Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Engineering

透過型電子顕微鏡における微生物の連続超薄切片を得る方法

Published: January 17, 2018 doi: 10.3791/56235

Summary

本研究は、透過型電子顕微鏡の高価な機器なし微生物の連続超薄切片を得るため信頼性が高く、簡単な手順を示します。

Abstract

細胞と細胞成分を透過型電子顕微鏡の高倍率で 3 次元観察試料の超薄切片を準備する必要があります。連続超薄切片の準備は非常に困難であると考えられている適切な方法を使用する場合より簡単です。本稿では微生物の連続超薄切片を安全に取得するためのステップバイ ステップの手順を紹介します。このメソッドの重要なポイントは、: 1) 標本の大部分を使用し、互いに平行になるので、試料の表面とナイフのエッジを調整するには2) グループの連続切片をカット、スリット格子; に連続切片のグループを取得するときに髪の毛のペアを使用してセクションを分離することの難しさを避けるために3) 'セクション保持ループ' を使用してセクション グループの順序を混合しないように4)「水表面調達ループ」を使用してセクションは水頂点に配置され、こと; グリッドの目的の位置に配置するためのグリッドを最初タッチを確認するには5) アルミ ラック支持フィルムを使用し、容易にグリッド上のセクションを回復するしサポート フィルムのしわを避けるために・ 6) 染色チューブを使用し、誤ってピンセットでサポート フィルムを破ることを避けます。この新しいメソッドは、難なく連続超薄切片を取得できます。メソッドは、自動テープ収集ウルトラミクロトーム メソッドとシリアル ブロック顔または集束イオンビーム走査電子顕微鏡を使用して達成することができない、3 D の高解像度で微生物の細胞構造を解析することが可能になります。

Introduction

適切なシリアル極薄断面法は細胞および三次元電子顕微鏡レベルでの細胞成分の研究に不可欠であります。酵母細胞の細胞周期におけるスピンドル極体のダイナミクスを検討し、, 細胞周期と重複1,2,3,の時間の間に彼らの微細構造の形態学的変化を明らかにいる4,5。2006 年に「構造」を組み合わせることで新しい単語 'ストラクトーム」を造語と '-青梅 '、'構造情報、電子顕微鏡レベルで全体細胞の、定量的および三次元' 6,7として定義。

シリアルの極薄断面法を必要とするストラクトーム解析による酵母Exophiala dermatitidisの酵母細胞が約 200,000 リボゾーム78を持っていたことがわかった。大腸菌セル 26,000 リボゾーム9結核菌細胞いた 1,700 リボゾーム10明神らせん状細菌のみ 300 リボゾーム11を持っていた。この情報だけでなく各有機体、9種の同定にも成長率の推定に役に立ちます。

さらに、ストラクトーム解析; 新しい有機体の発見につながったParakaryon myojinensisは、細胞構造が原核生物と真核生物12,13,14,15の間中間日本の海岸沖の深海で発見されました。現時点では、シリアルの極薄断面法マスターに長い時間がかかるので困難であると見なされます。本研究では難なく極薄シリアルセクショニングを実行できます誰も信頼性の高い方法を開発しました。

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

注: この研究で使用される標本は、プロパンと液体窒素で急速凍結された微生物を凍結置換アセトン 2% オスミウム四酸化二を含むとエポキシ樹脂1,2,3、埋め込み 4,5,6,7,8,9,1011,12,13 ,14,15,16,17,18

1. 支持膜 (図 1-3) の準備

注:19ガラスの上の鋳造法を使用しての銀色のホルムバール支持フィルムを用意しています。

  1. 1.5 %100 mL を加えるホルムバール作る装置 (図 1) に二塩化エチレンでホルムバール。ゴム製ボール19を使用して ' を通る空気とソリューションを押すことによって装置の上部の列でホルムバール ソリューション (76 × 26 × 1.3 mm) スライド ガラスの半分を浸しなさい。
    1. 三方活栓を開いて、圧力を減らすために 'b' を通る空気を解放によって列からソリューションをドレインします。スライド ガラスの表面に膜を形成する装置から空気で乾燥してスライド ガラスを取り出してください。ホルムバール フィルムの乾燥を加速するのに白熱ランプを使用します。
  2. (図 2 a)、かみそりの刃でスライド ガラス上のフィルムの 4 つのエッジを削り、スライド20日から映画の分離を容易にするスライドに呼吸にスライド ガラスを浸すことによって水のフィルムをフロートした後、水をゆっくりと低い水平角度 (約 10 °、図 2 b)。
  3. 穴 (直径 4 mm) アルミ ラック (30 mm × 25 × 3 mm) を使用して水からホルムバール映画スクープ (図 3 a)。乾燥器で使用 (図 3 b) までホルムバール フィルムでラックを保ちます。

2. 超音波トリム ブレードと実体顕微鏡 (図 4) の下でかみそりの刃21試料ブロックのトリミング

  1. ブロックの先端 (図 4 a) 光学顕微鏡で観察することによって、ブロックの表面に細胞があることを確認します。
  2. チャック (ブロック ホルダー) で試料ブロックをマウントし、トリミング ステージ21 (図 4 b) のチャックをマウントします。このトリミング ステージには、供試体の背面から照明メカニズムがあります。
  3. 0.7 mm × 1.0 mm (図 4 c、5 d) のサイズにブロックをトリムします。エポキシ樹脂は非常に難しいため、まず超音波トリム ブレードを使用してブロックをトリミングします。超音波トリム ブレードは新たに導入されたマシン、ブロックは簡単に切り捨てられます。それからさらにかみそりの刃が付いているブロックをトリムします。(図 5 d図 8を参照) を切削方向をマークする 1 つの肩をカットします。

3. ミクロトーム (図 5) を使用してダイヤモンド ナイフで試料ブロックのトリミング

  1. ウルトラミクロトームの試料ホルダーのチャックの試料ブロックを設定します。試料を置くシリアル極薄断面が場合の実際の位置に対して反時計回り 90 ° 実行 (参照してください図 5 d)。
  2. ダイヤモンド トリミング ナイフ (参照してください図 5 d) ブロックの表面をカットします。ダイヤモンド ナイフ エッジを標本ブロック面に平行に設定し、全ての試料 (図 5 d) を失うように試料表面の最小量をカットします。
    注: この手順は、試料の表面を滑らかに行われます。スリムな一部の試料表面の一部はそのまま (したがってこの部分は輝いていない鏡、図 5 dのような)、シリアル区分のため試料の任意の部分を失うように。供試体はブロックの表面にさらされるためにです。
  3. (図 5 c) 試料ブロックの切断を監視するナイフ ステージ上ミラー (メサ カット、M) を配置します。
  4. ナイフ ステージ (図 5 a) 左に 30 ° 回転させてトリミング ナイフを使用してブロックの左端 (上側、図 5 d、シリアルセクショニングでサンプルになります) をカットします。
  5. (シリアル断面、図 5 dで試験片の下側になります) 標本の左端からナイフ ステージ (図 5 b) 右に 30 ° を回転させることにより約 100 μ m でのブロックの顔をカットします。
    注: 連続切片は、約 90 の標本のスリムの部分からカットされますサイズ約 1 mm x nm。大きい部分が平行になるよう試料表面とナイフのエッジを調整する使用されます。ナイフ エッジに平行に試料表面を調整した後、大部分はかみそりの刃で削除されます。ミクロトームを用いた試験体の上下を切断することによって試料の両側になり滑らかな正確に平行互い (図 5 d) ストレートと切れ目のないリボンのセクションを取得する必要があります。

4 21を互いに平行に顔を試料表面とナイフのエッジの調整

  1. トリミング ナイフを削除し、標本ブロック 90 ° 右回りに回転します。
  2. 極薄のセクショニング ナイフをナイフ ステージに設定します。
  3. 試験片表面の大きい一部分を使用して互いに平行に顔を試料表面と、鋭利なエッジを調整します。
    注: シリアル断面の切断面が小さいので、特に垂直方向でのみ、この部分を使用して試料表面とナイフ エッジを調整し難いので、標本の大部分は調整に使用です。このように、標本の大部分を使用して容易に調整。

