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Genetics

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Massenspektrometrie-basierte Proteomics Analysen mithilfe der OpenProt-Datenbank zu enthüllen neue Proteine übersetzt aus dem nicht-kanonischen Open Reading Frames
 
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Massenspektrometrie-basierte Proteomics Analysen mithilfe der OpenProt-Datenbank zu enthüllen neue Proteine übersetzt aus dem nicht-kanonischen Open Reading Frames

Article DOI: 10.3791/59589-v 07:38 min April 11th, 2019
April 11th, 2019

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OpenProt ist eine frei zugängliche Datenbank, die eine Polycistronic Modell der eukaryotic Genome erzwingt. Hier präsentieren wir ein Protokoll für die Verwendung von OpenProt Datenbanken bei der Massenspektrometrie Datasets zu verhören. Mit OpenProt kann Datenbank zur Auswertung von Proteomic Experimenten für Entdeckung von Roman und bisher nicht nachweisbar Proteinen.

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Genetik Ausgabe 146 OpenProt ORF alternative ORF AltORF alternative Protein AltProt Proteomik mass Spectrometry Übersetzung Protein-kodierenden Gens nicht-kodierende Gen pseudogene
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