Summary
אנו מתארים פרוטוקולים כדי להכין זיהומים ולטהר את הנבגים עבור לימוד זיהום של המעי האנושי ואורגאואידים על ידי הקריפטוספורידיום parvum. אנו מדגימים את ההליכים למיקרו הזרקה של טפילים לתוך מעיים אורגנואיד וכתמים של אורגנואידים. לבסוף, אנו מתארים את הבידוד. של ציסטות שנוצרו מהאורגנואידים
Abstract
קריפטוספורידיום parvum הוא אחד הגורמים העיקריים של מחלת diarrheal אנושי. כדי להבין את הפתולוגיה של הטפיל ולפתח תרופות יעילות, מערכת תרבות מבחנה המהווה את התנאים במארח יש צורך. אורגנואידים, הדומה מאוד לרקמות המוצא שלהם, הם אידיאליים ללימוד אינטראקציות מארחים-פרזיאליות. אורגנואידים הם תלת-ממדיים (3D) מבנים מבוססי רקמה הנגזרים מתאי גזע בוגרים וגדלים בתרבות לפרקי זמן ארוכים מבלי לעבור סטייה גנטית או טרנספורמציה. יש להם קוטביות מוגדרת היטב עם משטחי פסגה וגם בזלת צלעות. אורגנואידים יש יישומים שונים בדיקות סמים, ביו בנקאות, ומידול מחלות ומארח-חיידק אינטראקציה לימודים. כאן אנו מציגים פרוטוקול צעד אחר צעד של איך להכין את הנבגים ואת הספוראוזוטים של קריפטוספורידיום לזיהום המעי האנושי אורגנואידים. אנו לאחר מכן להדגים כיצד מיקרוהזרקה ניתן להשתמש כדי להזריק את החיידקים לתוך אורגאיד לומן. ישנן שלוש שיטות עיקריות שבהן ניתן להשתמש באורגנואידים למחקרים מארחים-חיידק-מיקרוהזרקה, הטיה מכנית וציפוי, ועל ידי ביצוע monolayers. מיקרוהזרקה מאפשרת תחזוקה של המבנה התלת-ממדי ומאפשרת שליטה מדויקת באמצעי הטפיל והמגע הישיר הרשמי של החיידקים. אנו מספקים פרטים עבור צמיחה אופטימלית של אורגנואידים עבור הדמיה או הייצור הoocyst. בסופו של דבר, אנו גם להדגים כיצד אאוציסטות שנוצר לאחרונה ניתן מבודד אורגאיד עבור המשך עיבוד וניתוח במורד הזרם.
Introduction
התפתחות של תרופות או חיסונים לטיפול ומניעה של הדבקת הצפנה היתה מעכבת היעדר מערכות מבחנה אשר לחקות בדיוק את המצב vivo בבני אדם1,2. רבים מהמערכות הזמינות כעת רק לאפשר זיהום לטווח קצר (< 5 ימים) או לא לתמוך במחזור החיים המלא של הטפיל3,4. מערכות אחרות המאפשרות התפתחות מלאה של הטפיל מבוססים על קווי תאים מונצח או תאים סרטניים שאינם בנאמנות המצב הפיזיולוגי של בני אדם5,6,7 . אורגנואידים או ' מיני איברי ' הם 3D רקמות נגזרות מבנים אשר גדלים במטריצה מתוך החילוץ שנוספו עם רקמות שונות מסוימים הצמיחה גורמים. אורגנואידים פותחו מאיברים שונים ורקמות. הם יציבים מבחינה גנטית ומוארכים את רוב התפקודים של אברי המוצא שלהם, ויכולים להישמר בתרבות לפרקי זמן ארוכים. פיתחנו שיטה לזיהום המעי האנושי והריאות אורגנואידים עם Cryptosporidium המספקת מודל מדויק של מבחנה למחקר של אינטראקציות מארח טפיל רלוונטי מעיים והצפנת הנשימה8 ,9,10,11,12,13. בניגוד לדגמים אחרים של תרבות שפורסמו, מערכת האורגנואיד מייצגת אינטראקציות טפיל מארח של החיים האמיתיים, מאפשרת השלמת מחזור החיים כך שכל השלבים של מחזור החיים הטפיל ניתן ללמוד, ושומר על התפשטות הטפיל עד 28 ימים10.
Cryptosporidium parvum הוא טפיל apicom, אשר מדביק את האפיתל של הנשימה ומעיים שדות, גרימת מחלה diarrheal ממושכת. השלב הסביבתי עמיד הוא oocyst, נמצא מזון מזוהם מים14. לאחר שבלע או שאפה, את הריזוטו ומשחרר ארבעה sporozoites כי לצרף לתאי אפיתל. Sporozoites להחליק על תאים מארחים ולעסוק קולטנים תא מארח, אבל הטפיל לא לפלוש באופן מלא לתא, והוא מופיע כדי לגרום לתא המארח להפרץ15. הטפיל, שהופנמו בתוך תא פנימי, אך ממוכך, נשאר על פני השטח הרשמי של התא, ומשכפל בתוך החללים הפרזיטואטיים. הוא עובר שני סיבובים של רבייה לא-מינית – תהליך הנקרא merogony. במהלך המראווני, הסוג שאני מפתח מפתחים אשר מכילים שמונה merozoites המשוחררים לפלוש לתאים חדשים. אלה merozoites לפלוש תאים חדשים כדי להתפתח סוג II meronts המכיל ארבעה merozoites. Merozoites אלה, כאשר הם משתחררים, להדביק תאים ולהתפתח מאקרוגמונטים ומיקרוגמבטים. מיקרוגיים משתחררים ומדשן את המקגיים המייצרים זיטים שבוגרים לתוך ציסטות. בוגרת האוציסטות משתחררים לאחר מכן לתוך לומן. האוציסטות הן דקות-חומה אשר מיד מייבאות להדביק את האפיתל, או מוקף חומה עבה אשר משתחררים לתוך הסביבה כדי להדביק את המארח הבא14. כל שלבי הצפנת מחזור החיים זוהו במערכת התרבות האורגאידית שפותחה בעבר על ידי הקבוצה שלנו10.
מאז בנאמנות האדם אורגנואידים שכפול רקמות האדם9,11,13, ותמיכה בכל השלבים replicative הצפנה10, הם מערכת התרבות האידיאלית רקמה ללמוד קריפטוספטורידיום ביולוגיה ואינטראקציות מארחים-טפיל. כאן אנו מתארים את ההליכים לזיהום אורגנואידים עם שני ציסטות קריפטוגנטים ו-הצפנה , ובידוד החדש אאוציסטות המיוצר במערכת זו תרבות רקמה.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
כל טיפול ברקמות וכריתה בוצעה תחת הלוח סקירה מוסדית (IRB) מאושר פרוטוקולים עם הסכמת המטופל.
1. הכנה של C. parvum אוציסטות עבור הזרקה
הערה: הצפנת הקריפטוספדיום נרכשו ממקור מסחרי (ראה את הטבלה של חומרים). אלה האוציסטות מיוצרים עגלים מאוחסנים מלוחים באגירה פוספט (PBS) עם אנטיביוטיקה. ניתן לאחסן אותם במשך כ -3 חודשים ב -4 ° c ולעולם לא לקפוא. אנחנו בדרך כלל משתמשים. בציסטות בתוך חודש אחד אורגנואידים יכול להיות נגוע או אאוציסטות שלמות, או sporozoites יכול להיות מבודד מפני מקבל והשתמשו כדי להדביק אורגנואידים אם זה חשוב לא להיות בעלי המחלה המקורית.
-
הכן את הצפנת הצפנה עבור תאים מדביקים (איור 1a).
- לשמור על הקרח על כל המניפולציות עד שהם נוספים לאורגנואידים.
- לחשב את מספר הדרוש אאוציסטות עבור צלחת שש-באר מלא של אורגנואידים (בדרך כלל על 5 x 105– 2.5 x 105 עבור הצלחת). הרוזן את מספר האוציסטות בתוך הומוציטוטומטר כדי לאמת את הכמות וההעברה לשפופרת צנטריפוגה.
הערה: כדי לסייע ויזואליזציה, אאוציסטות עשוי להיות מעורב 1:1 עם נוגדן פלורסנט ספציפי לציסטה (לראות את הטבלה של חומרים) לפני הטעינה על המכשיר הומוציטוטומטר. Fluorophore-התווית אאוציסטות ניתן לאחר מכן בקלות דמיינו וממוספרים באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטית. אנו ממליצים להזריק כ-100 – 1000 אוציסטות/אורגנואיד. באופן כללי, 1000-2000 אורגנואידים ניתן לגדל בצלחת שש-היטב. - להביא את הנפח של ההשעיה אאוציסטות עד 900 μl עם PBS. הוסף 100 μL של נתרן היפוכלוריט (למשל, Clorox) אקונומיקה (ב -4 ° c). מודקון למשך 10 דקות על הקרח.
- צנטריפוגה עבור 3 דקות במיקרוצנטריפוגה ב 8,000 x g ב 4 ° c. כוון את החצוצרות בצנטריפוגה עם פתיחת כובע פונה פנימה. הגלולה יכול להיות קשה לראות כל כך לדעת איפה הטפילים יש מפלטטים בצינור הוא חיוני.
- הסר את הסופרנטנט עם הפיפטה שנזהר להמנע מהגלולה. הוסף 1 מ ל של מדיום הנשר של דולבקה שונה (DMEM) ומערבולת לערבב.
- צנטריפוגה עבור 3 דקות במיקרוצנטריפוגה ב 8,000 x g ב 4 ° c.
- חזור על שוטף עם DMEM פעמיים נוספות.
- הכנת בינונית הרחבה (OME) או בידול אורגאיד בינונית (OMD) שאליה התווסף טאורוכוליה לריכוז הסופי של 0.5% (w/v) (ראה טבלת חומרים). טאורוכולאט צריך תמיד להיות מוכן והוסיף טרי.
הערה: השתמשנו בהצלחה 0.5% טאורוכולאט הדלקת שלנו מספרת היכן האינויותאי שלמות, וראה שיעור שיפור של זיהום בלי השפעות מזיקות על התאים המארחים. עם זאת, הטאורוכולאט עשוי להיות השפעות בלתי צפויות על תאים, וריכוזים נמוכים יותר שימשו בהצלחה זיהום בחני16. - השהה מחדש את אאוציסטות ב-100 μl של בינונית תרבותית ארגונית בתוספת עם 0.5% (w/v) נתרן טאורוכולאט. הרוזן אאוציסטות שוב כפי שמתואר בשלב 1.1.2.
- להוסיף צבע ירוק מהיר על ההשעיה כדי להמחיש את ההזרקה.
- מילוי מיקרו-מטעין טיפים (לראות את הטבלה של חומרים) עם ההשעיה של האוסטאז ולהשתמש בו כדי למלא נימים משכו.
זהירות: ההליך כולו צריך להיעשות במכסה של תרבות הרקמה עם פרוטוקולי בטיחות רמה 2. שימוש במסכות מומלץ כציסטות קריפטוספורידיום יכול להיות גם זיהומיות כאשר מוטס.
2. טיהור שפכים של ספוראוזוטים מ -C. parvum אוציסטות
-
לטהר את הספורטים מ -C. parvum בציסטות לאחר הלבנת ושטיפת אקונומיקה כפי שמתואר לעיל.
- העבירו את האוציסטות. לשפופרת של 15 מ ל השהה מחדש את הציסטות בטמפרטורת החדר בינונית (0.75% w/v נתרן טאורוכולט) כדי לקבל 1 x 107 אוציסטות/mL. התוספת של הטאורוקריט משפרת את קצב הצ של האוציסטות, ומשפרת את תפוקת הספוראוזוט.
- השעיית הציסטה ב 37 מעלות צלזיוס עבור 1 – 1.5 h.
- בדוק את הדגימה המיקרוסקומית בהיקף של תחנת הרכבת; 60 – 80% התחנה הינה סבירה להתאוששות טובה של הספוראוזוענים. אם הרמה של תחנת הרכבת נמוכה, הדגירה ארוכה יותר (עוד 30 דקות עד 1 h).
- קבע את תחנת האחוזים ביחס למספר ההתחלה של האוציסטות. : תחנת הרכבת מחושבת
% התחנה = [1 – (מספר של אאוציסטות שלמות/מספר של אאוציסטות בהתחלה)] x 100 - לשטוף את התאים כדי להסיר את החומרים ריאגנטים על ידי הוספת 14 מ ל של PBS או בינונית, ערבוב, ומחלים תאים (oocysts שלמות, הפגזים של oocysts, ו sporozoites ו ספוראוזוטים) על ידי צנטריפוגה ב 3,400 x g עבור 20 דקות כדי לשחזר sporozoites. מנושף בזהירות כדי להימנע מאיבוד תאים.
- השהה מחדש את כדורי הספורז ב-1 – 2 מ ל כדי להשיג 3 x 107 oocysts/mL (מבוסס על מספר מתחיל oocysts).
