RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Katarzyna Okurowska1,2, Sanhita Roy3, Praveen Thokala4, Lynda Partridge1,5, Prashant Garg3, Sheila MacNeil1,6, Peter N. Monk1,7, Esther Karunakaran1,2
1Sheffield Collaboratorium for Antimicrobial Resistance and Biofilms (SCARAB),University of Sheffield, 2Department of Chemical and Biological Engineering,University of Sheffield, 3Hyderabad Eye Research Foundation,L V Prasad Eye Institute, 4Health Economics and Decision Science, School of Health and Related Research,University of Sheffield, 5Department of Molecular Biology and Biotechnology,University of Sheffield, 6Department of Materials Science and Engineering,University of Sheffield, 7Department of Infection, Immunity and Cardiovascular Disease,University of Sheffield
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Bu makalede, bakteriyel keratitin ex vivo porcine modelini kurmak için adım adım bir protokol açıklanmaktadır. Pseudomonas aeruginosa prototipik bir organizma olarak kullanılır. Bu yenilikçi model in vivo enfeksiyonu taklit eder, çünkü bakteri çoğalması bakterinin kornea dokusuna zarar verme yeteneğine bağlıdır.
Yeni antimikrobiyaller geliştirirken, hayvan deneylerinin başarısı in vitro testlerden in vivo hayvan enfeksiyonlarına kadar antimikrobiyal etkinliğin doğru bir şekilde tahmin edilmesine bağlıdır. Mevcut in vitro testler tipik olarak antimikrobiyal etkinliği abartır, çünkü bir difüzyon bariyeri olarak konak dokusunun varlığı hesaba katmaz. Bu darboğazın üstesinden gelmek için, prototipik bir organizma olarak Pseudomonas aeruginosa kullanarak bakteriyel keratitin ex vivo porcine kornea modelini geliştirdik. Bu makalede, porcine korneasının hazırlanması ve enfeksiyonun kurulması için protokol açıklanmaktadır. ısmarlama cam kalıplar, enfeksiyon çalışmaları için korneanın basit kurulumunu sağlar. Bakteriyel çoğalma kornea dokusuna zarar verme yeteneğine bağlı olduğu için model in vivo enfeksiyonu taklit eder. Enfeksiyonun kurulması, uygun plaka sayımları ile değerlendirilen koloni oluşturan birimlerin sayısında bir artış olarak doğrulanır. Sonuçlar, burada açıklanan yöntem kullanılarak ex vivo kornealarda enfeksiyonun oldukça tekrarlanabilir bir şekilde kurulabileceğini göstermektedir. Model gelecekte P. aeruginosadışındaki mikroorganizmaların neden olduğu keratitleri taklit etmek için genişletilebilir. Modelin nihai amacı, in vivo enfeksiyonları daha fazla temsil eden bir senaryoda antimikrobiyal kemoterapinin bakteriyel enfeksiyonun ilerlemesi üzerindeki etkisini araştırmaktır. Bunu yaparken, burada açıklanan model, hayvanların test için kullanımını azaltacak, klinik çalışmalarda başarı oranlarını artıracak ve sonuçta yeni antimikrobiyallerin kliniğe hızlı bir şekilde çevrilmesini sağlayacaktır.
Kornea enfeksiyonları körlüğün önemli nedenleridir ve düşük ve orta gelirli ülkelerde salgın oranlarında ortaya çıkar. Hastalığın etiyolojisi bölgeden bölgeye değişmekle birlikte bakteriler bu vakaların büyük bir çoğunluğunu oluşturmektedir. Pseudomonas aeruginosa, hızla ilerleyen bir hastalığa neden olan önemli bir patojendir. Çoğu durumda, hastalar stromal skar, düzensiz astigmatizma ile bırakılır, nakil gerektirir veya en kötü senaryoda, bir göz kaybeder1,2.
P. aeruginosa'nın neden olduğu bakteriyel keratit, özellikle P. aeruginosa'nın antimikrobiyal dirençli suşlarının artan ortaya çıkması nedeniyle tedavisi zor birgöz enfeksiyonudur. Son on yıl içinde, genel olarak kornea enfeksiyonları ve pseudomonas sp.'nin neden olduğu testler ve yeni tedaviler geliştirmek, antibiyotik direncindeki mevcut eğilimle mücadele etmek için gerekli olduğu ortaya çıktı3.
