Denne protokol beskriver en high-throughput clustered regelmæssigt interspaced short palindromic repeats (CRISPR) genredigeringsarbejdsgang til mikroRNA-klyngenetværksanalyse, der muliggør hurtig generering af et panel af genetisk modificerede cellelinjer, der bærer unikke miRNA-klyngemedlemssletningskombinationer så store som 35 kb inden for et enkelt eksperiment.