Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Genetics

Kardiyak hücre tedavisi için kök hücre DNA bütünlük değerlendirilmesi

Published: January 25, 2019 doi: 10.3791/58971
* These authors contributed equally

Summary

Burada, bir analiz DNA bütünlük içinde kök hücre hücre transplantasyonu önce değerlendirme için deneysel bir kurulumuna ilişkin ayrıntılı bir açıklama sağlamak.

Abstract

Kök ve kök hücre kaynaklı hücreler çeşitli dejeneratif hastalıklar için yenileyici bir terapi olarak büyük potansiyele sahip. DNA'sı, kök hücre de dahil olmak üzere tüm hücrelerdeki genetik veri depo ve bütünlüğünü rejeneratif kabiliyetini temelini oluşturur. Kök hücre nakli için gerekli numaraları elde laboratuvarlarında hızlı yayılma tabi. Hızlandırılmış hücre büyümesini reaktif oksijen, karbonil ve alkilleyici gibi birikmiş metabolitleri tarafından DNA bütünlük kaybına yol açar. Bu hücrelerin nakli zavallı engraftment ve rejenerasyon bozulan organ neden olur. Ayrıca, DNA zarar görmüş hücreleri yol açan mutasyonlar, DNA istikrarsızlık, hücresel yaşlanma dikim ve muhtemelen, hayatı tehdit edici hastalıkları kanser gibi. Bu nedenle, hücrenin uygunluğu nakli için değerlendirmek bir kalite kontrol yöntemi acilen ihtiyaç vardır. Burada, kök hücre hücre transplantasyonu önce DNA bütünlüğünü değerlendirilmesi için adım adım iletişim kuralları sağlar.

Introduction

Deneysel ve klinik kanıt hücre transplantasyonu orta hearts1,2,3,4,5 başarısız sol ventrikül contractile performansı artırabilir gösterir ,6,7,8,9. Son gelişmeler daha da çekici kardiyovasküler rejenerasyon için fırsatlar açtı; Bunlar somatik hücre Nanog teşvik ve bu indüklenmiş pluripotent kök hücreler (IPSC) farklı kalp soy, önemlisi cardiomyocyte (CM)10, ayırt etmek için programlama faktörlerin zorla ifade dahil 11 , 12 , 13. DNA yapay olarak oluşturulan iPSCs ve IPSC kaynaklı CM (IPS-CM), dahil olmak üzere her hücredeki kalıtsal malzemedir. DNA içinde depolanan genetik yönergeleri belirler büyüme, gelişme ve işlevi hücreler, dokular, organlar ve organizmalar. DNA etkisiz değil; metabolitleri, reaktif oksijen, karbonil ve azot türleri, gibi hücre ve alkilleyici neden DNA tüp bebek ve içinde vivo14,15,16,17zarar verebilir. Önemlisi, DNA hasarı sezgisel olarak önemli bir frekans ile her hücre oluşur. Bu zararlar düzeltilmez ise, bu DNA mutasyon, hücresel yaşlanma, DNA ve hücre bütünlüğü ve muhtemelen, hastalıklar, yaşamı tehdit eden kanser de dahil olmak üzere kaybına yol açacaktır. Bu nedenle, DNA bütünlüğünü koruyarak herhangi bir hücreye, özellikle klinikte çok büyük potansiyele sahip iPSCs, esastır.

Miktar ve izole genomik DNA bütünlüğünü değerlendirmek için pahalı aletler piyasada mevcuttur. Ancak, hücreleri izole olmadan hücrelerdeki DNA bütünlüğünü değerlendirmek için hiçbir basit ve maliyet-etkin yöntem vardır. Ayrıca, Kullanıcı kaynaklı DNA yıkımı sırasında DNA izolasyon Bu yöntemler kullanarak büyük dezavantaj biridir. Tek hücreli jel elektroforez (kuyruklu yıldız tahlil olarak da bilinir)18,19 ve γH2A.X immunolabeling8 araştırma laboratuarları ve DNA hasarı değerlendirmek için temel yaklaşımlar tekniklerdir. Bu iki yöntem pahalı ekipman veya DNA bütünlük8,20,21analiz etmek izole genomik DNA gerektirmez. Beri bu teknikleri içeren bütün hücreleri gerçekleştirilmiş; Kullanıcı kaynaklı DNA/RNA/protein yıkımı numune hazırlama sırasında bu iletişim kuralları etkilemez. Burada, DNA hasarı ve DNA hasarı yanıt kök ve kök hücre kaynaklı hücreler olarak değerlendirmek için kuyruklu yıldız tahlil ve γH2A.X immunolabeling gerçekleştirmek için adım adım protokolleri sağlamak. Ayrıca, bu iki yaklaşım birleştirerek, biz nakli için hücrenin uygunluğu değerlendirmek için kullanılan bir saf değerlendirme öneriyorum.

