谷氨酰胺通量成像使用基因编码的传感器

Bioengineering

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Summary

本文将展示如何利用FRET监测谷氨酰胺动态活细胞。遗传编码的传感器允许生物分子的亚细胞分辨率的实时监控。实验设计,实验设置的技术细节,并考虑后期的实验分析将用于基因编码的谷氨酰胺的传感器进行讨论。

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Besnard, J., Okumoto, S. Glutamine Flux Imaging Using Genetically Encoded Sensors. J. Vis. Exp. (89), e51657, doi:10.3791/51657 (2014).

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Abstract

遗传编码的传感器允许生物分子的亚细胞分辨率的实时监控。一个巨大的品种,例如传感器,生物分子在过去15年中面世,其中一些成为了经常被用在许多实验室不可缺少的工具。

其中一个基因编码传感器的令人兴奋的应用之一是在调查细胞转运过程中使用这些传感器。转运如动力学和底物特异性的属性可以在细胞水平进行调查,为运输活动的细胞类型特异性分析的可能性。在这篇文章中,我们将演示如何转运动力学可以用基因编码的谷氨酰胺传感器为例进行观察。实验设计,实验设置的技术细节,和考虑后的实验分析将进行讨论。

Introduction

由于技术的显着进步,使考试的转录组和蛋白质组在细胞水平上的,它现在已经很清楚,生物化学和由此产生的通量代谢物和离子是高度细胞类型特异性。例如,在哺乳动物的肝脏,顺序谷氨酰胺降解和合成是同时进行由门静脉周围的细胞和静脉周围的细胞分别,同时消耗过量的氨在后者的1-3喂养铵到尿素循环在前者的细胞类型。在某些情况下,显著生化异质性被检测,即使在一个单一的“小区类型”4,5。除了 ​​这样的空间特异性,代谢物和离子的细胞水平是高度动态的( 例如,信号分子,如Ca 2 +,环 ​​核苷酸)。代谢物和离子的时空模式往往能起到关键作用的信号转导。 Monitoring代谢物和离子的细胞动力学,但是,提出了独特的挑战。在许多情况下,其浓度的变化是快速和短暂的,通过信号转导分子如Ca 2 +,内〜20毫秒的树突棘6,该衰变的情况举例说明。此外,内部和之间的细胞的生化途径的分隔使得难以用萃取和柱色谱/质谱技术定量代谢物和离子的动力学。

遗传编码的传感器,用于生物分子现在广泛由于高时空分辨率,允许实验者研究短命和/或隔离的分子动力学使用(7评论,8)。这些基因编码的传感器大致可以分为两大类;基于强度的传感器和ratiometic传感器。强度为基础的传感器通常由一个结合结构域和一个感orescent蛋白(FPS),以及溶质结合的结合结构域改变的荧光强度。 Ratiometic传感器,在另一方面,往往采取的促进共振能量转移(FRET)2的FP充当FRET对的优势。这些传感器包括一个结合结构域和两个FP的,与溶质结合诱导在2的FP之间的FRET效率的变化。大量的传感器,用于生物学上重要的代谢物和离子已被开发,在过去十年中8,9。

其中由该基因编码的传感器所提供的令人兴奋的可能性是他们在膜转运过程的高分辨率分析,这在以前是不容易察觉在细胞水平上的使用。遗传编码的传感器便利的运输机制,如底物特异性和pH依赖性10,11中的分析。此外,在同遗传水库组合OURCES如RNA干扰的库构建的模式生物,它现在可以进行全基​​因组搜索使用基因编码的传感器新颖的运输过程。事实上,利用基因编码的传感器导致的以前未知转运多例12,13的发现。

