Summary
שיטות נוכחיות של ניתוח הדבקות של המטופלים בטיפול תרופתי מורכב-שחפת (DR-TB) משטרי יכול להיות לא מדויק ואינטנסיבי משאבים. השיטה שלנו מנתחת שיער, מטריצה בקלות שנאסף ומאוחסן, עבור ריכוזי של 11 תרופות DR-TB. באמצעות LC-MS/MS, אנחנו יכולים לקבוע את רמות התרופות תת-ננוגרמה שניתן לנצל כדי להבין טוב יותר את הדבקות בסמים.
Abstract
עמיד בפני סמים-שחפת (DR-TB) הוא איום בריאות הציבור הולך וגדל, והערכה של רמות תרופות טיפוליות אולי הטבות קליניות חשוב. רמות התרופה פלזמה הם הערכה התקן הזהב הנוכחי, אבל דורשים כריתת-פלבוטומיה ושרשרת קרה, וללכוד רק לאחרונה הדבקות. השיטה שלנו משתמשת שיער, מטריצה כי הוא נאסף בקלות רפלקטיבית של הדבקות לטווח ארוך, כדי לבדוק 11 נגד שחפת תרופות. העבודה הקודמת של הקבוצה שלנו מראה כי רמות התרופה תרופתי בשיער קשורים לתוצאות HIV. השיטה שלנו לתרופות DR-TB משתמשת 2 מ"ג של שיער (3 ס מ האבותיים לשורש), אשר מרוסק ומופק ב מתנול. דגימות מנותח עם שיטת LC-MS/MS יחידה, כימות 11 תרופות ב 16 דקות לרוץ. המגבלות הנמוכות יותר של כימות (יוסה) עבור 11 התרופות נעות בין 0.01 ng/mg ל-1 ng/mg. נוכחות התרופה מאושרת על ידי השוואת היחס בין שני מעברים בעלי ספקטרומטר מסה. דגימות הן כימות באמצעות יחס האזור של התרופה הדאובטים, 15N-, או 13C התווית איזוטופולוג התרופה. השתמשנו עקומת כיול החל מ-0.001-100 ng/mg. יישום השיטה למדגם נוחות של דגימות שיער שנאספו מחולים DR-TB על טיפול ישירות נצפתה (DOT) המצוין רמות הסמים בשיער בתוך טווח דינמי ליניארי של תשעה התרופות 11 (isoniazid,, מlevofloxacin, מmoxifloxacin, קלופצין. בדקווינין, פרטואיד (מחלקה) החולה לא היה על prothionamide, ואת רמות נמדד עבור ethionamide היו קרובים ל-יוסה שלה (עם עבודה נוספת במקום לבחון את ההתאמה של המטאווליט של ethionamide לניטור החשיפה). לסיכום, אנו מתארים את ההתפתחות של פאנל רב תכליתי עבור תרופות DR-TB בשיער כטכניקה עבור ניטור התרופה הטיפולית במהלך טיפול עמיד בפני תרופות נגד שחפת.
Introduction
במאה העשרים ואחת, עמיד בפני תרופות tb (ד ר-TB) הוא אסון מתפתח עבור תוכניות שליטה הלאומי חלש כבר שחפת, עם המקרים אישר הכפלת בעבר 5 שנים בלבד, חשבונאות כמעט שליש ממקרי המוות הקשורים להתנגדות מיקרוביאלית גלובלית1,2. הטיפול המוצלח של DR-TB נדרש בדרך הנדרשת יותר ויותר רעיל קו השני משטרי מאשר טיפול עבור התרופה רגיש TB. יתר על כן, חולים עם DR-TB לעתים קרובות יש אתגרים משמעותיים מראש קיימים לדבקות, אשר תרמו הופעתה של התנגדות בתחילה3.
בניגוד לזיהום HIV שבו נטען ויראלי ניתן להשתמש כדי לפקח על הטיפול, נקודות קצה פונדקאית של תגובת הטיפול בשחפת מתעכב ולא אמין על רמה הפרט4. מעקב הקפדה על המטופל, מנבא חשוב של ריכוז תרופות נגד שחפת וכישלון הטיפול, הוא גם מאתגר. הדבקות מדווחת בעצמו סובלת מאחזור הטיה והרצון לספק את הספקים5,6. ספירות הגלולה ותרופות מערכות ניטור אירועים (mems) יכול להיות אובייקטיבי יותר7 אך לא למדוד את צריכת התרופה בפועל8,9,10. רמות התרופות ב-ביואטריסס יכולות לספק גם נתונים הניתנים לדבקות ולשני הפרמקוקינטיים. לכן, רמות התרופות פלזמה משמשות בדרך כלל בניטור תרופות טיפולית11,12. עם זאת, בהקשר של ניטור הדבקות בסמים, רמות הפלזמה מייצגות חשיפה לטווח קצר ומוגבלות על-ידי שינויים משמעותיים בפנים ובבין המטופלים בעת קביעת טווח התייחסות מתאים לדבקות. אפקטים של "מעיל לבן", כאשר הדבקות משתפרת לפני ביקורי מרפאה או לימודים, מסבך עוד יותר את יכולתם של רמות פלזמה לספק דפוסי הדבקות בסמים מדויקים13.
שיער הוא ביומטריקס אלטרנטיבי שיכול למדוד לטווח ארוך14חשיפהלסמים 14,15. תרופות רבות חילוף החומרים האנדוגניים לשלב לתוך מטריצת חלבון השיער מן המחזור מערכתית כמו שיער צומח. כאשר תהליך דינמי זה נמשך במהלך צמיחת השיער, כמות התרופה שהופקדו במטריקס שיער תלוי בנוכחות רציפה של התרופה במחזור, הפיכת שיער בדיקה טמפורלית מעולה של צריכת התרופה. שיער כמו ביומטריקס יתרון נוסף של להיות נאסף בקלות ללא צורך שרשרת קר לאחסון ומשלוח בהשוואה לדם. כמו-כן, השיער אינו ביולוגי, המספק יתרונות נוספים של היתכנות בתחום.
רמות הסמים בשיער שימשו זמן רב ביישומים משפטיים16. במהלך העשור האחרון, השיער תרופתי (arv) רמות הפגינו השירות בהערכת דבקות התרופה ב-HIV טיפול ומניעה, אשר הקבוצה שלנו תרמו. רמות arv בשיער הוכחו להיות החזק ביותר הפרמנטורים עצמאיים של תוצאות הטיפול בנגיף HIV17,18,19,20,21. כדי לקבוע אם רמות השיער של חולים DR-TB יהיה שירות זהה בניבוי תוצאת הטיפול, השתמשנו LC-MS/MS כדי לפתח ולאמת שיטה לניתוח 11 התרופות DR-TB בדגימות שיער קטן. כהערכה ראשונית של ביצועי הטיפול, אנו מודדים DR-TB רמות התרופות במדגם הנוחות של חולים עם DR-TB מקבל טיפול ישיר (DOT) בקייפ המערבי, דרום אפריקה22.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
כל המטופלים סיפקו הסכמה מושכלת בכתב לפני איסוף דגימת שיער. הצלחנו לקבל אישור מוסדי מועצת המנהלים מאוניברסיטת קייפטאון ואוניברסיטת קליפורניה, סן פרנסיסקו.