Kornea enfeksiyonları için yeni tedavilerin etkinliğini test etmek için, geleneksel in vitro mikrobiyolojik yöntemler, laboratuvar kültürü sırasında ve in vivo enfeksiyonlar sırasında bakteriyel fizyolojinin farklılığı ve konak arayüzünün olmaması nedeniyle zayıf bir vekildir4,5. Bununla birlikte, in vivo hayvan modelleri pahalıdır, zaman alıcıdır, sadece az sayıda çoğaltma sağlayabilir ve hayvan refahı konusunda endişeleri artırabilir.
Bu yazıda, akut ve kronik enfeksiyonlar için çeşitli tedavileri test etmek için kullanılabilecek basit ve tekrarlanabilir bir organotipik ex vivo porcine keratit modeli göstermektedir. Bu deney için P. aeruginosa'yı kullandık, ancak model diğer bakteriler ve keratite neden olan mantar ve maya gibi organizmalarla da iyi çalışıyor.
Albino laboratuvar tavşanları, ev ofisi onaylı protokoller altında planlanan diğer deneysel çalışmalar için laboratuvarda feda edildi. Bu çalışmalarda deneysel kullanım için gözler gerekli değildi, bu yüzden bu protokol için kullanıldılar.
1. Sterilizasyon
2. Örnek toplama
3. Korneoskleral düğmenin hazırlanması
4. Korneoskleral düğmelerin bakımı
5. Bir inoculum hazırlanması
6. Korneoskleral düğmenin enfekte olması
7. Bakterileri hasat etmek için korneanın homojenizasyonu
Cam kalıpların tasarımı, kullanımı modeli kontaminasyonla ilgili minimum / hiç sorun olmadan tutarlı bir şekilde kurmamızı sağlayan yenilikçi ve orijinal bir fikirdir. Kalıplar Sheffield Üniversitesi'nde bir cam üfleyici tarafından bir tasarıma dayanarak hazırlanmıştır (Şekil 1A). Deneysel kurulum korneanın dışbükey şeklini korur ve enfeksiyonun gerçekleştiği epitelin üstünde bakteri tutar (Şekil 1B).
Porcine korneaları genellikle orta birkaç gün sonra şişer. Bu normaldir ve korneanın şişmesini önlemek için genellikle eklenen dektran ile ve eklenmeden kornealar arasında önemli bir fark olmadığını gördük (Şekil 1H). Kornealar tipik olarak bakterilerin epitellere nüfuz etmesine yardımcı olmak için yaralanır. Yaralı (kesik) ve çözülmemiş (kesilmemiş) kornealar arasındaki enfeksiyonun ilerlemesinde önemli bir fark olmamasına rağmen, kesilmemiş kornealardaki çoğalımlar arasında daha fazla varyasyon fark ettik (Şekil 1C). Korneaları PBS ile iki kez yıkamak epitellere bağlanmayan fazla bakterileri temizler. 24 saat boyunca P. aeruginosa PAO1 ile enfekte olmuş yıkanmış ve yıkanmamış porcine korneaları arasında CFU'da önemli bir fark vardı(Şekil 1D). PA14 ve PAO1 ile enfekte olan porcine ve tavşan korneaları arasında CFU sayılarında anlamlı bir fark yoktu(Şekil 1E,1F). Her iki model için de sonuçlar tekrarlanabilirdi. 24 saat sonra, Pseudomonas suşu ile enfekte olan kornea her zaman opaklık geliştirir ve kesilen alan enfekte olmayan korneaya kıyasla daha görünür ve açık hale gelir (Şekil 1G).

Şekil 1: Pseudomonas aeruginosaile enfekte ex vivo kornea . (A) Korneanın şeklini korumak ve bakteri ve tedavilerin girişini kolaylaştırmak için kullanılan bir cam kalıbın şematik resmi. Cam kalıpların kalınlığı 1,5 mm'dir ve borosilikat camdan yapılan test tüplerinin kalınlığı ile aynıdır. (B) Deneysel kurulumun şematik resmi. (C) Homojenizasyondan sonra yaranın son CFU sayısı üzerindeki etkisinin test edilmesi. Kesilmemiş (n = 16) ve kesilmiş (n = 28) kornealara 24 saat boyunca P. aeruginosa PAO1 ve P. aeruginosa PA14 bulaştı. Kornealar homojenizasyondan önce 1 mL PBS ile yıkandı. Hata çubukları standart sapmayı gösterir. (D)Korneaların 2 x 1 mL PBS (n = 6) ile yıkanması ve yıkanmaması (n = 6) P. aeruginosa PAO1 enfeksiyonundan sonraki son CFU sayısı üzerindeki etkisinin 24 saat boyunca test edilmektedir. Hata çubukları standart sapmayı gösterir. (E) P. aeruginosa PAO1 ve P. aeruginosa PA14 ile enfekte olan porcine kornealarında 24 saat boyunca son CFU sayısı (n = 10). Kornealar yıkandı ve kesildi. Hata çubukları standart sapmayı gösterir. (F) P. aeruginosa PAO1 ve P. aeruginosa PA14 ile enfekte tavşan kornealarında 24 saat boyunca son CFU sayısı (n = 6). Kornealar yıkandı ve kesildi. Hata çubukları standart sapmayı gösterir. (G) 24 saat boyunca P. aeruginosa PAO1 ile enfekte olan ex vivo porcine kornealarının resimleri. Kontrol yaralıydı ama bakteri eklenmedi. Enfekte kornealar yaralandı ve kesilen tarafa 107 CFU eklendi. Kontrol korneasından CFU bulunamadı. (H) Son CFU, dektran (n = 2) ile tedavi edilen kornealardan P. aeruginosa PAO1 ve dektransızlardan (n = 9) 24 saat süren enfeksiyondan sonra iyileşti. Kornealar yıkandı ve kesildi. Hata çubukları standart sapmayı gösterir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.
Bu makalede, bakteriyel keratitin ex vivo porcine modelini kurmak için adım adım bir protokol açıklanmaktadır. Pseudomonas aeruginosa prototipik bir organizma olarak kullanılır. Bu yenilikçi model in vivo enfeksiyonu taklit eder, çünkü bakteri çoğalması bakterinin kornea dokusuna zarar verme yeteneğine bağlıdır.
Yazarlar Chesterfield'daki Elliot Abattoir'e gözenekli gözler sağladığı için teşekkür etmek istiyor. Cam halkalar, Sheffield Üniversitesi Kimya Bölümü'nden cam üfleyici Dan Jackson tarafından tasarımımıza dayanarak yapıldı. Yazarlar, tıbbi araştırma konseyine (MR/S004688/1) finansman için teşekkür eder. Yazarlar ayrıca Kornea hazırlamada teknik yardım için Bayan Shanali Dikwella'ya teşekkür etmek istiyor. Yazarlar, resimleri biçimlendirme konusunda yardımcı olduğu için Bay Jonathan Emery'ye teşekkür etmek istiyor.
| 50 mL Falcon tüpü | SLS | 352070 | |
| Amfoterisin B | Sigma | A2942 | |
| Cellstar 12 kuyulu plaka | Greiner Bio-One | 665180 | |
| Dekstran | Sigma | 31425-100mg-F | |
| Distel | Fisher Bilimsel | 12899357 | |
| DMEM + glutamax | SLS | D0819 | |
| Çift Fırınlı İnkübatör | SLS | OVe1020 | Sterilizasyon fırını |
| Epidermal büyüme faktörü | SLS | E5036-200UG | |
| F12 HAM | Sigma | N4888 | |
| Fetal buzağı serumu | Labtech International | CA-115/500 | |
| Forseps | Fisher Scientific | 15307805 | |
| El tipi homojenizatör 220 | Fisher Scientific | 15575809 | Homojenizatör |
| Heracell VIOS 160i | Thermo Scientific | 15373212 | Doku kültürü inkübatörü |
| Heraeus Megafuge 16R | VWR | 521-2242 | Santrifüj |
| İnsülin, rekombinant İnsan | SLS | 91077C-1G | |
| LB agar | Sigma | L2897 | |
| Multitron | Infors | Uygulanamaz | Bakteriyel kuluçka makinesi |
| PBS | SLS | P4417 | |
| Penisilin-Streptomisin | SLS | P0781 | |
| Petri kabı | Fisher Scientific | 12664785 | |
| Petri kabı 35x10mm CytoOne | Starlab | CC7672-3340 | |
| Povidone iyot | Weldricks eczane | 2122828 | |
| Güvenli 2020 | Fisher Scientific | 1284804 | Sınıf II mikrobiyoloji güvenlik kabini |
| Neşter bıçağı numarası 15 | Fisher Scientific | O305 | |
| Neşter Swann Morton | Fisher Scientific | 11849002 |