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Sequenza RNA a singola cellula di sottogruppi definiti delle cellule del Ganglio retinico
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Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells
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Sequenza RNA a singola cellula di sottogruppi definiti delle cellule del Ganglio retinico

italiano

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13,546 Views

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11:26 min

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May 22, 2017

DOI:

10.3791/55229-v

DOI:
10.3791/55229-v

•

11:26 min
May 22, 2017

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1Department of Genetics, Development, and Cell Biology,Iowa State University, 2Department of Neurobiology,Northwestern University

Summary

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Qui presentiamo un approccio combinatorio per la classificazione di tipi di cellule neuronali prima dell'isolamento e per la successiva caratterizzazione di transcriptomi a singola cellula. Questo protocollo ottimizza la preparazione di campioni per il successo RNA Sequencing (RNA-Seq) e descrive una metodologia studiata appositamente per una migliore comprensione della diversità cellulare.

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Single-cell RNA-SeqRetinal Ganglion CellsFluorescent LabelingNeuronal SubtypeCellular DiversityRNA IsolationPatch-clampElectrophysiological RecordingsMicropipette PullerExtracellular SolutionOxygenationFluorescent Microscopy

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Laboissonniere, L. A., Sonoda, T., Lee, S. K., Trimarchi, J. M., Schmidt, T. M. Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells. J. Vis. Exp. (123), e55229, doi:10.3791/55229 (2017).

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