다윈의 종의 기원1, 이후 과학자 들은 어떻게 특성 정의 된 환경 및 생태 압력, 동굴 생물2덕분에 진화론 모양에 대 한 깊은 통찰력을 얻고 있다. 멕시코 tetra, A. mexicanus, 강 멕시코와 남부 텍사스 살고 눈된 조상 '표면' 인구와 파생된 동굴 변경해 거주 시에라 델 Abra의 적어도 29 지리적으로 고립 된 인구 구성 및 북동 멕시코3의 다른 지역입니다. A. mexicanus, 바꾸 인된 산소 소비, depigmentation, 눈를 포함 하 여 그리고 유와 구하고 행동4,,56, 변경에 확인 된 동굴 관련 된 특성의 수 7,,89. A. mexicanus 선물 잘 정의 된 진화 역사, 생태 환경, 상세한 특성화 및의 존재로 인해 수렴 진화의 메커니즘을 독립적으로 조사를 위한 강력한 모델 진화 동굴 인구10,11. 많은 눈의 손실을 포함 한 cavefish에, 손실 자, 먹이, 훈련의 손실 증가, 침략, 및 스트레스 응답을 감소, 감소 독립 기원, 자주 활용을 통해 여러 번 진화 하는 동굴에서 파생 된 특성은 다른 유전 통로 사이 동굴8,12,13,,1415. 이 반복은 A. mexicanus 시스템의 강력한 측면 이다 진화와 비슷한 고기를 생성 하 어떻게 유전자 시스템의 보다 일반적인 질문에 대 한 통찰력을 불안정 수 있습니다 제공할 수 있습니다.

유전자 기능의 기계 조사에 대 한 유전자 기술의 응용 ( A. mexicanus를 포함 하 여) 많은 물고기 종에 제한 되어는 제 브라의 최근 발전 제공 기준 물고기에서 유전자 기술 개발 16,17,18,19,20. 수많은 도구는에서 널리 이용 되 zebrafish 유전자 발현, 조작 하 고 이러한 절차의 구현 표준화 오래 있다. 예를 들어 단일 셀 단계에서 morpholino oligos (MOs)의 주입은 선택적으로 RNA를 차단 하 고 개발21,22동안 간단한 임시 창에 대 한 번역을 방지. 또한, 유전자 편집 방법, 정기적으로 클러스터 된 같이 interspaced 짧은 구조 반복 (CRISPR) / CRISPR-관련 단백질 9 (Cas9) 및 녹음 방송 활성 제 같은 이펙터 nuclease (TALEN), 정의 된 삭제의 세대에 대 한 허용 또는, 경우에 따라 게놈19,20,,2324에서 재결합을 통해 삽입. Transgenesis 셀 형식을 특정 방식으로 안정적인 유전자 발현 또는 기능을 조작 하는 데 사용 됩니다. Tol2 시스템은 transposase coinjecting에 의해 유전자 변형 동물을 생성 하기 위해 효과적으로 사용 transgene25,26를 포함 하는 Tol2 DNA 플라스 미드와 mRNA. Tol2 시스템 생성 유전자 변형 construct17의 안정적인 생식 삽입 하 메 다카의 Tol2 transposase를 사용 합니다. Tol2 제 닉 생성 coinjecting Tol2 transposase17 Tol2 통합 사이트 및 mRNA에 의해 형벌 transgene를 포함 하는 플라스 미드 포함 됩니다. 이 시스템 zebrafish에 유전자 변형 라인의 배열을 생성 하는 데 사용 되었습니다 및 사용 시 클 리드, 송사리, stickleback를 포함 하 여 추가 긴급 모델 시스템을 최근 확장 했다 그리고, 최근에, 멕시코 cavefish27, 28,29,30.

cavefish 특성이 진화의 elucidating 메커니즘에 대 한 매혹적인 생물 학적 시스템은, 진화 모델로 서의 전체 능력은 하지 되었습니다 완전히 무력화. 이것은 부분적으로 유전자를 조작 하는 무 능력 때문 이었고 휴대 기능 직접31. 양적 특성 loci (QTL) 연구를 사용 하 여 복잡 한 특성을 조절 하는 후보 유전자 확인 되었습니다 하지만이 후보 유전자의 유효성 검사는 어려운32,33,34되었습니다. 최근, morpholinos, CRISPR 및 TALEN 시스템 및 Tol2를 사용 하 여를 사용 하 여 편집 하는 유전자를 사용 하 여 일시적인 최저-중재 transgenesis 유전으로 기본 특성35,36,37의 수를 조사 하는 데 사용 되었습니다 ,38. 구현 및 이러한 기술의 표준화의 생물 학적 특성, 유전자 기능, 정의 된 세포 인구의 라벨의 조작을 포함 한 분자 및 신경 토대를 심문 하는 조작에 대 한 수 고 식 기능 기자입니다. 반면 유전자 또는 세포 기능 하 유전 이러한 도구를 성공적으로 구현 응급 모델 시스템에서 입증 되었습니다, 상세한 프로토콜은 여전히 A. mexicanus부족.

A. mexicanus 변화 하는 환경에 대 한 응답에서 진화의 메커니즘에 대 한 중요 한 통찰력을 제공 하 고 다양 한 특성을 조절 하는 새로운 유전자를 식별 하는 기회. 요인의 수는 A. mexicanus 는 쉽게 큰 무리 크기는 실험실에서 물고기를 유지 하는 기능을 포함 하 여 설립된 유전자 모델에서 현재 사용할 수 있는 설립된 게놈 도구를 적용 하기 위한 매우 온순한 모델 제안 투명성, 시퀀스 된 게놈 및 정의 된 행동 분석39. 여기, 우리는 morpholinos, transgenesis, A. mexicanus의 표면 및 동굴 인구에서 유전자 편집의 사용에 대 한 방법론을 설명 합니다. A. mexicanus 에서 이러한 도구의 광범위 한 응용 프로그램의 발달, 생리, 및 행동 차이 cavefish 및 표면 물고기의 진화를 기본 분자 과정에 기계 조사에 대 한 수 있습니다.

동굴 동물은 다양한 형태학, 발달 및 행동 특성을 조사하기위한 강력한 시스템을 제공합니다. 그러나 이 모형 시스템을 설치하는 한계 요인의 한은 우리가 유전자 기능을 조작하는 것을 허용하는 유전 공구의 부족입니다. 여기에서 우리는 멕시코 동굴 물고기, Astyanax 멕시코에서 유전자 기능을 조작하는 세 가지 다른 접근 법을 보여줍니다.

이 공구는 표면 물고기와 동굴 물고기 사이 자연적인 변이의 근본적인 유전자의 조사를 가능하게 하고 표현형과 어떻게 관련되는지. 베다니 스탈, 내 실험실에서 재능있는 postdoc이 절차를 보여줍니다. 시술을 시작하기 전에, 물고기 시스템 물에 용해 된 따뜻한 3 %의 아가로즈로 100 밀리리터 페트리 접시를 채우고 조심스럽게 45도 각도로 아가로즈에 계란 사출 몰드를 넣고 곰팡이 아래에 공기를 포획하지 않도록 아가로즈로 천천히 낮추십시오.

아가로즈가 고화되면 금형을 조심스럽게 제거한 다음 최대 1주일 동안 섭씨 4도에 플레이트를 보관하십시오. 그런 다음 제조업체의 지침에 따라 보로실리케이트 유리 모세 혈관과 전극 바늘 풀러에서 바늘을 가져옵니다. 주사 당일, 유리 파이펫을 사용하여 단일 세포 계란을 주사 판으로 옮기고 행당 30~40개의 계란으로 최대 5열의 주사판을 채웁니다.

소량의 생선 계통물로 수분을 공급하는 계란을 유지하십시오. 얼음에 Morpholino를 해동하고 포몰리노의 400 picograms가 긴 마이크로 로더 파이펫 팁을 사용하거나 끝에 2 ~ 4 마이크로 리터 볼러스를 추가하여 계란 당 주입되도록 주입 솔루션을 준비합니다. 모든 바늘이 로드되었을 때, 집게를 사용하여 주사 바늘 끝에서 초과 길이를 손질하고 첫 번째 바늘을 피콜리터 마이크로 인젝터에 연결된 미세 조작기로 장착하십시오.

그런 다음, 분사 접시를 해부 현미경 아래에 놓고 마이크로 조작기를 사용하여 모폴리노 주입 용액 1 나노리터를 노른자에 직접 주입하기 전에 바늘로 각 계란을 관통합니다. CRISPR 주입의 경우, 가이드 RNA 25 피코그램을 CRISPR 관련 단백질 9 메신저 RNA의 300 피코그램과 혼합하고 생성된 RNA 용액의 2나노리터를 각 배아에 주입한다. Tol2 transposase 및 Tol2 측면 플라스미드 주사의 경우 Tol2 메신저 RNA의 마이크로리터 당 25 나노그램과 Tol2 플라스미드 구조의 마이크로리터 당 25 나노그램, RNase 가없는 물에 페놀 레드를 결합합니다.

그런