नैदानिक मामले रिपोर्ट के लिए एक मेटाडेटा निष्कर्षण दृष्टिकोण जैव चिकित्सा अवधारणाओं की उन्नत समझ को सक्षम करने के लिए

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Summary

हम नैदानिक मामले रिपोर्टों में जैव चिकित्सा अवधारणाओं का वर्णन पाठ की निकासी के लिए एक प्रोटोकॉल और संबंधित मेटाडाटा टेम्पलेट प्रस्तुत करते हैं । इस प्रोटोकॉल के माध्यम से उत्पादित संरचित पाठ मान नैदानिक आख्यान के हजारों के गहरे विश्लेषण का समर्थन कर सकते हैं.

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Caufield, J. H., Liem, D. A., Garlid, A. O., Zhou, Y., Watson, K., Bui, A. A. T., Wang, W., Ping, P. A Metadata Extraction Approach for Clinical Case Reports to Enable Advanced Understanding of Biomedical Concepts. J. Vis. Exp. (139), e58392, doi:10.3791/58392 (2018).

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Abstract

नैदानिक मामले रिपोर्ट (सीसीआरएस) चिकित्सा में टिप्पणियों और अंतर्दृष्टि साझा करने का एक मूल्यवान साधन हैं । इन दस्तावेजों के रूप में बदलता है, और उनकी सामग्री कई, उपंयास रोग प्रस्तुतियों और उपचार के विवरण भी शामिल है । इस प्रकार अब तक, सीसीआरएस भीतर पाठ डेटा काफी हद तक unstructure्ड है, में गहराई से विश्लेषण के लिए इन उपयोगी डेटा प्रदान करने के लिए महत्वपूर्ण मानव और गणनात्मक प्रयास की आवश्यकता है । इस प्रोटोकॉल में, हम अक्सर सीसीआरएस भीतर मनाया विशिष्ट जैव चिकित्सा अवधारणाओं के लिए इसी मेटाडाटा की पहचान के लिए तरीकों का वर्णन । हम दस्तावेज़ एनोटेशन के लिए एक गाइड के रूप में एक मेटाडाटा टेंपलेट प्रदान करते हैं, पहचानने कि सीसीआरएस पर भव्य संरचना मैनुअल और स्वचालित प्रयास के संयोजन से पीछा किया जा सकता है । यहां प्रस्तुत दृष्टिकोण एक बड़े साहित्य कोष (जैसे, सीसीआरएस के हजारों) से अवधारणा से संबंधित पाठ के संगठन के लिए उपयुक्त है, लेकिन आसानी से अधिक ध्यान केंद्रित कार्यों या रिपोर्टों के छोटे सेट की सुविधा के लिए अनुकूलित किया जा सकता है । आने वाले संरचित पाठ डेटा पर्याप्त अर्थ संदर्भ के लिए अनुवर्ती पाठ विश्लेषण कार्यप्रवाह की एक किस्म का समर्थन भी शामिल है: मेटा-विश्लेषण कैसे CCR विस्तार को अधिकतम करने के लिए निर्धारित करने के लिए, दुर्लभ रोगों के महामारी विज्ञान के अध्ययन, और के मॉडलों के विकास चिकित्सा भाषा सभी संरचित पाठ डेटा के उपयोग के माध्यम से और अधिक साकार और प्रबंधनीय बनाया जा सकता है ।

Introduction

नैदानिक मामले रिपोर्टें (सीसीआरएस) चिकित्सा में टिप्पणियों और अंतर्दृष्टि साझा करने का एक मूलभूत साधन हैं । ये चिकित्सकों और मेडिकल छात्रों के लिए संचार और शिक्षा के बुनियादी तंत्र के रूप में सेवा करते हैं । ऐतिहासिक, सीसीआरएस भी उभरते रोगों के खातों प्रदान की है, उनके उपचार, और उनके आनुवंशिक पृष्ठभूमि1,2,3,4। उदाहरण के लिए, १८८५ में लुई पाश्चर द्वारा मानव रेबीज का पहला उपचार5,6 और रोगियों में पेनिसिलिन के पहले आवेदन7 दोनों सीसीआरएस के माध्यम से सूचित किया गया. से अधिक १,८७०,००० सीसीआरएस अप्रैल २०१८ के रूप में प्रकाशित किया गया है, पिछले दशक के भीतर आधे से अधिक एक लाख के साथ; पत्रिकाओं के लिए इन रिपोर्टों8के लिए नए स्थानों प्रदान जारी है । हालांकि रूप और सामग्री में अद्वितीय, सीसीआरएस पाठ डेटा है कि बड़े पैमाने पर unstructured होते हैं, एक विशाल शब्दावली होते हैं, और संबंधित घटनाएं, एक संरचित संसाधन के रूप में उनके उपयोग सीमित । विस्तृत मेटाडेटा निकालने के लिए महत्वपूर्ण प्रयास की आवश्यकता है (यानी, "डेटा के बारे में डेटा", या इस मामले में, दस्तावेज़ सामग्री के विवरण) सीसीआरएस से और उन्हें एक खोजने योग्य, सुलभ, संप्रचलित, और पुन: प्रयोज्य (निष्पक्ष)9 डेटा के रूप में स्थापित संसाधन.

यहां, हम पाठ और संख्यात्मक मूल्यों को निकालने के लिए प्रकाशित सीसीआरएस भीतर विशिष्ट जैव चिकित्सा अवधारणाओं का वर्णन मानकीकरण के लिए एक प्रक्रिया का वर्णन । इस पद्धति में कोई मेटाडेटा टेंपलेट शामिल है । इस प्रक्रिया के ओवरव्यू के लिए चित्र 1 देखें । एनोटेशन प्रक्रिया के एक बड़े संग्रह के लिए आवेदन (उदाहरण के लिए, रोग प्रस्तुति के एक विशिष्ट प्रकार के कई हजार) एक प्रबंधनीय और व्याख्या नैदानिक ग्रंथों के संरचित सेट की विधानसभा परमिट, मशीन को प्राप्त करने पठनीय प्रलेखन और जैव चिकित्सा घटनाएं प्रत्येक नैदानिक प्रस्तुति के भीतर एंबेडेड । हालांकि डेटा स्वरूपों जैसे HL7 द्वारा प्रदान की (उदाहरणके लिए, संदेश मानक10 के संस्करण 3 या तेजी से स्वास्थ्य अंतर संसाधन [FHIR]11), LOINC12, और अंतरराष्ट्रीय सांख्यिकीय के संशोधन 10 रोगों और संबंधित स्वास्थ्य समस्याओं का वर्गीकरण (आईसीडी 10)13 नैदानिक टिप्पणियों का वर्णन और आदान प्रदान के लिए मानक प्रदान करते हैं, वे इन डेटा के आसपास के पाठ पर कब्जा नहीं है, और न ही वे करने के लिए इरादा कर रहे हैं । हमारी पद्धति के परिणाम सीसीआरएस पर संरचना लागू करने और बाद में विश्लेषण, नियंत्रित शब्दावलियों और कोडिंग प्रणालियों (जैसे, आईसीडी 10), और/या ऊपर सूचीबद्ध नैदानिक डेटा प्रारूपों के लिए रूपांतरण की सुविधा के लिए सबसे अच्छा उपयोग किया जाता है .