1. דגימת שיער
- קבל הסכמה מושכלת בכתב.
- השימוש מספריים נקיים לחתוך כ 20-30 קווצות שיער הקרקפת מהאזור העורף קרוב לקרקפת ככל האפשר.
- הציבו את הקלטת סביב הצד המרוחק. של השיער כדי להצביע על כיווניות מקפלים דגימת שיער לתוך כיכר רדיד אלומיניום ולאחסן בטמפרטורת החדר. סמן את הקצה המרוחק של השיער כדי למנוע זיהום אפשרי מטיפול נוסף של הקצה האבובי.
- בנוסף דגימות החולה, לאסוף "שיער ריק": דגימת שיער הקרקפת ממישהו שלא לקח תרופות נגד שחפת. לאסוף כמות גדולה (> 30 mg שיער ריק עבור כל 20 המטופל דגימות).
2. חילוץ הסמים
- תווית מנורות חרוז. כל דגימת מטופל. דורשת צינורית אחת תווית 12 צינורות מ-"C0" ל-"C11", אחת עבור כל אחת מ -12 נקודות כיול. סמן שפופרת לבקרת איכות נמוכה, צינור לבקרת איכות בינונית ושפופרת לבקרת איכות גבוהה. לבסוף, סמן צינור עבור מטריצה ריק.
- פתחו את כיכר רדיד האלומיניום המכילה דגימת שיער. אם דגימת שיער ארוכה מ-3 ס מ, שיער חתוך בגובה 3 ס מ מהקצה האבובי והשתמש בחלק האבובי לניתוח.
- שוקלים 2 מ ג של דגימת השיער לתוך שפופרת חרוז.
- שוקלים 2 מ"ג של שיער ריק לתוך 16 שפופרות חרוז נוספות. אלה ישמשו כנקודות כיול, פקדי איכות ומטריצה ריקה. הצינורות יעברו את ההליך החילוץ אותו כמו דגימות המטופל, מלבד להיות מחודדים עם סטנדרטים התייחסות סמים ברמות המצוין בשלבים 2.8 ו 2.9.
- מניחים את כל שפופרות החרוזים לתוך ההומוגניצר. הפעל הומוגניצר במהירות 6.95 מ מ. הפעלה עבור שני מחזורים של 30 כל אחד, עם תקופה של 15 מנוחה בין שני מחזורי.
- הפוך תמהיל תקני פנימי והוסף אותו לדגימות.
- הוסף ~ 40 mL של מתנול בקבוקון מנפח 50 mL.
- בבקבוקונים זכוכית ענבר, להפוך את mixes של הסטנדרטים הפנימיים המוצגים בטבלה 1, באמצעות מתנול כמו הממס.
הערה: מתנול הוא נדיף מאוד. להשאיר את כל הבקבוקונים הכתיר במהלך תהליך זה כדי למנוע אובדן עקב אידוי. - מאותם תערובות, להוסיף את עוצמת הקול המוצג בטבלה 1 כדי 50 mL נפח בקבוקון. ואז, למלא את הבקבוקון כדי 50 mL עם מתנול.
- קאפ ומערבבים את הבקבוקון הנפחי. הוסף 500 μL של התערובת לכל הצינורות שיער מרוסק, למעט צינור ריק מטריצה. הוסף 500 μL מתנול אל השפופרת הריקה של המטריצה.
- הפוך תערובות סטנדרטיות לייחוס.
- מהווים סטנדרטים התייחסות מסודר של התרופות הבאות עם מתנול כדי לקבל את הריכוז המוצג בטבלה בשלב 2.7.2. יש צורך רק ב-1 mL של הריכוזים הבאים.
- הוסף 1768 μL של מתנול לבקבוקון, ולאחר מכן הוסף את כמויות תקן הייחוס המפורטות בטבלה 2 לאותו בקבוקון כדי לקבל את הנפח הסופי בשני mL. סמן בבקבוקון זה "Ref מיקס לתקן 1x". ערבולת.
- ספייק 100 μL מ "Ref מיקס לתקן 1x" לתוך 900 μL מתנול בבקבוקון חדש. סמן במבחנה זו "Ref מיקס לערבב 10x". ערבולת.
- ספייק 100 μL מ-"Ref מיקס למיקס 10x" לתוך 900 μL מתנול בבקבוקון חדש. סמן במבחנה זו "Ref שילוב מיקס 100 x". ערבולת.
- ספייק 100 μL מ-"Ref מיקס למיקס 100x" לתוך 900 μL מתנול בבקבוקון חדש. סמן במבחנה זו "Ref מיקס לערבב 1000x". ערבולת.
- ספייק צינורות עקומת הכיול על ידי הוספת כמות Ref מיקס שתוארו בטבלה 3.
- צור מתערובות QC ושפופרות בקרת איכות ספייק.
- תווית 5 במבחנות "קוו-א" דרך קוו-אי
- הוסף את הכמויות הבאות של מתנול לתוך חמשת הבקבוקונים שסומנו:
QC-A: 990 μL
QC-B: 940 μL
קוו-C: 950 μL
QC-D: 980 μL
QC-E: 950 μL
- באמצעות 1 mg/mL מניות סמים שנוצרו בשלב 2.7.1, להוסיף 10 μL לבקבוקונים הספציפיים המפורטים להלן. עבור מניות BDQ ו CLF, אשר נמצאים ב 0.5 mg/mL, להוסיף 20 μL לבקבוקונים המפורטים להלן.
QC-A: PTH
QC-B: EMB, CLF, BDQ, PTM
QC-C: INH, LFX, LZD, MFX, PZA
QC-D: PTH, EMB
קוו-E: CLF, BDQ, PTM
הערה: חלק מהסמים נמצאים בתערובות מרובות. - סמן בקבוקון בתור "QC-A df100". לדלל 10 μL של QC-A לתוך 990 μL מתנול.
- סמן בקבוקון בתור "מניות QC נמוכות". הוסף 1832 μL מתנול לבקבוקון זה. הוסף את הכמויות של מתערבב QC מפורט להלן:
QC-A df100:80 μL
QC-B: 8 μL
קוו-C: 80 μL
- סמן בקבוקון כ-"מלאי QC בינוני". הוסף 760 μL מתנול לבקבוקון זה. הוסף את הכמויות של מתערבב QC מפורט להלן:
QC-A df100:800 μL
QC-B: 40 μL
קוו-C: 400 μL
- סמן בקבוקון כ-"מלאי QC גבוה". הוסף 1376 μL מתנול לבקבוקון זה. הוסף את הכמויות של מתערבב QC מפורט להלן:
QC-D: 160 μL
QC-E: 320 μL
MFX, 1mg/mL מלאי: 16 μL
INH, 1mg/mL מלאי: 32 μL
LFX, 1mg/mL מלאי: 32 μL
LZD, 1mg/mL מלאי: 32 μL
PZA, 1mg/mL מלאי: 32 μL
- ספייק 10 μL מלאי QC נמוכה לתוך צינור ה-QC באיכות נמוכה.
