Этот протокол описывает простой в использовании метод исследования окисления субстрата путем отслеживания производства 14CO2 in vitro.
Митохондрии содержат механизм для цикла трикарбоновой кислоты (TCA) и цепи переноса электронов (ETC), которые генерируют аденозинтрифосфат (АТФ) для поддержания энергетического гомеостаза. Глюкоза, жирные кислоты и аминокислоты являются основными энергетическими субстратами, подпитывающими митохондриальное дыхание в большинстве соматических клеток. Фактические данные показывают, что различные типы клеток могут иметь явное предпочтение определенным субстратам. Однако использование субстрата различными клетками скелета подробно не изучено. Более того, поскольку клеточный метаболизм настроен на физиологические и патофизиологические изменения, прямые оценки субстратной зависимости в скелетных клетках могут дать важное представление о патогенезе заболеваний костей.
Следующий протокол основан на принципе высвобождения углекислого газа из молекул субстрата после окислительного фосфорилирования. Используя субстраты, содержащие радиоактивно меченые атомы углерода (14С), способ обеспечивает чувствительный и простой в использовании анализ скорости окисления субстрата в клеточной культуре. Тематическое исследование с первичными кальвариальными преостеобластами по сравнению с макрофагами, полученными из костного мозга (BMM), демонстрирует различное использование основных субстратов между двумя типами клеток.
Окислительное фосфорилирование (OXPHOS) у эукариот — это процесс, посредством которого питательные вещества расщепляются внутри митохондрий для высвобождения химической энергии в виде АТФ за счет потребления кислорода. Катаболизм различных субстратов внутри митохондрий через цикл трикарбоновой кислоты (TCA) генерирует несколько молекул АТФ напрямую, а скорее накапливает энергию за счет восстановления носителей электронов никотинамидадениндинуклеотида (NAD+) и флавинадениндинуклеотида (FAD+). Восстановленные носители затем окисляются ETC, расположенными на внутренней мембране митохондрий, чтобы генерировать градиент концентрации протонов по всей мембране. Протоны в конечном итоге текут вниз по своему градиенту обратно в митохондриальный матрикс через АТФ-синтазу с образованием АТФ. OXPHOS является наиболее эффективным средством производства АТФ из энергетических субстратов и, как правило, предпочтительным в аэробных средах. Ранее аэробный гликолиз – производство лактата из глюкозы при наличии кислорода – считался патофизиологическим, часто отличительной чертой раковых клеток. Все больше и больше обнаруживается, что некоторые нормальные типы клеток используют аэробный гликолиз по причинам, которые еще предстоит полностью расшифровать.
Метаболическая гибкость — это способность клеток или организмов адаптироваться к изменяющимся потребностям в энергии и доступным источникам топлива. Например, энергетическая потребность скелетных мышц в основном удовлетворяется OXPHOS в устойчивом состоянии, но анаэробным гликолизом во время высокоинтенсивных упражнений1. По мере увеличения продолжительности упражнений окисление глюкозы и жирных кислот вносит больший вклад в общее производство энергии2. Однако использование субстрата зависит не только от доступности, так как субстраты антагонистически конкурируют во время окисления. В частности, было показано, что окисление жирных кислот ингибирует утилизацию глюкозы скелетными мышцами в явлении, известном как эффект Рэндла3. Обратный эффект был продемонстрирован последующими исследованиями 4,5. Кроме того, многие заболевания связаны с изменением предпочтения субстрата и развитием метаболической негибкости в клетках. Например, окисление жирных кислот снижается в скелетных мышцах пациентов с диабетом II типа по сравнению с нормальными контрольными субъектами6. Метаболические изменения в условиях заболевания являются предметом интенсивного исследования, поскольку они могут способствовать патогенезу.
Энергетический метаболизм в типах скелетных клеток относительно недостаточно изучен, но привлек к себе внимание в последние годы7. Предыдущая работа показала, что аэробный гликолиз является доминирующим энергетическим путем в кальвариальных остеобластах, в то время как окисление глюкозы через цикл TCA играет роль в образовании остеокластов 8,9. Другие предоставили доказательства того, что жирные кислоты являются источником энергии для остеобластов10. Было также показано, что катаболизм глутамина поддерживает дифференциацию остеобластов от прародителей11,12. Тем не менее, всестороннее понимание использования субстрата различными типами клеток скелета все еще отсутствует. Кроме того, ожидается, что изменения клеточного метаболизма во время дифференцировки клеток или в ответ на патологические сигналы изменят использование топливного субстрата. Ниже описан простой в использовании протокол для анализа окисления субстрата in vitro.
Протокол обеспечивает простой в использовании метод определения скорости окисления основных энергетических субстратов. Это более простая альтернатива другим протоколам, которые используют колбы, содержащие центральный колодец и увенчанные резиновыми пробками 14,15,16.<…
The authors have nothing to disclose.
Работа была частично поддержана грантом NIH R01 AR060456 (FL). Мы благодарим доктора Майкла Робинсона и Элизабет Кризман (Детская больница Филадельфии) за их щедрую помощь со сцинтилляционным счетчиком.
0.22 µm filters | Sigma-Aldrich | SLGVM33RS | Used to filter BSA solution |
0.25% Trypsin-EDTA | Gibco | 25200056 | Dissociate cells from cell culture plates |
1.5 mL Eppendorf tubes | PR1MA | PR MCT17 RB | Used for reaction incubation |
10 cm plates | TPP | 93100 | Used for cell culture |
10 mL syringe | BD | 302995 | Used to flush marrow from long bones |
10% FBS | Atlanta biologicals | S11550 | For Cell culture medium preparation |
14C-Glucose | PerkinElmer | NEC042X050UC | Used to make hot media |
14C-glutamine | PerkinElmer | NEC451050UC | Used to make hot media |
14C-oleate | PerkinElmer | NEC317050UC | Used to make hot media |
23 G needle | BD | 305120 | Used to flush marrow from long bones |
24-well plates | TPP | 92024 | Used for cell culture |
70 μm cell strainers | MIDSCI | 70CELL | Used to filter supernatant during cavarial digestion |
Acridine Orange/Propidium Iodide (AO/PI) dye | Nexcelom Biosciences | CS2-0106 | Stains live cells to determine seed density |
Bovine Serum Ablumin | Proliant Biologicals | 68700 | Used for fatty acid conjugation |
Cellometer Auto 2000 | Nexcelom Biosciences | Determine the number of viable cells | |
Centrifuge | Thermo Fisher | Legend Micro 21R | Used to pellet cells |
Collagenase type II | Worthington | LS004176 | Dissociate cells from tissue |
Custom MEM alpha | GIBCO | SKU: ME 18459P1 | Used to create custom hot media |
Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline | Gibco | 10010023 | Used to dissolve and dilute reagents, and wash culture dishes |
Filter Paper | Millipore-Sigma | WHA1001090 | Traps CO2 with sodium hydroxide |
Glucose | Sigma-Aldrich | g7528 | Used to make custom media |
HEPES | Gibco | 15630080 | Traps CO2 during cell culture |
L-carnitine | Sigma-Aldrich | C0283 | Supplemented for fatty acid oxidation |
L-Glutamine | Sigma-Aldrich | g3126 | Used to make custom media |
MEM alpha | Thermo | A10490 | Cell culture medium |
Parafilm | Pecheney Plastic Packaging | PM998 | Used to seal cell culture dishes |
Penicillin-Streptomycin | Thermo Fisher | 15140122 | Prevents contamination in cell culture |
Perchloric Acid | Sigma-Aldrich | 244252 | Releases CO2 during metabolic assay |
Pyruvate | Sigma-Aldrich | p5280 | Used to make custom media |
Scintillation Counter | Beckman Coulter | LS6500 | Determines radioactivity from the filter paper |
Scintillation Fluid | MP Biomedicals | 882453 | Absorb the energy emitted by RAMs and re-emit it as flashes of light |
Scintillation Vial | Fisher Scientific | 03-337-1 | Reaction containers for scintillation fluid |
Sodium carbonate | Sigma-Aldrich | S5761 | Balance buffer for medium |
Sodium Hydroxide | Sigma-Aldrich | 58045 | Traps CO2 during metaboilc assay |
Sodium oleate | SANTA CRUZ | SC-215879 | BSA conjugated fatty acid preparation |
Vaccum filtration 1000 | TPP | 99950 | Filter cMEMα |