Mosaico de pez cebra transgénesis de Análisis Genómica Funcional de candidatos genes cooperativos en la patogénesis del tumor

Developmental Biology
 

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Ung, C. Y., Guo, F., Zhang, X., Zhu, Z., Zhu, S. Mosaic Zebrafish Transgenesis for Functional Genomic Analysis of Candidate Cooperative Genes in Tumor Pathogenesis. J. Vis. Exp. (97), e52567, doi:10.3791/52567 (2015).

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Abstract

Introduction

Los cánceres son enfermedades progresivas marcados por la acumulación de mutaciones patológicas, deleciones y ganancias cromosómicas con el tiempo. Estas anomalías genéticas pueden afectar a múltiples procesos celulares que van desde el ciclo celular, la muerte celular, el metabolismo energético y el montaje del citoesqueleto a respuestas de estrés tales como hipoxia. Por lo tanto, la tumorigénesis refleja las acciones colectivas de múltiples aberraciones genéticas a través de un espectro de procesos biológicos. Los recientes esfuerzos de integración genómica de investigación, incluyendo la secuenciación de todo el genoma, la secuenciación del exoma, secuenciación dirigida, secuenciación profunda y estudios de asociación del genoma, han identificado un número cada vez mayor de alteraciones genéticas novedosas en prácticamente todos los tipos de tumores 1-4. En muchos casos, las lesiones genéticas ocurren juntos de una manera no aleatoria 5-8, lo que sugiere su cooperación en la patogénesis de la enfermedad. La disección de las funciones oncogénicas de la gran variedad de genes aberrantemente expresadas resultantes fesde estas lesiones genómicas es necesario diseñar nuevas estrategias terapéuticas y de entender las respuestas de las células tumorales a estos agentes, pero esto ha demostrado ser una tarea de enormes proporciones, que requiere muy robustos sistemas de modelos animales para la conducción de alto rendimiento de análisis genómico funcional en vivo.

Aunque los mamíferos, especialmente roedores, son modelos favorecidos en la biología del cáncer, el pez cebra ha comenzado a atraer una atención considerable. El pez cebra teleósteos (Darío rerio) se ha utilizado como un organismo modelo para el estudio de desarrollo desde la década de 1960 y fue aplicado primero al estudio de la patogénesis del tumor en 1982 9-11. Facilidad de mantenimiento, pequeño tamaño del cuerpo, y la alta fecundidad hacen que el pez cebra un modelo sólido para pantallas adelante genéticos a gran escala para identificar las mutaciones que confieren fenotipos anormales y patológicas 10. La transparencia óptica de embriones de pez cebra es otra característica clave de apoyo a un mayor uso de este modelo de cáncer, comopermite de imágenes in vivo para ser llevado a cabo para localizar el desarrollo de tumores en tiempo real 9, una aplicación que es relativamente difícil en roedores 12. Recientes genómica comparativa análisis del genoma de referencia pez cebra (Zv9) reveló 26.206 genes codificadores de proteínas, con un 71% que tiene ortólogos humanos, de los cuales 82% están relacionados con los genes asociados a la enfermedad de la herencia mendeliana en línea en Man (OMIM) base de datos 13, 14. En consecuencia, el pez cebra se ha utilizado para modelar diversos tipos de cánceres humanos, incluyendo neuroblastoma 8, de células T de la leucemia linfoblástica aguda (LLA-T) 15,16, 17,18 melanoma, sarcoma de Ewing 19, rabdomiosarcoma 20,21, carcinoma de páncreas 22, 23 y carcinoma hepatocelular mieloides malignas 24,25, y ha sido seleccionado como un modelo de cáncer de xenotrasplantes estudia 11,26.

A transgénicas establesenfoque en el pez cebra se utiliza comúnmente para estudiar el efecto de ganancia de la función de los genes en el desarrollo normal o patogénesis de la enfermedad 27,28. Para desarrollar tal un modelo (Figura 1A), se inyecta una construcción de ADN que contiene el gen de interés dirigido por un promotor específico de tejido en una de las células de tipo salvaje embriones. Tres o cuatro meses después de la inyección, cuando los embriones inyectados alcanzan la madurez sexual, se outcrossed con el tipo salvaje de pescado para detectar los que muestran la integración de la construcción de ADN en su línea germinal, lo que les otorga licencias como peces fundador. Muchos factores, tales como el número de copias y el sitio de integración del transgén, afectan a la expresión del transgén en las líneas transgénicas estables. Por lo tanto, para desarrollar un modelo de tumor transgénico, múltiples líneas transgénicas estables que sobreexpresan un único oncogén tienen que ser generada primero y proyectado para la línea que expresa el transgén en un nivel que podría conducir a la inducción de tumores. Sin embargo, si la sobreexpresión de una o candidatoncogene es tóxico para las células germinales, es difícil generar una línea transgénica estable mediante la sobreexpresión directamente el transgén 29. Por lo tanto, este enfoque puede llevar mucho tiempo, con un alto riesgo de fracaso para generar un modelo de cáncer adecuado.

Aquí, se ilustra una estrategia alternativa basada en la transgénesis transitoria mosaico (Figura 1B) que proporciona ventajas únicas sobre la transgénesis estable tradicional para estudio genómico funcional in vivo. En este enfoque, una o más construcciones transgénicas se inyectan en la fase de una célula de transgénicos o de tipo salvaje embriones. Las construcciones de ADN inyectados contienen transgenes son entonces mosaically y aleatoriamente integradas en el pescado primaria inyectada, lo que resulta en una mezcla de genotipos en múltiples poblaciones celulares en peces individuales 30. Además, la coinyección de ADN múltiples constructos en embriones de una sola célula conduce a co-integración en la misma célula en sitios al azar, que permite a uno TRAce las células con expresión de los transgenes y explorar las interacciones de los diferentes genes durante la patogénesis de la enfermedad en los animales de mosaico 31. Como prueba de principio, transitoriamente overexpressed ALK mutacionalmente activado (F1174L) con el gen reportero mCherry en el sistema nervioso simpático periférico (SNPS) bajo control de la hidroxilasa beta dopamina (d βh) promotor de tipo salvaje pescado y peces transgénicos que sobreexpresan MYCN. ALK, que codifica un receptor tirosina quinasa, es el gen más frecuentemente mutado en neuroblastoma de alto riesgo 5-7,32,33. ALK (F1174L), como una de las mutaciones somáticas activación más frecuentes y potentes, es sobre-representado en MYCN- amplificado pacientes con neuroblastoma de alto riesgo y la sinergia con sobreexpresión MYCN para acelerar la tumorigénesis neuroblastoma en ratones transgénicos estables y modelos de pez cebra transgénico 8,34,35. Por mosaicola sobreexpresión transitoria de ALK (F1174L) con mCherry en el pez transgénico MYCN, que recapitula la aceleración de la aparición del tumor observado en los peces transgénicos estables que sobreexpresan tanto ALK (F1174L) y MYCN, lo que sugiere que la estrategia de la transgénesis de mosaico se puede utilizar para rápida y eficiente evaluar las contribuciones relativas de varios oncogenes en la iniciación del tumor in vivo.

Protocol

NOTA: Todos los estudios de pez cebra y el mantenimiento de los animales se realizaron de acuerdo con el protocolo aprobado por el IACUC Clínica Mayo Institute # A41213.

1. Construcciones de DNA para la transgénesis

  1. Amplificar una 5,2-kb beta hidroxilasa de dopamina (d βh) región promotora 8 usando el clon BAC CH211-270H11 (desde el centro de recursos BACPAC (BPRC)) como plantilla de ADN. Utilice una los programas de ciclos siguientes para la PCR PCR sistema apropiado para larga y precisa amplificación por PCR de plantillas de ADN largos y: 94 ° C durante 2 min, 10 ciclos de (94 ° C, 15 seg, 50 ° C, 30 seg, 68 ° C, 8 min), seguido por 30 ciclos de (94 ° C, 15 seg, 53 ° C, 30 seg, 68 ° C, 8 min), 68 ° C, 4 min (cebador directo 5'-GGGGACAACTTTGTATAGAAAAGTTGGCGTACTCCCCCTTTTTAGG-3 ' y cebador inverso 5'GGGGACTGCTTTTTTGTACAAACTTGTGTTGCTTTGTCGTCTTTTGA-3 ').
  2. Cree el d βh -pDONRP4-P1R entrada clone 8 utilizando el sistema de clonación recombinante comercial, como puerta de entrada para varios sitios. Mezclar 1 l de dβh purificada producto de PCR (172 ng / l), 1 l (150 ng / l) pDONRP4-P1R vector donante (junto con otros vectores de puerta de enlace son generosos donativos del doctor Chi-Bin Chien, Univ. De Utah) , 4 l de tampón TE (pH 8.0) con 2 l de BP mezcla de enzimas clonasa, se incuban durante 1 hora a 25 ° C y luego se transforman en un TOP10 Shot E. competente coli de acuerdo con el protocolo del fabricante.
  3. Generar el d βh: transgénicos EGFP-MYCN construir 8 utilizando el sistema de clonación recombinante mencionado en el paso 1.2. Mezclar 1 l de cada clon de entrada (150 ng / l) que incluye un 5,2 kb promotor dβh (dβh -pDONR P4-P1R constructo), EGFP carece de un codón de parada (PME-EGFP construcción), y de ADNc MYCN humana (un generoso regalo del Dr. Hogarty en el Hospital de Niños de Pennsylvania, MYCN pDONRP2R-Construcción P3), 1 l (150 ng / l) del vector destino modificado que contiene sitios de reconocimiento de I-SCE (un generoso regalo del doctor C. Grabher, Karlsruhe Institute of Technology, Karlsruhe, Alemania), 4 l de tampón TE ( pH 8,0) con 2 l de mezcla de enzimas LR Clonase, incubar durante 1 hora a 25 ° C y luego transformar a E. químicamente competentes coli como One superior tiro 10 y seguir el protocolo del fabricante.
  4. Haga MITF: transgénico MITF construir 8 digiriendo el vector PNP-MITF con enzimas de restricción NotI y SalI durante 2 horas a temperatura ambiente, y subclonando el liberado 2,65 kb (un generoso regalo del doctor D. Raible, Univ de Washington.) fragmento de ADN que contiene el promotor de MITF y la secuencia codificante del gen MITF pez cebra en los sitios NotI y MluI de un vector pBluescript modificado que contiene flanquean los sitios de reconocimiento de I-SceI (un generoso regalo del Dr. Hui Feng, Universidad de Boston), utilizando ADN ligasa de T4 de acuerdo con el protocolo del fabricante.
    NOTA: Para aumentar la eficiencia de la generación de líneas MYCN expresando estables, d βh: derivados de la cresta construcciones de ADN MITF se coinjected en una de las células de embriones etapa nácar Nácar designa un tipo de peces mutantes que carecen de un neural: EGFP-MYCN y la MITF. melanophore durante el desarrollo 36. Por lo tanto, la aparición de células de pigmento en los embriones inyectados sugiere la integración de MITF: DNA MITF construye en el genoma. Se ha demostrado que dos o tres constructos de ADN coinjected pueden cointegradas en el genoma de pescado 31. Por lo tanto, la pigmentación causada por la expresión de MITF puede servir como un marcador para la integración de la dβh: transgén EGFP-MYCN y para facilitar la identificación de MYCN línea transgénica estable.
  5. Mezclar el d βh: EGFP-MYCN y MITF: DNA MITFconstrucciones en una relación 3: 1 en un volumen total de 15 l de una reacción con 1 l de enzima I-SceI y 0,75 l de tampón. Asegúrese de que la cantidad total de ADN en la reacción no exceda de 750 ng.
  6. Llevar a cabo la digestión I-SCE a temperatura ambiente durante 4 horas o O / N. En el segundo día, el I-SceI- digirió ADN están listos para la microinyección o se pueden almacenar a -20 ° C para la inyección en el futuro. Almacenar la enzima I-SceI a -80 ° C en pequeñas alícuotas para mantener su eficiencia enzima.
  7. Subclonar el ALKF1174L humana y el gen ALK de tipo salvaje del vector pcDNA3 (un generoso regalo del doctor George en el Dana-Farber Cancer Institute) 7 en EcoRI y NotI sitios de un vector pENTRY1A (un generoso regalo del doctor C. Grabher, Karlsruhe Institute of Technology, Karlsruhe, Alemania) utilizando ADN ligasa T4 de acuerdo con el protocolo del fabricante.
  8. Generar el d βh: ALKF1174L </ Em> o dβh: construcciones transgénicas ALKWT utilizando el sistema recombinante como se ha mencionado en el Protocolo 1.2. En pocas palabras, combinar tres clones de entrada, dβh -pDONRP4-P1R, ALKF1174L- pENTRY1A (o ALKWT -pENTRY1A) y P3E-poli, en el vector de destino modificado que contiene sitios de reconocimiento de I-SCE (un generoso regalo del doctor C. Grabher, Karlsruhe Instituto de Tecnología de Karlsruhe, Alemania), utilizando LR Clonase enzima Mix, según el protocolo del fabricante.
  9. Mezclar la d βh: ALKF1174L (o dβh: ALKWT) y dβh: DNA mCherry construye en una proporción de 3: 1 y a alinear con la enzima I-SceI como se describe en el protocolo de 1.5 a 1.6.

2. La microinyección

  1. Utilice micropipetas de vidrio con 1,0 mm de diámetro para todas las inyecciones 37. Rompa la punta de las pipetas de vidrio con una hoja de afeitar antes de la inyección. Calibrar el volumen de inyección por inyeccióning H 2 O en una gota de aceite mineral. Medir el diámetro de las gotitas resultantes y ajustar el microinyector (presión o la duración de pulso de presión) para asegurar que el volumen de inyección es menor que 10% del volumen celular total de un embriones en fase celular.
  2. Añadir un adicional de 0,5 l de enzima fresco I-SceI (5 unidad / l) en 5 l de solución de inyección que contiene construcciones de ADN justo antes de la inyección para aumentar la eficiencia de la transgénesis 38. Inyectar 50-80 pg de constructos de ADN linealizado en el citoplasma de embriones fase de una célula. Para asegurar el éxito de la inyección, mezclar la muestra con 0,25% de rojo fenol para la visualización. Si las células se vuelven de color rojo después de la inyección, se indica la microinyección es exitosa. Para garantizar una alta tasa de éxito para la generación de peces transgénicos, por lo general inyectamos hasta 500 embriones.
  3. Para generar los peces transgénicos que expresan establemente MYCN, coinject linealizado d βh: EGFP-MYCN y MITF: constructos de ADN MITF (en una proporción de 3: 1) en embriones de pez cebra mutante la pigmentación de nácar en la fase de una célula. La expresión de Mitf sirve como reportero para la integración de las construcciones transgénicas en el genoma de los peces.
  4. Para la sobreexpresión mosaico de ALK en el de tipo salvaje o MYCN embriones transgénicos, co-inyectar el linealizado d βh: ALK F1174L (o dβh: ALKWT) con dβh: DNA mCherry construye (en una proporción de 3: 1) en la célula una embriones resultantes de la cría de F1 heterocigota Tg (dβh: EGFP-MYCN) peces transgénicos con el tipo salvaje AB peces. Así, la mitad de la descendencia son transgénicos para MCYN y la mitad son de tipo salvaje.

3. Pantalla de pescado Estable o Mosaico transgénico

  1. Para aumentar la eficacia de la identificación de las líneas de MYCN expresando estables, anestesiar embriones inyectados nácar principalmente con tricaína (0,02%) at días 3-5 de postfertilización y la pantalla de la pigmentación. La transferencia de los embriones con la pigmentación a una nueva placa de Petri con agua fresca al huevo y elevarlas a la madurez sexual para una revisión adicional para los peces fundador, que lleva el d βh: transgén EGFP-MYCN en las células germinales.
  2. Para identificar el fundador con la transmisión de la línea germinal de EGFP-MYCN, outcross pigmentada peces F0 adultos con el tipo salvaje AB pescado y pantalla para los embriones EGFP-positivas en 1-2 días después de la fertilización para su posterior genotipado. Coloque un solo embrión F1 EGFP-positivo en un tubo de PCR y eliminar todo el líquido. Añadir 50 l de tampón de extracción que contiene gDNA 12,5 l de tampón de lisis 4x, 35 l H 2 O y 2,5 l de proteinasa K (10 mg / ml) a un solo embrión. Se incuba la reacción durante 2-3 horas a 55 ° C, seguido por 10 min de incubación a 98ºC para inactivar la proteinasa K. Para hacer 50 ml de tampón de lisis 4x, añadir 500 l de Tris 1 M (pH 8,4), 2,5 ml de 1M KCl to 47 ml de H 2 O. NOTA: Después de F0 MYCN peces transgénicos estable se crían con la naturaleza tipo AB de pescado, todos los descendientes son pigmentados. Por lo tanto, la pigmentación no puede servir como marcador para la identificación de MYCN- peces positivo. Mientras que en los peces transgénicos MYCN, la proteína fusión EGFP MYCN se expresa en la PSNS, incluyendo las neuronas simpáticas del ganglio cervical superior y el ganglio segmentaria secuencial de la cadena simpática y los PSN no neuronas dopaminérgicas, tales como el bulbo raquídeo y ganglios craneales 8. Por lo tanto, la expresión de EGFP puede servir como marcador para la identificación de los embriones transgénicos estables MYCN.
  3. Utilice 2 l de gDNA extraídos del embrión F1 pigmentados como molde, cebadores MYCN-test F1: 5'-CTG CTT GAG GAG AAC CTG TG-3 '; MYCN -R3: 5'-AGG CAT CGT TTG AGG ATC AG-3 ', y el siguiente programa de ingenioh la GC-rico sistema de PCR: 1 ciclo de 95 ° C durante 3 min, 25 ciclos de 95 ° C durante 30 segundos, 58 ° C durante 30 segundos y 72 ° C durante 3 min. Por lo general genotipo de 14-16 embriones pigmentadas de un solo apareamiento para confirmar la presencia de transgen integrado MYCN en los embriones pigmentadas, más de 6 fundador peces que sobreexpresan MYCN MITF y fueron identificados por este método.
  4. Levanta el resto de los embriones F1 EGFP-positivas. Clip de Fin y el genotipo ellos en 2-3 meses de edad utilizando el protocolo anterior para confirmar aún más la integración de los transgenes MYCN en el pescado. Raza F1 MYCN peces transgénicos estable con el tipo salvaje AB pescado. Co-inyectar el d βh linealizado: ALK F1174L (o dβh: ALKWT) con dβh: DNA mCherry construye en los embriones de una célula como se describe en PROTOCOLO 2.4.
  5. Ordenar la MYCN expresando embriones en el experimento descrito en el PROTOCOLO 2.4 utilizando un fluor estereoscópicamicroscopio escencia y seleccionar a los embriones inyectados principalmente en los días 1-3 de postfertilización para la expresión de EGFP-MYCN en el PSNS. Luego, durante 2-5 días después de la fecundación de, anestesiar a los embriones con tricaína (0,02%) y ordenar esos embriones MYCN- positivos o negativos de nuevo basado en la expresión de mCherry en los PSNS usando un microscopio de fluorescencia estereoscópica. La expresión de mCherry sirve como un marcador para la coexpresión de ALK en los tejidos de los animales inyectados primaria mosaico.
    NOTA: ~ 600 descendencia resultante de la cría de peces transgénicos MYCN estable con el tipo salvaje peces fueron inyectados por grupo con los constructos de ADN linealizado, incluyendo d βh: ALK F1174L y dβh: mCherry, dβh: ALKWT y dβh: mCherry, o dβh : mCherry solo, respectivamente. Mosaico de expresión mCherry se puede observar en el 70-90% de los peces inyectados principalmente. La mitad de unotercio de los peces inyectados sobrevivió a través de la etapa de las larvas para el reloj de tumor.
  6. Levante todo el mCherry + MYCN + y + mCherry MYCN - embriones de acuerdo con los protocolos estándar de la libreta de pez cebra 39 y vigilar la aparición de tumores a partir de las 5 semanas después de la fecundación.

4. Tumor Watch en mosaico transgénico Pescado

  1. Monitorear peces positivo mCherry- inyectado principalmente cada 2 semanas a partir de las 5 semanas después de la fecundación para la evidencia de la aparición de tumores.
  2. Anestesiar pescado con tricaína (0,02%) y la pantalla de la presencia de mCherry - y EGFP-expresando tumores en los PSNS bajo la Nikon SMZ-1500 microscopio de fluorescencia estereoscópica equipado con una mira la cámara digital DS-U1.
  3. Para confirmar si los tumores están expresando el transgén ALK, aislar la mCherry- y masas EGFP-positivas para el genotipado ALK PCR.
  4. Usando PCR, amplificar el ADN genómicoextraído de tumores desarrollados con los siguientes cebadores: ALK P7: 5'-AGG CCA GGT GTC CGG AAT GC-3 'y ALK P18: 5'-TGT CTT CAG GCT GAT GTT GC-3' y la siguiente reacción de PCR: 1 ciclo de 94 ° C durante 5 min, 30 ciclos de (94 ° C durante 30 segundos, 55 ° C durante 30 segundos y 72 ° C durante 60 segundos). Entonces, la secuencia del producto de PCR con el cebador P7 ALK Para confirmar aún más la existencia de mutante o de tipo salvaje ALK en los tumores mCherry-positivos.

Representative Results

Para investigar si la sobreexpresión de F1174L ALK mutationally activado o de tipo salvaje ALK podría colaborar con MYCN en la inducción de neuroblastoma, overexpressed ya sea ALK activada humana o de tipo salvaje ALK humano bajo el control del promotor d βh en el PSNS de peces transgénicos que sobreexpresan MYCN. Cualquiera de las siguientes construcciones, dβh - ALKF1174L o dβh - ALKWT, fueron coinjected con dβh - mCherry en una de las células de tipo salvaje o MYCN embriones transgénicos (Figura 2A) 8. La expresión de mCherry sirvió como un marcador para la coexpresión de ALK en los tejidos de los animales inyectados primaria mosaico. Todos los genotipos esperados estaban representados en los peces inyectada: (1) MYCN peces expresando con coexpresión mosaico de ALKF1174L activado y mCherry MYCN peces expresando con coexpresión mosaico de tipo salvaje ALK y mCherry, MYCN designado; mosaico ALKWT; (3) MYCN expresando pescado con expresión mosaico de mCherry, MYCN designado; mosaico mCherry; (4) de tipo salvaje pescado con coexpresión mosaico de ALKF1174L activado y mCherry, WT designado; mosaico ALKmut; y (5) de tipo salvaje pescado con coexpresión mosaico de tipo salvaje ALK y mCherry, designado WT; mosaico ALKWT. A continuación, Un reloj tumor se realizó cada 2 semanas desde 5 semanas después de la fecundación (WPF) en un total de 492 animales inyectados.

Ocho GFP + / + mCherry tumores surgen en la glándula interrenal, la glándula suprarrenal humana equivalente, por 9 WPF en el pescado MYCN expresando coinjected con d βh - ALKF1174 L y dβh - mCherry (Figuras 2B y 3). Estos tumores fueron histologicamente, inmunohistoquímica, y ultraestructuralmente comparable a la de neuroblastoma humano (datos se pueden encontrar en la referencia 8). Por el contrario, no hay tumores fueron observados por 9 semanas de edad en el pescado MYCN expresando coinjected con dβh - ALKWT y dβh - mCherry (Figuras 2C y 3, p = 0,002) o inyectados con dβh - mCherry solo (Figuras 2D y 3, p = 0,007). Los tumores se presentaron tanto en el MYCN; mosaico ALKWT y MYCN; pescado mosaico mCherry con la misma tasa de inducción después de 12 semanas de edad. Además, no se detectaron neuroblastomas en cualquier pez de tipo salvaje coinjected ya sea con el ALK de tipo salvaje y mCherry o ALKF1174L y mCherry transgenes durante las 15 semanas de monitoreo. En conjunto, estos resultados muestran que la sobreexpresión mosaico de ALK mutacionalmente activado acelera o tumor inducida MYCNnset, independientemente del sitio de integración en los animales de mosaico individuales, y que la sobreexpresión de tipo salvaje ALK en los niveles dirigido por el promotor dβh no aparece a colaborar con la sobreexpresión MYCN para inducir neuroblastoma en este sistema modelo.

Figura 1
Figura 1: Esquema de los estable convencional y estrategias transgénicas mosaico transitorios de pez cebra en el estudio de las contribuciones de cooperación de oncogenes candidatos a la tumorigénesis (A) estrategia transgénica estable.. Linealizado transgénico construcción de ADN que contiene oncogén candidato se inyecta en fase de una célula de tipo salvaje o mutantes de nácar embriones de pez cebra en el que el transgén se puede integrar en el genoma de los peces en los loci genómico aleatorio. Se requiere la integración de los transgenes en las células germinales de la generation de la línea transgénica estable. Principalmente embriones inyectados tardan de 3 a 4 meses para alcanzar la madurez sexual (generación F0 de pescado), el cual será outcrossed con el tipo salvaje o peces mutantes nácar para la detección de los peces fundador con la transmisión de la línea germinal del transgén. La descendencia resultante de los peces fundador, denomina la generación F1, llevan los alelos heterocigotos del transgén en su genoma. Evaluar los efectos de colaboración de dos oncogenes candidatos, como el gen "a" y gen "b", en la tumorigénesis, nos criamos la progenie F1 de dos líneas transgénicas estables que sobreexpresan estos transgenes, con sólo un cuarto de los que llevan transgenes compuestos descendencia. Debido a la relativamente baja eficiencia de la generación de líneas transgénicas estables, este enfoque no es factible para alto rendimiento análisis genómicos funcionales. Estrategia transgénica transitorio (B) Mosaico. Similar a la transgénesis estable, linealizado transgénico co DNA nstructs contienen genes candidatos se pueden inyectar en una etapa de células de tipo salvaje embriones. Debido a que el transgén no tiene que integrarse en el genoma de las células germinales, mucho tiempo y esfuerzo se pueden guardar en el proceso de identificación de peces fundador. Alternativamente, si la línea de peces transgénicos que sobreexpresan uno de los oncogenes candidatos está disponible (en nuestro caso, MYCN peces transgénicos se desarrollaron), construcciones de ADN linealizadas transgénicas que contienen otros genes candidatos pueden ser inyectados en una sola etapa de células de embriones transgénicos para estudiar su cooperación en tumorigénesis. Hasta tres construcciones transgénicas se pueden coinjected y coexpressed en el pez inyectado principalmente 31; por lo tanto, la interacción de los oncogenes candidatos en la tumorigénesis puede evaluarse en el pez inyectado principalmente. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

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Figura 2: Expresión de mosaico Activado ALK acelera la aparición de MYCN inducida Neuroblastoma 8 Modificado figura con permiso de Elsevier (referencia 3466510609819).. (A) Enfoque para la construcción de la transgénesis mosaico. (BF) 2 días de edad, las larvas de los embriones inyectados principalmente. Vistas laterales de expresión EGFP estable en las neuronas dopaminérgicas, incluyendo ganglios craneales (CG, puntas de flecha) en imágenes de fluorescencia de campo claro fusionadas (paneles superiores). Vistas laterales de expresión mCherry mosaico (paneles inferiores) en los ganglios craneal (CG, puntas de flecha), bulbo raquídeo (MO, flechas). Algunos expresión ectópica mCherry se observa en la no PSNS y las neuronas no dopaminérgicas. (G - K) 7 semanas de edad, los peces inyectados principalmente.(B, G) MYCN expresando peces coinjected con d βh - ALKF1174L y dβh - mCherry construye (MYCN; mosaico ALKmut). EGFP - y tumores -positivas mCherry surgieron a las 7 semanas (flechas blancas vacías en G). (C, H) ​​MYCN expresando peces coinjected con dβh - ALKWT y dβh - mCherry construye (MYCN; mosaico ALKWT). (D, I) MYCN expresando peces inyectados con dβh - mCherry construir solo (MYCN; mosaico mCherry). (E, J) de tipo salvaje (WT) pescado coinjected con dβh - ALKF1174L y dβh - mCherry construye (WT; mosaico ALKmut). (F, K) de tipo salvaje (WT) pescado coinjected con dβh - ALKWT y dβh - mCherconstrucciones ry (WT; ALKWT mosaico). Los neuroblastomas no se observaron en el MYCN expresando peces coinjected con dβh-ALKWT y dβh - mCherry o dβh - mCherry solo en 7 wpf, o en cualquiera de los hermanos que no heredan el transgén MYCN y se inyectaron bien con el gen o ALKWT el gen ALKF1174L. Las barras de escala, 100 micras en B - F y 1 mm en G - K. Un microscopio de fluorescencia estereoscópica Nikon SMZ-1500 equipado con una mira la cámara digital DS-U1 y una Leica MZ10F microscopio de fluorescencia estereoscópica equipado con una cámara digital Leica DFC 345FX se utiliza para capturar la images.The fluorescente adquirieron imágenes fueron procesadas y compilados con Adobe Photoshop e Illustrator CS3 (Adobe) de software. Haga clic aquí para ver una versión más grandede esta cifra.

Figura 3
Figura 3: El inicio de neuroblastoma en MYCN transgénico pescado o de tipo salvaje (WT) Peces como Mosaicos coinjected con las construcciones de ADN. Reproducido con permiso de Elsevier (referencia 3466510609819) d βh - ALKF1174 L y dβh - mCherry (mosaico ALKmut);. Dβh - ALKWT y dβh - mCherry (ALKWT mosaico); o dβh - mCherry (mosaico mCherry) solo 8. La diferencia entre la aparición de tumores en un 9 WPF en el pescado MYCN expresando coinjected con dβh - ALKF1174 L y dβh - mCherr y (MYCN; mosaico ALKmut) y que en la línea de MYCN coinjected con dβh - ALKWT dβh - mCherry (MYCN; mosaico ALKWT) o dβh - mCherry solo (MYCN; mosaico mCherry) es significativo en p = 0,002 yp = 0,007, respectivamente, por dos colas la prueba exacta de Fisher.

Discussion

En este estudio representativo, se utilizó coinyección transitoria y coexpresión de ALK activado con el gen reportero mCherry en MYCN expresando peces transgénicos para mostrar que estos genes cooperan para acelerar notablemente la aparición de neuroblastoma, coherente con nuestra conclusión anterior en el compuesto estable que coexpresan los peces transgénicos tanto ALK y MYCN 8 activado. Este enfoque transgénico mosaico posee varias ventajas sobre el método convencional. Lo más importante, permite el examen rápido de los efectos de la coexpresión de oncogenes candidatos en animales inyectados principalmente (generación F0) sin el requisito de animales transgénicos estables, tales como eliminar el excesivo tiempo y mano de obra típicamente implicado en la cría y la identificación de ALK expresando estable peces transgénicos. También se examinó el efecto de la sobreexpresión de tipo salvaje ALK, con o sin MYCN másexpresión, en la iniciación del tumor. Los resultados muestran que la sobreexpresión transitoria de tipo salvaje ALK en nuestro modelo de pescado no es suficiente para iniciar la tumorigénesis del neuroblastoma, independientemente de la situación del oncogén MYCN. Sería interesante probar en el futuro si la co-expresión transitoria de ambos ALK activado y MYCN en el pescado de tipo salvaje podría inducir inicio más temprano de la tumorigénesis en los peces inyectados principalmente. Este estudio sería más fielmente imitar el contexto real de la enfermedad, en la que las alteraciones somáticas de ambos genes co-ocurren en un subconjunto de pacientes con neuroblastoma de alto riesgo 5.

Un elemento importante del diseño de la estrategia transgénica transitoria mosaico es la inclusión de un gen reportero de la coinyección con cualquier oncogenes candidatos de interés, que ayuda en la detección de animales con éxito de la integración de transgenes entre los embriones de pez cebra inyectados principalmente y para controlar el pescado positivo para tumor aparición y progresión. Para aumentar la eficiencia de la transgénesis, hemos aplicado el enfoque transgénico meganucleasa I-SceI mediada, lo que aumenta significativamente la expresión dependiente de promotor uniforme de transgenes a partir de 26% de los embriones inyectados principalmente sin meganucleasa a 76% de los embriones inyectados con meganucleasa 38 . Aunque el uso del enfoque transgénico meganucleasa I-SceI mediada ha mejorado la eficiencia de la transgénesis notablemente, el porcentaje de embriones inyectados positivamente para los transgenes sigue siendo muy por debajo de 100%. Por lo tanto, la expresión de un gen reportero coinjected puede servir como un marcador para identificar embriones inyectados con éxito de la integración de los transgenes candidatos antes de monitorizar aún más el pescado para la aparición de tumores. En contraste, un enfoque transgénico transposón mediada Tol2 ha convertido en una herramienta genética popular en los vertebrados modelo y ha sido utilizado con éxito para la transgénesis, la mutagénesis de inserción, trampa de genesping, y potenciador atrapando 40,41. La coinyección de transposones Tol2 con ARNm transposasa en embriones fertilizados puede facilitar eventos de integración temprana que aumenta la eficiencia de la integración cromosómica y la potencia de transmisión de la línea germinal éxito del transgén 42. Sin embargo, debido a la "cortar y pegar" mecanismo de transposición de ADN, una sola copia del transgén se integra en el cromosoma por locus de inserción 42. Por lo tanto, los genes candidatos se coinjected más probable integran individualmente en el genoma de los peces en diferentes sitios, lo que podría conducir a la expresión de genes candidatos en diferentes células y un patrón de expresión transitoria y mosaico más complicado de genes coinjected en el pez inyectado principalmente.

En general, el estudio apoya el uso futuro de la transgénesis mosaico como un medio rápido para evaluar la colaboración, tal vez sinérgica, las relaciones entre múltiples oncogenes en un alto-thmanera roughput, un reto que es difícil cumplir con otros modelos animales, incluidos roedores. Hasta el momento, esta estrategia también se ha aplicado con éxito en el pez cebra transgénico para identificar los genes que suprimen la RAS activada iniciación inducida del rabdomiosarcoma 31 y modifican la sensibilidad a la radiación de las células T inducida MYC-leucemia linfoblástica aguda 31. Además, Langenau et al, 15 han demostrado que la combinación del enfoque de coinyección con un enfoque transgénico-choque térmico inducible puede inducir la expresión del transgen por choque térmico en el pez inyectado principalmente, que sería muy útil en la exploración de las funciones de cooperación de oncogenes en el tumor progresión, ya que permite la expresión del gen para ser activado después de que se estableció el tumor primario. Muy recientemente, Langenau y sus colegas desarrollaron el primer modelo de pez cebra inmunocomprometidos apuntando gen rag2 con ingeniería zinc-finger nucleasas 43. Pérdidade la función de rag2 permitido robusto y largo plazo injerto de múltiples células de cáncer de 43 y tejidos, una ventaja que podría ser útil en el trasplante de las células de cáncer heterogéneos que sobreexpresan transgenes candidatos y evaluar el efecto de la expresión transgénica de mosaico en la capacidad de auto-renovación, terapéutico respuestas y la tasa de crecimiento de estas células cancerosas.

Por último, la transgénesis mosaico ofrece otra ventaja única sobre la transgénesis estable. En los animales transgénicos estables, los transgenes se integran en el genoma de cada célula en el cuerpo y son heredables de generación en generación 27. Sin embargo, muchos cánceres surgen de alteraciones genéticas en las células somáticas en vez de mutaciones hereditarias en las células germinales 44. Por lo tanto, el patrón de mosaico de integración del transgén en las primarias inyecta pescado y los genotipos mixtos dentro de las poblaciones celulares de mosaico peces transgénicos individuales sería mejor recapitular ªdefectos somáticos correos encontrados en los pacientes y evitarían el efecto posicional artificial causado por un solo punto de inserción en una línea transgénica estable. Por otro lado, la población de mosaicismo y pequeño de células que sobreexpresan los transgenes en los peces inyectados principalmente hace Estudio de los mecanismos más difícil.

En resumen, la estrategia transgénica mosaico proporciona una herramienta robusta para la evaluación rápida y eficaz de la contribución cooperativa de oncogenes a la iniciación del tumor y la diseminación. Se espera que este avance para generar información fundamental sobre la interacción entre los oncogenes candidatos, que se necesita con urgencia para una mayor investigación productiva de mecanismos oncogénicos y caminos y para el desarrollo de la terapia dirigida eficaz. El aumento de la eficiencia de cointegración de más de tres construcciones de ADN coinjected abriría la oportunidad para el examen de las complejas relaciones entre las combinaciones de múltiples genes simultáneamente expresadas en diversos tipos de lataciales. Retos para el futuro será la de modificar la estrategia transgénica mosaico para acomodar cualquier alteración genómica o epigenéticos que podrían desempeñar un papel en el proceso neoplásico, en lugar de limitar su uso a las mutaciones que cambian sólo la codificación de proteínas o genes se sobreexpresan, ganado o amplificado. Recientemente, las técnicas mejoradas de edición del genoma, tales como nucleasas de transcripción del tipo activador de efectoras (TALENS) 45 y agrupados espaciadas regularmente repeticiones palindrómicas cortas (de CRISPR) / sistemas de CRISPR-asociado (CAS) 46, se han convertido en ampliamente utilizado para modificar más rápidamente y eficientemente endógena genes en diversos tipos de células y organismos 46. Estas técnicas se nos permiten realizar apuntamos, modificaciones altamente eficientes de secuencia del genoma y la expresión génica en el sistema modelo de pez cebra y para entender mejor el mecanismo (s) subyacente al papel de las alteraciones genómicas o epigenéticos en la patogénesis del tumor. Estos, a su vez, es probable que estimular ªe desarrollo de nuevas terapias moleculares para una variedad de cánceres.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Expand Long Template PCR System  Roche Applied Science, IN 11681834001
pCR-TOPO vector  Invitrogen, CA 451641
T4 DNA ligase New England Biolabs, MA M0202M
Gateway LR Clonase II enzyme
Mix
Invitrogen, CA 11791-100
Gateway® BP Clonase® II enzyme mix Invitrogen, CA 11789-020
GC-RICH PCR System  Roche Applied Science, IN 12 140 306 001
Meganuclease I-SceI  New England Biolabs, MA R0694S
Nikon SMZ-1500 stereoscopic fluorescence microscope  Nikon, NY
Nikon digital sight DS-U1 camera Nikon, NY

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