כל השחלה דרוזופילה מורכבת מ~ 16V ovarioles, או רשתות של תאי ביצה ברצף התבגרות או זקיקים. כל זקיק מורכב מביצית אחת, תאי אחות או תמיכה נגזרים שורת נבט 15, ו~ 650 תאים סומטיים מכונים תאי זקיק (איור 1 א). Oogenesis דרוזופילה מחולק ל14 שלבים מוגדרים מורפולוגית של פיתוח 1. בכל שלב של התפתחות זקיק הוא ציין פעמים רבות בתוך זבוב אחד, ולכן קל יחסית לבודד מספר ניכר של זקיקים בשלב מסוים.
שלבי האמצע עד סוף של oogenesis (שלבי 10B-14) הם גם מתאימים במיוחד לבידוד במה (איור 1). בשלב 10B (S10B), הזקיק מוארך באופן מלא (כלומר אורכו שווה לזה של שלב 14 (זקיק S14), ראה איור 1 ואיור 2H) ומחצית מאורכו של הזקיק מורכב מתאי אחותואילו המחצית השנייה היא הביצית (איור 1 ג). בשלב זה תאי האחות עוברים שיפוץ אקטין דרמטי, חיזוק אקטין קליפת המוח ויצירת חבילות מקבילות של סיבי אקטין 2. במקביל, אוכלוסייה של תאי זקיק, המכונה תאים הצנטריפטלי, נודדים בין תאי האחות והביצית, ושתי קבוצות הגבי של תאי זקיק הופכות צוינו לעבור הגירה כדי ליצור את הנספחים הגבי, מנגנוני נשימה צינורי לעובר 3 . תאי האחות אז חוזה (S11), לוחץ תוכן cytoplasmic שלהם לתוך הביצית בתהליך הנקרא תא אחות השלכת, אשר מספק את הביצית עם הגורמים הדרושים לכך שכדי להשלים את העובר (1D איור). תאי האחות ואז לעבור תא מוות (S12-S13) 4, ותאי הזקיק מפרישים ודפוס קליפת הביצה 5 (האיורים 1E-G). לפיכך, בסוף oogenesis עשיר בהתפתחותיים חשובתהליכי morphogenetic ד.
זקיקים מבודדים באמצע בשלב מאוחר (S10B-S14) יכולים לשמש למגוון מטרות, כולל ניתוחים מולקולריים. לדוגמא, ה-mRNA מזקיקים מבוימים יכולה להיות מבודד לRT-PCR, microarray, או RNA-seq ניתוחים. זה מאפשר להסתכל על ביטוי גנים בתוך חלון התפתחותית קצר, עם רק כמה סוגי תאים בהווה, ולקבוע כיצד ביטוי גנים שונה על ידי הפרעות או תרופתיות או גנטיות. גם בידוד שלב ניתן להשתמש להסתכל על חלבונים על ידי מערבי סופג. ניתוח כזה הוא חשוב משום שהוא מאפשר לכמת את רמת ביטוי החלבון בwild-type לעומת מוטציות בשלבים מסוימים. אמנם אפשר להשתמש immunofluorescent מנתח כדי להשיג תוצאות דומות, כימות של הקרינה היא חזקה פחות בשל הדרישות הקפדניות שכל הפיקסלים יהיו בתחום ליניארי של זיהוי 6. בנוסף, ניתוח כתם מערבי עשוי לספק מידע אחר, כגוןים אם החלבון הוא שונה או שהוא בא לידי ביטוי מאיזופורם אחו ספציפי posttranslationally. גם שלבים מבודדים יכולים לשמש לטיהור חלבונים נוספת, כוללים חלוקה או coimmunoprecipitation subcellular.
גם בידוד זקיק בשלב מסוים יכול לשמש במבחני חוץ גופית פיתוח 7 וחייה הדמיה 8. זקיקי S10B-S13 מבודדים ימשיכו לפתח לS14 בתקשורת תרבות הפשוטה (ראה להלן). חשוב לציין כי זקיקי S10A לא להתקדם דרך תא אחות השלכת באמצעות תנאי התרבות שנדונו בכתב היד הזה. יש לנו בשימוש במבחני חוץ גופית פיתוח S10B להגדיר את התפקיד של פרוסטגלנדינים, שני פרמקולוגית וגנטי, בויסות שיפוץ אקטין באמצעות תא אחות השלכת ופיתוח לקריאה פסקי 7,9. בדומה לכך, בשלבים מאוחר יותר של התפתחות יכולים גם להיות מבודדים כדי לקבוע את ההשפעות של טיפולים תרופתיים או איש גנטיipulations על תהליכים מסוימים, כגון הגירה הצנטריפטלי תא, הגירת תוספת גב / היווצרות 10, ומוות של תאי אחות. מבחני מסוג זה יכול לשמש כדי לבצע מסכי אינטראקציה דומיננטיים או מבחני, למשל, בעוד heterozygosity למוטציות בPXT או fascin לבד אין להם השפעה על התפתחות S10B במבחנה, זקיקים מheterozygotes הכפול תא אחות תערוכת הטלת מומים ולחסום בפיתוח 9.
בנוסף, בגלל S10B-13 יכולים להתפתח בתרבות, כל התהליכים המתרחשים בתקופה זו ניתן לצפות בזמן אמת הדמיה. הדמיה כזו יכולה להתבצע רק באמצעות אור מועבר (אם הוא מעוניין רק בשינויים במורפולוגיה ברוטו) או עם מיקרוסקופיה confocal באמצעות זבובים מהונדסים מבטא בדיקות או זקיקים מוכתמים בצבעי ניאון הדמיה לחיות. הדמיה חיה נמצאת בשימוש כדי לקדם את ההבנה של תהליכים התפתחותיים שלנו באופן משמעותי. אכן, לחיות לדמייןגרם של זקיקים בשלב מאוחר הרחיב את הידע של הגירת תוספת גב, דוגמא של tubulogenesis 10. אנו מצפים כי הדמיה חיה של תהליכים נוספים בשלב מאוחר, ובכלל זה אקטין דינמיקה בתא אחות השלכת, תספק תובנה חדשות אירועים התפתחותיים אלה. חשוב לציין כי בעוד S10A ושל התפתחות זקיק בשלבים מוקדמים לא ימשיכו להתפתח S14 בתרבות, בשידור חי הדמיה של אירועים המתרחשים באותם שלבים של התפתחות אפשרית באמצעות תנאי תרבות אלטרנטיביים 11-14 (ראה דיון ליותר מידע).
כאן אנו מספקים פרוטוקולים מפורטים לבידוד זקיקים בשלב מאוחר גם עבור פיתוח במבחנה ולחיות הדמיה, או ניתוחים מולקולריים (mRNA ובידוד חלבון).