खनन सीसीआरएस बायोमेडिकल और नैदानिक सूचना के भीतर काम का एक सक्रिय क्षेत्र है । हालांकि पिछले प्रस्तावों केस रिपोर्ट की संरचना का मानकीकरण करने के लिए (उदाहरणके लिए, HL7 v 2.514 या मानकीकृत phenotype शब्दावली15का उपयोग कर) सराहनीय हैं, यह संभावना है कि सीसीआरएस अलग से एक किस्म का पालन जारी रहेगा प्राकृतिक भाषा रूपों और दस्तावेज़ लेआउट, के रूप में वे पिछली सदी के बहुत से है । आदर्श शर्तों के तहत, नए मामले की रिपोर्ट के लेखक देखभाल दिशानिर्देश16 का पालन सुनिश्चित करने के लिए वे व्यापक हैं । दोनों प्राकृतिक भाषा और चिकित्सा अवधारणाओं को इसके संबंध के प्रति संवेदनशील दृष्टिकोण इसलिए नए और संग्रहीत रिपोर्टों के साथ काम करने में सबसे प्रभावी हो सकता है । इस तरह के शिल्प17 और जीव विज्ञान और बेडसाइड (i2b2)18 उपचारात्मक समर्थन प्राकृतिक भाषा प्रसंस्करण (एनएलपी) दृष्टिकोण अभी तक विशेष रूप से सीसीआरएस या नैदानिक आख्यान पर ध्यान केंद्रित नहीं करने के लिए सूचना के द्वारा उत्पादित उन के रूप में संसाधन । इसी तरह, cTAKES19 और क्लैंप20 के रूप में चिकित्सा एनएलपी उपकरण विकसित किया गया है, लेकिन आम तौर पर विशिष्ट शब्दों या वाक्यांशों की पहचान (यानी, संस्थाओं) दस्तावेजों के भीतर बल्कि सामांय अवधारणाओं सामांयतः सीसीआरएस में वर्णित से ।

हम आमतौर पर सीसीआरएस के भीतर शामिल सुविधाओं के लिए एक मानकीकृत मेटाडाटा टेम्पलेट तैयार की है । यह टेंपलेट सुविधाओं को परिभाषित करने के लिए सीसीआरएस पर संरचना थोपना-दस्तावेज़ सामग्री की गहराई से तुलना के लिए एक आवश्यक अग्रदूत साबित-अभी तक पर्याप्त लचीलेपन के लिए अर्थ संदर्भ बनाए रखने के लिए अनुमति देता है । हालांकि हम इस टेम्पलेट के साथ जुड़े प्रारूप तैयार किया है दोनों मैनुअल एनोटेशन और गणना की सहायता पाठ खनन के लिए उपयुक्त हो, हम यह सुनिश्चित किया है कि मैनुअल व्याख्याओं के लिए उपयोग करने के लिए विशेष रूप से आसान है । हमारा दृष्टिकोण ध्यान से अधिक जटिल से अलग है (और इसलिए, कम तुरंत अप्रशिक्षित शोधकर्ताओं को समझ में आता है) ऐसी21FHIR के रूप में चौखटे । निम्न प्रोटोकॉल प्रत्येक टेम्पलेट डेटा प्रकार के लिए संगत दस्तावेज़ सुविधाओं को अलग करने के लिए कैसे का वर्णन करता है, एक एकल CCR में उन के लिए संगत मानों का एक सेट के साथ ।

टेंपलेट के भीतर डेटा प्रकार है उन सबसे सीसीआरएस और रोगी के लिए वर्णनात्मक-सामांय में चिकित्सा दस्तावेजों केंद्रित । इन सुविधाओं के एनोटेशन, मुख्य रूप से यह संरचना देकर CCR पाठ की खोज, पहुंच, अंतर, और reusability को बढ़ावा देता है । डेटा प्रकार चार सामान्य श्रेणियों में हैं: दस्तावेज़ और एनोटेशन पहचान, मामले की रिपोर्ट पहचान (यानी, दस्तावेज़-स्तर के गुण), चिकित्सा सामग्री अवधारणाओं (मुख्य रूप से अवधारणा स्तर के गुण), और पावती (यानी , धन के सबूत उपलब्ध कराने की सुविधाएं) । इस एनोटेशन प्रक्रिया में, प्रत्येक दस्तावेज़ में एक CCR का पूरा पाठ शामिल है, किसी भी दस्तावेज़ सामग्री मामले को स्वतंत्र सामग्री को छोड़ (जैसे, प्रयोगात्मक प्रोटोकॉल) । सीसीआरएस आम तौर पर १,००० से कम प्रत्येक शब्द हैं; एक एकल कोष आदर्श एक ही ग्रंथसूची डेटाबेस द्वारा अनुक्रमित किया जाना चाहिए और एक ही लिखित भाषा में होना चाहिए ।

दृष्टिकोण के उत्पाद यहां वर्णित है, जब एक CCR कॉर्प के लिए आवेदन किया है, व्याख्या नैदानिक पाठ का एक संरचित सेट है । हालांकि इस पद्धति को पूरी तरह से मैंयुअल रूप से किया जा सकता है और किसी भी सूचना के अनुभव के बिना डोमेन विशेषज्ञों द्वारा किया जा करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, यह प्राकृतिक भाषा संसाधन के ऊपर निर्दिष्ट दृष्टिकोण पूरक है और डेटा के लिए उपयुक्त प्रदान करता है अभिकलनी विश्लेषण । इस तरह के विश्लेषणों ब्याज की उन लोगों को जो अक्सर सीसीआरएस, सहित पढ़ने से परे शोधकर्ताओं के दर्शकों के लिए हो सकता है:

  • रोग प्रस्तुतियों, उनके प्रमुख symptomology, सामांय नैदानिक दृष्टिकोण, और उपचार के साथ संबंध
  • जो नैदानिक साहित्य के भीतर वर्णित घटनाओं के साथ नैदानिक परीक्षणों के परिणामों की तुलना करना चाहते हैं, संभवतः अतिरिक्त टिप्पणियों और अधिक से अधिक सांख्यिकीय शक्ति प्रदान.
  • bioinformatics, बायोमेडिकल सूचना, और कंप्यूटर विज्ञान शोधकर्ताओं जो चिकित्सा आख्यान के संरचित चिकित्सा भाषा डेटा सेट या उच्च-स्तरीय समझ की आवश्यकता होती है
  • सरकारी नीति शोधकर्ताओं कैसे नैदानिक परीक्षण सबसे अच्छा कैसे प्रतिबिंबित निदान और उपचार के रूप में यह वास्तविकता में होता है पर ध्यान केंद्रित

सीसीआरएस पर संरचना लागू करने के कई बाद बेहतर चिकित्सा भाषा और जैव चिकित्सा घटना को समझने के प्रयासों का समर्थन कर सकते हैं ।

