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February 19, 2019
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Cette méthode peut répondre à des questions clés dans la croissance et la morphologie des stolons et des rhizomes de différentes cultures telles que les graminées, les prairies et les pâturages. Le principal avantage de cette technique est que la longueur du stolon et du rhizome peut être mesurée dans des échantillons avec une grande quantité de biomasse pour laquelle le poids est le seul paramètre actuellement utilisé. Prélever des échantillons à l’aide d’un échantillonneur de carottes de sol.
Inclure la biomasse au-dessus du sol et une couche de sol avec une profondeur appropriée, selon les espèces pour assurer la collecte des stolons et des rhizomes. Vous pouvez également définir la surface à recueillir à l’aide d’un cadre et prélever les échantillons à l’aide d’une bêche. Étiquetez chaque échantillon avec du ruban adhésif de laboratoire.
Pour nettoyer les échantillons de biomasse, placez l’échantillon dans un grand tamis avec des ouvertures de 0,5 à 1,5 millimètre, selon la taille du stolon ou du rhizome. Les ouvertures doivent être suffisamment petites pour retenir tous les stolons et rhizomes, mais suffisamment grandes pour permettre l’enlever des particules du sol. Nettoyez les échantillons avec un jet d’eau avec suffisamment de puissance pour enlever les particules de sol sans endommager les plantes.
Récupérez les échantillons propres et placez-les dans un plateau avec des serviettes en papier, en prenant soin d’étiqueter les plateaux de façon appropriée. Nettoyez davantage les échantillons en enlevant les racines et les feuilles avec des ciseaux. Au cours de ce processus, séparez les stolons et les rhizomes si nécessaire et enregistrez des informations supplémentaires, telles que le nombre de plantes, de laboureurs et de stolons par plante.
Placer les stolons et les rhizomes dans des sacs étiquetés en papier. Placez l’échantillon sur un plateau en plastique transparent de l’équipement de numérisation standard WinRHIZO. Placez manuellement les stolons et les rhizomes à l’aide de forceps de laboratoire pour minimiser les chevauchements.
Les échantillons de grande taille peuvent devoir être divisés en sous-échantillons. Placez le plateau sur la surface du scanner, puis allumez le scanner et commencez à exécuter le programme. Pour plus de contrôle dans une image enregistrée, vérifiez le dpi d’image dans le menu Image en sélectionant le paramètre d’acquisition d’image de commande.
Pour une bonne classification des pixels appartenant aux organes numérisés, vérifiez le seuil et l’analyse en sélectionnant la distinction de fond racine de commande. Vérifiez que toute la surface du plateau sera numérisée dans le menu Image en sélectionnant le paramètre d’acquisition d’image de commande. Maintenant, vérifiez la classe de diamètre affichée pour la distribution des organes par diamètre dans la zone graphique au-dessus de l’image numérisée.
Sélectionnez 20 classes de largeur égale avec des intervalles de 0,1 millimètre en cliquant sur l’accès horizontal du graphique. Cette fonction permet l’exclusion des données appartenant à des racines ou à de petits organes lorsque les stolons ou les rhizomes n’ont pas été parfaitement nettoyés. La littérature rapporte que la plupart des racines des espèces de gazon ont un diamètre inférieur à 0,2 millimètre.
Exécutez la première analyse d’échantillon et vérifiez que la modification permet une bonne analyse. Suivez les instructions logicielles pour enregistrer l’image. Enfin, traiter l’analyse suivant l’option logicielle et étiqueter l’image et l’analyse avec l’étiquette de l’échantillon.
Procéder à la numérisation de tous les échantillons. Pour effectuer la mesure du poids sec, placez les échantillons numérisés dans un plateau en aluminium goudronné sur un équilibre électronique précis et enregistrez leur ivraie. Répétez cette étape pour tous les échantillons numérisés.
Insérez tous les échantillons dans un ensemble souvent à 105 degrés Celsius et séchez-les pendant 24 heures. Le lendemain, retirez les échantillons et attendez que le poids des tissus se soit stabilisé. Ensuite, pesez tous les échantillons avec leur ivraie.
Soustrayez l’ivraie du poids enregistré pour obtenir le poids net de chaque échantillon. Des exemples de résultats d’un essai sur le terrain comparant la densité de longueur de stolon et de rhizome de quatre cultivars bermudagrass de type gazon sont montrés. Il existe une différence significative dans la densité de la longueur des stolons entre les cultivars végétatifs Patriot et Tifway, et les cultivars ensemencés La Paloma et Yukon dans les échantillons prélevés en juillet 2014.
Pour les rhizomes, Patriot affiche la densité de longueur la plus élevée, suivie de Tifway et des cultivars ensemencés. Le développement de la densité de longueur stolon du cultivar Patriot tout au long de la période d’étude montre une augmentation de mars 2014 à juillet 2014 et il n’a pas varié de juillet 2014 à juillet 2015. Peu de rhizomes ont été trouvés dans des échantillons prélevés en octobre 2013 et mars 2014.
La densité de la longueur des rhizomes augmente en juillet 2014, atteignant les valeurs les plus élevées. Mais il diminue à nouveau en octobre 2014. Lorsque vous essayez cette procédure, il est important de se rappeler de sélectionner des échantillons représentatifs, de nettoyer méticuleusement les stolons et les rhizomes avant l’analyse, et de sélectionner la largeur des classes de diamètre en utilisant des options logicielles pour inclure uniquement des stolons et des rhizomes dans l’analyse.
Un système d’analyse image logicielle fournit une autre méthode pour étudier la morphologie des espèces stolonifères et rhizomateuses. Ce protocole permet de mesurer de la longueur et le diamètre des stolons et rhizomes et peut être appliqué à des échantillons avec une grande quantité de biomasse et à une grande variété d’espèces.
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Pornaro, C., Macolino, S., Richardson, M. D. Measuring Stolons and Rhizomes of Turfgrasses Using a Digital Image Analysis System. J. Vis. Exp. (144), e58042, doi:10.3791/58042 (2019).
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