edilmesi ile elde edilir; Bu mikrotübül dinamiklerinin olarak bilinir.
mikrotübül alanının önemli bir amacı, tübülin ve / ya da mikro tüpler bağlanan αβ-tübülin alt-birimleri ve dışsal düzenleyiciler çalışmalar dahil olmak üzere mikrotübül dinamiklerine, düzenleyen moleküler mekanizmalarını etmektir. Ve iyi bilinen bir deneysel yaklaşım com genellikle, saflaştırılmış αβ-tübülin proteini kullanılarak, in vitro olarak, bu sistem tekrar oluşturmak için olanSaflaştırılmış dış düzenleyicileri ile bileflimini. Bu yararlı bir yaklaşım olsa da, yeniden oluşturulmuş bir sistemde mikrotübül dinamikleri canlı hücrelerde gözlenen olandan kuvvetle farklılık olduğu açıktır. Örneğin, mikrotübüller daha hızlı büyür ve in vitro in vivo daha yavaş küçültmek. Bu farklılıklar, hücreler bilinen dış düzenleyiciler 1 mevcudiyeti, aynı zamanda, henüz tanımlanmamış-faktörlere bağlı olabilir. Nedenle, mikrotübül düzenleyiciler ve bir yerli hücresel bağlamda dinamiklerini bozacak mutantların faaliyetlerini belirlemek için çok önemlidir.
metazoan modelleri mikrotübül fonksiyonunu ve üst düzey örgüt araştırmak için geçerli olan sistemler olduğu kanıtlanmış olmasına rağmen, birkaç pratik kaygılar ciddi mikrotübül dinamiklerinin hassas ölçümü için bu modellerin yarar sınırlar. İlk olarak, hücre başına binlerce onlarca arasında değişen mikrotübül yüksek sayıda, güvenle etmek zorlaştırırzamanla bireysel Mikrotübülleri izlemek. Birçok çalışmada seçici böyle uç bağlayıcı (EB) ailede proteinler gibi mikrotübül uçlarına lokalize proteinler görüntüleme yoluyla bu sorunu aşmak. Bununla birlikte, bu proteinler, sadece Metazoan'da 2 mikrotübülleri büyüyen uçları lokalize bilinmektedir. Bu nedenle, bu proteinlerin programı yalnızca dolaylı olarak felaket sıklığı dinamikleri diğer yönleri, ölçüm yaparken doğrudan büyüme oranları ölçümü ile sınırlıdır. İkincisi, genom düzenleme teknolojisindeki gelişmeler rağmen kararlı bir şekilde floresan etiketli tubulin veya selektif tübülin veya mikrotübül düzenleyiciler işlemek için mutasyonlar tanıtarak ifade eden hücreleri oluşturarak önemli bir sorun olmaya devam etmektedir. Üstelik Metazoan'da birçok tübülin izotiplerinin varlığı mutasyonları bireysel tübülin genleri nasıl etkilediğini çalışma boşa çıkarıcıdır.
Çiçek mayası sistemi in vivo microtubu ölçüm için çeşitli önemli avantajlar sağlarle dinamiği. Maya bireysel mikrotübül görselleştirme izin basitleştirilmiş mikrotübül ağı bulunmaktadır. Mayada, mikrotübüller çekirdek zarfına 3 gömülü mil kutup gövdelerinin (SPBs) olarak bilinen merkezi organize kaynaklanmaktadır. SPBs mikrotübül 4, 5 çekirdeklenmesi γ-tübülin küçük kompleksleri için iskelet olarak hizmet vermektedir. SPBs mikrotübül, mil mikrotübül ve astral mikrotübül iki sınıfları çekirdekleştirmek. Nükleolazma içine Mil mikrotubuller projesi ve kinetochore mikrotübül aracılığıyla kromozomların bağlayabilmek için ve interpolar Mikrotübülleri 6 örtüşen yoluyla mil stabilize için önemlidir. Buna karşılık, astral mikrotübül dışa sitozol içine proje ve iğ mikrotübüller yoğun ağına nispeten nadir karşılaştırılır. Mitoz sırasında önceden anafaz hücreler SPB ya çıkan sadece 1-2 astral mikrotübülleri sahiptir; Bu i olarak varyerine 7 demetleri olarak daha ndividual mikrotübüller. mitoz sırasında mikrotübüllerin Astral rolü tomurcuk boyun olarak bilinen anne ve tomurcuk bölmeleri arasındaki birleşme içine çekirdeği ve mil taşımaktır. Bu hareket, doğru ve en sonunda tomurcuk boyun 8 içine çekirdeği ve mil çekme astral mikrotübüller üzerindeki kuvvet üretir iyi tanımlanmış yolları kapsar.
maya sisteminin bir diğer avantajı, eşsiz bir hassasiyetle mikrotübül düzenleyiciler ve tübülin alt-birimleri araştırmak için kullanılabilir olan genetik bir programı. Tek bir β-tübülin geni (TUB2) ve iki α-tubulin genleri (TUB1 ve TUB3): Maya da bir tübülin izotiplerinin basitleştirilmiş repertuar sahiptirler. Mutasyonlar hali hazırda bu genlerin sokulur ve böylece homojen bir tübülin nüfus 9, 10 olarak incelenebilir. yaygın bir dizi vardırMevcut etiketleme mikrotübül için yapılar ve bu kararlı ifadesi için kromozom lokuslarındaki entegrasyon için hedeflenebilir (Tartışma).
Bu yöntemin genel amacı, mikrotübül dinamiklerinin yüksek çözünürlüklü ölçümler için dört boyutta (X, Y, Z ve T), maya hücreleri, canlı görüntü tek mikrotübüllere etmektir. maya hücrelerinde floresan etiketli tubulin konstitütif, düşük seviyeli bir ekspresyon için yapıları birleştirmek için yöntemler tarif edilmiştir. görüntüleme önce, canlı hücreler uzun süreli görüntüleme için hücrelerini kararlı hale lektin Concanavalin A ile kaplanmış kayar odalarına monte edilmiştir. görüntü elde etmek için en uygun parametreler, hem de veri analizi için bir iş akışı, ayrıca açıklanmıştır.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. Hazırlama -Leu Çıkarma Plakalar
- 2 L'lik bir şişeye steril deiyonize su, 800 mL (O dihidro 2) ekleyin. Bırakma baz (DOB) toz 26.71 g, CSM-Leu 0.69 g, ve agar 20 g ekleyin. bir manyetik karıştırma çubuğu ile karıştırın. Dihidro 2 O ile 1 L'ye getir
- 121 ° C'de otoklav ve 30 dakika 19 psi.
