Summary
Les bases de données littéraires sont couramment utilisées pour évaluer les publications dans un sujet, une discipline, un pays ou une région du monde, une pratique connue sous le nom d'analyse bibliométrique. Le protocole actuel détaille comment utiliser les bases de données PubMed, Scopus et Web of Science pour effectuer une analyse bibliométrique.
Abstract
Les bases de données littéraires(c.-à-d.PubMed, Scopus et Web of Science) diffèrent en termes de couverture, de concentration et de l'outil qu'elles fournissent. PubMed se concentre principalement sur les sciences de la vie et les disciplines biomédicales, tandis que Scopus et Web of Science sont multidisciplinaires. Le protocole décrit dans la présente étude a été utilisé pour rechercher des publications d'auteurs jordaniens dans les années 2013-2017. Dans ce protocole, la façon d'utiliser chaque base de données pour effectuer ce type de recherche est expliquée en détail. Une recherche Scopus a donné lieu au plus grand nombre de documents (11 444 documents), suivi d'une recherche sur le Web des sciences (10 943 documents). PubMed a obtenu un plus petit nombre de documents en raison de sa portée et de sa couverture plus restreintes (4 363 documents). Les résultats montrent également une tendance chaque année : (1) le nombre de publications, (2) les disciplines qui ont le plus de publications, (3) les pays de collaboration et (4) le nombre de publications en libre accès. En revanche, PubMed dispose d'un service sophistiqué d'optimisation des mots clés(c.-à-d., Medical Subject Heading, ou MeSH), tandis que Scopus et Web of Science fournissent des outils d'analyse de recherche qui peuvent produire des chiffres représentatifs. Enfin, les caractéristiques de chaque base de données sont expliquées en détail et plusieurs indices qui peuvent être extraits à l'aide des résultats de recherche sont fournis. Cette étude fournit une base pour l'utilisation des bases de données de littérature pour l'analyse bibliométrique.
Introduction
Classiquement, les chercheurs ont utilisé des bases de données de littérature pour effectuer l'examen de la littérature pour leurs études1. Une autre utilisation de ces bases de données de littérature a surgi à la fin du19ème siècle, où les chercheurs ont analysé le corps de la littérature, une utilisation qui a lentement augmenté depuis2. Au cours des dernières décennies, la numérisation de la littérature et la formation de bases de données de littérature en ligne ont permis aux chercheurs d'analyser facilement et efficacement l'ensemble de la littérature et de la performance de la recherche. Un exemple serait l'analyse de la performance de recherche pour un document3, un sujet4, une discipline5, un pays6, ou même une région dans le monde7. Ce type d'analyse est connu sous le nom d'analyse bibliométrique. Heartsill Young a défini l'analyse bibliométrique comme l'utilisation de méthodes statistiques pour analyser un corpus de littérature pour révéler le développement historique8. En d'autres termes, la bibliométrie est l'étude quantitative des unités publiées sur la base de la citation et de l'analyse de texte9.
Différentes bases de données sont utilisées pour faire l'analyse bibliométrique et chaque base de données a des caractéristiques différentes et peut fournir différents services10. Actuellement, les bases de données de littérature les plus couramment utilisées sont le Web de la science et Scopus pour presque toutes les disciplines, à la fois uniquement disponible sur une base d'abonnement11, et PubMed pour les sciences biomédicales et de la vie, une base de données librement disponible10. Il ya aussi Google Scholar, qui pourrait être un outil facile à manipuler, mais il ne devrait pas être utilisé comme un outil d'analyse bibliométrique actuellement en raison de certaines lacunes telles que sa portée peu claire et la couverture, son manque d'outils d'analyse de citation, et son inclusion de non-pair contenu non scientifiqueexaminé 12,13. En outre, Google Scholar n'a pas les outils pour effectuer la recherche avancée et l'optimisation des mots clés14.
Plusieurs études antérieures ont comparé les caractéristiques des bases de données littéraires mentionnées précédemment à des fins de revue de littérature3,5,10,12,13,15 ,16,17. Cependant, dans cette étude, les bases de données PubMed, Scopus et Web of Science seront utilisées pour effectuer une analyse bibliométrique, et les avantages et les inconvénients de chacune d'elles seront comparés. L'analyse bibliométrique peut être utilisée pour analyser la production de recherche dans presque n'importe quelle discipline, de sorte que le public cible serait tout chercheur qui a l'intention d'analyser les tendances de publication. Un exemple d'analyse d'une tendance à la publication en Jordanie en tant que pays sera présenté à l'aide de chaque base de données. La Jordanie a été choisie parce qu'une analyse bibliométrique pour un pays (contrairement à un sujet) n'est pas très simple. En outre, la Jordanie, en particulier, est mal étudiée d'une manière bibliométrique car elle peut être à la fois un nom d'auteur et un nom de pays. Nous expliquons comment surmonter un tel défi dans la recherche.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
REMARQUE : Voici les méthodes de recherche et une recherche par exemple pour chaque méthode est fournie. Notez que la pièce liée spécifiquement à l'analyse bibliométrique est également fournie.
