Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
JoVE Journal Biology
Click here for the English version

Biology

טכניקות עיבוד תמונה בטומוגרפיה ממוחשבת לאחר המוות: הערכה של בריאות ביולוגית ופרופיל בCeceans תקועים

Published: September 27, 2020 doi: 10.3791/61701
Automatic Translation
1,2, 3, 1, 1
1State Key Laboratory of Marine Pollution, City University of Hong Kong, 2Department of Veterinary Clinical Sciences, Jockey Club College of Veterinary Medicine and Life Sciences, City University of Hong Kong, 3School of Medical and Health Sciences, Tung Wah College

Summary

תוכנית התגובה לנטידות של הונג קונג שילבה טומוגרפיה ממוחשבת שלאחר המוות, המספקת מידע רב ערך על הבריאות הביולוגית והפרופיל של בעלי החיים שנפטרו. מחקר זה מתאר 8 טכניקות עיבוד תמונה החיוניות לזיהוי והדמיה של ממצאים שלאחר המוות בceceans תקועים, אשר יסייעו רופאים, וטרינרים ואנשי תגובה נטושים ברחבי העולם כדי לנצל באופן מלא את המודאליות הרדיולוגית.

Abstract

עם 6 שנות ניסיון ביישום virtopsy באופן שגרתי לתוך הונג קונג cetacean stranding תגובה תוכנית, הליכים virtopsy מתוקנן, טומוגרפיה ממוחשבת שלאחר המוות (PMCT) רכישה, לאחר תהליך, והערכה הוקמו בהצלחה. בתוכנית זו החלוצה cetacean virtopsy strandtopsy תגובה, PMCT בוצע על 193 cetaceans תקועים, מתן ממצאים שלאחר המוות כדי לסייע necropsy לשפוך אור על הבריאות הביולוגית והפרופיל של בעלי החיים. מחקר זה נועד להעריך 8 טכניקות עיבוד תמונה ב- PMCT, כולל שחזור רב-פלנטרי, רפורמציה פלנטרית מעוקלת, הקרנת עוצמה מקסימלית, הקרנת עוצמה מינימלית, עיבוד נפח ישיר, פילוח, פונקציית העברה ועיבוד נפח פרספקטיבה. מאויר עם דוגמאות מעשיות, טכניקות אלה הצליחו לזהות את רוב ממצאי ראש הממשלה בcececeans תקועים שימשו ככלי כדי לחקור את בריאותם הביולוגית ואת הפרופיל שלהם. מחקר זה יכול להנחות רדיולוגים, רופאים ווטרינרים דרך התחום הקשה והמסובך לעתים קרובות של עיבוד תמונה PMCT ותיאום.

Introduction

Virtopsy, המכונה גם הדמיה שלאחר המוות (PM), היא בדיקה של פגר עם שיטות הדמיה חוצה חתך מתקדמות, כולל טומוגרפיה ממוחשבת שלאחר המוות (PMCT), הדמיית תהודה מגנטית לאחר המוות (PMMRI), ואולטרסאונד1. בבני אדם, PMCT שימושי בחקירת מקרים טראומטיים שלשינויים שלד 2,,3,גופים זרים,ממצאים גזיים 4,,5,,6, ופתולוגיותשל מערכת כליהדם 7,,8,,9. מאז 2014, virtopsy מיושם באופן שגרתי בתוכנית התגובה התקועים של הונג קונג1. PMCT ו PMMRI מסוגלים לתאר ממצאים פתו-מורפולוגיים על פגרים כי הם רקובים מדי כדי להיות מוערך על ידי necropsy קונבנציונלי. ההערכה הרדיולוגית הלא פולשנית היא אובייקטיבית ותו לא, ומאפשרת חוות דעת שנייה או מחקרים רטרוספקטיביים שנים מאוחריותר 1,,10,,11. Virtopsy הפך טכניקה חלופית רבת ערך כדי לספק תובנות חדשות של ממצאי PM בבעלי חייםימיים נטושים 12,13,14,,15,16. בשילוב עם necropsy, שהוא תקן הזהב כדי להסביר את השחזור הפתופיזיולוגיואת סיבת המוות 17, ניתן לטפל בבריאות הביולוגית והפרופיל של בעלי החיים. Virtopsy הוכרה בהדרגה ומיושמת לתוך תוכניות תגובה נטושות ברחבי העולם, כולל אך לא רק קוסטה ריקה, יפן, סין היבשתית, ניו זילנד, טייוואן, תאילנד וארה"ב1.

טכניקות עיבוד תמונה ברדיולוגיה משתמשות באלגוריתמים ממוחשבים כדי להפוך מספרים למידע על הרקמה. לדוגמה, צפיפות רדיולוגית באה לידי ביטוי בצילומי רנטגן ו- CT קונבנציונליים. הכמות העצומה של נתונים רב-עוצמה מאוחסנת בתבנית הדמיה ותקשורת דיגיטלית ברפואה (DICOM). ניתן להשתמש בתמונות CT להפקת נתוני voxel isotropic באמצעות הדמיה דו-ממדית (דו-ממדית) ותלת-ממדית (תלת-ממדית) בתחנת עבודה תלת-ממדית לאחר עיבוד עבור הדמיה ברזולוציה גבוהה18,19. נתונים ותוצאות כמותיים ממופים כדי להפוך תמונות סיסיות שנרכשו באופן סדרתי לתמונות תלת-מית-מיוד עם פרמטריםבגווני אפור או צבע 19,20,21. בחירת שיטת הדמיית נתונים מתאימה מטכניקות עיבוד מגוונות היא גורם טכני חיוני של איכות ההדמיה, המשפיעה באופן משמעותי על הניתוח והפרשנות של ממצאים רדיולוגיים21. הדבר קריטי במיוחד עבור עבודה נטושה הכרוכה בכוח אדם ללא כל רקע רדיולוגיה, מי צריך להבין את התוצאות בנסיבות שונות17. המטרה של יישום טכניקות עיבוד תמונה אלה היא לשפר את האיכות על ההדמיה של פרטים אנטומיים, מערכות יחסים וממצאים קליניים, אשר מגביר את ערך האבחון של הדמיה ומאפשר ביצוע יעיל של האזורים המוגדרים שלעניין 17,,19,22,23,24,25.

למרות שתמונות CT/MRI ראשיות מכילות את רוב המידע, הן עשויות להגביל אבחון מדויק או תיעוד של פתולוגיות מכיוון שלא ניתן להציג מבנים במטוסים אורתוגונליים שונים. רפורמת תמונה במטוסים אחרים מיושרים אנטומית מאפשרת הדמיה של קשרים מבניים מנקודת מבט אחרת מבלי למקם מחדש אתהגוף 26. כמו אנטומיה רפואית ונתוני פתולוגיה משפטית הם בעיקר 3D בטבע, תמונות PMCT מקודדות בצבע ותמונות משוחזרות 3D מועדפים תמונות בקנה מידה אפור ותמונות פרוסה 2D מול ההבנה והתאים משופרת לתפיסות ביתמשפט 27,28. עם ההתקדמות בטכנולוגיית PMCT, דאגה של חקר הדמיה (כלומר, יצירה ופרשנות של תמונה דו-מימד ותלת-מימד) בחקירת PM cetacean הועלתה12,29. טכניקות עיבוד נפחיות שונות בתחנת העבודה ברדיולוגיה מאפשרות לרדיולוגים, טכנאים, רופאים מפנים (למשל, וטרינרים ומדעני יונקים ימיים), ואפילו הדיוטות (למשל, אנשי תגובה נטושים, קציני ממשלה וציבור כללי) לדמיין וללמוד את אזורי העניין. עם זאת, הבחירה של טכניקה מתאימה ובלבול של מינוח להישאר נושא מרכזי. יש צורך להבין את המושג הבסיסי, החוזקות והמגבלות של הטכניקות הנפוצות, שכן היא תשפיע באופן משמעותי על הערך האבחוני והפרשנות של ממצאים רדיולוגיים. שימוש לרעה בטכניקות עלול ליצור תמונות מטעות (לדוגמה, תמונות עם עיוותים, שגיאות עיבוד, רעשי שחזור או חפצים) ולהוביל לאבחוןשגוי 30.

המחקר הנוכחי נועד להעריך 8 טכניקות עיבוד תמונה חיוניות בPMCT ששימשו לזיהוי רוב ממצאי ראש הממשלה בceceans תקועים במים הונג קונג. תיאורים ודוגמאות מעשיות של כל טכניקה מסופקים כדי להדריך רדיולוגים, רופאים, ווטרינרים ברחבי העולם באמצעות התחום הקשה והמסובך לעתים קרובות של עיבוד תמונה PMCT ווידאו להערכת בריאות ביולוגית ופרופיל.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

הערה: במסגרת תוכנית התגובה לתקעים viracean הונג קונג, cetaceans תקוע נבדקו באופן שגרתי על ידי PMCT. המחברים היו אחראים על סריקת virtopsy, עיבוד נתונים לאחר עיבוד (למשל, שחזור תמונה ועיבוד), פרשנות נתונים, ודיווח virtopsy1. טכנולוגיה מתקדמת זו מדגישה ממצאים קשובים ונותן תובנות על החקירה הראשונית של ממצאי PM לפני necropsy קונבנציונלי (https://www.facebook.com/aquanimallab).

1. הכנת נתונים

  1. יצא את ערכות הנתונים של CT שנרכשו בתבנית DICOM 3.0. העתק את תיקיית DICOM למחשב (לדוגמה, שולחן עבודה).
  2. פתח מציג DICOM ללא תשלום או מסחרי. השלבים הבאים מבוססים על תחנת העבודה TeraRecon Aquarius iNtuition (גירסה 4.4.12).
  3. לחץ פעמיים על הסמל של סמל מציג לקוח iNtuition דלי (AQi). הזן שם משתמש, סיסמה ושם שרת בשדות המתאימים. לחץ על לחצן כניסה.
    הערה: ודא שלשדה שם השרת יש את כתובת ה- IP הנכונה של השרת.
  4. לחץ על יבא תחת לחצני כלי ניהול הנתונים ובחר בתיקיית DICOM לייבוא. לחץ על סמל עדכון כדי לחדש את רשימת ה הלימודים לאחר שמצב הייבוא יגיע ל- 100%.
  5. הצג את ערכות הנתונים על-ידי בחירה בסדרת CT אחת או מספר רבות מתוך רשימת המטופלים על-ידי לחיצה כפולה על הסידרה.
  6. לאחר טעינת הסדרה המיועדת, לחצו על לחצן 'פריסת חלון' עבור ממשק התצוגה של 2x2, המציגים פריסת ברירת מחדל של 2x2, תמונה מעובדת בעוצמה תלת-ממדית (החלונית השמאלית העליונה) ו-3 תמונות MPR בתצוגה סיסית (החלונית השמאלית העליונה), תצוגת קורונלית (החלונית השמאלית התחתונה), תצוגה קשתית (החלונית השמאלית התחתונה) המעניקה כיוונים שונים. Window Layout Button
  7. הערך את ערכות הנתונים של virtopsy ביסודיות באמצעות טכניקות עיבוד תמונה שונות שסופקו.

2. שחזור רב-פלנטרי (MPR)

  1. הצג את ה- MPR המוגדר כברירת מחדל מתצוגה סיסית (החלונית השמאלית העליונה), תצוגת קורונל (החלונית השמאלית התחתונה) ותצוגת קשת (החלונית הימנית התחתונה) לאחר טעינת הסדרה. שנה את מצב העיבוד ל- MPR על-ידי לחיצה באמצעות לחצן העכבר הימני על התמונה ובחר MPR או לחץ על MPR בסרגל הכלים המצומצם של מצב עיבוד.
  2. העריכו את ערכות הנתונים של virtopsy מהתמונה הראשונה לתמונה האחרונה באמצעות התצוגה הסרסית, ואחריהן תצוגות קורונליות ושאגיטליות, בעזרת הפונקציות הבאות: לחצו על Slice, לחצו לחיצה שמאלה על לחצן העכבר וגררו את העכבר כדי להציג ולהתאים את תמונת ה-CT פרוסה אחר פרוסה.
  3. לחץ עלפאן , לחצן העכבר לחיצה-לחיצה-שמאל וגרור את העכבר כדי להתאים את מיקום התמונה בתוך החלונית.
  4. לחץ עלגודל תצוגה , לחצן העכבר לחיצה-לחיצה-שמאל וגרור את העכבר כדי להגדיל או לגוון את התמונה.
  5. בחר את החלון/רמות המתאימים שנקבעו מראש על-ידי לחיצה על Abd 1 (רוחב חלון: 350, רמת חלון: 75), Abd 2 (רוחב חלון: 250, רמת חלון: 40), ראש (רוחב חלון: 100, רמת חלון: 45), ריאות (רוחב חלון: 1500, רמת חלון: -700), Bone עצם (רוחב חלון: 2200, רמת חלון: 200) בסרגל הכלים של חלון/רמה,בהתאם לאזורי העניין.
  6. לחץ על חלון/רמה (W/L),לחצן העכבר לחיצה-יד שמאל וגרור את העכבר כדי להתאים באופן ידני את רוחב החלון ואת רמת החלון של פרוסת CT.
  7. לחץ עלסובב , לחצן העכבר לחיצה-לחיצה שמאלה וגרור את העכבר כדי לסובב את תמונות MPR.
  8. לחצן העכבר לחיצה-שמאלה במרכז MPR Crosshairs כדי להתאים בו-זמנית את אזורי העניין והפרוסות ב- 3 תמונות MPR.
    הערה: קיימים מצבי עכבר עבור 4 הפונקציות העיקריות של סיבובים, גלילה גלילה, שינויים בשינויי חלון/רמה המסופקים על-ידי AQi כדי להקל על תהליך הצפייה. לקבלת קיצורי מקשים, ראה טבלה 1.

3. רפורמציה תכנון מעוקל (החייאה)

  1. להחליט על אזור העניין האנטומי. לחצן העכבר לחיצה שמאלית במרכז הכוונת של MPR לאזור המעניין המסוים.
  2. הצג את MPR מ- 3 תצוגות שונות. ודא שקרוסת ה-MPR ממוקמת במיקום הנכון. כוונן את הכוונת של MPR אם לא.
  3. בחר לוח תצוגה אחד מתצוגות סיסיות, קורונליות ושגית כפאנל לימוד, למשל, במטרה להציג את הסנפיר מתצוגה סיסית.
  4. בהתאם לפאנל המחקר, להתאים את הקו המורחב של הכוונת MPR (למשל, צבע כחול) מתצוגת קורונל בניצב לאזור של עניין על ידי לחיצה שמאל לחצן העכבר על נקודת הסיבוב של קו מורחב.
  5. כוונן קו מורחב נוסף (לדוגמה, צבע אדום) של הכוונת MPR מתצוגת sagittal במקביל לאזור העניין על-ידי לחצן העכבר בלחיצה-שמאל על נקודת הסיבוב של קו מורחב.
  6. עיין בתצוגה הצ'יתית כדי לבדוק אם אזור העניין מותאם כראוי. התאם את הקווים המורחבים אם לא. העריך את ערכות הנתונים של virtopsy באמצעות 4 הפונקציות העיקריות של סיבוב, גלילה, שינוי גודל תצוגה ושינויים בחלון/רמה.
    הערה: ישנם 3 קווים מורחבים צבעוניים של הכוונת MPR (ירוק, אדום, וכחול), המייצגים יישורים שונים של מישור MPR(איור 2).

4. הקרנת עוצמה מרבית (MIP)

  1. שנה את מצב העיבוד ל- MIP על-ידי לחיצה באמצעות לחצן העכבר הימני על התמונה ובחירה ב- MIP או על-ידי לחיצה על MIP בסרגל הכלים המצומצם של מצב עיבוד.
  2. התאם את עובי הלוח בפינה הימנית העליונה (מינימום: 1 מ"מ, מקסימום: 500 מ"מ) על-ידי לחיצה על הביאור הירוק ובחר עובי חדש כדי להמחין את אזורי העניין, למשל, את העץ הסיפונות בריאה.
  3. הערך את ערכות הנתונים של virtopsy באמצעות 4 הפונקציות העיקריות של שינויים בסיבוב, גלילה, שינוי גודל תצוגה ושינויים בחלון/רמה.

5. הקרנת עוצמה מינימלית (MinIP)

  1. שנה את מצב העיבוד ל- MIP על-ידי לחיצה באמצעות לחצן העכבר הימני על התמונה ובחירה ב- MinIP או על-ידי לחיצה על MinIP בסרגל הכלים המצומצם של מצב עיבוד.
  2. התאם את עובי הלוח בפינה הימנית העליונה (מינימום: 1 מ"מ, מקסימום: 500 מ"מ) על-ידי לחיצה על הביאור הירוק ובחר עובי חדש כדי להמחין את אזורי העניין (לדוגמה, עץ הסיממנות בריאה).
  3. הערך את ערכות הנתונים של virtopsy באמצעות 4 הפונקציות העיקריות של שינויים בסיבוב, גלילה, שינוי גודל תצוגה ושינויים בחלון/רמה.

6. עיבוד ישיר של עוצמת הקול (DVR)

הערה: כ- 1 מממשקי ברירת המחדל של צג 2x2, DVR (החלונית השמאלית העליונה) מציג את התמונות המעובדות תלת-ממדיות של הפגר. הגדרת תבנית ברירת המחדל של DVR היא AAA (מפרצת אבי העורקי בבטן; רוחב חלון: 530, רמת חלון: 385), המעניקה מבנה שלד ברוטו של הפגר.

  1. התאם באופן אוטומטי את הגדרת חלון החלונות על-ידי לחיצה על תבנית תחת המציג ובחר את תבנית ה- DVR המתאימה, לדוגמה, אפור 10% (רוחב חלון: 442, רמת חלון: 115), שבר (רוחב חלון: 2228, רמת חלון: 1414) במידת הצורך.
  2. לחץ על חלון/רמה (W/L),לחצן העכבר לחיצה-לחיצה-שמאל וגרור את העכבר כדי להתאים את רוחב החלון ואת רמת החלון של פרוסת CT באופן ידני, מתן שכבה חיצונית (למשל, משטח אפידרמיס) לשכבה הפנימית (למשל,מבנה פנימי).
  3. השתמש ב-4 הפונקציות העיקריות של שינויים בסיבוב, גלילה גלילה, שינוי גודל תצוגה וחלון/רמה לתיקונים נוספים.
    הערה: כל תבניות DVR המסופקות על ידי AQi הן מונחות קליניות אנושיות, לא מיועדות להדמיית PM של cetaceans.

7. פילוח ואזור עניין (ROI) עריכה

  1. מקטע את פרוסת תמונת CT באמצעות 3 כלים שונים, הכלי תצוגת לוח וקוביה, הכלי החזר השקעה חינם, וכלי גידול אזור דינמי.
  2. עבור הכלי לוח ותצוגת קוביה , לחץ על לוח תחת כלי, המעניק קו תצוגה מקבילי. התאם את מיקום הלוח על-ידי העברת הכוונת של MPR מתצוגות MPR המתאימות. שנה את עובי הלוח (מינימום: 1 מ"מ, מקסימום: 500 מ"מ) באמצעות סרגל עובי הלוח ,וכתוצאה מכך פילוח של תמונות מעובדות תלת-ממדיות של הפגר.
  3. לכלי החזר השקעה חינם, לחצו על FreeRO תחת כלי. החזק את מקש Shift בלוח המקשים והשתמש ב'צייר עיקול חופשי' ב- MPR, צייר עיגול ב- MPR או ב- Draw Sphere ב- MPR כדי לא לכלול/לכלול את אזור העניין בתצוגות MPR וב- DVR.
  4. עבור כלי גידול אזורים דינאמיים, לחץ על אזור תחת כלי. החזק את מקש Shift בלוח המקשים, לחצן העכבר לחץ לחיצה-שמאלה וגלול את הלחצן האמצעי של העכבר (גלילה כלפי מטה: הגדל את אזור הבחירה, גלול מטה: הקטן את אזור הבחירה), ותעניק אזור מסומן. לחץ על אל תכלול כדי למחוק את האזור. לחץ על כלול כדי לשמור על האזור.

8. פונקציות העברה (TF)

  1. לחץ על הגדרת תלת-מיוד תחתמציג , בחר העתק כדי ליצור דגם חדש משוחזר תלת-מית-ד.
  2. במודל החדש המושחזר תלת-מית, לחץ על FreeRO או על אזור תחת כלי. החזק את מקש Shift בלוח המקשים, השתמש ב- VR תלת-מידי כדי לכלול את אזור העניין ולאחר מכן לחץ על בחר.
  3. קבע את תצורת הגדרות ה- 3D, כולל מחוון W/L, תיבות קלט טקסט W/L, תפריט נפתח VR, מחוון אטימות (מינימום: 0, מקסימום: 1), תיבת קלט טקסט אטימות ומחוון צבע טווח HU תחת הגדרת תלת-מישו . Opacity Text-input Box
  4. לחץ באמצעות לחצן העכבר הימני על אחד מהמחוונים בשורת מחוון הצבע כדי לשנות את צבע ה- DVR. בחרו 'שנה צבע' והגדרו צבע מותאם אישית מ לוח הצבעים במידת הצורך.

9. עיבוד עוצמת קול פרספקטיבה (PVR)

  1. כדי להפעיל את מודול Flythrough, לחץ באמצעות לחצן העכבר הימני על הסדרה שנבחרה ובחר Flythrough מתפריט לחיצה ימנית.
  2. בחרו באשף '3D ראשי של העדפת סגנון קריאה' לבחירת תצוגה ראשית. לחץ על פריסת המסך 2x2 ועל אישור, וכתוצאה מכך RVR באופן אוטומטי, למשל, נקודתיים. ודא שאזור העניין נבחר.
  3. בנה נתיב טיסה על-ידי הצבת נקודות ההתחלה והסיום של נקודות הבקרה על-ידי ציור נתיב. תקן את הנתיב על-ידי לחיצה על לחצןערוך חיבור /ערוך נתיב בחלונית הכלים אם יהיה נתיב שבור או מבנה חסר, עריכת נקודות הבקרה עבור חלקים חלקים יותר של העקומה או תיקון בעיות. צור נקודות בקרה חדשות על-ידי לחיצה על נתיב הטיסה. לאחר שדרך הטיסה נכונה, לחץ על אישור.
  4. הצג את החלון Flythrough המוצג, המציג חלון מעופף ראשי, תצוגות MPR ותצוגה שטוחה.
  5. השתמש בכלי Cine על-ידי לחיצה על לוח הכלים הממוקם בצד ימין של המסך כדי להעריך את המבנה הזוהר. התאם את המהירות והכיוון של המעופף באמצעות טיסה לאחור, השהה, טוס קדימה, תאט את העוף, והאט את העוף תחת כלי הסינוס.

10. הערכת נתונים

  1. לבצע הערכתvirtopsy באופן שיטתי מהראש לזנב. זה בדרך כלל בתוך 30 דקות, פועל כהתייחסות וטרינרים מדריך עבור necropsy הבא.
  2. לאחר necropsy, להשוות ממצאים virtopsy וממצאי necropsy. בהתבסס על דו"ח האתר, virtopsy, necropsy, וניתוח מדגם (למשל, היסטופתולוגיה ומיקרוביולוגיה), לסיים את חקירת ראש הממשלה על הבריאות הביולוגית והפרופיל של cetacean תקוע.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

מינואר 2014 עד מאי 2020 נבדקו בסך הכל 193 צ'אצ'נים שנתקעו במים של הונג קונג על ידי PMCT, כולל 42 דולפינים סנפירים אינדו-פסיפיק (סוזה צ'יננזיס), 130 דולפינים חסרי סנפיר של אינדו-פסיפיק(Neophocaena phocaenoides)ו-21 מינים אחרים. סריקת גוף שלמה בוצעה על 136 פגרים בעוד 57 היו סריקות חלקיות על גולגולות וסנפירים. תכונות אנטומיות ופתולוגיות שנצפו בדרך כלל היו מאוירים עם 8 טכניקות עיבוד תמונה להערכת הבריאות הביולוגית של cetaceans תקועים ופרופיל.

Figure 1
איור 1: פונקציית MPR המציגה דולפין גדול סנפיר סנפיר קדום אינו-פסיפי שנפטר (A) סיסי, (ב) משוחזר תלת-מיוד, (ג) קורונה משוחזרת, ו-(D) שיחזר תצוגות קשת. מדידות שטח של החלל atlanto-occipital מדגימים במטוס ציצי. מדידות ליניאריות של שחפת גחון לשוליים החיצוניים של condyle העורפי (קורונל), קשת הבס-גב קשת opisthion-גחון (קשת) לאבחון של דיסוציאציה atlanto-occipital מדגימים. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

Figure 2
איור 2: פונקציית החייאה המציגה מבנים מעוקלים בסנפיר של דולפין ללא סנפירים של האינדו-פסיפיק שנפטר בתצוגה בירנית. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

Figure 3
איור 3: פונקציית MIP המדגישה את הנוזלים הריאתיים המוגזמים (נקודות לבנות עזות) בשתי הריאות של דולפין ללא סנפירים של אינדו-פסיפיק שנפטר. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

Figure 4
איור 4: פונקציית MinIP המדגישה מבנים מלאים בגז, כלומר, עצי קנה הנשימה בשתי הריאות של דולפין ללא סנפירים של אינדו-פסיפיק שנפטר. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

Figure 5
איור 5: פונקציית DVR המציגה רכיבים שונים של דולפין ללא סנפירים באוקיינוס השקט שנפטר. (א)כלי דם הממוקם על מערכת השלד מודגשים על ידי AAA. מערכתהנשימהמודמת על ידי לונג. (ג)מערכת השלד כולל לוחות physeal החוליות מודגש על ידי עצם בתוספת צלחת. (ד)עצמות אוזניים היפר-אטנויות וווים לדגים מודגשים על-ידי חומרה. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

Figure 6
איור 6: פונקציית עריכת ROI המציגה דולפין ללא סנפירים של אינדו-פסיפיק שנפטר (A) עם ספת CT ו-(B) עם ספת CT הוסרה. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

Figure 7
איור 7: פונקציית TF המציגה רכיבים שונים של דולפין ללא סנפירים באוקיינוס השקט שנפטר. חול באק אוויר מודגש ציאן. תכולת הקיבה מסומנת בירוק. נגע דלקת מסטיטיס גרנולומטית טפילית מודגש באדום. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

Figure 8
איור 8: פונקציית PVR המדגימה ברונכוסקופיה וירטואלית של דולפין גדול סנפיר סנפיר ים-פסיפי שנפטר עם פונקציית Flythrough. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של נתון זה.

טבלה 1: קיצורי מקשים של התוכנה עבור פונקציות שונות לאחר העבודה של תמונה. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

להדמיה ברורה של ערכות נתונים virtopsy, 8 טכניקות עיבוד תמונה, המורכבות הן 2D והן עיבוד 3D, הוחלו באופן שגרתי על כל פגר תקוע לחקירת PM של בריאותם הביולוגית ופרופיל. טכניקות עיבוד אלה כללו MPR, החייאה, MIP, MinIP, DVR, פילוח, TF, ו PVR. טכניקות עיבוד מגוונות משמשות באופן משלים יחד עם התאמת חלון. המושגים של כל טכניקת רפורמת תמונה ויתרונות מתוארים גם.

שחזור רב-פלנטרי (MPR)
MPR הוא תהליך של יצירת תמונות דו-מידיות לא-סיסיות, כולל הקורונה, קשת, וכל תמונת מטוסאלכסוני מיושר אנטומית 24,30, אשר לא נרכש ישירות במהלך הרכישה במטוס סיסי. טכניקת עיבוד 2D דומיננטית זו מועילה במיוחד בהערכת כל מבנה אנטומי שלם או פתולוגיה במטוס הנדרש עם תמונותבאיכות גבוהה 31,32. בעזרת MRP, החקירות של ראש הממשלה של כל הגוף, אורתופדיה, נוירולוגית / עמוד שדרה בוצעו באופן שגרתי ב 3 כיוונים בו זמנית, אשר שיפרו באופן משמעותי את הדיוק שלממצאים (איור 1). באמצעות תצפית מקיפה מ-3 המטוסים, קצב השגיאה של זיהוי שגוי של פתולוגיות דקות מצטמצם. בנוסף, MPR תומכת גם במדידה ליניארית ואזורית במטוס ים,סיסי, קורונלי וסאגיטל. עם זאת, הוא תלוי במפעיל, ודורש ידע אנטומי מספיק כדי לזהות הן מבנים נורמליים והן תנאים פתולוגיים, אשר מונעים פרשנות שגויה של התמונות שניתנו.

רפורמציה פלנטרית מעוקלת (החייאה)
החייאה נקראת גם MPR מעוקל. למרות שטופלו כ-MRP בחלק מהספרות העמיתים, החייאה היא טכניקת עיבוד דו-ממדית מובהקת. באמצעות הדמיה isotropic המיישר את הציר הארוך של מישור התמונה עם מבנה אנטומי נבחר, תמונות דו-ממדיות מאותחלות מחדש ללא אובדן איכות תמונה18,24. הדבר מאפשר לאופרטור להגדיר באופן ידני נתיב קו מרכזי לשחזור מעוקל בתוך ערכת הנתונים הנפחית. זה קריטי במיוחד כאשר הנושא לא יכול להיות ממוקם בעמדה אנטומית אמיתית או יחסית אמיתית ביחס לגלאי PMCT (כלומר, תמונה אמיתית משוחזרת קורונל / sagittal / axittal / axial), במיוחד עבור פגרים קפואים או חנוט. יש צורך ביישור של מבנים מורכבים, נזיקין או מסויד כדי להשיג תמונה סימטרית יותר לאבחון. בשל מאפייני ההשתחה והעיוות הגמישים שלו, ניתן לפרש אותה בקלות. המפעיל חייב לזכור בבירור את המיקום והצורה של המבנים האנטומיים של עניין. פליפרים הם אחד מחלקי הגוף הקשים ביותר כדי להשיג תנוחה אנטומית אמיתית כפי שהם מעוקלים לכיוון אגפי הגוף, אלא אם כן נותק לפני סריקת PMCT. עם ניצול ההחייאה, רוב התכונות האנטומיות בסנפירים הפגינו במטוס אחד ולאותן גיל השלד(איור 2).

הקרנת עוצמה מרבית (MIP)
MIP מקרין רק את ערך ההתנפחות הגבוה ביותר בכל פיקסל של ערכות הנתונים הנפחיותבתוך מראה 32 של הצופה ובוחר את הווקסל בעוצמה המרבית כערך של פיקסל התצוגההמתאים 18. במקור, טכניקה זו מוכרת כדי להעריך את החומר האוסטיאולוגי, שתלים מתכתיים, ומבנים מלאים ניגודיות עבור אנגיוגרפיה CT ב אנטורטם רדיולוגיהקלינית 17,33. בשל ריקבון של מבנים פנימיים ואיברים, והיעדר זיגת דם בגוויות נטושות, אימוץ MIP בהערכת המבנים מלאים ניגודיות עבור אנגיוגרפיה CT להיות קשה מאוד virtopsy. עם זאת, MIP עדיין לוקח אופי דומיננטי בבדיקת חומרים אוסטאולוגיים, גופים זרים (למשל, בולוס מזון, שרידי דגים, אבן, הסתבכות מתכתית) והסתיידויות בתוך רקמות רכות, כמו גם מבנים מאוד מורכים, צרים, ודם או מים מלאים כגון העורקים הראשיים ורידים. באמצעות התאמת עובי הלוח (כלומר, עובי תמונה לשחזור נתונים) סובייקטיבי לגודל היעד המוערך, ניתן להדגיש את ההדמיה של נגעים. לדוגמה, באמצעות הזזה שונה לוחדק 34, זיהוי של נזלים ריאתיים קטנים בריאות קרסו של פגר תקוע שופרה באופן אינטנסיבי, כמו MIP הדגיש דקות אלה של כתמים hyperattenuated, אשר עדות הנוכחות שלאיחוד ריאות ודלקת ריאות טפילית (איור 3).

הקרנת עוצמה מינימלית (MinIP)
בניגוד ל-MIP, MinIP מקדם רק את ערך ההתנפחות הנמוך ביותר שנתקלו בו לאורך מעבר קרן דרך נפח לכיווןמראה הצופה בתוך אמצעי אחסון 18,24. למרות MinIP אינו משמש בדרך כללברדיולוגיה קלינית 24, טכניקה זו עדיין שימשה ככלי הדמיה מעולה על מבנים hypoattenuated ומבנים מלאים בגז, כגון מערכת הנשימה ומערכת העיכול. בדיקת המורפולוגיה וחריגות פרמנצ'ים ריאתיים, החלה מחור הנשימה עד לעץ קנה הנשימה, באצטונים הנטושים שופרו באופן משמעותי(איור 4). בדומה ל-MIP, יש לקחת בקרה נוספת על עובי הלוח, בכפוף לפתולוגיות שנבדקו, כדי ליצורתמונה בולטת יותר 35, מכיוון שעובי הלוח הוא קריטי כדי לקבוע את ההבחנה של המבנים המוצגים על המבנים הנחקרים.

עיבוד עוצמת קול ישיר (DVR)
DVR הוא אלגוריתם הממיר תמונה תלת-מית-מית-מותכת שלמה לתמונות דו-מית-מיד ישירות מבלי למחוקמידע כלשהו 18. התמונה הדו-מית-מיוחד המוצגת סופית נוצרת בהתבסס על יחידות Hounsfield שלה על-ידי הקצאת כל voxel בתמונה ערך צבע אטימות ספציפי יחד עם voxels אחרים באותה קרן הקרנה. כאופוזיציה ליצירת ייצוג ביניים (למשל, מודל משטח שחולץ על ידי כלי להסרת רקמות רכות), ניתן לבחון את התנאים הפנימיים והחיצוניים של פגר נטוש בכל המעמקים בשיטת תלת-מימד, מבלי לטשטש זה את זה. טכניקת עיבוד תלת-ממדי זו הייתה כלי מהיר, רב-תכליתי ואינטראקטיבי להערכת פגר לכל הגוף מכל זווית. ניתן היה לזהות נגעים גרמיים, שברים מורכבים, פיצול גוף וגופים זרים הנגרמים על ידי אינטראקציה אנושית (למשל, פציעות טראומטיות שנגרמו כתוצאה מהתנגשות כלישיט ודיג) (איור 5). האתגר של DVR הוא כי המפעיל צריך להתאים את פרמטרי עיבוד, כלומר,האטימות והבהירות, כדי להציג את כלי הדםבצורה מדויקת יותר 21,36.

פילוח ועריכת אזור עניין (ROI)
מבנים לא רלוונטיים, אובייקטים (למשל, שק גוף וספת CT) וחפצים (למשל, רוכסנים מתכתיים) המוצגים בדגם DVR עלולים לפגוע באיכות התמונה ולאבחן רדיולוגי מעורפל. כדי להמחיש אזורים מסוימים של אנטומיה או פתולוגיה בצורה טובה יותר, פילוח משמש כדי לכלול או לא לכלול נתונים רב-עוצמה נבחרים בתמונות דו-מידות או תלת-מידות18,24. למרות תוכניות פילוח אוטומטיות זמינות, פילוח ידני אשר דורש זיהוי רקמות גבוה ותיחום על ידי המפעיל בוצע ברוב הנסיבות כדי לסייע בזיהוי של ממצאים רדיולוגיים על DVR של פגרים נטושים. עריכת ROI הייתה כלי הפילוח הנפוץ ביותר המשמש במחקר הנוכחי, אשר אפשר לאופרטור לכלול או לא לכלול אזור עניין באופן ידני על-ידי ציור צורה מלבנית, אליפטית או אחרת כדי להגדיר את הגבול המרחבי המדויק של היעד(איור 6). בדומה לתבניות DVR המסופקות בתחנת העבודה תלת-מימד, פילוח אוטומטי מבוסס על כללי חיבור ותוספים, ונתונים לרדיולוגיה קלינית, שהייתה ברובה לא מתאימה למחקר זה, למעט פונקציית הסרת עצם הגוף האוטומטית.

פונקציות העברה (TF)
TF הוא אלגוריתם לשליטה בסף האטימות, הבהירות והצבע של אמצעי האחסוןהנבחר 18,24. כלי זה מאפשר לאופרטור לחשוף באופן סלקטיבי את המבנים הרלוונטיים במודל DVR, על-ידי בחירת ערך הסף, הטווח והצורה, כדי לשרת מטרות שונות באזור המוגדר. לדוגמה, בחירת סף אטימות נמוך מסיר את הרקמות הרכות החיצוניות בעלות אטימות נמוכה (עור ושומן) ומטשטש את תכולת הבטן, בעוד סף אטימות גבוה שומר על עצמים אטומים גבוהים (לדוגמה, עצם, סידן וחומרי ניגוד מופרשים); שינוי קנה המידה של הצבע, הבהירות והניגודיות מדגיש את אזור העניין, והופך את המראה של מודל ה- DVR להיראות שונה. פקדים אלה נותנים היבררות טובה יותר והידול מהיר יותר של מבנים בהתבסס על ההתעצמות שלהם. עם זאת, אלה פגיעים לשונות interobserver ותלויים שליטה מפעיל באופטימיזציה של עיבוד פרמטרים21. עם התרומה של פילוח ו TF, הקשר של רקמות מוצגות, איברים, וגופים זרים בפגרים סרוקים היו מסווגים היטב(איור 7). ממצאים ראשוניים מהירים וברורים על cetaceans תקועים הוכחו על מודל DVR ערוך, אשר נתן וטרינרים ואנשי תגובה נטוש סקירה על המצב הפנימי והחיצוני, כמו גם את ממצאי החקירה הראשונית של ראש הממשלה, והקלה על necropsy קונבנציונלי הבא.

עיבוד עוצמת קול פרספקטיבה (PVR)
PVR, המכונה גם הדמיה אנדולומינלית או עיבוד סוחף, מוחל בעיקר על מבנים המכילים אוויר כגון קנה הנשימה, המעי הגס, הוושט, ועורקים. זה מאפשר למפעיל לדמיין את התנאים הפנימיים של לומן על ידי ניווט וירטואלי35. האופרטור מייעד את נקודת ההתחלה, נקודת הקצה ואת הנתיב של קו המרכז לטיסה. על ידי הצגת אנימציה של טיסה דרך המבנה, ניתן לזהות את היחסים בין מבנים אנטומיים וחריגות אנדולומינליות כגון פוליפים או גידולים סרטניים על הקירות כמו אנדוסקופיה וירטואליתלא פולשנית 19. תמונות MPR המתאימות המוצגות לצד מאפשרות סקירה בו-זמנית של נגעיםמסוימים 37,38. על ידי הרחבת PVR מעבר לומן, מבנים מחוץ לאלומינליים סמוכים ניתן גםלדמיין 24. במחקר הנוכחי, PVR היה ישים רק על פגרים טריים עם מבנים שלא התדרדרו, אשר אפשרו שחזור של ההשקפה אנדולומינלית(איור 8).

במבט הנוכחי של טכניקות עיבוד, רק 8 טכניקות המשמשות בדרך כלל virtopsy השגרתי של cetaceans תקוע תוארו, בעוד אחרים היו שנויים במחלוקת בשל התועלת המוגבלת שלהם. הטכניקות שהוזכרו יכולות גם לתת תובנה ולהיות מיושמות על בעלי חיים אחרים באופן כללי. ברדיולוגיה קלינית, קיימות טכניקות עיבוד ותבניות DVR רבות אחרות, הבנויות על אלגוריתמים מבוססי סף עם ערכים מוגדרים מראש לאימות, בהירות, תאורה, סולם חום, רמת חלון ורוחב חלון, המסופקים ברוב תחנות העבודה תלת-ממדיות. אלה נועדו להדגיש את האיור של סוגי רקמות וחלקי גוף שונים לבדיקות מיוחדות, למשל, ניגודיות כלי דם, דרכי הנשימה, הקיבה או הטרומבוס18,,24,,31. עם זאת, במקרה של פגרים נטושים, יש הצטברות גז הנגרמת על ידי ריקבון ללא עירוי איברים. רוב DVR קבוע מראש של בדיקת CT קלינית, במיוחד אנגיוגרפיה CT, דורשים הזרקת ניגוד ולכן לא ניתן להחיל במחקר הנוכחי. ניתן ליצור את תבניות ה-DVR שעוצבו באופן עצמאי בשילוב עם מודלים של DVR יחיד או מרובים לחקירת CETACEAN PM לאחר סטנדרטיזציה של אלגוריתמים מבוססי סף במונחים של מינים ואת רמת הריקבון שלהם. אף על פי כן, בהתבסס על ניסיוננו, 8 טכניקות עיבוד המפורטות הצליחו לזהות את רוב ממצאי ראש הממשלה בceceans תקועים, והספיקו כדי לחקור את בריאותם הביולוגית ואת הפרופיל שלהם.

הכנה וסריקה של פגרים היא קריטית עבור לאחר תהליך והדמיה חזותית של נתוני virtopsy. הפעלה של מכונת CT, יחידה רדיולוגית מיוננות, חייבת להתבצע על ידי טכנאי רדיולוגי מוסמך או רופא בהתאם לחוק. למרות הנבדקים הסרוקים היו פגרים, מינון הקרינה צריך להישמר נמוך כמו בר השגה סביר. השליטה בפרמטרים של סריקה, במיוחד עובי פרוסה, תשפיע מאוד על הדיוק של מישורים קורונליים ושאגיטל משוחזרים. יתר על כן, הפחתה בעובי פרוסת CT מאפשרת אבחון מדויק יותר. לדוגמה, רכישת תמונות PMCT בעובי 3 מ"מ עלולה להזניח גרנולומה טפילית 1×1×1 מ"מ, נצפתה בבלוטות החלב של cetaceans נטושים. כדי להימנע ממחסר כל ממצא ולשפר את הרזולוציה של עיבוד דו-ממדי ותלת-ממדי, נעשה שימוש בפרוטוקול סריקה מתוקן. עובי הפרוסה נשלט ב- 1 מ"מ, ולרדת ל- 0.625 מ"מ במידת האפשר, שהוא עובי הפרוסה המינימלי הזמין עבור מכונת CT בשימוש.

הדמיה נכונה לאחר עיבוד ומניפולציה של ערכות נתונים virtopsy דורש הבנה ברורה של העקרונות ואת החסרונות של טכניקות עיבוד נפוצות המשמשות לחקירת ראש הממשלה cetacean, למשל, זיהוי של כוח וחולשה ביןהטכניקות 21. הבחירה בטכניקות עיבוד תלויה במבנים האנטומיים ובפתולוגיות הבסיסיות שיש להמחיש, אין טכניקה אחת שיכולה לזהות באופן מקיף את כל ממצאי ראש הממשלה. הכרת היתרונות והחסרונות ובחירת טכניקות העיבוד המתאימות יכולים לשפר את איכות התמונה ואת יכולת הפרשנות של ערכות נתונים virtopsy, אשר מסייעים להשיג אבחנה נכונה. סקירה קפדנית של ערכות נתונים של virtopsy והתאמתן לטכניקות אחרות יכולה למנוע עיבוד פוטנציאלי ושגייתפילוח 18. ובכל זאת, פסק הדין הסופי והאבחון צריך להיעשות על ידי רדיולוגים וטרינריים או רופאים רדיולוגיים אשר מוסמכים ומנוסים לדווח על ממצאי virtopsy.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

לסופרים אין מה לחשוף.

Acknowledgments

המחברים רוצים להודות למחלקת החקלאות, הדיג והשימור של ממשלת האזור המנהלי המיוחד של הונג קונג על התמיכה המתמשכת בפרויקט זה. הערכה כנה מורחבה גם לווטרינרים, אנשי צוות ומתנדבים ממעבדת Virtopsy בעלי חיים ימיים, אוניברסיטת העיר הונג קונג, אושן פארק שימור הקרן הונג קונג אושן פארק הונג קונג לשלם מאמץ רב על התגובה stranding בפרויקט זה. הכרת תודה מיוחדת חייבת לטכנאים במרכז הרפואי הווטרינרי CityU ובמרכז ההדמיה הווטרינרית של הונג קונג להפעלת יחידות CT ו-MRI עבור המחקר הנוכחי. כל חוות דעת, ממצאים, מסקנות או המלצות המובעות בזאת אינם משקפים בהכרח את השקפותיה של הקרן לשיפור האקולוגיה הימית או של הנאמן. פרויקט זה מומן על ידי מועצת מענקי המחקר של הונג קונג (מספר מענק: UGC/FDS17/M07/14) והקרן לשיפור האקולוגיה הימית (מספר מענק: MEEF2017014, MEEF2017014A, MEEF2019010 ו MEEF2019010A), הקרן לשיפור אקולוגיה ימית, אקולוגיה ימית & דיג שיפור קרנות נאמנות מוגבלת. תודה מיוחדת לד"ר מריה חוסה רובלס מלגמבה על העריכה האנגלית של כתב היד הזה.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Aquarius iNtuition workstation TeraRecon Inc NA
Siemens 64-row multi-slice spiral CT scanner Somatom go.Up Siemens Healthineers NA

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W., Chung, T. Y. T., Chan, D. K. P. Virtopsy as a revolutionary tool for cetacean stranding programs: Implementation and management. Frontiers in Marine Sciences. , (2020).
  2. Jacobsen, C., Bech, B. H., Lynnerup, N. A comparative study of cranial, blunt trauma fractures as seen at medicolegal autopsy and by computed tomography. BMC Medical Imaging. 9 (18), 1-9 (2009).
  3. Jacobsen, C., Lynnerup, N. Craniocerebral trauma--congruence between post-mortem computed tomography diagnoses and autopsy results: a 2-year retrospective study. Forensic Science International. 194 (1-3), 9-14 (2010).
  4. Plattner, T., et al. Virtopsy-postmortem multislice computed tomography (MSCT) and magnetic resonance imaging (MRI) in a fatal scuba diving incident. Journal of Forensic Sciences. 48 (6), 1347-1355 (2003).
  5. Jackowski, C., et al. Visualization and quantification of air embolism structure by processing postmortem MSCT data. Journal of Forensic Sciences. 49 (6), 1339-1342 (2004).
  6. Aghayev, E., et al. Pneumomediastinum and soft tissue emphysema of the neck in postmortem CT and MRI; a new vital sign in hanging. Forensic Science International. 153 (2-3), 181-188 (2005).
  7. Jackowski, C., Persson, A., Thali, M. J. Whole Body Postmortem Angiography with a High Viscosity Contrast Agent Solution Using Poly Ethylene Glycol as Contrast Agent Dissolver. Journal of Forensic Sciences. 53 (2), 465-468 (2008).
  8. Jackowski, C., et al. Virtopsy: postmortem minimally invasive angiography using cross section techniques - implementation and preliminary results. Journal of Forensic Sciences. 50 (5), 1175-1186 (2005).
  9. Grabherr, S., et al. Postmortem CT angiography compared with autopsy: a forensic multicenter study. Radiology. 288 (1), 270-276 (2018).
  10. Yuen, A. H. L., Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W. Accuracy and reliability of cetacean cranial measurements using computed tomography three dimensional volume rendered images. PloS one. 12 (3), 0174215 (2017).
  11. Kot, B. C. W., Chan, D. K. P., Yuen, A. H. L., Tsui, H. C. L. Diagnosis of atlanto-occipital dissociation: Standardised measurements of normal craniocervical relationship in finless porpoises (genus Neophocaena) using postmortem computed tomography. Scientific Reports. 8, 8474 (2018).
  12. Chan, D. K. P., Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W. Database documentation of marine mammal stranding and mortality: current status review and future prospects. Diseases of Aquatic Organisms. 126 (3), 247-256 (2017).
  13. Chan, D. K. P., Kot, B. C. W. Cetaceans postmortem multimedia analysis platform (CPMAP): pilot web-accessed database of a virtopsy-driven stranding response program in the Hong Kong waters. Proceedings of International Association for Aquatic Animal Medicine 48th Annual Conference, Cancun, MEX. , (2017).
  14. Hamel, P. E. S., et al. Postmortem computed tomography and magnetic resonance imaging findings in a case of coinfection of dolphin morbillivirus and Aspergillus fumigatus in a juvenile bottlenose dolphin (Tursiops truncatus). Journal of Zoo and Wildlife Medicine. 51 (2), 448-454 (2020).
  15. Weisbrod, T. C., Walsh, M. T., Marquardt, S., Giglio, R. F. Computed tomography diagnosis of pneumothorax and cardiac foreign body secondary to stingray injury in a bottlenose dolphin (Tursiops truncatus). Aquatic Mammals. 46 (3), 326-330 (2020).
  16. Kot, B. C. W., Tsui, H. C. L., Chung, T. Y. T., Lau, A. P. Y. Postmortem neuroimaging of cetacean brains using computed tomography and magnetic resonance imaging. Frontiers in Marine Science. , (2020).
  17. Lundström, C., et al. State-of-the-art of visualization in post-mortem imaging. Acta Pathologica, Microbiologica, et Immunologica Scandinavica. 120 (4), 316-326 (2012).
  18. Lipson, S. A. MDCT and 3D Workstations. , Springer. (2006).
  19. Perandini, S., Faccioli, N., Zaccarella, A., Re, T. J., Mucelli, R. P. The diagnostic contribution of CT volumetric rendering techniques in routine practice. Indian Journal of Radiology and Imaging. 20 (2), 92-97 (2010).
  20. Pavone, P., Luccichenti, G., Cademartiri, F. From maximum intensity projection to volume rendering. Seminars in Ultrasound, CT and MRI. 22 (5), 413-419 (2001).
  21. Fishman, E. K., et al. Volume rendering versus maximum intensity projection in CT angiography: what works best, when, and why. RadioGraphics. 26 (3), 905-922 (2006).
  22. Udupa, J. K. Three-dimensional visualization and analysis methodologies: a current perspective. RadioGraphics. 19 (3), 783-806 (1999).
  23. Thali, M. J., et al. a new imaging horizon in forensic pathology: virtual autopsy by postmortem multislice computed tomography (MSCT) and magnetic resonance imaging (MRI) - a feasibility study. Journal of Forensic Sciences. 48 (2), 386-403 (2003).
  24. Dalrymple, N. C., Prasad, S. R., Freckleton, M. W., Chintapalli, K. N. Informatics in radiology (infoRAD): introduction to the language of three-dimensional imaging with multidetector CT. RadioGraphics. 25 (5), 1409-1428 (2005).
  25. Thali, M. J., et al. Virtopsy - documentation, reconstruction and animation in forensic: individual and real 3D data based geo-metric approach including optical body/object surface and radiological CT/MRI scanning. Journal of Forensic Sciences. 50 (2), 428-442 (2015).
  26. Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W. Role of image reformation techniques in postmortem computed tomography imaging of stranded cetaceans. Proceedings of International Association for Aquatic Animal Medicine 47th Annual Conference. , Virginia Beach, VA, USA. (2016).
  27. Ampanozi, G., et al. Format preferences of district attorneys for post-mortem medical imaging reports: understandability, cost effectiveness, and suitability for the courtroom: a questionnaire based study. Legal Medicine (Tokyo). 14 (3), 116 (2012).
  28. Ebert, L. C., et al. Forensic 3D visualization of CT data using cinematic volume rendering: a preliminary study. American Journal of Roentgenology. 208 (2), 233-240 (2017).
  29. Alonso-Farré, J. M., et al. Cross-sectional anatomy, computed tomography and magnetic resonance imaging of the head of common dolphin (Delphinus delphis) and striped dolphin (Stenella Coeruleoalba). Anatomia, Histologia, Embryologia. 44 (1), 13-21 (2015).
  30. Gascho, D., Thali, M. J., Niemann, T. Post-mortem computed tomography: technical principles and recommended parameter settings for high-resolution imaging. Medicine, Science and the Law. 58 (1), 70-83 (2018).
  31. Lee, E. Y., et al. MDCT evaluation of thoracic aortic anomalies in pediatric patients and young adults: comparison of axial, multiplanar, and 3D images. American Journal of Roentgenology. 182 (3), 777-784 (2004).
  32. Errickson, D., Thompson, T. J. U., Rankin, B. W. J. The application of 3D visualization of osteological trauma for the courtroom: a critical review. Journal of Forensic Radiology and Imaging. 2 (3), 132-137 (2014).
  33. Prokop, M., Galanski, M. Spiral and multislice computed tomography of the body. , Thieme Medical Publishers. (2003).
  34. Kawel, N., Seifert, B., Luetolf, M., Boehm, T. Effect of slab thickness on the CT detection of pulmonary nodules: use of sliding thin-slab maximum intensity projection and volume rendering. American Journal of Roentgenology. 192 (5), 1324-1329 (2009).
  35. Vlassenbroek, A. The use of isotropic imaging and computed tomography reconstructions. Comparative Interpretation of CT and Standard Radiography of the Chest, Medical Radiology. , Springer-Verlag. Berlin Heidelberg. 53-73 (2011).
  36. van Ooijen, P. M., et al. Noninvasive coronary imaging using electron beam CT: surface rendering versus volume rendering. American Journal of Roentgenology. 180 (1), 223-226 (2003).
  37. Remy-Jardin, M., Remy, J., Artaud, D., Fribourg, M., Duhamel, A. Volume rendering of the tracheobronchial tree: clinical evaluation of bronchographic images. Radiology. 208 (3), 761-770 (1998).
  38. Bassett, J. T., Liotta, R. A., Barlow, D., Lee, D., Jensen, D. Colonic perforation during screening CT colonography using automated CO2 insufflation in an asymptomatic adult. Abdominal Imaging. 33 (5), 598-600 (2008).

Tags

ביולוגיה גיליון 163 עיבוד תמונה טומוגרפיה ממוחשבת לאחר המוות גדילה cetaceans בריאות ביולוגית פרופיל ביולוגי virtopsy רפואה וטרינרית
טכניקות עיבוד תמונה בטומוגרפיה ממוחשבת לאחר המוות: הערכה של בריאות ביולוגית ופרופיל בCeceans תקועים
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Kot, B. C. W., Chan, D. K. P.,… More

Kot, B. C. W., Chan, D. K. P., Chung, T. Y. T., Tsui, H. C. L. Image Rendering Techniques in Postmortem Computed Tomography: Evaluation of Biological Health and Profile in Stranded Cetaceans. J. Vis. Exp. (163), e61701, doi:10.3791/61701 (2020).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter