Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Neuroscience

果蝇调理作为学习和记忆的措施

Published: June 5, 2017 doi: 10.3791/55808

Summary

该协议描述了称为求爱条件的果蝇学习和记忆测定。这种经典的测定是基于不接受预先的女性的性拒绝后男性求爱行为的减少。这种自然形式的行为可塑性可用于测试学习,短期记忆和长期记忆。

Abstract

通过在模型生物体(如果蝇, 黑腹果蝇)中使用简单的行为分析,已经阐明了对学习和记忆底层的分子机制的许多见解。 果蝇可用于了解由与智力障碍(ID)和自闭症相关的人类认知障碍相关基因突变引起的认知缺陷的基本神经生物学。这项工作描述了一种使用被称为求爱条件的果蝇的经典范例来测试学习和记忆的方法。男性苍蝇法庭女性使用明显的易于识别的行为模式。预定的女性不接受交配,并将拒绝男性的交配尝试。为了回应这一拒绝,男性苍蝇减少了他们的求偶行为。随着时间的推移,这种学习减少求偶行为是衡量学习和记忆能力的指标。基本的num该测定的理论输出是求偶指数(CI),其定义为男性在10分钟间隔期间花费的时间的百分比。学习指数(LI)是与没有以前的社交相遇的天真苍蝇相比,已经暴露于预先的女性的苍蝇中的CI的相对减少。为了对基因型之间的LIs进行统计学比较,使用了自举的随机化测试。为了说明测定法如何用于解决与学习和记忆有关的基因的作用,本文对此表征了二羟丙酮磷酸酰基转移酶Dhap-at )的泛神经元敲低。 Dhap-at甘油磷酸O-酰基转移酶GNPT )的人类直系同源物参与了2型严重软骨发育不全症,特征为严重的ID的常染色体沉默综合征。使用求偶条件测定法,确定Dhap-at是长期记忆所必需的,但不是短期记忆。该结果作为进一步研究潜在分子机制的基础。

Introduction

在许多物种中,学习和记忆的分子机制是保守的。嗅觉学习和记忆缺陷的果蝇黑腹果蝇突变体系的开创性工作筛选为基础学习和记忆的过程提供了关键的分子洞察1 。这些研究确定了一些参与学习和记忆的第一个基因,如芸香花2失忆 3和猝死4 ,揭示环磷酸腺苷(cAMP)信号传导的关键作用5

记忆突变体的早期遗传筛选主要使用嗅觉调理进行。然而,随着时间的推移,出现了几种测量其他形式的学习和记忆的方法。最广泛使用的学习和记忆范式之一以及这里描述的测定法被称为c这是由Siegel和6号馆首先描述的,然后由其他几个研究组7,8,9提炼。求偶调理取决于在交配过程中由男性沉积的雌性腹部上存在特定的信息素(醋酸顺式乙酰胆碱)。感觉女性腹部的cVA自然降低了求偶行为,当加上女性拒绝的行为时,cVA对男性求爱减少的影响显着增强。通过观察其独特的求偶行为,可以容易地量化男性苍蝇的反应,其特征在于朝向和跟随雌性,叩击,延伸和振动翼,舔和尝试交配10图1A )。雄蝇学会区分接受处女和不接受交配的女性11之间的h,并且在性拒绝之后,他们向不接受的女性展示了9天的求偶行为。这种自然行为可用于阐明学习,短期记忆(STM)和长期记忆(LTM)8,9,12的机制。学习被定义为在训练期间立即减少求偶行为,通常被称为即时回忆记忆,在暴露于配偶女性6,8之后0至30分钟测量。在训练后30分钟和1小时之间测量STM,而训练后24小时最常测量LTM( 图1B )。 STM可以使用1小时训练期诱导,但只持续2-3小时s =“xref”> 6,8。在大多数学习范例中,LTM只能通过间歇反复训练来诱导。 Mcbride (1999) 8显示,三次间隔1小时的培训课程足以诱导持续长达9天的求偶记忆,与单次1小时训练课程诱导的2-3小时相反。 McBride 等人 8还表明,单一的5小时训练课程产生了长达9天的相似的LTM反应。苍蝇不要在这个5小时期间不断地进行法庭训练,实际上是在一次训练中产生自己的间歇训练来诱导LTM。从实践的角度来看,这是非常重要的,大大增加了该测定法可用于研究LTM的容易程度。目前的协议主要针对LTM 11,12采用7小时的单次训练。几项研究调查不同在求偶学习的不同方面具有特定缺陷的突变条件。例如,蘑菇体消融影响STM和LTM,但不学习8遗忘基因的突变首先被定义为使用嗅觉调理3的记忆的特异性调节因子,影响STM而不是学习6 。翻译调节子orb2(oo18 RNA结合(orb)CPEB2亚科)和蜕皮激素信号的破坏专门影响LTM 9,13。因此,求爱条件是解剖学习和记忆不同阶段的机制的有用范例。

