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Cancer Research

환자 전립선암 뼈 전이 표본 및 이종이식에서 파생된 3차원(3D) 오르가노이드의 설립 및 분석

Published: February 3, 2020 doi: 10.3791/60367

Summary

환자 BMPC 견본및 뼈 전이성 전립선암의 이종이식의 3차원 배양은 낭종, 스페로이드 및 복잡한, 종양 같이 organoids의 결과로 그들의 본래 종양의 기능적인 이질성을 유지합니다. 이 원고는 IFC를 사용하여 이기종 환자 유래 샘플 및 이들의 분석의 3D 배양에 대한 최적화 전략 및 프로토콜을 제공한다.

Abstract

인간 환자의 종양 표본과 환자 유래 이종이식(PDX) 전립선암 모델에서 오가노이드의 3차원(3D) 배양, 환자 유래 오르가노이드(PDO)로 지칭되는, 종양 발생 과 전립선 암의 전이. 그들의 주요 장점은 기존의 세포주와 비교하여 본래 조직의 독특한 게놈 및 기능적 이질성을 유지한다는 것이다. 더욱이, PDO의 3D 배양은 개별 적인 환자에 대한 약물 치료의 효력을 예측하기 위하여 이용될 수 있고 개인화한 약을 향한 단계입니다. 이러한 장점에도 불구하고, 몇몇 단은 다른 참을성 있는 견본을 위해 요구될 수 있는 PDO 문화 조건의 광대한 최적화 때문에 부분적으로 이 방법을 일상적으로 이용합니다. 우리는 이전에 우리의 전립선암 뼈 전이 PDX 모델, PCSD1, 항 안드로겐 치료에 기증자 환자의 뼈 전이의 저항을 재입증했다. 우리는 항 안드로겐 저항의 메커니즘을 더 특성화하기 위해 PCSD1 3D 오르가노이드를 사용했습니다. PDX 및 PDO 모델에 대한 현재 발표된 연구에 대한 개요에 따라 최적화된 배양 조건에서 돔형 또는 부동 지하 멤브레인(예: Matrigel) 구를 사용하여 PDO의 3D 배양에 대한 단계별 프로토콜을 설명합니다. 생체 내 스티치 이미징 및 세포 가입은 세포학에 대해서도 설명되어 있다. 이 프로토콜은 웨스턴 블롯, 공동 배양 등을 포함한 다른 응용 분야에 더욱 최적화될 수 있으며 약물 내성, 종양발생, 전이 및 치료법과 관련된 3D 배양 PDO의 특성을 탐구하는데 사용될 수 있다.

Introduction

3차원 배양 오르가노이드는 생체 내 아키텍처, 세포 기능 및 그들의 원래 조직의 유전적 서명을 되풀이할 수 있는 잠재력에 대해 관심을 끌고 있다1,2,3,4,5. 가장 중요한 것은, 환자 종양 조직 또는 환자 유래 이종이식 (PDX) 모델에서 설립 된 3D organoids는 종양 발생시 세포 신호의 메커니즘을 이해하고 각 세포집단6, 7,8,9,10,11,12,13에대한 약물 치료의 효과를 결정하는 귀중한 기회를 제공한다. Drost 등 5 는 비뇨기과 분야에서 널리 채택된 인간 및 마우스 전립선 오르가노이드의 확립을위한 표준 프로토콜을 개발했습니다. 또한, 3D 오르가노이드의 추가 특성화및 종양발생 및 전이의 상세한 기전을 이해하기 위해상당한 노력이 전념되어 왔다4,12,14,15. 3D 오르가노이드 배양에 대한 이전에 확립되고 널리 인정된 프로토콜 외에도 최적화된 배양 조건에서 세 가지 다른 도밍 방법을 사용하여 PDO의 3D 배양에 대한 단계별 프로토콜을 설명합니다.

이 원고에서, 3D 오르가노이드는 뼈 전이성 전립선암 (BMPC)의 ex vivo 모형으로 설치되었습니다. 이러한 배양에 사용되는 세포는 전립선암 샌디에이고(PCSD) 계열로부터 유래되었으며 환자 전립선암 뼈 전이성 종양 조직(PCSD18 및 PCSD22) 또는 환자 유래 이종이식(PDX) 종양 모델(PCSD1, PCSD13 및 PCSD17)으로부터 직접 유래하였다. 전립선암 세포의 자발적인 골 전이는 유전자 조작 마우스모델(16)에서드물기 때문에, 우리는 인간 종양 세포를 남성Rag2-/-γc-/- 마우스로 직접 대퇴내 주사하여 뼈 전이성 전립선암의 PDX 모델을확립하였다 17.