Kuyruklu yıldız tahlil veya tek hücre Elektroforez jel, hücrelerdeki DNA sonları ölçer. Düşük erime özel katıştırılmış hücreleri supercoiled DNA içeren formu nucleoids lysed. Bozulmamış DNA, onların büyük boyutu ve onların konjugasyon matris protein nedeniyle kısıtlı bir geçiş olacak ise Elektroforez özel gözenekler parçalanmış DNA ve kırık DNA iplikçikleri küçük parçalar geçirin. Bir floresan mikroskop altında lekeli DNA modeli taklit eden bir kuyruklu yıldız. Kuyruklu yıldız baş bozulmamış DNA içerir ve kuyruk parçaları oluşur ve kırık DNA dizilerini. DNA hasarı kısmını hasarlı DNA (kuyruklu yıldız kuyruk) Floresan yoğunluğu tarafından bozulmamış DNA (kuyruklu yıldız başı) yoğunluk göreli olarak ölçülebilir. Parametre kuyruk an Şekil 1' de gösterildiği gibi hesaplanabilir.

DNA hasarı fosforilasyon histon H2A nın neden olmaktadır. X (γH2A.X) Ser139 ATM, ATR ve DNA-PK kinazlar tarafından. Fosforilasyon ve H2A alımı. DNA kırılmalara X DNA hasarı yanıt (DDR) denir ve DNA hasar sonra hızla olur. Bu işlem, denetim noktası-aracılı hücre döngüsü tutuklama ve DNA onarım işlemleri başlatılır. DNA onarım başarıyla tamamlayan γH2A.X dephosphorylated ve fosfatazlar tarafından inaktive olur. Uzun süreli ve DNA ' γH2A.X foci birikimi için birden fazla DNA kırılmalara yol. Bu hücrenin DNA hasarı ve DNA bütünlüğü kaybı onarmak yetersizlik gösterir. DNA'daki bu γH2A.X foci belirlenebilir ve DDR foci sayısı 2 bölümünde iletişim kuralını kullanarak sayılabilir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. kuyruklu yıldız tahlil

