Summary
Ein Workflow mit Flow Cytometry oder Differential Zentrifugation wurde entwickelt, um erkennen, zu quantifizieren und isolieren Apoptotic Körper aus einem Apoptotic Probe zu hoher Reinheit.
Abstract
Apoptotic Bodies (ApoBDs), Microvesicles und exosomen gehören die extrazelluläre Vesikel-Familie, mit ApoBDs als eines der größten Art aus. Es wurde vorgeschlagen, dass ApoBDs Zelle sowie interzellulären Kommunikation durch Menschenhandel Biomolekülen unterstützen kann. Herkömmliche Ansätze zur Identifizierung und Isolierung von ApoBDs sind häufig durch das Fehlen der genaue Quantifizierung und niedrigen Probe Reinheit beschränkt. Hier beschreiben wir einen Workflow zur bestätigen die Induktion der Apoptose, ApoBD Bildung zu überprüfen und ApoBDs zu hoher Reinheit zu isolieren. Wir werden auch zu skizzieren und vergleichen Fluoreszenz-aktivierte Zelle Sortieren (FACS) und Differentielle Zentrifugation basierte Ansätze, ApoBDs zu isolieren. Darüber hinaus wird die Reinheit der isolierten ApoBDs bestätigt werden, mit einer zuvor Flow Cytometry-basierte Färbung und analytische Methode zu etablieren. Zusammengenommen mit dem beschriebenen Ansatz wurde THP-1 Monocyte Apoptose und apoptotische Zelle Demontage induzierte validiert und ApoBD generiert aus Monozyten THP-1 wurden isoliert zu einer Reinheit von 97-99 %.
Introduction
Apoptose, eine gut untersuchte Form des programmierten Zelltods, ist erforderlich, um die physiologischen Homöostase aufrechtzuerhalten und potenziell schädliche Zellen im menschlichen Körper1zu entfernen. Nach der Induktion der Apoptose können apoptotische Zellen (ApoCells) durchlaufen eine Reihe von morphologischen Veränderungen und Zerlegen in kleinen Membrane-springen Vesikel bezeichnet ApoBDs. Insgesamt ist dieser Prozess ist bekannt als apoptotische Zelle Demontage und kann in 3 verschiedene Schritte anhand der Morphologie2,3geteilt werden. Schritt 1 (Plasmamembran Blebbing) zeichnet sich durch die Bildung von Ballon-ähnliche Strukturen auf der Zelloberfläche, bekannt als Blebs4,5. Schritt 2 (Apoptotic Vorsprung Bildung) umfasst die Bildung von langen Membran Vorsprünge z. B. Apoptopodia, Perlen-Apoptopodia und Mikrotubuli Spitzen6,7,8. Schritt 3 (ApoBD Bildung) umfasst schließlich die Fragmentierung des apoptotischen Vorsprünge und/oder ApoCells ApoBDs6,9erzeugen. Bisherigen Erkenntnisse haben eine Rolle von ApoBDs in Beihilfe apoptotische Zelle Abstand und Vermittlung interzelluläre Kommunikation vorgeschlagen. Zum Beispiel wird vorgeschlagen, dass die Zersplitterung der ein ApoCell in ApoBDs kleine "mundgerechte" Stücke generieren kann, die durch Phagozyten2,10,11Umgebung leicht entfernt werden konnte. Darüber hinaus können ApoBDs beherbergen eine Reihe von Biomoleküle wie DNA, RNA und Proteine, die zu den umliegenden Zellen Zellezelle Kommunikation12,13,14zu erleichtern gehandelt werden können. Um diese Prozesse funktional zu untersuchen, ist es wichtig, die drei wichtigsten Parameter einschließlich (i) Validierung der Apoptose-Induktion und ApoBD Bildung, (Ii) Isolierung von ApoBDs und (Iii) die Bestätigung der ApoBD Reinheit zu bestätigen.