- ספייק 10 μL באמצע מניות QC לתוך צינור ה-QC באמצע.
- ספייק 10 μL גבוהה במלאי QC לתוך שפופרת ה-QC גבוהה.
- מניחים את כל הצינורות בשייקר חם עבור 2 h ב 37 ° c. לרעוד צריך להיות איטי מספיק כי המים לא להתיז על הצינורות.
- להסיר צינורות מ שייקר. העברת נוזל מצינורות חרוז לתוך צינורות מיקרוצנטריפוגה חדשים. תייג את הצינורות. המיקרוצנטריפוגה האלה באותו אופן
- הוסף 500 μL מתנול לצינורות הישנים. . כובע ומערבולת
- בפעם השנייה, להעביר נוזל מצינורות חרוז לתוך צינור המיקרוצנטריפוגה המקביל. . זה בסדר להעביר שיער מרוסק זה יהיה בסופו של דבר centrifuged החוצה.
- צנטריפוגה את צינורות המיקרוצנטריפוגה עבור 10 דקות ב 2,800 x g.
- בזהירות להסיר את הנוזל ולהעביר אותו צינורות צנטריפוגה חדשים עם תוויות המקביל. להיזהר לא להפריע או להעביר את השיער שיער.
- מתנדפים את הנוזל בצינורות הצנטריפוגה ליובש ב 32 ° c.
- מרכיבים את הדגימות על-ידי הוספת 200 μL של השלב הנייד A (בדיקות-כיתה-מים עם חומצה פורמית 1%) לצינורות היבשים. ערבולת.
- העבר את הנוזל לבקבוקונים עם הענבר עם מוסיף 250 μL.
3. הכנה LC-MS/MS
- הפוך ליטר אחד של השלב הנייד A (מיים בכיתות עם חומצה פורמית של 1%) על ידי הוספת מספר כלים לבקבוקון נפחי של ליטר אחד. ואז להוסיף 10 מ ל של > 95% החומצה פורמית לבקבוקון זה, ולאחר מכן למלא את הקו עם המים באמצעות כיתות.
- לעשות ליטר אחד של שלב נייד B (acetonitrile עם 0.1% פורמית חומצה) על ידי הוספת כמה acetonitrile ל בקבוקון נפחי ליטר אחד. ואז להוסיף 1 mL של > 95% החומצה פורמית לבקבוקון הזה, ולאחר מכן למלא את הקו עם acetonitrile.
- התקנת עמודת 2 x 100 מ"מ עם גודל החלקיקים 2.5 יקרומטר ו 100 בגודל הנקבוביות Å עם endcapped קוטב, האתר מקושר חרוזים מקושרים במלואו של סיליקה נקבובי בתא הטור. ודא שלעמודה יש גם מחסנית שמירה מומלצת ליצרן.
- פתח את תוכנת רכישת הנתונים ולחץ פעמיים על תצורת חומרה. סמן Lcms ולחץ על הפעל פרופיל.
- לחץ על תת פרוייקט חדש, או אם כבר קיימים פרוייקטים משניים אחרים, לחץ על העתק פרוייקט משנה. . נקוב בשמו של פרוייקט המשנה
- לחץ על מסמך חדש. לחץ פעמיים על שיטת הרכישה. לחץ על Spec מסה בתוך חלון שיטת הרכישה.
- שנה את הרשימה הנפתחת ' סוג סריקה ' ל- mrm (mrm). ודא שהקוטביות מוגדרת כחיובית.
- לחץ על ייבוא רשימה ובחר בקובץ. Csv MDR-TB lcms שיטה מעברים. csv הנכלל בחומרים משלימים.
- גלול מטה והגדר את המשך ל 16.751 דקות. זמן המחזור המתאים ומספר המחזורים יאכלס אוטומטית.
- בסרגל הצידי השמאלי, לחץ על שסתום Valco משולב. ודא ששם המיקום עבור שלב 0 הוא A. בעמודה סה כ זמן (דקות) , הקלד ב-0.4 בשורה הראשונה ו-13 בשורה השניה.
- בעמודה מיקום , הגדר שורה אחת ל-B ושורה שתיים ל-A.
- בסרגל הצידי השמאלי, לחץ על משאבה בינארית. הגדר את טבלת קצב המעבר והזרימה לפי טבלה 4.
- בסרגל הצידי השמאלי, לחץ על דוגם אוטומטי. שנה את נפח ההזרקה ל-10 μL. לחץ על בקרת טמפרטורה זמינה והגדר ל-4 ° c.
- בסרגל הצידי השמאלי, לחץ על תא עמודה. הגדר את הטמפרטורה הימנית והשמאלית ל-50 ° c.
- שיטת סגירה ושמירה.
- צור אצווה על-ידי לחיצה על מסמך חדש ובחירת אצוות רכישה. הקלידו שם ערכה ובחרו בשיטה החדשה שנוצרה מסרגל הנפתח.
- בגיליון אלקטרוני, צור אצווה העוקבת אחר סדר זה: עקומת כיול, בקרת איכות, דגימות מטופלים, עקומת כיול, בקרת איכות, דגימות מטופלים, עקומת כיול, בקרת איכות. הוסף זריקות ריקות ממס בתחילתו ובסופו של ההפעלה, כמו גם לפני ואחרי עקומת הכיול, בקרת איכות ודגימות המטופל. שים לפחות שמונה זריקות ריקות ממס לאחר זריקות של עקומת כיול בקבוקון בקרת איכות גבוהה על מנת להפחית את הנושא של האנליטה.
הערה: ייתכן שיהיה צורך להוסיף זריקות ריקות נוספות בהתאם לגיל העמודה. - בעמודה הסמוכה לשמות המדגם, הקלד את מיקום הדוגם האוטומטי המתאים לבקבוקון המתאים.
- לחץ על הוסף ערכה. בחלון המוקפץ, הקלד את מספר הדגימות באצווה.
- העתק והדבק שמות לדוגמה ומיקומי בקבוקון מהגיליון האלקטרוני אל האצווה החדשה שנוצרה.
- עבור אל הכרטיסיה שליחה . לחץ על לחצן שלח .
- בגיליון אלקטרוני, צור אצווה העוקבת אחר סדר זה: עקומת כיול, בקרת איכות, דגימות מטופלים, עקומת כיול, בקרת איכות, דגימות מטופלים, עקומת כיול, בקרת איכות. הוסף זריקות ריקות ממס בתחילתו ובסופו של ההפעלה, כמו גם לפני ואחרי עקומת הכיול, בקרת איכות ודגימות המטופל. שים לפחות שמונה זריקות ריקות ממס לאחר זריקות של עקומת כיול בקבוקון בקרת איכות גבוהה על מנת להפחית את הנושא של האנליטה.
