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जीन नियमन को समझने के लिए जीनोम में प्रोटीन-बाध्यकारी स्थानों का सटीक निर्धारण महत्वपूर्ण है । यहां हम एक जीनोमिक मैपिंग विधि का वर्णन करते हैं जो एक्सोन्यूक्लियेज पाचन (सीआईपी-एक्सो) के साथ क्रोमेटिन-इम्यूनोप्रिपिशिटेटेड डीएनए का इलाज करता है और इसके बाद उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण होता है। यह विधि स्तनधारी न्यूरॉन्स में बेस-पेयर मैपिंग रिज़ॉल्यूशन और उच्च सिग्नल-टू-शोर अनुपात के साथ प्रोटीन-डीएनए इंटरैक्शन का पता लगाती है।