일단 3D 오르가노이드가 이질적인 환자 종양 세포 또는 환자 유래 이종이식에서 확립되면, 전립선 종양 세포로서의 그들의 정체성을 확인하고 3D 오르가노이드 배양에서 그들의 표현형을 결정하는 것이 필수적이다. 면역형광 화학(IFC)은 각 세포에서 의 단백질 발현을 시각화할 수 있게 하며, 종종 특정 세포 집단에 대한 잠재적인 기능을 나타내는2,4. 일반적으로 조직 및 세포를 포함한 대부분의 시료에 대한 IFC 프로토콜은 간단하고 완전히 최적화되어 있습니다. 그러나, 세포 밀도 및 오르가노이드의 수는 종래의 배양보다 현저히 낮을 수 있다. 따라서, 오르가노이드에 대한 IFC 프로토콜은 샘플의 모든 오르가노이드에 대해 파라핀에 적절한 처리 및 포함을 보장하기 위한 추가 단계가 필요합니다. 우리는 특히 오르가노이드의 샘플이 원하는 것보다 낮은 세포 밀도가있을 때 오르가노이드에 IFC의 성공률을 증가 슬라이드에 단면 오르가노이드의 위치를 표시하는 아가로스 사전 포함 과정에 대한 추가 단계를 설명하고.

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Protocol

이 연구는 캘리포니아 샌디에이고 대학 (UCSD) 기관 검토 위원회 (IRB)에 대한 가이드의 권고에 따라 엄격하게 수행되었다. IRB #090401 승인은 UCSD 기관 검토 위원회 (IRB)에서 연구 목적을 위해 환자에게서 외과 견본을 집합하기 위하여 수신되었습니다. 각 환자로부터 동의를 얻어 외과용 뼈 전립선암 전이 시편은 대퇴골의 병리학적 골절의 정형외과적 수리로부터 얻어졌다. 동물 프로토콜은 캘리포니아 샌디에이고 대학 (UCSD) 동물 복지 및 기관 동물 관리 및 사용위원회 (IACUC) 승인 된 프로토콜 #S10298 하에 수행되었습니다. 기계적 및 효소적 해리된 환자 종양 조직으로부터의 세포는 앞서설명한바와 같이 6 내지 8주 령 의 남성Rag2-/-및 γ c-/- 마우스로 내-대퇴로 주입되었다. 이종이식 종양 부피는 생체 내 생물 발광 이미징 시스템 및 캘리퍼스 측정을 사용하여 결정되었다. 종양 성장 시 최대 2.0 cm (IACUC에 의해 승인 된 최대 허용 크기), 종양은 3D 오르가노이드 확립을 위해 수확되었다.

참고: 그림 1은 실험 절차의 각 단계에 대한 3D 오가노이드 및 프로토콜 번호를 설정하기 위한 워크플로우를 보여 주며, 이에 대한 워크플로우를 보여 주다.

1. 환자 유래 이종이식(PDX) 종양 조직의 처리

참고: 이것은 이종이식 마우스 모델에서 파생된 종양에 대한 오르가노이드 확립을 위한 초기 단계이다. 이 프로토콜은 Drost et al.5에 의해 이전 간행물에서 적응하 고 우리는 organoid 매체에 혈 청 보충을 포함 하도록 미디어 조건을 수정 했습니다.