1. PubMed
- Choisissez la recherche avancée à partir de la page d'accueil PubMed (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
- Entrez le terme de recherche souhaité dans le champ de recherche. Choisissez les termes de recherche dans la base de données de la rubrique sujet médical (MeSH). L'exemple suivant décrit comment évaluer la recherche sur le « cancer ».
- Ouvrez la base de données MeSH : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh.
- Entrez le mot « cancer » dans le champ de recherche.
- Assurez-vous que les résultats montrent le mot «néoplasmes» en haut de la recherche, où il note que l'utilisation du mot «néoplasmes» est plus approprié, comme «néoplasmes» est le mot utilisé pour indexer les sujets pertinents.
- Vérifiez en outre d'autres termes énumérés sous le terme "néoplasmes" en cliquant dessus. Les résultats montreront d'autres termes utilisés pour décrire des sujets similaires(p. ex., tumeur), et énuméreront également d'autres sous-catégories (sous-titres) sous le terme néoplasme.
- Utilisez les listes déroulantes dans la section Constructeur pour spécifier le champ de l'article que PubMed recherchera pour le terme. Notez que les champs de recherche suivants sont disponibles : tous les champs, le titre, l'abstrait, les auteurs, l'affiliation, les conflits d'intérêts, la langue, la revue, l'éditeur, le type de publication, le numéro de subvention, les termes ISBN et MeSH.
- Ajoutez autant de champs que nécessaire et choisissez la relation entre ces champs (ET, OU, ou PAS). Voir tableau 1 pour plus de détails.
- Cliquez sur Recherche.
- Affiner les résultats de recherche dans les résultats à l'aide de différents filtres disponibles comme détaillé dans le tableau 2. Notez qu'à partir de maintenant, la recherche finale effectuée sera sauvegardée dans l'historique de la recherche avancée, qui a été consultée dans la première étape. Cela signifie que la recherche peut être interrompue à cette étape et reprise plus tard.
- Assurez-vous que chaque nouvelle recherche est enregistrée dans l'écran d'historique de recherche avancée où elle sera attribuée un numéro(par exemple,#2). Utilisez ce numéro dans le champ de recherche ci-dessus pour soustraire les requêtes recherchées(p. ex., « #1 PAS #2 » pour soustraire les résultats de la recherche #2 des résultats de la recherche #1).
- Exporter les résultats pour les analyser davantage.
- Utilisez l'outil FLink (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi) pour exporter les résultats dans un format de valeurs séparées par virgule (CSV), et choisissez PubMed à partir de la S'il vous plaît choisir une base de données pour commencer la liste de déclassement.
- Choisissez l'entrée de l'historique entrez à partir de l'écran d'entrée, et un historique de recherche PubMed avancé apparaîtra à la liste de déroulant.
- Choisissez la recherche effectuée dans les étapes précédentes à la recherche avancée PubMed et cliquez sur Soumettre.
- Consultez le rapport qui en résulte puisqu'il offre la possibilité d'exporter les résultats de recherche dans un fichier format CSV.
- Effectuer les étapes suivantes pour analyser la production de recherche jordanienne au cours d'une période de 5 ans entre le 1/1/2013 et le 31/12/2017 à l'aide de PubMed.
- Ouvrez le formulaire de recherche avancé dans le formulaire de recherche de documents sur le site Web De PubMed (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
- Utilisez Jordan comme terme de recherche et spécifiez Affiliation comme champ de recherche. Notez que PubMed interprète l'affiliation comme toutes les informations relatives à l'auteur(c.-à-d. nom de l'auteur, adresse, affiliation), excluent ainsi tout document rédigé par un auteur nommé "Jordanie" dans lequel le pays affilié n'est pas la Jordanie. Suivez les étapes ci-dessous pour éviter d'inclure de tels résultats non pertinents.
- Tapez Jordan dans un autre champ et choisissez le type de champ Auteur.
- Choisissez l'opérateur PAS comme relation entre les deux champs et cliquez sur Recherche.
- Spécifiez les dates de publication du 1/1/2013 au 31/12/2017 dans la fenêtre des résultats, et choisissez l'article et l'examen du journal parmi les types d'article.
- Ouvrez FLink (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi), et choisissez PubMed comme base de données.
- Choisissez l'entrée de l'historique entrez à partir de l'écran d'entrée, et choisissez la recherche à partir de la liste de déroulant.
- Cliquez sur Télécharger CSV.
REMARQUE : La figure 1 détaille le rapport de recherche PubMed avec annotation pour chaque section du rapport.
2. Scopus
- Inscrivez-vous afin d'accéder aux capacités de recherche complètes de la base de données Scopus. Vérifiez si l'institution locale est déjà enregistrée et a accès à la base de données puisque les établissements d'enseignement sont généralement enregistrés en Scopus.
- Rendez-vous sur le site (www.scopus.com) et par défaut, Scopus ouvre l'écran du formulaire de recherche de documents.
- Entrez le terme de recherche souhaité dans le champ de recherche disponible.
- Spécifiez les champs de l'article à rechercher. Notez que les champs de recherche suivants sont disponibles : tous les champs, le titre, l'abstrait, les mots clés, les auteurs, les affiliations, les informations de financement, la langue, les références, la conférence, ISSN, CODEN, DOI, ORCID et le numéro CAS.
- Ajoutez d'autres champs pour rechercher et indiquer la relation entre le champ nouvellement ajouté et l'autre champ déjà entré (ET, OU, ou PAS). Voir ( tableau 1) pour plus de détails.
- Utilisez l'option Limite pour limiter la recherche en fonction des options fournies par Scopus, comme détaillé dans le tableau 2.Après l'exécution de la recherche, enregistrer la recherche et continuer plus tard si nécessaire.
- Dans ce cas, définir une alerte à l'aide de l'alerte d'option Set, où un e-mail sera envoyé lorsqu'un article répondant aux critères de recherche est ajouté.
- Affiner les résultats de recherche en plus loin des résultats directement en choisissant parmi les options fournies par Scopus ( tableau 2), où Scopus montre le nombre de documents inclus pour chaque option.
- Choisissez d'analyser les résultats directement sur le site Web de Scopus (cliquez sur Analyser les résultats de recherche), ou d'exporter les résultats dans les formats zip ou CSV après avoir rempli les critères de recherche.
- Effectuer les étapes suivantes pour analyser la production de recherche jordanienne au cours d'une période de 5 ans entre le 1/1/2013 et le 31/12/2017 à l'aide de Scopus.
- Rendez-vous sur le site (www.scopus.com) et par défaut, Scopus ouvre l'écran du formulaire de recherche de documents.
- Tapez Jordan comme terme de recherche dans le formulaire de recherche de document.
- Spécifier le pays d'affiliation comme champ de recherche.
- Limitez la durée de recherche de 2013 à 2017. A noter qu'à partir de 2013, du 1/1/2013 et de 2017 au 31/12/2017.
- Limitez le type de document à l'article ou à l'examen, puis cliquez sur Recherche.
REMARQUE : La figure 2 détaille le rapport de recherche Scopus avec une annotation pour chaque section du rapport.
3. Web de la science
- Inscrivez-vous afin d'accéder aux capacités de recherche complètes de la base de données Web of Science. Vérifiez si l'institution locale est déjà enregistrée et a accès à la base de données car les établissements d'enseignement sont généralement inscrits dans le Web of Science.
- Rendez-vous sur la page d'accueil du Web of Science (www.webofknowledge.com). Le site Web ouvre la recherche de base et inclut la collection Web of Science Core comme base de données sélectionnée pour la recherche.
- Rechercher les champs comme indiqué dans le tableau 2.
- Ajoutez un autre champ (si nécessaire) pour connecter les deux champs par ET, OU, ou PAS. Voir tableau 1.
- Définissez la durée recherchée jusqu'en 1945. Après avoir terminé la recherche, les résultats sont enregistrés dans l'historique et peuvent être retournés à tout moment. Si nécessaire, définir une alerte si un nouveau document est ajouté au rapport de recherche.
- Trier les résultats selon les données, les temps cités, les nombres d'utilisation, ou à d'autres catégories de la liste de déclassement fournie.
- Affiner les résultats de recherche directement à partir des résultats en choisissant parmi les options fournies par Web of Science ( tableau 2), où Web of Science montre le nombre de documents inclus pour chaque option.
- Affichez les résultats et analysez-les à l'aide d'une carte d'arbre ou d'un graphique à barres. Notez qu'il y a un tableau indiquant le nombre dans chaque catégorie.
- Téléchargez les résultats. Notez que contrairement à Scopus et PubMed, Web of Science ne permet le téléchargement de 5 000 enregistrements à la fois(par exemple, une recherche de résultats de 10 000 est téléchargée en deux lots, le premier lot pour les 5 000 premiers enregistrements, et un deuxième lot pour les 5 000 enregistrements suivants).