最近,我们实验室已经开发出一系列基于FRET的传感器谷氨酰胺。我们已经证明,细胞谷氨酰胺水平可以使用这样的FRET谷氨酰胺传感器10被可视化。这些传感器由在C-末端glnH的( 图1)一个FRET供体(mTFP1)插入到细菌谷氨酰胺结合蛋白glnH和FRET受体(金星)的。这些传感器中的FRET效率下降时的谷氨酰胺结合,导致受体/供体的强度比的降低。谷氨酰胺转运过程的精细调节是重要的生物过程,如neurotransmission 14,15和尿素循环的维持在肝脏1,16,17。

在这里,我们将展示分析运输活动与FRET传感器谷氨酰胺,使用宽场荧光显微镜下建立的方法。这里显示的实验的目的是检测在单个细胞中转运活动,并检查一个瞬时表达转运蛋白的底物特异性。

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Protocol

1,样品制备

注:在许多情况下灌注实验洗去细胞的显著部分,它可以成为一个令人沮丧的问题。虽然没有必要对所有的细胞系,涂层覆盖玻璃表面用聚-L-赖氨酸(添加0.01%的溶液1.0 ml/25厘米2的表面,孵育> 5分钟,用细胞培养级水洗涤两次,干燥生物安全柜)提高细胞的粘附。同时,要注意使用的细胞系的生物安全水平(BSL)的,并按照批准地方环境健康和安全办公室的标准作业程序。在该实验中,转染的COS7细胞用于由于低内源性谷氨酰胺转运活性(参见图4)。

  1. 种子COS7细胞在〜在Dulbecco改良的Eagle培养基(DMEM)70%-80%汇合度+10%宇宙的小牛血清和100 U / ml青霉素/链霉素,无论是在无菌25毫米盖玻片放置在6孔培养菜或8孔玻璃底的幻灯片。在37℃,5%CO 2,100%湿度下24小时。
  2. 更换生长培养基,以DMEM +10%宇宙的小牛血清(不含抗生素),根据制造商的方案。成长O / N在37℃,5%CO2,100%湿度。
  3. 将每个质粒DNA的0.4毫克编码谷氨酰胺传感器(染pcDNA3.1,携带FLIPQTV3.0传感器在CMV启动子10)和的mCherry标记ASCT2 10至50ml无血清培养基(OPTI-MEM),轻轻混匀。
  4. 加入1 ml转染试剂至50ml无血清培养基。在室温下孵育5分钟。
  5. 混合含有DNA(步骤1.3)和转染试剂(步骤1.4)的两种溶液并孵育20分钟。
  6. 轻轻地加在细胞上的顶端的转染试剂和由摆动腔轻轻混匀。孵育24小时后,在37℃,5%CO 2,100%湿度。
  7. 24小时后,更换培养基,以DMEM +10%宇宙小牛血清(CCS)+ 100单位青霉素/链霉素。
  8. 细胞成像48-72小时后转染。

2,灌注实验

注意:对于在该实验中使用COS7细胞,灌注介质和腔室保持在室温和环境CO 2浓度。然而,如果正在使用的电池需要较高的温度和CO 2浓度控制为生存,加热的显微镜载物台和/或环境室应该被使用。

  1. 准备灌注缓冲自动对焦(见材料清单)。附加旋塞至50ml注射器,关闭旋塞然后填写与灌注液。打开水龙头一个短暂的时期,以填补与缓冲活塞的头部空间。
  2. 切换的8通道,重力进料灌注系统与灌注铅笔,然后选择在选择功能选项“手动模式”。放置一个废物容器下的灌注铅笔。
  3. 手动通过按下相应的数字激活的端口,用10 ml注射器含有水补油管,然后关闭该端口。一旦端口被装满了水,设置包含缓冲区自动对焦灌注系统的端口1-6的注射器,然后打开旋塞。再次打开的端口,以取代水与缓冲管。流速应为约0.8毫升/分钟。
  4. 按取消一次灌注控制器返回到“选择功能”菜单。切换到“编辑程序”选项,然后在灌注协议表1所示。保存的灌注程序。
  5. 取出来的细胞培养箱中。与灌注缓冲液洗两次,然后将细胞在舞台上。灌注系统连接到室内。如果一个开放室使用,另设泵,去除室内的灌注液。
  6. 打开Slidebook软件。开始一个新的幻灯片。
    注意:下面的过程是特定于Slidebook软件,但其他软件如MetaFluor和萨 - 要素也可用于此处所述的成像的类型。理论上实验可以使用允许时间 - 过程成像任何软件来执行,并且图像序列可以被分析后的实验使用软件如ImageJ的(http://rsbweb.nih.gov/ij/)或斐济(呻/ fiji.sc /斐济)。然而,软件,允许的受体/供体比实时监测是非常有用的。
  7. 安装滑道到荧光显微镜阶段。发现细胞共表达的传感器和ASCT-mCherry的使用适当的过滤器集(请参阅材料清单)下的“聚焦”功能。通过点击“相机”选项卡和“收益”项下滑动滑动条调节增益。此外,从调节中性密度滤镜下拉菜单中的中性密度滤镜设置。注意:如果过滤器多维数据集不包括眼滤镜,不要用眼睛片,因为肖尔的T波长的激发光对眼睛有害。使用电脑屏幕找到细胞来代替。
  8. 获得的细胞图像with donor ( mTFP1) ex donor(mTFP1) em , donor ( mTFP1) ex acceptor(venus) em and acceptor ( mTFP1) ex acceptor(venus) em m channels (过滤器在材料列表中指定)。单击“图像捕捉”,然后在采集窗口,指定将要使用的过滤器。点击“测试”按钮,通过在框中键入所需的曝光时间旁边的过滤器设置来调整曝光时间。注:所有三个通道需要被暴露于相同的长度。当调节摄像参数,取预期的FRET效率的变化和折叠增加考虑:例如,如果预期的FRET效率在实验过程中向上去2倍,摄像参数应调整从而使供体的前接受器在静息状态下的强度应<可被仪器记录在最大值的50%,从而使信道不会成为在实验过程中达到饱和。从标记细胞信号应至少比背景区域高3倍。
  9. 使用该软件区域工具绘制一个地区的利益。可替换地,软件功能来选择上述一定强度的像素都可以使用,然后转换成的区域。要执行此操作,请单击面膜 - 分部,然后移动滑动条来突出显示所需的区域。
  10. 选择在拍摄类型框中的“时间流逝”,然后指定时间间隔(10秒在这个实验)和实验时间点。
  11. 在一个区域画出一个区域,没有任何荧光细胞。这个区域是用于背景减法。用鼠标右键单击绘制的区域,然后将其设置为背景。注意:在理想情况下,细胞是不吨表达该传感器应作为背景区域占两者的自体荧光和照相机所检测到的背景荧光。如果没有这样的细胞可在视场中,至少在没有细胞的区域应该被用来解释背景荧光。
  12. 选项​​ - 在“运行程序选择功能”选择所需的程序。切换到保存的程序(见步骤2.3),然后打的灌注控制器上的ENTER键。现在,这个程序被加载,并且击中任何键将开始灌注。
  13. 确保灌注和成像实验开始的同时按一下在同一时间按下灌注控制器上的按键,在拍摄窗口中的“开始”按钮。
    注:建议记录那里的解决方案进行了交流(这可以通过使用“票据”功能,采集选项卡中找到来完成)的时间点。
  14. 执行相同的灌注协议USI纳克细胞表达,预计将是饱和的或者未结合的实验条件下的传感器。
    注意:在这里,FLIPQTV3.0_1.5μ,这是在实验条件下饱和的,被用作对照, 图6这样的对照实验是必要的,以确认该FRET效率的变化是由于在基板上的实际变化,而 ​​不是。由于在其它参数,如细胞内pH的变化。

3,后期实验分析

  1. 检查如果在实验过程中发生样品漂移。绘制感兴趣区域(ROI)区域S在0时间点拍摄的图像上,然后移动在成像窗口顶部的滑动杆,并检查电池掉出的ROI在后来的实验中拍摄的图像。
  2. 如果是的话,那么使用跟踪功能来校正漂移,首先,在细胞周围建立口罩通过选择面膜 - 分类,然后将它指定截止到HIG行hlight区域含有细胞。追踪区域单击面膜 - 粒子跟踪 - 基本粒子跟踪。
  3. 必要时重新绘制的ROI和背景区域。
  4. 导出的感兴趣区的平均强度比实验的过程。点击统计 - 出口 - 比/慢速拍摄数据。
  5. 当底物浓度的FRET效率和量化是没有必要的,画出作为基材的动态代理的强度比( 供体接受器 ,/供体的前施主 )的时间过程。以确定细胞内浓度,计算出的最大和最小的比率变化( 即,在所述基板的饱和和不存在,分别),ΔR 最大 - ΔR 分钟 ,由Δratio(ΔR)与下面的等式的非线性回归:
    ΔR= [S] /(K D + [S])×(ΔR 分钟 )+△ 分钟
    其中[S]是底物浓度在胞质溶胶中。使用ΔR 最大 -传感器得到ΔR 最小值 ,饱和度(S)在给定的ΔR被计算为
    S =(ΔR - ΔR 分钟 )/(ΔR 最大 - ΔR 分钟
    S可进一步被转化成使用以下等式的底物浓度[S]:
    S = [S] /(K D + [S])
    注: 接受器受体EM信道的强度应同时绘制研究实验条件是否影响受体的直接荧光。
  6. 当基线漂移由于光漂白观察,进行基线校正。要做到这一点,画出供体和受体随着时间的强度( 图5A)。然后确定用于日的时间点ë基线,根据在灌注系统中的延迟和特定的细胞( 图5B)的转运活性。
  7. 计算多项式拟合最能说明基线。然后,归一化的原始强度从每个时间点与基线( 图5C)。从标准化的供体和受体的强度计算强度比( 捐赠受体他们,/捐赠者捐赠者除外EM)。

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Representative Results

典型时程实验示于图2,在这些实验中,FRET谷氨酰胺传感器为8毫米(FLIPQTV3.0_8m, 图2A2B)和100μM(FlipQTV3.0_100μC和D)的亲和性被共表达以强制性氨基酸器ASCT2 18 COS7细胞10。谷氨酰胺流入被检测作为给体(mTFP1)和受体(金星)( 图2A2C)之间的荧光强度比的变化。谷氨酰胺在另一衬底(丙氨酸)的存在下的流出也清楚地表明在这些实验中。用两个传感器,归一化的荧光强度变化可往复运动( 即,供体强度上升作为受体强度下降, 如图2B2D)在底物的存在,这表明所观察到的比率变化确实是由于吨o在荧光共振能量转移效率的变化。这些实验表明,谷氨酰胺的浓度在这些细胞中的波动非常动态的实验条件下;从100μM的传感器的检测范围内的近饱和浓度为8毫米的传感器。

转运蛋白的底物特异性,也可以使用传感器,在图3中展示了检验。在这些实验中的细胞预装载有谷氨酰胺,然后各种氨基酸加入到细胞外灌注液,以检查这些氨基酸是否能诱导谷氨酰胺流出。正如预期的那样,ASCT2基板(丙氨酸,丝氨酸,半胱氨酸,苏氨酸,D-丝氨酸)诱导谷氨酰胺流出( 图3A),而非基底氨基酸(Pro中,组氨酸,赖氨酸)没有( 图3B),证实与以往的研究18。通常,底物特异性是由竞争测定法使用具有竞争性底物混合,放射性同位素标记的底物测得,这是相当费力的,需要的细胞群被均匀地表达转运进行研究。光学成像在这里体现提供了一种替代方法。

当没有FRET效率的变化都在加入底物观察到的,有几个原因可以考虑。一个可能的原因是低吸收能力被测试的底物和/或保持在细胞内的浓度酶的高活性。例如,谷氨酰胺浓度的变化是最小的在COS7细胞中不进行测试的条件下表达ASCT2转运体,即使该细胞系可以清楚地生长在媒体,其中谷氨酰胺在主要氮源( 图4)。此外,如果传感器的亲和力过高或过低相比,细胞内的浓度,大多数传感器蛋白质仍将组成性结合或未结合分别;因此没有FRET效率的变化将是detected。

图1
图1:配置一个FRET谷氨酰胺传感器(A)开(青色)和关闭glnH(黄色)构象,谷氨酰胺大肠杆菌结合蛋白。其中mTFP1插入的位置被标记为洋红色。FLIPQTV_3.0传感器(二)示意图。

图2
图2:使用FLIPQ-TV3.0_8m和100μ传感器在体内谷氨酰胺测量。 (一)COS7细胞的venus/mTFP1比例共表达FLIPQ-TV3.0_8m传感器和ASCT2-mCherry的。的mCherry标记用于鉴定表达所述传输的细胞呃不干扰的mTFP1或金星发射通道。将细胞灌注HEPES缓冲的Hank氏缓冲液(pH 7.35)。当细胞外谷氨酰胺(红色)和丙氨酸(蓝色)加入到灌注介质的时间点被表示为方块图所示。实线和虚线代表在同一实验中测得两个单独的电池(B)供体(mTFP1)和受体(金星)通道中(A)所示的实验的强度。的值进行校正为光漂白和归一化到基线(C)(D)一个类似的实验中(A)和(B)中,用表达FLIPQ-TV3.0_100μ传感器COS7细胞中进行。 (图10修改)。

图3
图3。消除细胞谷氨酰胺吨hrough中的外部氨基酸存在下的ASCT2转运体,可视化使用FLIPQ-TV3.0_8m传感器。 (A)的胞质谷氨酰胺通过加入外丙氨酸,丝氨酸,半胱氨酸,苏氨酸和D-丝氨酸的出口。当细胞外谷氨酸(红色框)或其它氨基酸(蓝色框)被添加到媒体灌注时间点都显示为方块图形上方。(b)增加临,赖氨酸,他(黑盒)不会改变细胞内谷氨酰胺浓度,而另外丙氨酸(蓝色框)的促进谷氨酰胺的出口。实线和虚线代表在同一​​实验中测得两个单独的电池。所有氨基酸均在5 mm外部浓度添加。 (图最初发表于10)。

图4
图4。COS7细胞venus/mTFP1比expressing FLIPQ-TV3.0_8m传感器(A)和100μ传感器(B)将该细胞灌流HEPES缓冲的Hank氏缓冲液中。当细胞外谷氨酰胺(5毫摩尔)加入到灌注介质的时间点被表示为红色方块图所示。实线和虚线代表在同一​​实验中测得两个单独的电池。

图5
图5。校正为光漂白(A)图2A图2C所示的两个单元上游强度(B)被选择为计算基准那个数据点。多项式拟合曲线如图所示。(C)强度在A中所示的渠道,规范化的反对B.计算基准本图中所使用的数据集是IDEntical到图2A图2C所示。

图6
图6。使用FLIPQ-TV3.0_1.5m传感器在体内谷氨酰胺的测量(A)转染的COS7细胞的venus/mTFP1比共表达FLIPQ-TV3.0_1.5m传感器和ASCT2-mCherry的。的mCherry标记用于鉴定表达本转运无干扰的mTFP1或金星发射通道的细胞。将细胞灌注HEPES缓冲的Hank氏缓冲液(pH 7.35)。当细胞外谷氨酰胺(红色)和丙氨酸(蓝色)加入到灌注介质的时间点被表示为方块图所示。实线和虚线代表在同一实验中测得两个单独的电池(B)供体的强度(mTFP1)和受体(金星)频道在(A)所示的实验。的值进行校正为光漂白和归一化到基线。

时间(min) 溶液A 溶液B 溶液C 溶液D 溶液E 溶液F
0 阀门上
2 阀门关闭阀门上
4 阀门上阀门关闭
6 阀门关闭阀门上
8 阀门上阀门关闭 10 阀门关闭阀门上
12 阀门上阀门关闭
14 阀门关闭阀门上
16 阀门上阀门关闭
18 阀门关闭阀门上
20 阀门上阀门关闭
22 阀门关闭阀门上
24 阀门上阀门关闭 26 阀门关闭阀门上
28 阀门上阀门关闭
30 阀门关闭阀门上
32 阀门上阀门关闭
34 阀门关闭

表1实施例在本实验中所用溶液A的灌注协议:9.7克HANK盐(H1387),0.35克的NaHCO 3,5.96克HEPES至1升pH调至7.35,用NaOH 溶液B:溶液A + 0.04毫谷氨酰胺溶液C:。溶液A + 0.2毫米谷氨酰胺SOLUT离子D:解决方案A + 1毫米谷氨酰胺解决方案E:解决方案A + 5毫米谷氨酰胺溶液F:解决方案A + 5毫米阿拉巴马州

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Discussion

成像实验的成功取决于几个关键因素。其中一个因素是传感器的使用,如上面所讨论的亲和力。在感兴趣的亚细胞区室中衬底的绝对浓度,但是,常常是未知的。因此,我们建议您尝试多种传感器与交错的亲和力,以找到一个所需的实验条件下效果最好。例如,在我们的情况下,我们转染的COS7细胞中谷氨酰胺传感器,1.5μ,100μ,2分,和8米( 图3和数据未显示)。

另一个重要因素是传感器的蛋白质的表达水平。需要用于检测表达水平之间,实验而变化,例如,当一个短暂的事件( 例如,单个动作电位)需要被观察到的更高的表达水平可能成为必要19。因此,在大多数情况下,所要求的电平必须是empiricallŸ确定。如果目标存在于非常低的浓度在细胞中,由于目标耗竭内源性处理的扰动可以成为一个问题20。一个独立的检测,以评估这种可能性,如果可用,因此需要。在这篇文章中所示的实验中,由CMV启动子驱动的表达被认为是足够的。在情况下的启动子具有弱得多的活动需要使用时,调整以增加信号强度可能变得必要。例如,在曝光期间的信号强度和光致漂白之间折衷需要达到。除了较长的曝光时间,可以改变因素,如荧光团的亮度,传感器,分块的最大强度的变化,和CCD摄像机的灵敏度,以提高信号的强度。

当没有比变化在实验条件下观察到即使上述两个条件都可能得到满足,这是可能的,对于给定的代谢物或离子的细胞体内平衡是足够强的以掩盖转运活性(参见结果部分)。在这种情况下,细胞系具有不同的生化活性,可能需要作为背景来检测转运活动10,21。

虽然这些传感器允许一个监控底物浓度动力​​学在更高的时空分辨率比提取为基础的方法,测定绝对浓度需要进一步的实验步骤和注意事项。通常,底物浓度,计算时假设传感器的亲和力,通常是通过滴定纯化的蛋白质传感器计算出的,当在细胞中表达是不变的。浓度是使用以下单一结合等温线计算的,

[S] = K x(R - R 分钟 )/(R </ em>的最大值 - R)

[S]是底物浓度,K d是解离常数在体外测定中,r是在给定时间点所观察到的受体/供体比,R最小值是受主/施主时比传感器是在载脂蛋白形式r 最大是受主/施主时,比所有传感器被绑定到衬底上。R 最小 r 最大值由参数如传感器的浓度,所使用的成像设置,蜂窝milleu的组合物,并且因此需要在原位被测定的影响确定R 最小 r 最大值 ,实验条件,使细胞内底物浓度的修改成为必要。例如,有选择性的离子载体( 例如,离子霉素的Ca 2 +),22或穿孔试剂如二gitonin 23可用于平衡细胞内底物浓度与外部浓度。

其中一个在实验中该协议体现了类型的限制是低吞吐量;该分析是在细胞中的相对小的(<10)的数量分析一种代谢物的限制。技术的进步正在作出,但是,为了克服这种局限性。例如,用在自动化,高含量筛选的进步,现在可以在组合与小分子或RNAi文库用遗传编码的传感器;细胞中表达的生物传感器可以在高通量的格式( 例如,96 -或384 -孔)中生长,然后单独的孔可以与任何的siRNA或化学品处理和成像。这样的实验允许识别,破坏,可以由生物传感器24 25观察到的生物学过程的siRNA构建体或化学品。另一个令人兴奋的最新进展包裹体DES时间分辨微流体流式细胞仪,它允许高通量检测的荧光共振能量转移效率的变化在细胞水平上26的发展。这样的技术进步将有助于新的候选药物和生物过程的新组件的发现。

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Disclosures

没有什么可以透露。

Acknowledgements

这项工作是由美国国立卫生研究院授予1R21NS064412,NSF资助1052048和Jeffress纪念信托基金资助的J-908的支持。

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Inverted fluorescent microscope Olympus IX81F-3-5 An equivalent inverted fluorescent microscope from other suppliers would also be appropriate.
Excitation filter (mTFP1) Omega Optical 3RD450-460 Band width 450-460 nm
Excitation filter (Venus) Chroma ET500/20 Band width 490-510 nm
Emission filter (mTFP1) Chroma HQ495/30m Band width 475-505 nm
Emission filter (Venus) Chroma ET535/30m Band width 520-550 nm
Dichroic mirror (FRET channels) Chroma 470dcxr Long pass, 470 nm cut off
Dichroic mirror (YFP channel) Chroma 89002bs Passes 445-490 nm, 510-560 nm, 590-680 nm
mCherry filter set Chroma 49008 Excitation 540-580 nm, long pass dichroic with 585 nm cut off, emission filter 595-695 nm
Light source Olympus U-LH100L-3-5 LED- or halogen light source that produces stable light intensity, mercury lamps are not recommended
CCD camera Qimaging Rolera-MGi EMCCD
Apochromatic fluorescence objective Olympus
Perfusion system, ValveBank II AutoMate Scientific [01-08] Other perfusion systems that allow fast solution exchange would also work
Laminar-flow chambers C&L Instruments VC-MPC-TW Other larminar-flow chambers would also work.
Chambered slide Lab-Tek 154534 For open-chamber experiments
Perfusion pump Thermo Scientific 74-046-12131 For open-chamber experiments
Software supporting ratiometric measurements Intellegenent Imaging Innovation Slidebook 5.5
Laminar flow biosafety cabinet ESCO LA-3A2
Isotemp CO2 Incubator Thermo Scientific 13-255-25
Dulbecco's MEM (DMEM) Hyclone SH30243.01
Cosmic calf serum Hyclone SH3008703
Penicillin/streptomycin Hyclone SV30010
Serum-free medium for transfection (OPTI-MEM I) Invitrogen 31985 Used with Lipofectamine 2000
Poly-L-Lysine solution Sigma P4707
25 mm circular glass cover slips Thermo Scientific 12-545-102 In case VC-MPC-TW is used
Lipofectamine 2000 Invitrogen 11668027 Other transfection reagents can also be used.
Solution A (Hank's buffer) 9.7 g HANK salt (Sigma H1387), 0.35 g NaHCO3, 5.96 g HEPES to 1 L, pH adjusted to 7.35 with NaOH
Solution B Solution A + 0.04 mM Gln
Solution C Solution A + 0.2 mM Gln
Solution D Solution A + 1 mM Gln
Solution E Solution A + 5 mM Gln
Solution F Solution A + 5 mM Ala

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References

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