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सीआरआईएसपीआर से जुड़े प्रोटीन सीपीएफ 1 को एक विशेष रूप से डिजाइन किए क्रिस्प्र आरएनए (सीआरआरएनए) द्वारा निर्देशित किया जा सकता है ताकि वांछित जगहों पर डबल-फंसे डीएनए को साफ किया जा सके, चिपचिले सिरों को पैदा कर सकें। इस विशेषता के आधार पर, एक डीएनए असेंबली मानक (सी-ईंट) की स्थापना की गई थी, और इसका उपयोग करने वाले एक प्रोटोकॉल को यहाँ वर्णित किया गया है।
