Automatically Generated

Summary

تصف هذه الورقة نموذجا جديدا للفأر لانتقال المكورات الرئوية من مستعمر بدون أعراض إلى ممرض مسبب للأمراض أثناء العدوى الفيروسية. يمكن تكييف هذا النموذج بسهولة لدراسة التفاعلات متعددة الميكروبات والمضيف الممرض خلال المراحل المختلفة لتطور المرض وعبر المضيفين المختلفين.

Abstract

العقدية الرئوية (المكورات الرئوية) هي مستعمر بدون أعراض للبلعوم الأنفي في معظم الأفراد ولكن يمكن أن تتطور إلى مسببات الأمراض الرئوية والجهازية عند الإصابة بفيروس الأنفلونزا A (IAV). يعزز التقدم في العمر قابلية المضيف للإصابة بالالتهاب الرئوي الثانوي بالمكورات الرئوية ويرتبط بتفاقم نتائج المرض. العوامل المضيفة التي تقود هذه العمليات ليست محددة بشكل جيد ، ويرجع ذلك جزئيا إلى نقص النماذج الحيوانية التي تعيد إنتاج الانتقال من الاستعمار بدون أعراض إلى المرض السريري الشديد.

تصف هذه الورقة نموذجا جديدا للفأر يعيد إنشاء انتقال المكورات الرئوية من النقل بدون أعراض إلى المرض عند الإصابة الفيروسية. في هذا النموذج ، يتم تلقيح الفئران أولا عن طريق الأنف بالمكورات الرئوية المزروعة بالأغشية الحيوية لإنشاء نقل بدون أعراض ، تليها عدوى IAV لكل من البلعوم الأنفي والرئتين. وهذا يؤدي إلى انتشار البكتيريا إلى الرئتين ، والتهاب رئوي ، وعلامات واضحة للمرض يمكن أن تتطور إلى الفتك. تعتمد درجة المرض على السلالة البكتيرية والعوامل المضيفة.

الأهم من ذلك ، أن هذا النموذج يعيد إنتاج قابلية الشيخوخة ، لأنه بالمقارنة مع الفئران الشابة ، تظهر الفئران المسنة مرضا سريريا أكثر حدة وتستسلم للمرض بشكل متكرر. من خلال فصل النقل والمرض إلى خطوات متميزة وتوفير الفرصة لتحليل المتغيرات الجينية لكل من العامل الممرض والمضيف ، يسمح نموذج العدوى المشتركة S. pneumoniae / IAV هذا بالفحص التفصيلي لتفاعلات مرضي مهم مع المضيف في مراحل مختلفة من تطور المرض. يمكن أن يكون هذا النموذج أيضا بمثابة أداة مهمة لتحديد الأهداف العلاجية المحتملة ضد الالتهاب الرئوي بالمكورات الرئوية الثانوية في المضيفين المعرضين للإصابة.

Introduction

العقدية الرئوية (المكورات الرئوية) هي بكتيريا إيجابية الجرام تتواجد بدون أعراض في البلعوم الأنفي لمعظم الأفراد الأصحاء ^1,2. يمكن أن تنتقل المكورات الرئوية ، التي تعززها عوامل غير محددة تماما ، من مستعمرات حميدة للبلعوم الأنفي إلى مسببات الأمراض التي تنتشر إلى أعضاء أخرى مما يؤدي إلى عدوى خطيرة ، بما في ذلك التهاب الأذن الوسطى والالتهاب الرئوي وتجرثم الدم³. يعتمد عرض مرض المكورات الرئوية ، جزئيا ، على الاختلافات الخاصة بالسلالة ، بما في ذلك النمط المصلي ، الذي يعتمد على تكوين السكريات المحفظة. كان هناك أكثر من 100 نمط مصلي تم توصيفها حتى الآن ، وبعضها يرتبط بعدوى أكثر توغلا ^4,5. هناك عدة عوامل أخرى تزيد من خطر الإصابة بمرض المكورات الرئوية. أحد هذه العوامل هو العدوى الفيروسية ، حيث يزداد خطر الإصابة بالالتهاب الرئوي بالمكورات الرئوية 100 ضعف بمقدار^{IAV 6,7}. تاريخيا ، S. الرئوية هي واحدة من الأسباب الأكثر شيوعا للالتهاب الرئوي الجرثومي الثانوي بعد الأنفلونزا ويرتبط بنتائج أسوأ⁸. عامل خطر رئيسي آخر هو التقدم في العمر. في الواقع ، S. الرئوية هو السبب الرئيسي للالتهاب الرئوي الجرثومي المكتسب من المجتمع لدى الأفراد المسنين الذين تزيد أعمارهم عن⁶⁵ عاما ^9,10. يمثل الأفراد المسنون غالبية (>75٪) من الوفيات الناجمة عن الالتهاب الرئوي والإنفلونزا ، مما يشير إلى أن عاملي الخطر – الشيخوخة وعدوى IAV – يؤديان إلى تفاقم قابلية المرض بشكل تآزري¹¹،¹²،^13،14. ومع ذلك ، فإن الآليات التي تدفع بها العدوى الفيروسية انتقال المكورات الرئوية من مستعمر بدون أعراض إلى مسببات الأمراض الغازية وكيف يتم تشكيل ذلك من خلال العوامل المضيفة لا تزال غير محددة بشكل جيد. ويرجع ذلك إلى حد كبير إلى عدم وجود نموذج حيواني صغير يلخص الانتقال من استعمار المكورات الرئوية بدون أعراض إلى مرض سريري حرج.

تم تصميم دراسات العدوى المشتركة بشكل كلاسيكي في الفئران الملقحة بالمكورات الرئوية مباشرة في الرئتين بعد 7 أيام من الإصابة بالأنفلونزا^15,16. هذا يعيد إنتاج القابلية للإصابة بالالتهاب الرئوي الجرثومي الثانوي وهو مثالي لدراسة كيفية إضعاف الاستجابات المناعية المضادة للفيروسات للدفاعات المضادة للبكتيريا¹⁷. ومع ذلك ، فقد أظهرت الدراسات الطولية في البشر أن نقل المكورات الرئوية في البلعوم الأنفي ، حيث يمكن للبكتيريا أن تشكل الأغشية الحيوية عديمة الأعراض¹⁸ ، يرتبط بشكل موحد بالأمراض الغازية ^19,20. العزلات البكتيرية الناتجة عن التهابات الأذن الوسطى والرئة والدم متطابقة وراثيا مع تلك الموجودة في البلعوم الأنفي²⁰. وهكذا ، لدراسة الانتقال من النقل بدون أعراض إلى المرض الغازي بعد عدوى IAV ، تم إنشاء نموذج تم فيه إعطاء الفئران عن طريق الأنف المكورات الرئوية المزروعة بالأغشية الحيوية تليها عدوى IAV للبلعوم الأنفي^21,22. أدت العدوى الفيروسية في مجرى الهواء العلوي إلى تغيرات في البيئة المضيفة أدت إلى تشتت المكورات الرئوية من الأغشية الحيوية وانتشارها إلى الشعب الهوائية السفلية²¹. كانت هذه البكتيريا المشتتة قد نظمت التعبير عن عوامل الفوعة المهمة للعدوى ، وتحويلها من مستعمرين إلى مسببات الأمراض²¹. تسلط هذه الملاحظات الضوء على التفاعل المعقد بين الفيروس والمضيف والبكتيريا وتثبت أن التغييرات التي تطرأ على المضيف والتي تسببها العدوى الفيروسية لها تأثير مباشر على سلوك المكورات الرئوية ، والذي بدوره يغير مسار العدوى البكتيرية. ومع ذلك ، فشل هذا النموذج في تلخيص العلامات الشديدة للمرض التي لوحظت في البشر ، على الأرجح لأن الفيروس يقتصر على تجويف الأنف ، ولم يتم تلخيص الآثار الجهازية للعدوى الفيروسية على مناعة المضيف وتلف الرئة.

لقد أنشأنا مؤخرا نموذجا يتضمن التفاعل المعقد بين المضيف ومسببات الأمراض ولكنه يحاكي أيضا بشكل أوثق شدة المرض التي لوحظت في البشر²³. في هذا النموذج ، تصاب الفئران أولا عن طريق الأنف بالمكورات الرئوية المزروعة بالأغشية الحيوية لإنشاء نقل بدون أعراض ، تليها عدوى IAV لكل من البلعوم الأنفي والرئتين. أدى ذلك إلى انتشار البكتيريا إلى الرئتين ، والتهاب رئوي ، ومرض تطور إلى الفتك في جزء صغير من الفئران^{الشابة 23}. أظهرت هذه الدراسة السابقة أن كلا من العدوى الفيروسية والبكتيرية غيرت دفاع المضيف: عززت العدوى الفيروسية الانتشار البكتيري ، وأضعف الاستعمار البكتيري السابق قدرة المضيف على التحكم في مستويات IAV الرئوية²³. كشف فحص الاستجابة المناعية أن عدوى IAV قللت من النشاط المضاد للبكتيريا للعدلات ، في حين أن الاستعمار البكتيري أضعف استجابة الإنترفيرون من النوع الأول الحاسمة للدفاع المضاد للفيروسات²³. الأهم من ذلك ، أن هذا النموذج أعاد إنتاج قابلية الشيخوخة. بالمقارنة مع الفئران الشابة ، أظهرت الفئران المسنة علامات المرض في وقت سابق ، وأظهرت مرضا سريريا أكثر حدة ، واستسلمت للعدوى بشكل متكرر²³. يظهر العمل المقدم في هذه المخطوطة أن درجة المرض تعتمد أيضا على السلالة البكتيرية ، لأن سلالات المكورات الرئوية الغازية تظهر انتشارا أكثر كفاءة عند الإصابة بعدوى IAV ، وتظهر علامات أكثر وضوحا للالتهاب الرئوي ، وتؤدي إلى تسارع معدلات المرض مقارنة بالسلالات غير الغازية. وهكذا، فإن نموذج العدوى المشتركة للمكورات الرئوية/داء السيليكون المستقل يسمح بالفحص التفصيلي لكل من العوامل الممرضة والعوامل المضيفة، وهو مناسب تماما لدراسة الاستجابات المناعية للعدوى المتعددة الميكروبات في المراحل المختلفة لتطور المرض.

