Summary
인간 유두종 바이러스(HPV) RNA 염색체는 종양 내의 활성 인간 유두종 바이러스 감염 검출에 대한 금 기준 중 하나로 간주된다. 그것은 그것의 신호의 현지화 그리고 반정적인 평가를 가진 HPV E6-E7 mRNA 발현의 가시화를 허용합니다.
Abstract
인간 유두종 바이러스 (HPV) 감염은 구인두 편평 상피 세포 암종 (OPSCC)의 특수형에 대한 주요 위험 인자이며, 이는 알코올 및 담배 관련 OPSCC보다 더 나은 결과와 연관되는 경향이 있습니다. HPV 바이러스 RNA의 체질 성 하이브리드화(CISH)에서 발색성 은 좋은 공간 분해를 가진 종양 발생 단백질 E6 및 E7의 바이러스 성 전사체의 반정적 평가를 허용할 수 있었다. 이 기술은 종양 HPV 감염 세포에 있는 HPV 전사의 가시화를 가진 액티브한 감염의 진단을 허용합니다. 이 기술의 장점은 종양에 인접한 비신생 HPV 감염 세포로부터의 오염을 피하는 것입니다. 전반적으로, 그것의 좋은 진단 성과는 액티브한 HPV 감염 확인을 위한 금 본위제로 여겨진. E6 및 E7 바이러스 성 단백질 세포 단백질 pRb 및 p53세포 변환에 필수적이기 때문에, HPV RNA CISH는 기능적으로 관련성이 있고 활성 종양 발생 성 HPV 감염을 심각하게 반영합니다. 이 기술은 HPV 관련 p16 양성 두경부 암 환자 중 2개의 예후 그룹의 식별을 도왔기 때문에 "낮음" 또는 "높은" HPV 전사 수준이 임상적으로 관련이 있다. 여기서 우리는 제조사로부터 얻은 키트와 함께 포르말린 고정 파라핀 임베디드(FFPE) 슬라이드에서 수행된 수동 HPV RNA CISH에 대한 프로토콜을 제시한다. 염색체 계시 대신에, 체형 혼성화에 있는 RNA는 또한 형광 계시 (RNA FISH)로 수행될 수 있습니다. 또한 통상적인 면역염색과 결합될 수 있다.
Introduction
HPV RNA CISH는 구로두또는 자궁 경부와 같은 다양한 위치에서 양성 또는 악성 병변에서 결정적인 역할을 할 수 있는 활성 HPV 감염의 검출을 위한 강력한 도구입니다. 활성 HPV 감염의 검출은 HPV 유도병변의 진단을 지원하고, 그로 인하여, 그것의 처리 및 예후에 영향을 미칠 수 있습니다.
HPV는 가장 빈번한 성병 감염이고, 100개 이상의 바이러스성 유전자형은 1. 개략적으로, 유전자형 6 및 11과 같은 저위험 유전자형은 생식기 사마귀, 재발성 호흡 유두종증 및 그밖 양성 병변을 유도하기 위하여 알려집니다, 반면 유전자형 16와 18와 같은 고위험 유전자형은 대부분의 자궁 경관암을 책임 집니다 및 항문암은 지역역학자료에 의해 고려되는 바와 같이 가변적인 비율로 HNSCC 종양발생에서 역할을 한다2.
HPV 감염의 검출을 위해 몇몇 공구는 유효합니다. 고위험성 HPV 감염이 바이러스 성 발현단백질 E6 및 E73의 발현을 유도함에 따라, E6 및 E7 전사체의 검출은 활성 HPV 감염 식별을 위한 금본위제로 널리 인식되고있다4. HPV RNA CISH는 다양한 HPV 관련 질환을 앓고 있는 환자로부터 아주 쉽게 수득되는 FFPE 샘플에서 수행될 수 있다. 그 성능은 자궁 경부, 항문 및 질에서 편평상피내 신생물에서 평가되었으며, 자궁 경부, 항문 및 상부 소화관의 침윤성 편평 상피 세포 암종에서5: 98 % 이상의 감도를 달성합니다. HPV DNA 중합효소 연쇄 반응 (PCR) - 양성 케이스 중. 이것은 p16 면역 염색 (93%)보다 약간 낫습니다. 및 HPV DNA는 보다 일반적으로 사용되는 체형화(DNA ISH: 97%)이다. 두경부 암종(SCC)을 가진 57명의 또 다른 코호트에서, HPV DNA ISH에 비해, 생식기 부위, 피부 및 요로에서 발생하는, HPV RNA CISH는 더 나은 감도를 달성 (100% 대 88%). 및 특이성 (87% 대74%) 6.