- מערכת השפה על ידי הוספת קו הממס A לשלב הנייד A ו קו ממס B לשלב הנייד B. פתח את שסתום הטיהור על המשאבה הבינארית.
- הגדר הרכב הממס ל 50% B בקצב זרימה של 4 מ"ל/דקות. הפעל משאבה בינארית.
- לאחר 5 דקות, הפחת את הזרימה ל-0.3 mL/min. סגור את שסתום הטיהור. . תבדקו אם יש דליפות
- בתוכנה, לחץ על השפה העליונה בסרגל הכלים העליון. הגדר זמן ל> 5 דקות, לחץ על אישור.
- לאחר שכלי הנגינה הוצג בשפה התחתונה, המודולים בחלק הימני התחתון של החלון יופיעו ירוקים. בדוק כי הלחץ התייצב, ולאחר מכן להתחיל את האצווה על ידי לחיצה על התחל דגימה.
4. ניתוח נתונים
- לאחר השלמת האצווה, פתח את תוכנת הקוונטה. לחץ על סמל השרביט כדי ליצור טבלת תוצאות חדשה.
- לחץ על עיון כדי לנווט אל התיקיה המתאימה ולאחר מכן סמן את קובץ הנתונים ולחץ על החץ המצביע ימינה כדי להעביר את הנתונים לאזור שנבחר . לחץ על הבא.
- בחרו ' צור שיטה חדשה ' ולחצו על ' חדש'. כניסת שם שיטת כימות חדשה והקש שמור ואז הלאה.
- בחרו בזריקה הראשונה של נקודת הכיול האמצעית. לחץ על הבא.
- סמן שנתות את כל המעברים של התקנים הפנימיים בעמודה IS .
- עבור מעברים בין כימות עבור תקני הייחוס, בחר את האפשרות המתאימה היא בעמודה שם . לחץ על הבא.
- גלול במעברים כדי לוודא שזמן ההחזקה שנבחר באופן אוטומטי מדויק. ודא שהחלקת גאוס מוגדרת ל-1.5. כל הגדרות ברירת המחדל אחרים יכולים להישאר כפי שהוא (כלומר, רעש אחוז 100%, משנה בסיסית. חלון 2.00 min, השיא פיצול 2 נקודות).
הערה: אם רצונך בכך, שנה את פרמטרי האינטגרציה האוטומטית בשלב זה. מאחר שפרמטרים אלה משתנים בהתאם לכיוונון הכלי, לא כללנו את שלנו כאן. - לחץ על סיום כדי להחיל את שיטת הקוונטה על האצווה.
- לחץ על השמאלית העליונה מציג את לחצן סקירת שיא כדי להציג chromatograms. נווט בין המעברים באמצעות הסרגל הצידי השמאלי. גלול בכל הזרקה של כל מעבר כימות ולשלב באופן ידני את השיא הנכון במידת הצורך.
- כדי לשלב באופן ידני את השיא, לחץ על לחצן הפוך מצב שילוב ידני , התקרבות אל כרומטוגרם על-ידי לחיצה וגרירה לאורך ציר x או y, ולאחר מכן צייר קו מקו בסיס אחד אל קו הבסיס האחר, הגדרת השיא. איור 3 מראה שני כרומאטוגרמות: אחד כי יש inh, ולכן יש כבר משולב באופן ידני, ואחר כי אין inh.
הערה: יש לשלב את כל הזריקות באמצעות אותם פרמטרים. רוחב השיא יכול לספק מנחה לדבוק בפרמטרים אלה, אך לפעמים רוחב השיא יהיה שונה. כדי לכמת את השיא, זמן ההחזקה חייב להיות בתוך ± 0.15 דקות של זמן ההחזקה הצפוי עבור האנליטה (כפי שהוגדר על-ידי הפסגות הסטנדרטיות של ההפניה), שאושרו בצורה איכותית כשיש לו את הקוונט הצפוי ליחס מזהה (כפי שמוצג באיור 2), והיחס בין האות לרעש של
- כדי לשלב באופן ידני את השיא, לחץ על לחצן הפוך מצב שילוב ידני , התקרבות אל כרומטוגרם על-ידי לחיצה וגרירה לאורך ציר x או y, ולאחר מכן צייר קו מקו בסיס אחד אל קו הבסיס האחר, הגדרת השיא. איור 3 מראה שני כרומאטוגרמות: אחד כי יש inh, ולכן יש כבר משולב באופן ידני, ואחר כי אין inh.
- בעמודה סוג לדוגמה , הגדר את זריקות עקומת הכיול (למעט זריקות עקומת הכיול הריקות) לתקן. הגדר את זריקות בקרת האיכות לבקרת איכות. השאר את הזריקות הנותרות כבלתי ידועות.
הערה: הדבר יהיה מוגדר בכל המעברים. - בעמודה ריכוז בפועל , הקלד את הריכוזים שנמצאו בטבלה 5 עבור כל עקומת כיול וזריקות בקרת איכות.
- לחץ על השני משמאל למעלה מציג את לחצן עקומת הכיול . לחץ על לחצן הרגרסיה .
- הגדר סוג שקלול ל- 1/x והקש על אישור.
- אמת את עקומת הכיול ודגימות בקרת האיכות כדי להבטיח שהאצווה בוצעה בהצלחה.
- עבור כל מעבר הפניה לכמת (לא מעברים סטנדרטיים פנימיים), הבט בכל דיוק של הזרקה של עקומת כיול (בעמודת הדיוק ). לפחות שני שלישים מנקודות הכיול חייבים להיות בעלי דיוק בתוך 80-120%.
- עבור נקודות כיול הרחק מחוץ לדיוק הצפוי, ההזרקה עשויה להיות מדויקת יותר. הוצא החוצה אם הריכוז המחושב שלהם הוא יותר משתי סטיות סטנדרטיות הרחק משתי הזריקות האחרות של הבקבוקון. לחיצה על "et שיא כדי" לא נמצא לחצן מעל כל chromatogram.
- בדוק כי ערך ה-R המוצג מעל עקומת הכיול הוא > 0.975.
- בדוק כי כל זריקות בקרת איכות יש דיוק בתוך 80-120%.
- אם כל התנאים לעיל מסופקים, האצווה עברה, וניתן לכמת דגימות. לחץ על עריכה בסרגל הכלים ולאחר מכן לחץ על העתק טבלה שלמה. הדבקת הטבלה בגיליון אלקטרוני.
- קח את הממוצע של הריכוז המחושב של שתי זריקות לדוגמה כדי לקבוע את הריכוז המדווח של כל מדגם.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
איור של כרומוטוגרמה עם רמות מאושרות של כל 11 התרופות DR-TB מוצג באיור 1. זמן השמירה עבור כל אנליטה יכול להשתנות בעת שימוש בכלים ובעמודות שונים, כך שזמן השמירה המדויק ייקבע בנפרד.
מחולץ יון כרומטוגרמות (EICs) עבור תרופה אחת מסוימת (isoniazid, INH) באחד הכפויי (דגימת שיער ריקה עם סטנדרטים DR-TB התייחסות התרופות) מוצגים באיור 2. מעברים בין כימות ומזהים משמשים לאישור איכותי של התרופה, כאשר היחס בין שטח הכמת לבין אזור המזהה נשאר קבוע על פני דגימות. התקן הפנימי מפוקח גם על מנת להבטיח שכל הזרקה מדגם מנורמלת.
למטרות הדגמה, ניתחנו מדגם הנוחות של 15 דגימות שיער בקרב אוכלוסיית המחקר הכולל של 96 חולים לקיחת תרופות DR-TB בתנאים DOT ממערב קייפ, דרום אפריקה. טבלה 6 מציג רמות ייצוגית של תרופות DR-TB ברחבי הרמות הנמוכות והגבוהות ביותר שנמדדו עבור כל אנליטה. למרות הנתונים עבור 15 דגימות המטופל מוצגים, כל אנליטה לא היו 15 רמות דיווחו כי כל מטופל הוא על שילוב שונה של תרופות DR-TB. אף אחד מהחולים לא היה על prothionamide, ורק מטופל אחד היה לוקח pretomanid.
איור 1. איור של מייצג כרומאטוגרם מציג פסגות של 11 האנליטים בשיטה DR-TB (emb = ethambutol; INH = isoniazid; PZA = מסלול הפיזיאמיד; ETH = ethionamide; PTH = prothionamide; LFX = levofloxacin; MFX = moxifloxacin; LZD = מכסה לינייתי; PTM = pretomanid; BDQ = bedaquiline; CLF = clofazimine). בגלל הרגישות של השיטה עבור כל אנליטה שונה, INH, LZD, LFX, MFX ו LZD היו מחודדים 20 ng/mg שיער בעוד BDQ, CLF, EMB, ETH, PTH ו PTH היו מחודדים 2 ng/mg שיער. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2. שני שחולצו יון כרומטוגרמות (EICs) מתוך הזרקה של נקודת כיול 9 (C9), isoniazid (INH) ב 20 ng/mg. EIC העליון מראה הן מעבר כימות INH (כחול, מתויג INH-2) ואת מעבר מזהה INH (אדום, מתויג INH-3). EIC התחתון מראה תגובה של INH-d4, התקן הפנימי (IS) משמש לכמת INH. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3. צילומי מסך של תהליך של כימות. החלק העליון הוא רשימה לדוגמה חלקית המציגה נתוני הזרקה עבור אנליטה אחד (INH, isoniazid) על פני 12 נקודות כיול (המסומנות ב-c0-C11), שלוש רמות QC ושישה דגימות. החלק השמאלי התחתון הוא עקומת הכיול, החל 0.5 ng/mg – 100 ng/mg. נקודות כחולות אטומות הן נקודות כיול. ריבועים כחולים שקופים הם נקודות בקרת איכות. ערך R מוצג בקצה השמאלי העליון (0.99722) עם שקלול 1/x. שני chromatograms בחלק התחתון הימני להמחיש מדגם עם INH (העליון chromatograms) ומדגם ללא INH (התחתון chromatograms). אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
| סמים בכל תערובת | ריכוז כל תרופה בתמהיל | נפח של ערבוב נוסף ל 50mL vol. תרמוס |
| מערבבים 1: CLF-d7, EMB-d4 | 10 μg/mL | 40 מיקרומטר |
| מערבבים 2: LFX-d8, PTH-d5 | 10 μg/mL | 10 מיקרומטר |
| מערבבים 3: BDQ-d6, LZD-d3, MFX 13C-d3, OPC (מיועד PTM) | 10 μg/mL | 20 μL |
| מערבבים 4: PZA 15N-d3 | 10 μg/mL | 200 מיקרומטר |
| מערבבים 5: INH-d4 | 10 μg/mL | 100 מיקרומטר |
. שולחן 1 ריכוז וכמות של כל תקן פנימי להוסיף 50 mL בקבוקון נפחי.
| סמים | ריכוז מניות | הוספת אמצעי אחסון |
| שאלות ותשובות | 0.5 מ"ג/mL | 8 μL |
| מהירות התנועה | 0.5 מ"ג/mL | 8 μL |
| EMB | 1 מ"ג/mL | 4 מיקרומטר |
| מיכל הפול | 1 מ"ג/mL | 4 מיקרומטר |
| PTM | 1 מ"ג/mL | 4 מיקרומטר |
| איזוניאציד | 1 מ"ג/mL | 40 מיקרומטר |
| לפני ה, LFX | 1 מ"ג/mL | 40 מיקרומטר |
| לייזר הורד | 1 מ"ג/mL | 40 מיקרומטר |
| מודל MFX | 1 מ"ג/mL | 40 מיקרומטר |
| PZA | 1 מ"ג/mL | 40 מיקרומטר |
. שולחן 2 כמות כל תקן התייחסות לתרופה כדי להוסיף בקבוקון "Ref Std מיקס 1".
| שם תווית | בקבוקון שצויר מ | הוספת אמצעי אחסון |
| C0 | N/A | 0 מיקרומטר |
| C1 | שילוב של מיקס Std df1000 | 5 מיקרומטר |
| C2 | שילוב של מיקס Std df1000 | 10 מיקרומטר |
| C3 | שילוב של מיקס Std df1000 | 20 μL |
| C4 | שילוב של מיקס Std df100 | 5 מיקרומטר |
| C5 | שילוב של מיקס Std df100 | 10 מיקרומטר |
| C6 | שילוב של מיקס Std df100 | 20 μL |
| C7 | שילוב של מיקס Std df10 | 5 מיקרומטר |
| C8 | שילוב של מיקס Std df10 | 10 מיקרומטר |
| C9 | שילוב של מיקס Std df10 | 20 μL |
| C10 | שילוב של מיקס Std טיל df1 | 5 מיקרומטר |
| C11 | שילוב של מיקס Std טיל df1 | 10 מיקרומטר |
. שולחן 3 הסכום של כל מערבל Ref-Std להוספה לנקודות כיול של 12.
| סה ' ' כ זמן (מזערי) | קצב זרימה (μL/min) | A (%) | B (%) |
| 0 | 450 | 95 | מיכל 5 |
| 0.3 | 450 | 95 | מיכל 5 |
| 2.3 | 450 | 0 | 100 |
| מיכל 5 | 550 | 0 | 100 |
| 11 | 550 | 0 | 100 |
| 11.1 | 550 | 95 | מיכל 5 |
| 13 | 450 | 95 | מיכל 5 |
| 16.75 | 450 | 95 | מיכל 5 |
. שולחן 4 קצב הזרימה ומעבר הצבע של הפאזה הניידת המשמשים עבור כל זריקה.
| נקודת כיול | ריכוז בפועל של BDQ, CLF, ETH, EMB, PTH, PTH (ng/mg) | ריכוז בפועל של INH, LFX, LZD, MFX, PZA (ng/mg) |
| C0 | 0 | 0 |
| C1 | 0.005 | 0.05 |
| C2 | 0.01 | 0.1 |
| C3 | 0.02 | 0.2 |
| C4 | 0.05 | 0.5 |
| C5 | 0.1 | 1 |
| C6 | 0.2 | 2 |
| C7 | 0.5 | מיכל 5 |
| C8 | 1 | 10 |
| C9 | 2 | 20 |
| C10 | מיכל 5 | 50 |
| C11 | 10 | 100 |
. שולחן 5 ריכוז סופי של האנליטים. בכל נקודת כיול
| סמים | לוד (ng/mg שיער) |
מיכל בע (ng/mg שיער) |
מיכל הלוי (ng/mg שיער) |
ערכים לדוגמה (ng/mg שיער) דוגמאות: UC-04, UC-08, UC-11, UC-16, UC-25, UC-36, UC-69, UC-83, UC-89, UC-90, UC-91, UC-104, UC-105, UC-108, UC-109 |
| בדקווינין | 0.005 | 0.05 | 10 | 0.21, 0.38, 0.56, 0.86, 0.90, 1.04, 1.29, 2.15, 2.29, 5.64 |
| קלופצין | 0.005 | 0.05 | 10 | 0.37, 0.61, 1.84, 2.20, 2.90, 3.41, 3.90, 6.03, 8.25, 10.66, 11.01 |
| אתאמבולטול | 0.005 | 0.05 | 10 | 0.04, 0.05, 0.25, 0.42, 0.43, 0.5, 0.68, 0.92, 0.95, 1.01, 1.53, 1.54, 9.76 |
| אתיואמיד | 0.01 | 0.01 | 10 | < לוד, < לוד, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.17 |
| איזויוניאיד | 0.05 | 0.5 | 100 | < לוד, < לוד, 0.12, 0.26, 0.84, 0.94, 1.36, 2.88, 4.03, 4.04, 9.14 |
| Levofloxacin | 0.1 | 0.5 | 100 | 8.01, 8.42, 15.37, 24.41, 39.45, 42.12, 56.15, 75.58, 119.96 |
| לינזוליד | 0.1 | 0.5 | 100 | 0.87, 1.09, 3.51, 5.51, 7.80, 9.21, 15.68, 18.32, 19.13, 21.22 |
| Moxifloxacin | 0.05 | 0.5 | 100 | 0.35, 0.49, 1.58, 1.59, 6.23, 7.06, 13.14, 17.37, 21.72, 55.88, 86.64 |
| Pretomanid | 0.005 | 0.05 | 10 | 0.57 |
| פרוטיונואמיד | 0.002 | 0.01 | 10 | |
| פירמידה | 0.05 | 1 | 100 | 1.14, 1.74, 1.86, 3.21, 5.94, 11.39, 12.36, 12.71, 12.85, 14.38, 16.13, 44.17, 69.66 |
. שולחן 6 רמות מייצגים של תרופות הנמדד 15 חולים נטילת תרופות DR-TB תחת DOT. מגבלת הזיהוי (לוד), מגבלה נמוכה יותר של כימות (יוסה) ומגבלה עליונה של כימות (ULOQ) של השיטה עבור כל תרופה ניתנת להשוואה.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
אנו מדווחים כאן פרוטוקול עבור השיטה שפיתחנו ואומת עבור כימות 11 נגד שחפת תרופות מנוצל בטיפול של DR-TB דגימות שיער קטנות באמצעות LC-MS/MS. אין שיטה אחרת עבור כימות אלה 11 תרופות בשיער פותחה בעבר, מאומת ופורסם. השיטה שלנו יכולה לכמת תת-ננו רמות של תרופות רק 20-30 קווצות שיער של כ 3 סנטימטרים (cm) אורך (~ 2 מ"ג) ו כבר אומת22. המשקל הנמוך של השיער שנותחו משמעו שהחולים המעורבים במחקר יכולים להשתתף בדיסקרטיות ולחזור לבדיקה חוזרת ללא חשש מחשיפת קרקפת קירחת. בעבר פרסמנו נתונים על הקשר בין רמות התרופות של DR-TB בשיער ותוצאות DR-טיפול23. לכן, הפיתוח והאימות של שיטת פאנל רב-אנליטה זו מייצגת מקדמה משמעותית בתחום הניטור הרפואי של DR-TB.
שיער דורש טכניקות שונות הומוקות מאשר אלה הנדרשים עם ביואטריסס נוזלי. כתישה של קווצות שיער אפשרה גישה יעילה של הממס החילוץ כדי אנליטים במטריצת השיער. כך, תכונה אחת חשובה של השיטה שלנו היא תהליך החילוץ מהירה וקלה של סמים מהשיער באמצעות דגימות מרוסק. זמן דגירה במהלך תהליך החילוץ הוא רק שניים h, עקב שטח השטח נגיש גדול של שיער מרוסק, ואין צעד נקי למעלה, בשל גודל מדגם קטן (2 מ"ג). הטיפול חייב להילקח, אם כי, כדי להגביל את הירידה בסמים במהלך תהליך החילוץ. הפרוטוקול משתמש התחדשות שני מחזור, עם תקופת צינון של 45 s בין מחזורי. תהליך זה נמנע מהתחממות יתר ועלול לפגוע בסמים בשיער.
בניגוד לניתוחי שיער רבים לתרופות התעללות, שיטה זו אינה משתמשת בצעד כביסה. תרופות DR-TB באים כמוסה או טופס לוח, הגבלת מקורות אפשריים של זיהום חיצוני ואת הצורך הבאים לשטוף שיער לפני הניתוח. מחקרים עתידיים יכול לנתח את הממס לשטוף מתוך שיער החולה DR-TB כדי להעריך זיהום חיצוני.
למרות כתישה השיער מקדמת חילוץ תרופות יעיל, יש לו מגבלות משלה. המעבדה שלנו מצאה כי אם השיער מרוסק בתוך החרוזים ומשמאל בטמפרטורת החדר, הריכוז של כמה 11 התרופות פוחתת במשך שבועות וחודשים. זה עשוי להיות בשל שטח גדול של שיער מרוסק נחשף לאווירה שיכולה לקדם חמצון ותגובות השפלה אחרות. אם לימוד יציבות של תרופות בשיער רצוי, ניתן לגזור את השיער עם מספריים למקטעים קטנים של < 1 ס מ, הומוגניים ביד, ולאחר מכן שמאלה בטמפרטורת החדר במשך שבועות או חודשים במהלך מחקר היציבות. כאשר שיער לחתוך זה מרוסק ביום של ניתוח, לא הבחנו כל השפלה סמים משמעותיים לאורך זמן. מכאן, בביצוע הפרוטוקול המתואר, אנו ממליצים כי שיער להיות מרוסק על היום שהוא מופק. כמו כן, כל תערובות הסמים מתחת 10 הריכוזים של g/mL צריך להיות מוכן ביום החילוץ.
לא ניתן לפרסם שיטות שפורסמו בעבר כדי להעריך את ההתאמה של טווחים דינאמיים ליניאריים (יוסה-ULOQ) שאנחנו הקמנו עבור כל סם שחפת בשיטה רב-אנליטה. עם זאת, מדגם הנוחות של דגימות שיער ממערב קייפ, דרום אפריקה, מציין את ההתאמה של טווח דינמי ליניארי של שיטה זו. למעט ethionamide, pretomanid, ו prothionamide, יותר מ 95% של רמות התרופה שאנו מודדים בחולים אלה הם בתוך טווח דינמי ליניארי של כל האנליטה. רק מטופל אחד היה לוקח pretomanid (אשר זוהה), ואין חולים לוקחים prothionamide. עבור ethionamide, אנחנו ההשערה כי הסם לא יכול להפקיד היטב את מטריצת השיער, כמו לוד שלנו הוא 0.01 ng/mg שיער (או 10 pg/mg שיער) ועדיין רק אחד משמונת החולים לקיחת ethionamide יש רמות יותר מ 0.02 ng/mg שיער. בדיקה נוספת מוצדקת כדי לקבוע את הפרמקוקינטיקה של תרופות שונות של שחפת בשיער. לדוגמה, חלופה פוטנציאלית לניטור תרופות כמו ethionamide היא לפתח שיטה מיקוד שלהם מטבוליזם (s) במקום. הגענו להסתכלות דומה עבור delamanid, תרופה הרומן של DR-TB, אשר היה בתחילה חלק מלוח זה. שיטה לפילוח של delamanid של המטבוליייט הוא כעת בתהליך של להיות מאומת במעבדה שלנו, כי המטוליט נמצא בריכוזים גבוהים יותר מאשר התרופה ההורה. את אותו ההליך ניתן לבצע עבור ethionamide. ריכוזי הסמים בטבלה 6 מוצגים כקבוצה משום שהתוצאות הבודדות והתוצאות הקליניות אינן מתמקדות בנייר שיטה זה. הערכה אינדיבידואלית של קבוצת חולים זו פורסמה במקום אחר23.
המטופלים תורמים דגימות שיער קטנות עבור המחקר ההפגנה היו מנוהלים מגוון של תרופות משטרי באמצעות DOT בסביבה אשפוז, וכל משטרי תועדו על פי רשומות האחיות במהלך תקופת החולה. עם זאת, כפי שנפוץ בקרב מטופלים DR-TB, הקודם, משטרי התרופה גרוע גם היה מנוהל לפני שהייה אשפוז שלהם. זה הוביל לגילוי של תרופות בשיער חולה שלא צוין על הרשומות שלהם המטופלים. לכן, אנחנו לא יכולים להשתמש בדגימות אלה כדי לקבוע ספציפיות של השיטה, כפי שאנחנו לא יכולים לקבוע אם דגימות אלה היו באמת שווא תוצאות חיוביות. במקום זאת, בדקנו שיער מחולים שלא לקחו תרופות DR-TB. לא זוהו תרופות DR-TB בדגימות אלה, המציינות כי השיטה היא ספציפית.
למרות השיטה שלנו מדגים את התועלת של שימוש בשיער במדידת תרופות DR-TB, ניתוח שיער יש ערכה משלו של מגבלות. מכיוון ששיער הוא מטריצה מוצק, העולה של סטנדרטים התייחסות סמים במהלך אימות השיטה אינו מאפשר את הסטנדרטים ' שילוב מלא לתוך המטריצה כמו עם שתן ודם. לפיכך, הערכת שחזור מוגבלת לאיתור של התרופה לאחר שהוא מגיע אל המטריצה המוצק, ולא לאחזור בפועל מן המטריצה. כמו כן, כי השיער הוא מטריצה חלופית כי הוא עדיין בוחנים עבור בדיקות, לא זמין טווחי התייחסות לתרופות זמינים להערכת שיטה התאמה. מחקרים פרמקוקינטיים יותר על התאגדות של תרופות לתוך השיער יהיה שימושי כדי להבין עוד את השירות של רמות הסמים השיער בניטור הדבקות. לבסוף, האוסף הנכון של דגימות השיער באתרי השדה יש אתגרים ייחודיים משלו. בעוד אוסף ואחסון של דגימות שיער דורש פחות משאבים מאשר ביולוח אחרים, הטיפול חייב להיות נלקח כדי לזהות את הקצוות הגבוהים והאבותיים של קווצות שיער יותר מ 2 ס"מ. קווצות שיער ארוך יותר עשויים להיות ריכוזי סמים שונים לאורך סטרנד, בהתאם לשימוש בתרופות לאורך זמן. תיוג נאות מאפשר ניתוח של קטעים ספציפיים של קווצות; במקרה של השיטה שלנו, שלושת הסנטימטרים של השיער הקרוב ביותר לקרקפת שימש כדי לקבוע את הנתונים האחרונים על הדבקות תרופות. תיוג נאות דורש הכשרה והליכי אבטחת איכות באתרים.
לסיכום, פיתחנו הפאנל multi-אנליט הראשון לניתוח תרופות לשחפת המשמש DR-TB באמצעות LC-MS/MS בדגימות שיער קטן. בהינתן הכדאיות של איסוף ואחסון שיער בהגדרות משאבים מוגבלים, השיטה שלנו מייצגת מקדמה משמעותית בתחום הפיקוח על התרופות הטיפוליות בשחפת. האמצעים האובייקטיביים של חשיפה לסמים, כי לקחת בחשבון הן הדבקות והשונות הפרמקוקינטיות הפרט עשוי לספק אינדיקציה מוקדמת של משטרי טיפול לא יעיל, ובכך לסייע הן לטיפול פרטני, כמו גם הגבלת העברת הקהילה של DR-TB24.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
עבודה זו נתמכת על ידי המכון הלאומי לאלרגיה ומחלות זיהומיות RO1 AI123024 (Co-פיס: ג'ון מטסואפה ומוניקה גנדי).
Acknowledgments
המחברים רוצים להודות לפרופסור Keertan Dheda, ד ר עלי Esmail, ו מאריטג'יאה פרטוריוס באוניברסיטת קייפ טאון המכון לריאות שהקל על אוסף דגימות שיער למחקר. המחברים מכירים בהכרת העבודה את התרומות של המשתתפים במחקר.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 2 mL injection vials | Agilent Technologies | 5182-0716 | |
| 250 uL injection vial inserts | Agilent Technologies | 5181-8872 | |
| Bead ruptor 24 | OMNI International | 19001 | |
| Bead ruptor tubes (2 mL bead kit, 2.8mm ceramic, 2 mL microtubes) | OMNI International | 19628 | |
| Bedaquiline | Toronto Research Chemicals | B119550 | |
| Bedaquiline-d6 | Toronto Research Chemicals | B119552 | |
| Clofazimine | Toronto Research Chemicals | C324300 | |
| Clofazimine-d7 | Toronto Research Chemicals | C324302 | |
| Disposable lime glass culture tubes | VWR | 60825-425 | |
| Ethambutol | Toronto Research Chemicals | E889800 | |
| Ethambutol-d4 | Toronto Research Chemicals | E889802 | |
| Ethionamide | Toronto Research Chemicals | E890420 | |
| Ethionamide-d5 | ClearSynth | CS-O-06597 | |
| Formic acid | Sigma-Aldrich | F0507-100mL | |
| Glass bottles | Corning | 1395-1L | |
| Hot Shaker | Bellco Glass Inc | 7746-32110 | |
| HPLC | Agilent Technologies | Infinity 1260 | |
| HPLC grade acetonitrile | Honeywell | 015-4 | |
| HPLC grade methanol | Honeywell | 230-1L | |
| HPLC grade water | Aqua Solutions Inc | W1089-4L | |
| Isoniazid | Toronto Research Chemicals | I821450 | |
| Isoniazid-d4 | Toronto Research Chemicals | I821452 | |
| LC column, Synergi 2.5 um Polar RP 100 A 100 x 2 mm | Phenomenex | 00D-4371-B0 | |
| LC guard cartridge | Phenomenex | AJ0-8788 | |
| LC guard cartridge holder | Phenomenex | AJ0-9000 | |
| LC-MS/MS quantitation software | Sciex | Multiquant 2.1 | |
| Levofloxacin | Sigma-Aldrich | 1362103-200MG | |
| Levofloxacin-d8 | Toronto Research Chemicals | L360002 | |
| Linezolid | Toronto Research Chemicals | L466500 | |
| Linezolid-d3 | Toronto Research Chemicals | L466502 | |
| Micro centrifuge tubes | E&K Scientific | 695554 | |
| Moxifloxacin | Toronto Research Chemicals | M745000 | |
| Moxifloxacin-13C, d3 | Toronto Research Chemicals | M745003 | |
| MS/MS | Sciex | Triple Quad 5500 | |
| OPC 14714 | Toronto Research Chemicals | O667600 | |
| Pretomanid (PA-824) | Toronto Research Chemicals | P122500 | |
| Prothionamide | Toronto Research Chemicals | P839100 | |
| Prothionamide-d5 | Toronto Research Chemicals | P839102 | |
| Pyrazinamide | Toronto Research Chemicals | P840600 | |
| Pyrazinamide-15N, d3 | Toronto Research Chemicals | P840602 | |
| Septum caps for injection vials | Agilent Technologies | 5185-5862 | |
| Turbovap LV evaporator | Biotage | 103198/11 |
References
- WHO. Global Tuberculosis Control 2017. , Geneva. Available from: www.who.int/tb/publications/global_report/en/ (2017).
- WHO. Tuberculosis. , Geneva. Available from: www.who.int/mediacentre/factsheets/fs104/en/ (2017).
- Kurbatova, E. V., et al. Predictors of poor outcomes among patients treated for multidrug-resistant tuberculosis at DOTS-plus projects. Tuberculosis (Edinb). 92, 397-403 (2012).
- Dheda, K., et al. The epidemiology, pathogenesis, transmission, diagnosis, and management of multidrug-resistant, extensively drug-resistant, and incurable tuberculosis. Lancet Respiratory Medicine. , (2017).
- Berg, K. M., Arnsten, J. H. Practical and conceptual challenges in measuring antiretroviral adherence. Journal of Acquired Immunodeficiency Syndromes (JAIDS). 43, Suppl 1 79-87 (2006).
- Kagee, A., Nel, A. Assessing the association between self-report items for HIV pill adherence and biological measures. AIDS Care. 24 (11), 1448-1452 (2012).
- Haberer, J. E., et al. Adherence to antiretroviral prophylaxis for HIV prevention: a substudy cohort within a clinical trial of serodiscordant couples in East Africa. PLoS Medicine. 10 (9), 1001511 (2013).
- Pullar, T., Kumar, S., Tindall, H., Feely, M. Time to stop counting the tablets. Clinical Pharmacology & Therapeutics. 46 (2), 163-168 (1989).
- Liu, H., et al. A comparison study of multiple measures of adherence to HIV protease inhibitors. Annals of Internal Medicine. 134 (10), 968-977 (2001).
- Wendel, C., et al. Barriers to use of electronic adherence monitoring in an HIV clinic. Annals of Pharmacotherapy. 35, 1010-1101 (2001).
- Ruiz, J., et al. Impact of voriconazole plasma concentrations on treatment response in critically ill patients. Clinical Pharmacology & Therapeutic. , (2019).
- Saktiawati, A. M., et al. Optimal sampling strategies for therapeutic drug monitoring of first-line tuberculosis drugs in patients with tuberculosis. Clinical Phamacokinetics. , (2019).
- Podsadecki, T. J., Vrijens, B. C., Tousset, E. P., Rode, R. A., Hanna, G. J. "White coat compliance" limits the reliability of therapeutic drug monitoring in HIV-1-infected patients. HIV Clinical Trials. 9 (4), 238-246 (2008).
- Cuypers, E., Flanagan, R. J. The interpretation of hair analysis for drugs and drug metabolites. Clinical Toxicology. 56 (2), 90-100 (2018).
- Knitz, P., Villain, M., Crimele, V. Hair analysis for drug detection. Therapeutic Drug Monitoring. 28 (3), 442-446 (2006).
- Barroso, M., Gallardo, E., Vleira, D. N., Lopez-Rivadulla, M., Queiroz, J. A. Hair: a complementary source of bioanalytical information in forensic toxicology. Bioanalysis. 3 (1), 67-79 (2011).
- Gandhi, M., et al. Atazanavir concentration in hair is the strongest predictor of outcomes on antiretroviral therapy. Clinical Infectious Diseases. 52 (10), 1267-1275 (2011).
- Koss, C. A., et al. Hair concentrations of antiretrovirals predict viral suppression in HIV-infected pregnant and breastfeeding Ugandan women. AIDS. 29 (7), 825-830 (2015).
- Pintye, J., et al. Brief Report: Lopinavir Hair Concentrations Are the Strongest Predictor of Viremia in HIV-Infected Asian Children and Adolescents on Second-Line Antiretroviral Therapy. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes (JAIDS). 76 (4), 367-371 (2017).
- Baxi, S. M., et al. Nevirapine Concentration in Hair Samples Is a Strong Predictor of Virologic Suppression in a Prospective Cohort of HIV-Infected Patients. PLoS One. 10 (6), 0129100 (2015).
- Gandhi, M., et al. Antiretroviral concentrations in hair strongly predict virologic response in a large HIV treatment-naive clinical trial. Clinical Infectious Diseases. 5, 1044-1047 (2019).
- Gerona, R., et al. Simultaneous analysis of 11 medications for drug resistant TB in small hair samples to quantify adherence and exposure using a validate LC-MS/MS panel. Journal of Chromatography B. 1125, 121729 (2019).
- Metcalfe, J., et al. Association of anti-tuberculosis drug concentration in hair and treatment outcomes in MDR- and XDR-TB. European Respriatory Journal Open Research. 5 (2), (2019).
- Metcalfe, J. Z., O'Donnell, M. R., Bangsberg, D. R. Moving Beyond Directly Observed Therapy for Tuberculosis. PLoS Medicine. 12 (9), 1001877 (2015).