5. 試料ブロック (図 6) のネオプレン ソリューションの広がり

  1. 試料チャックを配置すると、元の位置と同じ位置でするには、チャックとミクロトームのチャック ホルダー テープを適用し、(図 6 a) 境界でカットします。
  2. 試料チャック、ミクロトームから取り出して (図 6 b) 顕微鏡の下に置きます。連続切片の取得元となる、スリムな部分を残してかみそりの刃をもつ試料の大部分を遮断します。
  3. パスツール ピペットを使用して、セクションの側面の接着剤を作るために, 使用する試料に約 1 μ L 0.5% ネオプレン ソリューション (図 6 b) をドロップします。ネオプレン ソリューション全体の標本をカバーします。試料のそばにフィルター紙の部分で余分なネオプレン ソリューションをすぐに吸収します。セクションのリボンを取得シリアル細胞の断面の写真を撮るために不可欠、ネオプレン接着剤は非常に有用なセクションを一緒に付けるため。
  4. 3 スリット グリッドの準備 (スリットのサイズ: 中間、0.4 mm x 2.2 mm、両方側面 0.2 mm × 2.2 mm) (図 6 c) 60 ° にグリッドのハンドルを曲げることによって連続切片を拾う、ため治療 0.5% ネオプレン ソリューション、グリッドとグリッドによって親水性を作るグロー放電22

6. シリアル セクション (図 7-9) を作る

  1. 試料ブロックの場所は、によって録音された部品を整列させる 5.1 (図 6 a) と同じ位置にミクロトームのチャックします。これによりブロックの顔とナイフ エッジお互いに完全に平行。供試体の近くにナイフをもたらします。
  2. ナイフ ボートを水で埋めます。
  3. ミクロトームを気流 (図 7) を防ぐためにプラスチック製のカバーでカバーします。
    注: 問題が発生する極薄切片としばしばセクションの検索中に空気の流れ。プラスチック製のカバーは 3 つの穴: 両眼のレンズの 1 つの穴があり、他の 2 つの穴は、カバーが上にあるときに操作を許可するように腕。木製アームレストは、グリッドと連続切片の取得などの繊細な作業をしながら腕を配置するために使用されます。木製アームレストは、トームにオペレーターの手の振動を送信しないようにミクロトーム テーブル (図 7矢印) から別のテーブルに配置されます。
  4. 200 nm 厚 (図 8) で試料の切削を開始します。200 nm の厚さで設定は、供試体の表面にナイフを持って来ることで時間を節約します。
  5. 最初のセクションは、カット後切片厚を 70 に設定 nm (図 8)。
  6. 連続切片数が 20 (正確に言えば、約 1.8 mm; セクションの数のセクションの幅によって異なりますリボン到達後) に達したとき、切片厚を 10 に設定をカットしながら nm (図 8)。
    注: ミクロトームは、10 nm 厚のセクションを切り取ることはできません、ので新しいセクションが表示されない、以前の断面は、ナイフエッジ離れ離れになっています。髪の毛のペアを使用して手動でセクションを分離することの難しさを避けるために連続切片を拾うため分離されたセクション グループ (図 9) を取得することが重要です。透過型電子顕微鏡の視野は 2.0 mm なのでセクションはせいぜい 1.8 mm をする必要があります。
  7. 切片厚を 60 に設定 nm (図 8)。マシンは以前の 10 nm の厚さを追加しますので、これは 70 nm セクション (図 8) になります。
  8. 切片厚を 70 に設定 nm (図 8) 長 1.8 mm のセクションを取得するまで切断を継続。
  9. 6.6 6.8 を繰り返して 5 1.8 mm 長いセクションが (図 9) を得られます。私たちの研究室で利用できる透過型電子顕微鏡で 5 つの標本のホールダーがあるが、5 は制限されていませんので、通常 5 つのセクション グループを行います。

7. シリアル セクション (図 10-12) を拾う

  1. 'セクション保持ループ'23を配置 (ループの内径: 5.0 mm) (図 10 a) の 3 番目のセクション グループ (図 10 b)。
    注: 正しい順序で写真を撮るための区分の順序でセクションを取得するために必要です。ただし、ナイフ ボートに 5 つのセクション グループがある、のでそれしばしば取得混乱しているグループが。ループを 3 番目のグループに配置することによって、オペレーターの近くに 2 つのグループは、明らかになればオペレーターから遠い 2、2 番目の最初と 4 番目と 5 番目のグループ (図 10 b)。これは順序を混合を防ぐ。
  2. '水表面調達ループ'23を配置 (WSRL、ループの内部の直径: 4.0 mm) (図 11 a) ナイフ ステージ (図 11 b)。WSRL は、底に磁石を備えているためナイフ舞台にしっかりと立つが。
    1. 連続切片のすぐ上のシャフトとのハンドルを移動することによって、WSRL のループを配置します。ループ セクションを取り囲むように水面の上に WSRL のループを下げます。
    2. 水の表面が表面張力 (図 11 c d) によって発生するので下ネジを回してループを押し下げます。ループの中央セクションに移動、水の頂点に位置、髪のストランド21を使用して、断面の方向を調整します。
    3. 裸スリット-グリッド、ピンセットによる開催は、水の表面 (図 11 d) に平行に触れることにより、セクション グループを拾います。セクション最初に、グリッドに触れることがなく、水 (図 11 d) のグリッドの中央に正確にセクションを配置するが重要です。
  3. ホルムバール サポート フィルム16 (図 12)、水の小さなドロップと一緒にセクションでグリッドを配置し、ろ紙を使用して余分な水分を削除します。
    注: 支持膜のしわは、しばしば問題のセクションは、膜 (セクション) は、直接膜 (フィルム) を触れるので支持フィルムとグリッドを使用してピックアップです。サポート フィルムのしわを取得の問題がホルムバール サポート フィルム16水の小さなドロップと一緒にセクション軸受グリッドを配置することによって削減します。

8. 染色のセクション16,24 (図 13)

  1. セクションが完全に乾いたら、グリッド、周りからホルムバール フィルムを引き裂くし、セクションを軸受グリッドを削除します。
  2. 適切な順序 (図 13) で染色チューブ16の溝にグリッドを設定し、ウラニル酢酸および鉛のクエン酸のための24のセクションを染色します。
    注: ある溝深さ 0.6 mm 管の長軸に沿ってかみそりの刃でカットします。チューブは16染色、洗浄プロセスの間にグリッドへ直接な取り扱いは必要ありませんので、ピンセットを使用する場合にサポート フィルムの破損事故を防止するために役立ちます。

9. シリアル セクション (図 14) の観察

  1. 試料ホルダーの軸に垂直なグリッド スリットの長軸を方向づけるマルチ ホルダー (図 14 a)、適切な順番で 5 グリッドを設定します。'グリッド フィクサー' はハンドルを触れないので、カットがグリッドのハンドル (矢印) にはありません。
  2. ' グリッド fixers' (図 14 b) のグリッドを修正し、透過型電子顕微鏡試料ホルダーに挿入します。
    注: それターゲット細胞の写真を撮影する前にすべてのセル セクション (図 15) 汚染なしと良好な固定性、良好な状態で興味深い微生物や細胞を見つけるための低倍率の画像を撮影する便利です。
  3. 高倍率でのすべてのセルのセクションで標的細胞の写真を撮る。

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

このプロトコルでは、3 スリット格子は連続切片を拾うために使用されていました。グリッドは、ニッケルや銅の作られています。連続切片は、真ん中のスリットに配置されます。両側スリットは、グリッドとそれらを拾うときにセクションを表示する必要があります。グリッド連続切片と平行するときしてピンセット (図 11 d) でそれらを拾い、ハンドルが曲がっている (図 6 c右)。小さなハンドルはセクションを拾いに深刻な問題が発生したグリッドの主要な部分の曲げを防ぐために、染色中にセクションを落下防止に便利です。このグリッドには、従来 2.0 mm × 1.0 mm シングル ホール グリッド上の利点があります。すなわち、セクションは 2 つの金属バー 0.4 mm 間隔で直接サポートされます (1.0 mm より狭くする)、ホルムバール サポート フィルム 3 スリット グリッド、間のセクションは、従来単孔グリッドの支持フィルムでのみサポートされます。3 スリット格子を用いた高倍率での撮影では試料ドリフトしたがってできません。

図 15は、連続切片を運ぶ 5 つのグリッドの低倍率ビューを示しています。以来、各セクションが一緒に付く、高倍率でも次のセクションで同じセルを見つけやすいです。図 16および 17 は、細胞の断面の連続画像の例を示します。セクションは、3 スリット格子に安全にサポートされて、ため高倍率 (x 50,000) で写真を簡単に試料ドリフトせずされます。DNA 2 nm の直径の繊維は、これら研究9,12で撮影されました。