这项工作展示了一个优化的实验设置,允许求和条件的相对高通量的测试。此外,它描述了统计分析脚本,并讨论了测定的关键因素。是sh自己在这里认为果蝇基因磷酸二羟基丙酮酰基转移酶Dhap-at 在LTM的神经元中是必需的,但不适用于STM。该基因的人类直系同源物, 甘油磷酸O-酰基转移酶GNPAT ),在2型14型的根茎性软骨发育不全症突变中,其特征在于严重的智力障碍,癫痫发作和其他几种临床特征15的常染色体沉默症。在这种情况下,求偶调节可用于功能验证人类疾病基因在学习和记忆中的作用,为机械研究提供依据。

Protocol

注意:在下面列出的协议中,描述了一系列的收集,训练和测试。为了测试结果的可重复性,这些步骤应该在多天并行并且分开的苍蝇组( 表1)重复。该方案基于从蛋到成虫的10天生命周期,当在25℃,70%湿度和12小时光/暗循环的恒定条件下饲养苍蝇时,这是正常的。该协议的所有方面假设条件在整个测定中保持不变。时间在灯开启前(BLO)或照明灯开启(ALO)后的小时表示,因为这可以根据研究人员的首选时间方便地进行设置。仅使用二氧化碳气体初次收集幼稚的雄蝇,并收集预先的女性。该求求条件协议由以下步骤组成:

  1. Ë建立预选的女性收藏文化
  2. 建立收集男性考试科目的文化
  3. 房屋的准备
  4. 建立用于生产标准化预先女性的交配瓶
  5. 收集男性考试科目
  6. 训练
  7. 测试
  8. 视频数据分析和统计

1.预设女性收藏文化的建立

  1. 准备精力充沛16 。煮沸0.8%(w / v)琼脂,8%(w / v)酵母,2%(w / v)酵母提取物,2%(w / v)蛋白胨,3%(w / v)蔗糖,6% w / v)葡萄糖,0.05%(w / v)MgSO 4和0.05%(w / v)CaCl 2水溶液15分钟。在加入0.05%(w / v)的对羟基苯甲酸甲酯(小心:有毒)和0.5%(v / v)丙酸(注意:有毒)之前,将溶液冷却至70℃。搅拌均匀,同时冷却至50℃,得到均匀溶液。
  2. 之前的食物是这样的在室温下盖起来,向每个175mL塑料小瓶中加入〜50mL的功率食品。让食物进一步冷却。用插头关闭小瓶。
    注意:Powerfood是一种专门用于生产大量苍蝇的专门食品混合物,大概是通过诱导产蛋。 Powerfood不用于生产用于行为分析的男性蝇(步骤2),因为非典型饮食和潜在的拥挤可能会影响发育。
  3. 在第11天( 表1 ),启动5-20野生型培养物,大约60-100只(男性和女性的混合物)在动力食品小瓶中;这些将在步骤4中用于制作标准化的预先女性17 。在每个小瓶中加入滤纸以增加幼虫可以蛹的面积;这将增加可以减少的苍蝇数量。
  4. 在整个实验中定期重复步骤1.1-1.3,以获得足够的新近飞翔的苍蝇作为输入“建立用于生产标准化前置女性的交配小瓶”(步骤4)。

2.建立男性考试科目收集文化

  1. 准备正常食物16 ,用0.5%(w / v)琼脂,2.75%(w / v)酵母,5.2%(w / v)玉米粉,11%(w / v)糖,0.05%(w / v) )对羟基苯甲酸甲酯和0.5%(v / v)丙酸的水溶液,如步骤1.1和1.2所述。关闭175毫升塑料小瓶与一个飞瓶插头。
  2. 在第-10天( 表1 ),在每个含有正常食物的175mL小瓶中放置大约10-20名男性,约30-75名女性( 材料/设备表 )。添加滤纸以增加瞳孔的表面积并最大限度地提高生产率。
  3. 根据基因型建立三至六个175 mL小瓶,以获得所需数量的测试对象雄性。
    注意:根据所需要的生产力,可能需要更多的小瓶otype。

3.住房块的准备( 图2A

  1. 在微波炉中每个住宅区块融化约50 mL的功率食品,或者将其新鲜烹调。
  2. 使用多分配器移液管向96孔平底块的每个孔中加入500μL功率食品。
  3. 让食物在室温下固化。
  4. 用PCR粘合剂膜覆盖块体,并使用针头每孔至少4个孔,为苍蝇提供新鲜空气。
  5. 为了能够打开每个孔,使用剃刀刀片在每排之间纵向切割粘合剂膜。在胶片的一端离开胶片。
  6. 块可以在4℃下储存长达2天。
    注意:使用前,让块重新平衡至室温。

4.建立标准化预售女性生产的配套样品瓶

  1. 在第-1天,删除和丢弃所有成年野生型苍蝇从预选的女性收集文化在2-5小时BLO。
  2. 使用抽吸器( 图2B )从这些小瓶中以2-3小时间隔( 例如, 30分钟,2.5小时和5小时ALO)收集苍蝇,并将它们放入补充有少量酵母的新功率食品小瓶中粘贴和滤纸。
  3. 为了避免拥挤和促进最佳交配气氛,不要将超过150-200只苍蝇转移到每个新的小瓶中。确保所有女性的交配,提供至少25%的男性。确保足够的雌性存在于交配小瓶中以适应实验的大小。
    注意:由于这是协议中的关键步骤,请确保只有新鲜的苍蝇,没有老苍蝇,幼虫或蛹被转移到新的交配小瓶。
  4. 孵育这些“交配小瓶”四天,以便足够的时间让所有的女性交配。

上校男性测试科目的选择

  1. 在2-3小时BLO的第1天( 表1 ),使用CO 2从雄性收集瓶中除去所有成年苍蝇(步骤2), 但让更多的苍蝇在接下来的几个小时内消失。
  2. 在接下来的5-6小时内,使用二氧化碳每20-30分钟清除一次新近放飞的苍蝇,并使用吸气器将每个雄性放在住房块的单个井中(步骤3)( 图2B )。
  3. 用粘合剂PCR膜重新密封孔。
    注意:这是协议中的关键步骤。男性应该经常收集。收集的男性应该在接近时间的房屋隔离,当它们表现出淡色的色素沉着和半透明的腹部存在胎粪时。
    注意:温和使用吸气器可以转移苍蝇;然而,不当使用会强调苍蝇,导致测定方法的差异(参见讨论)。
  4. 瞄准公司每个基因型最多可以检测到48位男性。这对于分析初始和训练条件所需的最大数量的男性提供了一小部分,允许在以后的转移步骤中发生一些损失。

6.培训

  1. 使用二氧化碳从配套小瓶中取出苍蝇(步骤4.2),并将预先选定的雌雄与男性分开。
  2. 使用吸气器,在一排新的房屋块中的每个井中添加一个麻醉的,预先的女性。
  3. 使用吸气器和无麻醉,将个体初生男性从步骤5.2中设置的房屋块转移到含有预先存在的女性的井中。将男性放入井后,立即用粘合膜重新密封;不要让男人逃跑。
    注意:通过利用自然“负性地质变化”行为将雄蝇从吸气器转移到房屋块(参见讨论)。
  4. 重复步骤6.2-6.3直到足够的雄 - 雌对成立。理想地,根据基因型建立24对,两排全部住房块。将剩余的初始男性留在第5.2步中设置的原始住房块。
  5. 在训练期间保持男性 - 女性对不受干扰( 表2图1B )。
    注意:在这段时间内,男性将被法庭判决,并被预先的女性拒绝。对于学习和STM,培训期为1小时,对于LTM,培训期为7-9小时。
  6. 结束训练( 表2图1B ),使用吸气器轻轻分离男性与预先的女性;不要使用麻醉。将分离的男子放在一个新的住房区。
  7. 使用吸气器将所有幼稚的男性轻轻地从第5.2步中设置的房屋块轻轻地传输到新的房屋块。
    注意:此步骤对于STM和lea是可选的但是对于LTM来说,这是非常重要的,因为苍蝇被安置了另外24小时才能测试LTM。
  8. 对于STM和LTM,允许男性在测试前分别休息1小时和〜24小时( 表2图1B )(步骤7)。
  9. 为了学习,立即测试训练有素和幼稚的男性(步骤7)。

7.测试

  1. 使用CO 2从交配小瓶收集苍蝇(步骤4.2),并将预先的雌性和雄性分离。
  2. 让女性在含有正常食物的小瓶中从麻醉中恢复至少1小时。
  3. 提前安装录像机( 图2C ),以便在测试开始前准备好所有设备。
  4. 根据不同的学习时间表,STM和LTM开始测试( 表2图1B )。训练后立即进行测试用于学习,训练1小时后,LTM培训24小时。
  5. 如果正在测试学习(步骤6.7,训练有素;步骤6.8,天真),使用吸气器,将个体男性从休息的住房区块或训练住房区块中移出,到隔离区域的一半的求偶场上( 图2D ;见建筑图的文件S1)。
    注意:使用自然的“负性地质变化”行为应足以将雄蝇从抽吸器转移到求偶场(讨论)。
  6. 快速但轻轻地将入口移动到下一个竞技场,重复步骤7.5,直到所有18个场地都包含一个男性。
  7. 使用吸气器和无二氧化碳,将一个预先的女性(收集在步骤7.2中)添加到所有18个场地的另一半。
  8. 小心地将求爱室放在照相机下面,井的开口朝下( 图2C
  9. 移除场地的分隔线,以允许男性和预先女性之间的直接相互作用。
  10. 立即开始记录行为至少10分钟。
    注意:当使用双摄像头设置时,可以在重叠的时间范围内并行记录两个求偶板,以最大限度地提高效率。
  11. 使用手持吸尘器清空求爱场所,并允许求爱室在重新使用前通风。
  12. 重复步骤7.4-7.11直到所有基因型和条件的测试( 天真和训练)已经完成。

8.视频数据分析与统计

  1. 计算求偶指数(CI),定义为男性法庭在测试期间的前10分钟内对每个单独的雄性飞行所占的时间百分比。
    注意:这可以通过观察刻板的求爱行为( 图1A )或您的手动完成唱电脑软件,用于自动量化求爱行为(讨论)。
    注意:建议在三天内分析每个病情40-60名男性,以达到足够的统计学能力,并判断CI数据的一致性。
  2. 计算学习指数(LI),定义为与未成年男性相比,训练男性平均CI的百分比降低(LI =(CI naive - CI 训练 )/ CI 天真 )。评估每一天的LI测试,并将其与从所有测试日合并计算的累积LI进行比较。
  3. 使用“基因型”和“CI”作为标题单独的两列选项卡数据文件。
    注意:这些标题区分大小写。每个CI的基因型名称必须包括基因型的描述,后跟下划线和训练条件( 例如,基因型-N和基因型-LTM等,其中N =naïve和LTM =长期记忆;参见补充文件S2作为示例)。该注释是必不可少的,因为该功能将基于“基因型”列中第一个下划线之后的字符识别经过训练和幼稚的苍蝇。
  4. 使用Analystn R脚本(补充文件S3)进行随机化测试,以判断来自不同基因型的LI值之间的差异的统计学显着性。
    1. 将脚本(补充文件S3)导入到R 18中 ,其定义了一个称为“analnn”的函数。
      注意:函数定义是:analaryn < - function(nboot = 10,000,naivelevel ='N',refmutation = NA,datname = NA,header = TRUE,seed = NA,writeoutput = TRUE)。
    2. 通过在R命令行中输入“analearn()”并通过弹出窗口选择要分析的数据文件(在步骤8.3中生成)来启动该功能。
    3. 选择参考突变,其中是控制基因型,输入相应的数字并按enter键。
      注意:选择参考基因型后,脚本需要几秒钟才能执行10,000次引导重复。
    4. 观察输出表(表3),其中包含基因型,学习条件( 学习,STM或LTM),平均CI天真,平均CI训练,LI,控制的LI与实验条件之间的差异(LI dif),LI dif的95%置信区间的下限(LL)和上限(UL),以及表示没有显着差异的概率的p值。
      注意:analnn将将输出文本文件存储在数据文件所在的目录中。但是,输出表也出现在R-Studio控制台中。默认名称是根据提供的数据文件的名称构建的。
    5. 在分析函数中有几个可以用来改变de的参数功能的故障设置来调整自举参数。
      注意:“nboot”定义了引导重复次数,默认设置为10,000。该值可以更改为大于零的任何整数。表5列出了可用于更改功能的默认设置的几个参数。但是,建议不要使用数量少的自举重复生成的数据。

