A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Title
- 01:07Introduction
- 02:11Sample Incubation and DNA Extraction
- 03:47Gradient Solns for Ultracentrifugation
- 05:26Ultracentrifugation
- 07:49Gradient Fractionation
- 09:46DNA Precipitation
- 11:22Representative Results
- 14:04Conclusion
DNA stabil-isotop sondering är en odlings-oberoende metod för att identifiera och karakterisera aktiva samhällen av mikroorganismer som kan utnyttja vissa substrat. Assimilering av substrat anrikat med tunga isotop leder till inkorporering av märkta atomer till mikrobiell biomassa. Densitetsgradient ultracentrifugering hämtar märkt DNA för nedströms molekylära analyser.
Tags
DNA-SIPStable-isotope ProbingMicroorganismsCarbon SubstratesNutrientsCellular BiomassCultivation-independent TechniqueMetabolic FunctionTerrestrial EnvironmentsAquatic EnvironmentsStable-isotope Labelled CompoundsNucleic AcidDensity Gradient UltracentrifugationGradient FractionationDNA PurificationCesium ChlorideMolecular CharacterizationFingerprintingMicroarraysClone LibrariesMetagenomics
