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JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics
Optimisation du séquençage et de l’analyse des échantillons d’ARN FFPE dégradés
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Optimisation du séquençage et de l’analyse des échantillons d’ARN FFPE dégradés

Article DOI: 10.3791/61060-v • 07:30 min • June 8th, 2020
June 8th, 2020 •
*1, *1,2, 1, 1, 1,2, 1
1NCI CCR Sequencing Facility, Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences, Frederick National Laboratory for Cancer Research
* These authors contributed equally

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Cette méthode décrit les étapes pour améliorer la qualité et la quantité de données de séquence qui peuvent être obtenues à partir d’échantillons d’ARN formalin-fixes paraffin-embedded (FFPE). Nous décrivons la méthodologie pour évaluer plus précisément la qualité des échantillons FFPE-ARN, préparer des bibliothèques de séquençage et analyser les données des échantillons FFPE-ARN.

Tags

Génétique Numéro 160 Séquençage de l’ARN paraffine formellement fixe intégré FFPE séquençage de la prochaine génération NGS analyse ARN-seq
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