Summary
Denne protokollen analyserer navigasjons virkemåten til Drosophila Larven svar på samtidige optogenetic stimulering av dets olfactory neurons. Lys 630 nm wavelength brukes til å aktivere individuelle olfactory neurons uttrykke en rød-skiftet kanal rhodopsin. Larver bevegelse registreres samtidig, registrert digitalt og analysert ved hjelp av tilpasset skrevet programvare.
Abstract
Muligheten for insekter å navigere mot lukt er basert på aktivitetene deres første orden olfactory reseptor neurons (ORNs). Mens har generert en betydelig mengde informasjon om ORN Svar å odorants, fortsatt rollen til bestemte ORNs i kjøring atferdsdata svar dårlig forstått. Komplikasjoner i atferd analyser forekomme forskjellige volatilities av odorants som aktiverer personlige ORNs, flere ORNs aktivert av én odorants, og vanskeligheter med replikere naturlig observert timelige variasjoner i olfactory stimuli bruker konvensjonelle lukt levering metoder i laboratorier. Her beskriver vi en protokoll som analyserer Drosophila larver atferd svar på samtidige optogenetic stimulering av sin ORNs. Optogenetic teknologi brukes her gir spesifisitet av ORN aktivisering og presis kontroll over timelige bruksmønstre ORN aktivisering. Tilsvarende larver bevegelse registreres, registrert digitalt og analysert ved hjelp av tilpasset skrevet programvare. Ved å erstatte lukt stimuli med lys stimuli, gir denne metoden en mer nøyaktig kontroll over personlige ORN aktivisering for å studere virkningen på larver atferd. Vår metode kan utvides ytterligere for å studere virkningen av andre-ordens projeksjon neurons (PNs) samt lokale neurons (LNs) larver oppførsel. Denne metoden vil dermed gjøre en omfattende Disseksjon av olfactory krets funksjon og supplement studier på hvordan olfactory Nevron aktiviteter oversette i atferd svar.
Introduction
Olfactory informasjon i en Drosophila Larvenes miljø er kjente av bare 21 funksjonelt forskjellige ORNs, aktiviteter som til slutt bestemmer larver atferd1,2,3,4. Likevel, relativt lite er kjent om logikken som sensoriske informasjonen kodes i aktivitetene til disse 21 ORNs. Det er derfor behov eksperimentelt måle funksjonelle bidrag av hver larver ORN virkemåten.
Selv om sensoriske reaksjon profilen til hele repertoaret av Drosophila larver ORNs har vært studert i detalj1,4,5, bidrag av individuelle ORNs olfactory krets og dermed navigasjons problemet forblir hovedsakelig ukjent. Vanskeligheter i larver atferd studier, så langt, forekomme kan romlig og timelig aktivere enkelt ORNs. Et panel av odorants spesielt aktivere 19 av de 21 Drosophila larver ORNs var nylig beskrevet1. Hver odorant i panelet i lave konsentrasjoner utløser en fysiologiske reaksjon fra sin beslektet ORN. Men i høyere konsentrasjoner som vanligvis brukes for konvensjonelle atferd analyser utløser hver odorant fysiologiske responser fra flere ORNs1,5,6. Videre har odorants i dette panelet variert volatilities som komplisere tolkning av atferd studier som dannelsen av stabil lukt graderinger7,8. Endelig naturlig har forekommende lukt stimuli en verdslig komponent som er vanskelig å gjenskape under laboratorieforhold. Det er derfor viktig å utvikle en metode som kan måle larver oppførsel mens samtidig aktivere personlige ORNs i en romlig og tidsmessige måte.
Her viser vi en metode som har fordeler over beskrevet tidligere larver sporing søk1,8. Sporing analysen beskrevet i Gershow et al. bruker elektronisk styrte ventiler for å opprettholde en stabil gradient lukt i atferd arena8. Men på grunn av den komplekse ingeniører som er involvert bygge lukt stimulans oppsettet, er denne metoden vanskelig å gjenskape i andre laboratorier. Videre forblir knyttet til benytter odorants å aktivere spesielt enkelt ORNs uløst. Sporing analysen beskrevet i Mathew et al. bruker en enklere lukt leveringssystem, men resulterende lukt graderingen er avhengig av volatilitet i test odorant og er ustabil for lang varighet av analysen1. Dermed ved å erstatte lukt stimuli med lys stimuli, vår metode har fordeler av spesifisitet og presis timelige kontroll av ORN aktivisering og er ikke avhengig av dannelse av lukt graderinger av forskjellige styrker.
Vår metode er enkel å konfigurere og passer for forskere interessert i å måle aspekter av Drosophila larver navigasjon. Denne teknikken kan tilpasses andre modellsystemer forutsatt at hun kunne kjøre uttrykk for CsChrimson i deres favoritt systemets neuron(s) valgfrihet. CsChrimson er en rød-skiftet versjon av kanalen rhodopsin. Det aktiveres på bølgelengder som er usynlig av Larvenes phototaxis systemet. Vi er derfor kunne manipulere aktiviteten av neurons med spesifisitet, pålitelighet og reproduserbarhet9. Ved å endre egendefinert skrevet programvare til endres av fag, kan denne metoden lett bli tilpasset for kravlesøk larver av andre insekt arter.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. bygge en oppførsel Arena og forberede maskinvare for å aktivere Optogenetic stimulering i atferd Arena
- For å bygge en lys-belastede atferd arena, konstruere en boks med en dimensjon av 89 x 61 x 66 cm3 (35-"x 24" W x 26" H) laget av svart farget pleksiglass akryl ark (3 mm tykk) (se Tabell for materiale). Å bygge slik boksen skal være tilgjengelig i lokale jernvareforretninger. Plass denne boksen på et bord i atferd rommet (figur 1A).
- Montere en monokrom USB 3.0 CCD kamera utstyrt med en IR lange pass 830 nm-filteret og 8 mm F1.4 C-mount objektiv (se Tabell of Materials) til midten av taket i den svarte boksen. Sted to infrarød LED strimler (se Tabell for materiale) på bord for å belyse Larvene i mørke arena (figur 1A).
- For å bygge LED plattformen, få en 22 cm x 22 cm firkantet aluminiumsplate (fortrinnsvis spray malt med matt svart overflate til å eliminere noen refleksjoner). I midten av tallerkenen, bruker metall kniv, skjære hull som er stor nok til å passe rundt CCD kameraet.
- Dekk metallplaten med rød stripe lys (se Tabell for materiale). Loddetinn LED lys stripe ledninger i serien og mate stripe ledningene i et optocoupler relé kontrollert av en bringebær Pi 2B mikroprosessor (se Tabell for materiale) (figur 1B og 2).
- Installer og Konfigurer Ubuntu kompis/Raspian Jesse/Linux basert operativsystem på bringebær Pi prosessor kobler optocoupler stafetten til LED strimler. Knytte en strømforsyning for å drive LED strimler og optocoupler (figur 2) (se Tabell for materiale). Montere LED plattformen rundt CCD kameraet (figur 1B).
Merk: Ubuntu kompis v16.04 operativsystemet er fritt tilgjengelig. Et sett med enkel Python basert kommandoer kan tilpasses enkelt å programmere mønstre LED lys stimuli (se fil syntaks). - Sikre at homogen Irradians på ulike punkter i atferd arena. Måle den absolutte Irradians på overflaten av arena ved hjelp av en Spectrometer og finne det å være ~1.3 W/m2 hele overflaten av arenaen.
Merk: Denne intensitet, ingen vesentlige endringer ble observert i temperaturen i løpet av eksperimenter. En annen studie10 brukes en høyere Irradians av ~1.9 W/m2 og observert endringer i temperatur i løpet av eksperimenter.
2. utarbeidelse av Drosophila Larvene for oppførsel analyser
- Opprettholde fluene på standard fly mat (se Tabell for materiale) ved 25 ° C og 50-60% RH en 12 h/12 h lys/mørke syklus.
-
For å uttrykke CsChrimson i et enkelt par ORNs, krysser jomfru kvinner fra en UAS-IVS-CsChrimson linje til menn fra en OrX-Gal4 linje ("X" tilsvarer en av 21 larver lukt reseptor (eller) gener som uttrykkes unikt i hver av 21 ORNs)9,11.
- Vekselsvis, for å uttrykke CsChrimson i alle 21 larver ORNs, cross jomfru kvinner fra en UAS-IVS-CsChrimson linje til menn fra en Orco-Gal4 linje ('Orco' er co reseptoren som er uttrykt i alle 21 ORNs).
- Bruke UAS-IVS-CsChrimson linje av seg selv som en kontroll i disse eksperimentene.
Merk: Fly aksjene listet her er tilgjengelig på Bloomington Drosophila lager Center (se Tabellen for materiale).
-
Når mannlige og kvinnelige fluer i et kryss tillates å mate og legge egg for 48t, overføre voksne til en frisk flaske.
- På overflaten av mat ampullen inneholder egg, legger du til 400 µL av en blanding som inneholder 400 µM all-trans retinal (ATR) oppløst i Dimethyl sulfoxide (DMSO) og 89 mM sukrose oppløst i destillert vann.
Merk: Den lille mengden av sukrose fremmer larver fôring av ATR løsningen. ATR er kofaktor kreves for upregulating av CsChrimson uttrykk9,10. ATR er lysfølsom. - Når ATR er lagt til mat hetteglass som inneholder egg, ruge ampullene i mørket en ytterligere 72 h.
Merk: Mens denne studien og over to studier ikke har observert effekter på larver oppførsel på grunn av ATR fôring, anbefales kontrollere for virkningene av ATR fôring ved å utsette testen linjer til samme mengde ovennevnte blanding som ikke inneholder ATR.
- På overflaten av mat ampullen inneholder egg, legger du til 400 µL av en blanding som inneholder 400 µM all-trans retinal (ATR) oppløst i Dimethyl sulfoxide (DMSO) og 89 mM sukrose oppløst i destillert vann.
- Ekstra tredje-skikkelsen Larvene (~ 120 h etter egglegging) fra overflaten av fly mat av dem med en høy tetthet (15%) sucrose løsning. Bruke en P1000 brønnene skille Larvene flyter på overflaten av sukrose løsningen i et 1000 mL glass beger.
- Vask Larvene 3-4 ganger ved å utveksle 800 mL destillert ferskvann i glass begeret hver gang. Tillate larvae å hvile i 10 min før utsette dem for oppførsel analysen.
3. atferd analysen
- Opprettholde konsekvent temperatur (mellom 22-25 ° C) og fuktighet (mellom 50 og 60% RH) i atferd rommet.
-
Klargjør larver gjennomgang medium ved å helle 150 mL av smeltet agarose (1,5%) i en 22 cm x 22 cm i firkant Petriskål. En Petriskål helles for hver prøveversjon av analysen, 8-10 forsøk per forsøk. Tillate agarose å stivne og kule for 1-2 h i Petri retter før du bruker dem i atferd analysen.
- Overføre mer enn 20 prepped tredje-skikkelsen Larvene til midten av Petriskål (figur 1C). Dekk Petriskål med sin lokk. Plass Petriskål i atferd arena under CCD kameraet.
Merk: Avhengig av eksperimentet atferd analyser er vanligvis utført for 3-5 minutter. Hvis en odorant brukes i analysen for å gi veiledning Stikkordene, har det blitt observert at resulterende lukt graderingen forblir stabil ca 5 min1. Lengre analysen ganger anbefales ikke. Skadelige effekter på Larvene dehydrering eller fra langvarig 630 nm røde lys eksponering er ikke observert i disse tidspunkt.
- Overføre mer enn 20 prepped tredje-skikkelsen Larvene til midten av Petriskål (figur 1C). Dekk Petriskål med sin lokk. Plass Petriskål i atferd arena under CCD kameraet.
- Slå på the 850 nm infrarød LED lys kilde å visualisere larver i videoen. Starte CCD kameraet for å registrere larver bevegelse.
- Bruke programvaren forbundet med bringebær Pi prosessoren, programmet prosedyren for å administrere riktig mønstre av rødt lys stimulering.
Merk: Et sett med enkel Python basert kommandoer kan lett tilpasses programmere mønstre LED lys stimuli (se fil syntaks).
4. databehandling og analyse
- Importere den innspilte videoen av hvert forsøk til tilgjengelig programmering programvare som Matlab.
- Få XY-koordinater for hver larve i en film som en funksjon av tid. Basert på grensene for sporingsprogramvare, kan 15-20 tredje-skikkelsen Larvene spores i en enkelt film1,8.
Merk: Et sett med enkle Matlab-koder ("Tracklarva") som kan enkelt tilpasset riktig forhold (se fil syntaks) er gitt. Dette programmet kombinerer alle forsøk i et eksperiment og utganger XY-koordinater for hver Larven for hele varigheten av analysen (se kodesyntaksen nedenfor). Alternativt kan man bruke flere åpen kildekode basert programmer som er fritt tilgjengelig for forskere. F.eks JAABA (http://jaaba.sourceforge.net/)12. -
Bruk de genererte XY-koordinatene tegne larver baner og analysere larver bevegelse.
- For oppførsel analyser, bruke navigasjons statistikk som hastighet, banen kurvatur, overskriften vinkel, segmentere personlige larver baner i vekslende sekvenser av kjører og svinger.
- Kjører defineres som sammenhengende perioder med bevegelse fremover. Viser skille etterfølgende kjøringer. Svinger er flagget når endringer til banen legning vinkler > 45° (se fil syntaks).
- Beregne gjennomsnittsverdier for løpe fart, kjører lengden, kjøre retning og andre parametere som kreves.
Merk: Et sett med enkel syntaks å trekke ut "kjører" og "stopper" fra larver baner er gitt (se fil syntaks). Enkelt Matlab eller Excel basert funksjoner kan brukes på hentet data til å beregne verdier for "kjøre speed", "Kjør lengde" osv. - Representere dataene for hver opptreden beregning som mener ± SEM.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
For å demonstrere spesifisiteten av ORN aktivisering, vår metode ble brukt for å fastslå effekten av to forskjellige ORN (ORN::7a & ORN::42a) (ORNs uttrykke enten Or7a eller Or42a) aktivisering på larver atferd (Figur 3). Samsvar med nyere studier at enkelte larver ORNs er funksjonelt forskjellige1,10,13, vår representant data viser at når ORN::7a uttrykke CsChrimson ble stimulert av lys, det var en betydelig reduksjon i kjørelengde sammenlignet med kontrollen dyr. Motsatt, når ORN::42a uttrykke CsChrimson ble stimulert av lys, det var en betydelig økning i kjørelengde sammenlignet med kontrollen dyr (Figur 3). Kollektive dataene analysert fra ~ 100-120 larver spor ble innhentet fra (n = 8) studier utført for hver genotype. Feilfeltene representerer SEM. Mens vi beskriver bare en enkelt atferd parameter (kjørelengde) her, oppmerksom vi på at hvert larver spor videre kan analyseres for å beregne parametere for hastighet, banen kurvatur, og kroppen bøyer1,8,13, 14,15. Flere parametere knyttet til retningen som overskrift vinkel, kjørelengde og kjøre fart mot og fra lukt kan oppnås hvis en lukt kilde er angitt på én side av arena1,8,13.
For å demonstrere vår metode evnen å alter timelige mønstre av ORN aktivisering, variert vi vår stimulans til alternative mellom lys av og på. Vi utsatt Larvene uttrykke UAS -CsChrimson i ORN::42a til tre forskjellige timelige mønstre av lys stimuli i lys ON perioden (0.04 Hz, 1 Hz og konstant). Vi deretter målt endringer i atferdsdata parametere som skjer i lys av → ON fasen og under lys på → av fase. Vi fant at for ORN::42a, ulike timelige mønstre av lys stimulering elicited forskjellige atferdsdata svar (Figur 4). Slike endringer ble ikke observert i kontroll larver som ikke uttrykke UAS-CsChrimson i en ORNs. Disse resultater markere betydningen av forståelse hvordan timelige mønstre av ORN aktivisering bidra til dyr oppførsel.
Figur 1 : Virkemåte arena og larver gjennomgang medium. (A) foran visning av black-box atferd arena. Åpne døren til arenaen avslører en CCD kamera suspendert fra taket i boksen. (B) nedenfra en metall plattform med rød LED lys strimler brukes for optogenetic stimulations er montert rundt CCD kameraet. (C) topp utsikt over larver gjennomgang mediet som brukes i analysen. Før innspillingen larver bevegelse, ~ 20 vasket Larvene legges langs midten av en 22 cm x 22 cm Petriskål lagvis med 1,5% agarose. Petriskål inneholder Larvene er plassert i midten av arenaen under CCD kameraet og mellom to infrarød LED lys strimler som brukes som en lyskilde for kameraet. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 2 : Optogenetics oppsett. En infographic viser det elektroniske arrangementet for optogenetics oppsett. Kort, LED-lys (630 nm) strimler er koblet i serie og ledninger fra strimler er matet inn i en optocoupler koblet til en bringebær PI 2B mikroprosessor. Både LED lys strimler og optocoupler er drevet av en strømforsyning. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 3 : Virkningen av lys aktivering av personlige ORNs larver oppførsel. Kjørelengde for Larvene uttrykke CsChrimson i ORN::7a og ORN::42a var annerledes berørt forhold for å kontrollere Larvene ved lys aktivering. Hver stolpe representerer gjennomsnittlig RI ± SEM (n = 8). Kjører lengden på Larvene når ORN::7a ble aktivert var betydelig lavere enn kontroll. Kjører lengden på Larvene når ORN::42a ble aktivert var betydelig høyere enn kontroll. Stolpene angir gjennomsnittlig ± SEM (n = 8, Student t-test; "*" er p < 0,05, "**" p < 0,001). Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 4 : Virkningen av forskjellige timelige mønstre av ORN aktivisering larver oppførsel. (A) tre timelige mønstre stimuli anvendt for aktivere ORNs. Stimulans a: 1 min konstant lys under stimulans b: 0.04 Hz lys stimulering, stimulans c: 1 Hz lys stimulering LED på løpet i minutt 2. (B) Larvene ble utsatt for tre ulike mønstre av lys stimuli beskrevet i A. Hvert punkt representerer endringen i larver atferd, under hver mønster av lys stimuli, når lys aktivisering er byttet fra ON til OFF. Endre i "Kjør lengde" (Av. kjørelengde (av) - Av. kjørelengde (på)) er tegnet inn på x-aksen. Endre i "Kjør hastighet" (Av. kjøre fart (av) - Av. kjøre fart (på)) tegnes på y-aksen. Venstre diagram (grå prikker) representerer målinger for kontroll larver og høyre grafen (røde prikker) representerer målinger for Larvene uttrykke CsChrimson i ORN::42a. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Ekstra fil syntaks: et sett med enkle Matlab-koder ("Tracklarva") som kan enkelt tilpasset riktig forhold. Klikk her for å laste ned denne filen.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Her beskrev vi en metode som tillater for måling av Drosophila larver atferd svar på samtidige optogenetic aktivisering av olfactory neurons. Tidligere beskrevet larver sporing metoder1,8 bruke forskjellige lukt levering teknologi til å aktivere ORNs. Men kan ikke disse metodene kontrollere for enten spesifisitet eller temporal bruksmønstre ORN aktivisering. Vår metode overvinner disse underskudd med lys stimuli i stedet for lukt stimuli for mer nøyaktig kontroll over ORN aktivisering.
Materialene som trengs for å bygge atferd arena lett kan bli funnet på den lokale jernvarehandelen og krever minimal innsats på forsamlingen. Elektronikk for å forberede optogenetics modulen er også lett tilgjengelig og konstruert. Metoden beskrevet her bruker rødt lys aktivere en rød-skiftet kanal rhodopsin (CsChrimson) i bestemte neurons. Den resulterende larver atferden svar på tilsvarende ORN aktiveringen registreres ved hjelp av en CCD kamera og målt med tilpasset skrevet programvare som tilbys her. Våre tillater forskere å spørre svar på flere spørsmål som ikke var mulig før: 1) Hva er virkningen av forskjellige olfactory stimulans mønstre på dyrets evne til å gå mot en lukt? 2) lik ON-senter og OFF-center ganglieceller i pattedyr netthinnen16, er det ORNs som reagerer spesielt en nedgang i olfactory stimuli i tillegg til ORNs som svarer til en økning i olfactory stimuli? Endelig, vår metoden tillater en rekke fremtidige programmer, inkludert måle effekten av nedstrøms nerveceller i olfactory krets (PNs og LNs) larver navigasjon.
Mens det er flere fordeler til våre metoden, erkjenner vi visse begrensninger. Det er uklart om konsentrasjon effekter observert med odorants kan enkelt replikeres med dette systemet. Mens våre nåværende oppsett ikke tillater dette, kunne modulen optogenetics enkelt endres for å imøtekomme økning eller nedgang i intensiteten av lys stimulans. I fremtiden, vil vi sjekke for å se om endre intensitet av lys stimulans etterligner konsentrasjon effekten av odorants. Enkle fly genetisk teknikker kan brukes til å uttrykke CsChrimson i enten alle 21 par av ORNs (med Orco-Gal4) eller ett enkelt par med ORNs (med personlige eller-Gal4s). Imidlertid komplisert genetikk må uttrykke CsChrimson i ' 1 < n < 21' neurons. På grunn av dette, ville det være vanskelig å gjenskape effektene observert med lukt blandinger der enkeltkomponenter i blandingen framprovosere reaksjoner fra flere ORN. Selv om larver navigasjons atferd anses å være en lav dimensjonale atferd, vi erkjenner at vår larver sporing program kan bli ytterligere forbedret i fremtiden av vurderer flere atferdsmessige beskrivelsene basert på dyr holdning (f.eks sannsynligheten for hodet viser, kroppen svinger etc.)8,17. Vår studie var begrenset til første ordre sensoriske neurons i Larven. Videre undersøkelser er nødvendig før vår metode kan brukes på andre ordre projeksjon neurons og lokale neurons som er innebygd i hjernen lobe regionen av hjernen18.
I sammendraget tilbyr vår metode muligheten til å analysere funksjonen til hver ORN i enkle, medgjørlig olfactory krets av Drosophila Larven. Dermed vil våre metoden aktivere utvikling av mer presis datamodeller som beskriver hvordan lukt signaler blir oversatt til forskjellige atferdsmessige utganger.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Forfatterne ikke avsløre.
Acknowledgments
Dette arbeidet ble støttet ved oppstart midler fra University of Nevada, Reno og NIGMS av National Institute of Health under bevilgning nummer P20 GM103650.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Video camera to capture larval movement | |||
| CCD Camera | Edmund Optics | 106215 | |
| M52 to M55 Filter Thread Adapter | Edmund Optics | 59-446 | |
| 2" Square Threaded Filter Holder for Imaging Lenses | Edmund Optics | 59-445 | |
| RG-715, 2" Sq. Longpass Filter | Edmund Optics | 46-066 | |
| Electronics for optogenetic setup | |||
| Raspberry Pi 2B | RASPBERRY-PI.org | RPI2-MODB-V1.2 | |
| 3 Channel programmable power supply | newegg.com | 9SIA3C62037092 | |
| 8 Channel optocoupler relay | amazon.com | 6454319 | |
| 630nm Quad-row LED strip lights | environmentallights.com | red3528-450-reel | |
| 850nm LED strips | environmentallights.com | wp-4000K-CC5050-60x2-kit | |
| Software | |||
| Matlab | Mathworks Inc. | ||
| Ubuntu MATE v16.04 | Nubuntu | https://github.com/yslo/nubuntu | |
| Other items | |||
| Plexiglass black acrylic | Home Depot | MC1184848bl | |
| Fly food and other reagents | |||
| Nutrifly fly food | Genesee Scientific | 66-112 | |
| Agarose powder | Genesee Scientific | 20-102 | |
| 22cm X 22cm square petri-dish | VWR Inc. | 25382-327 | |
| DMSO | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| Sucrose | Sigma-Aldrich | 84097 | |
| All trans-retinal | Sigma-Aldrich | R2500 | |
| Flies | |||
| UAS-IVS-CsChrimson | Bloomington Drosophila Stock Center | 55134 | |
| Orco-Gal4 | Bloomington Drosophila Stock Center | 26818 | |
| Or42a-Gal4 | Bloomington Drosophila Stock Center | 9970 | |
| Or7a-Gal4 | Bloomington Drosophila Stock Center | 23907 |
References
- Mathew, D., et al. Functional diversity among sensory receptors in a Drosophila olfactory circuit. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 2134-2143 (2013).
- Ramaekers, A., et al. Glomerular maps without cellular redundancy at successive levels of the Drosophila larval olfactory circuit. Current biology : CB. 15, 982-992 (2005).
- Couto, A., Alenius, M., Dickson, B. Molecular, anatomical, and functional organization of the Drosophila olfactory system. Current biology : CB. 15, 1535-1547 (2005).
- Kreher, S. A., Kwon, J. Y., Carlson, J. R. The molecular basis of odor coding in the Drosophila larva. Neuron. 46, 445-456 (2005).
- Kreher, S. A., Mathew, D., Kim, J., Carlson, J. R. Translation of sensory input into behavioral output via an olfactory system. Neuron. 59, 110-124 (2008).
- Hallem, E. A., Carlson, J. R. Coding of odors by a receptor repertoire. Cell. 125, 143-160 (2006).
- Monte, P., et al. Characterization of the larval olfactory response in Drosophila and its genetic basis. Behav Genet. 19, 267-283 (1989).
- Gershow, M., et al. Controlling airborne cues to study small animal navigation. Nature methods. 9, 290-296 (2012).
- Klapoetke, N. C., et al. Independent optical excitation of distinct neural populations. Nature methods. 11, 338-346 (2014).
- Hernandez-Nunez, L., et al. Reverse-correlation analysis of navigation dynamics in Drosophila larva using optogenetics. eLife. 4, (2015).
- Brand, A. H., Perrimon, N. Targeted gene expression as a means of altering cell fates and generating dominant phenotypes. Development. 118, 401-415 (1993).
- Kabra, M., Robie, A. A., Rivera-Alba, M., Branson, S., Branson, K. JAABA: interactive machine learning for automatic annotation of animal behavior. Nature methods. 10, 64-67 (2013).
- Newquist, G., Novenschi, A., Kohler, D., Mathew, D. Differential contributions of Olfactory Receptor Neurons in a Drosophila olfactory circuit. eNeuro. 3, (2016).
- Schulze, A., et al. Dynamical feature extraction at the sensory periphery guides chemotaxis. eLife. 4, (2015).
- Tastekin, I., et al. Role of the Subesophageal Zone in Sensorimotor Control of Orientation in Drosophila Larva. Current Biology. 25, 1448-1460 (2015).
- Famiglietti, E. V., Kolb, H. Structural basis for ON-and OFF-center responses in retinal ganglion cells. Science. 194, 193-195 (1976).
- Luo, L., et al. Bidirectional thermotaxis in Caenorhabditis elegans is mediated by distinct sensorimotor strategies driven by the AFD thermosensory neurons. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 2776-2781 (2014).
- Berck, M. E., et al. The wiring diagram of a glomerular olfactory system. eLife. 5, (2016).