  1. Reaktif hazırlık
    1. Düşük erime noktası özel için özel düşük erime 500 mg 100 mL DNA - yer / RNA ücretsiz su. Özel eriyene kadar fırın mikrodalga bir de şişe ısı. İhtiyaç kadar bir 37 ° C su banyosunda şişe yerleştirin.
      Not: Daha fazla okuma için Azqueta ve ark., özel toplama DNA gevşemek zaman ve birkaç Elektroforez faktörler23etkileri eğitimi görmek.
    2. SYBR yeşil DNA boya Tris-EDTA (TE) arabelleği 1:10,000 oranında hisse senedi boya çözüm çalışma x 1 edinmek için sulandırmak. Bu boya ışığa duyarlı, çok karanlık bir yerde saklayın.
    3. Hücre lizis arabellek için 100 mL lizis arabelleği dağıtılması (2.5 M NaCl, 0.1 M EDTA, 10 mM Tris, % 1 Triton X-100) deiyonize su (DI H2O). Daha sonra 10 M NaOH pH 10.0 için ayarlamak için ekleyin. Arabellek 4 ° c serin
    4. Alkali DNA-gevşemek/Elektroforez çalışan arabellek için 1 L DI H2O. serin arabellek 4 ° C'ye alkali çözeltinin (0.3 M NaOH, 1 mM EDTA) dağıtılması PH emin olun > 13.
    5. Precoated kuyruklu yıldız slaytlarını birkaç damla % 0.5 özel bir cam slayt üzerinde yerleştirin. Hemen, bir sonraki slayda düz yüzeyini kullanarak, özel kaplama ince bir tabaka oluşturmak için özel yayıldı.
      Not: Slaytları kullanmadan önce kuru.
    6. Confluency ulaşıncaya kadar IP'leri hücre kültürü için Bodrum-membran-matris-kaplı (bakınız Tablo reçetesi) kültür IP'leri hücrelerde mTESR1 kültür orta levha kısaca kültür.
      Not: İnsan-kalp-fibroblast-türetilmiş IP'leri hücreleri bu protokol için kullanılmıştır. IPS hücre türetme ve kültür koşulları yeniden programlama Son Makaleler Gönderen bizim araştırma grubu12,13,21açıklanmıştır.
  2. Numune hazırlama
    1. Kültür orta atın ve hücreleri yıkayın. Dekolmanı çözüm kullanarak hücreleri ayırmak ( Tablo malzemelerigörmek). Hücre Pelet fosfat tamponlu tuz çözeltisi (PBS) ile yıkama ve PBS hücrelerde 1 x 105 hücre/mL, resuspend.
  3. Örnek slayt hazırlama
    Not: Düşük ışık koşullarında ultraviyole ışık bağlı hücre hasarı önlemek için aşağıdaki adımları uygulayın.
    1. Mix 10 μL hücre süspansiyon ve özel çözüm 90 μL (1:10 oranı) bir tüp. Tüp güçlendirilerek üzerinden özel önlemek için 37 ° C su banyosu yerleştirin.
    2. Hava kabarcıkları tanıtımı olmadan çözüm mix ve 70 μL/spot precoated kuyruklu yıldız slayda pipet. Pipet Ucu kullanarak, ince bir tabaka oluşturmak için hücre özel karışımı spread. Slayt 4 ° C'de 15 dakika yerleştirin.
    3. Bir kap içinde tamamen soğuk lizis arabelleği slayt daldırın. 1s için 4 ° C'de karanlıkta konteyner yerleştirin.
    4. Lizis arabellek soğuk alkalin çözüm ile değiştirin. Slaytları tamamen sular altında emin olun. Kapsayıcı için 30 dk 4 ° C'de karanlık bir yer.
  4. Elektroforez
    1. Slaydı bir yatay Elektroforez tankı yerleştirin. Tank ile soğuk alkalin Elektroforez tampon dolduramazsınız slaytları tamamen sular altında. 1 V/cm için 15-30 dakika gerilim uygulanır.
      Not: Toplam gerilim elektrotlar x 1 V arasındaki mesafe =
    2. Bir kap içinde tamamen soğuk DI H2o slayt daldırın 2 dakika sonra DI H2O kaldırın ve taze DI H2O. tekrar bu adımı ekleyin.
    3. DI H2O soğuk % 70 etanol ile değiştirin. Yavaşça 5 dk. bekleyin slayt kaldırmak değil tilt ve izin kuruması.
    4. Bir kez kuru, seyreltilmiş DNA boya 100 μL her noktaya ekleyin. Oda sıcaklığında 15 dakika bekleyin. FITC filtre bir epifluorescence mikroskop kullanarak, toplam örnek başına 50-100 kuyruklu yıldızlar görüntülerini alın.
  5. Görüntü analizi ve hesaplama sonuçları
    1. Kuyrukluyıldızlar Puanlama için Ulusal Sağlık Enstitüleri'nın (NIH) kullanmak ImageJ kuyruklu yıldız tahlil eklentisi ile (ImageJ buradan indirebilirsiniz: https://imagej.nih.gov/ij/download.html; download eklenti burada: https://www.med.unc.edu/microscopy/resources/imagej-plugins-and-macros/comet-assay/).
      Not: Eklenti çözümlemeyi gerçekleştirmek için tüm ayrıntıları içeren bir PDF yönergesi ile gelir. Ayrıca, ekran kuyruklu yıldız analiz Şekil 2A-Cile gösterilir. Denetim ve doksorubisin (Doxo) temsilcisi kuyruklu yıldız görüntüleri-tedavi IP'leri hücreleri ve kuyrukluyıldızlar miktar Şekil 3A-Cile gösterilir.

2. DNA hasarı yanıt

  1. Örnek ve reaktif hazırlık
    1. Bir IPS-CM hücre kültürü kültür IPS-CM RPMI orta confluency sonuna kadar B-27 (CMM) ile desteklenmiş kültür levha Bodrum-membran-matris-kaplı (bakınız Tablo reçetesi) hücreleri.
      Not: Cardiomyocytes insan-IPS-hücre kaynaklı bu protokol için kullanılmıştır. Cardiomyocytes içine IP'leri hücre farklılaşması için protokol Son Makaleler Gönderen bizim araştırma grubu12,13,21bulunabilir.
    2. IPS-CMs odası slaytlarında tohum.
      1. IPS-CM wells kültür ortamından atmak. Hücreleri üç kez PBS ile yıkayın.
      2. 1 mL % 0.25 tripsin iyi ücret ekleyin ve 5 dk. onay plaka hücre dekolmanı için mikroskop altında 37 ° C'de kuluçkaya. CMM tripsin durdurmak için 1 mL ekleyin.
      3. 15 mL tüp ve santrifüj 4 ° C ve 200 x g5 min için hücre süspansiyon yeri. Orta atın, CMM 1 mL ekleyin ve hücreleri resuspend. Hücreleri saymak ve hücre sayısı 20 x 105 hücreleri CMM 1.6 ml elde etmek için ayarlayın.
      4. Tohum hücre süspansiyon 8-şey odası kuyu başına 200 µL slayt ( Tablo malzemelerigörmek). Yavaşça hücrelerin kuyunun etrafında yaymak ve 37 ° C'de kuluçkaya slayt dokunun
    3. IPS-CM doksorubisin tedavisi için IPS-CM wells kültür ortamından atmak. PBS hücrelerle yıkayın. 1 mikron doksorubisin hücrelerle tedavi ve CMM 4 h için orta Aspire edin ve PBS hücrelerle yıkayın.
    4. Engelleme arabellek için 10 mL % 3 BSA ve % 0.05 içeren Sığır serum albumin (BSA) çözeltisi hazırlamak Triton X-100. Engelleme arabellek 10 mL hazırlamak için 1 mL normal eşek serum 9 mL için hazırlanan BSA çözeltisi ekleyin.
    5. Birincil antikor çözüm için anti-tavşan Fosfo-histon H2A 1 μL ekleyin. X 200 μL engelleme arabelleği (Ser139) antikor.
    6. İkincil antikor karıştırmak için anti-tavşan ikincil antikor fluorochrome Birleşik, DAPI ve fluorochrome Birleşik phalloidin her 1 μL engelleme arabellek 200 μL için ekleyin.
  2. Immunolabeling
    1. Hücreleri üç kez PBS ile yıkayın ve taze hazırlanmış %4 paraformaldehyde (PFA) 200 μL her şey için ekleyin. İçinde belgili tanımlık karanlık oda sıcaklığında 20 dk için hücreleri tamir. PBS hücrelerle yıkayın.
    2. PBS kaldırın ve oda sıcaklığında bir oksijen odasında engelleme arabelleği bloğu için 30 dakika başı iyi 200 μL ekleyin. Engelleme arabellek kaldırın ve 200 μL birincil antikor çözüm ekleyin. Oda sıcaklığında bir karanlık, oksijen odasında 45 dk için kuluçkaya. Sonra wells üç kez PBS ile yıkayın.
    3. PBS kaldırın ve 200 μL ikincil antikor karışımı ekleyin. Oda sıcaklığında bir karanlık, oksijen odasında 45 dk için kuluçkaya. Sonra wells üç kez PBS ile yıkayın. DI H2ile O antifade ile montaj önce yıkayın. Bir coverglass yerleştirin ve 4 ° C'de karanlıkta slaytları depolama
    4. Bir epifluorescence mikroskop kullanarak, Şekil 4Agörüldüğü gibi örnek başına rastgele alanlarının 3-5 fotoğraf çekmek ve görüntü analizi için devam edin.
  3. DDR foci sayma
    1. Karşıdan yükleyip CellProfiler24 (http://cellprofiler.org).
    2. Not: Görüntü işleme Bu çalışmada CellProfiler sürüm 2.1.1 kullanılarak gerçekleştirildi. Kullanılan eğitim CellProfiler için başka bir yerde bulunabilir (https://www.youtube.com/watch?v=PvhRL9xpduk & listesi PL7CC87670239B4D10 =). CellProfiler daha yeni bir sürümü kullanılıyorsa, boru hattı küçük uyarlamalar gerektirebilir.
    3. Boru hattı punctae_gH2AX.cpipeindirin. Dosyayı seçin > içe aktar > boru hattı üzerinden dosya ve punctae_gH2AX.cpipeseçin.
    4. Sürükle ve bırak γH2A.X foci Analizi (Şekil 5A) için Giriş modülleri/resimlerini bölümündeki dosya listesi penceresine alınan görüntüleri içeren klasör. Sonra Şekil 5A-Liçinde gösterildiği gibi yönergeleri izleyin.
    5. Görüntüler için aşağıdaki parametreleri ayarlayın:
      1. İstenen görüntü analizi için dosya listesiüzerine sürükleyin. Giriş modülleri' in altında görüntüleri seçin (bkz: Şekil 5A modülü ayarları). Giriş modülleri meta verileri seçin (bkz: Şekil 5B modülü ayarları). NamesAndTypes giriş modülleriseçin (bkz: Şekil 5C modülü ayarları).
      2. Gruplariçin yokseçin. ColorToGray analiz modülleriseçin (bkz Şekil 5 d modülü ayarlarını için).
    6. Analiz modülleri, pürüzsüz seçin (bkz: Şekil 5E modülü ayarları).
      Not: Bu değer, görüntü çözünürlüğüne bağlı olarak en iyi duruma getirilmiş gerekir.
    7. IdentifyPrimaryObjects analiz modülleriseçin (bkz: Şekil 5F modülü ayarları).
      Not: Bu değerler tüm çekirdeği seçili olduğundan emin olun en iyi duruma getirme. Bu adımdan sonra bilgisayar gecikme.
    8. Analiz modülleri, pürüzsüz seçin (bkz: Şekil 5G modülü ayarları).
      Not: Bu değer, görüntü çözünürlüğüne bağlı olarak en iyi duruma getirilmiş gerekir.
    9. EnhanceOrSuppressFeatures analiz modülleriseçin (bkz Şekil 5 H için modülü ayarları).
    10. IdentifyPrimaryObjects analiz modülleriseçin (bkz: Şekil 5I modülü ayarları).
      Not: Bu değerler punctae seçilir emin olmak için en iyi duruma getirme. Bu adımdan sonra bilgisayarı yeniden gecikme.
      1. RelateObjects analiz modülleriseçin (bkz: Şekil 5J modülü ayarları). ClassifyObjects analiz modülleriseçin (bkz Şekil 5 K modülü ayarları için). ExportToSpreadsheet analiz modülleriseçin (bkz Şekil 5 L modülü ayarları için).
      2. Analiz görüntüleri görüntü analizi gerçekleştirmek için alt sol panelde'ı tıklatın. Çözümleme başarılı bitiminde, birkaç görüntü oluşturulur (Şekil 6A-F).
        Not: Kullanıcılar bu görüntüleri daha sonra başvurmak için kaydetmeniz gerekir.
      3. Oluşturulan ve kaydedilen bilgisayarda uygun yerde daha fazla çözümleme için nicel veri içeren .csv dosyası unutmayın. MyExpt_Imageolarak adlandırılan elektronik tabloda sütun B ve D beş ve daha fazla punctae için sırasıyla sahip çekirdeklerin numarasına sahip olacaktır. B ve D çekirdekleri toplam sayısını elde etmek için sütun ekleyin.
    11. 2.3.3 - 2.3.8 tüm görüntüler (her analiz önce MyExpt_ dosya adını değiştirmek) için adımları yineleyin. Araziler DNA bütünlüğü, değerlendirmek için Şekil 4 ciçinde gösterildiği gibi yapılabilir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