- otoklavdan balon çıkarın ve yumuşak bir şekilde karıştırma ile ~ 65 ° C'ye soğumasını sağlayın.
- 100 mm çaplı plakalara 30 ml / plaka dökün. Bu, 4 ° C'de depolamadan önce, 36-48 saat boyunca oda sıcaklığında bekletin.
2. GFP etiketli tubulin bünyesel anlatımı için, GFP-Tub1 entegre
- 3 dakika boyunca, 10 mg / ml tek kordonlu DNA (ssDNA) bir stok konsantrasyonu kaynatın.
- Saflaştırılarak GFP Tub1 plazmid DNA 11 400 ng ile kaynatılır ssDNA 2 uL birleştirin.
NOT: stabil, floresan etiketleme için kullanılabilecek plazmid çeşitli vardırAlternatif florofor ve seçilebilir işaretleyiciler kullanan maya içinde mikrotübül. Bu alternatiflerin bazıları Tartışma bölümünde açıklanmıştır. - kompetan maya hücreleri 50 uL alikot DNA karışımı ekleyin.
Not: sorbitol solüsyonu ile kompetan maya hücreleri hazırla (SORB 100 mM LiOAc, pH 8'e sulandırılmış asetik asit ile ayarlanmış 10 mM Tris-HCI pH 8, 1 mM EDTA, pH 8, 1 M sorbitol,). Kompetan maya hücreleri yapma ayrıntılı bir açıklaması için, referans 12 bkz. - Girdap iyice.
- DNA hücre karışımı, polietilen glikol (PEG) çözeltisi (100 mM LiOAc, 10 mM Tris-HCI pH 8, 1 mM EDTA / NaOH pH 8, ve% 40 PEG3350) toplam hacmine 6x ekleyin.
- Girdap iyice.
- yumuşak çalkalama ile 30 ° C'de en az 1 saat süreyle inkübe edin.
- toplam hacmi ve vorteks% 10 dimetil sülfoksit (DMSO) ekleyin.
- 15 dakika boyunca 42 ° C'de inkübe edilir.
- 5 dakika boyunca 2500 x g'de santrifüjleyin.
- Bir -Leu bırakma plakası üzerinde plakası hücreleri.
Not: diğer yapılar alternatif işaretleyici kullanır ama GFP Tub1 yapı, bir lösin okzotrofik işaretleyici içerir. Bırakma ortamı yapısının oksotrofik işaretleyiciye özgü olmalıdır. - dönüştürülmüş hücreler 30 ° C'de 3-5 gün süreyle büyümeye izin verin.
- otoklavlanıp kürdan kullanarak koloniler aktararak taze Leu bırakma plakasında Yeniden çizgi tek dönüştürme koloniler. 30 ° C 'de bir gece boyunca inkübasyona bırakılır.
- Görsel olarak temiz bir slayt üzerine su 2 uL aşama 2.14 plakadan tek bir koloni, hücrelerin yaklaşık olarak 1 uL asılmasıyla bir GFP sinyali için her transformant ekran. Bir lamel ile süspansiyon halinde duran hücreleri Kapak ve floresan mikroskobu kullanılarak dikkate alınmalıdır.
- 488 nm ışık sahip transformasyon heyecan ve bir GFP sinyali olduğunda arayın.
- 488 nm ışık sahip transformasyon heyecan ve bir GFP sinyali olduğunda arayın.
3. Artan sıvı Maya Kültür
- sentetik tam orta 3 mL bir levha üzerinde tek bir koloniden maya hücrelerinin ~ 1 uL inoküle. Hücreler 250 rpm'de 30 ° C'de gece boyunca büyümeye izin verin.
- Ortam içinde 0.1 <OD 600 Ertesi gün, doymuş kültür seyreltin. 3-4 saat için ya da hücreler, görüntüleme için odalarına yerleştirilir hazır olduğunda OD600 0.4 ve 0.8, arasında olana kadar 30 ° C çalkalayıcı seyreltilmiş kültür dönün.
4. Akım odası Slaytlar hazırlanması
- kesimUzun geniş bir parça 4 içine parafin film tabakası ve 7.
- parafin film 4 inç genişliğinde uzunlamasına standart bir mikroskop lamı yerleştirin ve slayt 3-4 katmanları kalın film kaplıdır 3-4 kez bu şekilde bütün slaydın etrafına bir film sarılır. Makul bir mühür olmadığından emin olmak için katmanları bir araya basın; Bu kesmek için daha kolay hale getirecek. Çok sert basarak veya kırışmasına filmi neden kaçının.
- Temiz bir kutu kesici tıraş makinesi kullanarak slaydın dış kenarları boyunca parafin filmi kesin. kesme için düz bir kenar sağlamak için başka bir slayt kullanın.
- Peel aşırı çalışma slayt kapalı sinema ve atın. filmin geri kalan yığınları sürgünün bir yüzünü kapsamaktadır ve görüntüleme odalar arasında duvarlar yapmak için kullanılır.
- bir düz kenar, ikinci bir slayt kullanılarak, yaklaşık on şeritleri, her birinin genişliği 2-4 mm içine sürgünün uzun ekseni boyunca yığılmış film katmanları kesti.
- dikey olarak istiflenmiş parafin film tabakalarının Kesmesürgünün kısa ekseni boyunca, aşama 4,5 yapılan kesiklerin, şeritleri genişliği 2-4 mm, uzunluğu 23-24 mm, ve kalın 3-4 katmanları oluşturmak için.
- 45 ° 'lik açıyla, bir jilet kullanılarak şeritler kesilmiş soyun. Forseps kullanarak, eşit bölmelerin istenen numaraları oluşturmak için temiz bir mikroskop lamı üzerine kesik film şeritlerini dağıtın. (4 parafin film şeritleri ile yapılan) kadar 3 bölmeler, bir slayt üzerinde oluşturulabilir.
- Filmin şeritlerinin üzerine tek bir lamel yerleştirin ve forseps ile pozisyona taşımak.
- (Bu, yaklaşık en ocak üzerinde, düşük-orta ayardır), hazırlanan slayt yerleştirin ~ 95 ° C'ye ayarlanmış bir sıcak plaka üzerinde, yukarı lamel. Film şeritleri (yaklaşık 3 dk) saydam kadar slayt ısıtılması ve daha sonra slayt mühür ve yavaşça cımbız ile lamel üzerine baskı ile bir arada lamel.