- Effectuer les étapes suivantes pour analyser les résultats de la recherche jordanienne au cours d'une période de 5 ans comprise entre le 1/1/2013 et le 31/12/2017 à l'aide du Web of Science.
- Tapez Jordan dans le champ de recherche et spécifiez l'adresse comme champ de recherche.
- Identifiez la durée de la recherche entre 2013 et 2017 et cliquez sur Recherche.
- Limitez la recherche à l'aide des filtres Article et Review.
- Choisissez d'analyser les résultats enregistrés dans l'historique de recherche maintenant ou plus tard.
- Choisissez d'analyser les résultats sous forme de tables ou de carte visuelle des arbres et des barres.
REMARQUE : La figure 3 détaille le rapport de recherche sur le Web de la science avec une annotation pour chaque section du rapport.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Résultats de la recherche PubMed
Au total, 4 363 documents ont été récupérés d'après la recherche effectuée dans le présent et le fait de la présente étude. Le texte intégral gratuit était disponible pour 1 767 documents (40,5 %). En 2013, un total de 532 documents ont été publiés, 663 documents en 2014, 811 documents en 2015, 952 documents en 2016 et 1 405 documents en 2017.
Les résultats révèlent que 1 008 (23,8 %) documents traitaient de questions liées au cancer, alors que seulement 53 (1,2 %) documents traitaient de sujets liés au sida. Les résultats montrent également que 150 (3,5 %) documents ont été publiés dans des revues liées à la dentisterie, tandis que 275 (6,5 %) documents ont été publiés dans des revues d'infirmières.
Résultats de la recherche Scopus
Au total, 11 444 documents ont résulté de la recherche effectuée dans la présente étude, dont 10 974 (95,9 %) articles et 470 (4,1 %) critiques. Seulement 652 (5,7 %) des documents étaient en libre accès.
La figure 4 montre la tendance anthère des publications jordaniennes au cours de l'intervalle de cinq ans. Selon le pays de collaboration dans la recherche Scopus (Figure 5), les États-Unis d'Amérique (États-Unis) est le pays le plus commun avec lequel les chercheurs jordaniens collaborent (1 553 publications), suivis de l'Arabie saoudite avec 1 176 publications, et Royaume-Uni avec 723 publications.
Figure 6 détaille les 10 disciplines les plus courantes dans lesquelles les Jordaniens ont publié. D'après la recherche Scopus, la médecine est la discipline la plus courante publiée dans (2 441 publications), suivie de l'ingénierie (1 837 publications) et des sciences sociales (1 468 publications). L'Université de Jordanie a contribué à 3 346 (29,3 %) publications du total des publications quinquennales, suivies par l'Université jordanienne des sciences et de la technologie avec 2 396 publications (21,0 %) et l'Université hachémite par 1 347 publications (11,8 %).
Résultats de la recherche Sur le Web de la science
Au total, 10 943 documents ont été publiés en Jordanie. 87 sont des documents très cités et 14 sont considérés comme des journaux chauds. Les résultats montrent que 2 879 documents étaient en libre accès, 2 547 documents étaient en libre accès en or, 170 documents ont été publiés en vert et 162 documents ont été acceptés en vert (manuscrit déposé dans des dépôts après acceptation avant publication).
La figure 7 montre la tendance anthère des publications jordaniennes au cours de l'intervalle de cinq ans. La figure 8 détaille le pays de la collaboration. Selon la recherche Sur le Web de la science, les États-Unis sont le pays le plus commun avec laquelle les Jordaniens collaborent (929 publications), suivis de la France avec 860 publications, et de l'Autriche avec 429 publications. La figure 9 détaille les 10 disciplines les plus courantes dans lesquelles les Jordaniens ont publié. Selon la recherche sur le Web des sciences, l'ingénierie est la discipline la plus courante publiée dans 1 315 publications, suivie des mathématiques (1 263 publications) et des sciences informatiques (828 publications).
Figure 1: Le rapport pour la recherche PubMed avec annotation couleur pour chaque section du rapport. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus large de ce chiffre.
Figure 2: Le rapport pour la recherche Scopus avec annotation couleur pour chaque section du rapport. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus large de ce chiffre.
Figure 3: Le rapport pour la recherche Web of Science avec annotation couleur pour chaque section du rapport. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus large de ce chiffre.
Figure 4: La tendance hebdomadaire des publications en Jordanie au cours de la période de5 ans, extraite de Scopus. S'il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus large de ce chiffre.
Figure 5: Les pays avec lesquels les Jordaniens ont tendance à écrire despublications, extraits de Scopus. S'il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Figure 6: Les disciplines despublications jordaniennes sont généralement d'environ, comme extrait de Scopus. S'il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Figure 7: Graphique àbarres montrant la tendance de publication annuel des années 2013-2017 en Jordanie, extraite du Web of Science. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus large de ce chiffre.
Figure 8: Graphique à barres montrant les pays avec lesquels les Jordaniens ont tendance à collaborer au cours desannées 2013-2017, extraits du Web de la science. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus large de ce chiffre.
Figure 9: Une carte d'arbre montrant les 10 disciplines dans lesquelles la plupart des Jordaniens publient au cours des années 2013-2017, extraites du Web de la science. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus large de ce chiffre.
| Fonction de l'opérateur | Pubmed | Scopus | Web de la science | échantillon |
| Les deux termes doivent apparaître | et | et | et | |
| Au moins un des termes doit apparaître | ou | ou | ou | |
| Le terme après qu'il ne doit pas apparaître | même pas | ET NON | même pas | |
| Vous voulez trouver deux mots à une distance "n" les uns des autres quel que soit leur ordre | X | W/n | NEAR/n | Jordan W/2 Cancer - trouver un résultat avec les mots "Jordanie" et "Cancer" dans les 2 mots les uns des autres |
| Vous voulez trouver un mot à l'intérieur d'une distance "n" avant l'autre mot (ordre respecté) | X | Pré/n | X | Jordan Pre/2 Cancer - trouver un résultat avec les mots "Jordanie" précède "Cancer" par 2 mots |
| Vous voulez trouver les mots avec la tige spécifiée, indépendamment de l'autre partie du mot | X | ou ? | * | Jordanie ou Jordanie ? - retournera également les résultats pour "Jordanian" |
| Vous voulez trouver un mot avec la tige spécifiée et avec un maximum d'une lettre de plus après elle | X | X | $ ou ? | Jordan$ ou Jordan ? - donnera des résultats pour "Jordanies" mais pas pour "Jordanie" |
| Les recherches pour la phrase exacte dans les guillemets, respectera la signification de tous les opérateurs mentionnés dans les citations | X | "" | "" | "Cancer en Jordanie?" - recherchera le "cancer en Jordanie" ou "cancer en Jordanie" |
| Recherche de la phrase exacte dans les guillemets, sans respecter le sens des opérateurs mentionnés dans les citations | X | {} | X | Le cancer en Jordanie ? - la recherche de "cancer en Jordanie?" seulement, c'est-à-dire qu'il interprétera le point d'interrogation comme un point d'interrogation |
Tableau 1 : Opérateurs pour effectuer les fonctions spécifiées pour chaque base de données. Les opérateurs de PubMed doivent être dans le cas supérieur, contrairement à ceux de Scopus et Web of Science. X n'est pas présent.
| Mesures des résultats | Pubmed | Scopus | Web de la science |
| Documents chaque année | √ | √ | √ |
| Publications dans un journal spécifique | √ | √ | √ |
| Publications par auteur | √ | √ | √ |
| Affiliation institutionnelle | √ | √ | √ |
| Pays des auteurs | √ | √ | √ |
| Nombre de publications en libre accès (Golden OA) | √ | √ | √ |
| Nombre de publications en libre accès (Green OA) | X | X | √ |
| Publications par type de document | √ | √ | √ |
| Zone du sujet | √ | √ | √ |
| Publications dans des éditeurs spécifiques | √ | X | X |
| Publications pour des termes spécifiques MeSH | √ | X | √ |
| Catégories Web of Science | X | X | √ |
| Agence de financement | X | X | √ |
| Publications sur le sexe spécifique | √ | X | X |
| Publications sur un groupe d'âge spécifique | √ | X | X |
| Publications par un ID PubMed unique | √ | X | √ |
| Publications gérées par un éditeur spécifique | X | X | √ |
| Articles très cités : Les articles sont les 1 % les plus élevés dans chaque domaine en termes de citations les plus élevées au cours des 10 dernières années. | X | X | √ |
| Articles chauds sur le terrain : Des articles qui ont été très cités au cours des deux derniers mois par rapport à la norme (citations moyennes dans les documents par les pairs). | X | X | √ |
Tableau 2 : Mesures des résultats et filtres de recherche disponibles pour chaque base de données de littérature. Les chercheurs peuvent se référer aux instructions de chaque base de données pour plus de détails sur l'utilisation de chaque filtre.
| Pubmed | Scopus | Web de la science | |
| Disciplines couvertes | Sciences de la vie et disciplines biomédicales | Toutes les disciplines | Toutes les disciplines |
| centre d'intérêt | Sciences de la vie et disciplines biomédicales | Physique, santé, vie et sciences sociales | Sciences, technologie, sciences sociales, arts et sciences humaines. |
| Période couverte | 1966 | 1970 | 1900* |
| Gratuit/payé | libre | rémunéré | rémunéré |
| propriété | Institut national de la santé | Elsevier | Clarivate Clarivate |
| Indexation des trimestres professionnels | ouais | non | non |
| Recherche de données associée | non | non | ouais |
| Couverture de données anciennes | non | non | ouais |
| Production de chiffres | non | ouais | ouais |
| Évaluation de l'accès libre | Accès libre d'or | Accès libre d'or | Accès libre vert et or |
| Interface conviviale | + | ++ | +++ |
| Disponibilité des opérateurs | + | +++ | ++ |
| La couverture dépend de l'abonnement institutionnel | |||
Tableau 3 : Comparaison des caractéristiques de PubMed, Scopus et Web of Science. L'information contenue dans ce tableau est basée sur les données de cette étude et les informations fournies par chaque base de données10,22,23,24.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Dans cette étude, les étapes par lesquelles les bases de données PubMed, Scopus et Web of Science sont utilisées pour effectuer une analyse bibliométrique ont été fournies. Il a été indiqué que l'outil le plus convivial et le plus facile à utiliser pour les services d'analyse bibliométrique est Web of Science; cependant, son inconvénient est que ses services ne sont pas disponibles gratuitement. PubMed est consacré aux sciences biomédicales et est affilié à plusieurs autres outils de la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) qui peuvent aider à optimiser l'analyse des sujets biomédicaux. Medical Subject Heading (MeSH) est un outil d'indexation professionnelle, où lors de l'ajout d'un nouvel article à la base de données PubMed, l'article sera recherché par des experts pour les principaux sujets qu'il aborde, et une liste de MeSH sera assignée pour chaque article. D'autre part, son principal inconvénient est qu'il nécessite de bonnes connaissances sur la façon de l'utiliser. La recherche de la collection de base du Web of Science donnera tous les articles qui sont publiés dans des revues indexées dans le Science Citation Index Expanded (SCIE), le Social Science Citation Index (SSCI), le Arts and Humanities Citation Index (AHCI) et le Indice de citation à la source émergente (ESCI), où les auteurs peuvent choisir la base de données dans le Web of Science à rechercher dans18. En outre, deux autres bases de données pour les livres et les conférences sont également inclus19. Scopus est généralement facile à utiliser et dispose d'une base de données qui couvre plus de revues que les deux autres services20, mais il est encore un service payant. Tableau 3 plus de détails et compare les caractéristiques de PubMed, Scopus, et Web of Science.
Comme le montrent les résultats, chacune des recherches de base de données Scopus et Web of Science a fourni différentes disciplines comme les disciplines les plus courantes que les Jordaniens publient. Les raisons de ces écarts ont été examinées en analysant la classification du domaine de recherche (discipline) pour chaque base de données. Il a été constaté que la recherche Scopus a donné 27 domaines de recherche, où les publications sont classées dans un ou plusieurs d'entre eux. D'autre part, la recherche sur le Web des sciences a donné lieu à 140 domaines de recherche. Cependant, les publications web of Science sont classées dans une seule d'entre elles (aucune publication n'est classée dans plus d'un domaine de recherche). Par exemple, le domaine de recherche unique "Médecine" dans Scopus correspond à 27 domaines de recherche dans le Web de la science, qui sont (les chiffres correspondent à la contribution de chaque domaine de recherche dans le total 10 936 publications qui ont résulté de la recherche Web of Science):
Médecine interne (2,5 %), neurologie (2,2 %), oncologie (2,2 %), chirurgie (1,4 %), endocrinologie (1,1 %), pédiatrie (1,1 %), psychiatrie (1 %), médecine expérimentale (1 %), système cardiovasculaire (0,9 %), maladies infectieuses (0,9 %), radiologie (0,9 %), orthopédie ( 0,7 %), obstétrique et gynécologie (0,7 %), immunologie (0,6 %), réadaptation (0,6 %), hématologie (0,6 %), urologie (0,5 %), respiratoire (0,4 %), ophtalmologie (0,3 %), gastroentérologie (0,3 %), médecine complémentaire (0,3 %), dermatologie (0,2 %), 0,2 %), la rhumatologie (0,2 %), l'anesthésiologie (0,2 %), les médicaments d'urgence (0,1 %), les allergies (0,1 %).
Comme expliqué précédemment dans le protocole, les chercheurs peuvent télécharger les résultats de recherche dans un format CSV ou XLSX, où plusieurs outils sont disponibles pour analyser et cartographier les résultats. Ces outils appliquent le concept de cartographie scientifique ou de cartographie bibliométrique, qui est une représentation spatiale de la façon dont les disciplines, les champs, les documents ou les auteurs sont liés24,25:
- L'outil Sci2 (https://sci2.cns.iu.edu/user/index.php ): Un outil librement disponible pour effectuer des analyses sur les données extraites de Scopus, Web of Science, ou même PubMed.
- BibExcel (http://homepage.univie.ac.at/juan.gorraiz/bibexcel/ ): Un outil librement disponible qui gère et construit des cartes pour les données extraites de différents logiciels bibliométriques.
- CiteSpace (http://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace/): Un outil disponible gratuitement pour visualiser et analyser les tendances et les modèles de la littérature scientifique.
- UCINET (https://sites.google.com/site/ucinetsoftware/home ): Un outil basé sur l'ubscription pour l'analyse des données des réseaux sociaux et le dessin de cartes visualisées.
- Pajek (http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/ ): Un outil disponible gratuitement pour l'analyse et la visualisation des grands réseaux.
- Logiciel de Leydesdorff (https://www.leydesdorff.net/software.htm ): Un outil librement disponible pour analze sortie à partir de bases de données bibliométriques et pour dessiner des cartes des résultats.
- Outil de workbench réseau (http://nwb.cns.iu.edu ) : Outil disponible gratuitement qui fournit des algorithmes spécifiques pour traiter les données des publications pour construire et analyser des réseaux et des cartes bibliométriques.
- VintagePoint (https://www.thevantagepoint.com ): Un outil par abonnement pour analyser et cartographier de grands volumes de texte structuré pour découvrir les modèles et les relations
- VOSviewer (http://www.vosviewer.com/download): Un outil librement disponible spécialement conçu pour construire et visualiser des cartes bibliométriques, en accordant une attention particulière à la représentation graphique de ces cartes.
En outre, les chercheurs peuvent utiliser les données obtenues à partir des trois bases de données (Pubmed, Scopus et Web of Science) et calculer plusieurs autres indices précieux à l'aide de données provenant d'autres sources, y compris la Banque mondiale et l'Organisation de coopération économique et développement (OCDE). Comme les publications chaque année et le pays d'affiliation de l'auteur sont disponibles en tant que mesures des résultats dans les trois bases de données, les indices suivants peuvent ainsi être mesurés :
- Indice de population
- Nombre de publications par million d'habitants, où les populations peuvent être obtenues à partir de la base de données26de la Banque mondiale .
- Publications par produit intérieur brut (PIB)
- Nombre de publications par milliard de dollars de PIB, où le PIB peut être obtenu à partir des «indicateurs du développement mondial» à partir de la base de données26de la Banque mondiale .
- Taux de croissance scientifique annuel (productivité de la recherche)
- (Publications dans l'année (n) - Publications dans l'année (n-1)/ Publications de l'année (n-1)
- Publications par région
Comme le monde est divisé en 9 régions selon l'Annuaire statistique des Nations Unies par les Nations Unies27, ces divisions sont basées sur des considérations géographiques, scientifiques et économiques. Ces régions sont : l'Europe occidentale, l'Europe de l'Est, les États-Unis d'Amérique (États-Unis), le Canada, l'Amérique latine et les Caraïbes, l'Afrique, le Japon, l'Asie (à l'exclusion du Japon) et l'Océanie.
Les chercheurs qui cherchent à faire une analyse bibliométrique à l'aide des bases de données susmentionnées devraient être conscients de leurs limites; la couverture des revues par Scopus et Web of Science dans presque toutes les disciplines n'atteint pas la moitié des revues dans le dictionnaire des périodiques d'Ulrich28. Cela signifie que bien que les revues indexées Scopus et Web of Science soient basées sur la qualité, elles ne couvrent pas toutes les revues dans aucune discipline. De plus, les revues de langue non anglaise sont sous-représentées, car ces bases de données sont axées sur les revues de langue anglaise28. L'une des limites que l'on peut rencontrer au cours de l'analyse est l'indisponibilité d'informations complètes sur un article(par exemple,le pays d'affiliation de l'auteur manquant), ce qui pourrait conduire à une sorte d'erreur dans les résultats. Cela peut être évité en effectuant une recherche manuelle pour l'auteur. Toutefois, cette question n'a pas été abordée dans l'analyse effectuée dans le présent rapport puisque des études antérieures ont estimé que les renseignements manquants causés par cette question étaient insignifiants (moins de 5 %)6.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Tous les auteurs ne révèlent aucun conflit d'intérêts potentiel.
Acknowledgments
Les auteurs tient à remercier le doyen de la recherche scientifique pour son fonds pour soutenir la production vidéo pour cette étude. Les auteurs aimeraient également remercier le Dr Aseel Zabin, Département de langue et de littérature anglaises, Université de Jordanie, pour l'examen de cette étude en anglais.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| clarivate | N/A | Web of Science provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan. | |
| Elsevier | N/A | Scopus provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan. |
References
- McGowan, J. PRESS peer review of electronic search strategies: 2015 guideline statement. Journal of Clinical Epidemiology. 75, 40-46 (2016).
- Hood, W., Wilson, C. The literature of bibliometrics, scientometrics, and informetrics. Scientometrics. 52 (2), 291-314 (2001).
- Bar-Ilan, J. Citations to the Introduction to infometrics indexed by WOS, Scopus and Google Scholar. Scientometrics. 82 (3), 495-506 (2010).
- Boudry, C., Baudouin, C., Mouriaux, F. International publication trends in dry eye disease research: A bibliometric analysis. The Ocular Surface. 16 (1), 173-179 (2018).
- Kulkarni, A. V. Comparisons of citations in Web of Science, Scopus, and Google Scholar for articles published in general medical journals. Journal of the American Medical Association. 302 (10), 1092-1096 (2009).
- AlRyalat, S. A., Malkawi, L. International Collaboration and Openness in Jordanian Research Output: A 10-year Publications Feedback. Publishing Research Quarterly. 34 (2), 265-274 (2018).
- Falagas, M. E., Karavasiou, A. I., Bliziotis, I. A. Estimates of global research productivity in virology. Journal of Medical Virology. 76 (2), 223-229 (2005).
- Young, H. The ALA glossary of library and information science. , Ediciones Díaz de Santos. (1983).
- Broadus, R. Toward a definition of bibliometrics. Scientometrics. 12 (5-6), 373-379 (1987).
- Falagas, M. E. Comparison of PubMed, Scopus, web of science, and Google scholar: strengths and weaknesses. The FASEB Journal. 22 (2), 338-342 (2008).
- Guz, A. N., Rushchitsky, J. J. Scopus: A system for the evaluation of scientific journals. International Applied Mechanics. 45 (4), 351 (2009).
- Jacso, P. As we may search-comparison of major features of the Web of Science, Scopus, and Google Scholar citation-based and citation-enhanced databases. CurrentScience. 89 (9), 1537-1547 (2005).
- Li, J. Citation analysis: Comparison of Web of Science, Scopus, Scifinder, And Google Scholar. Journal of Electronic Resources in Medical Libraries. 7 (3), 196-217 (2010).
- Levine-Clark, M., Kraus, J. Finding chemistry information using Google Scholar: a comparison with Chemical Abstracts Service. Science & Technology Libraries. 27 (4), 3-17 (2007).
- Gavel, Y., Iselid, L. Web of Science and Scopus: a journal title overlap study. Online Information Review. 32 (1), 8-21 (2008).
- Harzing, A. W., Alakangas, S. Google Scholar, Scopus and the Web of Science: a longitudinal and cross-disciplinary comparison. Scientometrics. 106 (2), 787-804 (2016).
- Aghaei Chadegani, A., et al. A comparison between two main academic literature collections: Web of Science and Scopus databases. , (2013).
- Testa, J. The Thomson Reuters journal selection process. Transnational Corporations Review. 1 (4), 59-66 (2009).
- Web of Science Core Collection: Web of Science: Summary of Coverage. , http://clarivate.libguides.com/woscc/coverage (2018).
- Burnham, J. F. Scopus database: a review. 3 (1), Biomedical Digital Libraries. 1 (2006).
- Pubmed. , www.ncbi.nlm.nih.gov/ (2018).
- Scopus. , www.scopus.com (2018).
- Web of Science. , www.webofknowledge.com (2018).
- Small, H. Visualizing science by citation mapping. Journal of the American society for Information Science and Technology. 50 (9), 799-813 (1999).
- Cobo, M. J. Science mapping software tools: Review, analysis, and cooperative study among tools. Journal of the American Society for Information Science and Technology. 62 (7), 1382-1402 (2011).
- World bank. , http://www.worldbank.org (2018).
- Statistical Yearbook – 60th issue. , https://unstats.un.org/unsd/publications/statistical-yearbook/ (2018).
- Mongeon, P., Paul-Hus, A. The journal coverage of Web of Science and Scopus: a comparative analysis. Scientometrics. 106 (1), 213-228 (2016).