Protocol

تم إجراء جميع الدراسات على الحيوانات وفقا للتوصيات الواردة في دليل رعاية واستخدام المختبر. تمت الموافقة على جميع الإجراءات من قبل لجنة رعاية واستخدام الحيوانات المؤسسية بجامعة بوفالو. 1. تحضير الوسائط المعرفة كيميائيا (CDM) قم بإعداد المخزون على النحو التالي:قم بإذابة مركبات المزيج I المدرجة في الجدول 1 في 100 مل من الماء عالي النقاء مع التحريك. يخزن في 200 ميكرولتر من القسمة عند -20 درجة مئوية. قم بإذابة مركبات المزيج II المدرجة في الجدول 1 في 20 مل من 0.1 M NaOH مع التحريك. يخزن في 100 ميكرولتر من القسمة عند -20 درجة مئوية. قم بإذابة مركبات المزيج الثالث المدرجة في الجدول 1 في 1 مل من الماء عالي النقاء مع التحريك. يحفظ في 10 ميكرولتر من القسامات عند 4 درجات مئوية. قم بإذابة مركب المزيج الرابع المدرج في الجدول 1 في 1 مل من الماء عالي النقاء مع التحريك. يخزن في 10 ميكرولتر من القسامات عند -20 درجة مئوية. قم بإذابة المركبات المدرجة في الجدول 2 في البداية في 15 مل من الماء عالي النقاء مع التحريك. اضبط الرقم الهيدروجيني على 7.0 مع بضع قطرات من 0.1 M NaOH واضبط الحجم النهائي على 20 مل باستخدام ماء فائق النقاء. يخزن في 1 مل من القسامات عند -20 درجة مئوية. قم بإذابة المركبات المدرجة في الجدول 3 في 90 مل من الماء عالي النقاء على طبق ساخن عند 50 درجة مئوية مع التحريك. اضبط الرقم الهيدروجيني على 7.0 باستخدام 0.1 M NaOH ، ثم اضبط الحجم النهائي على 100 مل باستخدام ماء فائق النقاء. يخزن في 5 مل من القسامات عند -20 درجة مئوية. اصنع المرق البادئ طازجا في كل مرة عن طريق إذابة المركبات الموجودة في الجدول 4 في 70 مل من الماء عالي النقاء مع التحريك. إلى مخزون المبتدئين الطازج ، أضف مخزون المزيج التالي بالترتيب: 200 ميكرولتر من مخزون Mix I (الجدول 1) ، و 80 ميكرولتر من مخزون Mix II (الجدول 1) ، و 10 ميكرولتر من مخزون Mix III (الجدول 1) ، و 10 ميكرولتر من مخزون Mix IV (الجدول 2) ، و 1 مل من مخزون الفيتامينات (الجدول 3) ، و 5 مل من مخزون الأحماض الأمينية (الجدول 4). بمجرد إضافة المخزون ، اضبط الحجم النهائي على 100 مل عن طريق إضافة 30 مل من الماء عالي النقاء إلى الدورق. تكملة آلية التنمية النظيفة بمركبات من الجدول 4. بمجرد خلطها جيدا ، قم بتعقيمها وتخزينها على حرارة 4 درجات مئوية لمدة أقصاها 2 أسابيع. 2. زراعة الأغشية الحيوية S. pneumoniae تحضير وسط RP-10 عن طريق خلط 445 مل من RPMI 1640 مع 50 مل من مصل بقري الجنين المعطل بالحرارة (FBS) و 5 مل من البنسلين / الستربتومايسين عند 10000 وحدة / مل و 10000 ميكروغرام / مل ، على التوالي. تنمو خط خلايا سرطان الجلد المخاطي NCI-H292 (H292). أضف الخلايا من قارورة واحدة تم شراؤها إلى 5 مل من وسط RP-10 في دورق T-25 معالج بزراعة الأنسجة. احتضان عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2 لمدة 3-5 أيام للوصول إلى التقاء 100٪. تحقق من الخلايا تحت المجهر الضوئي باستخدام تكبير 10x لتقييم التقارب.ملاحظة: عندما تكون جميع الخلايا على اتصال بخلايا أخرى ولا توجد فجوات بينهما ، يتم الوصول إلى التقاء 100٪ المطلوب. اغسل الخلايا 2x في 5 مل من PBS بدرجة حرارة الغرفة. تأكد من خلو المخزن المؤقت من الكالسيوم لتجنب مخلب EDTA في الخطوة التالية. أضف 1 مل من التربسين-EDTA إلى الدورق واحتضانه عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2 لمدة 5-10 دقائق حتى تنفصل الخلايا. تحييد مع 4 مل من RP-10 المتوسطة. امزج برفق عن طريق سحب الماصة لأعلى ولأسفل وانقلها إلى أنبوب مخروطي سعة 50 مل. أضف 500 ميكرولتر من معلق الخلية لكل بئر إلى صفيحة 24 بئر معالجة بزراعة الأنسجة. من قارورة T-25 متقاربة ، توقع 2 × 10 6-4 × 106 خلايا / مل. في اليوم التالي ، تحقق من الخلايا الموجودة تحت المجهر الضوئي للتأكد من أنها متقاربة ، كما في الخطوة 2.3. إذا لم تكن كذلك ، ثم احتضان لفترة أطول. بمجرد أن تتلاقى خلايا H292 بنسبة 100٪ في اللوحة المكونة من 24 بئرا ، اغسل الخلايا برفق 3x باستخدام 1 مل من برنامج تلفزيوني بدرجة حرارة الغرفة لضمان عدم وجود وسط يحتوي على مضادات حيوية أو حطام. بعد غسل الخلايا ، أضف 250 ميكرولتر / بئر من 4٪ بارافورمالدهايد لإصلاح الخلايا. احتضان إما لمدة 1 ساعة على الجليد أو بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية. في الليلة التي تسبق تثبيت الخلية ، قم بخط سلالة S. pneumoniae ذات الأهمية على ألواح أجار الدم واحتضانها طوال الليل عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2.ملاحظة: البيانات المقدمة هنا هي مع سلالات S. pneumoniae التالية التي تم الحصول عليها عن طريق التبادل التعاوني: عزل التهاب الأذن الوسطى من النمط المصلي 19F EF3030 24 ، النمط المصلي الكلاسيكي 2 سلالة أفيري D3925 ، وعزل تجرثم الدم من النمط المصلي 4 TIGR426. السلالات متاحة أيضا من المجموعات العامة المشار إليها في جدول المواد. تحضير آلية التنمية النظيفة بالإضافة إلى أوكسيراس (0.15 وحدة / مل) بإضافة 100 ميكرولتر من الأوكسيراس (30 وحدة / مل) إلى 20 مل من آلية التنمية النظيفة.ملاحظة: يستخدم Oxyrase للتخلص من الأكسجين للسماح بالنمو الفعال للمكورات العنقودية الرئوية في الثقافة السائلة27. قم بتلقيح البكتيريا من اللوحة إلى CDM + oxyrase الطازج عن طريق غسل البكتيريا من اللوحة عن طريق إضافة 1 مل من CDM + oxyrase ورفع المستعمرات البكتيرية برفق باستخدام جانب طرف ماصة 1 مل ، مع الحرص على عدم كشط الآجار. بدلا من ذلك ، استخدم حلقة تلقيح لرفع البكتيريا وتلقيحها في أنبوب يحتوي على 1 مل من CDM + oxyrase. تمييع البكتيريا في CDM + oxyrase إلى بداية OD600 من 0.05. قم بزراعة البكتيريا في أنبوب مخروطي مغطى بشكل فضفاض سعة 50 مل يقف عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO 2 حتى يتم الوصول إلىOD 600 من 0.2 (سيستغرق ذلك ما بين2-5 ساعات). تحقق من OD600 كل ساعة للتأكد من أن OD لا يتجاوز 0.2. بمجرد وصول OD إلى 0.2 ، دوامة أنبوب الثقافة البكتيرية. بذر 0.5 مل من البكتيريا على خلايا H292 الثابتة وإضافة 0.5 مل أخرى من وسط CDM + oxyrase لكل بئر. أضف 1 مل من CDM + oxyrase إلى آبار التحكم الخالية من البكتيريا. احتضان اللوحة لمدة 48 ساعة عند 34 درجة مئوية / 5٪ CO2.ملاحظة: يستخدم النمو عند 34 درجة مئوية لمحاكاة درجة الحرارة المنخفضة في البلعوم الأنفي21 عن كثب. كل 12 ساعة بعد البذر الأولي ، قم بإزالة 0.5 مل من الوسط برفق وقم بتجديده ب 0.5 مل من CDM + oxyrase الطازج. احرص على عدم تعطيل الغشاء الحيوي المتكون. تحقق من الجزء السفلي من اللوحة بحثا عن الأغشية الحيوية وابحث عن زيادة الغيوم مع مرور الوقت بسبب نمو الغشاء الحيوي. للتحكم في التلوث ، افحص الآبار الخالية من البكتيريا للتأكد من أن آبار التحكم تظل نظيفة. في 48 ساعة بعد التلقيح ، قم بإزالة المادة الطافية واغسل 2x برفق شديد باستخدام 1 مل من PBS. أعد التعليق في 1 مل من آلية التنمية النظيفة الطازجة والماصة لأعلى ولأسفل بقوة لرفع الغشاء الحيوي. لكل سلالة بكتيرية ، قم بتجميع البكتيريا من جميع الآبار في أنبوب مخروطي سعة 50 مل. تخلط جيدا عن طريق إمالة الأنبوب المغطى بإحكام برفق لأعلى ولأسفل عدة مرات. إلى الأنبوب المخروطي سعة 50 مل ، أضف 40٪ من الجلسرين في CDM بأحجام متساوية لتحقيق تعليق بكتيري بتركيز نهائي قدره 20٪ جلسرين. القسمة 1 مل في أنابيب الطرد المركزي الدقيقة ، وتجميد فلاش على الثلج الجاف ، وتوفير في -80 درجة مئوية. قبل الاستخدام ، قم بتعداد البكتيريا عن طريق إذابة قسامة واحدة على الجليد ، وتدوير الأنبوب عند 1700 × جم لمدة 5 دقائق ، وإزالة المادة الطافية ، وتعليق الحبيبات في 1 مل من PBS ، وطلاء التخفيفات التسلسلية على ألواح أجار الدم28. قم بزراعة ألواح الآجار طوال الليل عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2 وعد المستعمرات عند التخفيفات ذات الصلة للحصول على تركيز البكتيريا في وحدات تكوين المستعمرات (CFU) / مل.ملاحظة: يوصى بتعداد البكتيريا الموجودة في المخزون بعد يوم على الأقل من التجميد أو بعد ذلك ، حيث يوجد انخفاض في صلاحية البكتيريا خلال ال 24 ساعة الأولى. يمكن استخدام القسامات المجمدة المخزنة للعدوى اللاحقة للفئران لمدة أقصاها 2 أشهر. 3. التلقيح الأنفي للفئران بالأغشية الرئوية المزروعة بالأغشية الحيوية شراء الفئران واستخدامها في العمر المطلوب.