فسيفساء اسماك الزرد Transgenesis لتحليل الجينوم الوظيفي للجينات التعاونية المرشح لورم إمراض

Developmental Biology
 

Cite this Article

Copy Citation | Download Citations

Ung, C. Y., Guo, F., Zhang, X., Zhu, Z., Zhu, S. Mosaic Zebrafish Transgenesis for Functional Genomic Analysis of Candidate Cooperative Genes in Tumor Pathogenesis. J. Vis. Exp. (97), e52567, doi:10.3791/52567 (2015).

Please note that all translations are automatically generated.

Click here for the english version. For other languages click here.

Abstract

Introduction

السرطان هي أمراض التقدمية والتي تمثلت في تراكم الطفرات المرضية والحذف ومكاسب الكروموسوم مع مرور الوقت. ويمكن لهذه التشوهات الجينية تؤثر على العمليات الخلوية متعددة بدءا من دورة الخلية، موت الخلايا، والتمثيل الغذائي حيوية وتجميع الهيكل الخلوي للتأكيد الردود مثل نقص الأكسجة. وبالتالي، تكون الأورام يعكس الإجراءات الجماعية من الانحرافات الجينية المتعددة عبر مجموعة متنوعة من العمليات البيولوجية. وقد حددت الجهود الأخيرة التكاملية بحوث الجينوم، بما في ذلك كله تسلسل الجينوم، exome التسلسل، والتسلسل المستهدف، تسلسل عميق والدراسات رابطة الجينوم على نطاق، فإن عددا متزايدا من تغيرات جينية جديدة في الأساس جميع أنواع الأورام 1-4. في كثير من الحالات، تحدث الآفات الوراثية معا بطريقة غير عشوائية 5-8، مما يشير إلى تعاونهما في إمراض المرض. تشريح الأدوار أنكجنيك من مجموعة كبيرة من الجينات وأعرب aberrantly الناتجة وROM هذه الآفات الجينومية هو ضروري لوضع استراتيجيات علاجية جديدة وفهم استجابات الخلايا السرطانية لهذه العوامل، ولكن ثبت أن يكون مهمة شاقة، تتطلب أنظمة نموذج حيواني قوية للغاية لإجراء الإنتاجية العالية التحليل الجيني وظيفية في الجسم الحي.

وعلى الرغم من الثدييات، وخاصة القوارض، هي نماذج المفضلة في بيولوجيا السرطان، بدأت الزرد لجذب اهتماما كبيرا. وقد استخدم الزرد مكتملة العظام (داريو rerio) كما كائن نموذج لدراسة التنمية منذ 1960s و تم تطبيق أول لدراسة الورم المرضية في عام 1982 9-11. سهولة الصيانة، وحجم الجسم صغيرا، وخصوبة عالية تجعل من الزرد نموذج قوي للشاشات الوراثية إلى الأمام على نطاق واسع لتحديد الطفرات التي تمنح الظواهر الشاذة والمرضية 10. الشفافية البصرية من الأجنة الزرد هي سمة رئيسية أخرى دعم التوسع في استخدام هذا النموذج السرطان، كماأنه يسمح في مجال التصوير فيفو التي ستجرى لتحديد موقع الورم تنمية في الوقت الحقيقي أحد التطبيقات التي يصعب نسبيا في القوارض 12. كشفت مؤخرا تحليل الجينوم النسبية للجينوم إشارة الزرد (Zv9) 26206 الجينات المكودة للبروتين، مع 71٪ ذات orthologues الإنسان، والتي ترتبط 82٪ مع الجينات المرتبطة بالمرض في الميراث المندلية اون لاين في مان (OMIM) قاعدة بيانات 13، 14. ونتيجة لذلك، تم استخدام الزرد لنموذج مختلف أنواع السرطانات البشرية، بما في ذلك العصبية T-خلية سرطان الدم الليمفاوي الحاد (T-ALL) 15،16، 17،18 سرطان الجلد، ساركومة يوينغ 19، 20،21 العضلية المخططة، وسرطان البنكرياس 22، سرطان الكبد 23 و النخاعي الأورام الخبيثة 24،25، وقد تم اختيار كنموذج السرطان لزرع الأعضاء يدرس 11،26.

والمعدلة وراثيا مستقرةويستخدم النهج في الزرد عادة لدراسة تأثير مكسب من وظيفة الجينات في التطور الطبيعي أو المرضية المرض 27،28. لتطوير مثل هذا النموذج (الشكل 1A)، واحد يضخ بناء الحمض النووي الذي يحتوي على الجينات في المصالح يقودها المروج الأنسجة محددة في خلية واحدة من النوع البري الأجنة. بعد ثلاثة إلى أربعة أشهر الحقن، وعندما تصل الأجنة حقن النضج الجنسي، وoutcrossed أنهم مع من النوع البري الأسماك للكشف عن تلك التي تبين تكامل DNA بناء في سلالة الجرثومية، والتي ترخص لهم من الأسماك مؤسس. هناك العديد من العوامل، مثل عدد النسخ والموقع التكامل من التحوير، تؤثر تعبير عن التحوير في خطوط المعدلة وراثيا مستقرة. وهكذا، لتطوير نموذج الورم المعدلة وراثيا، متعددة خطوط المعدلة وراثيا مستقرة overexpressing على الجين الورمي واحد يجب أن تكون ولدت أولا وفرزهم للخط التعبير عن التحوير على المستوى قد يؤدي إلى ورم الاستقراء. ومع ذلك، إذا overexpression من وس المرشحncogene غير سامة للخلايا الجرثومية، فإنه من الصعب لتوليد خط المعدلة وراثيا مستقر من قبل overexpressing مباشرة التحوير 29. وبالتالي، يمكن أن يكون هذا النهج تستغرق وقتا طويلا، مع ارتفاع مخاطر الفشل في توليد نموذج سرطان مناسب.

