Identificeren van genetische componenten van necroptosis heeft vergemakkelijkt het gebruik van dierlijke modellen voor het testen van de implicaties van necroptosis in fysiologie en ziekte1,2,3,4,5. Knock-out van RIPK3 of MLKL in muizen had minimale implicatie in ontwikkeling en volwassene homeostase suggereert dat necroptosis is niet essentieel voor leven3,6. Sommige soorten bevatten bovendien geen RIPK3 of MLKL genen, ter ondersteuning van de niet-essentiële rol van necroptosis in dieren7,8. Aan de andere kant, is knock-out diermodellen uitdagend met diverse ziektebeelden geïnduceerd in het laboratorium gebleken dat een belangrijke rol van necroptosis in de ontsteking, aangeboren immuniteit en virale infectie9,10, 11 , 12.
Necroptosis kan op verschillende manieren worden geactiveerd door signalering door middel van verschillende aangeboren immuniteit sensoren, al die resulteren in de activering van RIPK31,13,14. Actieve RIPK3 op zijn beurt kinaseenzym en activeert MLKL3,4,5,6,7,8,9,10 ,11,12,13,14,15,16,17,18. De meest bestudeerde en wellicht de meest complexe manier, die leiden tot activering van RIPK3 gaat dood receptor afbinding, die bifurcates op basis van de stroomafwaartse samenstelling van de signalering complexen ofwel ertoe apoptosis of necroptosis1. Necroptosis ontstaat wanneer signalering via RIPK1 is favoriet en in de betrokkenheid van RIPK319,20 resulteert. Dit resultaat is gemakkelijk favoriet bij farmacologische remming of genetische schrapping van caspase 8, een vermeende endogene inhibitor van necroptosis die houdt van necroptosis in het bay. RIPK1 bindt aan en RIPK3 activeert. Een andere manier om te activeren necroptosis is door middel van Toll-like receptoren TLR3/TLR4 signalering, die zich bezighoudt en activeert RIPK3 via TIR-domein-bevattende adapter-inducerende interferon-β (TRIF)21. Nog is een andere manier om te sterven door necroptosis door activering van de DNA-sensor DAI, die direct bezighoudt en activeert RIPK322.
MLKL is een cytosolische eiwit bestaat uit een N-terminal helix bundel (NB)-domein en een C-terminal pseudokinase domein (psKD) door een regelgevende brace regio3met elkaar verbonden. In normale cellen, MLKL gevonden in het cytosol waar het wordt beschouwd als in een inactieve complex met RIPK314. Activering van necroptosis activeert fosforylering van de RIPK3 van MLKL in de lus van de activering van de psKD, en potentieel extra sites in de NB en brace3,15,23. Fosforylering induceert een conformationele verandering in MLKL waardoor de dissociatie van RIPK314. Slecht begrepen conformationele wijzigingen laat de brace uit de psKD24. De brace, die 2 helices bevat, bemiddelt oligomerisatie van MLKL in een vermeende trimeer via de C-terminal helix25. De helix van de N-terminal van de brace remt het domein NB, hetgeen essentieel om membraan permeabilization24,26 is. In isolatie is NB domein voldoende voor het opwekken van plasmamembraan permeabilization en necroptosis16,24,27. De activiteit van de pro-necroptotic voor NB was gereconstitueerd in muis embryonale fibroblasten tekort aan MLKL (mlkl- / - MEFs). NB is een lipide-bindend domein dat netcongestieproblemen de fosfolipide phosphatidylinositol 4,5 (III) difosfaat (PIP2 bezighoudt). Wij hebben voorgesteld een stapsgewijze mechanisme van activering van MLKL, waarin de brace oligomerisatie aanwerving van MLKL naar het plasmamembraan via zwakke interacties voor NB met de PIP2 polar hoofd groep24vergemakkelijkt. Op het membraan ondergaat de NB gereglementeerde blootstelling van een extra hoge-affiniteit bindende site voor PIP2, waarin wordt gemaskeerd door de brace in inactieve MLKL. Over het geheel genomen destabiliseren de meerdere interacties van NB met PIP2 het plasmamembraan leidt tot haar breuk, hoewel het moleculaire mechanisme van deze gebeurtenissen hebben niet is opgehelderd.
We illustreren hier specifieke methoden gebruikt voor het karakteriseren van de functie van MLKL als beul van necroptosis24. In het bijzonder richten we ons op de meest minimale domein van MLKL, de NB en brace (NBB), die wordt gereguleerd door remming van de brace en kan worden geactiveerd door middel van gedwongen dimerisatie ertoe plasmamembraan breuk en necroptosis. Wij beschrijven onze afleidbare expressie systeem gecombineerd met gedwongen drug-geïnduceerde FKBP-gemedieerde dimerisatie voor live-cel beeldvorming, en elektronenmicroscopie van cellen necroptosis ondergaan. Bovendien, illustreren we onze in vitro NMR-analyse van de interacties van de NBB met phosphatidylinositols (pitten).
Deze methoden kunnen helpen bij het beantwoorden van belangrijke vragen over de rol van de pseudokinase gemengd-lijn kinase-domein zoals MLKL in necroptose zoals membraantranslocatie en permeabilisatie bij lipidbinding. Het grote voordeel van deze technieken is dat ze MLKL direct impliceren als de uitvoerder van plasmamembraanruptuur in necroptose. Live-celbeeldvorming heeft het veld van celdoodonderzoek gerevolutioneerd, vooral voor MLKL-gemedieerde necroptose.
Kernspinresonantie is een krachtige techniek voor het bewaken van lipidbinding aan eiwitten zoals hier voor MLKL is aangetoond. Begin met het aanleggen van vijf keer 10 tot de vierde MLKL knockout muis embryonale fibroblasten of MEF's die het executordomein van MLKL expresseren, gefuseerd met een oligomerisatiecassette en Venus in één milliliter aangevuld DMEM in 24-well platen voor hun overnachtelijke incubatie in een celcultuurincubator. De volgende ochtend, behandel de cellen met doxycycline gedurende 12 uur om expressie van het transgen te induceren, gevolgd door de toevoeging van standaard DMEM aangevuld met FK506-bindend eiwit dimerisator en membraan-impermeable groene fluorescerende kleurstof om necroptose te inducere