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Biochemistry

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Modélisation de la structure quaternaire par spectrométrie de masse par réticulation chimique
 
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Modélisation de la structure quaternaire par spectrométrie de masse par réticulation chimique: extension des rapports TX-MS Jupyter

Article DOI: 10.3791/60311-v 05:18 min October 20th, 2021
October 20th, 2021

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La spectrométrie de masse à réticulation ciblée crée des modèles de structure protéique quaternaire à l’aide de données de spectrométrie de masse acquises à l’aide de jusqu’à trois protocoles d’acquisition différents. Lorsqu’ils sont exécutés en tant que flux de travail simplifié sur le serveur Web Cheetah-MS, les résultats sont signalés dans un bloc-notes Jupyter. Ici, nous démontrons les aspects techniques de la façon dont le Jupyter Notebook peut être étendu pour une analyse plus approfondie.

Tags

Biochimie numéro 176 interactions protéine-protéine interactions hôte-pathogène spectrométrie de masse de réticulation chimique amarrage des protéines modélisation de la structure des protéines Jupyter Notebooks
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