Bisher wurden eine Reihe von Methoden, einschließlich der Durchflusszytometrie und Elektronenmikroskopie zur Apoptose und ApoBDs15,16,17,18zu studieren. Allerdings sind ApoBD Erkennung und Quantifizierung oft schwierig oder übersehen. Zum Beispiel routinemäßig verwendet Flow Cytometry-basierte Apoptose assay beschäftigt annexin V (A5, ein Protein, das die externalisierte bindet "Essen-mich" Signal Phosphatidylserin (PtdSer)) und Nukleinsäure Flecken Propidium Jodid (PI)19. Jedoch mithilfe dieses universelle Fleck Kombination Analyse setzt voraus, dass es nur drei Arten der Zelle Teilmengen (lebensfähige Zellen, ApoCells und nekrotische Zellen) in der Probe gibt. Darüber hinaus obwohl von vielen Forschern für die Apoptose als "Goldstandard" betrachtet, Durchflusszytometrie assays und anschließende Datenanalyse schließt oft ApoBDs durch gating zunächst FSC/SSCZwischenprodukt hoher Ereignisse auswählen. Also, vor kurzem haben wir einen neuartige Flow Cytometry Assay mit A5 und TO-PRO-3, ein weiteres Nuclein-Fleck, der selektiv durch Caspase 3/7-aktivierte Pannexin 1 (PANX1) aufgenommen werden kann Kanäle7,20. Wie Caspase 3-induzierte PANX1 Aktivierung PtdSer Exposition in der Frühphase der Apoptose vorausgeht, Flecken TO-PRO-3 differentiell apoptotische und nekrotischen Zellen. Darüber hinaus enthält dieser Ansatz kombiniert mit unserem Roman Anspritzung Strategie alle erworbenen Ereignisse während der Datenanalyse und infolgedessen sechs Zelle/Partikel Teilmengen werden identifiziert, einschließlich: (i) lebensfähige Zellen (FSC/SSCMittelstufe/hohe, A5niedrig , TO-PRO-3niedrige), (Ii) A5– frühe ApoCells (FSC/SSCMittelstufe/hohe, A5niedrig, TO-PRO-3Mittelstufe), (Iii) A5+ ApoCells (FSC/SSCMittelstufe/hohe, A5hoch , TO-PRO-3Mittelstufe), (iv) nekrotische Zellen oder späten ApoCells (FSC/SSCMittelstufe/hohe, A5hoch, TO-PRO-3hohe), (V) ApoBDs (FSC/SSCniedrig, A5zwischen-, TO-PRO-3niedrig / Fortgeschrittene), und (vi) Schutt (FSC/SSCniedrig, A5niedrig, TO-PRO-3niedrige)20. Unser Ansatz betont die Bedeutung der Analyse alle Zellen/Partikel Teilmengen und noch wichtiger ist, die Trennung der ApoBDs von Zellen und Schutt20. So zeigt dieser Ansatz eine effiziente Technik um die Induktion der Apoptose und ApoBD Bildung gleichzeitig zu überprüfen.
ApoBDs traditionell durch eine Vielzahl von Ansätzen Differentielle Zentrifugation isoliert wobei ApoBDs von Zellen oder anderen extrazellulären Vesikel anhand der Dichte getrennt werden können. Allerdings sind solche Zentrifugation Methoden oft durch niedrige ApoBD Reinheit, Mangel an eine Quantifizierung Schritt zur Probe Reinheit und/oder Unfähigkeit, Zelle typspezifischen ApoBDs17,21,22trennen bestätigen begrenzt. Daher entwickelten wir vor kurzem zwei Ansätze, ein FACS-basierten und einen neuen Differentielle Zentrifugation basierenden Ansatz, welche mit unserer vorher festgelegten Flow-zytometrie-Methode, die Induktion der Apoptose und Probe Reinheit23validieren gekoppelt werden kann. ApoBD Isolierung über unsere FACS basierenden Ansatz kann ApoBDs bis zu 99 % Reinheit bereichern und koppelbar mit einer Vielzahl von Zelle-spezifischen Antikörper gegen ApoBDs von gemischten Zellpopulationen, Gewebeproben und Körperflüssigkeiten23zu isolieren. Darüber hinaus zeigt unsere überarbeitete Differentielle Zentrifugation Ansatz eine effiziente Methode, um ApoBDs zu isolieren > 90 % Reinheit23.
In diesem Papier beschreiben wir ausführlich unsere Versuchsanordnung um Apoptose-Induktion, zu validieren und zu erkennen und ApoBD Bildung zu quantifizieren. Auch die ApoBD Isolierung Workflows mit FACS-basierte und Differentielle Zentrifugation basierenden Methoden ausgearbeitet und im Vergleich. Die repräsentativen Daten zeigen, dass die beschriebene Methodik ein effektives modernstes Werkzeug für zukünftige ApoBD Studien bietet.