ملاحظة: تفضل الفئران التي تتراوح أعمارها بين 3-4 أشهر على نمذجة المضيفين الصغار ، ويمكن استخدام الفئران التي تتراوح أعمارها بين 21 و 24 شهرا لنمذجة الأفراد المسنين >65 عاما من العمر29 عاما. البيانات المقدمة هنا هي مع الفئران الذكور C57BL / 6. قم بإذابة القسامات البكتيرية المزروعة بالأغشية الحيوية على الثلج وقم بتدويرها بمعدل 1700 × جم لمدة 5 دقائق. قم بإزالة المادة الطافية والتخلص منها بعناية دون تعطيل الحبيبات ، واغسل البكتيريا عن طريق تعليق الحبيبات في 1 مل من برنامج تلفزيوني ، وقم بتدويرها مرة أخرى عند 1700 × جم لمدة 5 دقائق. قم بإزالة المادة الطافية وأعد تعليق الحبيبات بالحجم اللازم للوصول إلى التركيز المطلوب (استهدف 5 × 106 CFU / 10 μL للتلقيح داخل الأنف). تأكد من كميات البكتيريا التي يتم إعطاؤها عن طريق طلاء اللقاح المحضر على ألواح أجار الدم كما في الخطوة 2.19. تلقيح الفئران عن طريق الأنف مع 5 × 106 CFU عن طريق سحب 5 ميكرولتر من اللقاح المخفف في كل ناريس. تأكد من إمساك الفئران بإحكام ، وتثبيت الرأس ، حتى يتم استنشاق الحجم (عادة في غضون ثوان من سحب الحجم في النار). نفذ هذه الخطوة في حالة عدم وجود تخدير لمنع الطموح الرئوي للقاح. 4. العدوى الفيروسية بفيروس الأنفلونزا A (IAV) في 48 ساعة بعد التلقيح عن طريق الأنف مع S. الرئوية ، إذابة سلالة IAV من الفائدة على الجليد.ملاحظة: البيانات المقدمة هنا هي مع سلالة متكيفة مع الفئران من فيروس الأنفلونزا A A/PR/8/34 H1N1 تم الحصول عليها عن طريق التبادل التعاوني30. بمجرد ذوبان الفيروس ، قم بتخفيف الفيروس في برنامج تلفزيوني إلى التركيز المطلوب ؛ تهدف إلى 20 وحدة تشكيل البلاك (PFU) / 50 ميكرولتر للعدوى داخل القصبة الهوائية و 200 PFU / 10 ميكرولتر للعدوى داخل الأنف. بالنسبة للمجموعات المصابة بالوهمية والبكتيريا فقط ، استخدم برنامج تلفزيوني لتلقيح الفئران. ضع مواد تشحيم العيون على عيون الفئران قبل التخدير. تخدير الفئران باستخدام 5٪ إيزوفلوران وتأكيد التخدير بواسطة قرصة إصبع القدم الثابتة. بمجرد تخدير الحيوان ، قم بإزالته من غرفة الأيزوفلوران وأصاب الفئران المخدرة على الفور ب 50 ميكرولتر (20 PFU) من IAV داخل القصبة الهوائية باستخدام ملاقط حادة لسحب اللسان من الفم وسحب حجم السائل أسفل القصبة الهوائية. ضع الفئران في قفص منفصل وراقبها حتى الشفاء التام (فهي قادرة على الحفاظ على الاستلقاء القصي [قادرة على وضع مستقيم على الصدر]). بعد الشفاء ، قم بتلقيح الفئران عن طريق الأنف مباشرة ب 10 ميكرولتر (200 PFU) من IAV باستخدام طريقة التلقيح في الخطوة 3.3. الفئران المنزلية التي خضعت لعدوى بكتيرية وفيروسية مفردة أو مزدوجة مع نفس مجموعة العدوى وفصلها عن المجموعات الأخرى. 5. مراقبة الفئران لأعراض المرض راقب الفئران يوميا لمدة 10 أيام على الأقل وسجل بشكل أعمى علامات المرض على النحو التالي:النتيجة على النحو التالي لفقدان الوزن: 0 = 5٪ أو أقل ؛ 1 = 5٪ -10٪ ؛ 2 = 10٪ -15٪ ؛ 3 = 20٪ أو أكثر. القتل الرحيم للفئران باستخدام استنشاق CO2 عندما تكون درجة فقدان الوزن عند 3. النتيجة على النحو التالي للنشاط: 0 = عادي / نشط ؛ 1 = تتحرك ولكن تتضاءل قليلا ؛ 2 = تقلصت. 3 = تناقص شديد / خامل (يتحرك فقط إذا تم لمسه) ، 4 = غيبوبة / غير متحرك. القتل الرحيم للفئران عندما تكون درجة النشاط عند 3. النتيجة على النحو التالي للموقف: 0 = لا حدس (طبيعي) ؛ 1 = وضعية منحنية قليلا ؛ 2 = حدس شديد. القتل الرحيم للفئران عندما تكون درجة الموقف عند 2. النتيجة على النحو التالي للعيون: 0 = طبيعي ؛ 1 = جاحظ ؛ 1 = غارقة ؛ 1 = مغلق ؛ 1 = التفريغ. يمكن أن يكون مزيج. اجمع المجاميع للحصول على درجة العين النهائية. النتيجة على النحو التالي للتنفس: 0 = التنفس الطبيعي. 1 = غير منتظم أو معدل (معدل أعلى / أقل) ؛ 2 = عمل (جهد مبالغ فيه أو يلهث). القتل الرحيم للفئران عندما تكون درجة التنفس عند 2. بناء على المعايير المذكورة أعلاه ، أضف الدرجات الفردية للحصول على درجة سريرية إجمالية صحية (0) إلى مريضة للغاية (15). ضع في اعتبارك أن أي ماوس يعرض درجة إجمالية أعلى من 2 مريض. القتل الرحيم بشكل إنساني لأي فئران تعرض درجة إجمالية أعلى من 9 أو الدرجات المشار إليها لكل معيار وقم بتمييزها على منحنى البقاء على قيد الحياة. 6. معالجة الأنسجة المصابة للتعداد البكتيري في 48 ساعة بعد عدوى IAV ، القتل الرحيم الفئران. ضع الماوس في وضع ضعيف. باستخدام 70 ٪ من الإيثانول ، رش الصدر والبطن من الماوس لتنظيف الفراء. باستخدام الملقط ، قرصة الفراء والجلد في منتصف الماوس وقطع الفراء مع 4.5 في مقص تشريح لفضح المنطقة من الكبد حتى الصدر. جمع الدمباستخدام مقص التشريح ، قطع بلطف في التجويف البريتوني لفضح الكبد. باستخدام ملقط ، كشف الوريد البابي الكبدي في الجزء العلوي من الكبد بالقرب من الحجاب الحاجز. قطع الوريد البابي الكبدي باستخدام مقص التشريح. بمجرد أن يبدأ الدم في التجمع في التجويف البريتوني ، اجمع 10 ميكرولتر من الدم باستخدام ماصة دقيقة وضعها في 90 ميكرولتر من محلول مضاد للتخثر (محلول 50 مللي متر EDTA في PBS) في أنبوب طرد مركزي دقيق للطلاء للعبء البكتيري. استخدم ماصة P-1000 الدقيقة لجمع بقية الدم ، ووضعها في أنبوب جمع الدم ، وأجهزة الطرد المركزي عند 7600 × جم لمدة 2 دقيقة لجمع المصل. حفظ الأمصال في أنابيب الطرد المركزي الدقيقة في -80 درجة مئوية للتحليل اللاحق لأي سيتوكين أو مستقلب مطلوب. جمع الرئةباستخدام مقص التشريح ، قم بقطع جوانب القفص الصدري المكشوف واسحب الأضلاع برفق نحو رأس الفأر لفضح القلب. أدخل إبرة 25 جيجا متصلة بحقنة سعة 10 مل مملوءة مسبقا ب PBS في البطين الأيمن وابدأ في التعتيم ببطء. ابحث عن تبييض الرئتين كمؤشر على التروية الناجحة. احمر ببطء لتجنب كسر الأنسجة الرئوية. ارفع القلب بالملقط وقم بعمل قطع لفصل الرئتين والقلب. بمجرد الانفصال ، التقط جميع فصوص الرئة بالملقط واشطفها في طبق به برنامج تلفزيوني معقم لإزالة أي دم متبقي. في طبق بتري ، يفرم الرئتين إلى قطع صغيرة ويخلط جيدا. قم بإزالة نصف مزيج الرئة لتحديد CFU البكتيري أو PFU الفيروسي وضعه في أنبوب دائري القاع سعة 15 مل مملوء مسبقا ب 0.5 مل من PBS للتجانس.ملاحظة: من المهم عدم أخذ فصوص مختلفة من نفس الرئة لإجراء التقييمات المختلفة. بدلا من ذلك ، يجب فرم جميع الفصوص وخلطها جيدا معا وتحليلها بالتساوي للتقييمات المختلفة. قم بإزالة النصف الآخر من الرئة لقياس التدفق الخلوي (القسم 7 أدناه) وضعه في صفيحة 24 بئرا غير معالجة بزراعة الأنسجة مع كل بئر مملوءة مسبقا ب 0.5 مل من RP-10. اتركيه في درجة حرارة الغرفة حتى المعالجة. جمع البلعوم الأنفيفي الرقبة ، استخدم مقص التشريح لقطع الفراء ، ثم قطع العضلات وفضح القصبة الهوائية.ملاحظة: القصبة الهوائية عبارة عن هيكل يشبه الأنبوب يقع تحت العضلات. ضع ملقط صغير تحت القصبة الهوائية على مسافة 1 سم من فك الماوس لتثبيته. باستخدام مقص التشريح ، قم بعمل شق 0.1 سم برفق على الجزء الأمامي من القصبة الهوائية ، وتجنب قطع القصبة الهوائية تماما. قم بإعداد حقنة سعة 1 مل مملوءة ب 0.5 مل من PBS مع أنبوب 0.58 مم متصل بإبرة 25 جرام. اجمع غسول الأنف عن طريق إدخال الأنبوب في القصبة الهوائية متجها صعودا نحو البلعوم الأنفي. بمجرد الشعور بالمقاومة التي تدخل تجويف الأنف ، ضع أنبوب طرد مركزي دقيق عند الأنف واغسل برنامج تلفزيوني ببطء عبر القصبة الهوائية لجمع غسل الأنف. ضع الماوس في وضعية الانبطاح. رش رأس الماوس بالإيثانول. استخدم مقص التشريح لقطع الفراء والوسادة الصوفية لفضح عظم رأس الفأر. باستخدام مقص التشريح ، قم بقطع 1 سم على جانبي الفك السفلي وبين العينين. باستخدام الملقط ، اسحب عظام الوجه ببطء بعيدا عن الجسم لكشف تجويف الأنف. استخدم الملقط لإزالة أنسجة الأنف برفق ووضعها في أنبوب دائري القاع مملوء مسبقا ب 0.5 مل من برنامج تلفزيوني للتجانس. لتجانس الأنسجة التي تم جمعها ، قم أولا بتنظيف مسبار الخالط عن طريق وضعه في 70٪ من الإيثانول وتشغيل الخالط بنسبة 60٪ من الطاقة لمدة 30 ثانية. كرر الخطوة في الماء المعقم لمدة 10 ثوان. تجانس كل الأنسجة لمدة 1 دقيقة. قم بتنظيف مسبار الخالط في ماء معقم بين كل عينة وفي أنبوب جديد يحتوي على 70٪ من الإيثانول بين كل عضو ومجموعة عينة. تعداد الأعداد البكتيريةبمجرد حصاد جميع الأعضاء وتجانسها ، يتم تخفيف الصفائح التسلسلية على ألواح أجار الدم. لحساب إجمالي CFU ، استخدم 10 ميكرولتر للوحة وتدوين الحجم النهائي بالمل لكل عينة. قم بمسح عينات البلعوم الأنفي على ألواح أجار الدم المكملة ب 3 ميكروغرام / مل جنتاميسين لاختيار نمو العقدية الرئوية مع تثبيط نمو الكائنات الحية الدقيقة الأخرى التي تستعمر هذا النسيج. احتضان بين عشية وضحاها في 37 درجة مئوية / 5 ٪ CO2. لتعداد CFU البكتيري للرئة والبلعوم الأنفي ، قم أولا بحساب المستعمرات على ألواح أجار الدم. ثم استخدم المعادلة (1) والمعادلة (2) لحساب المبلغ لكل مل والعدد الإجمالي.