Representative Results

求偶条件测定可用于测量果蝇的学习和记忆。为了证明这一点,这里给出的结果分析与控制苍蝇相比,STM和LTM与具有Dhap-at的神经元特异性敲低的苍蝇相比。控制雄性表达靶向秀丽隐杆线虫特异性基因的RNA干扰发夹序列,推定的锌指蛋白C02F5.12 19 。该对照菌株在相同遗传背景下确保了敲除和对照之间相同数量的上游激活序列(UAS)元件,并且对照RNAi发夹解决了RNAi系统的任何非特异性作用。对照男性(基因型: UAS-dcr2 / +; P {KK108109} VIE-260B / +; elav-Gal4 / + )显示了对于两种STM的训练对初始的CI的显着降低( 图3Ap = 1.2×10- 4 ,Mann-Whitney U检验)和LTM( 图3Bp = 1.2×10 -4 ,Mann-Whitney U检验)。这个结果反映了这些苍蝇的学习和记忆的正常能力。对于STM,训练有素的幼虫( 图3Ap = 1.2×10 -4 ,Mann-Whitney U检验)。然而,它们在LTM训练后没有显示出CI的显着降低( 图3Bp = 0.33,Mann-Whitney U-检验)。 Mann-Whitney U检验用于比较初始和训练苍蝇的平均CI,这是由于某些条件下CI数据的非参数分布( 图3A3B )。通过CI的分析观察到的差异由LI针对每个基因型反映出来,其测量百分比减少在幼稚与受过训练的苍蝇中的CI( 图3C )。在对照组和对照组的Dhap-at敲低蝇中,LI( p = 0.115,10,000次引导重复, 图3C表3 )之间的LI没有显着差异 ,而LTM中的L1在Dhap-at击倒蝇中显着较低( p = 0.0034,10,000次引导重复, 图3C表3 )。为了比较基因型之间的LI,随机化测试20适用于Kamyshev 等人首先推荐的方法 7被使用。由于LI是来自人口数据的单一值( 平均CI初始和平均CI训练),所以依赖于实验派生分布的标准统计方法不适用。随机化测试是无分布的,并且使用自举( 随机抽样)ng),以产生从实际数据导出的假设数据集。分析脚本(File S3)为每个基因型生成一组假设的LI,并计算对照和测试基因型(LIdiff)之间的差异。该过程重复10,000次,结果值用于确定LIdiff的95%置信区间( 表3 )。该数据用于生成指示两种基因型的LI不同的概率的p值。这里显示的结果表明,Dhap-at在LTM神经元中是必需的,但不适用于STM。

为了控制日常变异性,在复制天数之间比较CI和LI( 表4 )。尽管每天都观察到LI的一些波动,但结果通常是可重复的。重要的是要注意,CI数据可能会因控制str而有很大差异ain使用和环境条件的测试。这里显示的CI数据是典型的这种对照基因型,但其他基因型可能表现出更高或更低的平均CI和分布。

图1
图1:求助指数的确定和实验概况。A )展示了对女性飞行的刻板男性求爱行为的图像。示出了不同阶段的求偶行为:方向(I),以下(II),机翼振动(延伸)和攻丝(III),舔(IV)和尝试交配(V)。 ( B )相对于孵化器轻循环的训练和测试时间的示意图,以小时为单位。培训时间用条形表示,STM和LTM的休息时间用虚线表示,测试起始点用箭头表示。请注意LTM的测试时间是训练后的第二天。 请点击此处查看此图的较大版本。

图2
图2:用于果蝇求助调理分析的设备。A )住房块是一个平坦的底部块,每个孔具有500μL的功率食物。用qPCR粘合剂膜密封,每个孔至少有4个孔,使用直径为0.8mm的注射器针产生。使用剃刀刀片将各行纵向切割成条,以允许打开和关闭。 ( B )无需麻醉,需要抽吸器轻柔转移雄性和雌性苍蝇。插图显示吸气器的尖端,用一块棉花封闭注意提示内的苍蝇​​。 ( C )设置双摄像机系统,同时录制两个求爱室。 ( D )拥有18个场地的求偶室。使用滑动进入孔将苍蝇放置在场地中。白色分隔线可以同时打开,以发起男性和女性之间的相互作用。 请点击此处查看此图的较大版本。

图3
图3:控制中的STM和LTM的分析和敲击飞行中的Dhap。AB )显示对于STM(A)和LTM(B)测试的对照(灰色)和Dhap-at敲低(白色)基因型的初始(N)和训练(T)蝇的CI值的分布的盒图。 ( C )Correspo对于STM和LTM测试的控制和Dhap-at击倒飞行的确定 LI值。使用随机试验(10,000次引导重复)比较对照和敲低基因型之间的LI差异。误差条表示在不同测试日计算出的LI值的平均值的标准误差。基因型为: w +,UAS-dcr2 / + ; P {KK108109} VIE-260B / + ;和elav-Gal4 / + (对照) w +,UAS-dcr2 / + ; VIE-260B / +;和elav-Gal4 / +Dhap-at- RNAi)。 请点击此处查看此图的较大版本。

一般 搜集 培养 测试
day -11 开始预先的女性收藏文化(步骤1.3)
天-10 开始收集男性受试者的文化(第2.2步)
第1天代表。 1
第2天代表。 2
第3天代表。 3
第4天代表。 4 代表。 1
第5天代表。 2 代表。 1
第6天代表。 3 代表。 2
第7天代表。 4 代表。 3
第8天代表。 4
第9天视频数据分析和统计(步骤8)
rep =重复

表1用于在个别天数上测试三次复制的LTM的示例时间表。

学习 STM LTM
训练时间 1小时。 1小时。 8小时。
休息时间 0小时。 1小时。 〜24小时。
开始训练 0H。 ALO 0小时。 ALO 4小时BLO
停止训练 1小时。 ALO 1小时。 ALO 4小时ALO
开始测试 1小时。 ALO 2小时ALO 0小时。 ALO(第二天)
ALO =灯亮后,BLO =开灯前,STM =短期记忆,LTM =长期记忆