P16 면역염색은 HPV 감염4,7에의해 야기될 수 있는 세포 주기 중단을 반영하는 간접 마커이다(그러나 독점적으로는 아님). 이 비용 효과적인 시험은 좋은 감도와 부정적인 예측 값을 가지고 있으며 미국 병리학자 대학 (CAP)과 국제 연합에 의해 oropharynx 암 (OPC)의 고위험 HPV 감염의 대리 마커로 권장됩니다. 암 통제 (UICC)8.
이 논문은 전적으로 HNSCC에 있는 HPV의 검출에 집중하더라도, HPV RNA CISH는 HPV 감염을 관련시키는 각종 그밖 조건에서 임상으로 관련이 있습니다. 예를 들어, 이 기술은 형태학적으로 모호한 경우 9에 대해 자궁경부 내 상피내 신생물,등급 1[CIN1]으로 알려진 자궁경부의 저급 편평상피성 병변의 진단의정확도를 향상시킬 수 있다. 구인두 SCC에 관하여, HPV RNA CISH는 두경부암의 TNM 분류의 최근 제8판에서 HPV 관련 구인두 SCC와 구별되는 HPV 관련 SCC의 확인을 허용합니다 (국제암을 위한 연합의 제어 [UICC])10. HPV 관련 SCC는 HPV 관련 SCC11,12,13보다더 긴 생존과 향상된 방사선 요법 및 화학 요법 감도를 가진 더 나은 예후를 나타내기 때문에, HPV 감염의 검출은 영향을 미칠 수 있습니다 환자 관리14,15. 또한, HPV RNA CISH는 HPV DNA CISH16보다더 높은 신호를 가진 HPV 관련 다수성 부종 암종의 진단에 사용될 수 있다. 몇몇 다변량 분석은 E6와 E7 전사체의 검출이 구인두 SCC 전반에 있는 더 나은 예후와 상관된다는 것을 건의합니다7,15,17,18 및 p16 양성 구인두 SCC19,20의하위 그룹.
여기서 우리는 제조자로부터 얻은 키트와 함께 FFPE 슬라이드에서 수행된 수동 HPV RNA CISH에 대한 프로토콜을 제시한다.
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Protocol
이 프로토콜은 윤리 적 지침을 따르며 윤리위원회 (Comité-de-Protection-des-Personnes Ile-de-France-II, #2015-09-04)의 승인을 받았습니다.
1. 재료의 준비
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1x 세척 버퍼의 제조
- 2.94L의 증류수와 1병(60mL)의 세척 버퍼(50x)를 대형 카보이에 추가하여 1x 세척 완충액 3L을 준비합니다. 잘 섞으세요.
참고 : 1x 세척 버퍼는 미리 준비하고 최대 1 개월 동안 실온에서 보관 할 수 있습니다.
- 2.94L의 증류수와 1병(60mL)의 세척 버퍼(50x)를 대형 카보이에 추가하여 1x 세척 완충액 3L을 준비합니다. 잘 섞으세요.
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카운터 스테인링 시약의 준비
- 50 % 헤마톡슬린을 준비하십시오.
- 연기 후드에 Gill's 헤마톡실린 I 100 mL을 염색 접시에 증류수 100 mL에 추가합니다.
참고 : 50 % 헤마톡슬린 염색 용액은 최대 1 주 동안 재사용할 수 있습니다.
- 연기 후드에 Gill's 헤마톡실린 I 100 mL을 염색 접시에 증류수 100 mL에 추가합니다.
- 0.02% (v) 암모니아 물 (홍조 시약)을 준비하십시오.
- 연기 후드에 1.43 mL의 1 N 암모늄 수산화물을 250 mL의 증류수를 점원통 또는 다른 용기에 넣습니다. 파라핀 필름으로 실린더를 밀봉합니다. 그 내용을 3x-5x에 잘 섞어 보세요.
참고: 분석 정량의 경우 수산화 암모늄을 사용하는 것이 중요합니다. 시약은 미리 제조될 수 있다. 모든 컨테이너가 덮여 있는지 확인합니다.
- 50 % 헤마톡슬린을 준비하십시오.
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1x 표적 검색 시약의 준비
- 대형 비커에 70mL의 10x 대상 검색 시약(재료 표참조)을 증류수 630mL에 추가합니다.
- 비커를 마그네틱 교반기로 가열 플레이트에 놓습니다. 알루미늄 호일로 덮습니다.
- 내용물 100°C에서 10-15분 동안 끓입니다.
참고: 30분 이상 끓이지 마십시오.
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시약 평형
- 하이브리드화 오븐이 40°C에 있는지 확인합니다. 젖은 가습 용지를 트레이 바닥에 놓습니다.
참고: 3.4~4.2단계의 경우 하이브리드화 오븐(재료 표참조)이 필요합니다. - 증폭 시약 (AMP1-AMP6, 재료 표참조)을 냉장고에서 제거하고 관련 인큐베이션 단계 전에 적어도 30 분 전에 실온에서 보관하십시오.
- 매 번 사용하기 전에 오븐이나 수조 또는 인큐베이터에서 40°C에서 대상 및/또는 제어 프로브를 10분 이상 데우면 됩니다.
- 하이브리드화 오븐이 40°C에 있는지 확인합니다. 젖은 가습 용지를 트레이 바닥에 놓습니다.
2. 연기 후드의 접착력 강화 및 탈파화
참고: 스테인드되지 않은 슬라이드에 장착된 3-5 μm 두께의 조직학적 샘플로 프로토콜을 시작합니다.
- 접착력을 높이기 위해 60°C에서 1시간 동안 또는 오븐에서 밤새 40°C에서 슬라이드를 굽습니다.
- 스테인드되지 않은 조직학적 슬라이드로 슬라이드 랙을 충전합니다. 슬라이드 랙을 염색 접시에 담긴 신선한 자일렌에 5분 간 담그고 가끔 씩 씩씩거리게 합니다. 신선한 자일렌과 함께 반복합니다.
- 슬라이드 랙을 염색 접시에 담긴 신선한 100% 에탄올에 3분 동안 담그고 일정한 교반을 합니다. 신선한 100% 에탄올로 반복합니다.
- 슬라이드를 실온에서 2분 동안 건조시키십시오.
참고: 분석 분석 후 슬라이드의 탈수를 위해 탈파피화 시약을 재사용하지 마십시오.
3. 조직 전처리
참고: 이 단계는 머리와 목 샘플에 대한 제조업체의 지침에 따라 "표준" 전처리 권장 사항을 따릅니다. 섹션 3.1 및 3.2의 타이밍은 조작된 조직에 따라 조정될 필요가 있습니다.
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과산화아제 활성 의 봉쇄
- 각 슬라이드에 과산화수소 4-6 방울을 넣고 실온에서 10 분 동안 배양하십시오.
- 슬라이드를 실온에서 증류수로 2분 동안 2x 세척합니다.
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RNA/조직 경계의 파손
- 클로를 사용하면 1.3절에서 끓는 1x 표적 회수 시약(TTR1x)에서 알루미늄 호일을 제거하고 교반을 중지합니다. 슬라이드 랙을 15분 동안 천천히 조심스럽게 담그십시오.
참고: 이 단계에서는 끓이면 계속 지속됩니다.