  1. 아래에 기재된 바와 같이 종양 시편을 처리한다.
    1. 종양 샘플을 1-3 mm3 크기의 조각으로 다진 후 실온에서 45 분 동안 10 mL의 세포 해리 액으로 샘플을 소화합니다.
    2. 소화를 종료하려면 샘플에 20 mL의 DMEM 완전 미디어를 추가합니다.
    3. 70 μm 세포 스트레이너를 통해 현탁액을 걸. 멸균 플런저 플랜지를 사용하여 남은 조직을 70 μm 세포 스트레이너 의 상단에 밀어 넣습니다.
    4. 4 °C에서 5 분 동안 300 x g에서 원심 분리기.
    5. 신선한 adDMEM 완전 매체로 세포 펠릿을 세 번 세척하십시오. 세척 및 재서스펜션용 용지의 볼륨을 표 3에제시된 용지 의 양과 일치시다. 예를 들어, 24웰 플레이트 배양 조건의 경우, 세척용 부피는 500 μL이어야 한다.
      참고: 표 3에나타낸 바와 같이 프로토콜은 다른 문화 조건에 적용할 수 있다.
    6. Trypan 파란색 염료와 혈세포계를 사용하여 최종 셀 수를 결정합니다.
    7. 세포 수를 얻은 후, 2 x 106 종양 세포 당 PBS에서 2% FBS의 80 μL에서 세포 펠릿을 다시 중단시켰다.
    8. 2 x 106 종양 세포 당 마우스 세포 고갈 칵테일 20 μL을 추가하십시오. 잘 섞고 2-8 °C에서 15 분 동안 배양하십시오.
    9. 2 x 106 종양 세포 당 PBS 완충액에서 2 % FBS로 500 μL로 볼륨을 조정하십시오.
      참고: 2.5 mL의 세포 현탁액에서 최대 1 x 107 종양 세포를 하나의 LS 컬럼에서 처리할 수 있습니다.
    10. LS 컬럼을 마그네틱 컬럼 분리기위에 로드하고 15mL 원엽 튜브를 랙 아래에 배치하여 흐름을 수집합니다.
    11. PBS 버퍼에서 3 mL의 2% FBS로 각 컬럼을 헹구고 있습니다. 세척 흐름으로 원엽 튜브를 버리고 새로운 멸균 된 15mL 원엽 튜브로 교체하십시오.
    12. 세포 현탁액 (1 x 107 종양 세포의 최대 2.5 mL)을 컬럼에 추가합니다. 인간 종양 세포로 농축될 흐름을 수집한다.
    13. PBS 버퍼에서 2% FBS의 1 mL로 컬럼을 두 번 세척합니다.
      참고: 열이 비어 있는 즉시 세척 단계를 수행하는 것이 중요합니다. 또한 기포가 형성되지 않도록하십시오.
  2. 원하는 배양 설정에 대한 1.5 mL 튜브에 적절한 양의 세포 현탁액을 Aliquot(표3).
  3. 1.5 mL 튜브를 300 x g및 4°C에서 5분 동안 원심분리한다.
  4. 조심스럽게 제거하고 상급을 폐기.

2. 환자 원발성 종양 조직의 처리

참고 : 이것은 오르가노이드 설립을위한 초기 단계입니다.

  1. 환자 1 차적인 종양 조직의 처리를 위해 필요하지 않은 마우스 세포 고갈 과정을 제외하고 1단계의 전부를 따르십시오.

3. 플레이트에 부착 된 둥근 돔 형성

참고: 이 원고는 그림 1 및 그림 2에 나타낸 바와 같이 세포 펠릿과 지하 막(예를 들어, 마트리겔)의 혼합물로부터 돔을 만드는 세 가지 방법을 설명합니다. 단계 2-4에서, 세포와 지하 막은 지하 막의 응고를 방지하기 위해 얼음에 보관되어야한다.

  1. 24웰 플레이트셋에 대해 적절한 부피의 지하막(예를 들어, 40 μL)으로 세포 펠릿을 재중단한다(표3).
  2. 피펫을 위아래로 부드럽게 하여 세포가 지하 막에 잘 다시 매달려 있는지 확인합니다.
  3. 세포-지하 막 혼합물의 적절한 부피(표3)를피펫(및 adDMEM 완전 배지의 선택적 10 μL)을 예열된 조직 배양 판의 중심으로 한다.
  4. 플레이트를 반전시키고 즉시 플레이트를CO2 세포 배양 인큐베이터에 거꾸로 놓고 5%CO2,37°C에서 15분 동안 설정하였다. 이것은 지하실 막이 고형화하는 것을 허용하면서 세포가 침전되고 플레이트 바닥에 고수하는 것을 방지합니다.
  5. 10 μM Y-27632 디하이드로클로라이드를 함유하는 미리 온난화배지의 적정 부피(표3)를각 웰내로 피펫한다.
  6. 플레이트를CO2 세포 배양 인큐베이터 내부에 오른쪽으로 놓습니다(5%CO2,37°C).
  7. 3-4일마다 미디어를 변경합니다. 5-7일 후, 배양배지를 10 μM Y-27632 디하이드로클로라이드 없이 사용하여 배양을 유지하였다.

4. 플레이트에 부착 된 둥근 돔에서 부동 돔 형성

  1. 3.7단계 후, 셀 스크레이퍼를 사용하여 돔을 분리한다.

5. 부동 구슬 형성

참고 : 이 프로토콜은 지하 막, 미디어 및 오르가노이드의 혼합물이 구슬처럼 보이기 때문에 부동 구슬로 명명됩니다.

