Summary
يصف لنا طريقة لتقييم أثر الحصانة موجودة مسبقاً ضد فيروس حمى الدنج في عدوى فيروس زيكا باستخدام مصل الدم البشري وخلايا الإنسان الأولية، والكمي العدوى بالكمية في الوقت الحقيقي تفاعل البوليميراز المتسلسل.
Abstract
وادي ظهور مصفر Zika والمضاعفات العصبية، مثل متلازمة غيلان-باريه وصغر الرأس عند الرضع، الشواغل المتعلقة بالسلامة العامة الخطيرة. من بين عوامل الخطر، يشكل تعزيز تعتمد على جسم (ADE) التهديد الأكثر أهمية، كما الأخيرة ظهور الفيروس Zika (زيكف) أساسا في المجالات التي تعرضت فيها السكان وفي حالة من الحصانة السابقة إلى أخرى وثيقة الصلة flaviviruses، وبخاصة فيروس حمى الدنج (DENV). هنا، يمكننا وصف بروتوكول للتحديد الكمي لأثر أضداد المصل البشري DENV على الإصابة زيكف في الخلايا البشرية الرئيسية أو خطوط الخلايا.
Introduction
من بين الأمراض الفيروسية المنقولة بالبعوض، العدوى Zika واحد من أكثر سريرياً هامة1. بسبب العدوى مصفر زيكف التي، في معظم الحالات، يستخدم بعوض الزاعجة المصرية ك ناقل الابتدائي1،2. ومع ذلك، هناك الدراسات التي أبلغت عن Aedes albopictus كناقل الأولية في بعض حالات تفشي زيكف3. على الرغم من أن الإصابة أعراض في كثير من الحالات، الأعراض الأكثر شيوعاً هي الحمى والصداع و الأم العضلات2. لا تتوفر أي علاج أو لقاح للإصابة زيكف والعلاج المتاحة في معظمها داعمة. الأخيرة تفشي زيكف في أمريكا الجنوبية أدت إلى الحالات الشديدة من المرض، وزيادة الاضطرابات النمائية في الأجنة يدعى صعل2برنامج تقريبا. كما أن أمريكا الجنوبية منطقة مستوطنة إلى سيتناقش عدة مثل الفيروس DENV وغرب النيل، من الأهمية بمكان للتحقيق في ما إذا كانت الحصانة السابقة إلى أخرى flavivirus(es) يلعب دوراً في شدة زيكف العدوى والمرض.
على مر العصور، تطورت الفيروسات استراتيجيات مختلفة لزيادة فرصهم للعدوى من أجل السيطرة على آليات الخلية المضيفة وقمع استجابة الأدوية المضادة للفيروسات. واحدة من أروع من كل ما هو استخدام الأجسام المضادة المناعية قبل المضيف بالفيروسات لتعزيز تكرارها مع ظاهرة ADE4. ADE عبر جميع اللقاح أربعة من DENV وقد درست بشكل جيد وأظهر زيادة التتر الفيروسية والأمراض نتيجة5،،من67. في دراسة سابقة في المختبر، وقد أظهرنا زيادة كبيرة في زيكف النسخ المتماثل بسبب الموجودة مسبقاً DENV الحصانة في الخلايا المناعية البشرية الأولية8. كما أظهرنا أسلوب ذات صلة في المختبر لقياس قدرة DENV الموجودة من قبل الأجسام المضادة لتحسين النسخ المتماثل زيكف في الخلايا الأولية.
يستخدم البروتوكول الذي وضعنا عينات مصل الدم البشري الذي يتم اختباره لتحييد DENV في تسيد-50 أو فحوصات البلاك الحد من تحييد الاختبار (طباعة)، جنبا إلى جنب مع زيكف في ذات الصلة بيولوجيا الخلايا أو الخلايا المشتقة من الأنسجة التي يمكن أن تصيب زيكف.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
وتم الحصول على عينات الأمصال المستخدمة في هذه الدراسة من المشاركين البشرية من مجموعة من كولومبيا. وأقر المجلس الاستعراض الداخلي (IRB) في جامعة دي بامبلونا (كولومبيا، أمريكا الجنوبية) ومستشفى لوس بوتيوس8جمع العينات. قدمت العينات مجهولة والمحققين لم يكن الوصول إلى معلومات المريض. تم فحص عينات مصلية للنمط المصلي DENV المسيطر. العينات وتأكدت كذلك لتحييد العدوى DENV في المختبر. لعنصر التحكم، استخدمت عينات المصل من الأشخاص الأصحاء (HC) من الولايات المتحدة الأمريكية.
ملاحظة: يمكن استخدام هذا البروتوكول لدراسة النسخ المتماثل ADE زيكف في أي نوع من الخلايا البشرية التعبير عن مستقبلات Fcγ. البروتوكول ويتكون من ثلاثة أجزاء (الشكل 1).
1-الخلية البذر والإعداد للإصابة
ملاحظة: وقد استخدمت لهذا دراسة معينة أو الضامة الابتدائي البشرية أو U937 حيدي الخلية خط (ATCC-CRL-1593.2). تم الاحتفاظ بالخلايا في ربمي النمو المتوسطة وتستكمل مع 10% مصل بقرى الجنين (FBS) في حاضنة 37 درجة مئوية مع 5% ثاني أكسيد الكربون (CO2). جميع الخطوات التي نفذت في مجال السلامة الأحيائية المستوى 2 (BSL-2) السلامة الأحيائية من مجلس الوزراء في ظروف معقمة.
- البذور 3 × 104 خلايا كل جيدا في صفيحة مسطحة القاع 96-جيدا عقيمة جنبا إلى جنب مع 100 ميليلتر من المتوسطة ووضعها في الحاضنة 37 درجة مئوية مع 5% CO2.
- بعد زرع الخلايا، ذوبان الجليد عينات المصل في درجة حرارة الغرفة وجعل الوقت تخفيف المسلسل (أي1/10، 1/100، 1/1,000، 1/10,000) عن طريق خلط العينات في المتوسط خالية من المصل. الكوة تخفيف في لوحة 96-جيدا عقيمة. استخدم الفيروس دون المصل كعنصر تحكم إضافية.
- ذوبان الجليد رصيد زيكف عند 37 درجة مئوية في حمام مائي لمدة 1-2 دقيقة ونقلها بسرعة الجليد لاستخدامها في المستقبل.
- إضافة تعدد 0.1 من العدوى (وزارة الداخلية) ما يعادل مبلغ زيكف سلالة MR766 إلى مختبرين المصل.
ملاحظة: تأكد من أن عامل إضعاف ما زالت مستمرة وأن إجمالي حجم ~ 200 ميليلتر؛ وهذا يكفي تريبليكاتيس لكل معاملة. تبقى ثلاثة آبار وقاية لاستخدامه كمراقبة سلبية لتحليل المتلقين للمعلومات. - احتضان تخفيف المصل مع الفيروس وأضاف في الحاضنة 37 درجة مئوية مع 5% CO2 لح 1 بغية السماح لأجسام DENV إلى نموذج المجمعات مع فيريونس زيكا (للراحة، يشار إلى "مجمعات محصنة").
- نضح الوسائط من الخلايا التي كانت تبذر في لوحة مسطحة القاع 96-جيدا. تغسل الخلايا مع العقيمة 1 × مخزنة الفوسفات المالحة (1 x PBS).
- إضافة 50 ميليلتر من المجمعات المناعة لكل بئر واحتضانها لهم في الحاضنة 37 درجة مئوية مع 5% CO2 ح 2.
- بعد نضح ح 2 من الحضانة، وسائل الإعلام التي تحتوي على مجمعات محصنة من الخلايا، باستخدام القنوات المتعددة "الماصة؛"، وتغسل الخلايا 2 x مع 1 x برنامج تلفزيوني إزالة أي فيريونس فاتحة ومجمعات محصنة تماما.
- إضافة 100 ميليلتر من وسائل الإعلام كاملة جديدة تستكمل مع 10% FBS لكل الخير واحتضان الخلايا في الحاضنة 37 درجة مئوية مع 5% CO2 ح 48.
2. استخراج الحمض النووي الريبي
- إزالة لوحة 96-جيدا من الحاضنة ونقلها إلى مجلس الوزراء السلامة الأحيائية.