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Protocol
1. Induktion der Apoptose
- Zentrifuge Zellprobe bei 300 X g für 5 min und verwerfen überstand, alle bereits bestehenden Zelle Ablagerungen zu entfernen.
Hinweis: Bei der Verwendung von adhärenten Zellen Zellen im Voraus Samen und Waschen mit 1 x Phosphat-gepufferte Lösung (PBS) vor der Apoptose-Induktion. - Bestimmen Sie Anzahl von Zellen und sammeln Sie Zellen zu.
Hinweis: Je nach Test Post-Isolierung empfehlen wir eine Zelle Anfangszahl von mindestens 1 x 107 Zellen. - Aufschwemmen Sie in komplette Medien (jeweils 10 % (Vol/Vol) fetalen Kälberserum, 50 IU/mL Penicillin, 50 µg/mL Streptomycin Mischung-haltigem Medium) für eine Endkonzentration von 1 x 106 Zellen/mL.
- Aliquoten ~ 2 x 106 Zellen pro Bohrloch eine 6-well-Platte.
- Um Apoptose induzieren, die Platte Deckel abnehmen und Zellen bei 150 mJ/cm2 mit einem UV-Strahler zu bestrahlen. Dies dauert ca. 30-60 s.
Hinweis: Vor der Bestrahlung, sicherzustellen Sie, dass ~0.5 X 106 Zellen für die "Unbehandelt" zellkontrolle aufbewahrt werden.
Hinweis: Apoptose kann auch über andere Methoden wie Anti-Fas oder Serum Hunger6induziert werden. - Inkubation bei 37° C, 5 % CO2 für 2 bis 8 Stunden, abhängig von der Zell-Linie.
- Mit einem Bench Top Lichtmikroskop, visualisieren Sie Zellen, um das Vorhandensein des apoptotischen Morphologien, z. B. Blebbing Apoptopodia Bildung und ApoBD Bildung zu bestätigen.
Hinweis: 40 X Vergrößerung ist ausreichend - Mit einer Pipette P1000, pipette und Apoptotic Proben sammeln.
- Waschen Sie die Platte mit 1 X PBS und kombinieren Sie mit restlichen Probe um maximalen Ertrag zu gewährleisten.
- Sammle ~1/10th für die "gesamte Apoptotic Probe" (WAS) steuern.
- Die "Unbehandelte" Probe zu sammeln.
- Zentrifugieren Sie die WS und unbehandelt Proben bei 3.000 x g für 6 min.
- In 1 mL 1 X PBS aufschwemmen und beiseite auf Eis.
- ApoBD Isolierung weiterhin entweder Schritt 2 oder 3 mit der restlichen Apoptotic Probe.
2. ApoBD Isolation über FACS
- Zentrifugieren Sie die gesamte Probe bei 3.000 x g für 6 min.
- Entfernen Sie den Großteil der Überstand ohne Unterbrechung das Pellet.
- In einer Färbelösung enthält 1 mL 1 x A5 Bindung Puffer, 75 µL A5-FITC und 2 µL des TO-PRO-3 pro 1 x 107 Zellen aufzuwirbeln.
- Inkubieren Sie Probe im Dunkeln bei Raumtemperatur für 10 min.
- Fügen Sie 1-2 mL 1 x A5 Bindung Puffer und Zentrifugieren Sie Probe bei 3.000 x g für 6 min um überschüssige Fleck zu entfernen.
Hinweis: Für gemischte Zellpopulationen oder Gewebeproben, führen Sie einen Antikörper Färbung Schritt mit einer Kombination aus Zelle Typ-spezifische Marker in 1 x A5 Bindung Puffer und inkubieren Sie auf Eis für 20 min (oder entsprechend des Herstellers Protokoll) vor Zentrifugation bei 3.000 x g für 6 Min. - Aufschwemmen Probe Pellet in 3 mL FACS-Puffer (1 X PBS, 1 x A5 Bindung Puffer, 10 % FSC, 2 mM EDTA) pro 1 x 107 Zellen.
- In einem Rundboden, Polypropylen (Durchflusszytometrie) Rohr durch ein 70 µm Zelle Sieb Filtern und Proben auf Eis und im Dunkeln halten.
- FACS Maschine schalten Sie ein und durchführen Sie Standardsatz mit einer Düse 100 µm, führen Sie die Drop-Verzögerung und gewährleisten Sie einen stabilen Strom.
- Laden Sie die Probe und Geschwindigkeit auf ~ 1000 Ereignisse/s festgelegt.
- Einstellen Sie FSC, SSC, APC (TO-PRO-3) und FITC (A5) Spannungen und positionieren Sie Ereignisse innerhalb der FACS Plots, um sicherzustellen, dass Populationen klar getrennt werden können.
- 20.000 Ereignisse aufzeichnen.
- Richten Sie eine gating Strategie wie in Teil 4.
- Fügen Sie in der Art-Layout das letzte ApoBD Tor als die gewünschte Sortierung Bevölkerung hinzu.
- Beginnen Sie Erwerb der Probenmaterials und führen Sie eine Test-Art durch das Sammeln von 5.000-10.000 ApoBDs in einen neuen Schlauch, ~ 250 µL FACS Puffer enthält.
- Führen Sie ein System wieder bündig und laden Sie sortierte ApoBDs zu.
- Erwerben Sie und notieren Sie Test-Art ApoBDs.
- Überprüfen Sie, ob die ApoBD Reinheit ~ 99 % ist durch Vergleich FSC (y-Achse) Vs A5 (x-Achse Veranstaltungen).
Hinweis: A5 Färbung kann leicht reduzieren bei der Analyse der Proben durch Laser-bleaching wieder. - Hoher Reinheit erreicht, Originalmuster zu laden und weiter sortieren, bis die gewünschte Anzahl an ApoBDs gewonnen wurde.
Hinweis: Falls erforderlich, kann doppelte Sortierung durchgeführt werden um ApoCells und ApoBDs gleichzeitig zu isolieren.
Hinweis: Beim Sortieren über einen langen Zeitraum hinweg empfehlen wir dem Sammelrohr bei 4 ° c inkubieren - Sobald die Sortierung abgeschlossen ist, sammeln Sie einen kleinen Teil des Post-Art ApoBDs, Post-sortieren Sie ApoCells, unbehandelt und WAS Apoptose zu überprüfen und bestätigen nach Art Reinheit.
Hinweis: Obwohl die Test-Sortierung und Post-Art Reinheit nicht erheblich abweichen sollte, basiert diese auf die Stream-Einstellungen und Stabilität.
3. ApoBD Isolation über Differentielle Zentrifugation
- Zentrifugieren Sie die restlichen Apoptotic Probe bei 300 X g für 10 min.
- Erfassen des Überstands, ~ 500 µL um nicht zu stören das Pellet Zelle zu verlassen und in ein neues 15 mL konische Röhrchen hinzufügen.
- Entfernen Sie die restlichen 500 µL und Aufschwemmen der Zelle Pellet in 2 mL 1 X PBS (Dies entspricht die ApoCell angereicherte Fraktion.
- Zentrifugieren Sie die gesammelten überstand für 20 min bei 3.000 g.
- Überprüfen Sie, ob ein Pellet und entfernen Sie vorsichtig den überstand (Überstand kann kleine extrazelluläre Vesikel einschließlich Microvesicles und exosomen enthalten).
- Aufschwemmen Sie das Pellet in 1 mL 1 X PBS (Dies entspricht den 'ApoBD-angereichert' Bruch)
- Sammeln Sie 100 µL der einzelnen lebensfähig, WS, ApoCell bereichert, und ApoBD angereicherte Proben in einer neuen Rundboden, Polystyrol (Durchflusszytometrie) Rohr.
- Hinzufügen von 100 µL der Fleck mit 2 x A5-Bindung Puffer, 1: 100 A5-FITC und 1:1,000 TO-PRO-3
- Inkubation bei Raumtemperatur für 10 min in der Dunkelheit.
- Analysieren Sie Proben von Durchflusszytometrie, mit der gating-Strategie wie oben beschrieben, um die erfolgreiche Induktion der Apoptose und Reinheit der ApoBD angereicherte Fraktion zu validieren.
4. die Durchflusszytometrie Anspritzung Strategie
- Plot-TO-PRO-3 (y-Achse) gegen FSC (x-Achse), nekrotische Zellen (TO-PRO-3hoch) von allen anderen nicht-permeabilized Veranstaltungen (TO-PRO-3Low/Mittelstufe) zu trennen.
- Wählen Sie alle nicht-permeabilized Ereignisse und plot-SSC gegen A5. Tor, zwei Populationen einschließlich Bevölkerung 1 (P1), SSCmittleren/hohen,niedrigen/mittleren Zellen A5 und 2 (P2), alle anderen Ereignisse.
- P2 plot TO-PRO-3 gegen A5 und wählen Sie A5mittleren/hohen Veranstaltungen alle zellenrückstand auszuschließen.
- Wählen Sie alle A5 positive Ereignisse und Plotten Sie FSC gegen A5. ApoCells (FSCMittelstufe/hohe) ApoBDs (FSCniedrig) trennen.
Hinweis: Bei ApoBDs für ApoBD Isolierung über der FACS basierenden Ansatz gating, empfehlen wir einen endgültigen Schritt durch ApoBDs und TO-PRO-3 bis A5 vergleichen und auswählen alle Ereignisse. Dies sorgt dafür, dass die endgültige sortierschleuse Fluoreszenz anstelle von FSC/SSC-Parameter verwendet. - Wählen Sie P1 für tragfähige Zellanalyse und führen Sie einen der beiden gating Strategien. Plotten Sie für allgemeine tragfähige Zellanalyse FSC gegen A5 und markieren Sie alle FSCmittleren/hohen Zellen, daher entfernen verbleibenden zellenrückstand. Alternativ für eingehende Analyse, lebensfähige Zellen trennbar von A5– frühen ApoCells von TO-PRO-3 gegen FSC Plotten. Wählen Sie TO-PRO-3niedrige, FSCmittleren/hohen lebensfähige Zellen und TO-PRO-3intermediate, FSCmittleren/hohen A5– frühe ApoCells.
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Representative Results
Hier beschriebene Verfahren verwenden, THP-1 Monocyte Apoptose induziert wurde und ApoBDs wurden erkannt und isoliert entweder über eine FACS-basierte oder eine Differentielle Zentrifugation Ansatz (Abbildung 1). Erstens Apoptose induziert wurde durch UV-Bestrahlung und Proben wurden nach 2-3 h Inkubation gesammelt, wenn Zellen Apoptose Morphologien, einschließlich Blebbing, apoptotischen Membran Vorsprung Bildung und die Generation der ApoBDs6ausgestellt. Eine TO-PRO-3 und A5-basierte Flow-zytometrie-Methode wurde verwendet, um die Induktion der Apoptose Monocyte und ApoBD Bildung zu bestätigen durch die Trennung von entwicklungsfähigen Zellen, nekrotische Zellen, frühe ApoCells, ApoCells, ApoBDs und Schutt (Abbildung 2). Zusammengenommen, Flow Cytometry Analyse darauf hingewiesen, dass UV-Behandlung in ~ 20 % führt zu einer ApoCells (Abbildung 3).
THP-1 Monocyte ApoBDs wurden dann isoliert von dem WAS über zwei Ansätze. Erstens wurden Proben für eine hohe Reinheit FACS basierenden Ansatz, wo nur ein einziges Zentrifugationsschritt erforderlich ist, um die gesamte Apoptotic Probe vor dem Beflecken Pellet, vorbereitet und FACS. Diese Methode eignet sich für funktionelle Assays, wenn deutlich hoher Abtastrate Reinheit benötigt (z.B. für qPCR-Analyse) wird, wenn eine bestimmte Anzahl von ApoBDs erforderlich ist oder wenn Erwerb von Handy-Typ-spezifischen ApoBDs aus einer komplexen Stichprobe. Mit dieser Methodik, wurden ApoBDs ~ 99 % Reinheit (Abbildung 4) isoliert.
Als nächstes wurden THP-1 Monocyte ApoBDs auch über einen zweistufigen Ansatz Differentielle Zentrifugation isoliert. Der erste Schritt beinhaltet die Isolierung der lebensfähigen Zellen, ApoCells und nekrotische Zellen. Der zweite Schritt umfasst die Trennung der größeren ApoBDs von kleinen extrazelluläre Vesikel wie Microvesicles und exosomen, die nicht in der Lage, bei 3.000 x g. Durchflusszytometrie pelleted erfolgte dann um Apoptose-Induktion und ApoBD Probe Reinheit zu bestätigen und zeigte eine ApoBD angereicherten Probe mit ~ 97 % ApoBDs (Abbildung 4). Dies stellt eine schnelle und effektive Technik, um ApoBD zu relativ hohen Reinheit zu isolieren und ist geeignet, wenn ApoBDs von Proben, die eine einzelne Zelle Art zu reinigen.
Abbildung 1 . Schematische Darstellung der ApoBD Isolation über entweder einen FACS-basierte oder Differentielle Zentrifugation Ansatz. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Abbildung 2 . Flow Cytometry Strategie gating. Sechs Zellen/Partikel Teilmengen (einschließlich der lebensfähige Zellen, A5– frühe ApoCells, A5+ ApoCells, nekrotische Zellen, ApoBDs und Schutt) wurden identifiziert und verwendet, um ApoBD für FACS-basierte Isolation auszuwählen. (a) Membran Permeabilised nekrotische Zellen sind von nicht-Permeabilised Ereignisse getrennt. (b) A5Low-Intermediate, SSC-tief-hoch -Zellen sind von A5Aufsteigend Ereignisse getrennt. (b.i) für eingehende Analyse, TO-POR-3niedrige lebensfähige Zellen von TO-PRO-3mittlere A5 trennbar– frühe ApoCells. (b.ii) Alternativ Berechnung einfach ApoBD Reinheit, lebensfähige Zellen können getrennt werden vom FSCniedrigen Veranstaltungen. (c) A5geringe Trümmer sind ausgeschlossen. (d) FSCmittleren/hohen ApoCells sind getrennt von FSCniedrige ApoBDs. (e) alle A5-TO-PRO-3mittleren/hohen ApoBDs werden ausgewählt, für die Sortierung. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Abbildung 3 . Validierung der THP-1 Monocyte Apoptose. Flow-zytometrie-Analyse von unbehandelten oder UV-Bestrahlung THP-1 Monozyten wurde durchgeführt, um festzustellen, das Niveau der lebensfähigen Zellen, A5– frühe ApoCells, A5+ ApoCells, und nekrotischen Zellen.
Abbildung 4 . Reinigung des THP-1 Monocyte-abgeleitete ApoBDs. Flow-zytometrie-Analyse wurde an isolierten THP-1 Monocyte abgeleitet ApoBDs über entweder einen FACS-basierte oder Differentielle Zentrifugation basierten Ansatz zeigt die Bereicherung des ApoBDs von entwicklungsfähigen Zellen, ApoCells und nekrotische Zellen durchgeführt. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
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Discussion
Seit seiner frühen Beschreibung in den 1950er Jahren avancierte das Feld der Apoptose deutlich, immer ein prominenter Forschungsgebiet. Trotz der breiten Interesse und umfangreiche Bemühungen sind bestimmte Aspekte der Apoptose, insbesondere die Bildung von ApoBDs, aufgrund des Fehlens geeigneter Methoden nicht gut untersucht worden. Dazu gehören vor allem die Einschränkung bei der Verfolgung von Apoptose Progression und ApoBD Bildung gleichzeitig mit der traditionellen Durchflusszytometrie A5/PI-Analyse und die Verunreinigungen der ApoBD Isolation. Vor kurzem haben wir Ansätze, um diese methodische Mängel zu beheben.
Unsere neue Flow Cytometry-basierte analytische Ansatz ermöglicht ApoBDs, die werden oft ignoriert, mit traditionellen analytischen Methoden, um erkannt zu werden und20quantifiziert. Darüber hinaus verändert das Flow Cytometry Methode, mit der Verwendung des Flecks TO-PRO-3, zeigt eine zusätzliche A5– Apoptotic früh Rendern daher bessere Abgrenzung der Apoptose Fortschreiten20. Konventionell, ApoBD Erkennung haben setzte stark auf Image-basierte Techniken wie konfokale Mikroskopie und Histologie, während unser Flow-zytometrie-Methode bietet einen Hochdurchsatz-Ansatz zur quantitate ApoBD Bildung. Obwohl scheinbar komplexe, das Verfahren ist relativ einfach und erfordert nur im Handel erhältlichen Reagenzien und eine grundlegende Durchflusszytometer. Die logische Erkennung und präzise Quantifizierung von ApoBDs weiter würde die Kenntnis der apoptotischen Zelle Mikroumgebung, dass Handy-Diktat-Clearance und Immunreaktionen. Durch die Kopplung von hier beschriebenen Flow-zytometrie-Methode mit Organell-spezifische Flecken, in der Tat haben wir vor kurzem die heterogene Verteilung der zellulären Inhalt in ApoBDs24berichtet. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass ApoBDs in verschiedene Untergruppen eingeteilt können und jede Teilmenge ApoBD kann unterschiedliche Funktionen aufweisen.
Unsere neu entwickelten ApoBD ISOLIERUNGSTECHNIKEN würde auch zu Fortschritten im Bereich der extrazellulären Bläschen beitragen. Traditionell gehören Differentielle Zentrifugation Methoden zur Isolierung der ApoBD eine erhebliche Menge an kleineren Zellen, die nachgeschalteten funktionelle Assays beeinträchtigen können. Allerdings kann unsere modifizierte Differentielle Zentrifugation Ansatz verwendet werden, ApoBDs, 97 % Reinheit zu isolieren. Obwohl hoher Reinheit durch Differentielle Zentrifugation erreicht werden kann, kann diese Methode zur Isolierung von ApoBDs von komplexen Proben nicht geeignet. Im Gegensatz dazu unsere FACS-basierte Methode kann ApoBDs zu 99 % Reinheit bereichern, und basiert auf die biologischen Besonderheiten der ApoBDs einschließlich der Partikelgröße, Granularität und PtdSer Exposition, anstatt allein auf Teilchendichte. Dieser Ansatz hat auch die Möglichkeit, gleichzeitig identifizieren und isolieren, ApoBDs andere Zelle Herkunft mit Zelle Typ-spezifische Marker24. Trotz ein langwieriges FACS-Verfahren bringt 1-8 h abhängig von der Menge des ApoBDs benötigt, würde genau ApoBD Isolierung und anschließende nachgelagerte Analyse direkte Zurechnung von der molekularen Eigenschaften und Funktionen des ApoBDs ermöglichen. Für solche Methoden ist es wichtig, dass ApoBD Isolierung Ansätze mit Techniken wie Durchflusszytometrie gekoppelt sind (wie hier beschrieben) um sowohl die Induktion der Apoptose und Reinheit der ApoBD angereicherten Probe zu überprüfen. Darüber hinaus unbedingt richtige FACS einrichten ApoBD Isolierung über der FACS basierenden Ansatz, da geringe Reinheit einen instabilen Stream oder nicht falsch ausgeführte Drop Verzögerung führen kann.
Gemeinsam haben wir modernste Methoden zur Quantifizierung der Apoptose-Induktion, ApoBD Nachweis und Isolierung von hochreinen ApoBDs skizziert. Unser Ansatz kann ein neues Instrument zur Untersuchung des apoptotischen Zelle Demontage Prozess und verdeutlichen die Rolle dieses Prozesses in Krankheit Einstellungen bereitstellen.
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Disclosures
Die Autoren haben nichts preisgeben.
Acknowledgments
Das funktionierte wurde unterstützt durch Zuschüsse aus dem National Health und Medical Research Council (GNT1125033 und GNT1140187) und Australian Research Council (DP170103790), I.K.H.P.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Cells e.g. cultured human THP-1 monocytes (clone number: TIB-202) | ATCC | - | |
| RPMI 1640 medium | Life Technologies | 22400-089 | |
| Penicillin-streptomycin mixture | Life Technologies | 15140122 | |
| FSC | Gibco | 10099-141 | |
| 1x PBS | - | - | |
| Annexin V FITC | BD Bioscience | - | |
| TO-PRO-3 iodide | Life Technologies | T3605 | TO-PRO-3 may cause skin, eye and respiratory irration. Avoid direct contact. |
| 10x Annexin V binding buffer | BD Bioscience | 556454 | |
| EDTA | Sigma-Aldrich | 1001710526 | |
| Centrifuge tube (15 mL) | Cellstar | 188271 | |
| Microcentrifuge tube (1.5 mL) | Sarstedt | 72.690.001 | |
| Tissue culture incubator (37 °C, 5% CO2) | - | - | |
| Centrifuge | Beckman Coulter | 392932 | |
| FACS ARIA III Flow cytometer, configured with two lasers for FITC and APC detection | BD Bioscience | - | |
| FACS Canto II Flow cytometer, configured with two lasers for FITC and APC detection | BD Bioscience | - | |
| FACS Diva 6.1.1 software | BD Bioscience | - | |
| FlowJo 8.8.6 software | - | - | |
| UV Stratalinker 1800 | Stratagene | - |
References
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