NOT: Bu c yukarıdaki bölgeler çizilmeye olarak, parafin film şeritleri hemen üzerindedir; lamel bölgeler üzerinde tek basına önemlidirHambers görüntü kalitesini azaltabilir. slaytı aşırı ısınmasına vermemeye özen; buharlaşmış bir film olacak kat yapışmasını hücreleri engelleyen bir hidrofobik film ile haznenin iç. - (Slayt sıcak olacaktır) ocak slayt kaldırmak ve kapak tarafı yukarı bakacak şekilde soğumaya kenara ayırın için forseps kullanır; slayt soğudukça film beyaz, opak renklenmeye dönecektir.
NOT: Bu noktada, slaytlar kültürlü maya hücreleri ile yüklenecek hazırdır. Ekstra slaytlar bu noktaya yapılmış ve süresiz tutar için temiz ve kuru bir yerde saklanabilir.
Hazırlanan Akış Odası Slaytlar içine 5. Yükleme Maya Hücreleri
- Concanavalin A (2 mg / ml steril dihidro 2 O) 'in bir dondurulmuş, 200 uL alikot çözülme.
- açık uçlarından birine pipetleme hazırlanan slayt her bölmeye çözülmüş Concanavalin A yaklaşık olarak 100 uL ekleyin. odasını dolduracak kadar Concanavalin A'yı ekleyin. Bu s içinTEP, Konkanavalin A kapilar etkisi ile bölme ile çekilir.
- Konkanavalin A lamel (yani odası) uymak için girmesi için 5 dakika için iki mikrofüj tüpü raflar veya kafesler arasında slayt, lamel-aşağı, asın.
- Bir lamel yukarı pozisyona slayt dönün. Konkanavalin A kaldırmak için sentetik tam orta; 2x ile odacık hacmi haznesi yıkayın (yaklaşık 200 uL yukarıda adım 5.2 belirlenmiştir)
- aynı anda diğer taze sıvı pipetleme ise bölmenin bir ucundan dışarı sıvı çekmek için, bir kağıt havlu köşesini veya ikiye katlanmış bir filtre kağıdı kullanarak, hazne içindeki orta akış. Alternatif olarak, diğer taze sıvı pipetleme sırasında dikkatli bir şekilde bir ucundan dışarı sıvı çekmek için bir vakum aspiratör kullanın.
- yönlendirilen bir akış meto kullanılarak (adım 3.4) hücre süspansiyonu oda hacmi (yaklaşık 200 uL) 2x akan Yük hücreleriAdım 5.4.1 tarif d.
NOT: Hedef görüntüye lamel de hücrelerin tek tabakasıdır. Nedenle, onlar birbirinin üstünde kazık olmadığını yeterince küçük, ama yeterli hücreler görüntü edinme başına maksimum veri miktarını toplamak için alanda mevcut olduğu kadar büyük bir hücre konsantrasyonunu yüklemek için önemlidir. bölme içindeki hücrelerin optimum konsantrasyonu değişebilir ve deneysel olarak tespit edilmelidir. , Akış odacağı içinde hücre konsantrasyonunu arttırmak yavaşça, 2 dakika boyunca 1000 x g'de hücre kültürünün pelet yüzer bazılarını kaldırmak için. Hücre konsantrasyonunu azaltmak hücre süspansiyonuna taze sentetik tam orta ekleyin. hücrelerin konsantrasyonu, bir faz kontrast mikroskop odası incelenmesi ile (aşağıdaki) adım 5.7 sonrası değerlendirilebilmektedir. Bu noktada, ek hücreler daha fazla hücre süspansiyonu içinde akan odasına ilave edilebilir. Bununla birlikte, bu noktada hücre yoğunluğunu azaltmak mümkün değildir ve en iyi elde edilirBir seyreltilmiş hücre süspansiyonu ile yeni bir bölme yüklenerek. - Hücreler lamel yapışmasına izin vermek için 10 dakika boyunca, aşama 5.3'te tarif edildiği gibi, kaydırma lamel sarkar.
- 4x yoluyla sentetik tam orta odacık hacmi (yaklaşık 400 uL) akan bir yapışmamış olan hücreleri yıkayın. Bu görüntü edinimini kirletebilir odasında serbest yüzen hücreleri, ortadan kaldıracaktır.
- Dikkatle lamel kenarına menisküs getiren, bir kağıt havlu kullanılarak temiz bir köşesi ile bölmenin her iki ucunu kurutun.
- Sıcak (75 ° C), sızdırmazlık maddesi ile odasının her uç kapatıcı kısım (örneğin, valap; eşit parçaya vazelin, yün mumu ve parafin balmumu).
NOT: Bu noktada, slayt görüntüsüne hazırdır. bölmelerinin her biri, bölme içindeki hücrelerin yoğunluğuna bağlı olarak, en fazla 9 saat boyunca görüntülenebilir. Hücreler, hücreleri yerinden kabarcıklar oluşturacaktır karbondioksit zamanla (CO2), üretecektir.
- Bir 1.45 NA 100X CFI Planı Apo hedefi, bir piezoelektrik aşamada, dönen bir disk konfokal tarayıcı biriminin, bir aydınlatma lazer ve bir EMCCD kamera ile donatılmış bir inverted mikroskop slaytı getirin. edinimi sırasında oda sıcaklığı (25 ° C) aşamasının sıcaklığı muhafaza edin.
Not: yüksek sayısal açıklık daha büyük bir görüntü çözünürlüğü sağlar, ve piezoelektrik aşama yüksek hızlı z yığın toplama sağlar. Asgari mikroskop gereksinimleri 100X objektif, aydınlatma lazer ve EMCCD kamera bulunmaktadır. - odak haline hücreleri getirin. edinim alan gruplanmış hücreler için slayt arayarak araya kümelenmiş en az 5-6 hücrelerini sahip olduğundan emin olun.
NOT: Bir seferde birden fazla hücre görüntüsüne gerekli olmamasına rağmen, aynı alanda görüntüleme birden çok hücre verilerin kalitesini bozmadan veri toplama verimliliğini artırır. Ancak, bu kritiktirHücreler aynı odak düzlem üzerinde ve birbirine üstüne yığılmış değildir. - Zamanla çoklu z serisi toplamak için çok boyutlu bir satın alma programlayın.
- Aşağıdaki aktif alıcı ayarları içinde ayarlar ayarlama: toplam Z derinlik = 6 um, tüm maya hücresi kapsaması; Z adım boyutu = 300 nm, yüksek hızda örnekleme olmayan ışık toplama maksimize etmek; toplam zaman süresi = 10 dak; Zaman aralıkları = Z serisi her 4 s; Pozlama süresi = her bir z-düzlemi 90 ms.