İnsan indüklenmiş pluripotent kök hücreler kültürlü ve DNA bütünlüğü bir ölçüsü olarak kullanılan, DNA hasarı ve kuyruk an, kuyruklu yıldız tahlil tarafından analiz edildi. IPS hücreleri düşük erime noktası özel içinde gömülü ve bir cam slayt üzerinde yerleştirilir. Hücreleri sonra supercoiled DNA elde etmek için alkali bir çözüm tarafından takip lizis arabellek ile tedavi edildi. Nucleoids electrophoresed ve kuyruklu yıldızlar DNA boya (Şekil 1A-B) tarafından görüntülenmiştir. Kuyrukluyıldızlar, kuyruklu yıldız tahlil eklentisi (Şekil 2A-C) kullanarak ImageJ ile analiz edildi.

İnsan IP'leri hücreleri DNA hasar ikna etmek ve olumlu bir denetim olarak kullanılmak üzere Doxo ile tedavi edildi. Doxo tedavi ve nontreated IPS hücrelerden kuyruklu yıldızlar temsilcisi filmler Şekil 3Aiçinde gösterilir. DNA hasarı bazal bir miktarda DNA hasarı ve kuyruk an gösterilen IP'leri hücrelerdeki bulundu. Ancak, tedavi IPS hücrelerdeki DNA hasar arttı Doxo (Şekil 3BC) bekleniyor. Bu kuyrukluyıldız tahlil DNA bütünlük somatik hücre18,19 sadece da pluripotent kök hücreler21değerlendirmek için kullanılabileceğini gösterir.

Taze IP'leri cardiomyocytes (IPS-CMs), IPS-CMs için 6 ay (uzun süreli kültür [PC]) ve IPS-CMs Doxo ile tedavi γH2A.X immunolabeling tabi tutuldu kültürlü farklı. γh2a.x immunolabelling temsilcisi filmler Şekil 4A (alt-büyütme) ve Şekil 4B (daha yüksek büyütme) gösterilir. γh2a.x resimde (DDR foci) sayısı (punctae) her çekirdeğinde sayılabilir, CellProfiler ile özel potansiyel satış ölçü birimi (Şekil 5A-L) kullanarak. γh2a.x için pozitif hücrelerinin yüzde sıfır olarak beş punctae ile çekirdek ve çekirdek 10'dan fazla punctae ile sınıflandırılır. Denetim IPS-CM, hücreleri daha fazla % 90 daha az beş DDR foci çekirdek başına vardı ve hücrelerin % 10'dan daha az toplam altı DDR foci çekirdeği (Şekil 4 c, denetim [Ctrl]) başına vardı. IPS-CMs için 6 ay kültürlü Doxo tedavi IPS-CM les hücrelerle % 80'den az gösterdi, ancak çekirdek başına beşten az DDR foci hücrelerle % 90 ve hücreleri % 13'den fazla toplam altı DDR foci çekirdeği (Şekil 4 c, PC), başına daha az vardı çekirdek başına beş DDR foci daha s ve hücreleri yaklaşık % 24 Toplam altı DDR foci çekirdeği (Şekil 4 c, Doxo) başına vardı. Bu veri açıkça uzun süreli hücre kültürü ve Doxo tedavi IPS-CMs önemli DNA hasarına neden ve hücre transplantasyonu için uygun değildir gösterir.