هنا، نحن لتوضيح استراتيجية بديلة تقوم على transgenesis عابرة الفسيفساء (الشكل 1B) التي توفر مزايا فريدة على transgenesis مستقر التقليدي للدراسة الجينوم وظيفية في الجسم الحي. في هذا النهج، يتم حقن واحد أو أكثر من يبني التحوير في مرحلة خلية واحدة من المعدلة وراثيا أو من النوع البري الأجنة. يبني DNA حقن تحتوي على الجينات المحورة ثم يتم دمجها mosaically وبشكل عشوائي في الأسماك حقن الأولية، مما أدى إلى الأنماط الجينية مختلطة داخل السكان الخلية متعددة في الأسماك الفردية 30. وعلاوة على ذلك، coinjection من DNA متعددة يبني في الأجنة خلية واحدة يؤدي إلى التكامل المشترك في نفس الخلية في مواقع عشوائية، مما يسمح احد لهيئة تنظيم الاتصالاتCE الخلايا مع التعبير عن الجينات المحورة واستكشاف التفاعلات بين الجينات المختلفة خلال المرضية المرض في الحيوانات الفسيفساء 31. وكدليل على المبدأ، ونحن overexpressed عابر ALK تنشيط mutationally (F1174L) مع mCherry مراسل الجينات في الجهاز العصبي الودي المحيطي (PSNS) تحت سيطرة هيدروكسيلاز الدوبامين بيتا (د βh) المروج في البرية من نوع السمك والأسماك المعدلة وراثيا overexpressing MYCN. ALK، الذي يشفر مستقبلات التيروزين كيناز، هو الجين المتحور الأكثر تواترا في العصبية عالية المخاطر 5-7،32،33. ALK (F1174L)، باعتبارها واحدة من الطفرات الجسدية تفعيل الأكثر شيوعا وقوية، غير ممثلة تمثيلا زائدا في MYCN- تضخيم المرضى العصبية عالية المخاطر والتآزر مع MYCN overexpression لتسريع العصبية تكون الأورام في كل من الفئران المعدلة وراثيا مستقرة ونماذج الزرد المعدلة وراثيا 8،34،35. بواسطة فسيفساءoverexpression عابر ALK (F1174L) مع mCherry في الأسماك المعدلة وراثيا MYCN، ونحن لخص تسارع ظهور الورم لوحظ في الأسماك المعدلة وراثيا مستقرة overexpressing كلا ALK (F1174L) وMYCN، مما يشير إلى أن الاستراتيجية transgenesis الفسيفساء يمكن استخدامها لبسرعة وكفاءة تقييم المساهمات النسبية من الجينات المسرطنة متعددة في بدء الورم في الجسم الحي.

Protocol

ملاحظة: جميع الدراسات الزرد وصيانة الحيوانات تم القيام به في اتفاق مع وافق IACUC-معهد مايو كلينيك بروتوكول # A41213.

1. التركيبات DNA لTransgenesis

  1. تضخيم 5.2 كيلوبايت الدوبامين بيتا هيدروكسيلاز (د βh) منطقة المروج 8 باستخدام استنساخ CH211-270H11 BAC (من مركز الموارد BACPAC (BPRC)) كنموذج DNA. استخدام نظام الاقتضاء PCR لفترة طويلة ودقيقة التضخيم PCR من قوالب DNA طويلة والبرامج دورة التالية لPCR: 94 ° C لمدة 2 دقيقة و 10 دورات (94 ° C، 15 ثانية، 50 ° C، 30 ثانية، 68 ° C، 8 دقيقة)، تليها 30 دورات (94 ° C، 15 ثانية، 53 ° C، 30 ثانية، 68 ° C، 8 دقيقة)، 68 ° C، 4 دقيقة (التمهيدي إلى الأمام 5'-GGGGACAACTTTGTATAGAAAAGTTGGCGTACTCCCCCTTTTTAGG-3 " والتمهيدي العكسي 5'- GGGGACTGCTTTTTTGTACAAACTTGTGTTGCTTTGTCGTCTTTTGA-3 ').
  2. إنشاء د βh -pDONRP4-P1R دخول اومهشمال شرق 8 باستخدام نظام تجاري الاستنساخ المؤتلف مثل بوابة متعددة المواقع. مزيج 1 ميكرولتر من dβh تنقيته PCR المنتج (172 نانوغرام / ميكرولتر)، 1 ميكرولتر (150 نانوغرام / ميكرولتر) pDONRP4-P1R ناقلات المانحة (جنبا إلى جنب مع ناقلات بوابة أخرى هي هدايا سخية من الدكتور تشي بن شين، جامعة. يوتا) و 4 ميكرولتر من TE العازلة (درجة الحموضة 8.0) مع 2 ميكرولتر من BP انزيم clonase المزيج، احتضان لمدة 1 ساعة على 25 درجة مئوية ومن ثم تحول إلى طلقة واحدة TOP10 المختصة E. القولونية وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة.
  3. توليد د βh: المعدلة وراثيا EGFP-MYCN بناء من 8 باستخدام نظام الاستنساخ المؤتلف المذكورة في الخطوة 1.2. مزيج 1 ميكرولتر من كل استنساخ الدخول (150 نانوغرام / ميكرولتر) بما في ذلك 5.2 كيلو بايت dβh المروج (dβh -pDONR P4-P1R بناء)، EGFP تفتقر إلى رامزة توقف (PME-EGFP بناء)، والبشرية MYCN كدنا] (هدية سخية من الدكتور Hogarty في مستشفى الأطفال في ولاية بنسلفانيا، MYCN-pDONRP2R-P3 بناء)، 1 ميكرولتر (150 نانوغرام / ميكرولتر) من متجه جهة المعدلة تحتوي على مواقع الاعتراف I-SCEI (هدية سخية من الدكتور C. غرابر Grabher، معهد كارلسروه للتكنولوجيا، كارلسروه، ألمانيا)، 4 ميكرولتر من TE العازلة ( درجة الحموضة 8.0) مع 2 ميكرولتر من LR Clonase انزيم المزيج، احتضان لمدة 1 ساعة على 25 درجة مئوية ومن ثم تحول إلى المختص كيميائيا E. القولونية مثل طلقة واحدة أعلى 10 واتبع بروتوكول الشركة المصنعة.
  4. جعل MITF: المعدلة وراثيا MITF بناء من 8 من هضم ناقلات PNP-MITF مع NOTI وسالي أنزيمات التقييد لمدة 2 ساعة عند RT، واستنساخ فرعي صدر 2.65 كيلو بايت (هدية سخية من الدكتور D. Raible، جامعة واشنطن). جزء DNA الذي يحتوي على المروج MITF وتسلسل ترميز الجين MITF الزرد في مواقع NOTI وMluI من متجه pBluescript المعدلة تحتوي على المرافقة المواقع الاعتراف I-SCEI (هدية سخية من الدكتور هوى الحديدنانوغرام، جامعة بوسطن)، وذلك باستخدام T4 DNA يغاز وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة.
    ملاحظة: لزيادة كفاءة توليد MYCN -expressing خطوط مستقرة، د βh: EGFP-MYCN وMITF: يتم coinjected يبني DNA MITF في خلية واحدة الأجنة مرحلة الصدف الصدف يعين نوع من الأسماك متحولة تفتقر إلى العصبية قمة تستمد- للخلايا الميلانية خلال تطوير 36. وهكذا، وظهور الخلايا الصبغية في الأجنة حقن يوحي دمج MITF: DNA MITF يبني في الجينوم. وقد ثبت أن اثنين أو ثلاثة يبني DNA coinjected يمكن cointegrated في الجينوم الأسماك 31. وهكذا، يمكن أن تصبغ الناجمة عن التعبير MITF بمثابة علامة للتكامل dβh: التحوير EGFP-MYCN، ولتحديد أسهل من MYCN خط المعدلة وراثيا مستقر.
  5. خلط د βh: EGFP-MYCN وMITF: DNA MITFيبني في 3: نسبة 1 في إجمالي حجم رد فعل 15 ميكرولتر مع 1 ميكرولتر من I-SCEI الإنزيم و 0.75 ميكرولتر من العازلة. تأكد من أن المبلغ الإجمالي من الحمض النووي في رد فعل لا يتجاوز 750 نانوغرام.
  6. تنفيذ عملية الهضم I-SCEI في RT لمدة 4 ساعة أو O / N. في اليوم الثاني، هضم I-SceI- السلطات الوطنية المعينة على استعداد ل microinjection أو يمكن تخزينها في -20 ° C للحقن في المستقبل. تخزين الإنزيم I-SCEI في -80 درجة مئوية في مأخوذة صغيرة للحفاظ على كفاءة إنزيم لها.
  7. Subclone في ALKF1174L البشرية والبرية من نوع ALK الجينات من متجه PCDNA3 (هدية سخية من الدكتور جورج في معهد دانا فاربر للسرطان) 7 في EcoRI وNOTI مواقع متجه pENTRY1A (هدية سخية من الدكتور C. غرابر Grabher، معهد كارلسروه للتكنولوجيا، كارلسروه، ألمانيا) باستخدام يغاز DNA T4 وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة.
  8. توليد د βh: ALKF1174L </ م> أو dβh: يبني المعدلة وراثيا ALKWT باستخدام نظام المؤتلف كما هو مذكور في بروتوكول 1.2. لفترة وجيزة، والجمع بين ثلاثة استنساخ الدخول، dβh -pDONRP4-P1R، ALKF1174L- pENTRY1A (أو ALKWT -pENTRY1A) وP3E-بوليا، في ناقلات جهة المعدلة تحتوي على مواقع الاعتراف I-SCEI (هدية سخية من الدكتور C. غرابر Grabher، كارلسروه معهد التكنولوجيا، كارلسروه، ألمانيا)، وذلك باستخدام LR Clonase انزيم ميكس، وفقا لبروتوكول الشركة الصانعة.
  9. خلط د βh: ALKF1174L (أو dβh: ALKWT) وdβh: mCherry DNA يبني في 3: 1 نسبة وخطي لهم I-SCEI انزيم كما هو موضح في بروتوكول 1،5-1،6.

2. حقن مكروي

  1. استخدام بال micropipettes الزجاج مع 1.0 مم لجميع الحقن 37. قطع غيض من بال micropipettes الزجاج بشفرة حلاقة قبل الحقن. معايرة حجم الحقن عن طريق حقنH 2 O جي إلى قطرة من الزيوت المعدنية. قياس قطرها من قطرات الناتجة عنها، وضبط microinjector (الضغط أو مدة ضغط النبض) للتأكد من أن حجم الحقن هو أقل من 10٪ من حجم الخلية الكلي للواحد الأجنة مرحلة الخلية.
  2. إضافة 0.5 ميكرولتر إضافية من جديد I-SCEI انزيم (5 وحدة / ميكرولتر) في 5 ميكرولتر من محلول الحقن التي تحتوي على الحمض النووي يبني الحق قبل حقن لزيادة كفاءة transgenesis 38. حقن 50-80 خريج من يبني DNA خطي في سيتوبلازم الخلية واحد الأجنة المرحلة. لضمان نجاح الحقن، وخلط العينة مع 0.25٪ الفينول الأحمر للالتصور. إذا خلايا تتحول حمراء بعد الحقن، وهذا يشير الى وحقن مكروي الناجحة. لضمان نسبة نجاح عالية لتوليد الأسماك المعدلة وراثيا، ونحن عادة حقن ما يصل الى 500 الأجنة.
  3. لتوليد الأسماك المعدلة وراثيا معربا عن ستابلي MYCN، coinject على خطي د βh: EGFP-MYCN وMITF: يبني DNA MITF (في 3: نسبة 1) في أجنة من تصبغ متحولة الصدف الزرد في مرحلة خلية واحدة. التعبير عن MITF بمثابة مراسل لإدماج بنيات المعدلة وراثيا في الجينوم الأسماك.
  4. لoverexpression فسيفساء من ALK في البرية من نوع أو MYCN الأجنة وراثيا، وشارك في حقن خطي د βh: ALK F1174L (أو dβh: ALKWT) مع dβh: mCherry DNA يبني (في 3: نسبة 1) في خلية واحدة الأجنة الناتجة عن تربية من F1 متخالف تيراغرام (dβh: EGFP-MYCN) الأسماك المعدلة وراثيا مع البرية من نوع AB الأسماك. وهكذا، فإن نصف النسل هم المعدلة وراثيا لMCYN ونصف هي من النوع البري.

3. الشاشة لمستقر أو الفسيفساء المعدلة وراثيا السمك

  1. لزيادة كفاءة تحديد MYCN -expressing خطوط مستقرة، تخدير الأجنة الصدف حقن في المقام الأول مع تريكين (0.02٪) لتي أيام 3-5 من postfertilization والشاشة لتصبغ. نقل الأجنة مع تصبغ إلى طبق بتري جديد مع المياه العذبة البيض ورفعها إلى مرحلة النضج الجنسي لمزيد من الفحص للأسماك مؤسس، والتي تحمل د βh: التحوير EGFP-MYCN في الخلايا الجرثومية.
  2. للتعرف على مؤسس مع انتقال سلالة الجرثومية من EGFP-MYCN، تهجين المصطبغة الأسماك F0 الكبار مع البرية من نوع AB الأسماك والشاشة لأجنة-EGFP إيجابية في 1-2 أيام بعد الإخصاب لمزيد من التنميط الجيني. ضع-EGFP إيجابي واحد F1 الجنين في أنبوب PCR، وإزالة جميع السائل. إضافة 50 ميكرولتر من gDNA استخراج العازلة التي تحتوي على 12.5 ميكرولتر من 4X العازلة تحلل، 35 ميكرولتر H 2 O و 2.5 ميكرولتر بروتين K (10 ملغ / مل) إلى الجنين واحد. احتضان رد فعل لمدة 2-3 ساعة عند 55 ° C، تليها 10 دقيقة من الحضانة في 98ºC لإبطال نشاط بروتين K. لجعل 50 مل من 4X تحلل العازلة، إضافة 500 ميكرولتر من 1M تريس (الرقم الهيدروجيني 8.4)، و 2.5 مل من 1M بوكل رس 47 مل من H 2 O. ملاحظة: بعد تربى F0 MYCN الأسماك المعدلة وراثيا مستقرة مع البرية من نوع AB الأسماك، كل من نسل هي المصطبغة. وبالتالي، وتصبغ لا يمكن أن تكون علامة لتحديد من الأسماك إيجابية MYCN-. بينما في الأسماك المعدلة وراثيا MYCN، يتم التعبير عن بروتين الانصهار EGFP MYCN في PSNS، بما في ذلك الخلايا العصبية متعاطفة من العقد عنق الرحم متفوقة ومتتابعة العقدة قطعي من سلسلة متعاطفة وPSNS غير الخلايا العصبية الدوبامين، مثل النخاع المستطيل و العقد الجمجمة 8. وهكذا، والتعبير عن EGFP يمكن أن تكون بمثابة علامة للحصول على التعرف على MYCN الأجنة وراثيا مستقرة.
  3. استخدام 2 ميكرولتر من gDNA المستخرجة من جنين F1 المصطبغة كقالب، الاشعال MYCN -test F1: 5'-CTG CTT GAG AAC GAG CTG TG-3 '؛ MYCN -R3: 5'-AGG CAT CGT TTG AGG ATC AG-3 '، وخفة دم البرنامج التاليح GC-RICH نظام PCR: 1 دورة من 95 درجة مئوية لمدة 3 دقائق، 25 دورات من 95 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، 58 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، و 72 درجة مئوية لمدة 3 دقائق. نحن عادة التركيب الوراثي 14-16 الأجنة المصطبغة من التزاوج واحد لتأكيد وجود متكاملة التحوير MYCN في الأجنة المصطبغة، تم تحديد أكثر من 6 مؤسس الأسماك overexpressing MYCN MITF وبواسطة هذه الطريقة.
  4. رفع ما تبقى من الأجنة F1-EGFP إيجابي. كليب الزعانف وراثى لهم في 2-3 أشهر من العمر باستخدام بروتوكول أعلاه لمزيد من تأكيد تكامل MYCN التحوير في الأسماك. تولد F1 MYCN الأسماك المعدلة وراثيا مستقرة مع البرية من نوع AB الأسماك. شارك في حقن خطي د βh: ALK F1174L (أو dβh: ALKWT) مع dβh: mCherry DNA يبني في الأجنة خلية واحدة كما هو موضح في بروتوكول 2.4.
  5. فرز MYCN -expressing الأجنة في التجربة وصفها في بروتوكول 2.4 باستخدام فلوري مجسمةالمجهر escence وفحص الأجنة المحقونة في المقام الأول إلى أيام 1-3 من postfertilization للتعبير عن EGFP-MYCN في PSNS. ثم، خلال الأيام 2-5 من postfertilization، تخدير الأجنة مع تريكين (0.02٪) وفرز تلك الأجنة MYCN- إيجابية أو سلبية مرة أخرى على أساس التعبير عن mCherry في PSNS باستخدام مجهر مضان مجسمة. التعبير عن mCherry بمثابة علامة للcoexpression من ALK في أنسجة الحيوانات فسيفساء الابتدائي حقن.
    ملاحظة: ~ 600 ذرية الناتجة عن تربية الأسماك المعدلة وراثيا MYCN مستقرة مع من النوع البري الأسماك تم حقن كل مجموعة مع يبني DNA خطي، بما في ذلك د βh: ALK F1174L وdβh: mCherry، dβh: ALKWT وdβh: mCherry، أو dβh : mCherry وحدها، على التوالي. ويمكن ملاحظة التعبير فسيفساء من mCherry في 70-90٪ من الأسماك حقن في المقام الأول. نصف واحد الى واحدة-ثلث السمك حقن نجا من خلال مرحلة اليرقات لمراقبة الورم.
  6. رفع كل من mCherry + + MYCN وmCherry + MYCN - الأجنة وفقا للبروتوكولات القياسية من الكتاب الزرد 39 ورصد ظهور الورم تبدأ في 5 أسابيع postfertilization.

4. ورم ووتش في الفسيفساء المعدلة وراثيا السمك

  1. مراقبة mCherry- الإيجابية الأسماك حقن في المقام الأول كل 2 أسابيع ابتداء من الساعة 5 أسابيع postfertilization عن أدلة على ظهور الورم.
  2. تخدير الأسماك مع تريكين (0.02٪)، وشاشة لوجود mCherry - وEGFP -expressing الأورام في PSNS تحت نيكون SMZ-1500 مضان المجهر مجسمة مجهزة مشهد كاميرا رقمية DS-U1.
  3. لتأكيد ما إذا كانت الأورام يعبرون عن التحوير ALK، عزل mCherry- والجماهير-EGFP إيجابي لALK التنميط الجيني PCR.
  4. باستخدام PCR، تضخيم الحمض النووي الجينيالمستخرجة من الأورام المتقدمة مع الاشعال التالية: ALK P7: 5'-AGG CCA GGT GTC CGG AAT GC-3 "وALK P18: 5'-TGT CTT CAG GCT GAT GTT GC-3" ورد فعل PCR التالية: 1 دورة من 94 درجة مئوية لمدة 5 دقائق، 30 دورات (94 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، 55 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، و 72 درجة مئوية لمدة 60 ثانية). ثم، وتسلسل المنتج PCR مع ALK P7 التمهيدي لزيادة تأكيد وجود متحولة أو البرية من نوع ALK في الأورام mCherry إيجابية.

Representative Results

للتحقيق في ما إذا كانت overexpression من تنشيط mutationally F1174L ALK أو من النوع البري ALK أن تتعاون مع MYCN في الحث العصبية، ونحن overexpressed إما تنشيط ALK البشري أو من النوع البري ALK البشري تحت سيطرة المروج د βh في PSNS من الأسماك المعدلة وراثيا overexpressing MYCN. تم coinjected ALKWT، مع dβh - - إما من بنيات التالية، dβh - ALKF1174L أو dβh mCherry في خلية واحدة من النوع البري أو MYCN الأجنة وراثيا (الشكل 2A) 8. التعبير عن mCherry بمثابة علامة للcoexpression من ALK في أنسجة الحيوانات فسيفساء الابتدائي حقن. ومثلت كل من التراكيب الوراثية المتوقع في الأسماك حقن: (1) MYCN -expressing السمك مع coexpression فسيفساء من تنشيط ALKF1174L وmCherry MYCN -expressing السمك مع coexpression فسيفساء من النوع البري ALK وmCherry، MYCN المعينة؛ فسيفساء ALKWT. (3) MYCN -expressing السمك مع التعبير فسيفساء من mCherry، المعين MYCN، فسيفساء mCherry. (4) من النوع البري السمك مع coexpression فسيفساء من تنشيط ALKF1174L وmCherry، WT المعينة؛ فسيفساء ALKmut. و (5) البرية من نوع السمك مع coexpression فسيفساء من النوع البري ALK وmCherry، المعين WT، فسيفساء ALKWT. ثم أجري ساعة ورم كل 2 أسابيع من 5 أسابيع postfertilization (WPF) على ما مجموعه 492 الحيوانات المحقونة.

نشأت ثمانية GFP + / + mCherry أورام في الغدة البين، والغدة الكظرية ما يعادل الغدة البشري، بنسبة 9 برنامج الأغذية العالمي في MYCN -expressing الأسماك coinjected مع د βh - ALKF1174 L وdβh - mCherry (الأرقام 2B و 3). وكانت هذه الأورام histologically، immunohistochemically، وقابلة للمقارنة ultrastructurally إلى العصبية البشرية (بيانات يمكن العثور عليها في إشارة 8). على النقيض من ذلك، لم يلاحظ أي أورام بنسبة 9 أسابيع من العمر في MYCN -expressing الأسماك coinjected مع dβh - ALKWT وdβh - mCherry (أرقام 2C و ص = 0.002) أو حقن مع dβh - mCherry وحدها (الأرقام 2D و P = 0.007). نشأت الأورام في كل من MYCN، فسيفساء ALKWT وMYCN، والأسماك فسيفساء mCherry بنفس معدل تحريض بعد 12 أسابيع من العمر. وبالإضافة إلى ذلك، تم لم يتم الكشف عن neuroblastomas في أي نوع من الأسماك من النوع البري coinjected مع إما من النوع البري ALK وmCherry أو ALKF1174L وmCherry الجينات المحورة خلال 15 أسابيع من الرصد. أخذت معا، وتظهر هذه النتائج أن overexpression فسيفساء من تنشيط mutationally ALK يسرع MYCN الورم يسببها سnset، بغض النظر عن الموقع التكامل في الحيوانات الفسيفساء الفردية، والتي overexpression من النوع البري ALK على الصعيدين مدفوعا المروج dβh لا يبدو أن التعاون مع MYCN overexpression للحث على العصبية في هذا النظام النموذجي.

الشكل (1)
الشكل 1: مخطط تخطيطي مستقرة التقليدي والاستراتيجيات الزرد عابرة الفسيفساء المعدلة وراثيا في دراسة الاشتراكات التعاونية من الجينات المسببة المرشح لتكون الأورام (A) استراتيجية المعدلة وراثيا مستقرة. يتم حقن خطي المعدلة وراثيا بناء DNA التي تحتوي على الجين الورمي مرشح في مرحلة خلية واحدة من النوع البري أو الصدف الأجنة الزرد متحولة حيث يمكن أن تكون متكاملة التحوير في الجينوم الأسماك في مواضع الجيني العشوائي. مطلوب التكامل من التحوير في الخلايا الجرثومية لgeneratioن من خط المعدلة وراثيا مستقر. الأجنة المحقونة في المقام الأول تستغرق 3 إلى 4 أشهر لتصل إلى مرحلة النضج الجنسي (الجيل F0 من الأسماك)، والتي سيتم outcrossed مع من النوع البري أو الأسماك متحولة الصدف للكشف عن الأسماك مؤسس مع انتقال التحوير الجرثومية. ذرية الناتجة من الأسماك مؤسس، يطلق الجيل F1، تحمل أليلات متخالف من التحوير في الجينوم الخاصة بهم. لتقييم آثار التعاونية اثنين من الجينات المسرطنة مرشح، مثل الجين "أ" وجين "ب"، في تكون الأورام، ونحن ولدت ذرية F1 اثنين من خطوط المعدلة وراثيا مستقرة overexpressing هذه الجينات المحورة، مع سوى ربع ذرية تحمل الجينات المحورة المجمع. ونظرا للكفاءة منخفضة نسبيا لتوليد خطوط المعدلة وراثيا مستقرة، وهذا النهج ليس ممكنا بالنسبة الإنتاجية العالية التحليلات الجينومية الوظيفية. (B) فسيفساء الاستراتيجية المعدلة وراثيا عابرة. على غرار transgenesis مستقرة، خطي المعدلة وراثيا DNA التعاون nstructs تحتوي على جينات مرشح يمكن حقنه في مرحلة خلية واحدة من النوع البري الأجنة. لأنه ليس لدى التحوير لتكون متكاملة في جينوم الخلايا الجرثومية، الكثير من الوقت والجهد يمكن إنقاذه في عملية تحديد الأسماك مؤسس. بدلا من ذلك، إذا كان خط الأسماك المعدلة وراثيا overexpressing واحدة من الجينات المسرطنة المرشح يتوفر (في حالتنا، وقد وضعت MYCN الأسماك المعدلة وراثيا)، يبني DNA المعدلة وراثيا الخطي تحتوي على جينات مرشحة أخرى يمكن حقنه في خلايا الأجنة مرحلة واحدة المعدلة وراثيا لدراسة التعاون في تكون الأورام. ما يصل إلى ثلاثة بنيات التحوير يمكن coinjected وcoexpressed في الأسماك حقن في المقام الأول 31؛ وبالتالي، فإن التفاعل بين الجينات المسرطنة مرشح في تكون الأورام يمكن تقييم في الأسماك حقن في المقام الأول. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.

"SRC =" / الملفات / ftp_upload / 52567 / 52567fig2.jpg "/>
الشكل 2: فسيفساء التعبير عن المنشط ALK يسرع بداية ظهور MYCN يسببها العصبية 8 معدلة الرقم بإذن من السيفير (المرجع 3466510609819). (A) نهج لبناء transgenesis الفسيفساء. (BF) اليرقات البالغة من العمر 2 يوما من الأجنة المحقونة في المقام الأول. إطلالة جانبية مستقر التعبير EGFP في الخلايا العصبية الدوبامين، بما في ذلك العقد الجمجمة (CG، النصال) في الصور ومضان brightfield المدمجة (لوحات العليا). إطلالة جانبية على الفسيفساء التعبير mCherry (لوحات أقل) في العقد الجمجمة (CG، النصال)، النخاع المستطيل (MO، السهام). لوحظ بعض التعبير mCherry خارج الرحم في غير PSNS والخلايا العصبية غير الدوبامين. (G - K) الأسماك حقن في المقام الأول البالغ من العمر 7 أسابيع.(B، G) MYCN -expressing الأسماك coinjected مع د βh - ALKF1174L وdβh - mCherry يبني (MYCN، فسيفساء ALKmut). EGFP - وmCherry الأورام -positive نشأ في 7 أسابيع (الأسهم فارغة بيضاء في G). (C، H) MYCN -expressing الأسماك coinjected مع dβh - ALKWT وdβh - mCherry يبني (MYCN، فسيفساء ALKWT). (D، I) MYCN -expressing الأسماك حقن مع dβh - mCherry بناء وحدها (MYCN، فسيفساء mCherry). (E، J) من نوع البرية (WT) الأسماك coinjected مع dβh - ALKF1174L وdβh - mCherry يبني (WT، فسيفساء ALKmut). (F، K) من نوع البرية (WT) الأسماك coinjected مع dβh - ALKWT وdβh - mCherيبني راي (WT، فسيفساء ALKWT). لم تراع Neuroblastomas في MYCN -expressing الأسماك coinjected مع dβh-ALKWT وdβh - mCherry أو dβh - mCherry وحدها في 7 برنامج الأغذية العالمي، أو في أي من الأشقاء التي لم ترث التحوير MYCN وحقنوا إما الجين ALKWT أو الجين ALKF1174L. على نطاق والحانات، و 100 ميكرومتر في B - F و 1 مم في G - K. تم استخدام المجهر مضان مجسمة نيكون SMZ-1500 مجهزة مشهد كاميرا رقمية DS-U1 ومضان المجهر مجسمة لايكا MZ10F مجهزة بكاميرا رقمية لايكا DFC 345FX لالتقاط images.The الفلورسنت المكتسبة ومعالجة الصور وتجميعها مع أدوبي فوتوشوب والمصور CS3 (أدوبي) والبرمجيات. الرجاء أنقر هنا لمشاهدة نسخة أكبرمن هذا الرقم.

الشكل (3)
الشكل (3): بداية من العصبية في MYCN المعدلة وراثيا السمك أو الأنواع البرية من نوع (WT) السمك كما الفسيفساء Coinjected مع التركيبات DNA. أعيد طبعها بإذن من السيفير (المرجع 3466510609819) د βh - ALKF1174 L وdβh - mCherry (فسيفساء ALKmut)؛ dβh - ALKWT وdβh - mCherry (ALKWT الفسيفساء)؛ أو dβh - mCherry (فسيفساء mCherry) وحدها (8). الفرق بين ظهور الورم بنسبة 9 برنامج الأغذية العالمي في MYCN -expressing الأسماك coinjected مع dβh - ALKF1174 L وdβh - mCherr ص (MYCN، فسيفساء ALKmut) وأنه في خط MYCN coinjected مع dβh - ALKWT وdβh - mCherry (MYCN، فسيفساء ALKWT) أو dβh - mCherry وحدها (MYCN، فسيفساء mCherry) هو جوهري في ص = 0.002 و p = 0.007، على التوالي، من قبل اثنين من الذيل اختبار فيشر الدقيق.

Discussion

في هذه الدراسة التمثيلية، كنا coinjection عابرة وcoexpression من ALK تفعيلها مع مراسل الجينات mCherry في MYCN -expressing الأسماك المعدلة وراثيا لإظهار أن هذه الجينات تتعاون لتسريع ملحوظ بداية العصبية، بما يتفق مع النتائج السابقة لدينا في مجمع مستقرة coexpressing الأسماك المعدلة وراثيا كلا تنشيط ALK وMYCN 8. هذا النهج المعدلة وراثيا الفسيفساء تمتلك عدة مزايا واضحة على الطريقة التقليدية. الأهم من ذلك، أنها تمكن الفحص السريع للآثار coexpressing المسرطنة مرشح في الحيوانات المحقونة في المقام الأول (الجيل F0) دون الحاجة لحيوانات معدلة وراثيا مستقرة، مثل القضاء على الوقت المفرط والعمل تشارك عادة في تربية وتحديد ALK -expressing مستقر الأسماك المعدلة وراثيا. كما درسنا تأثير overexpression من النوع البري ALK، مع أو بدون MYCN علىالتعبير، على بدء الورم. وتظهر النتائج أن overexpression عابرة من النوع البري ALK في نموذج الأسماك لدينا لا يكفي لبدء العصبية تكون الأورام، بغض النظر عن حالة من الجين الورمي MYCN. وسيكون من المثير للاهتمام أن اختبار في المستقبل سواء coexpression عابرة لكل من ALK تنشيط وMYCN في الأسماك من النوع البري يمكن أن تحفز ظهور سابق من تكون الأورام في الأسماك حقن في المقام الأول. ان هذه الدراسة تحاكي أكثر بأمانة سياق المرض الفعلي، والذي التعديلات الجسدية لكل من الجينات المشارك تحدث في مجموعة فرعية من المرضى العصبية عالية المخاطر 5.

عنصر التصميم هاما من استراتيجية المعدلة وراثيا عابرة الفسيفساء هو إدراج الجين مراسل coinjection مع أي مرشح الجينات المسرطنة من الفائدة، والذي يساعد في الكشف عن الحيوانات مع الاندماج الناجح من الجينات المحورة بين الأجنة الزرد حقنه في المقام الأول ورصد الأسماك إيجابية ل tumoبداية r و التقدم. لزيادة كفاءة transgenesis، وقد طبقنا النهج المعدلة وراثيا بوساطة ميجانيوكلياز إنترون فطريات الخميرة، مما يزيد بشكل كبير من المروج التي تعتمد على التعبير موحد من الجينات المحورة من 26٪ من الأجنة المحقونة في المقام الأول دون meganuclease إلى 76٪ من الأجنة المحقونة مع meganuclease 38 . على الرغم من أن استخدام نهج المعدلة وراثيا I-SCEI بوساطة meganuclease تحسنت كفاءة transgenesis بشكل ملحوظ، نسبة الأجنة حقن إيجابيا لالجينات المحورة لا يزال أقل بكثير من 100٪. وهكذا، فإن التعبير عن الجينات مراسل coinjected يمكن أن تكون بمثابة علامة لتحديد الأجنة المحقونة مع الاندماج الناجح من الجينات المحورة مرشح قبل المزيد من مراقبة الأسماك لظهور الأورام. في المقابل، أصبح نهجا المعدلة وراثيا Tol2 بوساطة ينقول أداة الوراثية شعبية في الفقاريات نموذج واستخدمت بنجاح لtransgenesis، الطفرات إقحامي، فخ الجينبينغ، ومحسن محاصرة 40،41. Coinjection من الترانسبوزونات Tol2 مع ترانسبوزاز مرنا في الأجنة المخصبة يمكن أن تسهل أحداث التكامل المبكرة التي تزيد من كفاءة التكامل الكروموسومات ويقوي نجاح انتقال سلالة الجرثومية من التحوير 42. ولكن نظرا لآلية "قص ولصق" من تبديل DNA، تم دمج نسخة واحدة من التحوير في كروموسوم في موضع الإدراج 42. وهكذا، الجينات المرشحة coinjected على الأرجح متكاملة بشكل فردي في الجينوم الأسماك في مواقع مختلفة، والتي يمكن أن تؤدي إلى التعبير عن الجينات المرشحة في خلايا مختلفة ونمط التعبير عابرة والفسيفساء أكثر تعقيدا من الجينات coinjected في الأسماك حقن في المقام الأول.

وبشكل عام، تدعم الدراسة الحالية الاستخدام المستقبلي لtransgenesis الفسيفساء كوسيلة سريعة لتقييم تعاونية، وربما التآزر، والعلاقات بين الجينات المسرطنة متعددة في ال عالالطريقة roughput، وهو تحد صعب للاجتماع مع النماذج الحيوانية الأخرى، بما فيها القوارض. وحتى الآن، كما تم تطبيق هذه الاستراتيجية بنجاح في الزرد المعدلة وراثيا لتحديد الجينات التي تقمع تنشيط RAS بدء يسببها من العضلية المخططة 31 و تعديل حساسية للإشعاع من الخلايا T-الناجم عن MYC سرطان الدم الليمفاوي الحاد 31. وعلاوة على ذلك، Langenau وآخرون، أظهرت 15 أن الجمع بين نهج coinjection مع نهج حرارة صدمة محرض المعدلة وراثيا يمكن أن تحدث التحوير التعبير من خلال الصدمة الحرارية في الأسماك حقن في المقام الأول، والتي سيكون من المفيد جدا في استكشاف الأدوار التعاونية من الجينات المسرطنة في الورم التقدم، إذ أنه يسمح التعبير الجيني ليتم تشغيله بعد تأسيس الورم الرئيسي. قريب جدا، وضعت Langenau وزملاؤه أول نموذج الزرد المناعة من خلال استهداف rag2 الجينات مع المهندسة والزنك والإصبع nucleases 43. خسارةوظيفة من rag2 يسمح engraftment قوية وطويلة الأمد للأنسجة متعددة والخلايا السرطانية 43، ميزة يمكن أن تكون مفيدة في زرع الخلايا السرطانية غير متجانسة أن بإفراط عن الجينات المحورة مرشح وتقييم تأثير الفسيفساء التعبير التحوير على قدرة التجديد الذاتي والعلاجية الردود ومعدل نمو هذه الخلايا السرطانية.

وأخيرا، transgenesis الفسيفساء يقدم ميزة أخرى فريدة من نوعها على transgenesis مستقر. في الحيوانات المعدلة وراثيا مستقرة، ودمج الجينات المحورة في جينوم كل خلية واحدة في الجسم وهما الموروثة من جيل الى جيل 27. ومع ذلك، تنشأ العديد من أنواع السرطان من تغيرات جينية في الخلايا الجسدية بدلا من الطفرات الموروثة في الخلايا الجرثومية 44. وهكذا، فإن نمط الفسيفساء التكامل التحوير في الانتخابات التمهيدية حقن الأسماك والأنماط الوراثية المختلطة ضمن السكان الخلية من الأسماك المعدلة وراثيا الفسيفساء الفردية سوف ألخص عشر أفضلالبريد العيوب الجسدية وجدت في المرضى، وسوف تجنب تأثير الموضعية الاصطناعي الناجمة عن موقع الإدراج واحد في خط المعدلة وراثيا مستقر. من ناحية أخرى، والاصباغ والصغيرة من الخلايا overexpressing الجينات المحورة في الأسماك حقن في المقام الأول يجعل دراسة الآلية أكثر صعوبة.

وباختصار، توفر الاستراتيجية المعدلة وراثيا الفسيفساء أداة قوية للتقييم السريع والفعال للمساهمة التعاونية من الجينات المسرطنة لبدء الورم وانتشار. ومن المتوقع أن تولد المعلومات المنوية على التفاعل بين الجينات المسرطنة مرشح، والتي هناك حاجة ماسة لمزيد من التحقيق منتجين في آليات أنكجنيك والممرات وتطوير العلاج الموجه الفعلي هذا التقدم. أن زيادة كفاءة التكامل المشترك لأكثر من ثلاث بنيات DNA coinjected فتح الفرصة لفحص العلاقات المعقدة بين مجموعات متعددة الجينات أعرب في وقت واحد في أنواع مختلفة من العلبةشهادات خفض الانبعاثات. سوف تحديات المستقبل سيكون لتعديل استراتيجية المعدلة وراثيا الفسيفساء لاستيعاب أي تغيير الجيني أو جينية يمكن أن تلعب دورا في عملية الورمية، بدلا من الحد من استخدامه إلى حدوث طفرات أن التغيير الوحيد البروتين الترميز أو الجينات overexpressed، المكتسبة أو تضخيمها. في الآونة الأخيرة، أصبحت تحسين تقنيات التحرير الجينوم، مثل النسخ الشبيهة المنشط nucleases المستجيب (TALENS) 45 وتتجمع interspaced بانتظام يكرر المتناوب قصيرة (كريسبر) / نظم المرتبط كريسبر (CAS) 46، على نطاق واسع تستخدم لأكثر بسرعة وبكفاءة تعديل الذاتية الجينات في أنواع مختلفة من الخلايا والكائنات 46. ان مثل هذه التقنيات تسمح لنا القيام المستهدفة، والتعديلات ذات كفاءة عالية من تسلسل الجينوم والتعبير الجيني في النظام النموذجي الزرد وفهم أفضل لآلية (ق) التي يقوم عليها دور التعديلات الجينومية أو جينية في الورم المرضية. هذه، بدورها، من المرجح أن يحفز عشرتنمية (ه) من العلاجات الجزيئية الجديدة لمجموعة من السرطانات.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Expand Long Template PCR System  Roche Applied Science, IN 11681834001
pCR-TOPO vector  Invitrogen, CA 451641
T4 DNA ligase New England Biolabs, MA M0202M
Gateway LR Clonase II enzyme
Mix
Invitrogen, CA 11791-100
Gateway® BP Clonase® II enzyme mix Invitrogen, CA 11789-020
GC-RICH PCR System  Roche Applied Science, IN 12 140 306 001
Meganuclease I-SceI  New England Biolabs, MA R0694S
Nikon SMZ-1500 stereoscopic fluorescence microscope  Nikon, NY
Nikon digital sight DS-U1 camera Nikon, NY

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Tenesa, A., Dunlop, M. G. New insights into the aetiology of colorectal cancer from genome-wide association studies. Nat Rev Genet. 10, (6), 353-358 (2009).
  2. Maher, B. Exome sequencing takes centre stage in cancer profiling. Nature. 459, (7244), 146-147 (2009).
  3. Meyerson, M., Gabriel, S., Getz, G. Advances in understanding cancer genomes through second-generation sequencing. Nat Rev Genet. 11, (10), 685-696 (2010).
  4. Chung, C. C., Chanock, S. J. Current status of genome-wide association studies in cancer. Hum Genet. 130, (1), 59-78 (2011).
  5. Mosse, Y. P., et al. Identification of ALK as a major familial neuroblastoma predisposition gene. Nature. 455, (7215), 930-935 (2008).
  6. Janoueix-Lerosey, I., et al. Somatic and germline activating mutations of the ALK kinase receptor in neuroblastoma. Nature. 455, (7215), 967-970 (2008).
  7. George, R. E., et al. Activating mutations in ALK provide a therapeutic target in neuroblastoma. Nature. 455, (7215), 975-978 (2008).
  8. Zhu, S., et al. Activated ALK Collaborates with MYCN in Neuroblastoma Pathogenesis. Cancer Cell. 21, (3), 362-373 (2012).
  9. White, R., Rose, K., Zon, L. Zebrafish cancer: the state of the art and the path forward. Nat Rev Cancer. 13, (9), 624-636 (2013).
  10. Amatruda, J. F., Patton, E. E. Genetic models of cancer in zebrafish. Int Rev Cell Mol Biol. 271, 1-34 (2008).
  11. Konantz, M., et al. Zebrafish xenografts as a tool for in vivo studies on human cancer. Ann N Y Acad Sci. 1266, 124-137 (2012).
  12. Ellenbroek, S. I., van Rheenen, J. Imaging hallmarks of cancer in living mice. Nat Rev Cancer. 14, (6), 406-418 (2014).
  13. Kettleborough, R. N., et al. A systematic genome-wide analysis of zebrafish protein-coding gene function. Nature. 496, (7446), 494-497 (2013).
  14. Howe, K., et al. The zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome. Nature. 496, (7446), 498-503 (2013).
  15. Langenau, D. M., et al. Myc-induced T cell leukemia in transgenic zebrafish. Science. 299, (5608), 887-890 (2003).
  16. Feng, H., et al. T-lymphoblastic lymphoma cells express high levels of BCL2, S1P1, and ICAM1, leading to a blockade of tumor cell intravasation. Cancer Cell. 18, (4), 353-366 (2010).
  17. Patton, E. E., et al. BRAF mutations are sufficient to promote nevi formation and cooperate with p53 in the genesis of melanoma. Current biology : CB. 15, (3), 249-254 (2005).
  18. Santoriello, C., Anelli, V., Alghisi, E., Mione, M. Highly penetrant melanoma in a zebrafish model is independent of ErbB3b signaling. Pigment Cell Melanoma Res. 25, (2), 287-289 (2012).
  19. Leacock, S. W., et al. A zebrafish transgenic model of Ewing's sarcoma reveals conserved mediators of EWS-FLI1 tumorigenesis. Dis Model Mech. 5, (1), 95-106 (2012).
  20. Le, X., et al. Heat shock-inducible Cre/Lox approaches to induce diverse types of tumors and hyperplasia in transgenic zebrafish. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104, (22), 9410-9415 (2007).
  21. Langenau, D. M., et al. Effects of RAS on the genesis of embryonal rhabdomyosarcoma. Genes & development. 21, (11), 1382-1395 (2007).
  22. Park, S. W., et al. Oncogenic KRAS induces progenitor cell expansion and malignant transformation in zebrafish exocrine pancreas. Gastroenterology. 134, (7), 2080-2090 (2008).
  23. Zheng, W., et al. Xmrk, kras and myc transgenic zebrafish liver cancer models share molecular signatures with subsets of human hepatocellular carcinoma. PLoS One. 9, (3), e91179 (2014).
  24. Forrester, A. M., et al. NUP98-HOXA9-transgenic zebrafish develop a myeloproliferative neoplasm and provide new insight into mechanisms of myeloid leukaemogenesis. British journal of haematology. 155, (2), 167-181 (2011).
  25. Alghisi, E., et al. Targeting oncogene expression to endothelial cells induces proliferation of the myelo-erythroid lineage by repressing the Notch pathway. Leukemia. 27, (11), 2229-2241 (2013).
  26. Veinotte, C. J., Dellaire, G., Berman, J. N. Hooking the big one: the potential of zebrafish xenotransplantation to reform cancer drug screening in the genomic era. Dis Model Mech. 7, (7), 745-754 (2014).
  27. Patton, E. E., Zon, L. I. The art and design of genetic screens: zebrafish. Nat Rev Genet. 2, (12), 956-966 (2001).
  28. Lieschke, G. J., Currie, P. D. Animal models of human disease: zebrafish swim into view. Nat Rev Genet. 8, (5), 353-367 (2007).
  29. Igoucheva, O., Alexeev, V., Yoon, K. Differential cellular responses to exogenous DNA in mammalian cells and its effect on oligonucleotide-directed gene modification. Gene Ther. 13, (3), 266-275 (2006).
  30. Koster, R. W., Fraser, S. E. Tracing transgene expression in living zebrafish embryos. Dev Biol. 233, (2), 329-346 (2001).
  31. Langenau, D. M., et al. Co-injection strategies to modify radiation sensitivity and tumor initiation in transgenic Zebrafish. Oncogene. 27, (30), 4242-4248 (2008).
  32. Chen, Y., et al. Oncogenic mutations of ALK kinase in neuroblastoma. Nature. 455, (7215), 971-974 (2008).
  33. Pugh, T. J., et al. The genetic landscape of high-risk neuroblastoma. Nature genetics. (2013).
  34. Berry, T., et al. The ALK(F1174L) mutation potentiates the oncogenic activity of MYCN in neuroblastoma. Cancer Cell. 22, (1), 117-130 (2012).
  35. Heukamp, L. C., et al. Targeted expression of mutated ALK induces neuroblastoma in transgenic mice. Sci Transl Med. 4, (141), 141ra191 (2012).
  36. Lister, J. A., Robertson, C. P., Lepage, T., Johnson, S. L., Raible, D. W. nacre encodes a zebrafish microphthalmia-related protein that regulates neural-crest-derived pigment cell fate. Development. 126, (17), 3757-3767 (1999).
  37. Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. Microinjection of zebrafish embryos to analyze gene function. J Vis Exp. (25), (2009).
  38. Thermes, V., et al. I-SceI meganuclease mediates highly efficient transgenesis in fish. Mech Dev. 118, (1-2), 91-98 (2002).
  39. Kimmel, C. B., Ballard, W. W., Kimmel, S. R., Ullmann, B., Schilling, T. F. Stages of embryonic development of the zebrafish. Dev Dyn. 203, (3), 253-310 (1995).
  40. Urasaki, A., Asakawa, K., Kawakami, K. Efficient transposition of the Tol2 transposable element from a single-copy donor in zebrafish. Proc Natl Acad Sci U S A. 105, (50), 19827-19832 (2008).
  41. Caneparo, L., Pantazis, P., Dempsey, W., Fraser, S. E. Intercellular bridges in vertebrate gastrulation. PLoS One. 6, (5), e20230 (2011).
  42. Ivics, Z., Izsvak, Z. The expanding universe of transposon technologies for gene and cell engineering. Mob DNA. 1, (1), 25 (2010).
  43. Tang, Q., et al. Optimized cell transplantation using adult rag2 mutant zebrafish. Nat Methods. 11, (8), 821-824 (2014).
  44. Watson, I. R., Takahashi, K., Futreal, P. A., Chin, L. Emerging patterns of somatic mutations in cancer. Nat Rev Genet. 14, (10), 703-718 (2013).
  45. Sander, J. D., et al. Targeted gene disruption in somatic zebrafish cells using engineered TALENs. Nat Biotechnol. 29, (8), 697-698 (2011).
  46. Sander, J. D., Joung, J. K. CRISPR-Cas systems for editing, regulating and targeting genomes. Nat Biotechnol. 32, (4), 347-355 (2014).

Comments

0 Comments


    Post a Question / Comment / Request

    You must be signed in to post a comment. Please or create an account.

    Usage Statistics