주의: 발톱을 사용하여 알루미늄 호일과 슬라이드 랙을 조작하여 화상 부상을 방지하십시오. 장갑과 실험실 코트와 같은 적절한 개인 보호 장비를 착용하십시오. - 발톱으로 뜨거운 슬라이드 랙을 증류수 욕조로 즉시 옮기고 2 분 동안 씻으십시오.
참고: 샘플이 TTR1x에서 냉각되지 않는지 확인합니다. - 슬라이드를 신선한 100% 에탄올로 2분 동안 씻습니다.
- 슬라이드를 실온에서 2분 동안 건조시고 말립니다.
- 클로를 사용하면 1.3절에서 끓는 1x 표적 회수 시약(TTR1x)에서 알루미늄 호일을 제거하고 교반을 중지합니다. 슬라이드 랙을 15분 동안 천천히 조심스럽게 담그십시오.
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배리어 생성
- 소수성 배리어 펜(재료 표참조)을 사용하여 샘플 주위에 장벽을 그립니다. 적어도 5 분 동안 건조시키십시오.
참고: 장벽이 정말 마르도록 하십시오. 시술 중에 마모되면 주저하지 말고 다시 그리십시오. 펜으로 티슈를 만지지 마십시오. 여기서 는 밤새 프로토콜을 일시 중지할 수 있습니다.
- 소수성 배리어 펜(재료 표참조)을 사용하여 샘플 주위에 장벽을 그립니다. 적어도 5 분 동안 건조시키십시오.
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프로테아제 소화
- 슬라이드 랙에 슬라이드를 놓고 샘플당 ~4 방울의 프로테아즈 플러스를 추가합니다(재료 표참조).
- 습도 조절 트레이를 뚜껑으로 덮고 40°C에서 30분 동안 혼성화 오븐에 넣습니다.
참고: 증발을 방지하려면 회전 노브가 잠금 위치로 완전히 바뀌지 않았는지 확인합니다. - 오븐에서 트레이를 분리하고 슬라이드 랙을 분리합니다.
- 한 번에 하나의 슬라이드, 신속하게 여분의 액체를 제거하고 증류수로 채워진 염색 접시에 잠긴 슬라이드 랙에 슬라이드를 배치합니다.
- 슬라이드를 실온에서 증류수로 2분 동안 2x 세척합니다. 끊임없이 교반합니다.
4. 분석기 실행
참고: 인큐베이션 단계 사이에 섹션이 마르지 않도록 하십시오.
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HPV 프로브의 혼성화
참고: 사용하기 전에 침전을 용해시키기 위해 프로브가 미리 따뜻해지도록 하십시오. 이 단계의 경우, HPV 프로브대신에, 펩티딜-프로릴 이소머라아제 B(PPIB) 양성 대조군 또는 디하이드로디피콜리네이트 리덕타제(DAPB)를 음의 제어를 위한(물질표 참조)도 사용될 수 있다.- 슬라이드를 탭하거나 쓸어넘기면 여분의 액체를 제거하고 슬라이드 랙에 놓습니다. HPV 프로브 4 방울을 추가하여 각 섹션을 완전히 덮습니다.
- 뚜껑으로 트레이를 덮고 40 °C에서 2 시간 동안 오븐에 삽입하십시오.
참고: 증발을 방지하려면 회전 노브가 잠금 위치로 완전히 바뀌지 않았는지 확인합니다. - 오븐에서 트레이를 분리하고 슬라이드 랙을 분리합니다.
- 한 번에 하나의 슬라이드, 신속하게 여분의 액체를 제거하고 1 x 세척 버퍼로 채워진 염색 접시에 잠긴 슬라이드 랙에 슬라이드를 배치합니다.
- 슬라이드를 1x 세척 버퍼로 1회 세척하여 실온에서 일정한 교반으로 2분 동안 세척합니다. 신선한 1x 세척 버퍼로 이 것을 반복합니다.
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AMP1, AMP2, AMP3 및 AMP4의 하이브리드화
참고: 이러한 단계에는 하이브리드화 오븐의 혼성화와 구입한 키트의 AMP1-AMP4가 포함됩니다(재료 표참조).- 탭 및/또는 쓸어넘기면 슬라이드에서 여분의 액체가 제거되고 슬라이드 랙에 놓습니다. 각 섹션을 완전히 커버하기 위해 ~ 4 방울의 AMP1을 추가하십시오.
- 뚜껑으로 트레이를 덮고 40 °C에서 30 분 동안 오븐에 삽입하십시오.
- 오븐에서 트레이를 분리하고 슬라이드 랙을 분리합니다.
- 한 번에 하나의 슬라이드, 신속하게 여분의 액체를 제거하고 1 x 세척 버퍼로 채워진 염색 접시에 잠긴 슬라이드 랙에 슬라이드를 배치합니다.
- 슬라이드를 1x 세척 버퍼로 1회 세척하여 실온에서 일정한 교반으로 2분 동안 세척합니다. 신선한 1x 세척 버퍼로 이 것을 반복합니다.
- 4.2.1-4.2.5 단계를 반복하지만 AMP1 대신 ~ 4 방울의 AMP2를 사용하고 40 °C에서 15 분 동안 배양하십시오. 슬라이드를 2x 2분 동안 세척하고, 두 번 모두 신선한 세척 버퍼로 세척합니다.
- 4.2.1-4.2.5 단계를 반복하지만 AMP1 대신 ~ 4 방울의 AMP3를 사용하고 40 °C에서 30 분 동안 배양하십시오. 슬라이드를 2x 2분 동안 세척하고, 두 번 모두 신선한 세척 버퍼로 세척합니다.
- 4.2.1-4.2.5 단계를 반복하지만 AMP1 대신 ~ 4 방울의 AMP4를 사용하고 40 °C에서 15 분 동안 배양하십시오. 슬라이드를 2x 2분 동안 세척하고, 두 번 모두 신선한 세척 버퍼로 세척합니다.
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AMP5와 AMP6의 혼성화
참고: 이 단계에는 오븐의 혼성화가 포함되지 않고 실온에서 혼성화됩니다. AMP5 및 AMP6는 구입한 키트에서 제공됩니다(재료 표참조).- 슬라이드를 탭하거나 쓸어넘기면 여분의 액체를 제거하고 슬라이드 랙에 놓습니다. 각 섹션을 완전히 커버하기 위해 ~ 4 방울의 AMP5를 추가하십시오.
- 뚜껑으로 트레이를 덮고 실온에서 30 분 동안 배양하십시오.
- 한 번에 하나의 슬라이드, 신속하게 여분의 액체를 제거하고 1 x 세척 버퍼로 채워진 염색 접시에 잠긴 슬라이드 랙에 배치합니다.
- 슬라이드를 1x 세척 버퍼로 1회 세척하여 실온에서 일정한 교반으로 2분 동안 세척합니다. 신선한 1x 세척 버퍼로 이 것을 반복합니다.
- 4.3.1-4.3.4 단계를 반복하지만 AMP5 대신 ~ 4 방울의 AMP6를 사용하고 실온에서 15 분 동안 배양하십시오. 슬라이드를 2x 2분 동안 세척하고, 두 번 모두 신선한 세척 버퍼로 세척합니다.
5. 3,3'-다미노벤지딘신호 감지
주의: 디아미노벤지딘 (DAB)은 독성이 있습니다. 이 화학물질을 폐기하고 취급할 때는 적절한 예방 조치 및 안전 지침을 따르십시오.
- 각 용액의 동일한 수의 방울을 분배하여 적절한 크기의 튜브에 DAB-A 및 DAB-B(재료 표참조)의 동일한 볼륨을 혼합합니다. 섹션당 DAB 기판의 ~120 μL을 만드십시오 (각 시약 / 총 4 방울 ~ 2 방울). 3x-5x를 잘 섞으세요.
- 슬라이드 랙에서 한 번에 하나씩 각 슬라이드를 가져 가서 슬라이드 랙에 놓기 전에 여분의 액체를 제거하거나 탭하거나 쓸어 넘깁니다.
