Högupplöst kartläggning av protein-DNA-interaktioner i musstamcellsbaserade nervceller med chromatinimmunprecipitation-exonukleas (ChIP-Exo)

Exakt bestämning av proteinbindande platser i genomet är viktigt för att förstå genreglering. Här beskriver vi en genomisk kartläggningsmetod som behandlar chromatin-immunoprecipitated DNA med exonuklease matsmältning (ChIP-exo) följt av hög genomströmning sekvensering. Denna metod detekterar protein-DNA interaktioner med nära bas-par mappning upplösning och hög signal-till-brus förhållandet i däggdjur nervceller.