  1. 파라핀 필름 의 2 인치 x 4 인치 조각을 잘라.
  2. 1000 μL 플라스틱 파이펫 팁 박스에서 빈 팁 홀딩 랙의 디봇 상단에 파라핀 필름을 놓습니다.
  3. 부드럽게 장갑 검지 손가락을 사용하여 디봇을 추적하기 위해 파라핀 필름을 아래로 누릅니다하지만 파라핀 필름을 뚫지 않고.
  4. 파라핀 필름을 70% 에탄올로 분무하고 세포 배양 후드에 UV 램프를 켜서 제조된 파라핀 필름을 30분 이상 살균하였다.
  5. 세포와 20 μL의 지하 막을 혼합하여 준비합니다. 파종 밀도는 돔당 50,000 - 250,000 셀일 수 있습니다.
  6. 피펫은 제조된 파라핀 막에서 형성된 디봇의 몰드 내로 1단계 또는 2단계, 및 20 μL의 지하막으로부터 처리된 세포의 혼합물이다.
  7. 지하 막에 세포 펠렛을 다시 중단하고 제조된 파라핀 촬영 디봇에서 세포 현탁액을 피펫한다.
  8. 고형 비즈와 파라핀 필름을 6웰 플레이트에 넣습니다. 6 웰 플레이트에 하나의 우물은 5 구슬까지 들어갈 수 있습니다.
  9. 10 μM Y-27632 디하이드로클로라이드를 함유하는 미리 가열된 배지의 피펫 3-5 mL을 각 우물에 넣고 파라핀 필름에서 구슬을 부드럽게 닦아냅니다.
    참고: 최소 볼륨으로 3mL를 권장합니다. 웰당 최대 비드 수(N=5)의 경우 중간 크기 5mL를 권장합니다.
  10. 플레이트를CO2 인큐베이터(5%CO2,37°C) 내부에 놓습니다.
  11. 3-4 일마다 오르가노이드 매체를 변경하십시오. 5-7일 후, 배양배지를 10 μM Y-27632 디하이드로클로라이드 없이 사용하여 배양을 유지하였다.

6. 현미경을 사용하여 생체 내 오르가노이드 이미지 스티치8

참고 : 특정 현미경은 세포 판 (가장자리 벽)의 외부 둘레에 도달 할 수 없습니다; 따라서 이미지 스티칭 할 때 셀 플레이트의 둘레에 가까운 웰을 사용하는 것이 좋습니다.

  1. 키ence 현미경의 플레이트 홀더에 세포 배양 판을 위쪽으로 놓습니다.
  2. 렌즈를 대상 돔의 중앙에 놓습니다.
  3. 프레임 수를 선택하여 자동 스티칭 프로세스를 설정합니다. 예를 들어 3 x 3 또는 5 x 5를 선택하여 총 9개의 이미지 또는 25개의 이미지를 생성할 수 있습니다.
  4. 캡처 버튼을 눌러 이미징 프로세스를 시작합니다.
  5. 이미지 뷰어 소프트웨어를 열고 4단계로 촬영한 이미지 그룹을 로드합니다.
  6. 이미지 스티칭을 클릭하여 고해상도 스티치 이미지를 만듭니다.
    참고: 직렬 9 또는 25개의 이미지 캡처는 셀에 초점을 맞추도록 수동 또는 자동 설정으로 수행할 수 있습니다.

7. 조직학을위한 오르가노이드 처리 : 아가로스 스핀 다운 방법

참고 :이 프로토콜은 블라코기아니스 외7에의해 이전 출판물에서 적응된다 . 우리는 성공적으로 오르가노이드의 모든 인구를 포함하기 위해 아가로즈 포함과 관련된 단계를 추가했습니다.

  1. 웰에서 기존 미디어를 제거합니다. 지하 멤브레인 돔을 흡인하지 않도록주의하십시오.
  2. 동일한(1단계에서 제거된 용지의 부피와 동일)을 추가하고 4°C에서 60분 동안 배양합니다.
  3. 파이펫을 사용하여 지하 멤브레인 돔을 빼내고 파이펫 팁을 사용하여 지하 멤브레인 돔을 분쇄합니다. 1.5 mL 튜브에서 해리 된 돔 및 세포 회수 용액을 수집합니다.
  4. 300 x g및 4 °C에서 5 분 동안 원심 분리기.
  5. 상급 (세포 복구 용액)을 제거하십시오. 최종 펠릿 단계에서 오르가노이드의 존재가 확인될 때까지 모든 상수체를 별도의 튜브에 저장합니다.
  6. 차가운 PBS의 원하는 부피(표3)를추가하고 기계적으로 펠릿을 방해하기 위해 위아래로 부드럽게 피펫을 피펫합니다.
  7. 300 x g및 4 °C에서 5 분 동안 원심 분리기.
  8. 상급체(PBS)를 제거합니다.
  9. 펠렛을 상온에서 60분 동안 4% PFA의 24웰 플레이트 배양 조건, 표 3으로부터1개의 펠렛에 대해 일치하는 부피(예를 들어, 500 μL)로 고정한다.
  10. 고정 후, 300 x g및 4°C에서 5분 동안 원심분리기를.
  11. 상급체(PFA)를 제거합니다.
  12. 일치하는 부피(예를 들어, 24웰 플레이트 배양 조건, 표 3)에서1개의 펠릿에 대해 300 x g 및 4°C에서 5분 동안 세척한다.
  13. 따뜻한 아가로즈 (PBS에서 2 % 아가로즈)를 준비하십시오.
    참고: 여기서, 동결된 단면도에 대한 세포 펠릿은 프로토콜 7에서 추가단계 없이 OCT 화합물의 200 μL에서 직접 재부유될 수 있다.
  14. 아가로스의 200 μL에서 세포 펠릿을 다시 일시 중단 (PBS에서 2 %).
    1. 아가로스를 첨가한 직후, 1mL 주사기에 부착된 25G 바늘을 사용하여 1.5 mL 튜브의 벽에서 세포 펠릿을 부드럽게 분리합니다. 도 3에도시된 바와 같이, 세포 펠릿이 1.5 mL 튜브의 벽으로부터 물리적으로 분리되지 않은 경우, 아가로스 임베딩 공정 동안 세포 펠릿의 전부 또는 일부를 잃을 위험이 있다.
  15. PBS에서 2 % 아가로즈가 완전히 응고 될 때까지 기다립니다.
  16. 1.5 mL 튜브로부터 고형화된 아가로즈 블록을 1 mL 주사기에 부착된 25 G 바늘을 사용하여 분리한다.
  17. 세포 펠릿을 함유하는 분리된 아가로즈 블록을 새로운 1.5 mL 튜브로 옮김을 전달한다.
  18. 튜브를 70% EtOH로 채우고 조직 탈수 및 파라핀 삽입을 위한 종래의 프로토콜을 사용하여 추가로 진행한다.