NOT: Optimal maruz kalma süresi kamera, uyarma ışık kaynağı ve diğer faktörlere bağlı olarak değişir. EMCCD ile ölçülen piksel değerlerine tabi olan sitoplazmadan sinyal GFP etiketli astral mikrotübül sinyalin: 1 oranını Genel olarak, optimum maruz kalma süresi 3 elde etmek için gerekli olan minimum süre olacaktır.
- Aşağıdaki aktif alıcı ayarları içinde ayarlar ayarlama: toplam Z derinlik = 6 um, tüm maya hücresi kapsaması; Z adım boyutu = 300 nm, yüksek hızda örnekleme olmayan ışık toplama maksimize etmek; toplam zaman süresi = 10 dak; Zaman aralıkları = Z serisi her 4 s; Pozlama süresi = her bir z-düzlemi 90 ms.
- 'Çalıştır' tıklayarak edinimini başlayın. tam 10 dk süresince çalışmasına izin verin. bir görüntü olarak verilerini kaydetserisi (tiff veya .nd2).
- odasının içinde görüntüye yeni bir alan seçin ve tekrar 6.2-6.4 adımları tekrarlayın.
NOT: Tek bir bölme odası içinde hücre yoğunluğuna bağlı olarak, hücre 15 ile 20 alanları vermelidir. Odasında CO2 daha hızlı inşa edecek şekilde daha yüksek hücre yoğunlukları, daha düşük toplam alanları verecektir.
7. Görüntü Analizi
- ImageJ (görüntü dosyasını açın https://imagej.nih.gov biyo-biçimleri ithalatçı eklentisi kullanarak bir hyperstack gibi).
- Açık ImageJ doğrudan kontrol paneli üzerine bölümünden 6 alınan görüntü yığını sürükleyebilir. biyo-biçimleri ithalatçı otomatik olarak başlayacaktır. Bir hyperstack olarak görüntü yığını yüklemek için "Tamam" ı seçin.
NOT: "Biyo-biçimleri İthalat Seçenekler" istemi açın ve "Yığın Görüntüleme" bölümünde, altında sağlayacaktır "isimli yığını:" ayarlandığında için "hyperstack"; ve "Yığın Sipariş:" ayarı "XYCZT."
- Açık ImageJ doğrudan kontrol paneli üzerine bölümünden 6 alınan görüntü yığını sürükleyebilir. biyo-biçimleri ithalatçı otomatik olarak başlayacaktır. Bir hyperstack olarak görüntü yığını yüklemek için "Tamam" ı seçin.
- Z-proje fonksiyon kullanılarak, maksimum yoğunlukta, 2 boyutlu projeksiyon her bir Z serisi kapa.
- "Resim" menüsüne "Yığın" alt menüsünü ve "Z-proje" özelliğini seçin. Açılır listeden "Maksimum projeksiyonu" ı seçin ve "Tamam."
- "Süreç" menüsünü, "Filtreler" alt menüsünü ve "Medyan" özelliği seçerek beneklenme gürültüsünü azaltmak için görüntü yığını bir medyan filtresi uygulayın. yarıçap kutuya 2.0 piksel yazın ve "Tamam."
- alanında ön anafaz hücreleri tanımlamak.
Not: Bu orta boy tomurcukları ve kısa bir mitotik iğ uzunluğunda 1-1.5 um (Şekil 1, bir kısa mitotik ok ucu noktası) ile karakterize edilir. bunlar tipik olarak sadece bir fe göstermesinden dolayı, bu aşamada hücreler, mikrotübül dinamiklerinin analiz edilmesi için idealdirMil uçlarına 7 çıkan ağırlık astral mikrotübüller. Astral mikrotübül sitoplazmada artı ucuna, SPB de eksi ucundan homojen bir GFP sinyali yoğunluğu sergilerler doğrusal filamanlar halinde tespit edilebilir. - artı ucuna astral mikrotübül ve daha yoğun olarak etiketlenmiş mil mikrotübül arasındaki kavşakta konumlandırılmışlardır eksi uçtan başka, tek bir astral mikrotübül boyunca bir çizgi çizmek segmentli hattı aracını kullanarak, görüntü dizisinin ilk zaman noktasında başlayan sitoplazmada olan (Şekil 1 'de kırmızı çizgiler bakınız). segmentli çizgiyi tamamlamak için Mikrotubullerin ucunda çift tıklayın.
- klavyede "M" düğmesine basarak "tedbir" özelliğini kullanarak sonuçları tabloda ölçümü kaydedin.
NOT: gri yoğunluğu gibi ek özellikler, "Analiz" menüsündeki ölçümleri ayarlama ve "Set Ölçümleri" alt menüsü ile kaydedilebilir. - Z-kaydırma çubuğu sağ oka tıklayarak veya klavyedeki "./>" tuşuna basarak ya sonraki timepoint ilerle. Tekrar görüntü dizisinde her zaman noktasında 7.5 ve 7.6 adımları tekrarlayın.
- Sonuçlar tablosundaki verileri kopyalayıp bir e-tabloya yapıştırmak. seçerek verileri kaydetme "Farklı Kaydet".
NOT: çizgi (yani astral mikrotübül) uzunluğunu gösterir serisinin bir zaman noktası gösteren dilim ve uzunluğu, bu ölçümler çeşitli değerleri içerecek, ama en önemli değerlerdir. Diğer ölçümler içeren kolonlar tutulan veya iptal edilebilir ya da (örneğin, alan, piksel değeri, açısı, vb) idi. - sağ tıklayarak ve "Ekle" işlevini kullanarak e-tabloda yeni bir sütun oluşturun. Girdi Her bir zaman noktası zamanını (ler) i.
- "Ekle Hattı kullanarak zaman (lar) bir fonksiyonu olarak mikrotübül uzunluğu (mikron) bir XY dağılım arsa oluşturunGrafik" özelliği; gibi uzunluk ölçümleri seçme 'Y' ve zaman sütun 'X'
- adım 7.10 den dağılım arsa üzerinde zamanla uzunluğunda pozitif ve negatif değişiklikleri arayarak polimerizasyonu, depolimerizasyonundan ve duraklama bölgelerini tanımlamak.