المبلغ لكل مل = عدد المستعمرات × عامل التخفيف × 100 (1)العدد الإجمالي = الكمية لكل مل × الحجم الإجمالي لكل عينة (2)ملاحظة: في المعادلة (1) ، يتم استخدام 100 للضرب لأن 10 ميكرولتر مطلية ، وهو تخفيف 100 ضعف بمقدار 1 مل. الحجم الإجمالي لكل عينة في المعادلة (2) هو من الخطوة 6.7.1 ، مما ينتج عنه حد الكشف عن 100 لكل عضو. لتعداد CFU البكتيرية لتجرثم الدم ، عد أولا المستعمرات على ألواح أجار الدم. ثم استخدم المعادلة (3) لتحديد الكمية لكل مل من الدم.المبلغ لكل مل من الدم = عدد المستعمرات × عامل التخفيف × 100 × 10 (3)ملاحظة: في المعادلة (3) ، يتم استخدام 100 حيث يتم طلاء 10 ميكرولتر ، وهو تخفيف 100 ضعف بمقدار 1 مل ، ويشير 10 إلى تخفيف الدم بنسبة 1:10 في مضادات التخثر. ينتج عن هذا حد الكشف عن 1000 / مل. 7. تجهيز عينات الرئة لقياس التدفق الخلوي قم بإعداد الوسائط المطلوبة على النحو التالي:قم بإعداد RP-10 كما هو موضح في الخطوة 2.1. تحضير محلول الهضم عن طريق خلط RP-10 مع 2 ملغ / مل كولاجيناز و 30 ميكرولتر / مل DNase I. تحضير محلول التحلل عن طريق إذابة 8.29 g من NH4Cl و 1 g من NaHCO3 و 0.038 g من EDTA في 1 L من H2O. قم بإعداد 10x FACS buffer عن طريق خلط 450 مل من HBSS مع 50 مل من FBS المعطل بالحرارة و 5 جم من أزيد الصوديوم. تحضير 1x FACS buffer عن طريق تخفيف 50 مل من 10x FACS buffer في 450 مل من HBSS. خذ عينات الرئة من الخطوة 6.4.3 وضعها في طبق من 24 بئرا. أضف 500 ميكرولتر من محلول الهضم إلى كل بئر. احتضان لمدة 45 دقيقة حتى 1 ساعة عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2. قم بتعبئة 50 مل من الأنابيب المخروطية لكل عينة ب 5 مل من RP-10. عندما تنتهي الحضانة ، ضع مرشحا 100 ميكرومتر في الجزء العلوي من الأنبوب المخروطي سعة 50 مل ورطبه ب 1 مل من RP-10. باستخدام ميكروبيت P-1000 ، حرك الرئتين المهضومتين وضعهما على الفلتر. استخدم مكبس حقنة سعة 3 مل لهرس العضو. شطف 2x مع 1 مل من RP-10 في كل مرة. أدر العينات على حرارة 4 درجات مئوية و 327 × جم لمدة 5 دقائق. نضح المادة الطافية وأعد تعليق الحبيبات في 1 مل من محلول التحلل. اتركيه لمدة 3 دقائق للسماح بتحلل خلايا الدم الحمراء. تحييد مع 5 مل من RP-10. أدر العينات على حرارة 4 درجات مئوية و 327 × جم لمدة 5 دقائق. نضح المادة الطافية ، وأعد تعليق الحبيبات في 1 مل من RP-10 ، وخذ 10 ميكرولتر لحساب العينات. أدر العينات على حرارة 4 درجات مئوية و 327 × جم لمدة 5 دقائق. نضح المادة الطافية وإعادة تعليق الحبيبات في RP-10 عند 2 × 10 6-4 × 106 خلايا / مل. أضف 60 ميكرولتر من كل عينة إلى صفيحة 96 بئرا لتلطيخ أنواع الخلاياالمرغوبة 23 المدرجة في الخطوة 7.9 والجدول 5 والجدول 6. أدري الطبق على حرارة 4 درجات مئوية و 327 × جم لمدة 5 دقائق. وفي الوقت نفسه ، قم بإعداد الخلطات الرئيسية للأجسام المضادة ، والفلورسنت ناقص واحد (FMOs) ، وأدوات التحكم في البقعة الواحدة باستخدام الأجسام المضادة المطلوبة. لتلطيخ كريات الدم البيضاء متعددة الأشكال (PMNs) ، والبلاعم ، والوحيدات ، والخلايا المتغصنة ، والخلايا التائية ، استخدم الأجسام المضادة والتخفيفات النهائية المدرجة في الجدول 5 والجدول 6. استخدم حجما إجماليا قدره 100 ميكرولتر / بئر من مزيج الأجسام المضادة. اتبع التخفيفات المدرجة في الجداول لتحديد الحجم المناسب للمزيج الرئيسي والأجسام المضادة الفردية المطلوبة. عند الانتهاء من الدوران (الخطوة 7.8) ، صب المادة الطافية ، وأعد تعليق الكريات في 100 ميكرولتر من خلطات الأجسام المضادة ، أو FMOs ، أو عناصر التحكم في البقعة الواحدة ، واحتضانها على الجليد لمدة 30 دقيقة في الظلام. اغسل الخلايا 2x بإضافة 150 ميكرولتر من المخزن المؤقت FACS إلى الآبار وتدوير اللوحة عند 4 درجات مئوية و 327 × جم لمدة 5 دقائق. عند الانتهاء من الدوران ، صب المادة الطافية ، وأعد تعليق الكريات في 100 ميكرولتر من محلول التثبيت ، واحتضانها على الجليد لمدة 20 دقيقة. اغسل الخلايا 2x بإضافة 150 ميكرولتر من محلول FACS إلى الآبار وتدوير اللوحة عند 4 درجات مئوية و 327 × جم لمدة 5 دقائق. تحضير أنابيب FACS الموسومة ب 200 ميكرولتر من المخزن المؤقت FACS. أعد تعليق الكريات في 150 ميكرولتر من المخزن المؤقت FACS. قم بتصفية كل عينة بشكل فردي في أنبوب FACS المقابل لها باستخدام مرشح 100 ميكرومتر. يحفظ على الجليد أو عند 4 درجات مئوية ويحمي من الضوء حتى يصبح جاهزا للتحليل. تحليل الخلايا باستخدام مقياس التدفق الخلوي. 8. مقايسة البلاك لتعداد IAV قم بإعداد الوسائط المطلوبة على النحو التالي:تحضير وسط العدوى عن طريق إذابة 2.5 غرام من ألبومين مصل البقر (BSA) في 40 مل من DMEM مع التحريك على حرارة 37 درجة مئوية لمدة 10-20 دقيقة حتى يذوب. تصفية تعقيم في 460 مل من DMEM. تحضير 2.4 ٪ السليلوز الجريزوفولفين عن طريق إذابة 1.2 ملغ من السليلوز الجريزوفولفين في 50 مل من H2O. الأوتوكلاف على إعداد السائل وتخزينها في درجة حرارة الغرفة. تحضير 5٪ من BSA DMEM عن طريق إذابة 2.5 جم من BSA في 40 مل من DMEM مع التحريك عند 37 درجة مئوية لمدة 10-20 دقيقة. أضف ال 10 مل المتبقية من DMEM للحصول على حجم نهائي قدره 50 مل. قم بتعقيمه بالتصفية وتخزينه في درجة حرارة 4 درجات مئوية. تحضير 2x MEM / 0.5٪ BSA عن طريق خلط 1 مل من 5٪ BSA DMEM مع 9 مل من 2x MEM. تحضير وسط تراكب منخفض اللزوجة عن طريق خلط نسبة 1: 1 من السليلوز الجريزوفولفين 2.4٪ و 2x MEM / 0.5٪ BSA مع 1 مجم / مل TPCK (مثبط الكيموتريبسين) التربسين. قم بإعداد EMEM / 10٪ FBS عن طريق خلط 450 مل من الحد الأدنى من الوسط الأساسي النسر (EMEM) مع 50 مل من FBS المعطل بالحرارة. تنمو خط خلايا كلية الكلاب Madin-Darby (MDCK). أضف الخلايا من قارورة واحدة تم شراؤها إلى 5 مل من EMEM / 10٪ FBS في دورق T-25 معالج بزراعة الأنسجة. احتضان لمدة 3-5 أيام عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2 حتى تصل الخلايا إلى التقاء 100٪. تحقق من وجود التقاء كما في الخطوة 2.3. قم بإزالة وسط الاستزراع والتخلص منه ، واشطف 2x ب 5 مل من برنامج تلفزيوني بدرجة حرارة الغرفة. أضف 1 مل من التربسين-EDTA إلى الدورق واحتضانه عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2 لمدة 10-15 دقيقة حتى تنفصل الخلايا. بمجرد رفعه ، قم بتحييده باستخدام 4 مل من EMEM / 10٪ FBS للحصول على تعليق خلية عند 2 × 105 خلايا / مل. قم بزرع خلايا MDCK في صفيحة معالجة بزراعة الأنسجة مكونة من 12 بئرا عن طريق إضافة 1 مل من الخلايا المعاد تعليقها لكل بئر (عند 2 × 105 خلايا / بئر) قبل يوم واحد من بدء فحص البلاك.ملاحظة: تأكد من وصول الخلايا إلى التقاء 100٪ قبل الاستخدام واحتضانها لفترة أطول إذا لزم الأمر للوصول إلى نقطة التقاء. للاستخدام كمعايير ، قم بعمل تخفيفات تسلسلية بمقدار 10 أضعاف (106-10 1) من مخزون IAV (من عيار معروف) في وسط العدوى المدرج في الخطوة 8.1.1. اصنع 1.2 مل من كل تخفيف لاختباره في ثلاث نسخ. ذوبان متجانسة الجهاز على الجليد. قم بالدوران على جهاز طرد مركزي منضدية عند 2000 × جم واجمع المادة الطافية الشفافة. كرر الخطوة 8.5 ولكن مع المادة الطافية من العينات في الخطوة 8.6. نضح الوسط من الخلايا واغسل 2x مع 1 مل من PBS لإزالة كل FBS. أضف 300 ميكرولتر من كل تخفيف قياسي أو عينة مخففة بشكل متسلسل برفق على طول جانب كل بئر ، بدءا من أعلى تخفيف إلى أدنى مستوى ، وافعل ذلك في ثلاث نسخ. ضع الألواح في الحاضنة عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO2 ، مع هز اللوحة كل 10 دقائق لمدة 50 دقيقة. تأكد من وضعها بشكل مسطح في الحاضنة وعدم تكديسها. بعد 50 دقيقة ، اغسل الخلايا 2x مع 1 مل من برنامج تلفزيوني. أضف 2 مل من وسط التراكب منخفض اللزوجة في كل بئر باستثناء الآبار الأقل تخفيفا والخالية من الفيروسات ؛ لهؤلاء ، أضف وسط العدوى والتربسين. ضع اللوحة مرة أخرى في الحاضنة عند 37 درجة مئوية / 5٪ CO 2 لمدة2-4 أيام لتحقيق لويحات يمكن رؤيتها بالعين المجردة. اغسل الألواح بإضافة 2 مل من PBS إلى كل بئر بسرعة من الجانب ورجها برفق لتعليق وسط التراكب منخفض اللزوجة المستقر. تخلص من حجم السائل بالكامل في البئر عن طريق سحب الوسط برفق. كرر الغسيل مرة أخرى مع 2 مل من PBS في كل بئر ، ثم تخلص من حجم السائل بالكامل عن طريق السحب اللطيف. لإصلاح اللويحات ، أضف 500 ميكرولتر من 4٪ بارافورمالدهيد في كل بئر ، رجها واتركها لمدة 30 دقيقة. تغسل ببطء أسفل الجانب مع 1 مل من PBS. ثم تخلص من السائل برفق. أضف 500 ميكرولتر من 1٪ من البنفسج البلوري (المخفف في الماء) إلى كل بئر لتغطية الطبقة الأحادية للخلية. احتضان لمدة 5 دقائق. يغسل مع 1 مل من ماء الصنبور. تأكد من التخلص من كل السائل في البئر عن طريق السحب اللطيف. ضع الطبق رأسا على عقب على وسادة حفاضات حتى يجف طوال الليل. عد اللوحات بصريا واحفظ الصور على أي جهاز تصوير متاح.

Representative Results

تم استخدام S. pneumoniae المزروعة بالأغشية الحيوية (الشكل 1 أ) لإصابة الفئران (الشكل 1 ب) باستخدام لقاح صغير سعة 10 ميكرولتر يتم توصيله عن طريق الأنف إلى الفئران غير المخدرة. ينتج عن هذا اللقاح صغير الحجم نقل متسق للمكورات الرئوية يقتصر على البلعوم الأنفي (الشكل 2A ، + مجموعات sp) مع تجنب الانتشار الجهازي (الشكل 2B ، C ، + مجموعات sp). بعد يومين من التلقيح عن طريق الأنف ، أصيبت الفئران بفيروس H1N1 A المكيف مع الأنفلونزا A A / PR / 8/34 (IAV) 22،30 الذي تم تسليمه عن طريق الأنف وداخل القصبة الهوائية لتحقيق توصيل ثابت لكميات محددة إلى البلعوم الأنفي والرئتين23. هنا ، تم استخدام النموذج لمقارنة مسار المرض بعد العدوى الفيروسية في الفئران التي تم تحديها داخل الأنف مع سلالات مختلفة من S. pneumoniae ، بما في ذلك TIGR4 و D39 ، وهي سلالات غازية تؤدي إلى الالتهاب الرئوي الذي يتطور إلى تجرثم الدم ، و EF3030 ، وهو سلالة التهاب الأذن الوسطى 21،24،25،26،31. كان عرض المرض في الفئران المصابة بعدوى S. pneumoniae / IAV يعتمد على السلالة البكتيرية (الشكل 2). في حين لم يكن هناك فرق كبير في أعداد البكتيريا من البلعوم الأنفي (الشكل 2A) بين أي من السلالات ، S. الرئوية TIGR4 و D39 ، ولكن ليس EF3030 ، انتشرت إلى الرئتين بحلول 48 ساعة بعد عدوى IAV (الشكل 2B). أظهر أربعون بالمائة من الفئران المصابة عن طريق الأنف ب S. pneumoniae TIGR4 انتشارا بكتيريا إلى الرئتين ، ومن بين هؤلاء ، أصبح نصفهم جراثيما (الشكل 2C) ، بما يتفق مع النتائج السابقة23. أظهرت الفئران المصابة عن طريق الأنف ب S. pneumoniae D39 انتشارا أكثر كفاءة ، لأنه لوحظ انتشاره إلى الرئتين في 100٪ من الفئران المصابة بعدوى مشتركة (الشكل 2B). على غرار S. pneumoniae TIGR4 ، عانى نصف هؤلاء من تجرثم الدم (الشكل 2C). في تتبع البقاء على قيد الحياة بشكل عام ، بغض النظر عن السلالة البكتيرية ، كان معدل بقاء الفئران المصابة بعدوى مشتركة أقل بكثير من الفئران التي تم تحديها بشكل فردي مع S. pneumoniae وحدها لجميع السلالات التي تم اختبارها (الشكل 2D). بالمقارنة مع الفئران الضابطة التي تم تحديها مع IAV وحده ، أظهرت الفئران المصابة عن طريق الأنف ب S. pneumoniae TIGR4 و D39 ، ولكن ليس EF3030 ، معدلات متسارعة من المرض. بحلول اليوم الثاني بعد الإصابة ب IAV ، استسلم 30٪ (D39) و 20٪ (TIGR4) من الفئران ، في حين أن مجموعات التحكم IAV فقط لم تبدأ في الاستسلام حتى اليوم الخامس بعد التحدي (الشكل 2D). كان لدى الفئران المصابة بعدوى S. pneumoniae EF3030 و IAV أعراض متأخرة ، تشبه إلى حد كبير عناصر التحكم في IAV فقط (الشكل 2D). توضح هذه النتائج أن نموذج العدوى المشتركة يؤدي إلى مرض في الفئران الشابة السليمة يعتمد على الإجهاد البكتيري ، مما يجعله مثاليا لاستكشاف العوامل البكتيرية المطلوبة في كل خطوة من خطوات تطور المرض. تم استخدام هذا النموذج لتقييم وجود خلايا مناعية مختلفة في الرئتين (أنواع الخلايا واستراتيجية البوابة في الشكل 3) بعد عدوى IAV في الفئران الملقحة عن طريق الأنف بسلالات مختلفة من S. pneumoniae. أثارت السلالات البكتيرية D39 و TIGR4 ، التي انتشرت في الرئتين بعد عدوى IAV ، زيادة كبيرة فوق خط الأساس (غير المصابة) في تدفق الخلايا المناعية الالتهابية من الدورة الدموية ، مثل العدلات (PMNs) والوحيدات ، في حين أن EF3030 لم تفعل ذلك (الشكل 4A-C). أثارت عدوى IAV وحدها زيادة كبيرة فوق خط الأساس في تدفق الخلايا المناعية المهمة للدفاع المضيف ضد العدوى الفيروسية ، مثل الخلايا القاتلة الطبيعية وخلايا جاما دلتا التائية (الشكل 4A-C). تم إضعاف هذه الاستجابات المضادة للفيروسات بشكل كبير في الفئران المصابة عن طريق الأنف بالمكورات الرئوية قبل التحدي الفيروسي (الشكل 4A-C). وهذا يتفق مع الدراسات السابقة التي قيمت استجابات السيتوكين التي وجدت أن نقل S. pneumoniae أضعف إنتاج الإنترفيرون من النوع الأول وأضعف قدرة المضيف على التحكم في أحمال IAV في الرئتين23. توضح هذه النتائج أنه يمكن استخدام نموذج العدوى المشتركة لدراسة كيفية تغير الاستجابات المناعية في العدوى الأحادية مقابل العدوى متعددة الميكروبات. تم استخدام هذا النموذج أيضا لتقييم تأثير الشيخوخة على مسار المرض بعد عدوى IAV في الفئران المصابة عن طريق الأنف ب S. pneumoniae TIGR4. في الفئران المصابة منفردة ، لم يختلف التتر الفيروسي بين الأفواج الصغيرة والمسنة (الشكل 5 أ)23. كما هو الحال في الدراسات السابقة23 ، أظهرت الفئران المسنة علامات مرض مبكرة وأكثر حدة مقارنة بنظيراتها الشابة ، كما يتضح من الدرجات السريرية الأعلى (الشكل 5 ب). تمشيا مع أعراض المرض ، بدأت الفئران المسنة الملقحة ب S. pneumoniae تموت بشكل أسرع في غضون 24 ساعة بعد الإصابة ب IAV ، واستسلمت جميعها للمرض ، في حين نجت الضوابط الشابة من العدوى بمعدل أعلى بكثير (33٪) (الشكل 5C). توضح هذه النتائج أنه يمكن استخدام نموذج العدوى المشتركة للكشف عن مرض أكثر وخامة في المضيفين المعرضين للخطر ، مما يجعله مثاليا لاستكشاف العوامل المضيفة التي تمنح المقاومة أو القابلية للإصابة بالعدوى المشتركة. الشكل 1: الجدول الزمني للعدوى المشتركة ومعالجة الأعضاء لتقييم تدفق الخلايا المناعية وعبء مسبب المرض . (أ) تزرع العقدية الرئوية في الأغشية الحيوية. (ب) يتم تلقيح الفئران عن طريق الأنف ب 5 × 106 CFU من سلالة S. pneumoniae المشار إليها المزروعة بالأغشية الحيوية لإنشاء نقل البلعوم الأنفي أو تركها دون علاج. بعد ثمان وأربعين ساعة ، يتم علاج الفئران إما ب PBS أو تلقي 200 PFU من فيروس الأنفلونزا A PR8 داخل الأنف و 20 PFU داخل القصبة الهوائية. تتم مراقبة الفئران بمرور الوقت للحصول على درجات الأمراض السريرية والبقاء على قيد الحياة. (ج) في 48 ساعة بعد الإصابة ب IAV ، يتم تقييم CFU البكتيري أو PFU الفيروسي في الأعضاء المختلفة أو تدفق الخلايا المناعية في الرئتين. الاختصارات: CFU = وحدات تشكيل المستعمرة ؛ PFU = وحدات تشكيل البلاك ؛ IAV = فيروس الأنفلونزا A PR8 ؛ تكنولوجيا المعلومات = داخل القصبة الهوائية ؛ NP = البلعوم الأنفي. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم. الشكل 2: تؤدي عدوى IAV المزدوجة داخل الأنف / داخل القصبة الهوائية للفئران الملقحة بالعقدية الرئوية إلى انتشار البكتيريا والمرض الذي يعتمد على السلالة البكتيرية. أصيبت ذكور الفئران الصغيرة (10-12 أسبوعا) C57BL / 6 (B6) كما في الشكل 1. تم تحديد الأعداد البكتيرية في الدم (أ) البلعوم الأنفي و (ب) و (ج) عند 48 ساعة بعد عدوى IAV. (ب، ج) تشير النسب المئوية إلى جزء الفئران التي أظهرت انتشارا. (د) تمت مراقبة البقاء على قيد الحياة لمدة 10 أيام بعد الإصابة ب IAV. يتم عرض البيانات المجمعة من (A ، B) n = 5 و (C) n = 11 و (D) n = 6 فئران لكل مجموعة. تتوافق كل دائرة مع ماوس واحد ، وتشير الخطوط المتقطعة إلى حد الكشف. (A-C) * ، يشير إلى وجود فرق كبير (p < 0.05) بين المجموعات المشار إليها كما هو محدد في اختبار Kruskal-Wallis. (D) * ، يشير إلى وجود فرق كبير (p < 0.05) بين + sp و Co-inf الفئران لكل سلالة بكتيرية كما هو محدد في اختبار رتبة اللوغاريتم (Mantel-Cox). الاختصارات: + sp = الفئران المصابة عن طريق الأنف بالبكتيريا فقط باستخدام السلالة المشار إليها ؛ Co-inf = الفئران المصابة بالبكتيريا المصابة ب IAV ؛ IAV = الفئران التي تلقت فيروس الأنفلونزا A ؛ CFU = وحدات تشكيل المستعمرة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم. الشكل 3: استراتيجية بوابات الخلايا المناعية. تم حصاد الرئتين ، وتم تحديد تدفق الخلايا المناعية عن طريق قياس التدفق الخلوي. يتم عرض استراتيجية البوابة التمثيلية لأنواع الخلايا المختلفة. (أ) CD45 + ، تم إغلاق الخلايا المفردة الحية والنسب المئوية ل (B) PMNs (Ly6G + ، CD11b +) ، الضامة (Ly6G- ، Ly6C- ، F480+) ، والوحيدات (Ly6G- ، Ly6C +) ، (C) DCs (Ly6G- ، CD11c +) والخلايا القاتلة الطبيعية (NK1.1+ ، CD3-) ، (D) TCR- γΔ و CD8 (CD8 + ، TCRβ +) و CD4 (CD4 + ، TCRβ + ) تم تحديد الخلايا التائية. الاختصارات: SSC-A = منطقة ذروة التشتت الجانبية ؛ FSC-A = منطقة ذروة التشتت الأمامية ؛ FSC-H = ارتفاع ذروة التشتت الأمامي ؛ SSC-W = عرض ذروة التشتت الجانبي ؛ L / D = حي / ميت ؛ FMO = الفلورسنت ناقص واحد ؛ NK = قاتل طبيعي ؛ PMN = الكريات البيض متعددة الأشكال النووية. DC = خلية متغصنة ؛ TCR = مستقبلات الخلايا التائية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم. الشكل 4: تعتمد الاستجابات المناعية الرئوية على السلالة البكتيرية. كانت الفئران الشابة (10-12 أسبوعا) C57BL / 6 إما غير مصابة ، أو ملقحة منفردة بسلالة العقدية الرئوية المشار إليها (+ sp) ، أو تم تحديها بشكل فردي مع IAV (IAV) ، أو مصابة بعدوى S. pneumoniae و IAV (Co-inf). بعد ثمان وأربعين ساعة من الإصابة ب IAV (انظر التصميم التجريبي في الشكل 1) ، تم حصاد الرئتين ، وتم تحديد تدفق الخلايا المناعية عن طريق قياس التدفق الخلوي باتباع استراتيجية البوابة في الشكل 3. (أ) يتم عرض متوسط النسب المئوية لكل نوع خلية محدد داخل بوابة CD45 لجميع مجموعات المعالجة على الخريطة الحرارية. (ب) تظهر مخططات نقطية تمثيلية لأنواع الخلايا التي أظهرت اختلافات كبيرة بين المعالجات لكل مجموعة فأر. (ج) النسب المئوية لأنواع الخلايا المناعية المشار إليها. كل دائرة تتوافق مع ماوس واحد. (أ، ج) يتم عرض البيانات المجمعة من n = 5 فئران لكل مجموعة. * ، يشير إلى وجود فرق كبير (p < 0.05) بين Co-inf وغير المصاب ؛ $ ، يشير إلى وجود أهمية كبيرة بين IAV وغير المصابين ؛ # ، يشير إلى وجود فرق كبير بين Co-inf و IAV وحدهما. تم تحديد فروق ذات دلالة إحصائية بين مجموعات التحدي لكل نوع من الخلايا بواسطة ANOVA متبوعا باختبار Tukey. الاختصارات: NK = قاتل طبيعي ؛ PMN = الكريات البيض متعددة الأشكال النووية. DC = خلية متغصنة ؛ TCR = مستقبلات الخلايا التائية ؛ IAV = فيروس الأنفلونزا أ. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم. الشكل 5: الشيخوخة وزيادة قابلية المضيف للإصابة بالعدوى المشتركة ل IAV / العقدية الرئوية . الشباب (10-12 أسبوعا) والذين تتراوح أعمارهم بين (21-22 شهرا) C57BL / 6 الفئران الذكور أصيبوا بعدوى S. pneumoniae TIGR4 i.n. و IAV i.n. و i.t. (كما في الشكل 1) أو تم تحديهم بشكل فردي مع IAV وحده. (أ) تم تحديد التتر الفيروسي بعد 48 ساعة. تشير العلامات النجمية إلى دلالة إحصائية (p < 0.05) كما يحددها اختبار t للطالب. يتم تجميع البيانات من n = 4 الفئران لكل مجموعة. (ب) تمت مراقبة النتيجة السريرية و (ج) البقاء على قيد الحياة بمرور الوقت. (ب) يتم عرض متوسط ± SEM المجمعة من n = 6 فئران لكل مجموعة. تشير العلامات النجمية إلى دلالة إحصائية (p < 0.05) بين الفئران الصغيرة مقابل الفئران القديمة في النقطة الزمنية المشار إليها على النحو المحدد في اختبار Mann-Whitney. (ج) يتم تجميع البيانات من n = 6 فئران لكل مجموعة. تشير العلامات النجمية إلى دلالة إحصائية (p < 0.05) بين الفئران الصغيرة مقابل الفئران القديمة كما هو محدد في اختبار رتبة اللوغاريتم (Mantel-Cox). الاختصارات: IAV = فيروس الأنفلونزا A ؛ i.n. = داخل الأنف ؛ i.t. = داخل القصبة الهوائية ؛ SEM = خطأ قياسي للمتوسط. أعيد طبع الشكل 5 أ بإذن من Joma et al.23. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم. مزيج أنا الأسهم لآلية التنمية النظيفة الادنين 0.1 غرام د-ألانين 0.25 غ CaCl2 اللامائي 0.025 جرام كبريتات المنغنيز 0.03 غ سيانوكوبالامين 100 ميكرولتر من مخزون 10 ملغم/مل حمض بارا أمينوبنزويك 400 ميكرولتر من مخزون 5 ملغم/مل بيريدوكسامين 2HCl 100 ميكرولتر من مخزون 10 ملغم/مل مخزون المزيج الثاني لآلية التنمية النظيفة جوانين 0.05 غ يوراسيل 0.05 غ مخزون المزيج الثالث لآلية التنمية النظيفة نترات الحديديك 9H2O 50 ملغ/مل كبريتات الحديديك 7H2O 10 ملغم/مل مزيج المخزون الرابع لآلية التنمية النظيفة بيتا نيكوتيناميد الأدينين ثنائي النوكليوتيد 25 ملغم/مل الجدول 1: المخزونات المختلطة الأول والثاني والثالث والرابع لآلية التنمية النظيفة. الاختصار: CDM = وسائط محددة كيميائيا. فيتامين ميكس الأسهم لآلية التنمية النظيفة بيريدوكسال هيدروكلوريد 0.8 غ الثيامين Cl2 0.4 غ الريبوفلافين 0.4 غ كا-بانتوثينات 0.4 غ البيوتين 0.04 غ حمض الفوليك 0.4 غ نياكيناميدي 0.4 غ الجدول 2: مخزون مزيج الفيتامينات لآلية التنمية النظيفة. الاختصار: CDM = وسائط محددة كيميائيا. مخزون الأحماض الأمينية لآلية التنمية النظيفة إل-ألانين 0.480 غ إل-أرجينين 0.250 غ L- الهليون 0.700 غ حمض الأسبارتيك 0.600 غ ل-سيستين 1.000 جرام ل-سيستين 0.100 غ حمض الجلوتاميك 0.200 غ إل-جلوتامين 0.780 جرام إل-جلايسين 0.350 غ إل-هستيدين 0.300 غ إل-آيسولوسين 0.430 غ ل-ليوسين 0.950 غ ل-ليسين 0.880 جرام إل-ميثيونين 0.250 غ إل-فينيل ألانين 0.550 غ إل-برولين 1.350 غ ل-سيرين 0.680 جرام ل-ثريونين 0.450 غ إل-تريبتوفان 0.100 غ إل-فالين 0.650 غ الجدول 3: مخزون الأحماض الأمينية لآلية التنمية النظيفة. الاختصار: CDM = وسائط محددة كيميائيا. مخزون المبتدئين لآلية التنمية النظيفة سكر العنب 1.0 جرام كبريتات المغنيسيوم-7-هيدرات 0.070 غ فوسفات البوتاسيوم ثنائي القاعدة 0.02 غ فوسفات البوتاسيوم أحادي القاعدة 0.1 غرام خلات الصوديوم اللامائية 0.45 غ بيكربونات الصوديوم 0.25 غ فوسفات الصوديوم ثنائي القاعدة 0.735 جرام فوسفات الصوديوم أحادي القاعدة 0.32 غ المكملات النهائية لآلية التنمية النظيفة كلوريد الكولين 0.1 غرام L- السيستين حمض الهيدروكلوريك 0.075 جرام بيكربونات الصوديوم 0.25 غ الجدول 4: مخزون المبتدئين والملاحق النهائية لآلية التنمية النظيفة. الاختصار: CDM = وسائط محددة كيميائيا. الأجسام المضادة / الفلوروفور استنساخ عامل التخفيف L / D لإثارة الأشعة فوق البنفسجية غير متوفر 0.38888889 Ly6G AF 488 1 أ 8 0.25 CD11b APC م1/70 0.25 CD11c PE إن 418 0.18055556 كتلة الماوس Fc 2.4 جرام 2 0.11111111 F4 / 80 PE Cy7 بي إم 8 0.18055556 Ly6C BV605 ال-21 0.25 CD103 BV 421 م290 0.18055556 CD45 APC-eF-780 30-F11 0.18055556 الجدول 5: لوحة الأجسام المضادة 1. الأجسام المضادة / الفلوروفور استنساخ عامل التخفيف L / D لإثارة الأشعة فوق البنفسجية غير متوفر 0.388888889 TCR-β APC Cy7 ح57-597 0.180555556 CD4 V450 (أزرق المحيط الهادئ) RM4-5 0.25 CD8 BV650 53-6.7 0.180555556 كتلة الماوس Fc 2.4 جرام 2 0.111111111 CD45 PE 30-F11 0.180555556 CD3 AF488 145-2 ج11 0.180555556 TCR- γΔ APC جي ال -3 0.180555556 NK1.1 AF 700 PK136 0.180555556 الجدول 6: لوحة الأجسام المضادة 2.

Discussion

تعتمد معظم الدراسات التجريبية الحالية للعدوى المشتركة للمكورات الرئوية / IAV على توصيل البكتيريا إلى رئتي الفئران المصابة مسبقا ب IAV. ساعدت هذه النماذج في تحديد التغيرات في البيئة الرئوية والاستجابة المناعية الجهازية التي تجعل المضيف عرضة للعدوى البكتيرية الثانوية 15،16،¹⁷،32،33،34،³⁵،^36،37. ومع ذلك ، فشلت هذه النماذج في محاكاة انتقال S. pneumoniae من مستعمر بدون أعراض إلى ممرض قادر على التسبب في التهابات رئوية وجهازية خطيرة. علاوة على ذلك ، فإن هذه النماذج ليست مناسبة لدراسة العوامل المضيفة والتفاعلات بين المضيف والممرض في الجهاز التنفسي العلوي التي تساهم في التعرض للعدوى. اعتمد نموذج سابق لحركة المكورات الرئوية من البلعوم الأنفي إلى الرئة بعد عدوى IAV على العدوى البكتيرية للبلعوم الأنفي تليها العدوى الفيروسية. ومع ذلك ، فقد فشل في إعادة إنتاج العلامات الشديدة للمرض التي لوحظت في المرضى من البشر²¹. يلخص نموذج عدوى الفئران المعدل الموصوف هنا انتقال العقدية الرئوية من النقل بدون أعراض إلى ممرض يسبب مرضا سريريا شديدا.

الخطوة الحاسمة في هذا النموذج هي إنشاء عدوى S. الرئوية في البلعوم الأنفي. العقدية الرئوية تشكل الأغشية الحيوية وتستعمر البلعوم الأنفي بكفاءات مختلفة^21,38. لإثبات العدوى المتسقة ، يلزم ما لا يقل عن 5 × 10⁶ CFU من السلالات البكتيرية المزروعة بالأغشية الحيوية التي تم اختبارها حتى الآن²³. يوصى باختبار أي سلالة بكتيرية جديدة بحثا عن عدوى مستقرة بالبلعوم الأنفي قبل الإصابة بالعدوى الفيروسية. بالنسبة للعدوى الفيروسية المشتركة ، وجدت الدراسات السابقة أن العدوى عن طريق الأنف مع IAV مطلوبة لتشتت البكتيريا من البلعوم الأنفي²¹،^22،23. في تلك الدراسات السابقة ، تم استخدام 500 PFU من IAV للتسليم عن طريق الأنف ، بينما في هذه الدراسة ، كان 200 PFU كافيا لزيادة أعداد البكتيريا في البلعوم الأنفي. لا تقتصر عدوى IAV على الشعب الهوائية العليا ويمكن أن تنتشر إلى الرئتين^39,40 ، وهو أمر أساسي لجعل البيئة الرئوية أكثر تساهلا للعدوى البكتيرية^15,16,41. يمكن تحقيق توصيل IAV إلى الرئتين إما عن طريق التوصيل عن طريق الأنف أو التركيب داخل القصبة الهوائية للفئران المخدرة. وجد العمل السابق مع الفئران BALB / cByJ أن الولادة عن طريق الأنف تؤدي إلى الالتهاب الرئوي الفيروسي²¹; ومع ذلك ، فإن وصول اللقاح إلى الرئتين بعد التلقيح عن طريق الأنف يكون أكثر تقييدا في الفئران C57BL / 6. في الفئران C57BL / 6 ، يلزم التثبيت داخل القصبة الهوائية للتوصيل المتسق للفيروس²³. في هذا النموذج ، يسرع الاستعمار البكتيري السابق من ظهور أعراض المرض بعد العدوى الفيروسية²³. نظرا لأن العدوى الفيروسية نفسها يمكن أن تسبب أعراضا مرضية مع اختلاف محتمل في الحركية ، فمن المستحسن أولا اختبار مجموعة من الجرعات لأي سلالة فيروسية جديدة تم اختبارها واختيار جرعة تكشف عن الحركية المتسارعة في المضيفين المصابين بعدوى مشتركة.

توفر الرئتان قراءة مهمة أخرى لتقييم المرض في هذا النموذج. لتقييم عبء مسببات الأمراض وتدفق الخلايا المناعية ، يمكن استخدام رئة من نفس الفأر. ومع ذلك ، نظرا لأن شدة العدوى والالتهاب يمكن أن تختلف بين الفصوص ، فمن المستحسن عدم أخذ فصوص مختلفة من نفس الرئة لإجراء التقييمات المختلفة. بدلا من ذلك ، يمكن فرم جميع الفصوص إلى قطع صغيرة ، وخلطها جيدا معا ، ثم تحليلها بالتساوي للتقييمات المختلفة. وبالمثل ، يمكن استخدام البلعوم الأنفي لتعداد CFU البكتيري أو PFU الفيروسي والاستجابة المناعية. ومع ذلك ، فإن عدد الخلايا التي تم الحصول عليها من الغسلات والأنسجة منخفض جدا لإجراء قياس التدفق الخلوي دون تجميع العينات من الفئران داخل نفس المجموعة. بدلا من ذلك ، يمكن تقييم الالتهاب في البلعوم الأنفي نسيجيا²³.

من السمات الحاسمة لهذا النموذج أنه يلخص المرض السريري الذي يظهر في المرضى. في البشر ، غالبا ما يؤدي الالتهاب الرئوي الثانوي بالمكورات الرئوية بعد عدوى IAV إلى علامات واضحة للمرض ، بما في ذلك السعال وضيق التنفس والحمى وآلام العضلات التي يمكن أن تؤدي إلى دخول المستشفى وفشل الجهاز التنفسي وحتى الوفاة⁸،¹⁵،^42،43. يلخص هذا النموذج العلامات الشديدة للأمراض السريرية التي لوحظت في البشر من حيث صعوبة التنفس (تنعكس في درجة التنفس) والشعور بالضيق العام (ينعكس في درجات الموقف والحركة) التي أظهرتها الفئران ، وكذلك الموت في بعض الضوابط الشابة الأصحاء. من المحتمل أن تكون أعراض المرض المتفاقمة في الفئران المصابة بعدوى مشتركة نتيجة لكل من انتشار البكتيريا إلى الرئتين وضعف التصفية الفيروسية في الفئران مع نقل المكورات الرئوية²³. يتمثل أحد قيود النموذج في أن حدوث المرض السريري وانتشار البكتيريا من البلعوم الأنفي يختلف بين الفئران ويتأثر بالسلالة البكتيرية وعمر المضيف والنمط الجيني²¹،^22،23. مما يعكس ذلك ، بالنسبة للسلالات الغازية ، يمكن أن يحدث التقدم من العدوى الموضعية (مع عدم وجود تجرثم الدم القابل للاكتشاف) إلى الموت في غضون 24 ساعة. لذلك ، من أجل تقييم حقيقي للانتشار الجهازي ، يجب متابعة تجرثم الدم على فترات أقصر (كل 6-12 ساعة). وبالمثل ، يمكن أن تتغير درجة المرض بسرعة ، لا سيما في أول 72 ساعة بعد الإصابة المشتركة. لذلك ، لتتبع أعراض المرض عن كثب ، ينصح بمراقبة الفئران ثلاث مرات يوميا لمدة 1-3 أيام بعد الإصابة ب IAV.

باختصار ، يكرر هذا النموذج حركة S. pneumoniae من مستعمر بدون أعراض للبلعوم الأنفي إلى ممرض قادر على التسبب في مرض رئوي وجهازي عند الإصابة بعدوى IAV. في هذا النموذج ، يؤدي IAV إلى انتقال S. pneumoniae عن طريق تعديل السلوك البكتيري في البلعوم الأنفي ، وزيادة انتشار البكتيريا إلى الرئة ، وتغيير المناعة المضادة للبكتيريا²³. وبالمثل ، فإن النقل البكتيري يضعف الاستجابات المناعية المضادة للفيروسات ويضعف إزالة IAV من الرئتين²³. هذا يجعل هذا النموذج مثاليا لتحليل التغيرات في الاستجابات المناعية في العدوى الفردية مقابل العدوى متعددة الميكروبات. بالإضافة إلى ذلك ، فإن مسار المرض بعد العدوى المشتركة يعتمد ، جزئيا ، على سلالة المكورات الرئوية الموجودة في البلعوم الأنفي. لذلك ، فإن النموذج مناسب لتشريح العوامل البكتيرية المطلوبة للاستعمار بدون أعراض مقابل الانتقال الممرض للمكورات العنقودية الرئوية. أخيرا ، يعيد هذا النموذج إنتاج قابلية الشيخوخة للعدوى المشتركة ، وعلى الرغم من أن هذا لم يتم اختباره هنا ، إلا أنه يمكن استخدامه بسهولة لتقييم تأثير خلفية المضيف على مسار المرض. في الختام ، يوفر فصل النقل والمرض إلى خطوات متميزة الفرصة لتحليل المتغيرات الجينية لكل من مسببات الأمراض والمضيف ، مما يسمح بالفحص التفصيلي لتفاعلات المرض المهم مع المضيف في مراحل مختلفة من تطور المرض. من الآن فصاعدا ، يمكن استخدام هذا النموذج لتخصيص خيارات العلاج للمضيفين المعرضين للخطر.

Materials

4-Aminobenzoic acid	Fisher	AAA1267318	Mix I stock
96-well round bottom plates	Greiner Bio-One	650101
100 µm Filters	Fisher	07-201-432
Adenine	Fisher	AC147440250	Mix I stock
Avicel	Fisher	501785325	Microcyrstalline cellulose
BD Cytofix Fixation Buffer	Fisher	BDB554655	Fixation Buffer
BD Fortessa			Flow cytometer
BD Intramedic Polyethylene Tubing	Fisher	427410	Tubing for nasal lavage
BD Disposable Syringes with Luer-Lok Tips (1 mL)	Fisher	14-823-30
BD Microtainer Capillary Blood Collector and BD Microgard Closure	Fisher	02-675-185	Blood collection tubes
Beta-Nicotinamide adenine dinucleotide	Fisher	AAJ6233703	Mix IV stock
Biotin	Fisher	AC230090010	Vitamin stock
C57BL/6J mice	The Jackson Laboratory	#000644	Mice used in this study
Calcium Chloride Anhydrous	Fisher Chemical	C77-500	Mix I stock
CD103 BV 421	BD Bioscience	BDB562771	Clone: M290 DF 1:200
CD11b APC	Invitrogen	50-112-9622	Clone: M1/70, DF 1:300
CD11c PE	BD Bioscience	BDB565592	Clone: N418 DF 1:200
CD3 AF 488	BD Bioscience	OB153030	Clone: 145-2C11 DF 1:200
CD4 V450	BD Horizon	BDB560470	Clone: RM4.5 DF 1:300
CD45 APC eF-780	BD Bioscience	50-112-9642	Clone: 30-F11 DF 1:200
CD45 PE	Invitrogen	50-103-70	Clone: 30-F11 DF 1:200
CD8α BV 650	BD Horizon	BDB563234	Clone: 53-6.7 DF 1:200
Choline chloride	Fisher	AC110290500	Final supplement to CDM
Corning Disposable Vacuum Filter/Storage Systems	Fisher	09-761-107	Filter sterilzation apparatus
Corning Tissue Culture Treated T-25 Flasks	Fisher	10-126-9
Corning Costar Clear Multiple Well Plates	Fisher	07-201-590
Corning DMEM With L-Glutamine and 4.5 g/L Glucose; Without Sodium Pyruvate	Fisher	MT10017CM
Cyanocobalamin	Fisher	AC405925000	Mix I stock
D39	National Collection of Type Culture (NCTC)	NCTC 7466	Streptococcus pneumoniae strain
D-Alanine	Fisher	AAA1023114	Mix I stock
D-Calcium pantothenate	Fisher	AC243301000	Vitamin stock
Dextrose	Fisher Chemical	D16-500	Starter stock
Dnase	Worthington Biochemical	LS002147
Eagles Minimum Essential Medium	ATCC	30-2003
EDTA	VWR	BDH4616-500G
EF3030	Center for Disease Control and Prevention	Available via the isolate bank request	Streptococcus pneumoniae strain, request using strain name
F480 PE Cy7	BD Bioscience	50-112-9713	Clone: BMB DF 1:200
Falcon 50 mL Conical Centrifuge Tubes	Fisher	14-432-22	50 mL round bottom tube
Falcon Round-Bottom Polypropylene Test Tubes With Cap	Fisher	14-959-11B	15 mL round bottom tube
Falcon Round-Bottom Polystyrene Test Tubes (5 mL)	Fisher	14-959-5	FACS tubes
FBS	Thermofisher	10437-028
Ferric Nitrate Nonahydrate	Fisher	I110-100	Mix III stock
Fisherbrand Delicate Dissecting Scissors	Fisher	08-951-5	Instruments used for harvest
Fisherbrand Disposable Inoculating Loops	Fisher	22-363-602	Inoculating loops
Fisherbrand Dissecting Tissue Forceps	Fisher	13-812-38	Forceps for harvest
Fisherbrand Premium Microcentrifuge Tubes: 1.5 mL	Fisher	05-408-137	Micocentrifuge tubes
Fisherbrand Sterile Syringes for Single Use (10 mL)	Fisher	14-955-459
Folic Acid	Fisher	AC216630500	Vitamin stock
Gibco RPMI 1640 (ATCC)	Fisher	A1049101
Gibco DPBS, no calcium, no magnesium	Fisher	14190250
Gibco HBSS, calcium, magnesium, no phenol red	Fisher	14025134
Gibco MEM (Temin's modification) (2x), no phenol red	Fisher	11-935-046
Gibco Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL)	Fisher	15-140-122
Gibco Trypan Blue Solution, 0.4%	Fisher	15-250-061
Gibco Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red	Fisher	25-200-056
Glycerol (Certified ACS)	Fisher	G33-4
Glycine	Fisher	AA3643530	Amino acid stock
Guanine	Fisher	AAA1202414	Mix II stock
Invitrogen UltraComp eBeads Compensation Beads	Fisher	50-112-9040
Iron (II) sulfate heptahydrate	Fisher	AAA1517836	Mix III stock
L-Alanine	Fisher	AAJ6027918	Amino acid stock
L-Arginine	Fisher	AAA1573814	Amino acid stock
L-Asparagine	Fisher	AAB2147322	Amino acid stock
L-Aspartic acid	Fisher	AAA1352022	Amino acid stock
L-Cysteine	Fisher	AAA1043518	Amino acid stock
L-Cysteine hydrochloride monohydrate	Fisher	AAA1038914	Final supplement to CDM
L-Cystine	Fisher	AAA1376218	Amino acid stock
L-Glutamic acid	Fisher	AC156211000	Amino acid stock
L-Glutamine	Fisher	O2956-100	Amino acid stock
L-Histidine	Fisher	AC166150250	Amino acid stock
LIFE TECHNOLOGIES LIVE/DEAD Fixable Blue Dead Cell Stain Kit, for UV excitation	Invitrogen	50-112-1524	Clone: N/A DF 1:500
L-Isoleucine	Fisher	AC166170250	Amino acid stock
L-Leucine	Fisher	BP385-100	Amino acid stock
L-Lysine	Fisher	AAJ6222514	Amino acid stock
L-Methionine	Fisher	AAA1031822	Amino acid stock
Low endotoxin BSA	Sigma Aldrich	A1470-10G
L-Phenylalanine	Fisher	AAA1323814	Amino acid stock
L-Proline	Fisher	AAA1019922	Amino acid stock
L-Serine	Fisher	AC132660250	Amino acid stock
L-Threonine	Fisher	AC138930250	Amino acid stock
L-Tryptophan	Fisher	AAA1023014	Amino acid stock
L-Valine	Fisher	AAA1272014	Amino acid stock
Ly6C BV 605	BD Bioscience	BDB563011	Clone: AL-21 DF 1:300
Ly6G AF 488	Biolegend	NC1102120	Clone: IA8, DF 1:300
Madin-Darby Canine Kidney (MDCK) cells	American Type Culture Collection (ATCC)	CCL-34	MDCK cell line for PFU analuysis
Magnesium Sulfate 7-Hydrate	Fisher	60-019-68	CDM starter stock
Manganese Sulfate	Fisher	M113-500	Mix I stock
MilQ water			Ultra-pure water
Mouse Fc Block	BD Bioscience	BDB553142	Clone: 2.4G2 DF 1:100
MWI VETERINARY PURALUBE VET OINTMENT	Fisher	NC1886507	Eye lubricant for infection
NCI-H292 mucoepidermoid carcinoma cell line	ATCC	CRL-1848	H292 lung epithelial cell line for biofilm growth
Niacinamide	Fisher	18-604-792	Vitamin stock
NK 1.1 AF 700	BD Bioscience	50-112-4692	Clone: PK136 DF 1:200
Oxyrase For Broth 50Ml Bottle 1/Pk	Fisher	50-200-5299	To remove oxygen from liquid cultures
Paraformaldehyde 4% in PBS	Thermoscientific	J19932-K2
Pivetal Isoflurane	Patterson Veterinary	07-893-8440	Isoflurane for anesthesia during infection
Potassium Phosphate Dibasic	Fisher Chemical	P288-500	Starter stock
Potassium Phosphate Monobasic	Fisher Chemical	P285-500	Starter stock
Pyridoxal hydrochloride	Fisher	AC352710250	Vitamin stock
Pyridoxamine dihydrochloride	Fisher	AAJ6267906	Mix I stock
Riboflavin	Fisher	AC132350250	Vitamin stock
Sodium Acetate	VWR	0530-500G	Starter stock
Sodium Azide	Fisher Bioreagents	BP922I-500	For FACS buffer
Sodium Bicarbonate	Fisher Chemical	S233-500	Starter stock and final supplement to CDM
Sodium Phosphate Dibasic	Fisher Chemical	S374-500	Starter stock
Sodium Phosphate Monobasic	Fisher Chemical	S369-500	Starter stock
TCR APC	BD Bioscience	50-112-8889	Clone: GL-3 DF 1:200
TCRβ APC-Cy7	BD Pharmigen	BDB560656	Clone: H57-597 DF 1:200
Thermo Scientific Blood Agar with Gentamicin	Fisher	R01227	Blood agar plates with the antibiotic gentamicin
Thermo Scientific Trypsin, TPCK Treated	Fisher	PI20233
Thiamine hydrochloride	Fisher	AC148991000	Vitamin stock
TIGR4	ATCC	BAA-334	Streptococcus pneumoniae strain
Uracil	Fisher	AC157300250	Mix II stock
Worthington Biochemical Corporation Collagenase, Type 2, 1 g	Fisher	NC9693955