- כדי להסיר את השאר אאוציסטות וקונכיות, לסנן את ההשעיה דרך מסנן 3 יקרומטר (איור 1b). השתמש 47 מ"מ מחזיק מכשיר מסנן מצויד עם מסנן פוליקרבונט (3 יקרומטר גודל נקבובית) מחובר לחבית 10 מ"ל מזרק. מניחים את מחזיק הפילטר מעל שפופרת של 15 מ"ל. מניחים את ההרכבה בדלי קרח או בחדר קר.
- הוסף 7.5 mL של ההשעיה sporozoite להרכבה מסנן ולאפשר לסנן דרך כוח הכבידה. לשטוף עם עוד 7.5 מ ל של DMEM.
הערה: כדי להבטיח הצלחה בבידוד sporozoite טרי ציסטות ותחנת המשטרה הטובה הם קריטיים. אם יש יותר מדי ציסטות בלתי מ, ההשעיה לא יזרום דרך כוח הכבידה. הפעלת לחץ על המזרק יכולה לגרום. לביטול הציסטות בדרך הזרקת הספוראוזוטים מאתגרת יותר מזה של האוציסטות, כי הספוראוזוניטים עלול לסבך ולחסום את הנימים. כדי למנוע זאת, אנו ממליצים לעשות טיפ נימי רחב יותר בעת הזרקת אורגנואידים עם הספאוזוענים. כדי להשיג רמות מספיקות של זיהום, 2 – 4 פעמים את מספר sporozoites צריך להיות מוזרק לתוך כל אורגאיד לעומת אורגנואידים נגועים עם oocysts. - צנטריפוגה את ההשעיה sporozoite מסוננים ב 3,400 x g באמצעות רוטור דלי מנופף עבור 20 דקות כדי sporozoite הגלולה.
- השהה מחדש 50 – 100 μl של מדיום תרבות אורגאיד בינונית או omd (לראות את הטבלה של חומרים) שיושלם עם 0.05% (w/v) צבע ירוק מהיר והגלוטתיון, בטטין, L-cysteine, חומצה לינולאית ו taurine המכילים הפחתת מאגר5 (ראה ה טבלה של חומרים).
הערה: דגירה של האוזנים במשך זמן ארוך מדי עלול לגרום לפירוק של sporozoites והתאוששות עניים ולכן יש להימנע.
3. תרבות חוץ גופית של מעיים אדם וריאות אורגנואידים עבור מיקרוהזרקה
- מחלות מעיים תרבותיות בתנאי תקשורת מתרחבות ובידול.
הערההפרטים של הפצת המעי והריאות, תוארו בעבר במאמרים אחרים8,13(ראה הוראותרשימת חומריםעבור מתכוני מדיה). כאן, נתאר בקצרה את שיטת התרבות הארגונית עם התייחסות ספציפית למיטובCryptosporidiumזריקה וצמיחה. מצאנו כי עבור הדמיה של טפילים באורגנואידים, אורגנואידים גדל בינוני הרחבה עדיפים על אלה מדיה בידול גדול כמו שיש פחות פסולת הצטברות מאשר לראות אורגנואידים גדל בידול בינוני. עם זאת, אם המטרה היא לבודד oocysts, אורגנואידים גדל בבידול מדיה לייצר מספרים גבוהים הרבה יותר של oocysts.- לשמור על אורגנואידים בתרבויות תלת-ממד במטריצה מלבינה (ראה את שולחן החומרים) ב-37 ° c. הוסף מדיית הרחבה (OME) למעלה ורענן כל יום.
הערה: עבור אורגנואידים ריאות, אין לנו הרחבה נפרדת ומדיה בידול. - כדי לפצל ולוחית הלוח למיקרו הזרקה, להסיר את המדיה מלוחית 6-באר המכילה אורגנואידים אנושיים ולהוסיף F12 + + + (לראות את הטבלה של חומרים) לבאר ולשבור את המטריצה על ידי ליטוף עם טיפ 1 מ ל פיפטה מספר פעמים. לאסוף תאים לתוך שפופרת 15 mL (2 מ ל F12 + + + + לצינור מספיק עבור הליכים נוספים).
- הוסף 10 – 12 מ ל F12 + + + לתוך שפופרת אחר 15 מ ל ומקום אש מלוטשת זכוכית pipet לתוך המדיום, פיפטה למעלה ולמטה 3 פעמים כדי לשבור את המעי האנושי והריאות אורגנואידים.
הערה: להשתמש בזכוכית הרבה ללטף (20 – 30 ס מ) ולהבריק אש זה לזמן קצר. אל תבצע את הפתיחה (קוטר 1 מ"מ) קטן מאוד, מכיוון שניתן לפגוע באורגנואידים. להפוך את הקצה של העוגה להחליק על ידי לחיצה קצרה להבריק אותו. לשבור את האורגנואידים לחתיכות קטנות יותר של ~ 50 μm. בריאות אורגנואידים יש קרום חיצוני עבה יותר ולכן דורשים הטיה חזקה יותר עם פיפטה זכוכית לעומת אורגנואידים מעיים. יתר על כן, יש להם שיעור צמיחה איטי יותר מאשר מעיים (עד 14 ימים בין כל מעבר). - הוסף F12 + + + עד 5 – 7 mL ו צנטריפוגה ב 350 x g עבור 5 דקות.
הערה: מהירות צנטריפוגה בשלב זה הוא גבוה יותר מהרגיל על מנת להפוך את הגלולה תא טוב כי הוא מופרד היטב מתוך מטריצה החילוץ (לראות את הטבלה של חומרים). הבחנו כי בהשוואה לעכבר המעי הדק אורגנואידים, המעי הדק אורגנואידים האדם קשה יותר לשבש. - הסר ככל האפשר מדיום מבלי להפריע את התאים, ואז להשעות מחדש את הגלולה עם מטריצה הנשמרת ב 4 ° c; 200 – 300 μL של מטריצה לכל טוב של צלחת שש היטב נדרש. אורגנואידים צריך להתחלק אחד בשלושה כדי לשמור על צפיפות תאים גבוהה למדי.
- צלחת האורגנואידים ב מטריקס טיפות של כ 5 – 10 μL כל אחד בבאר של שישה היטב צלחת. דגירה של 20 – 30 דקות ב 37 ° צ' ולאחר מכן להוסיף בינונית הרחבה (OME) על גבי.
- לשנות את המדיום כל 2 – 3 ימים.
הערה: בתוך כ 5 – 7 ימים, אורגנואידים גדל EM להגיע לגודל של 100 – 200 יקרומטר ומוכנים להזרקה. - כדי להבדיל את האורגנואידים, לאחר 5 – 6 ימים ב-EM, לשנות את המדיה לבידול מדיה (מיט) תנאים ולשמור עבור 5 – 6 ימים נוספים לפני הזרקת טפילים.
הערה: להרחבת האורגנואידים, מומלץ לגלויית האורגנואידים בצפיפות. להזרקה, השימוש בצלחת בעלת שש מיטב מומלץ כאשר מצופה אורגנואידים בצפיפות פחותה. לדוגמה, מארגני צלחות משלוש בארות של צלחת שש-היטב לצלחת שש-היטב מלאה לזריקות מיקרו. יש לשמור על מטריקס ב-20 ° c לאחסון ארוך טווח ולהפשיר ב-4 ° צ' או על קרח לפני השימוש. התרחבות של מארגני הריאות נעשית באופן דומה, אך באמצעות רכיבי מדיה ספציפיים מסוג אורגאיד (טבלה 1)8 .
- לשמור על אורגנואידים בתרבויות תלת-ממד במטריצה מלבינה (ראה את שולחן החומרים) ב-37 ° c. הוסף מדיית הרחבה (OME) למעלה ורענן כל יום.
4. הזרקה של המיקרוציסטות/ספוראוזוטים לתוך האורגאיד לומן
-
הכנסת טפילים לתוך הצד האפירשמי של האורגאיד התלת-ממדי (איור 2).
- הכינו נימים זכוכית של קוטר 1 מ"מ באמצעות פולר מיקרופיפטה.
הערה: הגדרות המשמשות על פולר מיקרופיפטה (ראה טבלת חומרים) הם: חום = 663, משוך = 100, מהירות = 200, Time = 40 ms. הגדרות יהיה צורך לכוונן בהתאם להוראות המשתמש עבור מחשב מסוים. - חותכים את קצה הקפילר עם מלקחיים. גודל/קוטר של הקצה הנימי צעדים על 9 – 12 μm; זה מאפשר זרימה קלה של אאוציסטות (4 – 5 יקרומטר גודל).
- מילוי נימי עם oocyst או השעיה sporozoite באמצעות מיקרו-מטעין טיפים.
- העמיסו את הנימי המלא של האוציסטה על מיקרו-מזרק.
- מיקרו הזרקת 100 – 200 nL השעיה לתוך כל אורגאיד תחת מיקרוסקופ הפוך בהגדלה 5x, שמירה על קבוע הלחץ. לאחר המיקרו הזרקה, רענן מדיה עם OME או OMD כל יום ולשמור על הצלחת ב 37 ° c.
הערה: אנחנו לא משתמשים. במיקרומניפולציה להזרקת מיקרו השימוש באותו נימי מומלץ לניסוי כולו כדי להבטיח הזרקה שווה בכל מדגם.
- הכינו נימים זכוכית של קוטר 1 מ"מ באמצעות פולר מיקרופיפטה.
5. כתמים מאימונולואורנציה של אורגנואידים
- לאסוף אורגנואידים (1 – 2 x 24 בארות) עם פיפטה P1000 לתוך שפופרת 15 מ"ל המכילים קר F12 + + +.
- כדור מאורגנואידים ב 300 x g עבור 2 דקות, להסיר את supernatant מבלי לשבש את הגלולה, ובעדינות ללטף את הגלולה רופף לתוך הנפח שנותר.
- הוסף 5 מ ל 2% פאראמפורמלדהיד ב PBS. כדי למנוע מהאורגנואידים לדבוק בקיר לא להפוך את הצינור. אפשר לאורגנואידים להתיישב בתחתית הצינור ולתקן ב -4 ° c ללילה או 1 h בטמפרטורת החדר.
- הסר את הקיבעון והוסף 10 מ ל של מאגר חדירות (0.2% טריטון ב-PBS).
- סובב את הצינור בטמפרטורת החדר במשך 20 דקות (זה מבטיח שכל האורגנואידים יישארו בהשעיה).
- גלולה האורגנואידים ב 300 x g עבור 2 דקות, ולאחר מכן למחוק את supernatant.
- השהה מחדש את האורגנואידים בעדינות ב-500 μL לחסימת פתרון (עיין בטבלת החומרים) והעבר לשפופרת מיקרוצנטריפוגה של 2 מ"ל.
- דגירה של 20 דקות בטמפרטורת החדר על שייקר. אפשר לאורגנואידים להתיישב. בתחתית הצינור בכוח הכבידה החלף את פתרון חסימת עם פתרון הנוגדן העיקרי (ראה טבלת חומרים) ו דגירה עבור 1-2 h בטמפרטורת החדר או לילה ב 4 ° c.
- כביסה 3x עם PBS המכיל 0.1% רצף. תן לאורגנואידים להתיישב בכל. פעם ולהסיר את הסופרנטאנט
- הוסף פתרון נוגדן משני (לראות את הטבלה של חומרים) ו הדגירה עבור 2 h בטמפרטורת החדר.
- כביסה 3x עם PBS המכיל 0.1% רצף. השאר 50 μL של הערוץ הPBS אחרי השטיפה השלישית.
- הר על השקופית על ידי ליטוף האורגנואידים הושעה 50 μL של PBS בשקופית. להסיר את העודפים PBS, להוסיף טיפה של סוכן להרכבה (לראות את הטבלה של חומרים) ולהוסיף את הכיסויים למעלה. סגרו את הצדדים בלק ציפורניים. ותנו לו להתייבש
6. בידוד של אוציסטות מאורגנואידים
- לבודד ציסטות שנוצרו מחדש מן הלוומאיד לומן.
הערההשימוש בציסטות מבודדות מהאורגנואידים על-ידי הפרדה אימונוגנטית באמצעות ערכת בידוד אוציסטה (ראה הרשימת חומרים) עם השינויים המתוארים להלן. ניתן לנתח את האוציסטות הבודדות באמצעות מיקרוסקופ מיקרוסקופי ואלקטרון.- התחל עם אורגנואידים הבדיל כי כבר נשמר OMD עבור 5 – 7 ימים, כי הם נגועים, נגוע ביום 1 ו נגוע 5 ימים. השתמש בשניים הראשונים כפקדים שליליים.
הערה: מצאנו כי אורגנואידים הבדיל לייצר יותר באוציסטות מאשר ריאות או הרחבת אורגנואידים מעיים10. - לאסוף אורגנואידים לתוך 15 שפופרות צנטריפוגה mL. צנטריפוגה את האורגנואידים עבור 20 דקות ב 3,000 x g ו-10 ° c.
הערה: זה מהירות גבוהה נדרשת כדי לוודא שאין אאוציסטות יאבדו מתוך כל אורגנואידים שעלולים להישבר. - הסר את המדיה הארגונית והחלף אותו ב-5 מ ל של מים.