Not: Polimerizasyon olaylar 3 zaman noktasında en az karşı, en azından 0.5 um ile mikrotübül uzunluğunu arttırmak ve R 2 ≥ 0.9 ve bir R-değeri> 0 (Şekil 1B, D, yeşil noktası) olan bir doğrusal regresyon uygun. Depolimerizasyon etkinlik 3 zaman noktasında en az karşı, en azından 0.5 um ile mikrotübül uzunluğunu azaltmak ve R 2 ≥ 0.9 ve bir R-değeri <0 (Şekil 1B, D, pembe noktası) olan bir doğrusal regresyon uygun. Duraklatma etkinlik polimerizasyon ve depolimerizasyon ayrıdır. Duraklama az 0,5 um 3 zaman noktasında en az boyunca mikrotübül uzunluğu net değişiklik olarak tanımlanır;-0.4 ve 0.4 arasında bir R-değerine sahip bir lineer regresyon uygun; ve F-testi ile tespit edildiği üzere, sıfırdan istatistiksel olarak farklı olmayan bir eğime sahiptir. - Bir kılavuz olarak dağılım çizimi kullanılarak uzunluk değişimi olumlu olduğu zamanda bölümleri belirlemek ve yeşil renkte bunları vurgulayın. uzunluk değişimi pembe renkte negatif olduğunda zamanın bölgeleri vurgulayın.
- Her bir lineer regresyon bölümünü vurgulanan hesaplayın ve yakın bölgelere sütun her bölüm için R ve R '2-değeri kaydedin. Bir polimerizasyon olayı veya bir depolimerizasyon olayını her renkli bölge sınıflandırır.
- adım 7.10 den dağılım arsa üzerinde zamanla uzunluğunda pozitif ve negatif değişiklikleri arayarak polimerizasyonu, depolimerizasyonundan ve duraklama bölgelerini tanımlamak.
- Her bir büyüme olay için zaman içinde değişim ile uzunluğunda net değişimi bölünmesi ile polimerizasyon oranlarını hesaplayın. Adım 7.10.3 doğrusal regresyon değerlerine sütunda bu sonuçlar bitişik kaydedin.
- Her shrinkin için zamanında değişiklikten uzunluğunda net değişimi bölünmesiyle depolymerization oranlarını hesaplayıng etkinliği. Adım 7.11 polimerizasyon hızı değerleri için sütundaki bu sonuçlar bitişik kaydedin.
- Tüm büyüme etkinlikleri 13 toplam zaman polimerizasyon için-depolimerizasyon geçiş sayısını bölünmesiyle felaket frekansı hesaplayabilir. Adım 7.12 den depolimerizasyon oranı değerlerine sütunda bu sonuçlar bitişik kaydedin.
- Tüm çekme etkinlikleri 13 toplam zaman depolimerizasyon-için-polimerizasyon geçiş sayısını bölünmesi ile kurtarma frekansı hesaplayabilir. Adım 7.13 felaket frekans değeri sütunundaki bu sonuçlar bitişik kaydedin.
- Adım 7.10.1 hesaplanan görüntü elde toplam süresi, bütün uzunluk değişiklikleri, mutlak değerinin toplamına bölünmesi ve ikinci 14 başına tübülin alt-birimleri elde etmek için 27.0833 ile çarpılarak Dinamisitesi hesaplayın. Kurtarma frekans val bitişik sütunda bu sonuçları kaydedinadım 7.14 den ues ve sonuç tablosu kaydedin.
Not: Bu, özel bir program kullanılarak adımda 7,10-7,15 tarif edilen analiz işlemini otomatikleştirmek için mümkündür (. ESTREM ve arkadaşları, yazma sunulmuştur). Program, yukarıda ayrıntıları aşağıdaki parametreler ile uzunluk ölçümleri polimerizasyon ve depolimerizasyon dönemlerini belirlemek için tasarlanmıştır.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
maya hücreleri canlı mikrotübül dinamiklerinin Ölçüm mikrotübül regülatörleri veya tubulin kodlayan genlerdeki mutasyonların etki polimerizasyonu ve depolimerizasyon oranları, aynı zamanda bu durumları arasındaki geçişin frekans alt-birimlerini ne kadar değerlendirmek için ilgi çekici bir araç sağlar. Şekil 1'de, bir vahşi tip hücre astral mikrotübül dinamiklerinin bir zaman serisi ve (430Δ tub2-) β-tubulin bir mutasyona sahip bir mutant hücre. Mikrotübüller mikrotübül uzunluğu görselleştirmek için GFP etiketli α-tubulin ile etiketlenir. Kırmızı oklar her bir görüntü (Şekil 1a ve 1 ° C) astral mikrotübül uzunluğunu iz. Mikrotübül uzunlukları 8 dakika için her bir zaman noktasında ölçülmüş ve bu derlenmiş uzunluklar yaşam araziler (Şekil 1B ve 1 D) 'de gösterilmiştir. Bu veriler, polimerizasyon hızı, depolimerizasyon oranı, polimerizasyon durati belirlemek için kullanıldıdepolimerizasyon süresi, kurtarma frekansı, felaket frekansı ve Dinamik yapısı, üzerinde.
GFP etiketli Mikrotübüller Astral mikrotübül dinamiklerinin Ölçümlerinin Şekil 1. Zaman atlamalı Görüntüleme. (A ve C), yabani tip ve tub2 -430Δ mutant hücrelerinin zaman atlamalı görüntüleme ilk beş sıralı görüntüler. Mikrotübüller, GFP-Tub1 ile etiketlenmiş ve hücre döngüsünün ön anafaz olarak görüntülenmiş. Her bir görüntü konfokal Z dizisinden bir maksimum yoğunluklu projeksiyonudur. Ölçek çubukları: 1 um. Zaman damgaları, her kare alma toplam süresini gösterir. kırmızı oklar ok başları artı uçlarını gösteren ile, astral Mikrotubullerin toplam uzunluğu boyunca uygulayın. (B ve D) Mikrotübül yaşam araziler zaman boyunca tek astral mikrotübül uzunlukları gösterir. yeşil noktas polimerizasyonu temsil ettiği ve pembe noktaları depolimerizasyonunu belirtmektedir. ok başları felaket olayları işaret ediyor. Bu rakamın büyük halini görmek için buraya tıklayın.
Şekil 1, bir vahşi tip suşu ve C-terminal β-tubulin 27 amino asit eksiği olan bir mutant soyu, daha önce daha kararlı mikrotübülleri 15 sahip olduğu gösterilmiş bir mutant arasındaki değiştirilmiş mikrotübül dinamiklerinin gösterir. Mikrotübül yaşam araziler de gösterildiği gibi, tub2 -430Δ mutant mikrotübül uzundur ve vahşi tip mikrotübül daha sergiler az afetler (Şekil 1B, D ok başları; Tablo 1). Buna ek olarak, polimerizasyon ve depolimerizasyon oranları, yükselen eğim ve azalan mikrotübül Leng tespitths, vahşi tip (Tablo 1 Şekil 1B ve 1D) ile karşılaştırıldığında, mutant azalmıştır. Son olarak, tub2 -430Δ mutant hücresidir mikrotübül polimerizasyon ve depolimerizasyon durumları daha fazla zaman geçirdiği ve vahşi tip (Tablo 1) ile karşılaştırıldığında Dinamisitesi azalmıştır.
| Gerginlik | Dinamisitesi (alt-birimler / s) | Polimerizasyon oranı (mikron / dakika) | % Polimerizasyon Zaman | Depolym oranı (mikron / dakika) | Depoly-% saat merization | % Pause Zaman | Kurtarma frekansı (olaylar / dakika) | Afet frekansı (evveliler / dakika) |
| Vahşi tip, n = 1 | 54 | 1.8 ± 0.5 | 48 | 3.0 ± 0.3 | 29 | 3 | 1.8 | 1.4 |
| tub2-430Δ n = 1 ' | 40 | 1.4 ± 0.1 | 41 | 1.5 ± 0.2 | 32 | 0 | 0.8 | 0.7 |
| aşağıdaki gibi kısaltmaları: um, mikron; dakika, dakika; s, ikinci; N, mikrotübül ömrü arsa (Fig1B, D) analiz tek mikrotübül. Değerler ortalama ± standart hatasıdır. | ||||||||
Tablo 1: Şekil 1 'de hücreler için mikrotübül dinamiklerinin Ölçümler değerleri Şekil 1' de gösterilen tek mikrotübül ölçümlerden ortalama ± standart hata ortalamasıdır.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Tomurcuklanan maya modeli zamanla görüntü tek mikrotüpcüklere yetenek ve maya genetik araçlarını kullanarak tübülinler ve mikrotübül düzenleyicileri manipüle etme yeteneği dahil olmak üzere, bir in vivo ortamda mikrotübül dinamiklerinin yüksek çözünürlüklü ölçümler toplamak için önemli avantajlar sunuyor.
Konkanavalin A ile kaplı bölmeler erimiş agar pedleri de dahil olmak üzere daha önce tarif edilen tertibatlarda, üzerinde bir çok avantaj sağlar. odaları ile Slaytlar önceden yapılmış ve uzun süreli saklandığı ya da hemen kullanılabilir edilebilir. Buna ek olarak, Concanavalin A ile kaplı bölmeler hücreler ilk olarak kültürlendiği aynı ortam içinde> 6 saat için maya hücrelerinin kültürlenmesi yeteneğine sahiptir. Odanın içindeki hücre sayısı haznesi görüntülü olabilir ne kadar dikte edeceği unutulmamalıdır. kaplanmış bölmeler maya hücrelerinin sadece tek bir katman lamel uygun olduğundan emin olmak. Son olarak, bir çok bölme oluşturmak için izin verirçeşitli maya cinsleri, aynı slayt görüntülenmek üzere.
nispeten düşük sinyal seviyeleri ve sürecin son derece dinamik yapısı dahil olmak üzere maya, tomurcuklanan mikrotübül dinamiklerini görüntülemeden önemli zorluklar vardır. Geniş alanlı mikroskoplar etiketli mikrotübül tek timepoint görüntüleri yakalamak için yeterli. Ancak, widefield mikroskopi uzun pozlama süreleri ve dışı odak ışığı ile numunenin bombardımanı nedeniyle photobleaching hızlı neden olur. Aynı şekilde, lazer taramalı eş odaklı mikroskoplar sayesinde daha hızlı ışıkla ağartma için yetersizdir. Disk konfokal mikroskopi Spinning mayayı tomurcuklanan mikrotübül dinamiklerini görüntülenmesi için özel olarak düzenlenmiştir. Burada kullanılan iplik disk konfokal mikroskop sistemi bu gerekleri göz önüne alınarak tasarlanmış.
mikroskop sistemi, yüksek hız ve yüksek hassasiyet için tasarlanmış olmalıdır. Mikroskop çeşitli sistemler müsait olabilecek, ancak bir kaç bileşen gereklidir. bir 100Xyüksek sayısal açıklık (1.45NA) objektif 100 nm mertebesinde tek mikrotübülleri ve uzunluk değişiklikleri gidermek için gereklidir. Dönen bir disk konfokal tarayıcı dışı odak ışığı bloke ederek, Photobleaching ve toksisite en aza indirmek için, ve sadece odak ışığı toplayarak, çözünürlük ve hassasiyetini maksimize etmek için gereklidir. EMCCD kamera zaman atlamalı edinimi her 90 ms boyunca yeterince GFP-Tub1 sinyalini toplamak için hızlı ve hassas olmalıdır. Şu anda, EMCCD kameraları bu uygulama için en iyi seçimdir. Mevcut CMOS sensörü kameralar üst uç EMCCDs duyarlılığını eksikliği; Ancak, bu teknoloji önemli ölçüde geliştirmektedir ve yakında uygun olabilir. Son olarak, bir piezoelektrik aşama dört boyutlu bir görüntü elde etme hızı sınırlayıcı adımdır olabilir Z, hızlı ve hassas bir hareket, için gereklidir.
Benzer ekipman kolayca temin değilse bu protokolde tarif edilen spesifik mikroskop sistemi bir bariyer oluşturabilir. değişiklikler cBir farklı görüntüleme sistemleri karşılamak için yapılacak, ancak bu değişiklikler geçici ve / veya uzaysal çözünürlüğü pahasına gelebilir. Mil tahrikli aşamalı motor piezoelektrik aşamasının yerine kullanılabilir. Ancak bu motorlar, daha yavaş daha az doğru ve sürüklenmeye yatkındır. Alım sonrası görüntü stabilize eklentileri bu motorla çalışan aşamaları ile ilişkili XY boyutlarda sapmasını minimize etmek için kullanılabilir. Buna ek olarak, yavaş okuma hızı ile alternatif kameralar kullanılabilir. Daha yavaş alma hızına yerleştirmek için, Z-serisi daha az sıklıkta toplanabilir olabilir (yani Z-serisi arasında daha fazla süre). Ancak, Z-serisi arasındaki zamanı artırarak timepoints arasında oluşabilecek kayıp geçişler riske atar. Alternatif olarak, Z-düzlemleri arasındaki mesafe Z serisi başına toplanan görüntülerin sayısını azaltılması için bir yol olarak arttırılabilir. Ancak, bu boşluğu artan Accur için deneycinin yeteneğini bozar düzlemler arasındaki görüntü bilgilerini, kaybetme riskiyle karşı karşıyaulaştırılması mikrotübül uçlarını tespit. Açıkçası, değişiklikler alternatif görüntüleme sistemlerini yerleştirmek için yapılabilir, ancak bu değişikliklerin görüntü bilgilerinin potansiyel kaybına karşı tartılmalıdır.
üç boyutlu görüntü yığınlarının iki boyutlu görüntü çıkıntılar dönüştürülür, bu protokolün bir diğer sınırlılığı uzaysal bilgileri kaybıdır. bir ön-anafaz maya hücresinde bir tek astral mikrotübül sitoplazma üç boyutlu alan boyunca uzunluğu ve projelerde tipik olarak 0.5 ve 2.0 mm. Z-konumlarında bir dizi görüntüler bireysel Mikrotubullerin tüm uzaysal bilgileri toplamak için kazanmak nedenle çok önemlidir. Bir zaman atlamalı edinme, bu 3000 görüntülerin toplam 150 zaman noktalarında her birinde 20, Z-dilimleri, bir karmaşık veri kümesi üretebilir. Bu sorunu aşmak adına ve görüntü analizi basitleştirmek için, Z-yığınlarının mekansal bilgi analizi sırasında sıkıştırılır. Bu benef ikenonun analizi, bu Z-boyuttan mekansal bilginin ücrete tabidir. Z-boyutu sıkıştırıldığında ne kadar bilgi kaybolur? Bu kaybı tahmin etmek için, deneyler Spc110-GFP etiketli SPBs yüksek sinyal-gürültü oranına sahip küresel odaklar için ölçmek için nispeten kolay olan, önceden anafaz hücrelerinde, SPBs arasındaki mesafeyi ölçmek için gerçekleştirildi. Mil astral mikrotübülleri daha Z farklı deplasmanı göstermeyen rağmen, ortalama uzunluğu (yaklaşık 1.5 um) ve bu nedenle, faydalı bir vekil sağlamaktadır benzerdir. Mil uzunlukları, ortalama olarak,% 15 daha fazla, aynı iğ iki boyutlu çıkıntılar (JM, yayınlanmamış sonuçlar) ölçüldüğü zaman daha tam bir üç boyutlu görüntü yığınlar halinde ölçüldüğü zaman. Bu nedenle, basit bir veri seti ve ölçümlerin yarar atılır Z bilgilerin eksiksiz karşı değerlendirilmelidir.
maya hücre biyolojisi topluluğu görüntüleme mikrotübül networ için çok yönlü bir araç seti geliştirdiks. Bu / Tub1-tubulin a kaynaşmış ve çeşitli oksotrofik belirteçler ile işaretlenmiş floresan proteinleri çeşitli içerir. Bu yapılar, LEU2 :: GFP TUB1 kromozomal LEU2 mahaline en entegre (pSK1050) 11, ve URA3 :: GFP TUB1 (pAFS125) 16 de dahil olmak üzere, URA3 lokusuna entegre GFP ve diğer fluorophores için çeşitli füzyonları, URA3 :: CFP-TUB1 (pAFS125-CFP) ve URA3 :: pHIS3 mCherry-TUB1 (pAK011) 17. Buna ek olarak, çeşitli fluoresan proteinleri Tub1 füzyonlarının bir dizi yakın ya kromozomal URA3 lokusuna ya da doğal TUB1 lokusu 18 bitişik bir mahale hedef entegrasyonu oluşturuldu. fluorophores ve işaretleme maddelerinin bu geniş paleti diferansiyel etiketli proteinler ile birlikte yer belirleme deneyleri için kullanışlıdır. GFP-Tub1 füzyon mikrotübüllerle zaman atlamalı görüntüleme için en iyi araç kalırnedeniyle parlaklık ve fotostabilite için bule dinamiği. Şarkı ve Lee (pSK1050) 11 tarafından oluşturulur, GFP-Tub1 füzyon α-tübülin / Tub1 amino terminaline GFP füzyon içerir ve lösin oksotrofi kurtarmak için LEU2 mahaline en bütünleştirir. Bu durumda, füzyon proteini doğal α-tubulin ek olarak ektopik ifade edilir ve hücre 9 ~ toplam α-tubulin% 20 ihtiva eder. Önemli olarak, GFP-Tub1 füzyon doğal α-tübülin / Tub1 (JM, yayınlanmamış sonuçlar) fonksiyonu kurtarmak değildir. Bu aynı zamanda, diğer TUB1 füzyon geçerlidir 18 oluşturur.
Mikrotübülleri ve bunların bağlayıcı proteinleri görselleştirmek için kullanılabilir araçları ile, mayayı tomurcuklanan tübülinleri ve diğer mikrotübül düzenleyiciler mutasyonları incelemek için ideal bir sistemdir. Ayrıca, tubulin genlerinin sınırlı sayıda mutant tübülinin homojen havuzunun doğrudan çalışma için izin verir. mutasyonlara ek olarak olaraktübülin geni, maya tomurcuklanan metazoan meslektaşları homolog olan mikrotübüle bağlı proteinlerin (MAP) bir dizi vardır. Bunlar MAP doğrudan incelenebilir ve mutasyonlar tek mikrotübül filamentler üzerinde sahip olduğu etkileri de incelenebilir. Burada ayrıntılı protokol mikrotübül dinamiklerini etkileyen içsel ve dışsal süreçlerin hem soruşturma için izin verir.
Özetle, mikrotübül birçok hücresel süreçlerin içinde işlevlerini tam olarak dinamik olmalıdır. Tübülüne içsel faktörler ve mikrotübül dinamiklerini düzenleyen dışsal ilişkili proteinleri anlamak gereklidir. mayayı tomurcuklanan doğrudan tek mikrotübül dinamiklerini nicelenerek bu faktörlerin etkisini incelemek için ideal bir sistemdir. Yukarıda ayrıntıları verilen protokol stabil olarak maya genomuna bir floresan füzyon proteinini entegre ve nasıl elde etmek ve konfokal görüntü in vivo olarak mikrotübül dinamiklerinin ölçmek için yığınlarının analiz açıklamaktadır
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Yazarlar hiçbir rakip mali çıkarları olduğunu beyan ederim.
Acknowledgments
Çeşitli FP-TUB1 plazmidler paylaşımı için Kerry Bloom (Kuzey Carolina Üniversitesi), Kyung Lee (NCI), Steven Markus (Colorado Eyalet Üniversitesi), ve Elmar Schiebel (Universität Heidelberg) teşekkür ederim. Biz slayt odası hazırlama yönteminde bizi eğitimi için Melissa Gardner (Minnesota Üniversitesi) minnettarız. Bu çalışma Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) (JKM kadar) R01GM112893-01A1 ve (CE) T32GM008730 hibe tarafından desteklenmiştir.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| DOB (dropout bases) | Sunrise science | 1650 | |
| CSM-Leu | Sunrise science | 1005 | |
| Agar | Ameresco | N833 | |
| 100 mm polystyrene plates | Fisher Scientific | FB0875713 | |
| ssDNA (Samon Sperm) in sterile DiH2O | Sigma-Aldrich | D7656 | resuspend at 10 mg/mL in DiH2O. Store aliquots at -20 ºC |
| Synthetic Complete Media | Sunrise science | 1459-100 | |
| Concanavalin A | Sigma-Aldrich | L7647 | resuspend at 2 mg/mL in DiH2O. Store aliquots at -20 ºC |
| Microscope slides | Fisher Scientific | 12-544-1 | |
| Microscope Coverslips | Fisher Scientific | 12-541-B | |
| Parafilm | Fisher Scientific | 13-374-12 | paraffin film |
| VALAP (Equal parts of Vaseline, lanolin and paraffin) | melt at 75 ºC before use | ||
| forceps | Fisher Scientific | 16-100-106 | |
| Poyethylene glycol (PEG) 3350 | Sigma-Aldrich | 202444 | |
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Microscope | |||
| Ti E inverted Perfect Focus microscope | Nikon Instruments | MEA53100 | |
| 1.45 NA 100X CFI Plan Apo objective | Nikon Instruments | MRD01905 | |
| Piezo electric stage | Physik Instrumente | P-736 | |
| Spinning disk scanner | Yokogawa | CSU10 | |
| Laser combiner module | Agilent Technologies | MCL400B | |
| EMCCD camera | Andor Technology | iXon Ultra 897 | |
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Software | |||
| NIS Elements software | Nikon Instruments | MQS31100 | |
| Microsoft Excel software | Microsoft | ||
| MATLAB software | MathWorks, Inc | ||
| ImageJ64 | NIH | Rasband, W.S., ImageJ, U. S. National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA, http://imagej.nih.gov/ij/, 1997-2016. | |
| Bio-Formats Importer plug-in | Open Microscopy Environment | ||
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Plasmids | |||
| pUC19-LEU2::GFP-TUB1 | pSK1050 | reference: Song, S. and Lee, K. S. A novel function of Saccharomyces cerevisiae CDC5 in cytokinesis. J Cell Biol. 152 (3), 451-469 (2001) |
References
- Zanic, M., Widlund, P. O., Hyman, A. A., Howard, J. Synergy between XMAP215 and EB1 increases microtubule growth rates to physiological levels. Nat Cell Biol. 15 (6), 688-693 (2013).
- Mimori-Kiyosue, Y., Shiina, N., Tsukita, S. The dynamic behavior of the APC-binding protein EB1 on the distal ends of microtubules. Curr Biol. 10 (14), 865-868 (2000).
- Byers, B., Goetsch, L. Behavior of spindles and spindle plaques in the cell cycle and conjugation of Saccharomyces cerevisiae. J Bacteriol. 124 (1), 511-523 (1975).
- Marschall, L. G., Jeng, R. L., Mulholland, J., Stearns, T. Analysis of Tub4p, a yeast gamma-tubulin-like protein: implications for microtubule-organizing center function. J Cell Biol. 134 (2), 443-454 (1996).
- Spang, A., Geissler, S., Grein, K., Schiebel, E. gamma-Tubulin-like Tub4p of Saccharomyces cerevisiae is associated with the spindle pole body substructures that organize microtubules and is required for mitotic spindle formation. J Cell Biol. 134 (2), 429-441 (1996).
- Winey, M., Bloom, K. Mitotic spindle form and function. Genetics. 190 (4), 1197-1224 (2012).
- Gupta, M. L. J., et al. beta-Tubulin C354 mutations that severely decrease microtubule dynamics do not prevent nuclear migration in yeast. Mol Biol Cell. 13 (8), 2919-2932 (2002).
- Moore, J. K., Cooper, J. A. Coordinating mitosis with cell polarity: Molecular motors at the cell cortex. Semin Cell Dev Biol. 21 (3), 283-289 (2010).
- Gartz Hanson, M., et al. Novel alpha-tubulin mutation disrupts neural development and tubulin proteostasis. Dev Biol. 409 (2), 406-419 (2016).
- Fees, C. P., Aiken, J., O'Toole, E. T., Giddings, T. H. J., Moore, J. K. The negatively charged carboxy-terminal tail of beta-tubulin promotes proper chromosome segregation. Mol Biol Cell. 27 (11), 1786-1796 (2016).
- Song, S., Lee, K. S. A novel function of Saccharomyces cerevisiae CDC5 in cytokinesis. J Cell Biol. 152 (3), 451-469 (2001).
- Knop, M., et al. Epitope tagging of yeast genes using a PCR-based strategy: more tags and improved practical routines. Yeast. 15 (10B), 963-972 (1999).
- Kosco, K. A., et al. Control of microtubule dynamics by Stu2p is essential for spindle orientation and metaphase chromosome alignment in yeast. Mol Biol Cell. 12 (9), 2870-2880 (2001).
- Toso, R. J., Jordan, M. A., Farrell, K. W., Matsumoto, B., Wilson, L. Kinetic stabilization of microtubule dynamic instability in vitro by vinblastine. Biochemistry. 32 (5), 1285-1293 (1993).
- Aiken, J., Sept, D., Costanzo, M., Boone, C., Cooper, J. A., Moore, J. K. Genome-wide analysis reveals novel and discrete functions for tubulin carboxy-terminal tails. Curr Biol. 24 (12), 1295-1303 (2014).
- Straight, A. F., Marshall, W. F., Sedat, J. W., Murray, A. W. Mitosis in living budding yeast: anaphase A but no metaphase plate. Science. 277 (5325), 574-578 (1997).
- Khmelinskii, A., Lawrence, C., Roostalu, J., Schiebel, E. Cdc14-regulated midzone assembly controls anaphase B. J Cell Biol. 177 (6), 981-993 (2007).
- Markus, S. M., Omer, S., Baranowski, K., Lee, W. L. Improved Plasmids for Fluorescent Protein Tagging of Microtubules in Saccharomyces cerevisiae. Traffic. 16 (7), 773-786 (2015).
