Summary
Bu çalışmada, biz iki fotonlu intravital görüntüleme ve hücre etkileşim fare trakeal mukoza grip virüsü ile enfeksiyon sonra çözümlemesi için bir protokol mevcut. Bu iletişim kuralı bağışıklık hücre dynamics sırasında solunum yolu enfeksiyonları eğitim araştırmacılar için ilgili olacaktır.
Abstract
Hücre-hücre ya da hücre-patojen etkileşim içinde vivo analizini enfeksiyon bağışıklık yanıtının dinamiklerini anlamak önemli bir araçtır. İki fotonlu intravital mikroskobu (2P-IVM) hücre etkileşimlerin gözlenmesi yaşayan hayvanlarda derin doku resim alma sırasında oluşturulan photobleaching en aza indirirken sağlar. Bugüne kadar farklı modeller için 2P-IVM lenfoid ve sigara lenfoid organlar tarif edilmistir. Ancak, bir meydan okuma hayvan solunum döngüsü ile ilişkili hareket nedeniyle solunum organlarının görüntüleme kalır.
Burada, in vivo bağışıklık hücre etkileşimlerde trakea 2 P-IVM kullanarak grip virüsü ile enfekte fareler görselleştirmek için bir protokol açıklayın. Bu amaç için cerrahi pozlama ve nötrofil ve dendritik hücreler (DC) Mukozal epitel dinamik görüntülerini edinimi ardından trakea, entübasyon dahil özel bir görüntüleme platformu geliştirdi. Ayrıca, grip burunici enfeksiyon ve akış sitometrik bağışıklık hücrelerinin borusunda çözümlemesi için gereken adımları ayrıntılı. Son olarak, analiz ettik nötrofil ve DC hareketliliği gibi onların etkileşim bir film boyunca. Bu iletişim kuralı istikrarlı ve parlak 4 D görüntüleri oluşturmak için hücre-hücre etkileşimleri trakea değerlendirilmesi için gerekli sağlar.
Introduction
İki fotonlu intravital mikroskobu (2P-IVM) içinde onların doğal çevre1oluştuğunda gibi hücre hücre etkileşimlerin gerçek zamanlı görüntüleme için etkili bir tekniktir. Bu yöntemin ana avantajlarından biri hücresel süreçler diğer geleneksel görüntüleme teknikleri2ile karşılaştırıldığında daha büyük bir örnek Derinlik (1 mm için 500 µm) adlı çalışması sağlanmıştır. Aynı anda iki fotonlu lazer tarafından oluşturulan iki düşük enerjili fotonlar kullanımı genellikle görüntü alma işlemi2ile ilgili doku fotoğraf-zarar en aza indirir. Son on yılda 2P-IVM hücre-hücre etkileşimleri çeşitli disiplinleri3,4,5farklı türde çalışma uygulandı. Bu çalışmalar kendi yüksek dinamizm ve tanınmış kişiler diğer hücreleri ve çevre tarafından oluşturulan sinyalleri takip oluşumu ile karakterizedir bağışıklık hücreleri araştırmak özellikle ilgili olmuştur. 2P-IVM da patojen ve ana bilgisayar6arasındaki etkileşimler çalışma uygulandı. Nitekim, daha önce bazı patojenlerin engelleyici, sonuç olarak, immün yanıt7bağışıklık hücreleri arasında temas süresi ve türünü değiştirebilirsiniz gösterilmiştir.
Hava yolu mukoza bağışıklık yanıtı havadan patojenlere karşı olduğu ilk sitesi8oluşturulan olduğunu. Bu nedenle, bu doku etkileşimlerde patojen-ana bilgisayar analizini vivo içinde konak savunma mekanizmaları başlatılması sırasında enfeksiyon anlamak için önemlidir. Ancak, 2P-IVM solunum yolları, özellikle resim alma sürecinin ödün vermez hayvan solunum döngüsü tarafından üretilen eserler nedeniyle zordur. Son zamanlarda, farklı cerrahi modelleri görüntüleme fare trakea9,10,11,12 ve akciğerleri13,14,15'anlatmıştık, 16. Trakeal 2P-IVM modelleri akciğer-alveoller 2 P-IVM modelleri enfeksiyonların geç faz çalışmaya daha uygun olmakla birlikte üst solunum yolları, bağışıklık reaksiyonu başlangıç aşamasında görselleştirmek için mükemmel bir set-up temsil eder. Lazer optik penetrasyon kısıtlamak ve intrapulmonary airways mukozal tabakasının içinde vivo 17 görüntüleme için erişilmez hale hava dolu alveoller varlığı ile ilişkili bir sınırlama Gelişmiş akciğer modelleri mevcut . Bunun tersi olarak, sürekli bir epitel tarafından kurulan trakea yapısını resim alma kolaylaştırır.
Burada, grip enfeksiyon, cerrahi hayvanlar hazırlanması ve 2 P-IVM trakea, gerçekleştirmek için gereken adımları ayrıntılı bir açıklamasını içeren bir protokolü mevcut. Buna ek olarak, belirli bir deneysel kurulum nötrofil ve dendritik hücreler (DC), grip virüsü18karşı,19 arabulucu savunma mekanizması olarak önemli bir rol oynamak iki bağışıklık hücre tipleri görselleştirme için tarif . Son olarak, nötrofil-DC etkileşimleri analiz etmek için bir yordam açıklanmaktadır. Bu kişiler DC harekete geçirmek modüle gösterilmiştir ve daha sonra patojenler20karşı bağışıklık yanıtı etkileyecek.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
Tüm hayvan yordamlar içeren fareler İsviçre Federal veteriner dairesi yönergeleri ve hayvan iletişim kuralları uyarınca gerçekleştirilen yerel veteriner yetkilileri tarafından kabul edildi.
1. CD11c-YFP fareler grip enfeksiyonu
- Biyogüvenlik
Not: Adapte fare zorlanma (PR8) grip A/Puerto Rico/8/34 H1N1 döllenmiş yumurta büyüdü, saf ve yukarıda açıklanan21titre. Tüm enfekte hayvan ya da biyolojik örnekleri içeren merdiven were bir Biyogüvenlik Biyogüvenlik düzeyi (BSL) göre kabin altında 2 koşulları yürütülmektedir.- Biyogüvenlik kabini ile % 70 etanol çözüm temiz önce ve sonra enfeksiyon yordam.
- Aşağıdaki uygun kim Biyogüvenlik yönergeleri (http://www.who.int/csr/resources/publications/biosafety/Biosafety7.pdf) Bu işlem sırasında üretilen tüm atık maddeler atmak. Autoclavable depo gözlerindeki katı atık ve kirlenmiş sıvı plastik torbalarda % 70 etanol çözüm veya tıbbi dezenfektan ile dolu atın.
- Grip burunici enfeksiyon
NOT: B6. CG-Tg(Itgax-Venus) 1Mnz/J (CD11c-YFP)22 C57BL/6J arka plan bu çalışmada kullanılmıştır. Fareler belirli patojen-Alerjik tesiste Araştırma Enstitüsü'nde Biyomedikal muhafaza.- En fazla 5 yaş ve cinsiyet-eşlemeli (altı sekiz haftalık ') CD11c-YFP fareler kafesi yerleştirin. Fareler calıştıkları konut koşullarını daha önce enfeksiyon yordam için en az iki gün bekleyin.
