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Genetics

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クロマチン免疫沈降-エキソヌクレアーゼ(ChIP-Exo)を用いたマウス幹細胞由来ニューロンにおけるタンパク質-DNA相互作用の高分解能マッピング
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クロマチン免疫沈降-エキソヌクレアーゼ(ChIP-Exo)を用いたマウス幹細胞由来ニューロンにおけるタンパク質-DNA相互作用の高分解能マッピング

Article DOI: 10.3791/61124-v • 08:40 min • August 14th, 2020
August 14th, 2020 •
1,2, 1,2
1Department of Cell and Systems Biology, University of Toronto, 2Department of Biology, University of Toronto

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ゲノム全体のタンパク質結合位置の正確な決定は、遺伝子調節を理解するために重要です。ここでは、クロマチン免疫沈降DNAをエキソヌクレアーゼ消化(ChIP-exo)に続けてハイスループットシーケンシングで処理するゲノムマッピング方法について説明します。この方法は、哺乳類ニューロンにおける近接塩基対マッピング分解能および高いシグナル対雑音比を用いてタンパク質とDNAの相互作用を検出する。

Tags

遺伝学 問題 162 ChIP-exo クロマチン免疫沈降 エキソヌクレアーゼ消化 タンパク質- DNA相互作用 転写因子 遺伝子調節 哺乳類ニューロン ゲノミクス エピジェネティクス
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