8. 오르가노이드의 조직학 및 면역형광 세포화학(IFC)

  1. 역학 또는 IFC에 대한 슬라이드를 선택합니다.
  2. 염색 과정을 시작하기 전에 슬라이드에 있는 셀의 위치를 알아내고 마커를 사용하여 슬라이드의 셀 주위에 원을 그립니다.
  3. 슬라이드의 가장자리 또는 보더 주위와 실험실 노트북의 슬라이드에 원이 있는 위치를 그려 위치를 기록합니다.
  4. 원하는 염색을 수행합니다.
    참고 : 이 과정에서 일반 제조업체가 화학 물질에 내성이 없기 때문에 표시된 원이 사라집니다. 심지어 일부 반학 영구 마커는 염색 과정에서 지워질 수 있습니다.
  5. 염색 과정을 마친 후 실험실 노트북의 도면 위에 슬라이드를 놓아 슬라이드의 셀 위치를 찾습니다.

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Representative Results

3D 오르가노이드는 환자 유래 이종이식(PDX) 모델인 골전이성 전립선암(BMPC)뿐만 아니라 환자 골전이성 전립선암 조직으로부터 직접 적으로 확립되었다(그림4). 간단히, BMPC의 우리의 PDX 모델은 남성 Rag2-/- c-/- 마우스로 종양 세포의 대퇴 내 (IF) 주입에 의해 설립된 다음 PDX 종양을 수확하고 이 원고에 기술된 대로 처리하였다. 그림 4에도시된 바와 같이, PCSD 시리즈의 PDX 종양 조직은 이 프로토콜을 사용하여 형성된 낭종, 스페로이드 및 더 높은 복잡성 오르가노이드로서 나타나는 차동 표현형을 가진 3D 오르가노이드를 초래했다.

25 개의 고해상도 10 x 배율 이미지에서 스티치 이미지는 지하 막과 오르가노이드의 전체 돔을 보여 주었다(그림 5). 이미지 분석 소프트웨어를 사용하여 특정 크기보다 큰 세포 또는 세포 클러스터를 정렬하거나 수동으로 스페로이드 또는 낭종을 선택할 수있는 옵션이 있습니다.

슬라이드에 단면 된 오르가노이드의 위치를 표시하는 오르가노이드 배양 및 팁의 아가로스 포함을위한 단계는 오르가노이드의 샘플이 원하는 것보다 낮은 세포 밀도를 가질 때 특히 오르가노이드에 IFC를 수행하는 성공을 증가시다. 도 6은 시토케라틴 5(CK5, 기저 상피 세포 마커), 시토케라틴 8(CK8, 발광 상피 세포 마커) 및 DAPI를 표적화하는 오르가노이드의 5 μm 두께의 파라핀 절편에서 IFC의 예를 나타낸다.

Figure 1
그림 1: 환자 종양 조직 또는 환자 유래 이종이식(PDX) 종양 조직에서 유래한 3D 배양 오르가노이드에 대한 확립 및 특성화. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

Figure 2
도 2: 세포 펠릿과 지하 막의 혼합물을 형성하는 방법론. 부속 돔(a),부동 돔(b)및 부동 구슬(c). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

Figure 3
그림 3: 성공적인 아가로즈 임베딩을 위한 핵심 단계입니다. 1.5 mL 튜브의 벽에서 세포 펠렛을 분리하는 과정. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

Figure 4
그림 4: 단일 세포, 낭종, 스페로이드 및 더 높은 복잡성 오르가노이드를 포함하는 일련의 PCSD PDX 종양에서 오가노이드의 차동 표현형. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

Figure 5
그림 5: 총 25개의 고해상도 이미지로부터원시 스티치된 이미지의 예와 셀 수를 계산하거나 셀/셀 클러스터의 면적을 측정하기 위한 후속 분석을 위한 응용 프로그램. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

Figure 6
도 6: CK5 및 CK8 IFC 염색PCSD1 오르가노이드를 보여주는 이미지(파라핀 섹션의 두께 5 μm 두께). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

스톡 구성 요소 최종 농도 500ml 용액에 필요한 Vol(mL)
1000 mM HEPES 10 mM 5
200 mM 글루타맥스 2 mM 5
100x 펜 스트렙 1x 5
adDMEM/F12 +/+++ 485

표 1: adDMEM/F12 +/+++ 준비. 이 표는 이전에 Drost et al.5에의해 출판되었습니다.

스톡 구성 요소 최종 농도 50mL 솔루션에 필요한 Vol(μL) 25mL 솔루션에 필요한 Vol(μL)
50x B27 희석 50배 1000 500
500 mM N-아세틸 시스테인 1.25 mM 125 62.5
0.5 mg/mL EGF 5 ng/mL 0.5 0.3
100 ug/mL 노긴 100 ng/mL 50 25
R-스폰딘 1 10% 컨디셔닝 매체 5000 2500
5 mM A83-01 500 nM 5 2.5
0.1 mg/mL FGF10 10 ng/mL 5 2.5
50 μg/mL FGF2 5 ng/mL 5 2.5
10 mM 프로스타글란딘 E2 1 μM 5 2.5
1M 니코티나미드 10 mM 500 250
30 mM SB202190 10 μM 16.7 8.4
FBS 10% 5000 2500
1 μM DHT 1 nM 50 25
adDMEM/F12 +/+++ 최대 50ml까지 가져 오십시오. 최대 25mL
100 mM Y-27632 디하이드로 클로라이드 10 μM 5 2.5

표 2: C/S 휴먼 미디어용 구성 요소 + 10% FBS. 이 표는 이전에 Drost et al.5에의해 출판되었습니다.

문화 판 파종 밀도 (셀) 지하 멤브레인 볼륨(μL) 중간(μl)
48 웰 25,000-50,000 20 250
24 웰 50,000-250,000 40 500
6 웰 50,000-250,000 40 2,000

표 3: 하나의 돔에 필요한 시딩 밀도, 지하 멤브레인 부피 및 중간 부피. 이 표는 Drost et al.5에의해 이전 간행물에서 수정되었습니다.

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Discussion

환자 뼈 전이 전립선 암 세포에서 파생 된 3D 오르가노이드는 여전히 상대적으로 드뭅니다. 여기서는 BMPC의 직렬 3D 환자 유래 오르가노이드(PSO)를 성공적으로 확립하기 위한 전략과 최적화된 프로토콜을 설명합니다. 또한, 프로토콜은 IFC 및 IHC 분석을 위해 더 낮은 세포 밀도를 가진 샘플에서 오르가노이드를 고정하기 위해 설명된다. 낭종, 스페로이드 및 더 복잡한 오르가노이드의 형태로 차동 표현형은이 프로토콜이 환자에서 이종 종양 세포 집단이 세포 표현형 과 구조를 유지할 수있는 배양 조건을 제공한다는 것을 나타냅니다. 따라서, 여기에 기술된 배양 조건은, Drost et al.5로부터 FBS 혈청 보충으로 변형된, 환자 BMPC 유래 세포의 배양에 최적인 것으로 나타났으며, 이들이 그들의 주제 내 및 주제 간 이질성을 유지하도록 하였다(제조중인 원고).

당사의 최적화된 프로토콜은 3D 오르가노이드 배양을 설정하기 위해 1차 또는 PDX 종양 조직에서 제한된 시작 물질에서 여러 종점으로 설정된 실험에 실용적입니다. 일반적으로, 환자 원발성 종양 조직에서 3D 오르가노이드의 확립은 PDX 종양 조직에서 3D 오르가노이드의 확립보다 덜 성공적입니다. 따라서 PDX 종양보다 환자 1 차 종양 조직에서 3D 오르가노이드의 확립을 위해 세포의 더 높은 시드 밀도 (최대 4 배 더 높도록)를 가지는 것이 좋습니다. 종양 조직 처리 동안 세포 수율을 증가시키는 한 가지 방법은 여과된 세포 현탁액을 다시 여과된 스트레이너를 통과시킴으로써 70 μm 세포 스트레이너의 상단에 남은 종양 조직을 회수하는 것입니다.

3D 오르가노이드 배양액을 형성하는 3가지 상이한방법(도 2)은후속 종점 분석에 따라 쉽게 사용되고 적응될 수 있다. 예를 들어, 3D 오르가노이드를 설치한 후 스티치 이미지를 갖고 싶은 경우 이미지 스티칭 프로세스에서 원하는 수의 이미지(9 또는 25)를 획득하기 위해 현미경 목표의 연속 이동이 필요하기 때문에 부착된 돔을 적극 권장합니다. 이 공정은 세포 배양 판의 홀더에 미묘한 진동을 초래한다. 이미지를 획득하는 동안 진동으로 인해 부동 돔의 두 유형이 자유롭게 이동합니다. 또한 두 가지 유형의 부동 돔을 한 우물에서 다른 웰로 쉽게 옮길 수 있으므로 별도의 웰에서 3D 오르가노이드 배양 및 부착 세포를 설정 한 후 부착 세포와 공동 배양에 적합합니다. 부착된 돔과 부동 돔은 최대 10주 동안 오간노이드를 유지하는 것으로 나타났습니다. 흥미롭게도, 부동 구슬 방법에서 부동 돔은 최대 4 개월 동안 오르가노이드를 유지하는 것으로 나타났습니다. 우리의 프로토콜에 도입 된 지하 막 구체를 생산하는 부동 구슬 방법은 더 많은 단계와 기술을 포함하지만 장기적인 문화를 고려할 수 있습니다. 병행하여, 다른 종양 및 전이에서 3D 오르가노이드의 설치를 위한 그들의 사용에도 불구하고, 오르가노이드 대형에 있는 doming 방법 및 지하 막 모양의 역할은 깊이 결정되지 않았습니다. 이러한 의미에서, 파라핀 막 방법은 다른 두 가지 방법이 실패했을 때 사용하기 위해 고려될 수 있다.

세 가지 방법 모두에 대해 이 프로토콜은 돔이 배양에서 더 오래 지속되므로 재서스펜션 프로세스에 더 적은 양의 미디어와 더 많은 지하 멤브레인을 사용하는 것이 좋습니다. 돔은 1:4 비율의 미디어와 지하 멤브레인으로 형성됩니다. 참고로, 이 방법은 체전 현탁액을 상하로 피펫팅하는 동안 기포의 형성을 증가시킵니다. 따라서 1.5 mL 튜브에 여러 돔에 대해 하나의 셀 펠릿을 갖는 대신 각 돔당 하나의 셀 펠릿이 되도록 1.5 mL 튜브를 설정하는 것이 좋습니다. 이렇게하면, 하나의 돔에 대한 하나의 튜브에 거품의 형성은 연속적으로 다른 돔에 영향을주지 않습니다. 배양 조건의 지속 기간이 이전에 최적화되어 짧은 것으로 알려진 경우 (최대 한 달), 지하 멤브레인은 지하 막의 점도 문제를 우회하기 위해 더 희석 될 수있다. 여러 웰에 대한 세포 펠릿 재현설은 세포 손실과 가변성을 최소화하기 위해 원하는 지하 멤브레인의 부피에 더 많은 양의 매체를 활용하여 한 튜브에서 제조할 수 있습니다.

파이펫팅 공정 중 기포 형성을 최소화하기 위해, 파이펫은 세포, 매질 및 지하 멤브레인 혼합물의 실제 부피보다 낮은 부피이다. 예를 들어, 24개의 웰 플레이트 내의 돔의 경우, 지하 막의 40 μL 및 최대 10 μL의 adDMEM 완전 매질이 세포 펠릿과 혼합된다. 이 경우, 파이펫은 기포 형성을 최소화하기 위해 상하 로 피펫을 피펫하면서 50 μL 대신 40 μL의 부피를 처리하도록 설정할 수 있습니다. 이러한 제2 방법의 경우, 여러 웰에 대한 세포 펠릿 재현탁액을 하나의 튜브에서 제조하여 세포 손실 및 가변성을 최소화할 수 있다. 시판되는 지하 멤브레인의 액체 상태는 종종 가변적입니다. 따라서, 지하 멤브레인의 새로운 배치는 도밍 공정에 대한 테스트될 필요가있다. 지하 막이 평소보다 더 점성이 있는 경우, 최대 10 μL의 adDMEM 완전 매체(1단계로 작성된 세부 사항)를 첨가하여 세포 펠렛과 지하 멤브레인의 혼합물을 희석시킬 수 있다.

여기에서는 원하는 절차를 성공적으로 완료하기 위한 자세한 팁과 함께 배양된 3D 오르가노이드를 확립, 이미지 및 처리하는 프로토콜을 제시합니다. 우리의 원고에 소개된 3D 오르가노이드에 대한 배양 배지는 전립선 유래 세포를 위해 특별히 이다. 그러나, 우리의 프로토콜에 기술된 그밖 세부사항은 종양 조직 및 전이성 사이트의 다른 모형에 적용 가능하다.

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Disclosures

이상희와 크리스티나 A.M. 제이미슨은 조브 메소드 컬렉션의 게스트 편집자입니다.

Acknowledgments

이 연구는 레오와 앤 앨버트 자선 재단과 JM 재단에 의해 지원되었다. 우리는 캘리포니아 샌디에고 무어암 센터 회원, Jing Yang 박사 및 케이 T. Yeung 박사가 기술 전문 지식에 대한 수술학과의 마이크로토메와 랜달 프랑스어의 사용을 허용해 주신 것에 대해 감사드립니다.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
1 mL Pipettman Gilson F123602
1 mL Syringe BD Syringe 329654
1.5 mL tube Spectrum Lab Products 941-11326-ATP083
25G Needle BD PrecisionGlide Needle 305122
4% Paraformaldehyde (PFA) Alfa Aesar J61899
70% Ethanol (EtOH) VWR BDH1164-4LP
A83-01 Tocris Bioscience 2939
Accumax Innovative Cell Technologies, Inc. AM105
adDMEM Life Technologies 12634010
Agarose Lonza 50000
Antibody -for Cytokeratin 5 Biolegend 905901
Antibody for Cytokeratin 8 Biolegend 904801
B27 Life Technologies 17504044
Bioluminescence imaging system, IVIS 200 Perkin Elmer Inc IVIS 200
Cell Culture Plate - 24 well Costar 3524
Cell Culture Plate - 48 well Costar 3548
Cell Culture Plate - 6 well Costar 3516
Cell Dissociation Solution, Accumax Innovative Cell Technologies, Inc. AM105
Cell Recovery Solution Corning 354253
Cell Scraper Sarstedt 83.180
Cell Strainer Falcon (Corning) 352350
CO2 incubator Fisher Scientific 3546
DAPI Vector Vectashield H-1200
DHT Sigma-Aldrich D-073-1ML
dPBS Corning/Cellgro 21-031-CV
EGF PeproTech AF-100-15
FBS Gemini Bio-Products 100-106
FGF10 PeproTech 100-26
FGF2 PeproTech 100-18B
Forceps Denville Scientific S728696
Glutamax Gibco 35050-061
HEPES Gibco 15630-080
LS Columns Miltenyi 130-0420401
Magnetic Column Seperator: QuadroMACS Separator Miltenyi 130-090-976
Marker VWR 52877-355
Matrigel (Growth Factor Reduced) Mediatech Inc. (Corning) 356231
Matrigel (High Concentration) BD (Fisher Scientific) CB354248
Microscope Imaging Software, Keyence BZ-X800 (newest software) BZ-X700 (old software)
Microscope, Keyence BZ-X700 (model 2016-2017)/BZ-X710 (model 2018-2019)
Mouse Cell Depletion Kit Miltenyi 130-104-694
N-Acetylcysteine Sigma-Aldrich A9165-5G
Nicotinamide Sigma-Aldrich N0636-100G
Noggin PeproTech 120-10C
OCT Compound Tissue-Tek 4583
Parafilm American National Can N/A
Pen-Strep Mediatech Inc. (Corning) 30-002-CI-1
Pipette tipes for 1 mL (Blue Tips) Fisherbrand Redi-Tip 21-197-85
Plunger (from 3 mL syringe) BD Syringe 309657
Prostaglandin E2 Tocris Bioscience 2296
R-Spondin 1 Trevigen 3710-001-01
SB2021190 Sigma-Aldrich S7076-25MG
Small Table Top Centrifuge ThermoFisher Scientific 75002426
Water Bath Fisher Sci 2320
Y-27632 Dihydrochloride Abmole Bioscience M1817

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References

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환자 전립선암 뼈 전이 표본 및 이종이식에서 파생된 3차원(3D) 오르가노이드의 설립 및 분석
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Lee, S., Burner, D. N., Mendoza, T.More

Lee, S., Burner, D. N., Mendoza, T. R., Muldong, M. T., Arreola, C., Wu, C. N., Cacalano, N. A., Kulidjian, A. A., Kane, C. J., Jamieson, C. A. M. Establishment and Analysis of Three-Dimensional (3D) Organoids Derived from Patient Prostate Cancer Bone Metastasis Specimens and their Xenografts. J. Vis. Exp. (156), e60367, doi:10.3791/60367 (2020).

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