- PR8 hisse senedi defrost ve soğuk 1 x 200 plak oluşturan birimler (PFU) son bir konsantrasyon elde etmek için Dulbecco'nın fosfat tampon serum kalsiyum klorür ve magnezyum klorür (PBS) değişiklik kullanarak karşılık gelen seyreltme 30 µL. tutun virüs seyreltme içinde hazırlamak Tüm prosedürü sırasında buz üzerinde.
Not: titrasyon her toplu işleminin kullanımı önce grip virüsü kesin enfeksiyon doz emin olmak için tavsiye edilir. - Ketamin (100 mg/kg) ve xylazine (10 mg/kg) bir doz intraperitoneally enjekte (IP) 26 G iğne 1 mL şırınga kullanarak.
- Fare tamamen imzalat (tam kaybı iyileştiren ve pedal çekilme refleks) tamamlanana kadar bekleyin. Değil tamamen imzalat fareler yutmak veya enfeksiyon doz değişimler önde gelen virüs inoculum okuldan beri derin anestezi en uygun enfeksiyon için gereklidir.
- Sırtüstü pozisyonda yer imzalat fare. Virüs inoculum 15 µL toplamak. Fare sol burun deliği yakın pipet ucu yerleştirin ve viral inoculum damla damla dağıtmak. Damla inhale gerekir gibi onları doğrudan burun boşluğu içinde pipette değil.
- 2-5 dakika bekleyin ve virüs inoculum doğru burun içinde kalan 15 µL içeren pipet ucu yerleştirin.
Not: boğulma önlemek için yaklaşık 20 s aralıklarla küçük boyutlu damla dağıtmak. - Fare düzgün nefes kontrol ve yanal dekübitusiçinde bir kafese yerleştirin. Fare nefes ve anestezi kurtarma (yaklaşık 60 dakika sonra indüksiyon) izlemek.
Not: 1'den fazla fare aynı zamanda enfekte mümkündür. Bu durumda, sırayla tüm fare sol burun içinde viral inoculum yönetmek, 2-5 dakika için bekleyin ve doğru burun deliği virüsü yönetmek. Bireyler arasında değişkenlik önlemek için aynı anda en fazla 3 fareler bulaştırmak. - Hayvan sağlık durumu ve kilo kaybı her gün izlemek.
- Fareler tarafından yetki kuralları kararlı insana ilişkin son nokta göre ötenazi. Ötenazi yöntemi hayvan deney yetkilileri tarafından onaylanması gerekiyor ve yerel etik düzenlemelere uymak zorunda. İki fotonlu deneyler sonra ketamin/xylazine servikal çıkığı tarafından takip aşırı doz yönetimi tarafından fareler ötenazi. Diğer tüm deneyler içinde CO2 inhalasyon ötenazi için bir yöntemi olarak kullanın.
Not: virüs bulaşmış trakea, % 50 doku kültürü infektif doz (TCID50) tahlil veya gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu viral titreleri ölçmek için (RT-PCR) tahlil yukarıda açıklanan23gerçekleştirilebilir.
- Nötrofil istihdam trakea akış sitometresi tarafından değerlendirilmesi
Not: Bu protokol isteğe bağlı bir parçasıdır. Bu grip enfeksiyonu takip trakeal mukozasında nötrofil işe alım değerlendirmek amaçlamaktadır.- Virüslü ve bulaşmamış kontrol fareler, 3. gün sonrası enfeksiyon (özel dedektif) CO2 inhalasyon tarafından ötenazi.
Not: trakeal zarar görmesini önlemek için servikal çıkığı hayvanlara ötenazi için kullanmaktan kaçının. Ayrıca, perfüzyon euthanized farelerin kan nötrofil kirlenme önlemek için tavsiye edilir. - Fare boyun % 70 etanol çözüm ile sprey ve bir cilt kesi çene için göğüs cerrahi makas kullanarak gerçekleştirebilirsiniz.
- Tükrük bezleri forseps kullanarak ayırın ve trakea bulaşmasına neden.
- Forseps ve makas kullanarak nefes borusu çevresindeki kaslar incelemek.
Not: trakea işlem sırasında kolayca zarar görebilir bu adımı dikkatli bir şekilde gerçekleştirilmesi gerekir. - Trakea forseps ile tutun ve yemek borusu diseksiyon tarafından dikkatle bağlantısını kesin.
- Trakea intratorasik parçası forseps ile tutarak, bir kesi bronş ağacının başında olun. Trakea gırtlak üzerinden bağlantısını kesin ve dikkatli bir şekilde çıkarın herhangi bir kas için yorum yaptı.
- Organ içeren RPMI 1640 + HEPES Orta (RPMI) buz üzerinde 1,5 mL tüp yerleştirin.
- 0,26 adet/mL collagenase (ı ve II) ve 0.2 mg/mL DNaz içeren trakea sindirim enzim karışımı hazırlayın ı RPMI.
- Enzim karışımı 1 mL içeren bir 6-şey plaka disseke borusunda bir yer.
- Org forseps ve makas yardımı ile küçük parçalar halinde kesin. Bu adımı sırasında plaka buz üzerinde tutun.
- 45 dk 37 ° C'de kuluçkaya. Bu süre boyunca, plaka her 15dk sallamak.
- Enzim sindirim PBS içinde 1 mL FACS çamaşır arabelleği (2 mM EDTA ve % 2 ısı inaktive filtre sterilize fetal Sığır serum (FBS)) ekleyerek durdurmak.
- Doku kısmen sindirilmemiş parçalarını ilişkisini kaldırmak yardımcı olmak için 1 mL pipet ile çözüm resuspend.
- Çözüm için başka bir şey 40 µm süzgeç aracılığıyla içeriği geçirerek aktarın. Sonra yavaşça 2 mL şırınga lavabo pompası kullanarak süzgeç üstünde tepe-in tuzağa organ kalan parçalarını şut.
Not: trakea kısmen sindirilmemiş parçaları süzgeç Smashing hücrelerinin en uygun bir numarası akış sitometrik çözümlemesi sırasında almak için kritik bir adımdır. - Kuyu ve süzgeç FACS çamaşır ile tampon ve 5 mL tüp süspansiyon aktarım yıkama buz tuttu.
- 166 x g 4 ° C'de 5 min için de tüpler santrifüj kapasitesi Süpernatant atın ve 100 µL FACS çamaşır arabelleği hücrelerde resuspend.
- Antikor yüzey akış sitometresi için boyama ile devam edin. Kısaca, Fc reseptör bir antikor CD16/32, yüzey boyama tarafından takip karşı kullanarak izole hücre bloğu. Nötrofil doğru tanımlamak için akış sitometresi paneli aşağıdaki antikor içermelidir: αLy6G, αCD11b, αCD45 yanı sıra bir canlılık boya ölü hücreleri dışlamak için.
- Örnekleri tüm içeriği üzerinde bir akış sitometresi çalıştırmak ve verileri analiz.
- Bağışıklık hücreleri sayısı almak için değil 3000 olaylar/s yüksek bir hızda tek hücre süspansiyon çalıştırın. Bu satın alma sırasında dışlanan olayların sayısını azaltacaktır. Bu iletişim kuralını kullanan, 1 ila 2 milyon hücre trakea başına elde etmek mümkün olacaktır.