- نضح وسائط الإعلام، وتغسل الخلايا 2 x مع 1 x برنامج تلفزيوني، والمضي قدما لاستخراج الحمض النووي الريبي.
ملاحظة: ويمكن استخراج الحمض النووي الريبي بأي طريقة لاختيار (الرجوع إلى الجدول للمواد). - إضافة 250 ميليلتر من المخزن المؤقت لتحلل الخلية مع 10% β-mercaptoethanol كل بئر. "الماصة؛" المخزن المؤقت صعودا وهبوطاً على الأقل 5 س جنبا إلى جنب مع خدش الخلايا مع طرف الماصة لتسريع عملية تحلل.
- نقل ليساتيس الخلية إلى أنابيب مل 1.5 الجديد، المسمى، وعقيمة.
- إضافة مبلغ مساو من الإيثانول 70% (250 ميليلتر). "الماصة؛" صعودا وهبوطاً 4 س-5 س حتى يصبح الخليط واضحة.
- نقل الخليط (~ 500 ميليلتر) إلى تسمية الأعمدة المستندة على السليكا في أنابيب جمع 2 مل والطرد المركزي في 15,000 س ز لتجاهل س. 30 من التدفق من خلال الحفاظ الأعمدة في أنابيب جمع نفس.
- إضافة 700 ميليلتر من المخزن المؤقت للمياه والصرف الصحي 1 لكل عمود والطرد المركزي في 15,000 س ز لتجاهل س. 30 من التدفق من خلال إبقاء الأعمدة في أنابيب جمع نفس.
- إضافة 500 ميليلتر يغسل المخزن المؤقت 2 لكل عمود وأجهزة الطرد المركزي في س 15,000 ز لتجاهل س. 30 المادة طافية. كرر هذه الخطوة 2 x.
- نقل الأعمدة إلى أنابيب جمع 2 مل جديدة وأجهزة الطرد المركزي في س 15,000 ز للحد الأدنى 2 ضمان الحصول على أعمدة القائم على السليكا جافة تماما، وهناك لا الإيثانول غادر من المخزن المؤقت للمياه والصرف الصحي 2.
- تجاهل هذه الأنابيب 2 مل ومكان الأعمدة في الجديدة والعقيمة، المسمى، أنابيب الإنعاش 1.5 مل.
- إضافة بريوارميد (42 درجة مئوية) 30 ميليلتر من المياه خالية من رناسي في وسط كل عمود وأجهزة الطرد المركزي في 15,000 س ز لمدة 1 دقيقة.
- استرداد التيد الجيش الملكي النيبالي، وتحديد حجم العينات، باستخدام جهاز المطياف الضوئي في الطول موجي نانومتر 260.
ملاحظة: ومن الناحية المثالية، تحديد نقاء الجيش الملكي النيبالي بحساب النسبة بين امتصاص القيم في 260 nm و 280 نانومتر. نسبة 260/280 المنقي رنا مثالي بين 1.8 2.0.
3-الكمية في الوقت الحقيقي تفاعل البوليميراز المتسلسل
ملاحظة: يمكن أن تنفذ الكمية في الوقت الحقيقي تفاعل البوليميراز المتسلسل (قرة-PCR) باستخدام أي مزيج سيبر الأخضر الذي يتكون عادة من "الأخضر سيبر" أنا صبغ بوليميراز "الدنا بوليميراز"، ديوكسينوكليوتيدي تريفوسفاتيس (دنتبس) وصبغة سلبية. يمكن استخدام أي آلة qPCR قادرة على الكشف عن سيبر أخضر القيام برد فعل، والحصول على البيانات. استخدمت مجموعة RT-PCR خطوة واحدة لهذه التجربة، التي كان مزيج من "الأخضر سيبر" أنا روكس صبغ، بوليميراز الدنا بوليميراز، دنتبس وخليط مادة إضافية من المنتسخة العكسية (الرجوع إلى الجدول للمواد). كبسولة تفجير تصميم ضد منطقة المغلف والمستخدمة في هذه الدراسة لقياس مستويات الجينوم زيكف هي ككجكتجكككاكاكاج لربع النهائي زيكف وككاكتاكجتكتتتجكاجاكات زيكف-ريال قطري. كعنصر تحكم، يقاس الإنسان بيتا-2-ميكروجلوبولين (B2M) واستخدامه لتطبيع التعبير عن زيكف (الجينات التدبير المنزلي). تسلسل التمهيدي التحديد الكمي للتعبير الجيني B2M المستخدمة في هذه الدراسة هي كتككجتجككتاجكتجتج ل B2M-qF وتتجاجتاكجكتجاتاجككت ل B2M-ريال قطري. تأكد من وضع ثلاثة replicates التقنية لكل عينة زيكف والجينات B2M. إعداد RT-PCR يرد بإيجاز أدناه.
-
الإعداد RT-PCR
- استخدام 100 نانوغرام من الحمض النووي الريبي كل عينة.
- إضافة 1 ميليلتر من 10 ميكرون الأرصدة من الإشعال إلى الأمام وعكس كل من جين معين لكل رد فعل.
- إضافة 0.25 ميليلتر من مزيج المنتسخة العكسية كل عينة.
- لكل رد فعل فردي، إضافة 12.5 ميليلتر من مزيج "الأخضر سيبر".
- إضافة إلى 25 ميليلتر من الماء. جعل ماجستير في مزيج من جميع الكواشف المذكورة أعلاه باستثناء الجيش الملكي النيبالي، اليكووت في لوحة بكر 96-جيدا، وإضافة الحمض النووي الريبي آخر.
- ختم اللوحة بشريط لاصق شفاف.
- الطرد المركزي اللوحة في 1,000 س ز لمدة 1 دقيقة لخلط الكواشف.
- وضع اللوحة في الجهاز قبكر.
-
RT-PCR الشخصية
ملاحظة: استخدام التشكيل الجانبي RT-PCR هو مبين في الجدول 1 .- احتضان العينات عند 50 درجة مئوية لمدة 10 دقائق لضمان تركيب الحمض النووي التكميلية (كدنا).
- بعد التوليف كدنا، تنشيط بوليميراز "الدنا بوليميراز" في 95 درجة مئوية لمدة 5 دقائق.
- إجراء دورات 40 من تمسخ عند 95 درجة مئوية 10 s والصلب التمهيدي والإرشاد عند 60 درجة مئوية لمدة 30 ثانية.
- وضع الخطوة منحنى تذوب إضافية (65 درجة مئوية) في نهاية المطاف.
-
تحليل البيانات
- رصد المنحنى تذوب بواسطة النقر فوق علامة التبويب منحنى تذوب في البرنامج الذي تم استخدامه لتشغيل الجهاز قبكر، التي، من الناحية المثالية، ويبين ذروة واحدة في جميع العينات لجين معين للتأكد من وجود أمبليكون واحدة فقط وقيمة تضخيم إذا أكثر من 1.6 الغوري ويرى thm 2 كقيمة التضخيم 100% (قيمة التضخيم تختلف الخوارزمية المستخدمة من قبل الجهاز qPCR). تأكد من استخدام 0.5 درجة مئوية درجة الحرارة زيادات بين الخطوات والحد أدنى عقد الساعة 10 s في البروتوكول منحنى تذوب، لتحقيق أفضل النتائج.
- بعد التأكد من وجود أمبليكون واحد وقيمة التضخيم جيدة، أولاً انقر فوق علامة التبويب بيانات القياس الكمي للحصول على دورة كمية (Ct/Cq القيمة) من كل عينة وتصدير إلى Microsoft Excel.
- استخدام جداول بيانات، حساب متوسط كل عينة باستخدام قيمة الأشعة المقطعية. بعد ذلك، انقر فوق الصيغ وحدد المتوسط. يتم استخدام القيم المقطعية متوسط كل عينة (تكرار) لمزيد من التحليل.
- حساب ΔCt استخدام ΔCt الصيغة التالية، = متوسط Ct الجينات المستهدفة--متوسط Ct الجينات التحكم (في هذه الحالة، ΔCt = متوسط Ct الجين زيكف--متوسط Ct الجينات B2M).
- حساب ΔΔCt لتطبيع البيانات (في هذه الحالة، ΔΔCt = ΔCt زيكف عينات-عينات B2M).
- حساب إضعاف زيادة التعبير الجيني بكتابة 2^-(ΔΔCt) صيغة لكل قيمة واحدة ΔΔCt تطبيع. يمكن الحصول على نتائج زيادة إضعاف لإجراء الاختبارات الإحصائية كما هو موضح في دراسات سابقة9،10.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
في الشكل 1، هناك مثال خطوة بخطوة البيانية لجميع الخطوات التي تنطوي عليها لتنفيذ البروتوكول ADE. ورسم تخطيطي يظهر الإجراء بأكمله "أدى زيكف" بسبب الحصانة موجودة مسبقاً إلى DENV. ويبين الشكل 2 المصل الإنسان كيف تم تصنيف العينات إلى ثلاث مجموعات مختلفة: DENV أكد العدوى عينات يشار إلى مجموعة المصابين DENV، DENV جسم، أكدت العينات المشار إليها كمجموعة DENV المكشوفة، وصحية سيرا الأفراد مع عدم وجود الأجسام المضادة لتحييد DENV أو الحمض النووي الريبي تسمى مجموعة مراقبة صحية (HC). (الشكل 2).
وسمح لجعل المجمعات مع زيكف جميع عينات مصل وثم استخدمت لتصيب خلايا بلعم. بعد بوستينفيكشن ح 48، استخراج الحمض النووي الريبي وتعرض لبكر قرة. تجربة الممثل في الشكل 3 يوضح أن معظم الأمصال المحتوية على الأجسام المضادة للنمط المصلي المسيطر 1 إلى 4 DENV كانت قادرة على تحسين النسخ المتماثل زيكف على مختلف المستويات. تم العثور على أعلى زيادة في التتر زيكف في الضامة تعامل مع الأمصال المحتوية على الأجسام المضادة للنمط المصلي المسيطر 2 و 4 DENV مقارنة بالنمط المصلي المسيطر 1 و 3، مما يدل الاستقراء أقل نسبيا من زيكف.
الشكل 1 : التوضيح البيانية بروتوكول ADE. مثال توضيحي خطوة بخطوة يوضح جميع الخطوات المشتركة في البروتوكول كله. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
الشكل 2 : التخطيطي من الإجراءات التجريبية. كانت ثلاثة أنواع من الأمصال المحتضنة مع فيروس زكى. مجموعة أنا وتألفت من عينات (DENV المصابة) إيجابية DENV-الجيش الملكي النيبالي. وتألفت المجموعة الثانية DENV جسم إيجابية العينات (مكشوف DENV). المجموعة الثالثة تتألف من العينات مع لا الحمض النووي الريبي DENV أو جسم (مراقبة صحية). تمت إضافة خليط الأمصال الفيروس الضامة البشري والعدوى كمياً. لقد تم تعديل هذا الرقم من لوندونو-رينتيريا et al.8. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
الشكل 3 : الأمصال المناعية DENV يعزز الإصابة زيكف في الضامة البشرية الأساسية- البشرية الأمصال المحتوية على الأجسام المضادة DENV (DENV1-4 النمط المصلي المسيطر أكدت، العقيد هي النمط المصلي المسيطر غير معروف) أو من ضوابط صحية وكانت مخففة 01:10 للمضيفين والمحتضنة مع زيكف. الأمصال موصوفة في الجدول 1. الابتدائي الضامة البشرية المعزولة أصيبوا مع زيكف وحدها أو الخلائط سيرا زيكف. () DENV1 الأمصال المحتوية على الأجسام المضادة. (ب) DENV2 الأمصال المحتوية على الأجسام المضادة. (ج) DENV3 الأمصال المحتوية على الأجسام المضادة. (د) DENV4 الأمصال المحتوية على الأجسام المضادة. (ﻫ) جسم DENV الأمصال من الكولومبي 1 الفردية. (و) جسم DENV الأمصال من الكولومبي 2 الفردية. وتم قياس العدوى بتحليل PCR قرة في بوستينفيكشن ح 48. وقد فعلت replicates التقنية والبيولوجية في ثلاث نسخ. ويتم تجميع البيانات، وأشرطة الخطأ تشير إلى الانحراف المعياري. الطالب t-واستخدمت ANOVA واختبار للتحليل الإحصائي. ف < 0.001. لقد تم تعديل هذا الرقم من لوندونو-رينتيريا et al.8. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
الجدول 1: الشخصية الحرارية لبكر قرة.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
وقد أعاق ه DENV الأجسام المضادة مما يؤدي إلى ADE اللقاح DENV الأخرى تطوير لقاح فعال11. وينتمي إلى نفس العائلة، فيروسات مصفرة، زيكف التماثل كبير مع فلافيفيروسيس الأخرى، لا سيما DENV12. والهدف الرئيسي لتحييد الأجسام المضادة لكل من زيكف و DENV هو البروتين المغلف، الذي أسهم التماثل تسلسل الهيكلي ورباعي عالية جداً بين الفيروسات اثنين13،،من1415. وقد ثبت أن الحصانة قبل أن DENV أو زيكف يمكن أن يعزز انتقال العدوى إلى سائر الفيروسات8،16.
وهناك عدد من الطرق المختلفة المستخدمة لقياس العدوى الفيروسية في تجارب ADE، بدءاً من اللوحة فحوصات17، وتلطيخ مستضد الفيروسية داخل الخلايا باستخدام الأجسام المضادة مترافق مع الأصباغ الفلورية، والتدفق الخلوي18 ،19. هذه الاختبارات مضيعة للوقت ولا يمكن تكييفها بسهولة للفائق لعينات متعددة في نفس الوقت. الأهم من ذلك، معظم الدراسات التي تستخدم مونوكلونل DENV على حدة للتحقق من أثرها على زيكف ودرست ADE في الخلية خطوط فقط20،21. في هذا البروتوكول، يصف لنا طريقة بسيطة لكنها فعالة التي كنا عينات المصل المناعي قبل البشرية التي لها قدرة تحييد ضد DENV، جنبا إلى جنب مع الخلايا المناعية البشرية الأساسية، لدراسة تأثير المصل المريض على زيكف النسخ المتماثل باستخدام قرة--PCR. هذا الأسلوب هو قوية وذات الصلة، ويمكن أن تكتمل في غضون ثلاثة أيام. على الرغم من أن تظهر النتائج الممثلة في هذه المخطوطة طلبها للحصول على زيكف، هذا البروتوكول يمكن بسهولة تعديل واستخدامها لغيرها flaviviruses، مثل فيروس الحمى الصفراء وفيروس حمى الضنك وفيروس غرب النيل. واحد العوامل الهامة للنظر أن هذا البروتوكول له قيد في التمييز بين الرنا الفيروسي ناضجة وغير ناضجة.
خلال البروتوكول، من الأهمية بمكان تنظر بعناية عند القيام باستخراج الحمض النووي الريبي، ضمان أن البيئة خالية من رناسي خلال جميع الجيش الملكي النيبالي التعامل مع الخطوات. وعلاوة على ذلك، ينبغي أن الأرصدة الفيروسية مذاب في 37 درجة مئوية في حمام مائي لمدة 1-2 دقيقة وفورا على الجليد. غير أن الفيروس لا يوضع على الجليد لفترة طويلة ك، آنذاك، أنه يمكن أن يفقد العدوى.
وقد أظهرت نتائج السابقة أن هذا البروتوكول هو مريحة للغاية وقابلة للتكيف للتعامل مع عدد كبير من العينات، ويمكن أن تكتمل في وقت أقل نسبيا من أساليب أخرى. هذا البروتوكول لديه القدرة على استخدامها مقايسة مفيدة للدراسات المستقبلية ADE.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
الكتاب ليس لها علاقة بإعلان.
Acknowledgments
وأيد هذا العمل سخاء 1R21AI129881-01 (إلى وماستريخت)، وأموال بدء التشغيل من الوطني المختبرات الأمراض المعدية الناشئة، وفي كلية الطب بجامعة بوسطن.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Fetal Bovine Serum | GEMINI | 100-106 | |
| iCycler | BioRad | 785BR02188 | Model No. CFX96 Optics Module |
| Microfuge 18 Centrifuge | Beckman Coulter | 367160 | |
| Nanodrop-1000 | Thermoscientific | 1072 | |
| Quantifast SYBR-One step RT-PCR kit | Qiagen | 204154 | Used for 1 step RT-qPCR |
| RNeasy RNA Isolation Kit | Qiagen | 74106 | Used for RNA extraction |
| RPMI-medium | Gibco | 11875093 |
References
- Hayes, E. B. Zika virus outside Africa. Emerging Infectious Diseases. 15, 1347-1350 (2009).
- Grard, G., et al. Zika virus in Gabon (Central Africa) - 2007: a new threat from Aedes albopictus. PLoS Neglected Tropical Diseases. 8 (2), 2681 (2014).
- Fauci, A. S., Morens, D. M. Zika Virus in the Americas--Yet Another Arbovirus Threat. New England Journal of Medicine. 374 (7), 601-604 (2016).
- Hawkes, R. A. Enhancement of the Infectivity of Arboviruses by Specific Antisera Produced in Domestic Fowls. Australian Journal of Experimental Biology and Medical Science. 42, 465-482 (1964).
- Musso, D., Gubler, D. J. Zika Virus. Clinical Microbiology Reviews. 29 (3), 487-524 (2016).
- Vaughn, D. W., et al. Dengue viremia titer, antibody response pattern, and virus serotype correlate with disease severity. The Journal of Infectious Diseases. 181 (1), 2-9 (2000).
- Khandia, R., et al. Modulation of Dengue/Zika Virus Pathogenicity by Antibody-Dependent Enhancement and Strategies to Protect Against Enhancement in Zika Virus Infection. Frontiers of Immunology. 9, 597 (2018).
- Londono-Renteria, B., et al. A relevant in vitro human model for the study of Zika virus antibody-dependent enhancement. Journal of General Virology. 98 (7), 1702-1712 (2017).
- Ganger, M. T., Dietz, G. D., Ewing, S. J. A common base method for analysis of qPCR data and the application of simple blocking in qPCR experiments. BMC Bioinformatics. 18 (1), 534 (2017).
- Renn, L. A., et al. High-throughput quantitative real-time RT-PCR assay for determining expression profiles of types I and III interferon subtypes. Journal of Visualized Experiments. (97), e52650 (2015).
- McArthur, M. A., et al. Dengue vaccines: recent developments, ongoing challenges and current candidates. Expert Review of Vaccines. 12 (8), 933-953 (2013).
- Priyamvada, L., et al. Humoral cross-reactivity between Zika and dengue viruses: implications for protection and pathology. Emerging Microbes and Infections. 6 (5), 33 (2017).
- Dai, L., et al. Molecular basis of antibody-mediated neutralization and protection against flavivirus. IUBMB Life. 68 (10), 783-791 (2016).
- Dai, L., et al. Structures of the Zika Virus Envelope Protein and Its Complex with a Flavivirus Broadly Protective Antibody. Cell Host & Microbe. 19 (5), 696-704 (2016).
- Sirohi, D., et al. The 3.8 A resolution cryo-EM structure of Zika virus. Science. 352 (6284), 467-470 (2016).
- George, J., et al. Prior Exposure to Zika Virus Significantly Enhances Peak Dengue-2 Viremia in Rhesus Macaques. Scientific Reports. 7 (1), 10498 (2017).
- Morens, D. M., Halstead, S. B. Measurement of antibody-dependent infection enhancement of four dengue virus serotypes by monoclonal and polyclonal antibodies. Journal of General Virology. 71, Pt 12 2909-2914 (1990).
- Dejnirattisai, W., et al. Cross-reacting antibodies enhance dengue virus infection in humans. Science. 328 (5979), 745-748 (2010).
- Priyamvada, L., et al. Human antibody responses after dengue virus infection are highly cross-reactive to Zika virus. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113 (28), 7852-7857 (2016).
- Charles, A. S., Christofferson, R. C. Utility of a Dengue-Derived Monoclonal Antibody to Enhance Zika Infection In Vitro. PLoS Currents. 8, (2016).
- Swanstrom, J. A., et al. Dengue Virus Envelope Dimer Epitope Monoclonal Antibodies Isolated from Dengue Patients Are Protective against Zika Virus. MBio. 7 (4), (2016).
