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Un ARN ribosómico (ARNr) de protocolo agotamiento fue desarrollado para enriquecer el ARN mensajero (ARNm) de ARN-ss de la metatranscriptome intestino del mosquito. Sondas de muestreo específicos rRNA, que fueron utilizados para extraer el rRNA mediante sustracción, se crea a partir del mosquito y sus microbios intestinales. Rendimiento del protocolo puede resultar en la eliminación de aproximadamente el 90-99% de rRNA.