Figure 1
Şekil 1: kuyruklu yıldız testin şematik. (B) ve(a)karışım hücre süspansiyon ile düşük erime noktası özel bir cam slayt üzerinde yerleştirin. (C) hücre lizis arabelleği, supercoiled DNA içeren nucleoids almak için alkali bir çözüm tarafından takip ile tedavi. (D) Electrophorese ve SYBR yeşil DNA boya kullanarak DNA leke. (E) şeması sağlam (sol) ve hasarlı DNA (sağ, kuyruklu yıldız şekli). (F) bir kısmını DNA hasarı ve kuyruk an hesaplamak için formül. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 2
Resim 2: ImageJ tarafından DNA hasarı ve kuyruk an quantification. (A-C) Ekran görüntüleri, ImageJ, kuyruklu yıldız baş ve kuyruk yelpazesi gösterilen kuyruklu yıldız analiz eklentisi ile. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 3
Şekil 3: doksorubisin insan IP'leri hücrelerdeki DNA hasarı indükler. (A) DNA hasarı doksorubisin tedavi (Doxo) ve nontreated (kontrol) IP'leri hücreleri, kuyruklu yıldız tahlil kullanılarak analiz. (B) kesir DNA hasar (n = 3) ve (C) kuyruk an (n = 63 kuyruklu yıldızlar) kuyruklu yıldız tahlil kullanarak sayılabilir. Doksorubisin, DNA enterkalasyon bir ajan ile tedavi DNA an hasar ve kuyruk kısmını IP'leri hücrelerdeki önemli ölçüde arttı. Veri anlamına gelir ± SEM vardır *P < 0,05, öğrenci unpaired t-test. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 4
Şekil 4: DNA hasarı yanıt olarak IP'leri türetilmiş cardiomyocytes. γh2a.x ayirt doksorubisin tedavi (Doxo) ve nontreated (kontrol) IPS-cardiomyocytes ile tanımlanan hem de uzun süredir devam eden (A) DNA hasar yanıt marker kültür IPS-cardiomyocytes (PC). DNA hasarı IP'leri içinde sitelerdeki etiketleme (B) daha yüksek büyütme γH2A.X (yeşil punctae)-in CMs. (C) miktar DDR foci, CellProfiler ile özel potansiyel satış ölçü birimi kullanılarak analiz. Veri anlamına gelir ± SD vardır; n = 3-4. P < 0,05, öğrenci unpaired t-test. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 5
Şekil 5: CellProfiler göre DNA hasarı yanıt analiz otomatik. (A-L) CellProfiler ekran görüntüleri ve otomatik kimlik ve γH2A.X punctae IP'leri içinde miktar almak için belirtilen ayarları ile-CMs. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 6
Şekil 6: CellProfiler göre DNA hasarı yanıt analiz otomatik. (A-F) Görüntü analizi bitiminde CellProfiler tarafından oluşturulan veri görüntüler. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

DNA bütünlük hücre bütünlük canlandırıyor. Hücreler hasarlı DNA ile sık sık stres vardır ve sonunda kendi bütünlüğünü kaybetmek. Kök ve nakli amacıyla yayılır kök hücre kaynaklı hücreler hücreleri onların istenen işlevi gerçekleştirmek asıl dürüstlüktür. Hasarlı DNA içeren hücrelerin nakli bir zavallı engraftment hızı ve performansı cep8,20neden olacaktır. Bu nedenle, hücre transplantasyonu önce DNA bütünlük inceleyerek gerekli kalite denetimi iletişim kuralı. Burada iki düşük maliyetli yaklaşım, DNA hasarı ve kök ve kök hücre kaynaklı hücreler kalitesini değerlendirmek için etiketleme yani kuyruklu yıldız tahlil ve γH2A.X ayirt açıklayın.

Önemli bir nedeni, hücresel yaşlanma hücrelerdeki DNA hasarı birikimi olduğu düşünülmektedir. Kuyruklu yıldız tahlil kullanılarak, Al-Baker ve ark. DNA hasarı genç ve senescent insan dermal fibroblastlar22analiz. Daha önce biz bu nakli DNA Kardiyak hasar-Alerjik göstermiştir p53 transgenik fareden izole progenitör hücrelerin ana organ8engraftment oranı arttı. Son zamanlarda, biz DNA hasarı tamir mekanizmaları insan IP'leri hücreleri21p53 transactivation etki alanı rolünü göstermiştir. Her iki çalışmalarda her ikisi de metodolojileri kök hücrelerde DNA zarar değerlendirmek için etiketleme kuyruklu yıldız tahlil ve γH2A.X ayirt istihdam. Her iki yöntem maliyet-etkin ve temel laboratuar ekipmanları ile gerçekleştirilebilir. Biz kez deneyimli bir sinir bozucu kritik pipet ve tüpler özel güçlendirilerek sorundur. Bu sorun tüm tüpler ve ipuçları önce pipetting özel prewarming tarafından üstesinden gelmek. Kuyruklu yıldız tahlil 2 gün sürer iken, en iyi duruma getirilmiş γH2A.X ayirt etiketleme yordamı altında 4 h içinde tamamlanabilir.

İnsan IP'leri hücre kültürleri ile fazla % 10 DNA hasarı, kuyruklu yıldız tahlil tarafından ölçülen verimli bir şekilde cardiomyocytes (veri gösterilmez) vitro ayırt etmek değil. Kuyruklu yıldız tahlil hassas ve dinamik DNA hasarı kök hücre içinde değerlendirirken. Ancak, DNA bütünlük değerlendirmeler IP'leri türetilmiş cardiomyocytes gibi belirli hücrelerdeki kuyruklu yıldız tahlil hücreleri doğası gereği tarafından hantal vardır. Cardiomyocytes troponin, sarcomeric proteinler ve salgılanan hücre dışı matriks proteinleri ile zenginleştirilmiş. Denaturing supercoiled yapmak için bu karmaşık yapılar DNA ve onun tekrarlanabilirlik sorgulanabilir. En önemlisi, insan cardiomyocytes, % %25 40 binucleated25vardır ve bu yüzdeleri IP'leri türetilmiş cardiomyocytes değişir. Hücre duvarı kuyruklu yıldız tahlil bozulur beri hücreleri DNA hasar yüzdesi kesin değerlendirilmesi mümkün değildir. Bu nedenle, IPS-CMs durumunda DNA zarar değerlendirmek için γH2A.X ayirt etiketleme kuyruklu yıldız tahlil için basit bir alternatif işlemdir.

Fazla % 10 ise bu sonuçlar ve bu önceki yayınlardan tarafından grup8,20,21dayanarak, biz, önermek kuyruklu yıldız tahlil veya hücreleri % 90 daha az tarafından değerlendirilen DNA hasar var sıfır beş DDR olarak resimde, sonra kültür hücre transplantasyonu için diskalifiye edilmelidir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Yazarlar ifşa gerek yok.

Acknowledgments

Bu eser kısmen Ulusal Kalp, akciğer ve kan Enstitüsü hibe RO1-HL-99507, tarafından desteklenmiştir HL-114120, HL-131017, HL138023 ve UO1-HL-134764 (için J. Zhang) ve Amerikan Kalp Derneği bilimsel gelişme Grant 17SDG33670677 (için R. Kannappan) tarafından.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
0.25% Trypsin Corning 25200056
8-well chamber slide Millicell PEZGS0816
Accutase Stemcell Technologies 7920 Cell detachment solution
Alexa Fluor 488 AffiniPure
Donkey Anti-Rabbit IgG
Jackson Immuno
Research Laboratories
711-545-152
(RRID: AB_2313584)
Bovine Serum Albumin Sigma-Aldrich A7906
Cy3 AffiniPure Donkey Anti-Rabbit IgG Jackson Immuno
Research Laboratories
711-165-152
(RRID:AB_2307443)
DAPI Sigma-Aldrich D9564
Gibco B-27 Supplement, Serum Free, Gibco 17504-044
Matrigel growth factor reduced Corning 354230
mTeSR1 Stemcell Technologies 85850
PhalloidinA488 Life Technology A12379
Phospho-Histone H2A.X (Ser139) Antibody Cell Signaling Technology 2577 (RRID: AB_2118010)
RPMI Gibco 11875-093
SYBR Green I nucleic acid gel stain Sigma-Aldrich S9430
Triton X-100 Fisher scientific BP151-100
UltraPure Low melting Point Agarose Invitrogen 16520050
Vectashield Vector Laboratories H-1000 Antifade