- 각 조직 섹션에 DAB의 피펫 ~ 120 μL. 섹션이 덮여 있는지 확인하고 실온에서 10 분 동안 배양하십시오.
- 현지 규정에 따라 나머지 DAB를 폐기하고 슬라이드를 수돗물로 채워진 염색 접시에 잠긴 슬라이드 랙에 삽입합니다.
6. 카운터 스테인링
- 슬라이드 랙을 50% 헤마톡실린 염색 용액이 함유된 염색 접시로 옮기면 실온에서 30s 동안 휴식을 취하십시오. 슬라이드는 보라색이 됩니다.
- 즉시 슬라이드 랙을 수돗물이 들어있는 염색 접시로 다시 옮기고 랙을 위아래로 움직여 슬라이드를 3x-5x 씻어 내십시오.
- 슬라이드가 명확해질 때까지 깨끗한 수돗물로 세척 단계를 반복하고 섹션은 보라색으로 유지합니다.
- 염색 접시에 있는 수돗물을 0.02% 암모니아 물로 교체하십시오. 랙을 위아래로 2x-3x 이동합니다. 티슈 섹션이 파란색으로 바뀝니다.
- 암모니아 물을 수돗물로 교체하십시오. 슬라이드를 3x-5x 세척합니다.
7. 탈수
- 슬라이드 랙을 연기 후드에 70% 에탄올이 들어 있는 염색 접시로 옮기고 가끔 교반하여 2분 간 휴식을 취합니다.
- 슬라이드 랙을 100% 에탄올이 들어 있는 첫 번째 염색 접시로 옮기고 가끔 교반하여 2분 간 휴식을 취합니다.
- 슬라이드 랙을 100% 에탄올이 들어 있는 두 번째 염색 접시로 옮기고 가끔 교반하여 2분 간 휴식을 취합니다.
- 슬라이드 랙을 자일렌이 들어있는 염색 접시로 옮기고 가끔 교반하여 5분 간 휴식을 취합니다.
8. 슬라이드 장착
- 슬라이드 랙에서 슬라이드를 제거하고 연기 후드를 위로 향하여 섹션을 평평하게 놓습니다.
- 각 슬라이드에 자일렌 기반 마운팅 매체 1방울을 떨어뜨리고 24mm x 50mm 커버슬립을 섹션 위에 조심스럽게 배치하여 한 번에 하나의 슬라이드를 장착합니다. 기포를 포획하지 마십시오.
- 미끄럼을 ≥5분 동안 공기 건조시.
9. 샘플 평가
- 20x-40x 배율로 표준 브라이트필드 현미경으로 조직 섹션을 검사합니다.
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Representative Results
여기서 설명된 바와 같이, 두경부 편평세포암에서는, 세포질 또는 종양 세포의 핵에서 갈색 천공얼룩이 있는 경우 양성으로 간주될 수 있다. 대부분의 연구에서 신호는 "양성" 또는 "감지되지 않음"14로간주됩니다. 신호의 반정화 방법이 보고되었지만 팀 간의 표준화가 부족합니다. 예를 들어, 일부 연구에서는 신호가 종양 세포 당 1-3 점으로 1+, 종양 세포 당 4-9 점으로 2+ 또는 종양 세포당 10 점 이상으로 3+로 점수가 매겨졌습니다 6; 포스트 혹 분석에서 해석하기 쉬운 2+ 및 3+ 신호만 고려되었습니다. 또 다른 연구에서는, 결과는 두 가지 점수로 나뉘었다: RNA CISH "높음" 및 RNA CISH "낮음". RNA CISH "높은" 점수는 염색된 암세포의 50% 이상, 또는 20x 목적으로 관찰된 바와 같이 암세포의 적어도 30%에서 세포 표면(핵 및 세포질)의 80%이상을 덮는 염색에 의해 정의되었다(도 1)21.
긍정적 인 대조군과 관련하여, PPIB 신호는 20x-40x 배율에서 세포 핵 내의 반점점으로 표시되어야합니다. 음성 대조군 슬라이드의 경우, 20x 현미경 필드당 배경 DAB 염색을 표시하는 10개 세포마다 하나의 점이 허용됩니다.
도 1: "낮음" 및 "높음" RNA CISH 염색의 예. (A와 B) RNA CISH "낮은" 구인두 편평 상피 세포 암에 염색 점수. 염색은 종양 세포의 50% 이하에서 관찰되고 세포 표면의 80% 미만을 커버합니다. (C 및 D)RNA CISH "높은" 점수는 구인두 편평 상피 세포 암에 염색. 염색은 종양 세포의 50 % 이상에서 관찰되며,이 경우 염색 표면은 종양 세포의 30 % 이상에서 80 %를 초과합니다. 이 그림은 아우구스틴 등에서 수정되었습니다.21이그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
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Discussion
구입한 키트로 수행된 HPV RNA CISH는 바이러스 성 전사체의 검출을 위한 강력한 도구이며 활성 HPV 감염을 나타냅니다. 수동으로 수행하면 프로토콜의 단계가 전반적으로 따라하기 쉽고 구입한 키트가 편리합니다. 이 기술은 19개의 조직학 견본 플러스 1개의 통제 미끄럼을 한 번에 염색하는 것을 허용하고, 분석결과는 약 8 시간 지속됩니다. 달리 언급되지 않는 한 샘플이 단계 간에 건조되지 않도록 하는 것이 중요합니다. 전처리 상태는 조작된 조직에 따라 조정될 필요가 있습니다.
HPV E6-E7 mRNA 발현 신호는 정확한 공간 분해능으로 검출되어 종양에 인접한 HPV 감염 비신생 세포로부터의 어떠한 오염도 배제한다. HPV E6 및 E7 RNA의 검출은 이러한 전사체가 세포 p53 및 pRb 단백질과의 상호작용을통해 HPV 유도 세포 형언에 필요하기 때문에 기능적으로 관련이 있다 4. 따라서, 자궁 경부의 전암 성 병변에서, HPV RNA CISH는 신호의 국소화에 따라 고급 상피 내 병변 (HSIL)에서 저급 상피 병변 (LSIL)을 구별하는 데 도움이 될 수 있습니다 : LSIL의 대부분의 경우, 풍부 확산 적으로 염색 된 핵은 상피 두께 전체에 걸쳐 표지되어 생산적인 단계를 나타냅니다. HSIL은 표면 층에 풍부한 확산 염색 된 세포 핵을 전시, 낮은 층에서 강한 핵 및 세포질 구두점 신호와 공존 (이전 CIN2로 알려진 병변에서), 또는 세포질 점으로 강한 핵 염색 상피의 두께를 통해, HPV 감염의 변형 단계를 나타내는 (이전에 CIN3로 알려진 병변에서)22.
신호의 반정적 평가에 대한 표준 권고는 아직 없지만, 일부 저자는 HPV E6 및 E7 전사체의 반정적 평가가 두 가지 예후의 식별을 허용했기 때문에 임상 관련성을 보고합니다. HPV 관련 HNSCC 환자 중 그룹21. E6 및 E7 전사체가 없거나 E6 및 E7 전사체의 낮은 수준으로만 HPV DNA의 검출이 기능적으로 무관할 것이고 그러한 환자는 HPV 음성 암 환자21로 풀려나야 한다고 가정되었습니다. 23.
이 절차의 한계에 관해서는, 그것은 몇 가지 비특이적 크로스 혼성화가 어떤 경우에는 발생할 수 있다고 가정, Dreyer 등.23 RNA CISH는 E6 / E7 RNA 전사체와 바이러스 성 사이의 차별에 적합하지 않을 수 있습니다 DNA는, 프로토콜로서 100°C 열처리 단계를 포함하며, 이는 바이러스 DNA변성(23)을 허용하는 것으로 의심된다. 이것은 긍정적 인 경우에 신호의 두 가지 유형의 관찰에 의해 지원됩니다, 즉 강한 염색은 주로 종양 세포 핵에 국한, 뿐만 아니라 세포질에 미세 한 세분화 된 신호. 이 프로토콜에 사용된 프로브가 HPV 관련 HNSCC 4의 대다수에 관여하는 HPV 유전자형 16및 18을 구체적으로 결합하기 때문에, 가끔 HPV 관련 케이스는 RNA CISH에 의해 놓칠 수 있습니다, 어느 때문에 특정 HPV 유전자형이 아닙니다 프로브에 포함, 또는 때문에 돌연변이 또는 프라이머 결합 사이트의 삭제. 마지막으로, 이 방법은 비용이 많이 드는 시약 및 장치를 필요로하며 일상적인 연습에서 쉽게 접근 할 수 없습니다.
모든 샘플에 대해 HPV 분석, 양성 대조군, 음성 대조를 위한 절제술을 수행하는 섹션 등 총 3개의 섹션이 필요합니다. RNA는 깨지기 쉬운 분자이고 FFPE 견본에 있는 시간이 지남에 따라 악화될 수 있기 때문에, 전사체의 질은 PPIB, DNA 지시된 RNA 폴리머라제 II 소단위 RPB1 (Polr2a) 또는 polyubiquitin-C (UBC)와 같은 긍정적인 통제 프로브를 사용하여, 모든 견본을 위해 검사되어야 합니다 , 인간의 하우스 키핑 유전자입니다. 더욱이, 반정적 접근법이 있을 때, 신호는 하우스키핑유전자 대조군 프로브(21)로 정규화되어야 한다. 각 조직에 대 한 권장된 긍정적인 제어 제조 업체의 지침에서 찾을 수 있습니다. 그러나, 최근 연구 결과는 mRNA 발현이 2004년과 2008년부터 견본 사이 비교 가능한 mRNA 수준을 보여주는 미래 와 회고견본에서 둘 다 강력하게 공부될 수 있다는 것을 확인합니다. 이것은 시간24에걸쳐 mRNA의 상대적 무결성에 찬성합니다. 비특이적 염색을 피하기 위해 사용되는 권장 음성 대조군 프로브는 DAPB를 코딩하는 세균 유전자입니다.
여기서 HPV RNA의 체화혼성화에서 발색성은 수동으로 수행되는 것으로 서술된다. 이 기술은 또한 형광 표지 및/또는 전통적인 면역 염색과 결합된 으로 수행될 수 있습니다.
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Disclosures
CB: 보드, 세미나: MSD, BMS, 아스트라제네카, 로슈
Acknowledgments
저자는 호피탈 유로페엔 조르주 퐁피두와 네커 (로리안 샹볼레, 엘로디 미셸, 그리고 기젤 레갈)의 병리학 과에 감사드립니다; PARCC의 조직학 플랫폼, 호피탈 유로페엔 조르주 퐁피두 (코린 레사프레); 언어 편집을위한 버지니아 클라크; 알렉산드라 엘바키안의 공헌.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Hematoxylin solution, Gill No. 1 | Merck | GHS132 | |
| HybEZ Oven (110v) | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 321710 | |
| HybEZ slide rack | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 300104 | |
| ImmEdge Hydrophobic Barrier Pen | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 310018 | |
| RNAscope 2.5 HD Detection Reagents-BROWN | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 322310 | This kit includes amplification reagents AMP1, AMP2, AMP3, AMP4, AMP5 and AMP6, and detection reagents DAB-A and DAB-B |
| RNAscope 3-Plex Negative Control Probe | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 320871 | DAPB |
| RNAscope 3-Plex Positive Control Probe | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 320861 | PPIB |
| RNAscope H202 & Protease Plus Reagent | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 322330 | Hydrogen Peroxyde x2 and Protease Plus x 1 |
| RNAscope Probe- HPV16/18 | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 311121 | |
| RNAscope Target Retrieval Reagents | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 322000 | |
| RNAscope Wash Buffer Reagents | Advanced Cell Diagnostics Inc. | 310091 | Wash Buffer 50X x4 |
References
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