Figure 1
図 1.ホルムバール サポート映画製作装置。スライド ガラスの半分をゴム製のボールを使用して ' を通る空気とソリューションを押すことによって、装置の上部の列でホルムバール溶液浸漬すると。ソリューションは、三方活栓を開いて、圧力を減らすために 'b' を通る空気を解放によって列から排水です。(山口、足立、権限を持つ 2011年19から再現)。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 2
図 2.水スライド ガラスからフィルムを解放するためのメソッド。(a) スライド ガラス上のフィルムの 4 つの端は、かみそりの刃を使用して掻きが。(b) ホルムバール フィルムは低い角度でゆっくりとスライド ガラスを下げることによって水の上を浮動します。(山口、足立、権限を持つ 2011年19から再現)。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 3
図 3.アルミ ラック ホルムバール支持フィルム。(a) ホルムバール フィルムはアルミ ラックが付いている水からすくってです。(b) のラックは、織ってに使用するまで保持されます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 4
図 4.超音波トリム刃と顕微鏡下でかみそりの刃の試料ブロックのトリミングします。(a) 供試体の存在を確認するには、光学顕微鏡下で試料ブロックを観察します。採集された深海12,14スケール ワーム chaeta (約 1.7 mm) に関連付けられている図に含まれている微生物で示されているブロック。(b) トリミング ステージ。(顕微鏡の c) 全体像。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 5
図 5.ミクロトームを用いたダイヤモンド ナイフで試料ブロックのトリミングします。(a) 左側のエッジを切断するための図。(約 100 の位置で b) のブロックの顔をカット試料の左端から nm。(c) 鏡 (メサ カット、M) は、ナイフのステージに配置されます。(d) 供試体の表面。アッパー サイドとスリムな部分の下側が滑らかで、完全に平行に注意してください。また、マーク (図 8参照) を切断の方向に肩を切ることに注意してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 6
図 6.試験片表面にネオプレン治療。(a) 試料チャックを配置すると、元の位置に正確に戻るにチャックとミクロトームのチャック ホルダーをテープでマークし、境界でカットします。(b) 試料をパスツール ピペットを使用してネオプレン ソリューションでぬれ。(c) 3 スリット連続切片を拾うためのグリッド。ハンドルは、60 度 (c、右) に曲がっています。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 7
図 7.ミクロトームと木製アームレストのプラスチック製のカバーです。のプラスチック カバーが極薄切片中に空気の流れを防ぐために役に立つ。木製アームレストは、連続切片の取得など繊細な作業を行うために使用されます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 8
図 8.切片厚を設定し、適切な厚さでセクションを取得します。切片厚が 10 に設定されてシリアル セクションの数は、20 に達した後、nm。ミクロトームは、10 nm 厚のセクションを切り取ることはできません、ので新しいセクションが表示されない、以前の断面は、ナイフエッジ離れ離れになっています。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 9
図 9.超薄切片の例は、プロトコルを介して取得します。長さ約 1.8 mm の連続切片の 5 つのグループが切削後すでに分割されているに注意してください。超薄切片の中心の色は、この特定のケースでは、標本の存在のために黄色。試料が含まれていないし樹脂のみで構成される、セクションの他の部分はシルバー カラーです。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 10
図 10.「セクション保持ループ」。(、) の平面図 (上部) とループの下の表示 (写真の下の部分)。(b) セクション保持ループを使用して、連続切片の 3 番目のグループを保持します。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 11
図 11.連続切片の検索。(a)「水表面調達ループ」(WSRL) 。ループのハンドルは、その可動軸から削除できます。ループは、ネジの上部を回して上下に移動できます。(b) WSRL は磁石によってナイフ ステージに固定されます。((b) c) の近景。(d) ループ、水面、セクション、および (側面図) の取得中にグリッドの図。超薄切片は、超薄切片に裸グリッド平行を下げることによって、スリットのグリッドに正確に取得できます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 12
図 12.ホルムバール フィルム上のグリッドが配置します。グリッドのセクションを保持は、アルミ ラック上ホルムバール膜に水の小さなドロップと一緒に配置されます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 13
図 13.チューブを染色16。溝深さ 0.6 mm かみそりの刃を使用して長い軸に沿って作られています。グリッドは、適切な順序で溝に配置されます。チューブの一方の端は、その方向をマーク (矢印) がカットされます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 14
図 14.試料ホルダーにグリッドを配置すること。(、)、グリッドが適切な順序で試料ホルダーに配置されます。(b) のグリッドは、' グリッド-フィクサー」と固定されています。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 15
図 15.連続切片は、スリット格子にマウントされています。の図 18 に 25 のセクションを 1 つのグリッドにマウントされているを示しています。各スリット内の数字は、最初のセクションから始まるシーケンス番号を示します。最初のセクションは、他のものより厚い (図 8を参照です)。セクションが一体となって、同じ厚さに注意してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 16
図 16.Parakaryon myojinensisの連続切片12。左下の数字は、最初のセクションの相対的な順序を示します。図は、12 のうち 67 の完全なセクションを示しています。このセル単一核様体膜と共生細菌、しかしないミトコンドリアのような裸の DNA の繊維から成る大規模な核様体があることがわかった。このように、この生物は原核生物から真核生物12へ進化して中間の生命体のように見えます。N、核様体。山口から Worman、2014 を再現しました。14権限を持つ。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Figure 17
図 17.大腸菌の連続切片9。左下の数字は、最初のセクションの相対的な順序を示します。図は、12 の完全なセクションを示しています。このセルは、21,700 リボゾーム9が含まれて発見されました。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

ここで紹介した方法は、高価な機器を必要としません。染色管 (図 13)、水表面を上げるループ (図 11 a)、ループ セクションを保持 (図 10 a) 3 スリット グリッド (図 6 c) アルミ ラック (図 3) のみが必要です。現在のメソッドの多くの機能があります。標本の大部分は、互いに平行に顔を試料の表面とナイフのエッジを調整する使用されます。連続切片は、グループのスリット グリッド上にシリアル セクションのグループを取得するときに髪の毛のペアを使用して分離のセクションで困難を避けるためにカットされています。セクション グループの順序との混同を避けるために「セクション保持ループ」を使用。'水表面調達ループ' を使用して、セクション、水の頂点に配置され、グリッド上の目的の位置に配置するためのグリッドを最初、タッチを確認します。アルミ ラック ホルムバール支持フィルム、やすく支持膜のしわを避けるために、グリッドのセクションを回復する使用されます。染色チューブは、誤ってピンセットでサポート フィルムを破ることを避けるためです。

最近では、自動テープ収集ウルトラミクロトーム走査電子顕微鏡 (SEM) 電子不透明ビニール テープでイメージのために自動的にセクションを収集するために開発された25であった。このメソッドが確実にカット数千超薄切片26, 本手法により不可能であります。また、連続ブロック顔 (SBF) 27とフォーカス イオンビーム (FIB)-SEM28を使用して細胞の 3次元情報と動物の組織を収集します。これらのメソッドでダイヤモンド ナイフまたはフォーカス イオン ビーム断面 SEM 顕微鏡内部に統合された、特別なテクニックを必要としない全自動方法で実施します。これらのメソッドは、役立ちますが、装置は高価なので、多くの機関がこれらのマシンを購入します。また、これらのメソッドは、写真のセクションに SEM を採用以来、顕微鏡の解像度は透過型電子顕微鏡 (TEM) を採用し現在のメソッドに劣る。これらのメソッドは、現時点では個々 のリボソーム粒子、微小管、フィラメント、および DNA の繊維を解決できません。

微生物のストラクトーム解析と未知微生物の電顕的研究、細胞や細胞壁、細胞膜、ミトコンドリア、核、原子膜、小胞体などの細胞成分を観察する必要があります。葉緑体、プラスチド、ゴルジ体、リボゾーム、および高解像度で糸状の要素。連続超薄切片の観察は、このような分析を 3 次元で可能にするいくつかの方法のひとつです。同じ領域が繰り返し見られるこの方法で観察した超薄切片が残っているので観測、後観測領域が失われるので、これは SBF または FIB SEM で可能ではありません。この機能は、低倍率で生物の面白さを最初に検索し、高倍率でターゲット有機体に連続写真を撮る必要がある深海の微生物を研究することが重要です。

結論としては、シリアルの極薄断面法今実行できる、簡単で安価なと relaible 方法 3 D 電顕的に不可欠である本研究では、高分解能電子顕微鏡による微生物の研究します。

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

著者が明らかに何もありません。

Acknowledgments

我々 は心から彼の貴重な提案や議論の茂雄北をありがちましょう。我々 はまた原稿の彼らの重要な読書のジョンとすみれエクスタインをありがちましょう。

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Formvar making apparatus Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 652 W 180 x D 180 x H 300 mm
Glass slide Matsunami Co. Ltd., Osaka - 76 x 26 x 1.3 mm
Aluminum rack with 4-mm holes Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 658 W 30 x D 25 x H 3 mm, Refer to this paper
Stereomicroscope Nikon Co. Ltd., Tokyo - SMZ 645
LED illumination for stereomicroscope Nikon Co. Ltd., Tokyo - SM-LW 61 Ji
Trimming stage Sunmag Co.Ltd., Tokyo - Tilting mechanism equipped, Refer to this paper
LED illumination for trimming stage Sunmag Co.Ltd., Tokyo - Refer to this paper
Ultrasonic trimming blade Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 5240 EM-240, Refer to this paper
Diamond knife for trimming Diatome Co. Ltd., Switzerland - 45°
Diamond knife for ultrathin sectioning Diatome Co. Ltd., Switzerland - 45°
Ultramicrotome Leica Microsystems, Vienna - Ultracut S
Mesa cut Leica Microsystems, Vienna - Mirror
0.5% Neoprene W solution Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 605
Special 3-slit nickel grid Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 2458 Refer to this paper
Special 3-slit copper grid Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 2459 Refer to this paper
Section-holding loop Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 526 Refer to this paper
Water-surface-raising loop Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 527 Refer to this paper
Staining tube Nisshin EM Co. Ltd., Tokyo 463 Refer to this paper
Multi-specimen holder JEOL Co. Ltd., Tokyo - EM-11170
JEM-1400 JEOL Co. Ltd., Tokyo - Transmission electron microscope

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Yamaguchi, M., et al. The spindle pole body duplicates in early G1 phase in a pathogenic yeast Exophiala dermatitidis: an ultrastructural study. Exp. Cell Res. 279, 71-79 (2002).
  2. Yamaguchi, M., et al. The spindle pole body of the pathogenic yeast Exophiala dermatitidis: variation in morphology and positional relationship to the nucleolus and the bud in interphase cells. Eur. J. Cell Biol. 82, 531-538 (2003).
  3. Yamaguchi, M. Quantitative and dynamic ultrastructure of yeast cells by electron microscopy. Recent Res. Dev. Microbiology. 8, 219-243 (2004).
  4. Yamaguchi, M., Biswas, S. K., Ohkusu, M., Takeo, K. Dynamics of the spindle pole body of the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans examined by freeze-substitution electron microscopy. FEMS Microbiol. Lett. 296, 257-265 (2009).
  5. Yamaguchi, M., et al. The spindle pole body of the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans: variation in morphology and positional relationship with the nucleolus and the bud in interphase cells. J. Electron Microsc. 59, 165-172 (2010).
  6. Yamaguchi, M. Structome of Exophiala yeast cells determined by freeze-substitution and serial ultrathin sectioning electron microscopy. Curr. Trends Microbiol. 2, 1-12 (2006).
  7. Yamaguchi, M., et al. Structome of Saccharomyces cerevisiae determined by freeze-substitution and serial ultrathin sectioning electron microscopy. J. Electron Microsc. 60, 321-335 (2011).
  8. Biswas, S. K., Yamaguchi, M., Naoe, N., Takashima, T., Takeo, K. Quantitative three-dimensional structural analysis of Exophiala dermatitidis yeast cells by freeze-substitution and serial ultrathin sectioning. J. Electron Microsc. 52, 133-143 (2003).
  9. Yamada, H., et al. Structome analysis of Escherichia coli. cells by serial ultrathin sectioning reveals the precise cell profiles and the ribosome density. Microscopy. 66, 283-294 (2017).
  10. Yamada, H., Yamaguchi, M., Chikamatsu, K., Aono, A., Mitarai, S. Structome analysis of virulent Mycobacterium tuberculosis, which survives with only 700 ribosomes at density per 0.1 fl cytoplasm. PLoS ONE. 10, e0117109 (2015).
  11. Yamaguchi, M., et al. High-voltage electron microscopy tomography and structome analysis of unique spiral bacteria from the deep sea. Microscopy. 65, 363-369 (2016).
  12. Yamaguchi, M., et al. Prokaryote or eukaryote? A unique microorganism from the deep-sea. J. Electron Microsc. 61, 423-431 (2012).
  13. Yamaguchi, M. Ultrathin sectioning of the Myojin parakaryote discovered in the deep sea. Cytologia. 78, 333-334 (2013).
  14. Yamaguchi, M., Worman, C. O. Deep-sea microorganisms and the origin of the eukaryotic cell. Jpn. J. Protozool. 47, 29-48 (2014).
  15. Yamaguchi, M. An electron microscopic study of microorganisms: from influenza virus to deep-sea microorganisms. JSM Mycotoxins. 65, 81-99 (2015).
  16. Yamaguchi, M., Okada, H., Namiki, Y. Smart specimen preparation for freeze-substitution and serial ultrathin sectioning of yeast cells. J. Electron Microsc. 58, 261-266 (2009).
  17. Yamaguchi, M., Biswas, S. K., Suzuki, Y., Furukawa, H., Takeo, K. Three-dimensional reconstruction of a pathogenic yeast Exophiala dermatitidis cell by freeze-substitution and serial sectioning electron microscopy. FEMS Microbiol. Lett. 219, 17-21 (2003).
  18. Kozubowski, L., et al. Ordered kinetochore assembly in the human pathogenic basidiomycetous yeast, Cryptococcus neoformans. mBio. 4, e00614-e00613 (2013).
  19. Yamaguchi, M., Adachi, K. Specimen support. Guide Book for Electron Microscopy. The Japanese Society of Microscopy, , 2nd ed, Kokusaibunkeninsatsusya, Tokyo. 52-57 (2011).
  20. Hayat, M. A. Support films. Principles and Techniques of Electron Microscopy: Biological Application. , 4th ed, Cambridge, Univ. Press. Cambridge, United Kingdom. 216 (2000).
  21. Yamaguchi, M., Kita, S. Ultrathin sectioning. Guide Book for Electron Microscopy. The Japanese Society of Microscopy, , 2nd ed, Kokusaibunkeninsatsusya, Tokyo. 40-52 (2011).
  22. Yamaguchi, M., Aoyama, T., Yamada, N., Chibana, H. Quantitative measurement of hydrophilicity/hydrophobicity of the plasma-polymerized naphthalene film (Super support film) and other support films and grids in electron microscopy. Microscopy. 65, 444-450 (2016).
  23. Kita, S. Reliable method for obtaining serial ultrathin sections using new small tools. Kenbikyo. 46, in Japanese 253-257 (2011).
  24. Yamaguchi, M., Shimizu, M., Yamaguchi, T., Ohkusu, M., Kawamoto, S. Repeated use of uranyl acetate solution in section staining in transmission electron microscopy. Plant Morphology. 17, 57-59 (2005).
  25. Hayworth, K. J., Kasthuri, N., Schalek, R., Lichtman, J. W. Automating the collection of ultrathin serial sections for large volume TEM reconstructions. Microsc. Microanal. 12, Suppl . 2. 86-87 (2006).
  26. Hildebrand, D. G. C., et al. Whole-brain serial-section electron microscopy in larval zebrafish. Nature. 545, 345-349 (2017).
  27. Denk, W., Horstmann, H. Serial block-face scanning electron microscopy to reconstruct three-dimensional tissue nanostructure. PLoS Biol. 2, e329 (2004).
  28. Heymann, J. A. W., et al. Site-specific 3D imaging of cells and tissues with a dual beam microscope. J. Struct. Biol. 155, 63-73 (2006).

Tags

工学問題 131、凍結置換、高解像度、ループ、微生物、ミクロトーム、極薄シリアルセクショニング、ストラクトーム、3 D 分析、電子顕微鏡観察、微細構造
透過型電子顕微鏡における微生物の連続超薄切片を得る方法
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Yamaguchi, M., Chibana, H. A MethodMore

Yamaguchi, M., Chibana, H. A Method for Obtaining Serial Ultrathin Sections of Microorganisms in Transmission Electron Microscopy. J. Vis. Exp. (131), e56235, doi:10.3791/56235 (2018).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter