3 널리 사용 되는 응용 프로그램에 기능을 분자의 공간 분포 특성에 최적화 된 질량 분석 (IMS) 이미징: 조직 슬라이스, spheroids, 및 미생물 식민지1,2,3. 조직 조각 호스트, 타겟 또는 특정 대량 범위 내에서 타겟이 불분명 한 생물학 상황의 맥락에서 대사 산물의 지역화를 평가 하기 위해 사용할 수 있습니다. 그러나, 건강 한 조직 질병 상태, 예를 들어 종양에 비교 될 때 가장 중요 하 고 명백한 분자 기능 사이의 차이점은. 그러나 IMS 이렇게 질병 바이오 마커의 검출에 특히 적응은,, 질병의 진행 (예: 종양 등급)에 개별 단계에서 조직 샘플을 확보 하는 걸로의 개시에 대 한 중요 한 될 수 있는 신호 식별은 질병입니다. 공간을 통해 정보 교환 많은 생물 학적 시스템의 유비 쿼터 스 기능 이며 조직 조각이 동적 화학 릴레이 캡처할 수 없습니다. 화학 및 확산을 시각화 수 있는 1 개의 기술은 이다 한 천 배지;에 성장 하는 미생물 식민지의 IMS 작은 분자는 agar 전역을 통해 확산을 수 있으며 매트릭스 보조 레이저 탈 착 또는 이온화 (MALDI-TOF) 질량 분석4를 통해 캡처할 수 있습니다. 이 성장 설치 개별 생물 엔터티 (식민지) 간에 교환 하는 분자를 식별 하는 데 수 고 또한 대사 산물 생산의 방향성을 결정할 수 있습니다. 원래 미생물 식민지 성장을 위해 설계 된 플랫폼 적응 포유류 세포, 성장 조직 explants의 기본 신진 대사를 탐험 하 고 IMS는 생체 외에서 포유류 시스템에서 동적 화학 교환 평가 하는 데 사용 되었다.

지난 몇 년 동안, 그것은 분명 고급 액 난소 암 (HGSOC) 종종 나 팔 관 상피 (FTE)에서 유래 하 고 다음 초기 질병 개발5,6, 중 난소에 metastasizes 되고있다 7 , 8. tumorigenic FTE 확산 어디 결국 큰 종양 형성 및 전이 더, 난소 세포 이유 현재 명확 하지 않다. 이전 연구는 난소; 하 주 전이 난소 단백질의 역할에 집중 그러나, 그것은 최근 증명 되었습니다 tumorigenic 조직에 건강에서 전환 세포질 물질 대사의 대규모 장애 발생 및 작은 분자9,,1011의 생산을 변경. 따라서, 우리가 가설 작은 분자는 FTE 및 난소 사이 교환 분할 책임 있는 HGSOC의 주 전이 될 수 있습니다.

우리의 새로 개발된 된 IMS 절차를 사용 하 여, 우리 결정 coculture tumorigenic FTE 및 건강 한 난소 조직을 난소에서 norepinephrine의 생산을 유도 한다. 그러나, 다른 세포 유형 또는 정상적인 FTE 셀이이 효과 유도 하지 않았다. 이 방법의 특별 한 혜택은 분자 생산 및 실제 분자를 나타내는 신호를 교환 구상 될 수 있다, 그래서 심지어는 coculture에서는 신호의 소스를 확인할 수 있습니다. 이것이 무 균된 샘플의 분석에 이점을 모든 공간 정보가 손실 됩니다. 우리의 모델 시스템에서 명확 하 게 난소에 norepinephrine의 생산을 할당할 수 있었습니다. Norepinephrine 전이 및 chemoresistance 난소 암에 연결 되었습니다 및이 분자의 우리의 감지 소설 IMS 메서드 생물학 관련 분자12,13, 를 찾아낼 수 있습니다 확인 했다 14.이 유효성 검사 제안 하는 IMS의이 새로운 응용 프로그램 그룹을 coculture 환경에서 작은 분자를 식별 하 고 셀 변환에 영향을 주는 초기 이벤트를 이해 하는 것을 시도 하는 연구를 특히 도움이 될 수 있습니다 그리고 전이입니다. 이 방법의 전반적인 목표는 정체성과 조직 및 장기, 3D 세포 배양 체 외에서 또는 vivo 전 조직에 의해 표현 사이의 교환 동안 작은 분자의 공간적 분포를 명료 하 게.

우리의 프로토콜은 세포와 조직 사이 작은 분자 화학 통신을 지도할 수 있고, 우리는 난소암 전이에 있는 작은 분자를 탐구하기 위하여 이것을 구체적으로 적용했습니다. 우리의 기술의 주요 장점은 2D에서 세포와 조직의 공간 무결성을 유지하면서 레이블이없는 방식으로 작은 분자를 측정하는 능력입니다. 이 기술은 우리가 표적으로 하지 않은 방식으로 난소암 전이에 있는 작은 분자의 기여를 심문하는 것을 허용했습니다.

이것은 이전에 간과된 새로운 치료 표적 및 통로를 공개할 수 있었습니다. 이 방법론은 아가로즈에서 재배될 수 있는 그밖 암 및 공간 성분이 결과 세포 표현형에 중요할 지도 모르다 그밖 질병으로 쉽게 확장될 수 있었습니다. 모든 세포와 성분이 손에 있고 건조 공정에 대한 인내심이 이 프로토콜에 필수적입니다.

급하게 탈수 단계는 종종 품질이 좋지 않은 질량 분석 데이터로 이어질 수 있습니다. 이 방법의 시각적 데모는 이러한 agar에 조직 이나 미생물을 사용 하는 일반적인 이미징 질량 분광 실험에서 크게 탈피로, 우리의 샘플 준비 및 건조 단계를 이해에 도움이 됩니다. 시작하려면, 뜨거운 접시에 섭씨 70도에서 아가로즈를 액화.

ITO 처리 슬라이드 위에 8웰 디바이저를 놓습니다. 표준 트립신 치료를 통해 15밀리리터 원뿔관, 원심분리기에서 MOE 세포를 수집하고 150 마이크로리터당 50, 000 세포의 농도를 얻기 위해 DMEM 미디어를 1회 추가하여 최종 밀도의 2배에 달한다. 분할되지 않은 동문화의 경우, 집게를 사용하여 4개의 우물의 중앙에 난소 절박을 추가하십시오.

도금 직전에 200 마이크로리터의 세포 현탁액과 200 마이크로리터를 개별 2밀리리터 튜브에 결합합니다. 파이펫팅 중에 기포를 피하십시오. 즉시, 각 우물에 세포 아가로즈 혼합물의 300 마이크로 리터를 추가하고, 우물 사이에 누출또는 혼합을 보장하기 위해 분배에 연속 부드러운 하방 압력을 적용합니다.

기포가 없고 난소가 우물 중앙에 남아 있는지 확인하십시오. 파이펫 아가로즈가 난소를 방해하는 경우 파이펫 팁을 사용하여 아가로즈가 식기 전에 중앙에 부드럽게 사용하십시오. 그런 다음 가습 된 인큐베이터에서 섭씨 37도 및 이산화탄소 5 %에서 슬라이드를 배양하십시오.

분할 된 공동 문화의 경우 얇고 매끄러운 플라스틱에서 분리를 잘라냅니다. 멸균, 일회용 미디어 분지의 측면이 사용됩니다. 우물의 저혈압에 꼭 맞을 만큼 충분히 넓게 자른다.

ITO 처리 슬라