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Bolli, R., et al. Cardiac stem cells in patients with ischaemic cardiomyopathy (SCIPIO): initial results of a randomised phase 1 trial. The Lancet. 378 (9806), 1847-1857 (2011).
  2. Makkar, R. R., et al. Intracoronary cardiosphere-derived cells for heart regeneration after myocardial infarction (CADUCEUS): a prospective, randomised phase 1 trial. The Lancet. 379 (9819), 895-904 (2012).
  3. Tomita, Y., et al. Cardiac neural crest cells contribute to the dormant multipotent stem cell in the mammalian heart. Journal of Cell Biology. 170 (7), 1135-1146 (2005).
  4. Oyama, T., et al. Cardiac side population cells have a potential to migrate and differentiate into cardiomyocytes in vitro and in vivo. Journal of Cell Biology. 176 (3), 329-341 (2007).
  5. Fischer, K. M., et al. Enhancement of myocardial regeneration through genetic engineering of cardiac progenitor cells expressing Pim-1 kinase. Circulation. 120 (21), 2077-2087 (2009).
  6. Cottage, C. T., et al. Cardiac progenitor cell cycling stimulated by pim-1 kinase. Circulation Research. 106 (5), 891-901 (2010).
  7. Angert, D., et al. Repair of the injured adult heart involves new myocytes potentially derived from resident cardiac stem cells. Circulation Research. 108 (10), 1226-1237 (2011).
  8. Kannappan, R., et al. p53 Modulates the Fate of Cardiac Progenitor Cells Ex vivo and in the Diabetic Heart In vivo. EBioMedicine. 16, 224-237 (2017).
  9. Hatzistergos, K. E., et al. Bone marrow mesenchymal stem cells stimulate cardiac stem cell proliferation and differentiation. Circulation Research. 107 (7), 913-922 (2010).
  10. Okita, K., Yamanaka, S. Induced pluripotent stem cells: opportunities and challenges. Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences. 366 (1575), 2198-2207 (2011).
  11. Zhang, J., et al. Functional cardiomyocytes derived from human induced pluripotent stem cells. Circulation Research. 104 (4), e30-e41 (2009).
  12. Ye, L., et al. Cardiac repair in a porcine model of acute myocardial infarction with human induced pluripotent stem cell-derived cardiovascular cells. Cell Stem Cell. 15 (6), 750-761 (2014).
  13. Zhang, L., et al. Derivation and high engraftment of patient-specific cardiomyocyte sheet using induced pluripotent stem cells generated from adult cardiac fibroblast. Circulation: Heart Failure. 8 (1), 156-166 (2015).
  14. Hirakawa, K., Midorikawa, K., Oikawa, S., Kawanishi, S. Carcinogenic semicarbazide induces sequence-specific DNA damage through the generation of reactive oxygen species and the derived organic radicals. Mutation Research. 536 (1-2), 91-101 (2003).
  15. Martinez, G. R., et al. Oxidative and alkylating damage in DNA. Mutation Research. 544 (2-3), 115-127 (2003).
  16. Valko, M., Rhodes, C. J., Moncol, J., Izakovic, M., Mazur, M. Free radicals, metals and antioxidants in oxidative stress-induced cancer. Chemico-Biological Interactions. 160 (1), 1-40 (2006).
  17. Wiseman, H., Halliwell, B. Damage to DNA by reactive oxygen and nitrogen species: role in inflammatory disease and progression to cancer. Biochemical Journal. 313 (Pt 1), 17-29 (1996).
  18. Ostling, O., Johanson, K. J. Microelectrophoretic study of radiation-induced DNA damages in individual mammalian cells. Biochemical and Biophysical Research Communications. 123 (1), 291-298 (1984).
  19. Singh, N. P., McCoy, M. T., Tice, R. R., Schneider, E. L. A simple technique for quantitation of low levels of DNA damage in individual cells. Experimental Cell Research. 175 (1), 184-191 (1988).
  20. Goichberg, P., et al. Age-associated defects in EphA2 signaling impair the migration of human cardiac progenitor cells. Circulation. 128 (20), 2211-2223 (2013).
  21. Kannappan, R., Mattapally, S., Wagle, P. A., Zhang, J. Transactivation domain of p53 regulates DNA repair and integrity in human iPS cells. American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology. , (2018).
  22. Al-Baker, E. A., Oshin, M., Hutchison, C. J., Kill, I. R. Analysis of UV-induced damage and repair in young and senescent human dermal fibroblasts using the comet assay. Mechanisms of Ageing and Development. 126 (6-7), 664-672 (2005).
  23. Azqueta, A., Gutzkow, K. B., Brunborg, G., Collins, A. R. Towards a more reliable comet assay: optimising agarose concentration, unwinding time and electrophoresis conditions. Mutation Research. 724 (1-2), 41-45 (2011).
  24. Carpenter, A. E., et al. CellProfiler: image analysis software for identifying and quantifying cell phenotypes. Genome Biology. 7 (10), R100 (2006).
  25. Paradis, A. N., Gay, M. S., Zhang, L. Binucleation of cardiomyocytes: the transition from a proliferative to a terminally differentiated state. Drug Discovery Today. 19 (5), 602-609 (2014).

Tags

Genetik sayı 143 DNA bütünlüğü DNA hasarı IPS hücreleri kuyruklu yıldız tahlil γH2A.X cardiomyocytes hücre transplantasyonu
Kardiyak hücre tedavisi için kök hücre DNA bütünlük değerlendirilmesi
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Miller, J. M., Mardhekar, N. M.,More

Miller, J. M., Mardhekar, N. M., Rajasekaran, V., Zhang, J., Kannappan, R. Assessing Stem Cell DNA Integrity for Cardiac Cell Therapy. J. Vis. Exp. (143), e58971, doi:10.3791/58971 (2019).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter