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JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics
Analisi trascrittomica di
Leveraging CyVerse Resources for De Novo Comparative Transcriptomics of Underserved (Non-model) Organisms
Journal (Genetics)
Leveraging CyVerse Resources for De Novo Comparative Transcriptomics of Underserved (Non-model) Organisms
Genome-wide Surveillance of Transcription Errors in Eukaryotic Organisms
Journal (Genetics)
Genome-wide Surveillance of Transcription Errors in Eukaryotic Organisms
 
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Analisi trascrittomica di

Article DOI: 10.3791/55473-v • 10:19 min • April 8th, 2017
April 8th, 2017 •
1, 1
1Department of Pediatrics, University of Pittsburgh School of Medicine, Children's Hospital of Pittsburgh

Chapters

Summary
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Galaxy e David sono emersi come strumenti popolari che permettono ai ricercatori senza formazione bioinformatica per analizzare e interpretare i dati di RNA-Seq. Descriviamo un protocollo per la C. elegans ai ricercatori di effettuare RNA-Seq esperimenti, l'accesso ed elaborare il set di dati utilizzando Galaxy e ottenere informazioni biologiche significative dalle liste di geni con David.

Tags

Genetica RNA di sequenziamento RNA-Seq Trascrittomica l'espressione genica Galaxy progetto Tuxedo database per l'annotazione la visualizzazione e integrato Discovery (David), Next-Generation Sequencing (NGS) Trascrizione Profiling Genomics
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