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Genetics

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JoVE Journal Genetics
分解されたFFPE-RNAサンプルのシーケンシングと分析の最適化
ACT1-CUP1 Assays Determine the Substrate-Specific Sensitivities of Spliceosomal Mutants in Budding Yeast
Journal (Genetics)
ACT1-CUP1 Assays Determine the Substrate-Specific Sensitivities of Spliceosomal Mutants in Budding Yeast
Separating Bacteria by Capsule Amount Using a Discontinuous Density Gradient
Journal (Genetics)
Separating Bacteria by Capsule Amount Using a Discontinuous Density Gradient
 
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分解されたFFPE-RNAサンプルのシーケンシングと分析の最適化

Article DOI: 10.3791/61060-v • 07:30 min • June 8th, 2020
June 8th, 2020 •
*1, *1,2, 1, 1, 1,2, 1
1NCI CCR Sequencing Facility, Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences, Frederick National Laboratory for Cancer Research
* These authors contributed equally

Chapters

Summary
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本手法はホルマリン固定パラフィン埋め込み(FFPE)RNAサンプルから得ることができる配列データの質と量を改善するステップを説明する。我々は、FFPE-RNAサンプルの品質をより正確に評価し、シーケンシングライブラリを準備し、FFPE-RNAサンプルからのデータを分析するための方法論を説明する。

Tags

遺伝学、問題160、RNAシーケンシング、ホルマリン固定パラフィン埋め込み、FFPE、次世代シーケンシング、NGS、RNA-seq分析
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