Protocol

1. दस्तावेज़ और एनोटेशन पहचान

नोट: इस श्रेणी में मान एनोटेशन प्रक्रिया का समर्थन करते हैं ।

  1. एनोटेशन टेम्पलेट का उपयोग करके, इस मेटाडेटा सेट के लिए विशिष्ट पहचानकर्ता प्रदान करें, उदा., Case123. पहचानकर्ता स्वरूप पूरे प्रोजेक्ट में एकरूप होना चाहिए (उदा., Case001 के माध्यम से Case500) ।
  2. वह दिनांक निर्दिष्ट करें जिस पर कोई दस्तावेज़ पढ़ा गया और व्याख्या की गई थी । एकरूपता और पठनीयता के लिए "Jan १० २०१८" जैसी किसी स्वरूप का उपयोग करें ।

2. मामले की रिपोर्ट पहचान

नोट: इस श्रेणी के मान दस्तावेज़-स्तरीय सुविधाएं प्रदान करते है और दस्तावेज़ की खोज में योगदान देते हैं ।

  1. सभी एनोटेशन में प्रत्येक फ़ील्ड के स्वरूप के अनुरूप हो, उदा., सभी प्रविष्टियों में रिक्तियों का अनुसरण किए बिना व्यक्तिगत मानों को अर्धविरामों से अलग किया जाना चाहिए । मूल दस्तावेज़ या ऐसे मेडलाइन के रूप में एक ग्रंथसूची डेटाबेस में इस्तेमाल किया उन लोगों के लिए समान स्वरूपों का उपयोग करें ।
  2. दस्तावेज़ का शीर्षक प्रदान करें ।
  3. प्रदान किए गए क्रम में दस्तावेज़ के सभी लेखकों के नाम प्रदान करें । सभी नामों के स्वरूप को सामान्य करें, जैसे कि सभी नाम प्रारंभिक के किसी भी नंबर के बाद एक एकल अंतिम नाम के रूप ले, जैसे जेन बी पार्क पार्क जेबीबन जाता है. शीर्षक शामिल न करें । एकाधिक लेखकों को अतिरिक्त विराम चिह्नों के बिना अर्द्धविराम से पृथक करें, जैसे कि जॉन a. स्मिथ, Jane B. Park स्मिथ JA का एक रूप लेता है ; पार्क जेबी ।
  4. दस्तावेज़ के प्रकाशन का वर्ष प्रदान करें ।
  5. जिसमें दस्तावेज़ प्रकाशित किया गया जर्नल का पूरा शीर्षक प्रदान करें । एनएलएम कैटलॉग (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nlmcatalog) द्वारा नियंत्रित जर्नल नामों की एक सूची प्रदान की गई है
  6. दस्तावेज़ के लेखकों की गृह संस्था का पता प्रदान करें, जैसा कि दस्तावेज़ में निर्दिष्ट किया गया है । इसमें विभाग, भौगोलिक स्थान, और डाक पता विवरण शामिल हो सकते हैं ।
    1. यदि एकाधिक स्थान प्रदान किए गए है (उदा., यदि संबद्धता लेखकों के बीच भिंन हो), तो संबंधित लेखक के लिए केवल विवरण निर्दिष्ट करें । यदि किसी संगत लेखक की पहचान नहीं की जा सकती, तो पहले लेखक का उपयोग करें, या कोई संस्था निर्दिष्ट न करें । यदि किसी संबंधित लेखक के पास एकाधिक संबद्धताएं हैं, तो दोनों को निर्दिष्ट करें और अर्धविराम से अलग कर ।
  7. दस्तावेज़ का संगत लेखक प्रदान करें, जैसा कि लेखकों के डेटा प्रकार में उपयोग किए गए समान स्वरूप का उपयोग करते हुए दस्तावेज़ शीर्षक के भीतर निर्दिष्ट किया गया है ।
  8. कोई दस्तावेज़ पहचानकर्ता (उदा., कोई PMID) प्रदान करें ।
  9. कोई डिजिटल ऑब्जेक्ट पहचानकर्ता प्रदान करें, जहां संभव हो और उपलब्ध हो, दस्तावेज़ URL में (https://www.doi.org/के माध्यम से), कोई PubMed केंद्रीय पृष्ठ न हो ।
  10. यदि उपलब्ध हो, तो दस्तावेज़ के पूर्ण पाठ के लिए एक स्थिर URL प्रदान करें पहुंच बढ़ाने के लिए, यह PubMed मध्य संस्करण को संदर्भित कर सकता है ।
  11. दस्तावेज़ भाषा प्रदान करें । एकाधिक भाषाओं में उपलब्ध दस्तावेज़ों के लिए, दोनों को अर्धविराम से अलग कर दें ।

3. चिकित्सा सामग्री

नोट: इस श्रेणी के मान दस्तावेज़-स्तर, अवधारणा-स्तर, और पाठ-स्तर सुविधाओं की पहचान करते हैं । वे किसी दस्तावेज़ की पहुंच, अंतर, और पुनर्प्रयोज्यता बढ़ाने की सेवा करते हैं । इन सुविधाओं के तरीके के लिए दस्तावेज़ सामग्री के बीच वैचारिक और अर्थ समानताएं निरीक्षण प्रदान करते हैं, जैव चिकित्सा विषयों और घटनाओं पर ध्यान देने के साथ । इस अनुभाग में अधिकांश श्रेणियां एकाधिक पाठ कथनों को शामिल कर सकती है और प्रत्येक को अर्द्धविराम का उपयोग कर अलग किया जाना चाहिए ।

  1. प्रत्येक क्षेत्र में प्रासंगिक विस्तार शामिलकरें (जैसे, "मां की उंर ५० में स्तन कैंसर था") के बजाय एक नियंत्रित शब्दावली से केवल शब्दों को उपलब्ध कराने (जैसे, नहीं "स्तन कैंसर" अकेले) । प्रत्येक अवलोकन से परे व्यापक विस्तार शामिल न करें ।
  2. सामान्यतः दोहराए गए शब्द और वाक्यांश (उदा., सर्वनाम, शब्द "रोगी" और वाक्यांश "की शिकायत की गई" या "इसके साथ प्रस्तुत") छोड़ें. हालांकि कई व्याख्याताओं के पार मनोवाद की संभावना है, यह प्रत्येक दस्तावेज़ के लिए एकाधिक व्याख्याताओं और डेटा संग्रह के बाद स्वचालित सामांयीकरण के माध्यम से कम किया जा सकता है । गणना के बाद प्रसंस्करण दृष्टिकोण बाद में विश्लेषण की जरूरत से अलग हो जाएगा और यहां विस्तार से चर्चा नहीं कर रहे हैं ।
  3. एनोटेशन टेंपलेट में निंन जानकारी प्रदान करें ।
    1. मुख्य शब्दों के रूप में, आमतौर पर इसके शीर्ष लेख में, किसी दस्तावेज़ में पहचानी गई विशिष्ट शर्तें प्रदान करें । अर्धविराम के साथ अलग शब्दों के रूप में अंय विराम चिह्न शामिल हो सकते हैं ।
    2. जनसांख्यिकीय मूल्यों प्रदान करते हैं, विशेष रूप से किसी भी पाठ बयान एक रोगी की पृष्ठभूमि का वर्णन है, जिसमें सेक्स और/या लिंग, आयु, जातीयता, या राष्ट्रीयता ।
    3. नैदानिक कथा, विशिष्ट संस्थान पतों के अलावा अंय के भीतर उल्लेख भौगोलिक स्थानों प्रदान करें । इस संरचनात्मक स्थानों/भागों शामिल नहीं है, लेकिन किसी भी भौगोलिक स्थान है जहां रोगी रहता है या यात्रा शामिल हो सकते हैं ।
    4. जीवन शैली मूल्यों प्रदान करते हैं, किसी भी पाठ अक्सर रोगी गतिविधियों या उनके सामांय स्वास्थ्य के लिए प्रासंगिक व्यवहार का वर्णन बयान सहित । व्यवहार में, यह अक्सर धूंरपान या शराब की खपत वाला शामिल है, लेकिन यह भी सूरज जोखिम, आहार, या शारीरिक गतिविधि के विशिष्ट प्रकार की आवृत्ति शामिल हो सकते हैं ।
    5. परिवार के इतिहास की चर्चा करते हुए चिकित्सा इतिहास मान प्रदान करें । किसी भी पाठ के नैदानिक टिप्पणियों और भाई बहन, माता पिता, और परिवार के अंय सदस्यों द्वारा अनुभवी घटनाओं का वर्णन बयान शामिल हैं । यह आनुवंशिक स्थितियों और नकारात्मक टिप्पणियों में शामिल है (यानी, परिवार के इतिहास के एक रोग के लिए नकारात्मक था )
    6. सामाजिक इतिहास की चर्चा करते हुए, किसी भी पाठ जनसांख्यिकी या जीवन शैली में कवर नहीं रोगी पृष्ठभूमि का वर्णन बयान सहित मूल्यों प्रदान करें । इन श्रेणियों के बीच सामग्री में अधिव्याप्त हो सकती है । बयान व्यावसायिक इतिहास और सामाजिक आदतों में शामिल हो सकते हैं ।
    7. रोगी के चिकित्सा और सर्जिकल इतिहास की चर्चा करते हुए मान प्रदान करें । नैदानिक प्रस्तुति की शुरुआत से पहले किसी भी चिकित्सा टिप्पणियों, उपचार, या जगह लेने के अंय घटनाओं का वर्णन किसी भी पाठ बयान शामिल करें । यह प्रसूति इतिहास और अच्छे स्वास्थ्य, जहां नोट की अवधि भी शामिल है ।
    8. निंन 16 रोग प्रणाली श्रेणियों में से एक या अधिक निर्दिष्ट करें । ध्यान दें कि इन मूल्यों स्पष्ट बजाय मुक्त पाठ कर रहे हैं । श्रेणियां व्यापक नहीं है लेकिन अधिकांश नैदानिक प्रस्तुति और निदान रोग में वर्णित घटनाओं से प्रभावित प्रणालियों का संकेत करना चाहिए ।
      1. श्रेणियों के एक विशिष्ट सेट का पालन करें, रोगों और संबंधित स्वास्थ्य समस्याओं के अंतरराष्ट्रीय सांख्यिकीय वर्गीकरण में इस्तेमाल श्रेणियों के आधार पर, 10 (आईसीडी-10) कोड प्रणाली में संशोधन । इसी आईसीडी 10 कोड पर्वतमाला के साथ साथ रोग प्रणाली श्रेणियों की सूची के लिए 1 तालिका देखें ।
    9. सभी लक्षण और लक्षण का विवरण प्रदान करें किसी भी पाठ के संकेत या प्रारंभिक प्रस्तुति में शुरू लक्षण के किसी भी चिकित्सा टिप्पणियों का वर्णन शामिल है, उनकी शुरुआत, अवधि, गंभीरता, और संकल्प सहित, यदि प्रदान की । परिणाम में वर्णित लक्षण शामिल न करें । ये मान अंय प्रकारों के साथ अधिव्याप्त हो सकते है यदि लक्षण इतिहास से आरंभिक प्रस्तुति तक जारी रखते हैं ।
    10. किसी भी comorbidities का ब्यौरा उपलब्ध कराएं । आरंभिक नैदानिक प्रस्तुति के समय मौजूद विशिष्ट रोगों का वर्णन करने वाले किसी भी शब्द या वाक्यांश को शामिल करें. इन मानों और नैदानिक इतिहास में उन के बीच ओवरलैप होने की संभावना है, हालांकि Comorbidity निदान में उन के समान शब्द शामिल नहीं होना चाहिए ।
    11. सभी नैदानिक तकनीकों और प्रक्रियाओं का विवरण प्रदान करें । नैदानिक प्रयोजनों के लिए किया चिकित्सा प्रक्रियाओं के नाम शामिल हैं, परीक्षा, परीक्षण, और इमेजिंग सहित, साथ ही शर्तों जिसके तहत इन परीक्षणों प्रदर्शन किया गया और प्रासंगिक संरचनात्मक स्थानों (जैसे, "ऊपरी अतिवाद शिरापरक अल्ट्रासाउंड ") । परीक्षण परिणाम छोड़ें ।
    12. निदान का ब्यौरा दें । किसी भी पाठ रोग के निदान का वर्णन बयान, भले ही अंतिम निदान अस्पष्ट है शामिल हैं ।
    13. सभी प्रयोगशाला मूल्यों और परीक्षा परिणाम प्रदान करते हैं । नैदानिक परीक्षणों के नाम शामिल करें, उनके मान और शर्तें जिनके अंतर्गत वे प्रदर्शन किए गए थे. यह नैदानिक तकनीकों और कार्यविधियों डेटा प्रकार में उपयोग किए गए शब्दों के साथ ओवरलैप शामिल होंगे । दोनों संख्यात्मक और गुणात्मक मूल्यों (जैसे, पूरा रक्त गिनती सामांय सीमा के भीतर था) स्वीकार्य हैं यदि नैदानिक परीक्षणों के नाम प्रदान नहीं किए जाते हैं, तो परिणामों का वर्णन करने वाले शब्दों (उदा., leukopenia) का उपयोग करें, यद्यपि उन्हें संकेतों और लक्षणों में भी शामिल किया जाना चाहिए.
    14. पैथोलॉजी का ब्यौरा उपलब्ध कराएं । विकृति और प्रोटोकॉल अध्ययन के परिणामों का वर्णन किसी भी पाठ बयान शामिल, सकल विकृति विज्ञान, इम्यूनोलॉजी, और सूक्ष्म अध्ययन सहित. शर्तों नैदानिक तकनीकों और प्रक्रियाओं में इस्तेमाल किया उन लोगों के साथ ओवरलैप हो सकता है (चरण ३.११), जैसे , बायोप्सी के रूप में नमूने प्राप्त करने के लिए प्रदर्शन किया प्रक्रियाओं के साथ.
    15. सभी औषधीय चिकित्सा प्रदान करते हैं । एंटीबायोटिक दवाओं या विशिष्ट दवा के नाम जैसे सामान्य शब्दों सहित उपचार के दौरान इस्तेमाल किया दवा चिकित्सा का वर्णन किसी भी पाठ बयान शामिल हैं इसके अलावा, कब और कैसे दवा चिकित्सा बंद कर दिया गया के विवरण शामिल हैं ।
    16. सभी हस्तक्षेप प्रक्रियाओं प्रदान करें । उपचार के दौरान इस्तेमाल किया चिकित्सीय प्रक्रियाओं का वर्णन किसी भी पाठ बयान शामिल, इनवेसिव प्रक्रियाओं सहित, चिकित्सा उपकरणों का आरोपण, और अन्य चिकित्सा की सुविधा के लिए किया प्रक्रियाओं. इसके अलावा, जब और कैसे चल रही चिकित्सीय प्रक्रियाओं, यदि आवश्यक हो, रोक के विवरण शामिल हैं ।
    17. रोगी परिणाम प्रदान करते हैं । किसी भी अनुवर्ती परीक्षण सहित रिपोर्ट में वर्णित नैदानिक प्रस्तुति के अंत के रूप में रोगी के स्वास्थ्य का वर्णन करने वाले किसी भी पाठ कथनों को शामिल करें ।
    18. सभी नैदानिक छवियां, आंकड़े, वीडियो/एनिमेशन और तालिकाओं की संख्याएं प्रदान करें । रिपोर्ट में शामिल दृश्य मीडिया की सभी गणनाएं, निंन स्वरूप में शामिल करें: छवियों की गणना; आंकड़ों की गिनती; वीडियो या एनिमेशन की गिनती; तालिकाओं की गणना ।
      1. इस तरह से छवियों और आंकड़ों के बीच भेद: चित्र अन्य सभी छवियों हैं, जबकि तस्वीरें, माइक्रोग्राफ, इलेक्ट्रोकार्डियोग्राम ताल छवियों, और नैदानिक इमेजिंग के अन्य उत्पादों सहित नैदानिक निदान के किसी भी उत्पाद शामिल हैं, आम तौर पर डेटा भूखंडों और चित्र सहित ।
    19. अन्य सीसीआरएस को रिश्तों का सबूत प्रदान करते हैं । इस फ़ील्ड में इस रिपोर्ट के द्वारा उद्धृत या संदर्भित डेटा सेट में अंय रिपोर्ट्स के पहचानकर्ता (उदा., PMIDs) शामिल हो सकते हैं ।
    20. नैदानिक परीक्षणों के लिए संबंधों के सबूत प्रदान करते हैं । इस क्षेत्र में इस CCR का हवाला देते हुए नैदानिक परीक्षणों के पहचानकर्ता शामिल हो सकते हैं । एनसीटी, या अंय स्थिर पहचानकर्ता द्वारा पहले उनके ClinicalTrials.gov पहचानकर्ताओं द्वारा परीक्षणों की पहचान करना ।
    21. इस दस्तावेज़ के संगत डेटाबेस crosslinks शामिल करें, जिसमें पहचानकर्ता, जैसे डेटाबेस नाम और स्थिर url हों ।

4. पावती

नोट: इस श्रेणी में मान दस्तावेज़-स्तर सुविधाओं की पहचान करते है अभी तक प्रकाशनों में थोड़ी सुसंगत संरचना है । वे एक CCR और संबंधित काम के लिए समर्थन प्रदान संगठनों के बारे में विवरण प्रदान करते हैं । इस श्रेणी के संदर्भ की कुल गिनती के लिए एक क्षेत्र भी शामिल है एक लेख द्वारा उद्धृत: यह डिग्री है जो एक दस्तावेज़ किसी भी प्रकार के अंय जैव चिकित्सा दस्तावेजों के साथ वैचारिक संबंध है की एक मोटा मीट्रिक प्रदान करना है । इस अनुभाग में चार डेटा प्रकारों के भीतर, निंन प्रदान करें ।

  1. काम और इसी PI के साथ ही प्रासंगिक पुरस्कार संख्या का समर्थन सभी धन स्रोत निर्दिष्ट करें । पहला मूल्य, धन स्रोत, सभी संगठनों के काम के लिए वित्तीय सहायता प्रदान करने के नाम शामिल होना चाहिए ।
    1. अर्धविरामों और रिक्तियों के साथ पृथक संगठन, उदा., राष्ट्रीय स्वास्थ्य संस्थान/ डो; स्मिथ-पार्क फाउंडेशन .
    2. निम्न मान, पुरस्कार संख्या के लिए, पुरस्कारों के प्राप्तकर्ताओं के साथ प्रदान किए गए किसी भी पुरस्कार संख्या या विशिष्ट पदनामों को निर्दिष्ट करें, जहां उपयुक्त हो, कोष्ठकों में प्राप्तकर्ताओं के प्रथमाक्षर के रूप में, उदा., R01HL123123 (JP को) , NS12312 (जेपी के लिए, जे एस), अनुसंधान प्रशिक्षण फैलोशिप (जे एस के लिए)। लेखक स्पष्ट रूप से राज्य कर सकते है कि कोई संगत जानकारी उपलब्ध नहीं है (उदा., "कोई धन प्राप्त नहीं हुआ"); इन मामलों में, लेखकों द्वारा प्रदत्त पाठ का उपयोग धन स्रोत मान के रूप में करें । नहीं तो मान जाना चाहिए ना ।
  2. लेखकों द्वारा निर्दिष्ट के रूप में हितों के प्रकटीकरण/निर्दिष्ट करें, जैसे, जेपी DrugCo के लिए एक सलाहकार है। लेखक स्पष्ट रूप से स्थिति हो सकती है कि कोई संगत जानकारी उपलब्ध नहीं है (उदा., "ब्याज का कोई विरोध घोषित नहीं है"); इन मामलों में, लेखकों द्वारा प्रदान किए गए पाठ का उपयोग करें, जैसे कि ब्याज मूल्य के प्रकटीकरण/ अंयथा, जैसा कि ऊपर, मान होना चाहिए ना ।
  3. दस्तावेज़ द्वारा उद्धृत सभी संदर्भों की संख्यात्मक संख्या निर्दिष्ट करें, जिसमें किसी भी अनुपूरक सामग्री में प्रदान नहीं किए गए हैं । इस फ़ील्ड में कोई संदर्भ पाठ शामिल नहीं किया जाना चाहिए ।

Representative Results

एनोटेशन प्रक्रिया का एक उदाहरण चित्रा 2में दिखाया गया है । यह मामला22 जीवाणु रोगज़नक़ Burkholderia thailandensisद्वारा संक्रमण की एक प्रस्तुति का वर्णन करता है । संदर्भ के लिए, इस CCR के प्रासंगिक भाग अनुपूरक फ़ाइल 1में सादे पाठ प्रारूप में प्रदान की जाती है; कुछ शोध निष्कर्ष भी इस रिपोर्ट में प्रस्तुत किए गए हैं और तुलना के लिए शामिल किए गए हैं. व्यवहार में, HTML या PDF स्वरूप में प्रदान की रिपोर्ट सादे पाठ में परिवर्तित दक्षता और मेटाडेटा निष्कर्षण में आसानी में सुधार हो सकता है ।

तालिका 2में पूर्ण CCR मेटाडेटा एनोटेशन के दो सेट के उदाहरण दिए गए हैं । इन उदाहरणों का पहला नकली डेटा प्रत्येक मान के आदर्श स्वरूप वर्णन करने के लिए है, जबकि दूसरा उदाहरण एक दुर्लभ शर्त पर एक प्रकाशित CCR से निकाले गए मान होते हैं, acrodermatitis enteropathica23.

Figure 1
चित्र 1. मामले की रिपोर्ट एनोटेशन के लिए कार्यप्रवाह । यहां वर्णित प्रोटोकॉल नैदानिक मामले की रिपोर्ट के भीतर अक्सर मौजूद शाब्दिक सुविधाओं की पहचान के लिए एक विधि प्रदान करता है । इस प्रक्रिया को किसी दस्तावेज़ के असेंबली कॉर्प की आवश्यकता है । एनोटेशन प्रक्रिया के उत्पाद, एक बार एक फ़ाइल में एकत्रित, पाठ चिकित्सा अवधारणाओं और मामले की रिपोर्ट के भीतर उनके विवरण के साथ जुड़े सुविधाओं की पहचान परमिट । कृपया यहां क्लिक करें इस आंकड़े का एक बड़ा संस्करण को देखने के लिए ।

Figure 2
चित्र 2. एक नैदानिक मामले की रिपोर्ट में अवधारणा-विशिष्ट पाठ की पहचान । मामले की रिपोर्ट के पाठ के साथ शुरुआत, दस्तावेज़ के माध्यम से मैन्युअल व्याख्याता प्रगति कर सकता है, मेटाडेटा टेम्पलेट के प्रत्येक घटक के संगत पाठ के खंडों की पहचान कर रहा है. पहचान सुविधाओं नीले रंग में डाला जाता है । चिकित्सा अवधारणाओं के लिए इसी पाठ लाल और उनके प्रकार के साथ लेबल में हैं; तृतीय स्तंभ में सभी हाइलाइट किए गए पाठ विकृति प्रकार को संदर्भित करता है । कृपया यहां क्लिक करें इस आंकड़े का एक बड़ा संस्करण को देखने के लिए ।

श्रेणी विवरण आईसीडी 10 अध्याय आईसीडी 10 कोड रेंज
कैंसर किसी भी प्रकार का कैंसर या घातक ट्यूमर । द्वितीय C00-D49
तंत्रिका तंत्र मस्तिष्क, रीढ़ की हड्डी, या नसों की कोई बीमारी । Vi G00-G99
हृदय दिल या संवहनी प्रणाली के किसी भी रोग । रक्त रोगों में शामिल नहीं है । ग्यारहवीं I00-I99
पुराने ऑस्टियोआर्थराइटिस और आमवाती मांसपेशियों, कंकाल प्रणाली, जोड़ों, और संयोजी ऊतक के किसी भी रोग । तेरहवें M00-M99
पाचन जठरांत्र संबंधी मार्ग और पाचन अंगों, जिगर और अग्ंयाशय सहित के किसी भी रोग । Xi K00-K95
प्रसूति और स्त्री-संबंधी गर्भावस्था, प्रसव, महिला प्रजनन प्रणाली, या स्तनों से संबंधित कोई भी रोग । XIV Xv O00-O9A; N60-N98
संक्रामक संक्रामक सूक्ष्मजीवों द्वारा किसी भी रोग का कारण बनता है । मैं A00-B99
श्वसन फेफड़ों और श्वसन तंत्र की कोई बीमारी । एक्स J00-J99
hematologic रक्त की कोई बीमारी, अस्थि मज्जा, लिम्फ नोड्स, या तिल्ली । Iii D50-D89
किडनी और urologic मूत्रवाहिनी सहित गुर्दे या मूत्राशय की कोई भी बीमारी, साथ ही पुरुष प्रजनन अंगों, प्रोस्टेट सहित. Xiv N00-N53; N99
Endocrine अंत में स्रावी ग्रंथियों के किसी भी रोग, साथ ही चयापचय संबंधी विकार. Iv E00-E89
ओरल और मैक्सिलोफैशियल किसी भी मुंह, जबड़े, सिर, चेहरा, या गर्दन को शामिल हालत । इलेवन तेरहवें K00-K14; M26-M27
आँख किसी भी आंखें शामिल है, अंधापन सहित शर्त । सातवीं H00-H59
otorhinolaryngologic कान, नाक, और/या गले की किसी भी हालत । आठवीं H60-H95; J30-J39
त्वचा त्वचा का कोई भी रोग । बारहवीं L00-L99
दुर्लभ एक विशेष श्रेणी दुर्लभ रोगों की रिपोर्टों के लिए आरक्षित, संयुक्त राज्य अमेरिका में २००,००० से कम व्यक्तियों प्रभावित उन लोगों के रूप में परिभाषित (https://rarediseases.info.nih.gov/diseases देखें) ना ना

तालिका 1. दस्तावेज़ एनोटेशन के लिए रोग श्रेणियां । यहां सूचीबद्ध श्रेणियां दस्तावेज़ मेटाडेटा टेंपलेट में रोग सिस्टम डेटा प्रकार के लिए उपयोग की जाने वाली हैं । प्रत्येक रोग प्रस्तुति कई अंग प्रणालियों या etiologies शामिल हो सकता है के रूप में, एक एकल नैदानिक मामले की रिपोर्ट एकाधिक श्रेणियों के अनुरूप हो सकता है. इन श्रेणियों मुख्यतः रोगों और संबंधित स्वास्थ्य समस्याओं के अंतरराष्ट्रीय सांख्यिकीय वर्गीकरण के वर्गों अंतर करने के लिए इस्तेमाल किया उन का पालन करें, 10 संशोधन (आईसीडी-10) कोड प्रणाली: इसी आईसीडी 10 अध्यायों और कोड पर्वतमाला प्रदान की जाती हैं । कुछ श्रेणियों, जैसे कि मौखिक और मैक्सिलोफैशियल रोग के लिए, आईसीडी 10 प्रणाली के कई वर्गों के अनुरूप है ।

डेटा प्रकार उदाहरण #1 उदाहरण #2 (कैमरून और McClain १९८६)
दस्तावेज़ और एनोटेशन पहचान
आंतरिक ID CCR005 CCR2000
एनोटेशन दिनांक मार्च २ २०१८ मार्च १ २०१८
मामले की रिपोर्ट पहचान
शीर्षक अन्तर्हृद्शोथ का एक मामला । acrodermatitis enteropathica के नेत्र histopathology.
लेखकों ग्रांट एबी; चांग सीडी कैमरून जद; McClain मुख्य ंयायाधीश
साल २०१७ १९८६
जर्नल विश्व चिकित्सा और मामले की रिपोर्ट जर्नल नेत्र विज्ञान के ब्रिटिश जर्नल
संस्था चिकित्सा विभाग, कार्डियोलोजी के प्रभाग, पहले जनरल अस्पताल, बोस्टन, मैसाचुसेट्स, संयुक्त राज्य अमरीका नेत्र विज्ञान विभाग, मिनेसोटा मेडिकल स्कूल, Minneapolis, मिनेसोटा ५५४५५ विश्वविद्यालय
इसी लेखक ग्रांट एबी कैमरून जद
PMID २५५५५५५५ ३७५६१२२
Doi 10.1011/wjmcr. 2017.11.001 ना
लिंक https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9555555/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1040795/
भाषा अंग्रेज़ी अंग्रेज़ी
चिकित्सा सामग्री
मुख्य शब्द brucellosis अन्तर्हृद्शोथ mitral वाल्व ना
जनसांख्यिकी ३७ वर्षीय पुरुष पुरुष बच्चे
भौगोलिक स्थानों फ्लोरिडा रियो डी जनेरियो, ब्राज़ील ना
जीवन शैली धूम्रपान कभी-कभार शराब पीता ना
परिवार का इतिहास तीसरे की पांच संतानों को आंकने वाले माता-पिता; छोटे भाई पुरानी एक्जिमा है ना
सामाजिक इतिहास निर्माण मजदूर ना
चिकित्सा/सर्जिकल इतिहास थकान का इतिहास 8 पाउंड 9 औंस (३८८४ ग्राम) एक सीधी, पूर्ण अवधि गर्भावस्था के उत्पाद; उम्र 1 महीने जब तक अच्छे स्वास्थ्य में वह अपने गाल पर एक छाले त्वचा लाल चकत्ते विकसित; आंखों, नाक, और मुंह के आसपास त्वचा को शामिल करने के लिए दाने फैल; त्वचा के घावों को भी पेट और अंगों पर ध्यान दिया गया; डायरिया और विफलता पनपे; उस समय त्वचा की बायोप्सी acrodermatitis enteropathica की parakeratosis ठेठ दिखाया; व्यापक स्पेक्ट्रम एंटीबायोटिक दवाओं, स्तन के दूध, और diodoquin के आंतरायिक पाठ्यक्रमों के साथ अगले छह वर्षों में इलाज; आंशिक रूप से जवाब दिया; विकसित कुल खालित्य, आंतरायिक acrodermatitis, और उपइष्टतम वजन लाभ के साथ आंतरायिक डायरिया; spasticity एई द्वारा केंद्रीय तंत्रिका तंत्र की भागीदारी के लिए जिंमेदार ठहराया उंर के 8 महीने से विकसित किया था; 11 माह में कार्डियोपल्मोनरी गिरफ्तारी के कई प्रकरण; अपने मुखर डोरियों के सह समंवय की कमी; tracheostomy; 18 महीने की उंर से बच्चे को द्विपक्षीय ऑप्टिक शोष और रेटिना जहाजों के मामूली क्षीणन के साथ ही मनोप्रेरणा मंदता के लक्षण के साथ जुड़े खोज nystagmus विकसित; द्विपक्षीय keratoconjunctivitis; त्वचा लाल चकत्ते; दूसरी त्वचा बायोप्सी 3 साल की उंर में प्रदर्शन फिर एई के लिए ठेठ parakeratosis दिखाया; गंभीर त्वचा लाल चकत्ते और डायरिया; द्विपक्षीय सकल पूर्वकाल corneal opacities देखा गया है जो पूरी तरह से समय वह पांच साल की उंर में जांच की थी द्वारा हल किया था; मध्यकर्णशोथ, मूत्र मार्ग में संक्रमण, और त्वचा संक्रमण सहित अक्सर संक्रमण
रोग प्रणाली हृदय संक्रामक पाचन त्वचा नजर दुर्लभ
लक्षण और लक्षण palpitations और पिछले सप्ताह में dyspnea; सुस्ती, सिरदर्द, और ठंड लगना के साथ प्रस्तुत गंभीर blepharoconjunctivitis आणि द्विपक्षीय पूर्वकाल corneal vascularisation; गंभीर त्वचा लाल चकत्ते और डायरिया; चना-नकारात्मक जीवाणु पूति; त्वचा के घावों acrodermatitis enteropathica की विशिष्ट, thymic ऊतक के अभाव, ऑप्टिक नसों, chiasm, और ऑप्टिक पथ और व्यापक अनुमस्तिष्क अध...
Comorbidity हाइपरटेंशन hyperlipidemia ना
नैदानिक तकनीकों और प्रक्रियाओं शारीरिक परीक्षा; जी॰ रक्त संस्कृतियों नेत्र परीक्षा; necropsy
निदान ब्रूसेला अन्तर्हृद्शोथ acrodermatitis enteropathica
प्रयोगशाला मूल्यों सी प्रतिक्रियाशील प्रोटीन में वृद्धि (9 मिलीग्राम/ क्षारीय फॉस्फेट (२५० यू एल/ ना
विकृति ब्रूसेला melitensis के खून के नमूनों से हुआ था कल्चर दाईं और बाईं आंखें दिखने में समान थीं; corneal उपकला कॉर्निया की पूरी सतह पर समतल स्क्वैमस उपकला कोशिकाओं की एक से तीन कोशिका परतों के लिए मोटाई में कम किया गया था; उपकला के सभी ध्रुवीयता खो गया था. बोमन झिल्ली केवल सही कॉर्निया की परिधि में पहचाना जा सकता है । कोई बोमन की झिल्ली बाएं कॉर्निया में पहचाना जा सकता है । न ही अपक्षयी और न ही भड़काऊ pannus या तो आंख में पहचाना जा सकता है; सिलिअरी शरीर के परिपत्र और परोक्ष मांसपेशियों की व्यापक शोष; लेंस संपुटी उपकला और जल्दी cortical अपक्षयी परिवर्तन के कुछ पीछे प्रवास; पीछे पोल में रेटिना वर्णक उपकला के व्यापक अध; रेटिना और संलग्न था हल्के autolytic भर में परिवर्तन दिखाया; पीछे ध्रुव में रॉड और शंकु बाहरी क्षेत्रों के कुछ संरक्षण, तथापि, इन संरचनाओं पूरी तरह से भूमध्य रेखा के लिए पूर्वकाल खो गए थे; दोनों आँखों के नाड़ीग्रंथि कोशिका और तंत्रिका तंतु की परतों का व्यापक नुकसान; डिस्क और आसंन ऑप्टिक तंत्रिका के लगभग पूरा शोष
औषधीय चिकित्सा गेन्तमयसीं २४० mg/iv/दैनिक ना
Inverventional थेरेपी कृत्रिम वाल्व प्रतिस्थापन ना
रोगी परिणाम मूल्यांकन वसूली अनहोनी थी; डिस्चार्ज होम १९७१ में निधन (वय ७)
नैदानिक इमेजिंग/ 2; 1; 0; 1 7; 0; 0; 0
दूसरे मामले की रिपोर्ट से संबंध ५५५५५५५ २३४३०८४९
Clinial परीक्षण के साथ संबंध NCT05555123 ना
डेटाबेस के साथ Crosslink MedlinePlus स्वास्थ्य सूचना: https://medlineplus.gov/ency/article/000597.htm HighWire-PDF: http://bjo.bmj.com/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=3756122; युरोप PubMed मध्ये: http://europepmc.org/abstract/MED/3756122; आनुवंशिक गठबंधन: http://www.diseaseinfosearch.org/result/143
अभार
फंडिंग सोर्स राष् ट्रीय स् वास् थ् य संस् थान, फेफड़ों और रक्त संस् थान मिनेसोटा लायंस क्लब; दृष्टिहीनता को रोकने के लिए अनुसंधान; दिग्गजों प्रशासन; शराब और अंय नशीली दवाओं के दुरुपयोग के कार्यालय मिनेसोटा राज्य के प्रोग्रामिंग
पुरस्कार संख्या R01HL123123 (एजी करने के लिए) ना
प्रकटीकरण ब्याज के विरोध/ डॉ अनुदान DrugCo के लिए एक भुगतान प्रवक्ता है । ना
संदर्भ 4 27

तालिका 2. नैदानिक मामले रिपोर्ट के लिए मानकीकृत मेटाडेटा टेम्पलेट, उदाहरण एनोटेशन के साथ. नैदानिक मामले रिपोर्टों के लिए आम सुविधाओं का एक सेट और उनकी अवधारणा स्तर एनोटेशन सुविधा यहां दिखाया गया है । इस टेम्पलेट को तीन प्राथमिक अनुभागों में व्यवस्थित किया गया है: पहचान, चिकित्सा सामग्री और रसीद, प्रत्येक प्रकार की केस रिपोर्ट सुविधा द्वारा वहन किए गए उद्देश्य और अतिरिक्त मूल्य को टिप्पण. इस तालिका में उदाहरण एनोटेशन, एक fictionalized केस रिपोर्ट के दो सेट, और किसी अंय सेट की स्थिति पर रिपोर्ट से व्युत्पंन acrodermatitis enteropathica23है ।

अनुपूरक फाइल 1. एक नैदानिक मामले की रिपोर्ट का पाठ (चांग एट अल । २०१७). कृपया इस फ़ाइल को डाउनलोड करने के लिए यहां क्लिक करें

Discussion

सीसीआरएस के लिए मानकीकृत मेटाडेटा टेम्पलेट का कार्यांवयन उनकी सामग्री को अधिक निष्पक्ष बना सकता है, उनकी ऑडियंस का विस्तार कर सकते हैं, और उनके अनुप्रयोगों का विस्तार करते हैं । चिकित्सा संचार में शैक्षिक उपकरण के रूप में सीसीआरएस के पारंपरिक उपयोग के बाद, स्वास्थ्य सेवा प्रशिक्षुओं (जैसे, चिकित्सा छात्रों, इंटर्न, और अध्येता), और बायोमेडिकल शोधकर्ताओं कि संक्षेप मामले रिपोर्ट सामग्री और अधिक तेजी से सक्षम मिल सकता है समझ. सीसीआरएस के साथ मेटाडाटा मानकीकरण की सबसे बड़ी ताकत है, तथापि, यह है कि अनुक्रमण इन डेटा अंयथा अलग टिप्पणियों व्याख्यात्मक पैटर्न में बदल देती है । यहां दिए गए प्रोटोकॉल सीसीआरएस के साथ कार्य करने के लिए कार्यप्रवाह में पहले चरण के रूप में कार्य कर सकते हैं, चाहे इस कार्यप्रवाह में महामारी विज्ञान विश्लेषण, पोस्ट-मार्केटिंग दवा या उपचार निगरानी, या रोगजनन या चिकित्सीय प्रभावकारिता के व्यापक सर्वेक्षण शामिल हों । संरचित सीसीआरएस के भीतर की पहचान की सुविधाओं को विशेष रूप से दुर्लभ परिस्थितियों के लिए रोग प्रस्तुतियों और उपचार पर ध्यान केंद्रित शोधकर्ताओं के लिए एक उपयोगी संसाधन प्रदान कर सकते हैं । नैदानिक शोधकर्ताओं पिछले उपचार परहेजों पर डेटा दर्ज लक्षण या साइड इफेक्ट और देखभाल के पिछले मानकों के तहत सुधार की डिग्री का विश्लेषण करने के लिए मिल सकता है । डेटा भी एक नई प्रभावकारिता पर आधारित उपचार के व्यापक विश्लेषण ड्राइव कर सकते हैं, प्रतिकूल प्रभाव या विषाक्तता की कमी, या नशीली दवाओं पर लिंग में अंतर लक्ष्यीकरण, आयु समूह, या आनुवंशिक पृष्ठभूमि.

संरचित मेटाडेटा द्वारा प्रदत्त लाभ इसी प्रकार गणनात्मक वर्कफ़्लोज़ को पार्स करने या मॉडल चिकित्सा भाषा के लिए लागू होते हैं. संरचित CCR सुविधाएं उन क्षेत्रों के प्रमाण भी प्रदान कर सकती है जहां रिपोर्ट लेखक अधिक आसानी से मशीन-पठनीय (और कुछ मामलों में, मानव-पठनीय) सामग्री प्रदान कर सकते हैं । सीसीआरएस के बीच विचरण स्पष्ट रूप से प्रदान की टिप्पणियों की कमी से परिणाम कर सकते हैं: उदाहरण के लिए , एक रोगी की सटीक आयु निर्दिष्ट नहीं किया जा सकता है । इसी तरह, चिकित्सकों अगर निदान या उनके परिणाम तुच्छ माना जाता था परीक्षणों का उल्लेख नहीं कर सकते हैं । में गहराई से विश्लेषण के लिए आवश्यक अंतराल के उदाहरण प्रदान करके, सीसीआरएस पर संरचना लागू करने संभावित सुधार पर प्रकाश डाला गया । एक व्यापक परिप्रेक्ष्य में, चिकित्सा दस्तावेजों से संरचित पाठ डेटा की अधिक से अधिक उपलब्धता प्राकृतिक भाषा प्रसंस्करण (एनएलपी) को स्वास्थ्य24,25में बड़े डेटा से सीखने के प्रयासों का समर्थन करता है ।

Disclosures

लेखकों का खुलासा करने के लिए कुछ नहीं है ।

Acknowledgments

यह काम राष्ट्रीय हार्ट, फेफड़े, और रक्त संस्थान द्वारा भाग में समर्थित किया गया था: R35 HL135772 (पी. पिंग करने के लिए); राष्ट्रीय जनरल चिकित्सा विज्ञान संस्थान: U54 GM114833 (के लिए पी. पिंग, के. वाटसन, और डब्ल्यू वांग); नेशनल इंस्टिट्यूट ऑफ़ बायोमेडिकल इमेजिंग और जैव इंजीनियरिंग: T32 EB016640 (to A. बुि); होग फाउंडेशन और Dr. S. Setty से एक उपहार; और UCLA में T.C. Laubisch बंदोबस्ती (पी. पिंग करने के लिए) ।

Materials

Name Company Catalog Number Comments
A corpus of clinical case reports n/a n/a Full texts of case reports may be accessed through PubMed (e.g., using the search query "Case Reports"[Filter]), other citation databases such as Europe PMC (https://europepmc.org/) or directly through publishers.

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