- משבשים את האורגנואידים על ידי הפיתיקות הנמרצת עם זכוכית מלוטשת-אש פסטר.
- אם הגושים גלויים, העבר את ההשעיה הארגונית לזכוכית הומוגניאיד, והומוטואידים עד שהאורגנואידים מובחים היטב. . ההומוגנידה לא תשפיע על האוציסטות
- ברגע שאין גושים גלויים, להוסיף 5 מ ל של מאגר A מתוך ערכת הבידוד oocyst. לערבב ולאחר מכן להוסיף 120 μL של חרוזים מגנטיים מצופה עם אנטי oocyst IgM.
- דגירה ההשעיה התא וחרוזים מגנטיים עבור 2 h בטמפרטורת החדר עם ערבוב רציפה על פלטפורמת נדנדה.
- בסוף הדגירה, מניחים את הצינורות המכילים תאים וחרוזים על מתלה הפרדה מגנטית מיועד 15 שפופרות mL.
- לסובב את הצינורות בארון הפרדה מגנטי ידנית עבור 3 דקות. החרוזים יהיה לדבוק בצד של הצינור ליד המגנט.
- בזהירות, עם פיפטה של 10 מ ל, הסירו את הסופרנטאנט מהחרוזים. השהה מחדש את החרוזים ב-450 μL של מאגר B והעבר לשפופרת מיקרוצנטריפוגה של 1.5 mL.
הערה: שמור על הסופרנטאנט עד. שבידוד האוציסטות יאושר - כדי לאסוף את כל החרוזים הנותרים oocysts, לשטוף את 15 מ"ל שפופרת עם 450 μL של מאגר B ולהוסיף את זה לשטוף את החרוזים מגנטי בצינור המיקרוצנטריפוגה.
- חזור על השלב 6.1.11 פעם אחת נוספת. כל החרוזים והאוציסטות שנתפסו צריכים עכשיו להיות מועברים לצינור המיקרוצנטריפוגה.
- מניחים את צינורית המיקרוצנטריפוגה על ארון הפרדה מגנטי המיועד להחזקת צינורות מיקרו-צנטריפוגה.
- סובב את הצינור בארון ההפרדה המגנטי ביד במשך 3 דקות.
- הסירו בזהירות את הסופרנטנט. עם הפיפטה לצינור חדש
הערה: שמור על הסופרנטאנט עד. שבידוד האוציסטות יאושר - הסר את צינורית המיקרוצנטריפוגה המכילה חרוזים מגנטיים ואוציסטות ממדף ההפרדה המגנטי.
- הוסף 100 μL של 0.1 N HCl לחרוזים מגנטיים כדי לבטל את החרוזים. . מערבולת ל -30 מנות
הערה: יש להגדיר את vortexer כמעט פחות ממהירות מקסימלית. - מודטה את החרוזים ב 0.1 N HCl עבור 10 דקות בטמפרטורת החדר.
- . שוב מערבולת ואז מניחים את הצינורית. על מתלה ההפרדה המגנטי המתן לחרוזים לדבוק בצד של הצינור ולאחר מכן להעביר את supernatant צינור מיקרוצנטריפוגה חדש.
- חזור על הצעדים 6.1.17 דרך 6.1.19 ולשלב את משחרל השני עם הראשון לאחד.
- לנטרל את להתחמק עם 20 μL של 1 N NaOH, או אחר לנטרל מאגר כגון 1 M טריס, pH 8.
- כדי לספור אאוציסטות, לקחת 10 μl של להתחמק, לשלב אותו עם 10 μl של נוגדן ספציפי אאוציסטות (ראה טבלת חומרים) ולספור אוציסטות פלורסנט על הומוציטוטומטר.
הערה: ניתן לאחסן האוציסטות מבודדות ב -4 ° c או בשימוש מיידי לצורך הדמיה של מיקרוסקופ או מיקרוסקופיה אלקטרונים.
- התחל עם אורגנואידים הבדיל כי כבר נשמר OMD עבור 5 – 7 ימים, כי הם נגועים, נגוע ביום 1 ו נגוע 5 ימים. השתמש בשניים הראשונים כפקדים שליליים.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
הפרוטוקולים המוצגים כאן התוצאה היא טיהור יעיל של האוציסטות והספורזוטים (איור 1A) מוכן הזרקת מיקרו. הפרוטוקול בתחנת המשטרה מביא לשחרורו של הספוראוזוטים מ-70%-80% מהציסטות, ולכן חיוני לסנן את שאר הפגזים והצדפים דרך מסנן של 3 יקרומטר. הסינון מביא כמעט 100% לטיהור הספוראוזוט (איור 1B). יתר על כן, תוספת של צבע ירוק מסייע להבטיח הזרקה של כל האורגנואידים ומאפשר ויזואליזציה של אורגנואידים מוזרק לפחות עבור 24 שעות לאחר ההזרקה (איור 2B).
פרוטוקולים אלה להכנת האוציסטות ו sporozoites הם פשוטים ושימשו במשך שנים רבות, כך הוא צפוי כי אאוציסטות הטיפול ומטוהרים הספוראוזוטים יהיה בר קיימא וזיהומיות. עם זאת, במחקרים שלנו, השתמשנו בסריקת אלקטרון מיקרוסקופ כדי להבטיח כי תהליך התחנה לא יזיק את הספוראוזוענים או אאוציסטות (איור 2a)10. הזרקה של כמויות שוות של אאוציסטות לתוך לומן אורגנואיד יכול להיות מאושר באופן חזותי על ידי הדמיה מיקרוסקופיים פשוטה (איור 2c). חלק של אורגנואידים נגועים צריך להיות מוגדר כדי לוודא התפשטות טפיל על ידי PCR כמותי כפי שתיארנו10.
התקדמות דרך מחזור החיים טפיל יכול להיות מדמיין על ידי אוסף של הנגועים בנקודות זמן שונות לכתוב זיהום וניתוח על ידי שידור אלקטרון מיקרוסקופ או על ידי immunofluorescence בשילוב עם 4 ′, 6-diamidino-2-פניינילידול ( DAPI) כתמים של גרעיני טפיל10. לדוגמה, ניתן להשתמש בנוגדנים לאנטיגנים merozoite פני השטח, כגון gp40 ו-gp1517 לזיהוי שלבי המרמונט; סוג אני meronts יהיו 8 גרעינים וסוג II meronts, 4 גרעיני10. לאחרונה, פאנל של נוגדנים חד-שבטיים ספציפיים לטרופוזוטים, merozoites, סוג I לעומת II meronts, ו macrogamonts הפך להיות זמין18. נוגדנים אלה יהיה גם יעיל מאוד לסמן את ההתקדמות של הטפיל באמצעות שלבים מחזור החיים השונים של האורגנואידים.
Immunofluorescence יכול לשמש גם כדי לחקור איזה סוגי תאים נגועים בקריפטוספורידיום. זה היה חשוב במיוחד להסתכל באורגנואידים דרכי הנשימה כמו מעט מאוד ידוע על cryptosporidiosis הנשימה, ואת התא המארח המדויק עבור הטפיל לא היה ידוע. אנו מתנהלים אימונוofluoras, מאמר על קריפטוספורידיוםנגוע אורגנואידים, שיתוף לוקליזציה CC10, סמן לתאי מועדון ומצא כי Cryptosporidium הנגועים הן CC10-שלילי וחיובי תאים (איור 3). תוצאות אלה אומתו על ידי המים שבו הבחנו הצפנת הצפנה הדבקת תאים שאינם הפרשה בתאי נתיב האוויר10.
לאחר אורגנואידים הבדיל נדבקו במשך חמישה ימים, צריך להיות מספר משמעותי של אאוציסטות להיות מיוצר. בידיים שלנו, זיהום של אורגנואידים מ 1 6-צלחת הבאר הניב על 4000 oocysts, אשר ניתן לזהות בקלות ולספור על הפציטוטומטר על ידי תיוג עם נוגדן מסוים oocysts. הנוכחות של ארבעה sporozoites ב אאוציסטות יכול להיות מאושר על ידי ייבוש חלק של אאוציסטות על שקופית דבק, תיקון עם מתנול ושילוב dapi מכתים עם נוגדן ספציפי אאוציסטות (איור 4). אימות של ייצור של אוציסטות עבות מוקפת חומה יכול להתבצע על ידי ניתוח TEM10.
איור 1: הכנה וטיהור של ציסטות הצפנה ומגנטים. (א) ייצוג סכמטי של השיטה המשמשת להכנת האוציסטה והכנת הספוראוזוט לזיהום. (ב) תמונה המציגה בתחנת מחוץ למבחנה של האוציסטות. סינון הקליפות והצדפים הבלתי-מרוגזים נותן פתרון מטוהר של הספוראוזוטים. סרגל קנה מידה = 10 μm. נא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: מיקרוהזרקה של האוציסטות לתוך אורגאיד לומן. דמות זו השתנתה מ Heo et al.10. (א) סריקת תמונות של מיקרוסקופ אלקטרוני (SEM) של האוציסטות והספורזוניטים. (ב) הצגת התמונה מראה המוזרקים. הצבע הירוק מסייע להמחיש את ההזרקה של כל אורגנואיד וממשיך לאורך לפחות 24 שעות (ג) תמונה של אורגאיד מוזרק עם אוציסטות. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: התמונה החיסונית של הקריפטוספורידיוםהנגועה בטיפול בדרכי הנשימה. Mucin מתויג עם anti-mucin 5 נוגדנים (אדום) לומן האורגאיד, תאי מועדון מתויגים עם anti-CC10 (צהוב), Cryptosporidium מזוהה עם נוגדן ספציפי oocyst (ירוק), גרעיני התא הם מוכתמים dapi (כחול). פאנל ב' הוא הגדלה של האזור המצוין במשבצת בלוח A. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: הדימוי הimmunofluorescence של האוציסטה מבודד בידי אורגנואידים מעיים הבדיל. הקיר oocyst מתויג עם נוגדן ספציפי oocyst בירוק וארבעת הגרעינים sporozoite הם דמיינו עם DAPI (כחול) אנא לחץ כאן כדי לצפות בגירסה גדולה יותר של איור זה.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
תרבות של הצפנת הצפנה טפילים במעי ואורגנואידים הנשימה מספק מודל מדויק ללמוד אינטראקציות מארח טפיל10 אבל יש גם יישומים רבים אחרים. לדוגמה, השיטות הנוכחיות של בחירת והפצת הצפנה מהונדסים גנטית טפילים דורשים מעבר בעכברים19 אשר אינו מאפשר בידוד של טפילים כי יש שינויים חיוניים עבור זיהום vivo. תרבות אורגאידית של קריפטוספורידיום מספקת חלופה לפרוצדורה זו. עם זאת, ציינו כי הספוראוזוטים האלקטרו-מגנטים מאוחדים וחוסמים את המיקרופיפטה. לצורך בחירת טפילים מהונדסים גנטית, אורגנואידים ניתן לגדל על מצופה קולגן טרנסבארות בפורמט דו מימדי תחת תנאי הבדלה כדי לאפשר זיהום עם הספורטים מזוהמים וכתוצאה מכך הבחירה של האוציסטות ששונו גנטית. הטרנסבארות מאפשרות גישה הן למשטחים האפולביים והן למשטח הבזלת ויציבים לפרקי זמן ארוכים.
כיום, אנו אורגנואידים התרבות בפורמט דו מימדי עבור הקרנת תפוקה גבוהה של תרופות עבור רקמות הסרטן הנגזרות (נתונים שלא פורסמו). שיטה זו של תרבות ארגונית יכול להיות גם מותאם לבדיקה של תרופות נגדהצפנה באמצעות גנטית שונה לוציפראז מתויג הצפנה זנים19. יתר על כן, למרות הזיהום אינו מסונכרן הדוק, זיהום של אורגנואידים עם sporozoites מספק סנכרון מספיק של מחזור החיים כי תרופות ניתן לבדוק את היעילות שלהם נגד שלבים מחזור חיים ספציפיים.
מערכות שיתוף תרבות אורגאיד מפותחות כעת בהתחשב בהיבטים אחרים של המערכת המארחת כגון microbiota ותאים חיסוניים20. לפיכך, היכולת לנתח את האינטראקציות בין הטפיל והתאים המארחים, תאים חיסוניים ומיקרוביוטה יהיו אפשריים בקרוב בתוך מבחנה. מניפולציה גנטית של קריפטוספורידיום הוא גם כעת אפשרי19, ואת השילוב של זנים של כתב פלורסנט של cryptosporidium ותרבות אורגאידית תספק את הכלים עבור רצף תא בודד של תאים נגועים, ו אפילו יותר במיוחד רצף התא בודד של תאים נגועים בשלבים ספציפיים של הטפיל.
הצלחת הניסויים המתוארים כאן תלויה מאוד ביכולת הכדאיות והנגועים של האוציסטות. קבוצות שונות של הצפנת הצפנה ניתן לשנות באופן נרחב בתעריפי התחנה ואת היכולת להדביק תאים מארחים. תשואות מספיקות של הספוראוזוטים תלויות בתעריפי התחנה הטובים ושיעור התחנה אינו מתאם תמיד לנגועים. אם רמות נמוכות של זיהום או תחנת המשטרה המסכנה נצפו עם אצווה מסוימת של אאוציסטות, זמן ומאמץ ניתן לשמור על ידי קבלת הרבה חדש של אאוציסטות במקום לנסות להגדיל את מספרי אאוציסטות, או התארכות פעמים דגירה.
מדיית תרבות ארגונית צריכה להיות מרעננת כל יום חלופי. מומלץ להשתמש בקטעים מוקדמים יותר של תרבויות אורגנואיד. חשוב להפשיר בקבוקון חדש של אורגנואידים אם אורגנואידים להתחיל להבדיל בקטעים מאוחרים יותר כבריאות של תרבויות אורגנואיד במידה רבה לקבוע הכדאיות של הטפיל. לאחר ההדבקה, יש לרענן מדיה ארגונית מדי יום כדי למנוע הצטברות של חומרים רעילים במדיה.
תרבות אורגאידית של קריפטוספורידיום מוגבלת כי הטפיל לא ניתן להפיץ ללא הגבלת זמן, ואת הזיהום פיטרס לאחר שלושה מעברים מעל 28 ימים10. הזרקה של מיקרונואידים מספיק עבור ניסויים בעכבר כגון שתיארנו יכול להיות זמן רב ומפרכת פיזית. אף על פי כן, עד היום, שום שיטה אחרת מאפשרת את מחזור החיים המלא במערכת החוץ לחלוטין מייצג את הזיהום האנושי, ואין שום מערכת התרבות שתוארה מאפשר חקירה של אינטראקציות מארח-הפתוגן חשוב עבור דלקת בדרכי הנשימה. התרבות האורגאידית של Cryptosporidium מספקת כלי חדש ורב עוצמה שפותח את שדרות המחקר לתוך אינטראקציות מארח-טפיל לא אפשרי בעבר הקריפטוספורידיום.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
. למחברים אין מה לגלות
Acknowledgments
אנו אסירי תודה לדבורה א. שפר מבית הספר של בעלי חיים ומדעי ביורפואי השוואתי, המכללה לחקלאות ומדעי החיים, אוניברסיטת אריזונה, טוסון, AZ, ארה ב על שסייע לנו עם ייצור וניתוח הoocyst. כמו כן, אנו מודים לגבי מיקרוסקופ ומרכז ההדמיה ו-d. d Mullendore באוניברסיטת וושינגטון לקראת הכנה והדמיה של ציסטות מבודדות של אורגנואיד.
D.D. הוא המקבל של מענק בני מארגון הולנד למחקר מדעי (NWO-ALW, 016.171.015). I.H. הוא המקבל של מענק בני מארגון הולנד למחקר מדעי (NWO-ALW, 863.14.002) ונתמך על ידי מלגות מארי קירי מהוועדה האירופית (הצעה 330571 FP7-אנשים-2012-IIF). המחקר המוביל לתוצאות אלה קיבל מימון ממועצת המחקר האירופית תחת הסכם מתקדם המענק של ERC no. 67013 ו-NIH NIAIH תחת R21 AT009174 כדי RMO. עבודה זו היא חלק ממכון Oncode, אשר ממומן חלקית על ידי האגודה ההולנדית לסרטן ומומן על ידי מענק של האגודה ההולנדית לסרטן.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Basement membrane extract (extracellular matrix) | amsbio | 3533-010-02 | |
| Crypt-a-Glo antibody (Oocyst specific antibody) | Waterborne, Inc | A400FLR-1X | Final Concentration = Use 2-3 drops/slide |
| Crypto-Grab IgM coated Magnetic beads | Waterborne, Inc | IMS400-20 | |
| Dynamag 15 rack | Thermofisher Scientific | 12301D | |
| Dynamag 2 rack | Thermofisher Scientific | 12321D | |
| EMD Millipore Isopore Polycarbonate Membrane Filters- 3µm | EMD-Millipore | TSTP02500 | |
| Fast green dye | SIGMA | F7252-5G | |
| Femtojet 4i Microinjector | Eppendorf | 5252000013 | |
| Glass capillaries of 1 mm diameter | WPI | TW100F-4 | |
| Matrigel (extracellular matrix) | Corning | 356237 | |
| Microfuge tube 1.5 mL | Eppendorf | T9661-1000EA | |
| Micro-loader tips | Eppendorf | 612-7933 | |
| Micropipette puller P-97 | Shutter instrument | P-97 | |
| Normal donkey Serum | Bio-Rad | C06SB | |
| Penstrep | Gibco | 15140-122 | |
| Sodium hypoclorite (use 5%) | Clorox | 50371478 | |
| Super stick slides | Waterborne, Inc | S100-3 | |
| Swinnex-25 47 mm Polycarbonate filter holder | EMD-Millipore | SX0002500 | |
| Taurocholic acid sodium salt hydrate | SIGMA | T4009-5G | |
| Tween-20 | Merck | 8221840500 | |
| Vectashield mounting agent | Vector Labs | H-1000 | |
| Vortex Genie 2 | Scientific industries, Inc | SI0236 | |
| Adv+++ (DMEM+Penstrep+Glutamax+Hepes) | Final amount | ||
| DMEM | Invitrogen | 12634-010 | 500 mL |
| Penstrep | Gibco | 15140-122 | 5 mL of stock in 500 mL DMEM |
| Glutamax | Gibco | 35050038 | 5 mL of stock in 500 mL DMEM |
| Hepes | Gibco | 15630056 | 5 mL of stock in 500 mL DMEM |
| INTESTINAL ORGANOID MEDIA-OME (Expansion media) | Final concentration | ||
| A83-01 | Tocris | 2939-50mg | 0.5 µM |
| Adv+++ | make up to 100 mL | ||
| B27 | Invitrogen | 17504044 | 1x |
| EGF | Peprotech | AF-100-15 | 50 ng/mL |
| Gastrin | Tocris | 3006-1mg | 10 nM |
| NAC | Sigma | A9125-25G | 1.25 mM |
| NIC | Sigma | N0636-100G | 10 mM |
| Noggin CM | In house* | 10% | |
| P38 inhibitor (SB202190) | Sigma | S7076-25 mg | 10 µM |
| PGE2 | Tocris | 2296/10 | 10 nM |
| Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | 1 mL/500 mL media |
| RSpoI CM | In house* | 20% | |
| Wnt3a CM | In house* | 50% | |
| In house* - cell lines will be provided upon request | |||
| INTESTINAL ORGANOID MEDIA-OMD (Differentiation media) | To differentiate organoids, expanding small intestinal organoids were grown in a Wnt-rich medium for six to seven days after splitting, and then grown in a differentiation medium (withdrawal of Wnt, nicotinamide, SB202190, in a differentiation medium (withdrawal of Wnt, nicotinamide, SB202190, prostaglandin E2 from a Wnt-rich medium or OME) | ||
| LUNG ORGANOID MEDIA- LOM (Differentiation media) | Final concentration | ||
| Adv+++ | make up to 100 mL | ||
| ALK-I A83-01 | Tocris | 2939-50mg | 500 nM |
| B27 | Invitrogen | 17504044 | 0.0763888889 |
| FGF-10 | Peprotech | 100-26 | 100 ng/mL |
| FGF-7 | Peprotech | 100-19 | 25 ng/mL |
| N-Acetylcysteine | Sigma | A9125-25G | 1.25 mM |
| Nicotinamide | Sigma | N0636-100G | 5 mM |
| Noggin UPE | U-Protein Express | Contact company directly | 10% |
| p38 MAPK-I | Sigma | S7076-25 mg | 1 µM |
| Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | 1:500 |
| RhoKI Y-27632 | Abmole Bioscience | M1817_100 mg | 2.5 µm |
| Rspo UPE | U-Protein Express | Contact company directly | 10% |
| Reducing buffer (for resuspension of oocysts and sporozoites for injection) | Final concentration | ||
| L-Glutathione reduced | Sigma | G4251-10MG | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
| Betaine | Sigma | 61962 | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
| L-Cysteine | Sigma | 168149-2.5G | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
| Linoleic acid | Sigma | L1376-10MG | 6.8 μg/mL of OME/OMD /LOM |
| Taurine | Sigma | T0625-10MG | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
| Blocking buffer (for immunoflourescence staining) | Final concentration | ||
| Donkey/Goat serum | Bio-Rad | C06SB | 2% |
| PBS | Thermo-Fisher | 70011044 | Make up to 100 mL |
| Tween 20 | Merck | P1379 | 0.1% |
| List of Antibodies used | |||
| Alexa 568 goat anti-rabbit | Invitrogen | A-11011 | Dilution-1:500; RRID: AB_143157 |
| Crypt-a-Glo Comprehensive Kit- Fluorescein-labeled antibody Crypto-Glo | Waterborne, Inc | A400FLK | Dilution- 1:200 |
| Crypta-Grab IMS Beads- Magnetic beads coated in monoclonal antibody reactive | Waterborne, Inc | IMS400-20 | Dilution-1:500 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D1306 | Dilution-1:1,000; RRID : AB_2629482 |
| Phalloidin-Alexa 674 | Invitrogen | A22287 | Dilution-1:1,000; RRID: AB_2620155 |
| Rabbit anti-gp15 antibody generated by R. M. O’Connor (co-author). | Upon request | Upon request | Dilution-1:500 |
| Sporo-Glo | Waterborne, Inc | A600FLR-1X | Dilution- 1:200 |
References
- Checkley, W., et al. A review of the global burden, novel diagnostics, therapeutics, and vaccine targets for Cryptosporidium. The Lancet Infectious Diseases. 15 (1), 85-94 (2015).
- Bones, A. J., et al. Past and future trends of Cryptosporidium in vitro research. Experimental Parasitology. 196, 28-37 (2018).
- Muller, J., Hemphill, A. In vitro culture systems for the study of apicomplexan parasites in farm animals. International Journal for Parasitology. 43 (2), 115-124 (2013).
- Karanis, P., Aldeyarbi, H. M. Evolution of Cryptosporidium in vitro culture. International Journal for Parasitology. 41 (12), 1231-1242 (2011).
- Morada, M., et al. Continuous culture of Cryptosporidium parvum using hollow fiber technology. International Journal for Parasitology. 46 (1), 21-29 (2016).
- DeCicco RePass, M. A., et al. Novel Bioengineered Three-Dimensional Human Intestinal Model for Long-Term Infection of Cryptosporidium parvum. Infection and Immunity. 85 (3), (2017).
- Miller, C. N., et al. A cell culture platform for Cryptosporidium that enables long-term cultivation and new tools for the systematic investigation of its biology. International Journal for Parasitology. 48 (3-4), 197-201 (2018).
- Sachs, N., et al. Long-term expanding human airway organoids for disease modelling. bioRxiv. , https://www.biorxiv.org/content/early/2018/05/09/318444 (2018).
- Dutta, D., Clevers, H. Organoid culture systems to study host-pathogen interactions. Current Opinion in Immunology. 48, 15-22 (2017).
- Heo, I., et al. Modelling Cryptosporidium infection in human small intestinal and lung organoids. Nature Microbiology. 3 (7), 814-823 (2018).
- Dutta, D., Heo, I., Clevers, H. Disease Modeling in Stem Cell-Derived 3D Organoid Systems. Trends in Molecular Medicine. 23 (5), 393-410 (2017).
- Clevers, H. Modeling Development and Disease with Organoids. Cell. 165 (7), 1586-1597 (2016).
- Sato, T., et al. Long-term expansion of epithelial organoids from human colon, adenoma, adenocarcinoma, and Barrett's epithelium. Gastroenterology. 141 (5), 1762-1772 (2011).
- O'Hara, S. P., Chen, X. M. The cell biology of Cryptosporidium infection. Microbes and Infection. 13 (8-9), 721-730 (2011).
- Lendner, M., Daugschies, A. Cryptosporidium infections: molecular advances. Parasitology. 141 (11), 1511-1532 (2014).
- Feng, H., Nie, W., Sheoran, A., Zhang, Q., Tzipori, S. Bile acids enhance invasiveness of Cryptosporidium spp. into cultured cells. Infection and Immunity. 74 (6), 3342-3346 (2006).
- O'Connor, R. M., Kim, K., Khan, F., Ward, H. Expression of Cpgp40/15 in Toxoplasma gondii: a surrogate system for the study of Cryptosporidium glycoprotein antigens. Infection and Immunity. 71, 6027-6034 (2003).
- Wilke, G., et al. Monoclonal Antibodies to Intracellular Stages of Cryptosporidium parvum Define Life Cycle Progression In Vitro. mSphere. 3 (3), (2018).
- Vinayak, S., et al. Genetic modification of the diarrhoeal pathogen Cryptosporidium parvum. Nature. 523 (7561), 477-480 (2015).
- Dijkstra, K. K., et al. Generation of Tumor-Reactive T Cells by Co-culture of Peripheral Blood Lymphocytes and Tumor Organoids. Cell. 174 (6), 1586-1598 (2018).