- Virüslü ve bulaşmamış kontrol fareler, 3. gün sonrası enfeksiyon (özel dedektif) CO2 inhalasyon tarafından ötenazi.
2. izolasyon ve enjeksiyon nötrofil
Not: Bu yordamda, B6.129 (ICR)-Tg (CAG-ECFP) CK6Nagy/J fareler (CK6-ECFP) kullanılan24olduğunu. Bu hayvanlar tüm hücre türleri'nin altında insan β-aktin organizatörü CFP ifade eder. Alternatif olarak, hücre ayırmak ve onları 2.6. adımda anlatılan protokolüne göre leke C57BL/6J fare kullanmak mümkündür. Arıtma ve nötrofil manipülasyon potansiyel göç ve fonksiyonel özelliklerini değiştirerek onların harekete geçirmek durum artabilir.
- Hayvan CO2 inhalasyon tarafından ötenazi.
- Kalça ve yırtılmalarıteşhis çıkarmak ve nazikçe onları temiz forseps kullanarak.
- Kemik epifizleri kesme ve kemik iliği buzda muhafaza 50 mL tüp içinde steril soğuk PBS ile dolu bir 1 mL şırınga kullanarak floş.
- Hücreleri bir 18 G iğne ile resuspend ve hücre süspansiyon ile 40 mikron süzgeç filtre. Bir kez vasıl 110 x g 4 ° C'de 5 min için PBS ile yıkama ve 2 mL soğuk PBS hücrelerde resuspend.
-
% 100 oranında seyreltin Percoll 9:10 x PBS 1 ve percoll % 72, %64 ve % 52 1 x PBS kullanarak degrade çözümleri hazırlayın. Dikkatle her üç degradeler 15 mL tüp içinde 2 mL kat, en başlayan bir konsantre.
- Dikkatle 2 mL kemik iliği hücre süspansiyon gradyanlar ve santrifüj en üstünde, 1100 x g hızlanma ve fren olmadan (RT) Oda sıcaklığında 30 dakika için ekleyin.
- Dikkatle %64 ve % 72 arasında arayüz band kaldırmak ve bir kez 200 x g 4 ° c soğuk PBS ile 5 min için de yıkayın. PBS 100 μL hacmi hücrelerde resuspend ve buz üzerinde tutun. Nötrofil saflığı 90 daha yüksek olması bekleniyor.
- İsteğe bağlı olarak, etiket nötrofil üreticinin iletişim kuralını kullanarak bir hücre proliferasyonu kiti ile. 1 ml hacminde 10 mikron son bir konsantrasyon için hücre süspansiyon boya eklemek için 30 dk 37 ° C'de kuluçkaya ve (166 x g, 5 min) yıkayın.
- Bir hemasitometre kullanarak hücre konsantrasyonu tahmin etmek ve intravenöz 5 x 106 hücrelerinde maksimum hacmi 100 μL görüntüleme önce 12 h bir 26 G iğne 1 mL şırınga kullanarak daha önce enfekte CD11c-YFP+ farelerde enjekte.
3. fareyi görüntüleme için hazırlanması
-
Anestezi
- 3. gün p.ı. Adım 1.2.3 göre enfekte CD11c-YFP+ fareler anestezi.
- Fareler derin anestezi sonra kateter yeniden anestezi dozaj için hazırlayın.
- 30 G iğne forseps kullanarak bir şırıngadan çıkarın.
- İğneyi PE-10 Tıbbi silikon tüp 20 cm parçasına takın.
- Tüp diğer tarafında ketamin/xylazine karışımı ile dolu bir 30 G iğne şırınga yerleştirin.
- Tüp içindeki hava kaldırmak.
- Bir tüp oksijen makine otomatik havalandırma (Şekil 1Aben) korumak için insufflating bağlı bir 20 G kateter hazırla. 130 vuruş / dakika (b.p.m.) nefes oranında 0.2 mL % 100 oksijen gaz kullanarak gelgit hacmi ile açık olarak ayarlayın.
-
Fare ameliyat için hazırlayın
- Isıtmalı bir tabak veya 37 ° C'de ameliyat her zaman için ayarla ısıtmalı bir cerrahi tezgah üzerinde fareyi belirli özelleştirilmiş cerrahi tahtası (Şekil 1AII-III) tutmak.
- Tıraş ve depilatory bir krem kullanarak fare boyun saç tıraş (Şekil 1Bı).
- Fareyi plastik fare üzerinde konumsal getirin (Şekil 1AII-a), pozisyonel dışında hayvan kafa tutmak (trakea entübasyon kolaylaştırır bir açı oluşturmak içinŞekil 1BII).
- Ön ayakları, pençeleri ve kuyruk cerrahi bant ile düzeltmek, fare gözleri bir A vitamini zenginleştirilmiş jel ile nemlendirin ve fare boyun (Şekil 1BII) dezenfekte.
-
Cerrahi
- Yani, makas, mikrocerrahi makas ve forseps düzgün autoclaved öğelerini hazırlayın.
- Boyun, yaklaşık 1 cm uzunluğunda, üst göğüs ve alt çene (Şekil 1BIII) daha düşük noktası üzerinden geçen çizgi arasındaki orta alanda uzun orta eksen üzerinde küçük bir insizyon attım gerçekleştirin.
- Yanal hareket deri yamalar ve tükürük bezleri ve kasları tarafından örtülü trakea görselleştirin. O zaman, dikkatlice forseps (Şekil 1BIII) kullanarak trakeal kas incelemek.
- Fare bir kateter ile entübasyon ve suni havalandırma (Şekil 1BIV) başlatın.
Not: Kateter trakeal mukoza ve bir iç demir iğne koruyan bir dış plastik parçası, oluşur. İğne varlığını genişletmek ve trakea stabilize etmek üzere ve onun fuar düzenlemek için ideal bir çözüm temsil eder. Kateter aracılığıyla suni havalandırma fare doğru nefes garanti edecek. - Nefes monitör fare için suni havalandırma başlamak hemen.
- Kateter yüksekliği ve belirli çubuk üzerinde cerrahi kurulu (Şekil 1AII-b) bağlı bir cerrahi kanca (Şekil 1Bv) kullanarak yönlendirmesi düzeltmek. Trakea çene aynı yükseklikte maruz.
- Trakea vazelin ile sarmak ve organ (Şekil 1BVI) için uygun hidrasyon güvence altına almak için önceden ısıtılmış PBS birkaç damla ile kaplayın.
- Coverslip hazırlık üzerine monte. Bu adımda, bir coverslip XYZ çevirmen (Şekil 1AII-c) vidalı bir metal kutusunda (Şekil 1BVII), tutkal. Coverslip cerrahi hazırlık üzerine yerleştirmek için XYZ çevirmen ayarlayın.
- İntraperitoneally anestezi yönetimi için kateter yerleştirin (Şekil 1BVIII).
- Ketamin/xylazine karışımı her 30 dakikada ilk doz % 50'si enjekte.
Not: % 50 den başlayarak ilk ketamin/xylazine karışım % 25'e yeniden dozaj güvenli ve geçerli alternatif25' tir. Ancak, bu iletişim kuralı terminal ve sıkı bir immobilizasyon hayvanın tüm prosedürü sırasında gerekli beri daha yüksek dozlarda derin cerrahi uçağa anestezi korumak için kullanın.
4. Vivo içinde zaman hata görüntüleme
Not: Resim alma iki Ti:Sa lazerler, ısı kontrollü kuluçka odası ve bir 25 X ile donatılmış bir dik iki fotonlu mikroskop ile gerçekleştirildi / NA 1.1 su daldırma amaç. Resim alma için kullanılan photomultipliers (PMT) hibrid dedektörleri veya yüksek hassasiyet GaAsP vardı.
- Cerrahi kurulu imzalat fare ile (37-38 ° C önceden ısıtılmış) mikroskop kuluçka odası içine yerleştirin ve coverslip üzerinde bir damla su ekleyin.
- Merkezi ve bul trakeal doku odaklanmak.
-
Tarama sıklığı 520 x 520 piksel, görüş alanı 440 x 440 μm kalınlığında2 800 Hz olarak ayarlayın ve içini kaplamak ortalama 1.
- Melodi Ti:Sa lazer 830 için kollajen, 150 bir kaynaktan gösterge bir güçle gelen ikinci harmonik üretimi (SHG) heyecanlandırmak için nm mW. İkinci Ti:Sa lazer 920, nağme ile 94 nm mW kaynağında CFP ve YFP heyecanlandırmak için.
- Kurulum 3D ve timelapse edinme moduyla aynı anda uyarma
Not: lazer güçler photobleaching ve fototoksisite en aza indirmek mümkün olduğunca düşük tutmak.
- Sigara descanned modunda, ana Dikroik ayna 560, iki kanal kullanarak kayıt floresans nm. Bu protokol için kullanılan kurulum içinde ikinci bir Dikroik ayna 495, sinyal split nm ayırmak için Kanal 1 Kanal 2 (emisyon filtre 525/50) (emisyon filtre 475/50) (Şekil 2A). Bu yapılandırma SHG kollajen ilk kanal üzerinden ışık CFP emisyon her iki kanal 1 ve 2 toplanır ve YFP Kanal 2 sadece toplanan toplar.
- Bir aralığı 50 mikron 3 mikron (voxel boyutu 0,86 mikron x 3 mikron) adım büyüklüğü ile Z ekseni boyunca tanımlayın. Kaydı görüntüler her 30 s 30 dk toplam süresi için.
- İsterseniz, birden çok bölge elde etmek. Daha fazla satın almalar çalıştırmadan, yaşam belirtileri kontrol ve anestezi (bkz. Adım 3.3.10) gerekirse kateter aracılığıyla kanlarını.
- Görüntüleme işleminin sonunda, fareyi ketamin/xylazine aşırı doz servikal çıkığı tarafından takip aracılığıyla ötenazi.
5. görüntü işleme ve nicel analiz nötrofil-DC hareketliliği ve etkileşim
Not: Bu protokol için özel bir görüntüleme yazılımı mikroskobu verileri analiz etmek için kullanıldı.
- 4 D resim alma tamamlandıktan sonra bir iş istasyonunda yeterli Hesaplamalı kaynaklarla (veri ve meta veriler) dosya aktarımı (önerilen minimum sistem gereksinimleri: 32 GB RAM, hızlı solid-eyalet-Sürücüler, son CPU, GPU dayalı adanmış bir kitlesel paralel mimarisi).
- Dosyaları görüntüleme yazılımı açın.
- Belgili tanımlık video oyun ve hücreleri ilgi açıkça görülebilir ve görüntüleme eserler yok emin olun.
Not: bu amaçla, her iki hareketin örnek ve parlaklık değişkenlik yeterince ki sınırlı doğrulayın. Gerçekten de, bunlar otomatik olarak analiz26için sorunlar temsil etmektedir. Örnek bitişik Çerçeveler arasındaki hareketini aşırı örneğin SHG kanal sabit bir referans olarak kullanarak bir drift düzeltme yöntemini uygulayın. Bu hareket hücrelerin yerine örnek hareketi daha iyi ölçmek için sağlar. Ayrıca, parlak arka plan veya enkaz varlığında, hacim seçimi parametre olarak kullanarak yeniden oluşturulan yüzeyler Kuru Erik. - CFP ve kollajen (SHG) arasındaki sinyal ayırmak için CFP+ hücrelerin belirli bir ortak yerelleştirme kanal oluşturmak. Bu amaçla, sadece yeşil kanal ve mavi kanal olumlu bir yoğunluk sahip voxels seçen bir perdeleme Çokgen (Şekil 2Bben) gösterir.
Not: Bu yordam hücreleri boyama ve mikroskop filtre kümesi göre değişebilir. Yeşil ve mavi kanal yeterli yoğunluğu ile sadece voxels seçerek elde edilebilir. Kullanılabilir araçlar arasında "coloc" işlevi colocalization kanallı yoğunluk eşik üzerinde otomatik olarak hesaplamak için kullanılabilir. Ayrıca, makine öğrenme temelli yöntemleri için bu adım bir uzman27gözetimi ile kullanılabilir. - Algılamak ve CFP+ hücreleri, otomatik yüzey yeniden kullanma ve izleme (Yüzey Aracı) uygun eş yerelleştirme kanal üzerinden izlemek.
Not: El ile küratörlüğü nihai izleme hataları ve dışlama tanımlanmış eşiğin (Yani, 150 s)-ebilmek var olmak gerekli daha kısa bir süre ile parça. - CFP ve YFP sinyalleri ayırmak için CD11c-YFP+ hücrelerin belirli bir ortak yerelleştirme kanal oluşturmak. Bu amaçla, sadece yeşil kanal olumlu bir şiddeti oldu ama düşük yoğunluklu mavi kanal voxels seçen gating Çokgen (Şekil 2BII) gösterir.
Not: temsilcisi Filmler Kanal 1, Kanal 2, CFP Co yerelleştirme kanal, YFP için ortak yerelleştirme kanal ve tüm kanalları bileşimini gelen sinyalleri gösterilen Şekil 2BIIIde bulunabilir. - Zaman içinde (Yüzey Aracı) konumlarını izlemek ve CD11c-YFP+ hücre yüzeyine yeniden.
Not: El ile düzeltme nihai izleme hataları için bu adım gerekli değildir. Nitekim, DC karmaşık spatio-temporal dinamikleri nedeniyle, 2 P-IVM verilerden kesin yüzeyini yeniden inşa kullanılabilir bölümleme yazılımı ile elde edilemez zor bir görev olduğunu. Bu görevi zorlayıcı olun nedenleri arasında ince çıkıntılar ve parlaklık çeşitlemeleri filtreleri veya statik eşik yumuşatma gibi bazı görüntü işleme teknikleri kullanımı için izin vermez. Ayrıca, DC bir ağda, tek hücreler yalnızca 2 P-IVM veri kendi görünümünü temel alan ayırmak zordur. Bu nedenle, yerine için yazılım parametrelerinin ayarlanması tarafından doğru bir bölümleme denemeden, DC doğru olmayan yüzeyleri yeniden oluşturmak öneriyorum. Sonra olası hataları 5,8 içinde açıklandığı gibi sağlam ölçümleri yoluyla işlemek. -
Ölçü birimi hücre göç.
- Klasik geçiş önlemler CFP+ ve CD11c-YFP+ hücreler için verin. "Doğruluk izlemek" hücreleri yön gösterirken bunlar arasında hücrelerin ortalama göçmen hız "parça hız demek" gösterir. Bu önlemlerin görüntüleme yazılımı bir elektronik tablo dosyası olarak dışa aktarılabilir.
- Dışa aktarılan elektronik tablo dosyalarını "(düzeltilmiş doğumdan oranı olarak da adlandırılır) düzeltilmiş parça doğruluk" hesaplamak CFP+ ve CD11c-YFP+ hücreler için tanımlandığı "tarafından kare kökünü çarpılır parça doğruluk" olarak "süresi izlemek" bölünmüş video süresi tarafından kare kökünü. "Doğruluk kısa varlığında izlemek" izler Örneğin izleme hatalarından kaynaklanan28, daha sağlam bir ölçüsüdür.
Not: sadece aynı uzunlukta videoları bu ölçü ile karşılaştırılabilir.
-
Hücre etkileşim ölçmek.
- Onların mesafe (en yakın voxels) eşit veya daha az bir eşik daha (Yani, 2 mikron) ise CFP+ hücre ve CD11c-YFP+ hücre arasında bir kişiyi tanımlayın.
Not: Bu eşik hücreleri yakın olduğunda bir kişiyi tespit etmek için yeterince sıkı olmalıdır. Ancak, bu eşik 0, ideal N kez Voksel RADIUS daha büyük daha büyük tutmak için tavsiye (N > 2), çünkü kenar yumuşatma hücreleri yeniden inşası gerçek hücre boyutu daha küçük yapabilirsiniz. - Sayısı sayısı ve kişiler CFP+ ve CD11c-YFP+ hücreler arasındaki süre. Görüntüleme yazılımı bu örneğin bir "öp ve kaç" eklenti yürütmek yoluyla yapılabilir. Bu önlemlerin istatistikler sekmesindeki bir elektronik tablo dosyası olarak dışa aktarılabilir.
- Onların mesafe (en yakın voxels) eşit veya daha az bir eşik daha (Yani, 2 mikron) ise CFP+ hücre ve CD11c-YFP+ hücre arasında bir kişiyi tanımlayın.
- İstatistiksel yazılım daha önce hesaplanan önlemler almak, araziler oluşturmak ve istatistiksel testler gerçekleştirmek.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Bu çalışmada, biz vivo içinde çalışmaya detaylı bir protokol nötrofil ve DC arasındaki etkileşimler ve hareket fare trakea (Şekil 3A) grip enfeksiyonu sırasında açıklanan. Bu amaçla, biz izole CFP+ nötrofil (% 92 saflık; Şekil 3B) CK6-ECFP fare ve biz adoptively onları grip ile enfekte bir CD11c-YFP fare içine transfer. Bundan sonra biz 2 P-IVM 3 gün özel dedektif, trakea, gerçekleştirilen Bu zaman noktada akış sitometrik çözümlemesi (Şekil 3 c) tarafından gösterildiği gibi açık işe alım Nötrofil enfekte alanı içinde gözlenen. 2P-IVM Protokolü kemirgenler (Şekil 1A) için belirli bir cerrahi Yönetim Kurulu ve bir oksijen Tedarikçi kullanımını gerektirir. Oksijen borusunda eklenen bir kanül aracılığıyla temin nefes, nefes borusu Fuar kolaylaştırdı ve (Şekil 1B) nefes ile ilişkili organ hareketi kontrol hayvan yardımcı oldu. Bu deneysel kurulumu, biz 30 dk (3D şekilFilm 1) döneminde virüslü trakea istikrarlı 4 D görüntüleri vivo içinde satın aldı.
Özel görüntüleme yazılımı hücrelerin göç ölçmek için ve nötrofil ve DC spatio-zamansal dinamiği ölçmek için izin alınan 4D resimlerle analizi. Hücre hareketliliği ile ilgili ikinci (Şekil 4A) daha önemli ölçüde daha hızlı bir hız gösterdi işe nötrofil ve DC hareketi arasında önemli farklılıklar görülmektedir. Bu sonuç dinamik yapısı son derece hareketli hücreler doğru bir chemoattractant kaynak29geçirme yeteneğine sahip olarak daha önce açıklanan nötrofil, onaylar. Yön ile ilgili, biz sırayla parça azalma süresi ve artan varyans ölçülen yönlü davranış (Şekil 4B) ile üretilen DC sık hataları izleme, hücredeki vermiştir o karmaşık morfolojisi sonucuna vardı. Bu nedenle, biz parça süresi göz önüne alınarak yön ölçmek mümkün sağlam bir ölçü hesaplanan. Bu ölçüm kullanarak, biz yön nötrofil vs DC (Şekil 4 c) önemli bir fark görülmektedir.
Ayrıca, nötrofil ve DC arasındaki mesafe hesaplama algılamak ve kişilerine zamanla çözümlemek için izin. Bu deneysel modelinde, biz herhangi bir kişiyi görüntülü döneminde (Şekil 4 d) formu değil birden çok-kısa rehber DC ve diğerleri ile oluşan bazı nötrofil gözlenen. Ayrıca, nötrofil ve DC arasındaki mesafe zaman içinde ortalama eğilim çalışma izin bize okudu hücreleri (Şekil 4E), genel konumlandırma eğitim belirli hücreleri ayırdetmek için izin eğilim incelenmesi sırasında her tek hücreli (Şekil 4FFilm 2) davranışını.
Şekil 1: ekipman ve adımları için 2P-IVM fare trakea,. (AI) Taşınabilir hayvan anestezi sistem otomatik havalandırma sorumlu fare oksijen sağlayan bir pompa bağlanır. Ön görünüm (bütün) ve yan görünüm (Aiii) trakeal modeli için kullanılan özel cerrahi kurulu. Yönetim Kurulu oluşan plastik fare pozisyonel ile metal bir sahne (bütün-a), çubuk hareketli kelepçe (bütün-b) tutmak için bir ve güzel bir akort XYZ çevirmen (bütün-c). (B) sıralı adımları trakeal cerrahi modeli: (bı) epilasyon cerrahi çevrenin (bıı) cerrahi masa, nefes borusu, (Biv (Bill) cerrahi Fuar imzalat fare konumlandırma ) bir sonda ile suni havalandırma, kateter fiksasyonu (Bv), PBS (BVI) ek olarak maruz kalan nefes borusu ile entübasyon coverslip ve bir kateter yerleşimini (Bviii) (Bvii) montajı anestezi ile. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 2: floresan sinyal algılama sırasında 2P-IVM. Mikroskop algılama şematik gösterimi(a)filtre kurulum ve karşılık gelen kanalları. Dikroik ayna 560 nm ayıran mavi/yeşil kırmızı/uzak kırmızı emisyon üzerinden at. 495 ek Dikroik ayna nm daha fazla emisyon spektrumun farklı milletlere tanımak için kullanılır. Kanal 1 Kanal 2 kullanır yüksek hassasiyet GaAsP Devresel_ödeme (emisyon filtre 525/50) ise bir melez dedektörü (emisyon filtre 475/50), istihdam etmektedir. CFP (bı) ve YFP (bıı) fluorophores gelen sinyal tanımlaması için colocalization kanalları oluşturmada gating strateji gösterilen 2 P sinyal (B) temsilcisi dağılım nokta çizer. (Bill) Kanal 1 (Ch 1, koyu mavi), Kanal 2 (Ch 2, yeşil), ortak yerelleştirme kanal CFP (açık mavi) için Co yerelleştirme kanal YFP (sarı) için ve tüm kanalları bileşimini belirli sinyalleri gösterilen temsilcisi Filmler (Ch 1 + Ch 2 + CFP + YFP). Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 3: nötrofiller ve DC Intravital 4D görüntülemede bir grip bulaşmış trakea. (A)iletişim kuralının şematik anahat. (B) temsilcisi akış sitometrik scatterplot nötrofil yüzdesi toplam CD45 + hücrelerde fare kemik iliği Percoll degrade yöntemle izole bir hücre süspansiyon ile ilgili olarak gösteriliyor. (C) temsilcisi akış sitometrik scatterplots bir artış nötrofil tracheas içinde sıklıkla hastalık bulaşmamış tek fare gün 3 özel dedektif (D) (sol panelde) anatomik görüntüsünü bir fare, grip virüsü ile enfekte fareler karşılaştırıldığında üzerinden gösterilen resim alma için seçili alanı gösterilen nefes borusu. (Doğru kapı aynası) P.ı. SHG sinyal karanlıkta mavi gösterilir nötrofil (açık mavi) ve DC (sarı) yüzey yeniden izlerini günde 3 ile birlikte gösterilen 2 P-IVM test temsilcisi 3D projeksiyon. Ölçek çubuğu 100 µm. = Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 4: nötrofil ve enfekte grip trakea DC göç ve etkileşim dinamiklerini karakterizasyonu. Parça hız gösterilen temsilcisi araziler(a)demek, doğruluk (B) izlemek ve parça doğruluk (C), (2009)28, nötrofil ve nefes borusu ile 3 gün özel dedektif, DC Beltman ve meslektaşları tarafından tanımlanan düzeltildi grip virüsü. Düzeltilmiş parça doğruluk ölçüm hataları izleme için sağlamlık sergiler. (D) 2D çubuk grafik nötrofil DC ve temas süresi olan kişileri kendi sayısına göre sıklığı gösterilen. Filmin süresi sırasında en yakın etki alanı denetleyicisinin nötrofil (E) ortalama mesafe. Bir temsilcisi en yakın etki alanı denetleyicisinin zamanında nötrofil mesafe Analizi (F) (solda). Noktalı kırmızı çizgi bir nötrofil bir DC bir kişiyle kurulan düşünmeye mesafe eşik belirtir. (Doğru i-III) Bir nötrofil (açık mavi) geçiş doğru bir DC (sarı) temsil eden farklı zaman noktalarda alınan filmler. Hücre parça rengi maviden kırmızıya saati göstermek değişir çok renkli bir çizgi olarak gösterilir. Fibrillary kollajen SHG sinyal koyu mavi renkte gösterilir. Ölçek çubuğu 50 µm =. Bütün rakamlar en az üç bağımsız deneyler temsilcisi sunulan verilerdir. Sonuçları, demek gibi ± SD istatistikleri Welch test tarafından verilir. NS p > 0,05; p < 0,0001. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Film 1: nötrofil ve DC trakea grip enfeksiyonu sırasında dinamiklerini. etkileşim dynamics nötrofil (açık mavi) ve DC (sarı) yanı sıra kendi izlerini trakea kollajen ağ (koyu mavi) ile ilgili olarak arasında gösterilen 30 dk hızlandırılmış 3D görüntü. Temsilcisi nötrofil-DC etkileşimleri Beyaz oklarla belirtilmiştir. Hücre parça rengi maviden kırmızıya saati göstermek değişir çok renkli bir çizgi olarak gösterilir. Ölçek çubuğu 50 µm. lütfen buraya tıklayın Bu videoyu izlemek için =. (İndirmek için sağ tıklatın.)
Movie 2: temsilcisi kısa vadeli nötrofil-DC etkileşiminde trakea grip enfeksiyonu sırasında. bir nötrofil (açık mavi) ve bir DC arasında temsili bir etkileşim (sarı) gösterilen 30 dk hızlandırılmış 3D görüntü ve ilgili izlerini. Hücre parça rengi maviden kırmızıya saati göstermek değişir çok renkli bir çizgi olarak gösterilir. Kollajen SHG sinyal koyu mavi renkte gösterilir. Ölçek çubuğu 10 µm. lütfen buraya tıklayın Bu videoyu izlemek için =. (İndirmek için sağ tıklatın.)
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Bu çalışma adoptively transfer edilen nötrofil ve ilişkileri ile DC geçişi grip enfeksiyon sırasında fare borusunda gösterilen 4 D görüntüleri nesil için detaylı bir Protokolü sunar. Açıklanan 2P-IVM modeli bir solunum yolları enfeksiyonu sırasında bağışıklık hücre dinamiği çalışmaya ilgili olacak.
Son zamanlarda, çeşitli modeller hücre dinamiği içinde solunum yolları görselleştirme göre gelişmiş9,10,11,12,13,14,15 olmuştur ,16. Ancak, in vivo görüntüleme akciğerin bu organ ve hareketi sırasında solunum döngüsü30en aza indirmek için teknik zorluklar anatomik konumunu göz önünde bulundurarak hala meydan okuyor. Bu sorunların üstesinden gelmek için bazı yazarlar ameliyatla göğüs13,14' te eklenmesi gereken bir ölçüye göre dairesel emme odası, kullanımını önerdi. Ancak, bu yordam sonuçlarında özellikle inflamatuar yanıt soruşturma üzerinde odaklanmıştır çalışmalar tehlikeye atabilecek bir invaziv müdahale gerektirir. Ayrıca, akciğer cerrahi modelleri alveoller17havada kaynak öğe ışık kırılma nedeniyle derin doku görüntüleme için bir sınırlama mevcut. Diğer taraftan, farklı trakeal modelleri son zamanlarda hava yolu epitel hücre dinamiklerini incelemek için istihdam edilmiştir. Görüntüleme bu organ akciğer, teşhir ve org yanı sıra yüksek erişilebilirlik için trakeal epitel hareketsiz için gerekli nispeten basit cerrahi gibi karşılaştırıldığında net avantajları sunar. Önerilen trakeal modeli ayrıca trakea viral çoğaltma bir grip enfeksiyonu8seyri sırasında ilk sitelerden biri olduğu gibi grip virüsü, solunum yolu patojenlere karşı yanıt inisiyasyon araştırmak uygundur.
İlginçtir,12alternatif entübasyon-Alerjik nefes borusu görüntüleme yöntemi son zamanlarda gösterilen bir çalışma yayınladı. Bu yöntem tarafından azalmış inflamasyon ile karakterizedir ve net avantajları nerede korunacaktır epitel hücrelerinin mucociliarity işlev gerekir çalışmalarda gösterir. Ancak, bu yöntem yeterli istikrar garanti etmez ve parlak sinyallerini hücre-hücre kişiler'a sıra-in birkaç µm. diğer taraftan, eğitim gerekli yöntemi geçerli iletişim kuralında sunulan edinimi organ daha iyi immobilizasyon sağlar Entübasyon için teşekkür ve organ ve coverslip12arasında daha kısa mesafe bir sonucu olarak daha güçlü floresan sinyallerini algılanmasını sağlar.
Doku immobilizasyon vivo içinde 2 P-IVM resim alma sırasında gerçekleştirerek en uygun veri oluşturmak için en önemli adımdır. Sunulan Yöntem istikrarına katkıda çok önemli bazı önlemler içerir: bir uygun fare anestezi; doğru fare entübasyon; ve coverslip tarafından organ kolay bir erişim sağlar trakea cerrahi bir fuar. Ayrıca, hücreleri (görüş alanı başına ideal 30 hücre) sayıları görüntüleme elde edilen sonuçları güçlendirecektir. Hücre en uygun sayısı alımı çok viral inoculum uygun yönetimi tarafından etkilenir viral enfeksiyon doz büyük ölçüde bağlı olacaktır.
Protokolü'nün diğer kritik adım trakea cerrahi Fuar olduğunu. Farklı önlemler ameliyat sırasında için organ hasarları en aza indirmek için kabul edilebilir. Örneğin, trakea doğrudan cerrahi araçları ile değiştirilmesi değil. Bunun yerine, sadece çevre dokular (deri, tükürük bezleri ve kaslar) manipüle ederek maruz. Kesinlikle gerekiyorsa, nefes borusu unsharpened öğeleri kullanarak ele alınmalıdır. Ayrıca, çabaları kan damarı zarar önlemek için yapılmalıdır. Son olarak, organ su kaybı önlemek için bu da hemen ameliyattan sonra PBS ile karşılamak önemlidir.
Trakeal mukoza bağışıklık hücre etkileşimlerde görselleştirme için önceden açıklanan yöntemleri üzerinde bu yöntemin benzersiz avantajları rağmen bazı sınırlamalar bu model kullanımı sunuyor. Yukarıda açıklandığı gibi trakeal cerrahi ile ilişkili inflamasyon varlığı bağışıklık yanıtı okurken bir dezavantajı temsil edebilir. Bu sınırlamayı aşmak için yordamı başlanmasından önce anti-inflamatuar ilaçlar yönetmek de mümkündür. Bu modelin başka bir sınırlama esas olarak ikamet hücreleri ve mukus tabakası tarafından oluşturulan havayolları, varolan bir güçlü autofluorescence sinyali varlığı ile ilgili. Bu belirsiz floresans Analizi engel eserler oluşturur. Ayrıca, ne zaman karşılaştırma hücre farklı süreleri ve kısa süreli26parça izleme hatalara neden ne zaman parça parça doğruluk parametresinin yanıltıcı hesaplama oluşturulan. Bu sorunu çözmek için biz parça doğruluk düzeltmek için bir ceza katsayısı uygulanır. Böyle düzeltme Bayan-izleme sonuçları28içinde etkisini en aza indirmek için tasarlanmıştır.
2P-IVM deneyler çok önemli bir bölümünü görüntüleme ve cerrahi undergone yeniden kullanım farelere imkanı vardır. Burada açıklanan protokol Imaging in vivo Hayvan ötenazi veya organ koleksiyonu, böylece yeniden elde etmek için olasılık bırakarak ve yeniden kullanım fare diğer yordamlar için ameliyat sonrası gerektirmez. Örneğin, tek bir fare trakea düşsel vasıl farklı zaman puan önemli ölçüde Toplam hayvan hayvan azaltma ilkesi destekleyen bir deneyde, gerekli sayısını azaltmak gerçekleştirmek için kullanıyor. Ayrıca, aynı zamanda arası bireysel değişkenliği azaltmak olabilir. Ancak, hayvan kurtarma ve yeniden kullanım uygun analjezik ilaçlar ve hayvanlara antibiyotik yönetimi sırasında kurtarma süresini içerir hayvan refah standartlarını izlemelidir. Bu yordamları hayvan deney Protokolü dahil ve yerel hayvan hastalıklarıyla ilgili makamları tarafından onaylanmış.
Açıklanan protokol diğer bağışıklık hücre tipleri çalışma odasına kolayca adapte edilebilir. Örneğin, yalıtım ve enjeksiyon (floresan veya lekeli) patojen özgü T hücrelerinin T hücre harekete geçirmek dynamics31 yanı sıra onların etkileşim trakeal DC gibi diğer hücrelerle çalışma için kullanılabilir. Benzer şekilde, kan veya lenf damarları görselleştirme inflamatuar hücrelerin enfeksiyon seyri sırasında işe trakeal doku içine eğitim için ilginç bir yaklaşım temsil edebilir. Ayrıca, 2P-IVM trakea, diğer hava patojenler için bağışıklık yanıtı dinamiklerini incelemek için de uygulanabilir. Bu nedenle, Streptococcus pneumoniae32gibi transgenik floresan havadan patojenlere kullanımı onların etkileşim bağışıklık sistemi ile çalışmak için yeni fırsatlar yaratacak. Bu yordam sırasında enfeksiyon bağışıklık hücreleri dinamikleri ölçme üzerinde duruluyor olsa da, kanser, astım, dahil olmak üzere veya yara iyileşmesi farklı alanlara da uygulanabilir.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Yazarlar ifşa gerek yok.
Acknowledgments
Bu eser İsviçre Ulusal Vakfı (SNF) hibe (176124, 145038 ve 148183), Avrupa Komisyonu Marie Curie Reintegration Grant (612742) ve SystemsX.ch D.U.P. için bir hibe için tarafından desteklenmiştir (2013/124).
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Gigasept instru AF | Schülke & Mayr GmbH | 4% solution | |
| CD11c-YFP mice | Jackson Laboratories | 008829 | mice were bred in-house |
| CK6-ECFP mice | Jackson Laboratories | 004218 | mice were bred in-house |
| 1x Dulbecco's Phosphate Buffered Saline modified without Calcium Choride and Magnesium Chloride | Sigma | D8537-500ML | |
| 10x Dulbecco's Phosphate Buffered Saline modified without Calcium Choride and Magnesium Chloride | Sigma | D1408-500ML | |
| Percoll PLUS | Sigma | E0414-1L | Store at 4°C |
| Ketamin Labatec | Labatec Pharma | 7680632310024 | Store at RT, store at 4 °C when in solution of ket/xyl mixture |
| Rompun 2% (Xylazin) | Bayer | 6293841.00.00 | Store at RT, store at 4 °C when in solution of ket/xyl mixture |
| 26 G 1 mL Sub-Q BD Plastipak | BD Plastipak | 305501 | |
| 30 G, 0.3 mL BD Micro-Fine Insulin Syringes | BD | 324826 | |
| Falcon 40 µm Cell Strainer | Corning | 352340 | |
| 2 mL Syringes | BD Plastipak | 300185 | |
| Microlance 3x 18 G needles | BD | 304622 | |
| Introcan Safety 20 G (catheter) | Braun | 4251652.01 | |
| 6 Well Cell Culture Cluster | Costar | 3516 | |
| RPMI medium 1640 + HEPES (1x) | ThermoFisher Scientific | 42401-018 | Store at 4°C |
| Liberase TL Research Grade | Roche | 5401020001 | Store at -20 °C / collagenase (I and II) mixture |
| DNAse I | Amresco (VWR) | 0649-50KU | Store at -20 °C |
| CellTrace Violet stain | ThermoFisher Scientific | C34557 | Store at -20 °C |
| EDTA | Sigma | EDS-500G | |
| Fetal Bovine Serum | Gibco | 10270-106 | Store at -20 °C |
| PE-10 Micro Medical Tubing | 2Biological Instruments SNC | #BB31695-PE/1 | |
| Surgical Plastic Tape | M Plast | ||
| Viscotears | Bausch & Lomb | Store at RT | |
| Plasticine | Ohropax | ||
| High Tolerance Glass Coverslip 15 mm Round | Warner Instruments | 64-0733 | |
| SomnoSuite Portable Animal Anesthesia System | Kent Scientific | SS-01 | |
| Nuvo Lite mark 5 | GCE medline | 14111211 | |
| MiniTag (gaseous anesthesia and heating bench) | Tem Sega | ||
| SURGICAL BOARD | University of Bern | ||
| TrimScope II Two-photon microscope | LaVision Biotec | ||
| Chameleon Vision Ti:Sa lasers | Coherent Inc. | ||
| 25X NA 1.05 water immersion objective | Olympus | XLPLN25XWMP2 | |
| The Cube&The Box incubation chamber and temperature controller | Life imaging Services | ||
| Imaris 9.1.0 | Bitplane | Imaging software | |
| GraphPad Prism 7 | GraphPad | Statistical software |
References
- Helmchen, F., Denk, W. Deep tissue two-photon microscopy. Nature Methods. 2 (12), 932-940 (2005).
- Zipfel, W. R., Williams, R. M., Webb, W. W. Nonlinear magic: multiphoton microscopy in the biosciences. Nature biotechnology. 21 (11), 1369-1377 (2003).
- Fein, M. R., Egeblad, M. Caught in the act: revealing the metastatic process by live imaging. Disease Models & Mechanisms. 6 (3), 580-593 (2013).
- Dombeck, D. A., Harvey, C. D., Tian, L., Looger, L. L., Tank, D. W. Functional imaging of hippocampal place cells at cellular resolution during virtual navigation. Nature Neuroscience. 13 (11), 1433-1440 (2010).
- Cahalan, M. D., Parker, I. Choreography of cell motility and interaction dynamics imaged by two-photon microscopy in lymphoid organs. Annual review of immunology. 26, 585-626 (2008).
- Germain, R. N., Robey, E. A., Cahalan, M. D. A Decade of Imaging Cellular Motility and Interaction Dynamics in the Immune System. Science. 336 (6089), 1676-1681 (2012).
- Coombes, J. L., Robey, E. A. Dynamic imaging of host-pathogen interactions in vivo. Nature Reviews Immunology. 10 (5), 353-364 (2010).
- Pulendran, B., Maddur, M. S. Innate Immune Sensing and Response to Influenza. Life Science Journal. 6 (4), 23-71 (2014).
- Lim, K., et al. Neutrophil trails guide influenza- specific CD8 + T cells in the airways. Science. 349 (6252), (2015).
- Kim, J. K., et al. In vivo imaging of tracheal epithelial cells in mice during airway regeneration. American journal of respiratory cell and molecular biology. 47 (6), 864-868 (2012).
- Kretschmer, S., et al. Autofluorescence multiphoton microscopy for visualization of tissue morphology and cellular dynamics in murine and human airways. Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology. 96 (8), 918-931 (2016).
- Veres, T. Z., et al. Intubation-free in vivo imaging of the tracheal mucosa using two-photon microscopy. Scientific Reports. 7 (1), 694 (2017).
- Looney, M. R., et al. Stabilized imaging of immune surveillance in the mouse lung. Nature. 8 (1), 91-96 (2011).
- Thornton, E. E., Krummel, M. F., Looney, M. R. Live Imaging of the Lung. Current Protocols in Cytometry. 60 (1), (2012).
- Tabuchi, A., Mertens, M., Kuppe, H., Pries, A. R., Kuebler, W. M. Intravital microscopy of the murine pulmonary microcirculation. Journal of Applied Physiology. 104 (2), 338-346 (2008).
- Fiole, D., et al. Two-photon intravital imaging of lungs during anthrax infection reveals long-lasting macrophage-dendritic cell contacts. Infection and immunity. 82 (2), 864-872 (2014).
- Secklehner, J., Lo Celso, C., Carlin, L. M. Intravital microscopy in historic and contemporary immunology. Immunology and Cell Biology. 95 (6), 506-513 (2017).
- Lambrecht, B. N., Hammad, H. Lung Dendritic Cells in Respiratory Viral Infection and Asthma: From Protection to Immunopathology. Annual Review of Immunology. 30 (1), 243-270 (2012).
- Camp, J. V., Jonsson, C. B. A role for neutrophils in viral respiratory disease. Frontiers in Immunology. 8, (2017).
- van Gisbergen, K. P. J. M., Sanchez-Hernandez, M., Geijtenbeek, T. B. H., van Kooyk, Y. Neutrophils mediate immune modulation of dendritic cells through glycosylation-dependent interactions between Mac-1 and DC-SIGN. The Journal of experimental medicine. 201 (8), 1281-1292 (2005).
- Gonzalez, S. F., et al. Capture of influenza by medullary dendritic cells via SIGN-R1 is essential for humoral immunity in draining lymph nodes. Nature Immunology. 11 (5), 427-434 (2010).
- Lindquist, R. L., et al. Visualizing dendritic cell networks in vivo. Nature immunology. 5 (12), 1243-1250 (2004).
- Li, H., et al. Human Vγ9Vδ2-T cells efficiently kill influenza virus-infected lung alveolar epithelial cells. Cellular and Molecular Immunology. 10 (2), 159-164 (2013).
- Tran Cao, H. S., et al. Development of the transgenic cyan fluorescent protein (CFP)-expressing nude mouse for "technicolor" cancer imaging. Journal of Cellular Biochemistry. 107 (2), 328-334 (2009).
- Jaber, S. M., et al. Dose regimens, variability, and complications associated with using repeat-bolus dosing to extend a surgical plane of anesthesia in laboratory mice. Journal of the American Association for Laboratory Animal Science JAALAS. 53 (6), 684-691 (2014).
- Pizzagalli, D. U., et al. Leukocyte Tracking Database, a collection of immune cell tracks from intravital 2-photon microscopy videos. Scientific Data. , In press (2018).
- Sommer, C., Straehle, C., Kothe, U., Hamprecht, F. A. Ilastik: Interactive learning and segmentation toolkit. 2011 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro. , 230-233 (2011).
- Beltman, J. B., Marée, A. F. M., De Boer, R. J. Analysing immune cell migration. Nature Reviews Immunology. 9 (11), 789-798 (2009).
- Keller, H. U. Motility, cell shape, and locomotion of neutrophil granulocytes. Cell motility. 3 (1), 47-60 (1983).
- Sumen, C., Mempel, T. R., Mazo, I. B., von Andrian, U. H. Intravital Microscopy. Immunity. 21 (3), 315-329 (2004).
- Lambert Emo, K., et al. Live Imaging of Influenza Infection of the Trachea Reveals Dynamic Regulation of CD8+ T Cell Motility by Antigen. PLOS Pathogens. 12 (9), e1005881 (2016).
- Kjos, M., et al. Bright fluorescent Streptococcus pneumoniae for live-cell imaging of host-pathogen interactions. Journal of bacteriology. 197 (5), 807-818 (2015).