表2学习,STM和LTM的培训时间,培训时间和测试时间。

基因型 学习
条件
CI
幼稚
CI
熟练

区别
下限
(95%信心间隔)
上限
(95%信心间隔)
p值
控制 STM 0.467 0.116 0.752 NA NA NA NA
DHAP-AT-RNA干扰 STM 0.699 0.257 0.633 0.119 -0.030 0.265 0.116
控制 LTM 0.590 0.384 0.348 NA NA NA NA
DHAP-AT-RNA干扰 LTM 0.697 0.650 0.068 0.280 0.103 0.446 0.003

从分析脚本中产生的统计数据。包含基因型,学习条件( 学习,STM或LTM)的引导R脚本的输出文件意味着CI天真,平均CI训练,LI,控制LI与实验条件之间的差异(LI dif) ,LI dif的95%置信区间的下限(LL)和上限(UL),以及表示无显着差异的概率的p值。

控制 DHAP-AT-RNA干扰
平均CI天真 平均CI训练 平均CI天真 平均CI训练
STM 第1天 0.300 0.125 0.584 0.679 0.239 0.648
第二天 0.634 0.107 0.831 0.720 0.276 0.617
每天 0.467 0.116 0.752 0.699 0.257 0.633
LTM 第1天 0.590 0.441 0.252 0.630 0.646 -0.027
第二天 0.640 0.363 0.432 0.709 0.710 -0.002
第3天0.547 0.349 0.363 0.738 0.598 0.190
每天 0.590 0.384 0.348 0.697 0.650 0.068

表4在独立测试日获得的CI和LI值。

“naivelevel”确定将识别每个基因型的天真值的文本。默认值为“N”,但可以更改为任何其他字母数字文本。
默认情况下,“refmutation”设置为“NA”(不适用),但可以更改为控件或基因型的名称,以执行统计比较。
这将导致script自动选择对照基因型。
“datname”是指数据文件的名称,可以在此参数中指定,而不是默认的文件选择。
“头”可用于指示数据文件是否包含列标题。
默认值为“TRUE”,但是当此参数更改为“FALSE”时,可以使用不带标题的文件。
“seed”初始化随机数生成器,默认设置为“NA”,并在每次使用脚本时确保随机数。
通过设计,即使使用相同的数据文件,引导分析也会在每次运行时产生稍微不同的结果。
当种子被大于零的任何整数指定时,获得同一组随机引导样本。
“写出 put“可以设置为”TRUE“或”FALSE“,以确定是否生成输出文件。默认值为“TRUE”。

表5:分析函数中可用于修改功能的默认设置以调整引导参数的参数

补充文件S1:求爱室的建筑计划。可以使用允许.stp扩展名(CAD文件)的任何应用程序打开该文件请点击这里下载此文件。

补充文件S2分析脚本的输入文件示例 。S2.zip“target =”_ blank“>请点击此处下载此文件。

补充文件S3Anal.n.R脚本。该文件可以用R-studio 18打开。 请点击这里下载此文件。

Discussion

求偶条件测定法是分析果蝇学习和记忆的典型范例。这里提出的协议遵循前面6,7,8,9所述的一般方法但包括独特方面,如实用指南,专门设备和用于随机化测试的数据分析脚本9,12。使用该协议,可以使用96孔平底块( 图2A )并行分析大量苍蝇,以收集和训练雄性。这些块用PCR粘合剂膜密封,这使得苍蝇在需要时容易接近。此外,这里描述的独特的求爱室允许在近二维空间中同时配对18个男 - 女对,最适合视频分析。定制的求爱室易于使用,并提供建筑计划( 文件S1图2D )。该协议从用于收集测试对象到收集视频数据的文化的建立需要大约20天( 表1 )。视频数据分析需要额外的时间。根据我们的经验,STM测定非常强大。 LTM测定也相当健壮,但对混合环境变量更敏感,因此可能难以掌握。

动物行为可以变化很大。因此,必须小心执行协议中的关键步骤以减少此方差。首先,温和地使用吸气器( 图2B )可以减轻粗暴处理或吹出太强烈的压力。提出个人转让方式从吸气器出发是通过使用负面的地理位置。随着苍蝇往往走起来,可以简单地将吸嘴的尖端向上;在飞行到达提示之前,轻轻的打击就足以让飞出。此外,为了让男性在测试之前进入求爱室,打击往往是没有必要的。

另一个重要的步骤是收集和产生男性考试科目。所有的男性在年轻的时候都必须收集,社会上是天真的。这可以通过在羽化的高峰期期间频繁收集来实现(步骤5.2)。如果在这个紧张的时间内没有收集到男性,他们可能会有早期的社交互动,这可能导致学习不良或CI的高度变异性。应评估的男性测试对象的另一个因素是遗传背景。不同的遗传背景将表现出不同程度的初始求爱,并且一般活动或运动能力也可能不同。当compa环多重基因型,应考虑遗传背景,以避免可能影响李分数的这些混杂因素。此外,应仔细评估CI数据的分布。 CI数据可以是参数和非参数,这取决于基因型或其他环境因素。在某些情况下,如果CI的分布显着地偏离正态分布,那么使用中位数CI而不是用于计算LI的平均值可能会更好。然而,在我们的经验中,中位数或平均CI的使用在数据的统计解释方面没有任何差异,平均CI的使用是文献中的常见做法。

对于成功的求爱条件,在训练期间积极拒绝预先女性的男性求爱意图至关重要。重要的是确保在该测定中使用的预先使用的雌性已经被有效地交配并且是因此不允许交配。这种预先建立在步骤4中制备的交配小瓶中,其中雄性和雌性苍蝇一起饲养4天( 表1 )。随后,可以通过定期检查测试视频和在训练期间观察男性 - 女性对来监测交配。如果交配确实发生,在预备的女性的准备过程中可以采取几种措施。首先,在最佳育种条件下,应先预选女性。可以用酵母糊和折叠滤纸补充小瓶以增加潜在的配对面。在这里描述的条件下,苍蝇的孵化已经在过去产生了强大的预先的雌性,但是这可能在不同的实验室和使用不同的遗传菌株中变化。因此,可能需要通过改变孵育时间和条件来优化预先女性的产生。

求爱行为的定量是该协议的另一个关键步骤。这可以手动或使用专门的软件程序自动完成。自动量化速度快,原则上是无偏见的。已经出版了几个节目21,22,23 ;然而,它们不是直接使用,通常需要专门的视频格式和高级计算技能。手动量化容易准确,但是劳动密集度高,受个体差异和偏差的影响。重要的是要强调,该协议不能满足视频格式化对于CI的自动化量化可能需要的要求。对于手动量化,使用任何简单的视频录制设备,可能产生足够质量的视频,以准确地观察求爱行为。对于自动量化,可能会有所不同要求取决于所使用的软件,如果需要自动量化,用户应彻底调查。

结合可用于苍蝇遗传操作的广泛工具,求偶条件测定提供了强大的读数,可用于解剖学习和记忆中涉及的分子机制和神经元网络。

Disclosures

作者没有什么可以披露的。

Acknowledgments

我们承认维也纳果蝇资源中心提供果蝇菌株。此外,在本研究中使用从布卢明顿果蝇库存中心获得的种群(NIH P40OD018537)。这项研究部分得到欧盟FP7大型综合网络Gencodys向KK,HvB和AS以及NSERC发现和CIHR项目拨款的支持

Materials

Name Company Catalog Number Comments
P{KK101437}VIE-260B VDRC 101437 Dhat-at-RNAi in 60100 background 
P{KK108109}VIE-260B - - Control-RNAi in 60100 background (gift from K. Keleman)
w+, UAS-dcr2/yhh;;elav-Gal4 (III)  - - panneuronal driver line
Containers for plant tissue culture VWR 960177 175 mL plastic vials
Folded filters Whatman 10311643 Filter paper to enlarge area flies can pupate on 
Flat-bottom blocks (96-wells) Qiagen 19579 Used for housing blocks
MicroAmp Clear Adhesive Film Applied Biosystems 4306311 PCR adhesive film as lid on flat-bottom blocks
Razor blade - - Any sharp will do
Needle  - - 0.8 mm diameter
Aspirator - - Cut a 1mL pipet tip with scissors in order to have two pieces. The narrow tip of the pipettip is placed as fly entrance in a ~80 cm flexible hose. To prevent a fly from getting in the hose, a normal piece of cotton or small mesh gaze is placed in between the tip and the hose. The other half of the pipettip can be used as mouth piece at the end of the hose. 
Courtship chambers - - file S1 can be opened with indicated CAD software 
Camcorder Sony - camera specification: >4M pixels, full HD.
For manual quantification, any simple video recording device has the potential to produce a video of sufficient quality to observe courtship behavior accurately. For automated quantification, there will likely be different requirements depending on the software to be used, and users should investigate this thoroughly if automated quantification is desired.
Name Company Catalog Number Comments
power food
Agar Sigma A7002
Yeast Bruggeman -
Yeast extract MP biomedicals 0210330391 
Peptone Sigma P6838
Sucrose Sigma S9378
Glucose Sigma G7021
MgSO4 Sigma M2643
CaCl2 Merck 1023780500
Methylparabene (CAUTION) Sigma H5501
Propionic acid (CAUTION) Sigma P1386
Demineralized water -
Yeast paste - yeast grains and water mixture in a 1:1 ratio
Name Company Catalog Number Comments
normal food
Agar MP biomedicals 215017890
Yeast bruggeman -
Corn flour de Molen -
Sugar de Molen -
Methylparabene (CAUTION) Sigma H5501
Propionic acid (CAUTION) Sigma P1386
Demineralized water -

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Quinn, W. G., Harris, W. A., Benzer, S. Conditioned behavior in Drosophila melanogaster. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 71, 708-712 (1974).
  2. Livingstone, M. S., Sziber, P. P., Quinn, W. G. Loss of calcium/calmodulin responsiveness in adenylate cyclase of rutabaga, a Drosophila learning mutant. Cell. 37, 205-215 (1984).
  3. Quinn, W. G., Sziber, P. P., Booker, R. The Drosophila memory mutant amnesiac. Nature. 277, 212-214 (1979).
  4. Dudai, Y., Jan, Y. N., Byers, D., Quinn, W. G., Benzer, S. dunce, a mutant of Drosophila deficient in learning. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 73, 1684-1688 (1976).
  5. Dubnau, J., Tully, T. Gene discovery in Drosophila: new insights for learning and memory. Annu. Rev. Neurosci. 21, 407-444 (1998).
  6. Siegel, R. W., Hall, J. C. Conditioned responses in courtship behavior of normal and mutant Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 76, 3430-3434 (1979).
  7. Kamyshev, N. G., Iliadi, K. G., Bragina, J. V. Drosophila conditioned courtship: two ways of testing memory. Learning & memory. 6, 1-20 (1999).
  8. McBride, S. M., et al. Mushroom body ablation impairs short-term memory and long-term memory of courtship conditioning in Drosophila melanogaster. Neuron. 24, 967-977 (1999).
  9. Keleman, K., Kruttner, S., Alenius, M., Dickson, B. J. Function of the Drosophila CPEB protein Orb2 in long-term courtship memory. Nature Neurosci. 10, 1587-1593 (2007).
  10. Hall, J. C. The mating of a fly. Science. 264, 1702-1714 (1994).
  11. Keleman, K., et al. Dopamine neurons modulate pheromone responses in Drosophila courtship learning. Nature. 489, 145-149 (2012).
  12. Kramer, J. M., et al. Epigenetic regulation of learning and memory by Drosophila EHMT/G9a. PLoS Biol. 9. 9, e1000569 (2011).
  13. Ishimoto, H., Sakai, T., Kitamoto, T. Ecdysone signaling regulates the formation of long-term courtship memory in adult Drosophila melanogaster. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106, 6381-6386 (2009).
  14. Kochinke, K., et al. Systematic Phenomics Analysis Deconvolutes Genes Mutated in Intellectual Disability into Biologically Coherent Modules. Am. J. Hum. Genet. 98, 149-164 (2016).
  15. Buchert, R., et al. A peroxisomal disorder of severe intellectual disability, epilepsy, and cataracts due to fatty acyl-CoA reductase 1 deficiency. Am. J. Hum. Genet. 95, 602-610 (2014).
  16. JoVE Science Education Database. Essentials of Biology 1: yeast, Drosophila and C. elegans. Drosophila Maintenance. JoVE. , Cambridge, MA. (2017).
  17. JoVE Science Education Database. Essentials of Biology 1: yeast, Drosophila and C. elegans. An Introduction to Drosophila melanogaster. JoVE. , Cambridge, MA. (2017).
  18. R Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing. , Vienna (Austria). (2016).
  19. Stepien, B. K., et al. RNA-binding profiles of Drosophila CPEB proteins Orb and Orb2). Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 113, E7030-E7038 (2016).
  20. Basu, D. Randomization Analysis of Experimental Data: The Fisher Randomization Test. J Am Stat Assoc. 75, 575-582 (1980).
  21. Dankert, H., Wang, L., Hoopfer, E. D., Anderson, D. J., Perona, P. Automated monitoring and analysis of social behavior in Drosophila. Nat Methods. 6, 297-303 (2009).
  22. Reza, M. A., et al. Automated analysis of courtship suppression learning and memory in Drosophila melanogaster. Fly. 7, 105-111 (2013).
  23. Schneider, J., Levine, J. D. Automated identification of social interaction criteria in Drosophila melanogaster. Biol. Lett. 10, 20140749 (2014).

Tags

神经科学,第124期,
<em>果蝇</em>调理作为学习和记忆的措施
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Koemans, T. S., Oppitz, C., Donders, More

Koemans, T. S., Oppitz, C., Donders, R. A. T., van Bokhoven, H., Schenck, A., Keleman, K., Kramer, J. M. Drosophila Courtship Conditioning As a Measure of Learning and Memory. J. Vis. Exp. (124), e55808, doi:10.3791/55808 (2017).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter