We presenteren een protocol voor structurele en analyse van de samenstelling van natuurlijke orale biofilm van orthodontische apparatuur met<em> In situ</em> Hybridisatie (FISH) en confocale laser scanning microscopie (CLSM). Orale biofilm monsters werden verzameld van palatinale expanders, schrapen acryl-hars vlokken van hun oppervlak en verwijzen ze voor de moleculaire verwerking.